2BKTA

Crystal structure of renin-pf00257567 complex
Total Genus 83
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
83
sequence length
334
structure length
329
Chain Sequence
TSSVILTNYMDTQYYGEIGIGTPPQTFKVVFDTGSSNVWVPSSKCSRLYTACVYHKLFDASDSSSYKHNGTELTLRYSTGTVSGFLSQDIITVGGITVTQMFGEVTEMPALPFMLAEFDGVVGMGFIEQAIGRVTPIFDNIISQGVLKEDVFSFYYNRDSLGGQIVLGGSDPQHYEGNFHYINLIKTGVWQIQMKGVSVGSSTLLCEDGCLALVDTGASYISGSTSSIEKLMEALGAKKRLFDYVVKCNEGPTLPDISFHLGGKEYTLTSADYVFQESYSSKKLCTLAIHAMDIPPPTGPTWALGATFIRKFYTEFDRRNNRIGFALAR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Hydrolase
molecule keywords RENIN
publication title Equipotent Activity in Both Enantiomers of a Series of Ketopiperazine-Based Renin Inhibitors
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 83
structure length 329
sequence length 334
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.4.23.15: Renin.
pdb deposition date 2005-02-18

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00026 Asp Eukaryotic aspartyl protease
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.40.70.10 Mainly Beta Beta Barrel Cathepsin D, subunit A; domain 1 Acid Proteases 2bktA02
2.40.70.10 Mainly Beta Beta Barrel Cathepsin D, subunit A; domain 1 Acid Proteases 2bktA01
1OD1A 5AH7A 2OAHA 3TNEA 3PMYA 1FQ8A 1YTJA 3OQDA 5P0MA 2QHZA 3VV7A 1A30A 2R3WA 5P7BA 2V12C 4F75A 5BRYA 1KJ7A 1W5XA 3KT2A 1ZAPA 1ZSRA 3BHEA 1W6IA 5P88A 3OWNA 4DJXA 3HAWA 3EKPA 1T6EX 5P2RA 4I0IA 2R5PA 4KB9A 1GVUA 4Y5BA 5PEPA 2V16C 5P7IA 3TLHA 3HDKA 3IN4A 4Y57A 5P2NA 3N3IA 1HSHA 4LXAA 4OD9B 2G20A 4A6BA 4J1IA 4CPWA 5OZ7A 4OBHA 2FS4A 4Y3WA 4I0FA 4Y6MA 3CKPA 4Q1XA 4J1EA 5HE4A 3OGQA 5OZ8A 4DJWA 4DQHA 3C9XA 4Y5NA 3EKVA 2AVMA 4DQFA 5OZUA 5P3GA 3S8IA 5P01A 5P6SA 3VF7A 3K5GA 1CMSA 4Z2ZA 4YDGA 2IEOA 4L7JA 5P0GA 4WTUA 3U7SA 4F74A 5P6VA 1G6LA 5P7EA 3PM4A 4QJ7A 2P8HA 2HB3A 2VJ9A 2QU2A 3O99A 4GYEA 2I0AA 5P5IA 3EL1A 4I0EA 4QJ6A 2ZHRA 1XL5A 1IDAA 4TRZA 5P2VA 3LIZA 1WBKA 5P3FA 4Y50A 2RKFA 4CPRA 3EMYA 4YD4A 4HEGA 5P8IA 3OHFA 3R0WA 1D4KA 4EYRA 5HU1A 5P7HA 2Q15A 5P7LA 1SGUA 4Y54A 5P8QA 3OU1B 5P4DA 3FNTA 1EPOE 2AOEA 1C6ZA 5P8GA 2HAHA 4B1EA 3MXDA 2G69A 