1DP5A

The structure of proteinase a complexed with a ia3 mutant inhibitor
Total Genus 91
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
91
sequence length
329
structure length
329
Chain Sequence
GGHDVPLTNYLNAQYYTDITLGTPPQNFKVILDTGSSNLWVPSNECGSLACFLHSKYDHEASSSYKANGTEFAIQYGTGSLEGYISQDTLSIGDLTIPKQDFAEATSEPGLTFAFGKFDGILGLGYDTISVDKVVPPFYNAIQQDLLDEKRFAFYLGDTSKDTENGGEATFGGIDESKFKGDITWLPVRRKAYWEVKFEGIGLGDEYAELESHGAAIDTGTSLITLPSGLAEMINAEIGAKKGWTGQYTLDCNTRDNLPDLIFNFNGYNFTIGPYDYTLEVSGSCISAITPMDFPEPVGPLAIVGDAFLRKYYSIYDLGNNAVGLAKAI
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title The aspartic proteinase from Saccharomyces cerevisiae folds its own inhibitor into a helix.
pubmed doi rcsb
molecule keywords PROTEINASE A
molecule tags Hydrolase/hydrolase inhibitor
source organism Saccharomyces cerevisiae
total genus 91
structure length 329
sequence length 329
ec nomenclature ec 3.4.23.25: Saccharopepsin.
pdb deposition date 1999-12-23

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00026 Asp Eukaryotic aspartyl protease
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.40.70.10 Mainly Beta Beta Barrel Cathepsin D, subunit A; domain 1 Acid Proteases 1dp5A01
2.40.70.10 Mainly Beta Beta Barrel Cathepsin D, subunit A; domain 1 Acid Proteases 1dp5A02
5JODA 2I4UA 2Q11A 4ZPFA 3K5CA 3K5DA 4J55A 3ZKSA 3D20A 3UQUA 5HE7A 5P0RA 3VF5A 5P65A 5P7XA 1LYBB 5P04A 5P4RA 3FNTA 4RGHA 5P35A 5P80A 3IA9A 2ZDZA 4Y3XA 1T6GA 1B6MA 1EAGA 2IDWA 4EP3A 1DW6C 4RLDA 4Y3GA 3INFA 5P2RA 4RRNA 5P1ZA 5P6KA 5P3JA 4NJVA 3MSJA 3OGQA 4JPEA 5HDZA 2AODA 4Y3HA 5P6EA 5I3VA 4NJSA 4ZSMA 1SMRA 5OZJA 5P3FA 5P2VA 3SA8A 2HB4A 3NWQA 1VIJA 5P6MA 5P37A 3EL0A 4MC6A 5COKA 3UFNA 3B7VA 1FQ4A 1M4HA 3UQWA 5P6WA 2AZ9A 5P1JA 3OTSA 3UCBA 4HDFA 2F80A 4ACUA 2PC0A 4FS4A 1LYAA 1HSGA 5P3QA 2I0AA 1C6YA 3PBZA 5I3YA 5P62A 2OHPA 5P13A 4ZE6A 5P89A 2AOHA 1TQFA 2O40A 1M0BA 3IVHA 3NSHA 5DR7A 3IN4A 4GJ9A 4Q1WA 3SABA 