2QZXA

Secreted aspartic proteinase (sap) 5 from candida albicans
Total Genus 88
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
88
sequence length
342
structure length
342
Chain Sequence
GPVAVTLHNEAITYTADITVGSDNQKLNVIVDTGSSDLWIPDSNVICIPKWRGDKGDFCKSAGSYSPASSRTSQNLNTRFDIKYGDGSYAKGKLYKDTVGIGGVSVRDQLFANVWSTSARKGILGIGFQSGEATEFDYDNLPISLRNQGIIGKAAYSLYLNSAEASTGQIIFGGIDKAKYSGSLVDLPITSEKKLTVGLRSVNVRGRNVDANTNVLLDSGTTISYFTRSIVRNILYAIGAQMKFDSAGNKVYVADCKTSGTIDFQFGNNLKISVPVSEFLFQTYYTSGKPFPKCEVRIRESEDNILGDNFLRSAYVVYNLDDKKISMAPVKYTSESDIVAIN
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase/hydrolase inhibitor
molecule keywords Candidapepsin-5
publication title X-ray structures of Sap1 and Sap5: Structural comparison of the secreted aspartic proteinases from Candida albicans.
pubmed doi rcsb
source organism Candida albicans
total genus 88
structure length 342
sequence length 342
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.4.23.24: Candidapepsin.
pdb deposition date 2007-08-17

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00026 Asp Eukaryotic aspartyl protease
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.40.70.10 Mainly Beta Beta Barrel Cathepsin D, subunit A; domain 1 Acid Proteases 2qzxA02
2.40.70.10 Mainly Beta Beta Barrel Cathepsin D, subunit A; domain 1 Acid Proteases 2qzxA01
3K5CA 5P65A 1N49A 4OC6B 3VF3A 3T7QA 5P3QA 3D1YA 2NMYA 1EPME 1C6ZA 5P43A 5P55A 3Q5HA 5P5CA 1DIFA 2WEAA 5P2DA 2PYMA 1DMPA 3UDJA 1DAZC 2QI7A 5T4SA 5P2XA 5OZWA 5P0IA 5HCTA 5HDZA 7HVPA 4MC9A 5P3EA 3EKXA 1HXBA 2ZJIA 4QGIA 3MXDA 3BVAA 5P47A 1OD1A 5P6LA 1D4JA 3FIVA 2Q3KA 2ZJLA 5P2BA 1G2KA 4Y37A 1EPPE 5HE5A 5P8PA 5OZVA 5P7SA 1ZTZA 4K8SA 1FQ7A 5P07A 1PFZA 3DUYA 1HVIA 3BGBA 1ZPAA 3OADB 1HVLA 4JPCA 5KR8A 1FQ5A 3PEPA 1MSMA 2R5QA 