4YCTA 1T7KA 3FX5A 2HPEA 1SGZA 4Y3GA 3I25A 2AVOA 5OZZA 1VIJA 3I2LA 2ZHUA 5OYWA 4DQGA 3ZKNA 2Q11A 4H3GA 2R43A 3KA2A 5AHBA 5P1HA 4FCOA 1G0VA 2VNNA 3QPJA 3R0YA 3MWSA 4BFDA 1J71A 3M9FA 5P1JA 5P6ZA 2B8LA 3JW2A 4FS4A 4L1AA 2QI4A 1LYBB 1NPAA 5P1BA 5P2XA 2WF4A 1W51A 1U8GA 3RTHA 2IL2A 3PI0A 3UQRA 1FQ4A 3LIVA 4Y4TA 3ZPUA 5COPA 1HOSA 5OZDA 4XX4A 4J17A 1META 5OYVA 3CMSA 1K6CA 1SBGA 2B42A 4Y3YA 3JVWA 3D20A 5TOLA 4YD6A 4FSEA 3IVHA 1MERA 3OUAA 3UFNA 4DQBA 1YTGA 5P4HA 5OZ2A 3EL4A 1MVPA 3PBDA 3TOFA 5P2DA 2P83A 1HVIA 5P5FA 5P6OA 3ZKQA 2B7ZA 5P17A 3G6ZA 5P7WA 4I0DA 1MT9A 5BS4A 1BVEA 2WEBA 5P22A 4Y37A 4Y53A 4B0QA 5ISKA 4DJPA 2NXLA 1RV7A 1BILA 3LIQA 2JJIA 2H6TA 5P4KA 5P5DA 4FAEA 1IZDA 5P1EA 1APVE 4Y39A 5P29A 3SM2A 3UQUA 5P4CA 1F7AA 4N00A 3PLLA 5I3XA 2WKZA 3OXCA 1AXAA 1PSNA 4J1KA 1YM2A 3WSJA 3OQKA 1D4LA 2PH8A 5P87A 5P3VA 2ZHSA 2RKGA 3UQPA 5P24A 4ER2E 3NU9A 5HE5A 2F3KA 4J1HA 3U71A 2QAKA 1XL2A 2QNNA 3EBZA 1LF2A 3EL5A 5P7YA 4KE1A 5P4GA 3VFBA 2OHTA 1BV7A 1QBRA 3KT5A 1OHRA 3INEA 3L3AA 3O9LA 3SKGA 3FNUA 4EP3A 3ZKMA 3VSXA 5F00A 3LITA 3ER3E 2FIVA 5P2MA 4I10A 1MSMA 5P3XA 3NLSA 1HSIA 2Z4OA 1F34A 2F80A 3BGCA 1ZPKA 4FM7A 5HDXA 5P70A 3OK9A 3K4VA 5P8HA 5P2SA 1KJFA 1LS5A 3PMUA 1NPVA 5P75A 3VYDA 5OZTA 1T7JA 2AOCA 5SY2A 4J0YA 4Y3EA 5P76A 4E43A 5P78A 5HCTA 2H6SA 5OZVA 2PWCA 1IDBA 4Y4XA 5P6KA 4DQEA 1CZIE 5P8RA 3GGXA 4OC6B 5HDVA 5P31A 4RCDA 1LYAA 3UPJA 4Y3NA 5F01A 5P32A 5P63A 4AA8A 5P5SA 2AOFA 5P7RA 2IDWA 2HM1A 4B1DA 2JE4A 3KMYA 3BGBA 5KOSA 5P7OA 3DCKA 2ZJKA 3UDKA 1LYWA 4Y3TA 4MC1A 2QZKA 3DOXA 3ZOVA 3L5EA 3PB5A 4HVPA 1EAGA 5P7CA 4Y5MA 5P47A 1GKTA 1FQ7A 1XS7D 1HPSA 3DV1A 4JECA 3D1XA 4GJAA 5SY3A 2XYEA 4Q5MA 5P2YA 5P39A 3EKTA 3Q3TA 4X2LA 4Y48A 1A8GA 5E5JA 3EKYA 4YCKA 3UQWA 2ZHTA 1KJGA 1XN3A 1AJXA 2OHUA 3SA3A 2IQGA 1HEGE 5OZFA 1IVPA 3FSMA 4UPJA 2NXDA 2P4JA 1XN2A 5P5HA 2PYNA 3TTPA 2PMAA 2QI0A 3LPKA 4K9HA 2IGYA 2QI5A 4RCEA 4U7VA 5P0VA 5P4UA 4U8WA 2QI7A 5P25A 5EZXA 3WB5A 1GVVA 3APRE 5P5LA 5P80A 2R3TA 4Y56A 5P5UA 4Y51A 5P3SA 5OYXA 3ZKGA 1MT7A 2IRZA 3KFRA 3WZ8A 4GJBA 4LP9A 3QN8A 1SH9A 2NNPA 5P4IA 5OZPA 3TL9A 3UDYA 3NU4A 1VIKA 4K4RA 1AM5A 4JPCA 4K8SA 4KUPA 5P5BA 5OZSA 5P11A 3TOGA 5P7ZA 3GI5A 