4Y39A 5P6SA 1M43A 3NU9A 3EL4A 1Q9PA 3OU1B 5P40A 5P5CA 2XYEA 4Y45A 5T4SA 3GI5A 5P1VA 4EQ0A 5OZKA 1YM4A 1C6XA 3S7MA 2ZHTA 3FV3A 3VV7A 5IVTA 1UH9A 3O9BA 5OZYA 5P8LA 1LV1A 4Y3JA 4EXHA 3VEUA 3UF3A 5OZ7A 1HTRB 4Y4BA 2G1RA 3HD8A 5EZZA 4X2LA 1QBUA 2B8VA 5OZMA 5P7FA 3VG1A 2R43A 1PPKE 1YTHA 3HW1A 4Y4XA 3OTYA 4B05A 2MIPA 5AH6A 5C9DA 5P5LA 1A8GA 4GJ8A 3QBHA 4Y4UA 2J9KA 3OHHA 1FFFC 2ZJLA 2UXZA 5P66A 3OUDA 3KMXA 1GVTA 4RVXA 3SA6A 4PZXA 5KR0A 4Z4XA 2OHLA 2HAHA 3CMSA 4B78A 4K8SA 3KT5A 4M8XA 1FMXA 4Q1XA 3OQDA 5P3KA 1IDBA 3GGXA 5P22A 5IS4A 1MT7A 2Q15A 3NXEA 5P6LA 5P74A 3BRAA 5DR0A 3PMYA 3LINA 1A8KA 1ZSFA 3S53A 4H3FA 5P7GA 5P1WA 5P03A 3EXOA 2QMFA 4R95A 1EC3A 3MWSA 2HB2A 1TW7A 4AMTA 3QRVA 3OADB 2BPXA 2V10C 5P6FA 5P6TA 1KJ7A 4ACXA 2O4KA 3N3IA 4IVSA 4JP9A 1HPVA 1HPXA 4Y36A 2VIYA 3NUJA 5P3LA 2R3WA 1K6TA 1BDRA 3EKWA 5P6CA 3RTHA 3DJKA 3M9FA 4J0PA 2ANLA 5TOLA 5P57A 3RU1A 5DGWA 5P3XA 4DQFA 3KDDA 3RSVA 4DJXA 5OZEA 3LZVA 5OZOA 2OHKA 1NSOA 1BDLA 5ISKA 3S85A 3OAGA 3BXSA 2PYMA 3CYXA 5P8HA 5P5DA 5P7WA 4FAEA 4EQJA 5P0LA 3ER5E 5P0TA 2QMDA 3TOGA 3LIZA 4DPFA 2G22A 4AZYA 5JFPA 1EBWA 1K6VA 3PLDA 5P43A 4WY6A 1ZP8A 1B5FA 1EBYA 3VFBA 1AM5A 1A9MA 1TZSA 4PYVA 4CPSA 3MSLA 1MRWA 5DPZA 3S54A 2JE4A 5P3ZA 3F9QA 1BV9A 5P5XA 5P0KA 5OZZA 1YTJA 5OYQA 1NPAA 2PSUA 2BBBA 5P0HA 3SO9A 3OUAA 4YD4A 5P47A 4H1EA 4HLAA 2QCIA 5P8KA 1ZPKA 3FX5A 2F3FA 5OZ6A 4I0GA 3OU3A 4H3IA 5P38A 1CZIE 1MESA 5P2BA 5P3OA 1HHPA 3NU5A 1OEXA 4HVPA 5P3WA 4EPJA 3QP0A 2QZLA 5DQ4A 1NPVA 3AIDA 5P33A 4L7HA 1DMPA 4DH6A 4FRSA 5P78A 5AHCA 1ODWA 4FSLA 2IKUA 2VIEA 4L7JA 2QNQA 3TOHA 3BGBA 5B18A 3K5GA 4KE1A 1FQ7A 5KQZA 3IAWA 4B1DA 4U8WA 3HDKA 4FLGA 3U71A 4YBFA 1FG8C 5P4WA 2OHQA 2ER0E 2HPEA 5P3AA 2A1EA 1T7JA 1WKRA 5P7VA 5P3MA 1APTE 3KYRA 1SH9A 1TCWA 5P5KA 1XN3A 5P6BA 2QZXA 1HIIA 4J5JA 5P2HA 4I0IA 1NPWA 5P87A 1MT9A 5P4OA 5P4ZA 4I0FA 5P1UA 3SA4A 3VFAA 4KB9A 4ZIPA 2FXDA 2NPHA 2ER7E 4ZPGA 5P2AA 5AH8A 5P81A 4EWOA 1DPJA 5P6GA 4I0JA 1D4KA 2NXDA 2AVQA 4GJAA 