3GGAA 1FG6C 5P39A 3T7XA 4CPUA 4I1CA 1K6VA 4DJQA 1Z8CA 5P7IA 3OU4A 5OZGA 4HEGA 4XX4A 4Z2ZA 3TKWA 5AHCA 4APEA 2XFIA 3EKPA 2UXZA 5P04A 5P3GA 5P27A 3EKWA 5P69A 1IZDA 1FQXA 3UFLA 5IS4A 5P3FA 5P2OA 3NYGA 5P7GA 3CKTA 4Y5NA 3PWWA 5HU0A 5P4TA 2Q11A 1QBTA 5P4IA 1PPKE 2BB9A 3EKTA 1APTE 3G70A 3QS1A 4YD6A 2B8VA 4B00A 4K4PA 2NTRA 5P38A 1PPME 2QCIA 2BPXA 2NPHA 4Y4UA 2QD6A 2VJ6A 5OZUA 1A8KA 5P57A 4Y57A 4CMSA 2BPYA 3LZSA 1J71A 3ZKGA 5P3IA 5P1WA 1K2CA 5OZ2A 4DV9A 3NSHA 1AVFA 5IVSA 5P3MA 5P3KA 5P25A 4ZPGA 5IVRA 5P3SA 4Y3MA 4H3IA 1QRPE 4TVHA 1B6JA 3VYDA 4Y3FA 3UQXA 5P1KA 4DJRA 2EWYA 3SPKA 7UPJA 5P1RA 4FIVA 1QBRA 5P5EA 2PH6A 4OD9A 5P7NA 1KJ4A 4CKUA 3I7EA 2Q54A 4Q5MA 5P77A 2R3WA 5P7DA 4J0YA 1META 2QNPA 1FG8C 5P71A 3KYRA 1XDHA 4J55A 5P0WA 5OZ9A 1YTHA 2P3DA 5OZMA 2BJUA 4RVXA 1C6YA 2P8HA 2QU2A 3QBFA 3R1GB 3SABA 3OOTA 5P0BA 4ACUA 2ZHSA 3ZKNA 4KE0A 4J17A 5P5ZA 4LL3A 2XYEA 2Q55A 2ZJMA 5P0HA 1NPWA 2G27A 5P0XA 4Y39A 3OU1A 3OTSA 3EL4A 4GJ8A 5P4MA 5OZJA 1W6IA 3VV7A 4J1EA 3NXNA 1SIPA 4ER4E 4FRKA 5P8EA 5P3XA 5OYQA 3VYEA 1EC0A 5P7MA 3TPRA 3CICA 4AA9A 1GVXA 3GGUA 3FV3A 2NXDA 2PQZA 1BAIA 1HTEA 4OBKA 5EZZA 4FAFA 4D83A 5P2QA 1HIHA 5I70A 5P2WA 3LPKA 4NJSA 2AOHA 4MC1A 2FLEA 5P0GA 4Q1XA 4Y3JA 3UHLA 2BPVA 5P5XA 5P6RA 5JODA 3K4VA 5KOSA 2ZGAA 5P40A 4YA8A 4YDGA 2ZDZA 2OHUA 3OUAA 1SMRA 4Y5PA 2H6TA 1YX9A 3O9AA 5DGUA 5P0PA 5P7ZA 5P7RA 1G35A 5P2SA 3LIVA 4RCFA 4HZTA 5P2TA 4A6CA 1OHRA 3KT5A 3IVHA 2QD7A 1SH9A 2QI4A 3LINA 5OZTA 1EEDP 3TKGA 4UPJA 4GJ9A 5OZ7A 5P2JA 3LPIA 3HVGA 5P3OA 4RRNA 1Q9PA 1AJVA 5P05A 5P78A 1FEJC 2VA5A 5DR4A 2G69A 3OU1B 4KB9A 5P84A 2AVQA 3EM3A 2Z4OA 3S7LA 5P1OA 3OXCA 5P1TA 3KF0A 5P28A 3HLOA 3ZL7A 5OYWA 5P1VA 2NXMA 4ZSQA 5P6FA 2ZHRA 4F74A 5P20A 5P4NA 2R8NA 3PRSA 3ZPTA 4Y3NA 5P2UA 4CPSA 4WY6A 3PHVA 2P3BA 3PM4A 4M8XA 3L5CA 5JFUA 2AOGA 1XN2A 2Q63A 5P0CA 