1BILA

Crystallographic studies on the binding modes of p2-p3 butanediamide renin inhibitors
Total Genus 88
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
88
sequence length
337
structure length
334
Chain Sequence
GNTTSSVILTNYMDTQYYGEIGIGTPPQTFKVVFDTGSSNVWVPSSKCSRLYTACVYHKLFDASDSSSYKHNGTELTLRYSTGTVSGFLSQDIITVGGITVTQMFGEVTEMPALPFMLAEFDGVVGMGFIEQAIGRVTPIFDNIISQGVLKEDVFSFYYNRDSESLGGQIVLGGSDPQHYEGNFHYINLIKTGVWQIQMKGVSVGSSTLLCEDGCLALVDTGASYISGSTSSIEKLMEALGAKKRLFDYVVKCNEGPTLPDISFHLGGKEYTLTSADYVFQESYSSKKLCTLAIHAMDIPPPTGPTWALGATFIRKFYTEFDRRNNRIGFALAR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystallographic studies on the binding modes of P2-P3 butanediamide renin inhibitors.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Renin
molecule tags Hydrolase/hydrolase inhibitor
source organism Homo sapiens
total genus 88
structure length 334
sequence length 337
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.4.23.15: Renin.
pdb deposition date 1995-09-27

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00026 Asp Eukaryotic aspartyl protease
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.40.70.10 Mainly Beta Beta Barrel Cathepsin D, subunit A; domain 1 Acid Proteases 1bilA02
2.40.70.10 Mainly Beta Beta Barrel Cathepsin D, subunit A; domain 1 Acid Proteases 1bilA01
5OZ6A 5P7ZA 2G20A 2BQVA 3DV5A 5P5CA 5P12A 1JLDA 5KAOA 3PSGA 3UTLA 2PH8A 4YCKA 5P8FA 5P8UA 3VSWA 1HPOA 2OHLA 4PZXA 5P18A 5P1WA 3U71A 1QBSA 4WTUA 1RV7A 1TSUA 5P3EA 3OU4A 3GI0A 1FFFC 5P7HA 1NPWA 3LIVA 5COKA 5P3IA 4KB9A 5I3WA 4Y50A 1QRPE 3IGBA 4Y4WA 4EP2A 4LXKA 5P2UA 5P6FA 5P0JA 5OYXA 3ZKXA 4Y51A 5SY3A 3G70A 3IXJA 5P5QA 5AH9A 5OYQA 1IBQA 5P8DA 3O9AA 4IVTA 3TTPA 5KR2A 1W51A 4DQHA 5P4MA 5P5JA 1LF2A 3MXEA 2P83A 3BVAA 2IRZA 4ACUA 5P40A 4M8YA 3APPA 5OZXA 5P1GA 4GJ8A 3ZPTA 2AOHA 3OU4B 3LPIA 3SA6A 4AUCA 4QJ2A 2OF0A 4Y44A 5KQXA 3OU3A 3NU3A 5P1PA 1TSQA 5P0SA 5P6PA 4L6BA 5OZKA 3LZYA 5P8BA 