4JOOA 1XE5A 4FSEA 5P3NA 3TTPA 1LYWA 2G1OA 3UDRA 1BV7A 5P15A 5P8OA 5P4CA 3L58A 1GVVA 2FNSA 5P28A 5I3WA 1T6EX 5DQCA 2R8NA 1GNMA 3OU4A 3IVIA 5P77A 5HU0A 5P19A 4HDBA 5SY2A 2OHUA 3ZKIA 3DOXA 5P1SA 4Y3FA 2FMBA 3WZ6A 3QPJA 4Y5AA 1HSHA 5P4IA 5P63A 1BIMA 1K1TA 1HVSA 4XX4A 3L5FA 3PSUA 1W5VA 2RMPA 4HE9A 3TPPA 2OHRA 5P5OA 3SLZA 2O4NA 5P6UA 1LZQA 2PH6A 5P8AA 2IQGA 5P1NA 4J0ZA 1D4YA 4ZSPA 5P6XA 3EL9A 5P84A 2QI6A 5P2FA 4Y5LA 1ME6A 3FSMA 3R0YA 3PSYA 2AVMA 2VIJA 1K1UA 2SAMA 4EJ8A 5P68A 2XFJA 5P0PA 2WF2A 2PWCA 5P79A 4Y5CA 3WZ8A 5KQXA 4H3GA 5IVSA 2Q54A 1B6PA 2OHTA 5P1EA 4DV9A 3GGAA 4TRZA 4CPUA 2ER6E 2VNNA 5DGUA 3S45A 3T6IA 1RL8A 3NDWA 1IIQA 3EM6A 2A4FA 2AOFA 5KQYA 5P0IA 5P25A 5HDVA 5OZUA 2Q3KA 5OZ2A 2AZBA 4H3JA 4J1HA 5JG1A 3UQRA 4EYRA 5P3GA 1EEDP 5P5MA 4RCFA 4COEA 5OZ3A 5P52A 5OYUA 4BFDA 2FDEA 3OXXA 4GJBA 5OZTA 3HAUA 5P7MA 3ECGA 5P8FA 3GGVA 4Y3AA 4Y50A 5P8IA 5P4KA 4GZFA 2B7FA 5P3PA 4QJ6A 1HXBA 1KJHA 2F3KA 4JPCA 1AJVA 3L38A 4ER1E 5P17A 3GI0A 4L7GA 3ZLQA 3U6AA 1FQ6A 5HDXA 1EBKC 5P5GA 2P3CA 5KOQA 3CKRA 5P8CA 8HVPA 4Y5EA 5HE5A 5P5VA 2V13A 5P7RA 5P16A 3VLAA 5OZCA 4RYGA 3NDTA 3OUCA 4Y48A 5OZ0A 3IN3A 3INEA 1EBZA 2RKFA 5KR2A 5P42A 3BXRA 5DQ1A 4HZTA 3HLOA 3PM4A 3KMYA 1SIPA 3BHEA 2BPVA 2QHYA 2VJ9A 1FQ5A 5OZAA 3TKGA 3D3TA 4Y44A 5P7EA 2IRZA 3DV5A 3VSWA 1YM2A 5OYZA 1TCXA 1AJXA 3S7LA 1FQ8A 1K6PA 1BAIA 4FIVA 5P7NA 3LIYA 5P5EA 2FGUA 2VJ7A 4Y5GA 5OYYA 3R4BA 4Y5MA 2JXRA 5P4SA 5OYTA 2I4WA 3I2LA 5P7KA 5KQFA 4I12A 1BVGA 2OAHA 2BPYA 2AOJA 2FGVA 5P0NA 1EPRE 1QRPE 1SDUA 6UPJA 5P2QA 2Z4OA 1BWAA 5P8BA 5P00A 2Q5KA 2AZ8A 2H6SA 1HOSA 5OZPA 1MTBA 2ZJMA 3GW5A 2V0ZC 2ZHUA 3ZKXA 5P01A 2JJIA 3HBOA 5P3BA 1BDQA 3R0WA 3EL5A 5P31A 4Y57A 2HB3A 2JYSA 1B11A 1B6JA 3ZPTA 3I25A 2HPFA 3MXEA 1AZ5A 4FCOA 5P45A 1ZPAA 5P8MA 2AOIA 5P2ZA 1CPIA 2V16C 1FMBA 4Z50A 4DFGA 3LIVA 4OD9B 2G24A 4Z2ZA 2APRA 1T3RA 3ZKNA 1LYBA 1D4IA 5P0GA 5P7DA 4F76A 4OBFA 5P8EA 5P71A 5P64A 3PRSA 4J1EA 1EC2A 5P30A 3JVWA 5P5YA 3OUDB 2R9BA 4BEKA 2P8HA 