4Y51A 3AIDA 4FRSA 5OZIA 5P42A 4L7HA 3INHA 2A1EA 3UQRA 1A94A 4RYGA 4DJOA 2FDDA 3LPJA 5P0NA 4FGXA 3ZKXA 1CMSA 1SMEA 1AAQA 3SFCA 3G6ZA 4Y41A 4Y3TA 5P0LA 5P2CA 5P8IA 1RQ9A 1HVSA 3L58A 1B6MA 3VF5A 3O9DA 2VJ7A 1D4LA 4TRYA 2PYNA 2BKSA 4Y43A 5P4LA 3ST5A 4I11A 3G72A 4Y45A 5P80A 2QHZA 5OYTA 1YTJA 1PSNA 5P7XA 3KM4A 5P49A 2WF3A 1K6PA 2P3AA 4HA5A 3TOHA 5P73A 2I4WA 3NU3A 4LXMA 4I12A 4ZPEA 3S53A 1FB7A 3CYXA 1E80E 3VEUA 2FMBA 4B1DA 1SBGA 2ER7E 5P0RA 1ZBGA 1IVQA 3DV5A 4TRZA 4I0FA 3OU3A 3EC0A 2V16C 2QMPA 2O4SA 3SA7A 5P7UA 2RENA 5P0SA 3K4VC 2P3BB 1QBUA 4BFDA 4CPQA 1APWE 4CPXA 2V11C 1VIKA 3SA6A 5P8BA 3N4LA 4Y3RA 3UQUA 1KJHA 1NH0A 4MC2A 3DCKA 4QJ7A 5P7VA 5P8HA 5P31A 1T7JA 3GW5A 3VV6A 3EL5A 5I3WA 1E5OE 1LZQA 4ZIPA 4X2LA 3O9HA 1W5WA 5P24A 4HVPA 1FFIC 3CKRA 3KN0A 3QRVA 4DQHA 1ZJ7A 5OYRA 5P30A 5P48A 3VSXA 5P66A 5P2LA 1APVE 1FMXA 5P59A 5P1NA 4B70A 3D91A 4DQFA 1SGUA 1BWBA 4NJVA 3OTYA 3UFNA 1NSOA 1FLHA 1FQ6A 5P5NA 1W5VA 4I0JA 1XL5A 2RKFA 3BUHA 4ZPFA 1HEFE 1BDQA 1F34A 4K4RA 2V13A 1RV7A 2OHSA 1BDLA 2VIJA 5FIVA 5C9FA 2OF0A 3LHGA 1T7KA 4QJ6A 4Y36A 1Z1HA 5P4XA 3NDWA 2G1YA 4Y5AA 3T11A 5P3PA 3NU5A 4X7IA 5P1UA 1HHPA 3HBOA 4J1IA 3A2OA 2G21A 3PI0A 4FM7A 5JFPA 1CPIA 1HIIA 1MRXA 2G1RA 1FFFC 3MSJA 1GKTA 4MC6A 5P5VA 2V10C 3R0WA 2QMGA 5SY3A 4TVGA 3GI6A 5P2FA 3VCMA 1BDRA 2PK6A 1KJGA 1MTBA 1QDMA 3EKQA 1DPJA 4APRE 2QP8A 2QMDA 4WY1A 3OUDA 1TW7A 4DJUA 2QZXA 2VIZA 4JECA 2O4KA 1BXQA 1TCWA 1XE6A 2G1NA 4DQGA 4EJ8A 4J1FA 5P3TA 1A9MA 1GVWA 5COOA 4DJWA 5IE1A 1UH9A 5P8AA 5P8VA 1XS7D 4Q1YA 3FX5A 3N3IA 2OHRA 2QMFA 2WF4A 5P8FA 1RPIA 4PHVA 5P5GA 5P32A 3OQDA 5P2GA 4E43A 5P5UA 5P8SA 5P26A 3IXJA 3PLLA 2G94A 4QLHA 5P70A 3D1XA 5P2HA 2IEOA 3JVYA 2AIDA 4H3GA 2F80A 5DQ2A 5P4AA 5P8MA 5DQ5A 4BFBA 4Y50A 2JJJA 3VSWA 5P87A 4Q1NA 4CPRA 1RL8A 2AOIA 4J0VA 2R38A 2VS2A 3BGCA 3MSKA 2G1OA 6APRE 