5P4JA 2HPFA 1T6GA 2VA7A 5P50A 4Y38A 2PC0A 4L7GA 5OZKA 5P2GA 1NSOA 5OYSA 1AVFA 5P16A 4BELA 4I0GA 5P1RA 3OXXA 5ENMA 5P6TA 4ER1E 5P0FA 2IS0A 2A4FA 5P85A 1RL8A 5P42A 4J5JA 1A8KA 1ZLFA 4RZ1A 1HWRA 5P5CA 3QRMA 2OHRA 5P64A 5P67A 3QBHA 5DQ2A 4RLDA 3HVGA 3UF3A 2QD8A 3LPJA 4RRNA 4GJ9A 3OQFA 4QJAA 4Y3AA 4JPEA 3UHLA 5P5ZA 3A2OA 5P8DA 1C6XA 4NPTA 2G21A 1MTBA 2BJUA 1DPJA 5P44A 4WY6A 3Q5HA 5P69A 4Z4XA 2NR6A 3PI5A 3K5DA 4OBZA 2G27A 1EPRE 5P4NA 3OXWA 2G1NA 4OD9A 4M8YA 5P8AA 1WKRA 5P5VA 4Q1WA 5P71A 5P4XA 4AZYA 3QP0A 5P55A 3VEUA 1QRPE 3DJKA 1FFFC 4RVXA 2BKTA 4ZLSA 5P1NA 1IZEA 3GGVA 1HSGA 3NSHA 5P04A 5DGUA 3T6IA 5P3WA 2BPYA 3CIDA 2QI3A 4K4PA 1MT8A 4GJDA 4HLAA 3UDNA 2AQUA 4B05A 4ZEAA 5E5KA 5OYTA 2BPVA 3UDMA 5COOA 5P66A 5P4QA 4Y4GA 3RVIA 3EKXA 1EC2A 2FDDA 3OUDB 3Q4BA 5P4YA 2O4KA 2QU3A 3TKGA 3DK1A 5I70A 4FM6A 3OHHA 5P18A 3SM1A 3S43B 1M4HA 5COKA 4K4QA 4YE3A 4YD7A 5P3LA 1MIQA 3O9AA 5P79A 3LNKA 1HPVA 5P3JA 4DVFA 4ZIPA 1FIVA 2ER7E 4J0TA 5OZ1A 2QI6A 3PSUA 4D8CA 3OU1A 1FMUA 3APPA 1GVWA 3KM4A 5P7PA 3KFSA 3UDJA 3ZPSA 1TSQA 1IZHA 2R5QA 5P6FA 5P37A 1OEXA 4DPIA 3VUCA 1B5FB 1XE6A 1T3RA 3INFA 1CPIA 4XKXA 4TRYA 5HDUA 4HZTA 5P7AA 2ZGAA 3OTSA 3KYRA 1KJ4A 5P03A 2AOJA 1YX9A 4KE0A 1BDRA 4ACXA 1GNNA 1K6VA 4RVJA 5P4ZA 4I0HA 2WEAA 3UCBA 2NNKA 5P1IA 3D1YA 1HPXA 1MESA 5P1QA 2IGXA 2WF2A 4AA9A 1D4HA 1LYBA 4Y4WA 1PROA 5P02A 3GI6A 2NTRA 5P2CA 1W6HA 1AAQA 2G94A 1DP5A 2ZJJA 2QCIA 2AZ8A 2UPJA 2WF0A 1WBMA 1KZKA 3O9GA 5FIVA 5P8UA 3MSLA 3D3TA 5OZGA 1AZ5A 1BIMA 1EBWA 1D4IA 5P1CA 3B7VA 4HA5A 5OZHA 5J25A 3NDWA 4NPUA 3PHVA 4NKKA 4DUSA 2V0ZC 2G1SA 5HDZA 3TPPA 1MEUA 3EC0A 3PEPA 1B6LA 2QP8A 4EXGA 5OZXA 5OZ5A 3TPRA 1ZP8A 1IVQA 1E80E 4GJ6A 5CONA 3QRSA 5P7MA 4CPXA 3O9IA 5P8VA 2J9KA 5EZZA 5P3BA 1FLHA 3NXNA 5P0KA 5KOQA 1C6YA 5P20A 5ER1E 5OZRA 3OOZA 5P83A 5C9DA 5OZEA 1HVKA 5P5GA 1SDVA 2A1EA 4CMSA 5P53A 3ST5A 3NDTA 4Y43A 5HCOA 4APEA 5OZCA 4AMTA 5P82A 5P26A 3L5DA 5HU0A 5P1PA 2IENA 5P8OA 5DPZA 5OZNA 2AOIA 1LF4A 5P2OA 5P0EA 5P0SA 1PPME 3N4LA 1TCXA 1A9MA 5P4VA 1T7IA 2BBBA 1ME6A 2AVQA 5P7XA 3KF0A 1HTRB 4Y35A 3SO9A 2OHSA 2QD7A 4OBJA 4EHCA 3T3CA 1ODXA 5P4FA 4DJYA 2G26A 4X7IA 1C70A 1B6JA 5P09A 1QBSA 2WEDA 3K1WA 1QDMA 