4I11A 1HWRA 5P2OA 3EL1A 1W5XA 5P1QA 4OBJA 2RENA 2PSVA 4Y3QA 5P1HA 5P2CA 5BWYA 5P2SA 5P2WA 5P5SA 5P20A 5P0EA 5P4XA 5P7BA 4Y56A 3KDCA 2QNPA 1D4HA 5P5PA 3RVIA 4Y3EA 5P6RA 3VLBA 5P29A 3VYFA 3TPLA 4DJOA 1LEEA 5P0ZA 5OYWA 4Y4DA 5P8NA 1W5WA 1SIVA 4FL8A 4Y51A 1XL5A 3CICA 5DR4A 4CPQA 5P08A 5P36A 4YD6A 4OC6A 2F8GA 3L5DA 2V00A 3OU1A 1MVPA 5P3UA 3BUHA 2H6TA 1APVE 3ZKMA 3MXDA 5P7TA 4YOAA 3PHVA 1G0VA 3NYGA 4Y4WA 2QI0A 3OQAA 5P5AA 2Q64A 1T7IA 5P70A 4FRJA 1RQ9A 4K9HA 3SM2A 3UFLA 4Y38A 2PSGA 3RTNA 5EZXA 3KFRA 3NU4A 5P5IA 2BKSA 2AOGA 4R8YA 3KDBA 4J1FA 5OYXA 3I6OA 3L3AA 3DUYA 5UPJA 3QVIA 1MTRA 5P7HA 4ZSQA 1Z1HA 4FM8A 5P27A 3UDJA 4K4PA 4YCTA 1APUE 1ZLFA 2G27A 3OUBA 3SA5A 2AOCA 3EKXA 2G21A 1FLHA 5P8SA 1XL2A 2OHNA 5P7QA 2IKOA 3PI5A 3APRE 3L5BA 2IEOA 3OADA 4IVTA 5OZ4A 4DJRA 2VIZA 2PK5A 4CPXA 1RNEA 2PWRA 3Q70A 5P1YA 1GVWA 1GNOA 3Q5HA 4Y3TA 1MRXA 5P48A 3VF3A 3T7PA 5OYRA 2J9JA 3O9IA 2PQZA 5P1TA 3AUPA 2IL2A 2XFKA 4EP2A 3ZOVA 1FFIC 3SA7A 1AIDA 5P2YA 4FM6A 3O9EA 1HTFA 1BILA 3OXWA 3KFPA 5P24A 5P6VA 3TPJA 4K4QA 1FIVA 4YD7A 4Y6MA 1LF4A 4DJQA 4DUSA 1HVIA 3PWMA 5P3DA 3R2FA 1KZKA 4DQHA 4I10A 5OZ1A 4QGIA 5P1CA 4CKUA 1FMUA 2PMAA 3BUGA 4I8ZA 5P3RA 2Q55A 4DJVA 4GJ6A 5IVQA 1PSNA 5P6OA 5BRYA 4DPIA 3WZ7A 4MC9A 5DR1A 5KR1A 1B6LA 3K1WA 5OZDA 3QAAA 3VUCA 4TVGA 2QHCA 5J25A 4Q1YA 1VIKA 4J54A 4Y41A 1SGUA 5P2KA 3R1GB 5P11A 4AUCA 2HIZA 4B1EA 5P7AA 3L5CA 3OQFA 2FXEA 3LZSA 3CIBA 1ZTZA 3KF0A 1AVFA 2I1AA 4TRYA 5P6YA 4OBZB 2QU3A 5E5JA 5OZSA 3IXOA 1SP5A 2QI4A 3B80A 4QJ7A 5P2LA 2XYFA 3I8WA 1K2BA 2B7ZA 3ZKGA 1BXOA 5I70A 3OXCA 5AGZA 2AZCA 2ZJKA 3EKTA 4D85A 4Y43A 5AHBA 1U8GA 4L1AB 2ZE1A 1UH8A 4LP9A 4ZEAA 2F81A 2PH8A 5BS4A 4D83A 5P23A 5P5QA 4CPWA 1B6KA 3URJA 3TNEA 1HXWA 4RVIA 3N4LA 2HS1A 3ST5A 1E81E 5P7CA 5P4FA 2BPWA 3ZPUA 1FG6C 4J1CA 1OHRA 2VA5A 4OBKA 4CPRA 1HVKA 4R5NA 4LXMA 3LIXA 3O99A 3D1XA 4DJWA 1IZEA 3S56A 4JECA 3UDPA 3O9FA 2G1NA 1K6CA 1DIFA 2ZGAA 3T3CA 3PSGA 2B60A 4PEPA 3S43A 4Y3NA 5P0OA 5P7YA 4RRSA 