5P2MA 5P7FA 3VLBA 3M9FA 5EZXA 1BV7A 5P1GA 4Y5LA 5DR0A 2HB2A 5AHBA 5DQ4A 3EM6A 3QPJA 3L38A 4Y3GA 5P1QA 1IZEA 1GNMA 2PC0A 4B05A 1A30A 5P0KA 1MSNA 3OHFA 4ACXA 5B18A 5KOQA 4GZFA 5P4JA 3SKFA 4Y3WA 3U7SA 1FGCC 4CPWA 1W6HA 3PSYA 5P06A 5P1PA 3PI5A 3OUDB 1LYAA 1YG9A 1LYBB 2IKOA 5P1YA 4RZ1A 1QS8A 1EBWA 1BVEA 3S43A 1K2BA 1D4KA 5P2ZA 5P3CA 2R5PA 3RSXA 1T6GA 3SA9A 2A4FA 2I4QA 3CYWA 5P3BA 3NUJA 3BUGA 5P7JA 1HIVA 4YHQA 3ZKMA 1AM5A 3PSUA 2QAKA 5I3XA 2ANLA 4Y3QA 4EQ0A 3HZCA 4EXHA 1HPVA 2ZJKA 4Y3SA 3O9FA 4Y3YA 4I8WA 4HLAA 4Y47A 5P34A 2ZHUA 1EC3A 5BWYA 1AJXA 2FDEA 2VIYA 5ER1E 3QP0A 2OHKA 5P10A 1W50A 5P85A 5P4KA 4BELA 1B6LA 2PWRA 3TPLA 3LZVA 2CEJA 3NDTA 3OAGA 3TL9A 2Q15A 4Y4ZA 3S85A 1TSQA 3SA3A 1MERA 3OXWA 5P67A 5OZEA 3KA2A 4D85A 1FKNA 2G24A 2VA6A 2BPZA 5P5HA 5P89A 5P1XA 3PWRA 1ODWA 2HS2A 5OYZA 3I2LA 4DPFA 2VIEA 4I0DA 1M4HA 3NLSA 5AH8A 5P6DA 1Z1RA 4Y4WA 4I8ZA 5P6SA 4YE3A 3B80A 5P83A 5P37A 3INFA 1MESA 3NUOA 3PMUA 4LBTA 1ZSFA 3OK9A 5ISJA 5P6MA 4DJPA 1ODYA 3IVIA 1PSOE 5P4PA 3DJKA 5P1ZA 3S43B 3JW2A 5P4HA 1LEEA 4J1CA 3OHHA 5P4FA 5P0JA 1UH7A 5P3ZA 2O4LA 4N00A 4AMTA 3WSJA 4Z4XA 5P53A 5P68A 1HVKA 2CEMA 3ZKSA 4I0IA 5P6QA 5OZNA 3OWNA 3OU4B 5P46A 3S7MA 5OZRA 3OAGB 3VV8A 1JLDA 2ZYEA 5OZKA 2WF1A 1BV9A 5P29A 3LIQA 2FGUA 5P1HA 3QVIA 3DV1A 5P5TA 1IDBA 5OZDA 3OQ7A 1WBKA 2SAMA 4YBIA 2FXDA 5P4RA 5P5OA 1BVGA 4DQEA 5OZ6A 1HWRA 1XE5A 5P0OA 5APRE 5P3HA 3RTHA 3IA9A 4Y38A 5I3YA 2QZLA 1W5YA 2JYSA 2G26A 1F7AA 4Y3PA 3SA5A 3GI0A 5I3VA 4OBJA 6UPJA 3BRAA 3EXOA 4HE9A 1HVJA 3QROA 4B0QA 1G0VA 2Q5KA 2H6SA 4Y3DA 3MWSA 1MEUA 5KR1A 4YOBA 3VLAA 5P7AA 5P17A 2J9JA 3OXVA 5HDXA 4FL8A 4YD5A 3L5FA 2R43A 1AZ5A 4NPUA 4OD9B 5J25A 4OBHA 2IL2A 4IVTA 4NPTA 2WEDA 5P5JA 5P7KA 5OYVA 5P8LA 5KQZA 3K5GA 4NJUA 1IIQA 4OBZA 5C9DA 1ZLFA 4Z50A 5P36A 4Y4GA 3R0YA 4Y4TA 3O9LA 1YM2A 3B7VA 5P61A 