1TZSA 2P4JA 3EXOA 3L5DA 1BV7A 5J25A 3T11A 3OY4A 4D83A 1YTHA 1QBTA 5P1IA 4PEPA 1HTRB 4TRYA 5P24A 2ZJIA 5P2IA 3EKQA 1OD1A 3KDDA 2IL2A 1A94A 4LL3A 3O9BA 5P43A 3NDXA 4RYCA 1MIQA 5OZEA 1UH9A 2RKFA 5P7BA 5P3KA 2HB3A 5E5KA 5P6UA 3N3IA 3R0WA 5P6NA 2R43A 4IVSA 3SKFA 1GVWA 5P4HA 2VNMA 4D85A 1IDBA 5OZVA 4DV9A 5P7YA 1GKTA 5P4CA 4J55A 4LP9A 4FL8A 5OZLA 1EBWA 3WSJA 2UY0A 4Y9WA 5P46A 4CKUA 2QMGA 2B7FA 4ZSQA 5P36A 5P1HA 5I3VA 3RTHA 1HIVA 2OHMA 3UHLA 1HTFA 3INHA 3D20A 4YD3A 1WKRA 4Y53A 3T3CA 1BDQA 1UH7A 3EL9A 1DIFA 4TVGA 2ER7E 5P2HA 2V0ZC 3OHFA 1EPNE 5DQ2A 5AH7A 5P89A 3QVCA 1K6TA 5P05A 2IENA 2IQGA 5P8KA 3ZKGA 2JJJA 3EKXA 4X7IA 2RENA 3Q5HA 1BILA 3UDNA 2HS2A 5P3LA 5P68A 5P14A 3GGUA 3JVYA 2FDDA 2PK5A 2AZCA 4RCDA 4TRWA 5P28A 4HZTA 4A4QA 2FXDA 4OD9A 5P3TA 5P30A 2PSUA 4CPUA 3OOZA 4HDPA 5OZNA 5P33A 1D4YA 5P1QA 3EBZA 4CPXA 1KJGA 5P87A 5P5LA 2QI4A 1HHPA 5DR1A 2V11C 3ER5E 5P65A 3CKRA 3IAWA 1IZEA 3ZPSA 3TPJA 2QD6A 2Z54A 4E43A 2NTRA 3I6OA 5OZWA 1SMRA 5P6IA 3PWMA 1IZIA 4GJDA 2J9JA 5P70A 3NSHA 3EL4A 1LS5A 3BGBA 4Y43A 4A6CA 3VF7A 4B72A 4FAEA 5P3DA 2QHYA 1CMSA 2IDWA 5P4GA 4Q1NA 5P4WA 1E80E 2R3WA 4OD9B 5P4QA 5ER1E 4MC6A 5P0PA 3QBFA 3QPJA 1DMPA 4OBDA 4ZPEA 5P3ZA 2FS4A 4RCFA 4F74A 1HVJA 5P59A 5P2WA 5HDVA 5P56A 5JODA 2FGUA 3OXVA 5P25A 5P5ZA 3RTNA 1ENTE 2VS2A 5P2KA 4Y37A 1FG6C 5OZIA 3VSXA 2B42A 2VIJA 2JXRA 3VLBA 1ER8E 5P7EA 2J9JB 2PWRA 4Z50A 1ZLFA 3BHEA 4QJ6A 4J0ZA 4EWOA 5P4DA 5P2ZA 5P3RA 1HXWA 5P8VA 3GI6A 4TRZA 3IN3A 4Y3ZA 3S7MA 3O9EA 1Z1RA 5P0NA 3EC0A 4I0JA 5P2SA 1SGUA 5P7LA 2CENA 2QNNA 3LINA 5P3AA 4L7HA 4AA9A 5P73A 5P7RA 4DQBA 5P4OA 5SZ9A 5KR1A 5P4PA 3D1ZA 1YG9A 2BKTA 5HD0A 4B1DA 3QN8A 1BBSA 2CEMA 1ZTZA 4K4PA 1FLHA 1SIVA 2XFJA 2OHPA 1APUE 3I25A 4R91A 5P55A 3T7QA 5P5SA 2XFKA 4GJ7A 4ER2E 1K6VA 1ZSRA 2BPWA 5P8TA 4RROA 5P0TA 1XL2A 2VA5A 4HA5A 5P3PA 4EPJA 4F73A 1TCWA 3LPKA 1HVSA 1SMEA 5P0KA 1BIMA 3UDHA 2HPEA 1DP5A 1W6IA 4EYRA 1MPPA 3FNSA 4AZYA 5P3VA 4L7JA 4EXHA 3OHHA 5DGWA 4JPEA 1HWRA 1EPLE 4GJBA 