4YD3A 2VA7A 2FS4A 4I0DA 2FDDA 2VS2A 1BXQA 5OYVA 2WEZA 3LIQA 2QZWA 3UDQA 2FIVA 1FF0C 3PEPA 5P1RA 3URLA 1W6HA 5P3YA 2VA6A 5P51A 3EC0A 4XX3A 3TPRA 4Y5BA 5P6JA 3L59A 9HVPA 5P32A 1HTGA 2NXLA 2B8LA 4DI2A 2RSPA 1SBGA 1HRNA 5P2UA 5P7JA 5P56A 4Y3PA 3NXNA 2CENA 5P8JA 4Y3YA 5P2XA 3O9CA 3ZKQA 4GB2A 5DR8A 4I0EA 3TH9A 4B77A 4I1CA 2AIDA 3CIDA 1MUIA 4KUPA 3CKPA 2WEAA 5HTZA 1BBSA 3NDUA 2I4QA 4I0ZA 1PSOE 1E80E 5P3EA 2VNMA 5P5BA 4RROA 1HVJA 1QBRA 2P3BA 3VV8A 1Z1RA 3T11A 1YT9A 3WSJA 2B42A 3PB5A 5OYSA 2WHHA 3O9DA 4Y5NA 3HZCA 1IZDA 4ER2E 5P1OA 5P7IA 5P8UA 3VV6A 5P09A 4HA5A 3VSXA 3T7XA 4Y35A 4R91A 5OZWA 3IGBA 4DJUA 2ASIA 2ZJHA 3VYEA 5SY3A 5HU1A 3DK1A 3RTMA 2OHSA 5KOSA 3SAAA 4Y54A 1G35A 2IS0A 4M8YA 5P5RA 4ER4E 5I3XA 2WL0A 5P8RA 1ZAPA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 5JOD A;  2I4U A;  2Q11 A;  4ZPF A;  3K5C A;  3K5D A;  4J55 A;  3ZKS A;  3D20 A;  3UQU A;  5HE7 A;  5P0R A;  3VF5 A;  5P65 A;  5P7X A;  1LYB B;  5P04 A;  5P4R A;  3FNT A;  4RGH A;  5P35 A;  5P80 A;  3IA9 A;  2ZDZ A;  4Y3X A;  1T6G A;  1B6M A;  1EAG A;  2IDW A;  4EP3 A;  1DW6 C;  4RLD A;  4Y3G A;  3INF A;  5P2R A;  4RRN A;  5P1Z A;  5P6K A;  5P3J A;  4NJV A;  3MSJ A;  3OGQ A;  4JPE A;  5HDZ A;  2AOD A;  4Y3H A;  5P6E A;  5I3V A;  4NJS A;  4ZSM A;  1SMR A;  5OZJ A;  5P3F A;  5P2V A;  3SA8 A;  2HB4 A;  3NWQ A;  1VIJ A;  5P6M A;  5P37 A;  3EL0 A;  4MC6 A;  5COK A;  3UFN A;  3B7V A;  1FQ4 A;  1M4H A;  3UQW A;  5P6W A;  2AZ9 A;  5P1J A;  3OTS A;  3UCB A;  4HDF A;  2F80 A;  4ACU A;  2PC0 A;  4FS4 A;  1LYA A;  1HSG A;  5P3Q A;  2I0A A;  1C6Y A;  3PBZ A;  5I3Y A;  5P62 A;  2OHP A;  5P13 A;  4ZE6 A;  5P89 A;  2AOH A;  1TQF A;  2O40 A;  1M0B A;  3IVH A;  3NSH A;  5DR7 A;  3IN4 A;  4GJ9 A;  4Q1W A;  3SAB A;  4Y39 A;  5P6S A;  1M43 A;  3NU9 A;  3EL4 A;  1Q9P A;  3OU1 B;  5P40 A;  5P5C A;  2XYE A;  4Y45 A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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