4Y5EA 1Z1HA 3AUPA 5P6BA 1YTIA 1D4YA 7HVPA 5P8LA 3RSXA 2OHKA 2V10C 2VA6A 2APRA 4ZSRA 3OADB 4PEPA 4Y3XA 3CYXA 5P0DA 5P6AA 1EPLE 2FGVA 3BC4A 3CICA 4Q1YA 5ENKA 4H3FA 5P3MA 4ZPEA 4I0JA 4FIVA 2O4PA 4Y36A 3NWXA 4Y3ZA 3CKTA 5I3VA 4Y3MA 2HC0A 4DI2A 1FQXA 2I4UA 3SA8A 4JOOA 3IGBA 5P6XA 1IIQA 3QROA 3EL9A 3LINA 1UH7A 4FRJA 5P3IA 4DJQA 2XFIA 1FGCC 5P1DA 2FXEA 1XE5A 5P5OA 3NYGA 2ZHVA 1UH8A 3D1ZA 4ZE6A 3R4BA 1TCWA 3NU5A 4RRSA 4B1CA 4JP9A 4NJSA 2WF3A 3QS1A 3LZUA 4H3JA 5P0WA 5P60A 5P0BA 2FLEA 4YA8A 2P3BA 2QHYA 3AIDA 5P0XA 2EWYA 3S54A 1EBYA 5P3EA 2UY0A 4ACUA 1LZQA 3DM6A 1K6PA 1Z8CA 3EM6A 5P36A 1BWBA 5P7VA 3QAAA 1XDHA 1RPIA 5JFPA 5P77A 4R5NA 3GW5A 5P4SA 3VSWA 2I1AA 3RTMA 4PHVA 4J0ZA 3S7MA 2NPHA 1EPPE 5OZ9A 1MUIA 2VJ6A 4Y4EA 5P0ZA 4Y4BA 1APWE 2FNSA 2I4QA 1SIPA 2AZCA 2OHNA 5P1FA 1HEFE 5P1LA 4EQ0A 5KR1A 3NDXA 5P5NA 5P30A 1DMPA 4D83A 4QGIA 3BUHA 2BPWA 5P6HA 3ER5E 5B18A 3SA6A 4YD5A 1AJVA 3T7QA 5P1VA 4FRKA 3K4VC 3GGAA 5P6WA 2NMYA 2QD6A 3VF3A 1BXQA 5ER2E 2PQZA 5JODA 3SABA 3WZ6A 4LC7A 2PSGA 4TVGA 5P43A 1HTGA 3L5FA 3UDRA 5P81A 5P28A 3BRAA 5P2EA 5P1KA 5I3WA 5P8JA 4Y3RA 5KR2A 3OAGA 5P57A 1W50A 5JFUA 2I4XA 5UPJA 3BXSA 1FG6C 1BWAA 3TOHA 1FKNA 3BXRA 5P7DA 3PCWA 2ZJMA 3G72A 5P0QA 3IXJA 4PYVA 1ENTE 3FNSA 3FV3A 4A4QA 4Y5CA 5DQ5A 2BPXA 4I8WA 3ZKSA 5IVSA 3DCRA 2Q54A 3O9LB 5OZIA 2PH6A 3IXOA 3G70A 3NDUA 2I0DA 2PSUA 8HVPA 2PYMA 5IVQA 2OHLA 3ZKIA 3H5BA 5P1AA 2I4DA 3MXEA 5IE1A 3SA9A 3CYWA 5C9BA 3L38A 4Q1NA 4PZWA 4J1CA 4EJDA 2I4WA 3QRVA 2VS2A 4Y41A 4BFBA 4GJ7A 2RSPA 1MPPA 1E82E 2QMGA 4Y5LA 1SMRA 5OZYA 4Y4JA 3IA9A 5P65A 3O9BA 3NUJA 3ZPTA 5P3KA 4CPTA 1GVTA 3RTNA 3ZKXA 4I0ZA 5P8MA 5APRE 5P0JA 5P4PA 4DV9A 3OUDA 2OHQA 4R92A 1LYAB 5P7JA 4Y3SA 3SA4A 1SDUA 1HTFA 5P3AA 5P61A 2WHHA 5P40A 4Y4UA 5P6MA 1SIVA 5IS4A 3SKFA 3NU3A 1LYWB 4NJTA 4MC2A 2AVSA 5P2LA 2QMFA 3VLAA 1ER8E 5P8PA 3SFCA 2Z54A 4D89A 1DAZC 2BB9A 4DFGA 4IVSA 3S45A 3OQAA 2FXDA 1PPKE 5P08A 3LZSA 5KR8A 2WF1A 3HD8A 3SQFA 5P5PA 2J9JB 3HBOA 3R2FA 7UPJA 1Q9PA 2OHPA 3LZVA 3QI1A 5P4LA 2F3EA 5P8KA 4HE9A 5DR1A 5P73A 5P5MA 4GJ5A 3Q70A 4FGXA 5P1ZA 5P6RA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 1OD1 A;  5AH7 A;  2OAH A;  3TNE A;  3PMY A;  