5P4TA 3UDPA 3ZKNA 5P62A 3CIDA 1FB7A 5P4SA 3NUOA 5P1UA 3K5FA 3OWNA 2I4WA 4DPIA 1GVUA 1FQ6A 2B7ZA 4KUPA 1IIQA 2V13A 6UPJA 2CEJA 1FQ8A 4Y4DA 3TLHA 3FKTA 2QK5A 3TOHA 4JOOA 2R8NA 2WEBA 3NDTA 1PPME 2ZHSA 3UDKA 3O9CA 2R5PA 5OZTA 5P5UA 4H3GA 3VCMA 1BVGA 1HXBA 3IXOA 4LHHA 5P4IA 1AXAA 1F34A 2HPFA 5P57A 5OZBA 4XKXA 3EM6A 1AZ5A 3Q4BA 5P0IA 1XL5A 1D4KA 4HEGA 4GJAA 5P7WA 2F80A 4QJ9A 1HIIA 5OZDA 3G72A 5P72A 4B0QA 5P3QA 4FSLA 4Z4XA 4XXSA 1PFZA 1YTJA 5P44A 2FDEA 3MSLA 4Y5PA 4KE1A 3GGVA 3KFPA 3RSVA 3EKPA 5P7XA 3O9LA 1FMXA 5P2DA 2PSGA 4H3JA 5P0ZA 5P4NA 2R38A 5P5OA 3FV3A 3CYWA 5P0QA 5KR8A 5P4KA 2WHHA 1HRNA 4BEKA 4LC7A 1LV1A 3OXCA 4PYVA 2AVQA 3WZ7A 1ZPAA 5HCOA 5P7FA 5P1EA 3L5EA 4EJ8A 1G0VA 5OZCA 1QS8A 3OU1A 5HDXA 5P3XA 5P0EA 4YDFA 5P5GA 3PGIA 4DVFA 4I1CA 1FQXA 4Y3HA 4ZPGA 3RTMA 4EHCA 2ASIA 4FGXA 4HE9A 1EEDP 3EL0A 1EBKC 4LBTA 5P6MA 5I3YA 4YD4A 1A8GA 1B11A 1K1TA 3VYDA 4FIVA 5P2YA 4GYEA 2ZJKA 5P3SA 5P6BA 3NU9A 1C70A 3BC4A 4DJVA 3UQUA 1E81E 1VIKA 1HPSA 2PSVA 2ZHRA 2R3TA 2B8LA 2WF1A 5P2JA 4JP9A 4ZPFA 3R0YA 1NSOA 3D3TA 4PPHA 5P7UA 1TW7A 5BS4A 5P0MA 2HM1A 1TQFA 5P20A 5DR4A 3OQKA 2AZ9A 2ZJJA 5P7VA 5P67A 3N4LA 3S56A 5DR7A 1EC1A 4R95A 2V12C 1XN3A 3O99A 3OU1B 5P4AA 1HPXA 2FXEA 3K4VC 2ZJMA 3OXWA 5P1FA 3TOFA 3Q70A 1AAQA 3PWWA 3VV8A 2ZJHA 3QRVA 5P5MA 1ODXA 2WF4A 4DUSA 3H5BA 5P1VA 2AZ8A 2AOGA 2Q64A 3UQRA 1ZBGA 5P51A 4ZSRA 3BXSA 5P08A 1BWAA 3VYFA 4HVPA 5P5XA 2P3DA 3ZLQA 5KQYA 5SY2A 3UDQA 5OZPA 5OZGA 1G2KA 2QD8A 3EM3A 1LF3A 3BUFA 1D4LA 5P4ZA 5P7QA 4I0IA 1K2CA 2APRA 3OTYA 4J54A 4I0ZA 2QI1A 4K9HA 5B18A 1FEJC 1LF4A 5P3BA 2V10C 4I10A 4RVIA 2F8GA 4FM8A 3ZKSA 1HBVA 3VF3A 2V16C 3RU1A 2NMZA 3S45A 2AVOA 5P19A 4FM6A 5P2AA 4DQFA 1SH9A 1W5VA 5PEPA 1M43A 3OK9A 5P0HA 5P5VA 5P88A 3IXKA 3RSXA 5P7DA 3K5GA 4N00A 5P1RA 3APRE 5P1ZA 3VG1A 5P0UA 2NXDA 2QI7A 5AH6A 5P37A 1HOSA 2FDPA 4R5NA 2ANLA 5P03A 1IDAA 1TCXA 2G94A 5P22A 3TPPA 3LITA 3L59A 1T3RA 4DJXA 1D4IA 3PMYA 5P5HA 4EJDA 5P8HA 1XS7D 4ER4E 5F00A 1AJXA 2WL0A 