2WEBA 3HD8A 2I4XA 1MTRA 2HPFA 2PSUA 4DJVA 5OZSA 5HD0A 4DI2A 3QIHA 3KDCA 3PMYA 3ZPSA 3BUFA 4QJ9A 4KUPA 1YTIA 3U71A 5OZBA 3GGXA 1EAGA 5P15A 4FM6A 1MVPA 2ZJJA 3WB5A 4PYVA 3DK1A 3OGPA 3Q6YA 3ZPUA 3KMXA 5P22A 4DQBA 2JJIA 5P60A 1K6TA 5P5BA 2V0ZC 1SP5A 2QI1A 4LC7A 5P4YA 5P16A 5SY2A 5P54A 5E5JA 2QNNA 4J0TA 1XL2A 4FSEA 5P18A 3INDA 4I0EA 4OBFA 4Q1WA 4LHHA 4NKKA 5P1MA 5HDUA 4U7QA 3RU1A 2PK5A 5P1LA 4NJTA 2PSGA 2RKGA 5CONA 5P0AA 1PROA 3EBZA 3O9IA 2PH8A 1B6KA 5OZPA 3CIBA 4R8YA 4Y3HA 3WZ6A 3HW1A 3UDHA 4RVIA 5OYSA 2ZJNA 5P44A 1LYWA 2OHMA 1FMBA 4D88A 5P1SA 5P0MA 5P7WA 3PVKA 2OHNA 1KJ7A 2AVMA 4Y5GA 5P5MA 3T6IA 5IVQA 5P50A 4Y4EA 4OBDA 4GMIA 4PEPA 3DCRA 4K4QA 5P2AA 2NNPA 4GJ5A 5P0VA 5P6KA 4ER2E 2IGXA 2VA7A 3NWXA 2B60A 2QU3A 5OZ1A 5P7EA 3QI1A 1HVHA 3QAAA 4Y4DA 5P3VA 4S1GA 4LXAA 3KT2A 5HE7A 1MT7A 1XN3A 5P5AA 1LF2A 4I0HA 4EJKA 2WHHA 5SXNA 2UPJA 5P12A 3SAAA 1HSGA 5P2NA 5P2KA 1HRNA 1MPPA 2I1AA 3T3CA 5P5QA 1BIMA 2OHTA 4J1KA 5OZLA 5P7OA 2OHPA 5P8CA 3UF3A 5P3DA 5P2EA 3K5DA 1HPOA 4GJ6A 2FGVA 3NU9A 4B72A 1IDAA 1BILA 4YOAA 1EC1A 3GGVA 3NR6A 4Y54A 5P58A 1LYWB 1C6XA 3NXEA 3RSVA 4YCYA 5E5KA 2NNKA 5P0DA 4J54A 2XFJA 5P8GA 5P3NA 3S8IA 3KDDA 1D4SA 2NXLA 5P00A 5SZ9A 1HBVA 3UDQA 5P86A 3BXSA 3L5EA 2QK5A 3D20A 1G6LA 2Q64A 4Z22A 5P3RA 3QBHA 3O9GA 2B8LA 3ZOVA 3IN3A 4YCTA 1GVVA 3D3TA 1FMUA 2P4JA 1GVUA 1M0BA 3SA4A 3OY4A 2QI3A 5P4SA 2HAHA 1HTGA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 3K5C A;  5P65 A;  1N49 A;  4OC6 B;  3VF3 A;  3T7Q A;  5P3Q A;  3D1Y A;  2NMY A;  1EPM E;  1C6Z A;  5P43 A;  5P55 A;  3Q5H A;  5P5C A;  1DIF A;  2WEA A;  5P2D A;  2PYM A;  1DMP A;  3UDJ A;  1DAZ C;  2QI7 A;  5T4S A;  5P2X A;  5OZW A;  5P0I A;  5HCT A;  5HDZ A;  7HVP A;  4MC9 A;  5P3E A;  3EKX A;  1HXB A;  2ZJI A;  4QGI A;  3MXD A;  3BVA A;  5P47 A;  1OD1 A;  5P6L A;  1D4J