1FQ8 A;  1YTJ A;  3OQD A;  5P0M A;  2QHZ A;  3VV7 A;  1A30 A;  2R3W A;  5P7B A;  2V12 C;  4F75 A;  5BRY A;  1KJ7 A;  1W5X A;  3KT2 A;  1ZAP A;  1ZSR A;  3BHE A;  1W6I A;  5P88 A;  3OWN A;  4DJX A;  3HAW A;  3EKP A;  1T6E X;  5P2R A;  4I0I A;  2R5P A;  4KB9 A;  1GVU A;  4Y5B A;  5PEP A;  2V16 C;  5P7I A;  3TLH A;  3HDK A;  3IN4 A;  4Y57 A;  5P2N A;  3N3I A;  1HSH A;  4LXA A;  4OD9 B;  2G20 A;  4A6B A;  4J1I A;  4CPW A;  5OZ7 A;  4OBH A;  2FS4 A;  4Y3W A;  4I0F A;  4Y6M A;  3CKP A;  4Q1X A;  4J1E A;  5HE4 A;  3OGQ A;  5OZ8 A;  4DJW A;  4DQH A;  3C9X A;  4Y5N A;  3EKV A;  2AVM A;  4DQF A;  5OZU A;  5P3G A;  3S8I A;  5P01 A;  5P6S A;  3VF7 A;  3K5G A;  1CMS A;  4Z2Z A;  4YDG A;  2IEO A;  4L7J A;  5P0G A;  4WTU A;  3U7S A;  4F74 A;  5P6V A;  1G6L A;  5P7E A;  3PM4 A;  4QJ7 A;  2P8H A;  2HB3 A;  2VJ9 A;  2QU2 A;  3O99 A;  4GYE A;  2I0A A;  5P5I A;  3EL1 A;  4I0E A;  4QJ6 A;  2ZHR A;  1XL5 A;  1IDA A;  4TRZ A;  5P2V A;  3LIZ A;  1WBK A;  5P3F A;  4Y50 A;  2RKF A;  4CPR A;  3EMY A;  4YD4 A;  4HEG A;  5P8I A;  3OHF A;  3R0W A;  1D4K A;  4EYR A;  5HU1 A;  5P7H A;  2Q15 A;  5P7L A;  1SGU A;  4Y54 A;  5P8Q A;  3OU1 B;  5P4D A;  3FNT A;  1EPO E;  2AOE A;  1C6Z A;  5P8G A;  2HAH A;  4B1E A;  3MXD A;  2G69 A;  4YCT A;  1T7K A;  3FX5 A;  2HPE A;  1SGZ A;  4Y3G A;  3I25 A;  2AVO A;  5OZZ A;  1VIJ A;  3I2L A;  2ZHU A;  5OYW A;  4DQG A;  3ZKN A;  2Q11 A;  4H3G A;  2R43 A;  3KA2 A;  5AHB A;  5P1H A;  4FCO A;  1G0V A;  2VNN A;  3QPJ A;  3R0Y A;  3MWS A;  4BFD A;  1J71 A;  3M9F A;  5P1J A;  5P6Z A;  2B8L A;  3JW2 A;  4FS4 A;  4L1A A;  2QI4 A;  1LYB B;  1NPA A;  5P1B A;  5P2X A;  2WF4 A;  1W51 A;  1U8G A;  3RTH A;  2IL2 A;  3PI0 A;  3UQR A;  1FQ4 A;  3LIV A;  4Y4T A;  3ZPU A;  5COP A;  1HOS A;  5OZD A;  4XX4 A;  4J17 A;  1MET A;  5OYV A;  3CMS A;  1K6C A;  1SBG A;  2B42 A;  4Y3Y A;  3JVW A;  3D20 A;  5TOL A;  4YD6 A;  4FSE A;  3IVH A;  1MER A;  3OUA A;  3UFN A;  4DQB A;  1YTG A;  5P4H A;  5OZ2 A;  3EL4 A;  1MVP A;  3PBD A;  3TOF A;  5P2D A;  2P83 A;  1HVI A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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