4EQJA 5P5RA 5OYZA 2IS0A 1HTGA 2QAKA 5P42A 4LAPA 5P6XA 1CPIA 3MSKA 5P5AA 3EKTA 5P2CA 5P6ZA 2VJ7A 5HU0A 4ZE6A 3QBHA 3NYGA 2WJOA 3KMXA 3SA3A 3NU5A 3GGXA 4YD7A 3UPJA 3TKWA 2Q3KA 4A6BA 1HVLA 4COEA 5P6DA 2PH6A 4MC9A 3I7EA 1LZQA 5AHCA 2RMPA 2G27A 1M4HA 5OYRA 3MWSA 2QZWA 4Y5GA 5P7NA 3S2OA 3VFBA 3L5BA 4Y35A 3LNKA 5P7JA 7HVPA 3O9GA 1LEEA 5P0DA 5P0XA 4RVXA 5P5FA 3WZ6A 3KA2A 3GW5A 3OQDA 1APVE 2AOJA 5P39A 5P11A 4L1AA 1B6JA 5AGZA 2FMBA 1T7IA 2NXMA 5P48A 3CKPA 3S8IA 1A8KA 4I8WA 2PYMA 5P49A 5P75A 4Y39A 4Y5MA 1ODWA 4Y3JA 4R8YA 3PRSA 4Y3LA 3SACA 3VLAA 4FM7A 5P45A 1SP5A 4DJWA 1XDHA 4J1FA 3NUJA 2F3KA 1E82E 2OAHA 5OYSA 2P3AA 2I4VA 2RSPA 5P8RA 5OYUA 1AVFA 5P81A 2VIEA 3LIYA 1APTE 4RYGA 1B5FA 3PBZA 4Y3PA 5P2LA 2XFIA 4GJ9A 4Y3EA 3TKGA 1MRXA 2VA7A 3SLZA 3O9FA 4DJPA 5P6TA 3EKWA 2BPYA 4Y3XA 3U6AA 1WBKA 4L1AB 5KOSA 4Y4BA 5P31A 4NJVA 4B00A 5P76A 4Y5BA 3ZOVA 3KF0A 4M8XA 1W6HA 5IS4A 3DCRA 2QNQA 5P54A 4RRSA 5P52A 5P82A 2B8VA 3HZCA 3ZPUA 3HVPA 4OBZA 2VA6A 5P5DA 2AVSA 2VJ6A 3CMSA 3DUYA 2Z4OA 2QI0A 4GZFA 5P7IA 1MEUA 4GJCA 1GVXA 3FNTA 4Y36A 3FIVA 5OZHA 1B5FB 1EC2A 5P27A 1SDVA 5KQFA 2QD7A 1SGZA 3NXEA 3S53A 4B78A 4ZEAA 2OHKA 2H6TA 3HW1A 5JFUA 1XE6A 4DJOA 5P1KA 4Y5AA 1YM4A 4LXAA 1K2BA 3DJKA 4YCTA 6FIVA 2IEOA 4Y3WA 3K5DA 3SO9A 4Y4GA 1T6EX 1EPME 4LXMA 3TH9A 2VKMA 2ZHUA 2ZHTA 1RNEA 2G1NA 3T6IA 2QMPA 4OBZB 5P3GA 2QMDA 4QGIA 3ST5A 4GJ5A 3HBOA 4Y3RA 3S85A 5KQZA 4NJTA 4Y45A 3OGPA 4GJ6A 3GI4A 4H1EA 4Y3FA 4B1EA 2G1RA 4I0FA 5P34A 4Y4ZA 4OBHA 2XYEA 5ISJA 1RQ9A 1VIJA 2BKSA 4F76A 5P6EA 4K4QA 3ZMGA 4UPJA 5IVSA 5P13A 4NJUA 2HB4A 3IVHA 3DOXA 1LYWA 2O4LA 5P7PA 4Y4TA 5P23A 3KDCA 3QP0A 5P02A 4RLDA 3IVIA 3QRMA 3L58A 5OZ1A 3OADA 3SA5A 1IZHA 4QJ7A 4Y5KA 5OZ5A 3DV1A 4DQEA 4I8ZA 4DJUA 4Y3SA 4ZSMA 5P4BA 4GB2A 5OZYA 3S7LA 3PBDA 1B6KA 5P3UA 2RKGA 2AOIA 5IVTA 5P2VA 4XX3A 3OXXA 2F3EA 3OUCA 4DQCA 5P58A 2P3BA 5P69A 2O4KA 5P0WA 4J1EA 4CPSA 4EJLA 3QAAA 4OBFA 2NNKA 3K5CA 4PHVA 4J0TA 2QZXA 1LYWB 3PB5A 1KJ7A 3R2FA 4J0YA 1YX9A 4GMIA 