A;  3FIV A;  2Q3K A;  2ZJL A;  5P2B A;  1G2K A;  4Y37 A;  1EPP E;  5HE5 A;  5P8P A;  5OZV A;  5P7S A;  1ZTZ A;  4K8S A;  1FQ7 A;  5P07 A;  1PFZ A;  3DUY A;  1HVI A;  3BGB A;  1ZPA A;  3OAD B;  1HVL A;  4JPC A;  5KR8 A;  1FQ5 A;  3PEP A;  1MSM A;  2R5Q A;  3GGA A;  1FG6 C;  5P39 A;  3T7X A;  4CPU A;  4I1C A;  1K6V A;  4DJQ A;  1Z8C A;  5P7I A;  3OU4 A;  5OZG A;  4HEG A;  4XX4 A;  4Z2Z A;  3TKW A;  5AHC A;  4APE A;  2XFI A;  3EKP A;  2UXZ A;  5P04 A;  5P3G A;  5P27 A;  3EKW A;  5P69 A;  1IZD A;  1FQX A;  3UFL A;  5IS4 A;  5P3F A;  5P2O A;  3NYG A;  5P7G A;  3CKT A;  4Y5N A;  3PWW A;  5HU0 A;  5P4T A;  2Q11 A;  1QBT A;  5P4I A;  1PPK E;  2BB9 A;  3EKT A;  1APT E;  3G70 A;  3QS1 A;  4YD6 A;  2B8V A;  4B00 A;  4K4P A;  2NTR A;  5P38 A;  1PPM E;  2QCI A;  2BPX A;  2NPH A;  4Y4U A;  2QD6 A;  2VJ6 A;  5OZU A;  1A8K A;  5P57 A;  4Y57 A;  4CMS A;  2BPY A;  3LZS A;  1J71 A;  3ZKG A;  5P3I A;  5P1W A;  1K2C A;  5OZ2 A;  4DV9 A;  3NSH A;  1AVF A;  5IVS A;  5P3M A;  5P3K A;  5P25 A;  4ZPG A;  5IVR A;  5P3S A;  4Y3M A;  4H3I A;  1QRP E;  4TVH A;  1B6J A;  3VYD A;  4Y3F A;  3UQX A;  5P1K A;  4DJR A;  2EWY A;  3SPK A;  7UPJ A;  5P1R A;  4FIV A;  1QBR A;  5P5E A;  2PH6 A;  4OD9 A;  5P7N A;  1KJ4 A;  4CKU A;  3I7E A;  2Q54 A;  4Q5M A;  5P77 A;  2R3W A;  5P7D A;  4J0Y A;  1MET A;  2QNP A;  1FG8 C;  5P71 A;  3KYR A;  1XDH A;  4J55 A;  5P0W A;  5OZ9 A;  1YTH A;  2P3D A;  5OZM A;  2BJU A;  4RVX A;  1C6Y A;  2P8H A;  2QU2 A;  3QBF A;  3R1G B;  3SAB A;  3OOT A;  5P0B A;  4ACU A;  2ZHS A;  3ZKN A;  4KE0 A;  4J17 A;  5P5Z A;  4LL3 A;  2XYE A;  2Q55 A;  2ZJM A;  5P0H A;  1NPW A;  2G27 A;  5P0X A;  4Y39 A;  3OU1 A;  3OTS A;  3EL4 A;  4GJ8 A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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