3SQFA 3OQFA 3LHGA 3OADB 4Q5MA 3U7SA 2ER0E 3R4BA 3INEA 3NR6A 5P8MA 3UCBA 2O4SA 3SM2A 1ZPKA 4J0VA 1EPPE 4YE3A 5P4RA 3ECGA 5P6OA 4HDBA 5P6LA 2V00A 1XN2A 5OZQA 2AOFA 2QMFA 3UF3A 3PMUA 1Z1HA 2P3BB 5P78A 2OHNA 1GNOA 2QI5A 3LIQA 5P5BA 5P8NA 4BELA 2ER9E 3NLSA 4Y4XA 5P2FA 5P5WA 5COOA 3ZKMA 5HE5A 1GVTA 3SA9A 1F7AA 3LIXA 4RGHA 2OHRA 3D1YA 1GVVA 3G6ZA 2Q54A 3KFNA 5P8QA 1FMUA 2NNPA 2PC0A 4WY1A 5OYYA 3HAUA 1EBYA 5P4XA 3CYXA 1B6PA 5P38A 2OHUA 1SBGA 3HD8A 5OZ7A 4CPRA 1NH0A 1C6ZA 3UDMA 3HDKA 4EJKA 1PSNA 2G1OA 5P2QA 5OZ4A 2P3CA 4RCEA 5P1AA 4FAFA 3QROA 5P8AA 5P0RA 2AOEA 3BGCA 4NKKA 5CLMA 1DAZC 3UFLA 3ZKIA 1FQ7A 2Q15A 5P3WA 1D4SA 3GI5A 5OZ9A 3UQPA 1E5OE 3FNUA 5P8PA 2VIZA 1PPKE 3SABA 4I0DA 5P1DA 1AM5A 2NR6A 1KZKA 2ZJLA 5DQ5A 3H0BA 2R9BA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 5OZ6 A;  5P7Z A;  2G20 A;  2BQV A;  3DV5 A;  5P5C A;  5P12 A;  1JLD A;  5KAO A;  3PSG A;  3UTL A;  2PH8 A;  4YCK A;  5P8F A;  5P8U A;  3VSW A;  1HPO A;  2OHL A;  4PZX A;  5P18 A;  5P1W A;  3U71 A;  1QBS A;  4WTU A;  1RV7 A;  1TSU A;  5P3E A;  3OU4 A;  3GI0 A;  1FFF C;  5P7H A;  1NPW A;  3LIV A;  5COK A;  5P3I A;  4KB9 A;  5I3W A;  4Y50 A;  1QRP E;  3IGB A;  4Y4W A;  4EP2 A;  4LXK A;  5P2U A;  5P6F A;  5P0J A;  5OYX A;  3ZKX A;  4Y51 A;  5SY3 A;  3G70 A;  3IXJ A;  5P5Q A;  5AH9 A;  5OYQ A;  1IBQ A;  5P8D A;  3O9A A;  4IVT A;  3TTP A;  5KR2 A;  1W51 A;  4DQH A;  5P4M A;  5P5J A;  1LF2 A;  3MXE A;  2P83 A;  3BVA A;  2IRZ A;  4ACU A;  5P40 A;  4M8Y A;  3APP A;  5OZX A;  5P1G A;  4GJ8 A;  3ZPT A;  2AOH A;  3OU4 B;  3LPI A;  3SA6 A;  4AUC A;  4QJ2 A;  2OF0 A;  4Y44 A;  5KQX A;  3OU3 A;  3NU3 A;  5P1P A;  1TSQ A;  5P0S A;  5P6P A;  4L6B A;  5OZK A;  3LZY A;  5P8B A;  1TZS A;  2P4J A;  3EXO A;  3L5D A;  1BV7 A;  5J25 A;  3T11 A;  3OY4 A;  4D83 A;  1YTH A;  1QBT A;  5P1I A;  4PEP A;  1HTR B;  4TRY A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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