1E81E

Endothiapepsin complex with renin inhibitor merck-kgaa-emd61395
Total Genus 86
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
86
sequence length
330
structure length
330
Chain Sequence
STGSATTTPIDSLDDAYITPVQIGTPAQTLNLDFDTGSSDLWVFSSETTASEVDGQTIYTPSKSTTAKLLSGATWSISYGDGSSSSGDVYTDTVSVGGLTVTGQAVESAKKVSSSFTEDSTIDGLLGLAFSTLNTVSPTQQKTFFDNAKASLDSPVFTADLGYHAPGTYNFGFIDTTAYTGSITYTAVSTKQGFWEWTSTGYAVGSGTFKSTSIDGIADTGTTLLYLPATVVSAYWAQVSGAKSSSSVGGYVFPCSATLPSFTFGVGSARIVIPGDYIDFGPISTGSSSCFGGIQSSAGIGINIFGDVALKAAFVVFNGATTPTLGFASK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Refinement of Four Endothiapepsin Inhibitor Complexes. Crystallographic Studies of Cytochrome Ch from Methylobacterium Extorquens and Inhibitor Complexes of Aspartic Proteinases.
rcsb
molecule keywords ENDOTHIAPEPSIN
molecule tags Hydrolase/hydrolase inhibitor
total genus 86
structure length 330
sequence length 330
ec nomenclature ec 3.4.23.22: Endothiapepsin.
pdb deposition date 2000-09-15

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
E PF00026 Asp Eukaryotic aspartyl protease
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.40.70.10 Mainly Beta Beta Barrel Cathepsin D, subunit A; domain 1 Acid Proteases 1e81E02
2.40.70.10 Mainly Beta Beta Barrel Cathepsin D, subunit A; domain 1 Acid Proteases 1e81E01
5OZZA 5KR8A 1W5WA 2RKFA 1HIHA 4D89A 2XFIA 4PZWA 1EPLE 3K5GA 1SDTA 5HU0A 5P7EA 4DUSA 1BV9A 5HDXA 5IVQA 4YBIA 3O9DA 4QGIA 5DR7A 3LIQA 5P6JA 3NSHA 5ENKA 1UH8A 1BXQA 1ZSRA 3L5CA 4AA9A 4Y3EA 5P2ZA 3WZ8A 1QBTA 2VIYA 5HDVA 3LZYA 5OZFA 4ACXA 5ISJA 5I3WA 3HAUA 5P2IA 9HVPA 5DR8A 4Y3XA 5P5ZA 1BILA 3EKQA 3SABA 5P12A 1TSQA 4LXKA 3H5BA 4F76A 1LYWA 1GNMA 1MSNA 5P8KA 4YOAA 2I0AA 3RVIA 2J9KA 4PHVA 4I0DA 1LYAB 1A94A 4BFDA 3OXVA 4DJPA 3WSJA 1M4HA 1PROA 5P45A 3EKPA 4PPHA 2JXRA 2OHUA 4DH6A 1B6LA 2PK6A 3OQKA 2WKZA 4L1AB 4U7QA 3TOFA 5P1WA 1ODXA 4JPCA 4RLDA 3PWWA 5P08A 3UQXA 3OGQA 4I0FA 4Q1YA 4ZSRA 2PH8A 3SACA 2VJ6A 5P6HA 1E81E 3DV5A 4Y4ZA 4I0EA 4ZPGA 5OZ2A 4YDFA 3UCBA 4NJTA 1FMXA 5P0BA 2WF3A 2Z4OA 5P7JA 4AMTA 1HPSA 1IDBA 1W5YA 4FE6A 3I7EA 4RCEA 1EBYA 4GJ7A 4OBZB 1EPNE 2QHYA 5ER2E 3K1WA 3KYRA 2G1SA 2OHRA 4LXMA 2VJ7A 3QPJA 5P1JA 4K8SA 5P8VA 5P7ZA 3HBOA 5AHBA 1HVKA 1FMBA 5P3JA 3NUOA 2QHCA 4Y5PA 2JE4A 3M9FA 3UDPA 5AGZA 1U8GA 4FM7A 4YD7A 4Y48A 3RSXA 1WKRA 4DV9A 2EWYA 1TCWA 2WF0A 3T3CA 4RVXA 2HPFA 2AZCA 1YG9A 4HVPA 1EBWA 3WB5A 1MUIA 1K6CA 1DAZC 5P42A 3RU1A 5P8SA 5KQZA 1D4LA 1B6JA 4Y9WA 2PMAA 5E5JA 5P84A 1N49A 4FCOA 5P5GA 5P7RA 1LV1A 2PYNA 1Q9PA 5P6WA 4A6BA 4ZIPA 2BBBA 2ZHRA 1B5FA 1CMSA 5P01A 4Y44A 4Q1XA 3CIDA 3T7PA 5OZ3A 3PLDA 3UHLA 5P48A 4Q1WA 5OYWA 5P1HA 3IN4A 3K5FA 4DPFA 4KE0A 1NH0A 1E82E 2FNSA 5OZTA 2OF0A 4L7GA 2VS2A 5P74A 4U8WA 5P3NA 5P5HA 5P7YA 3PMYA 1IDAA 3OQAA 3PSGA 5P1DA 4FRIA 5IE1A 1VIKA 4YCTA 4CPUA 1D4IA 4I0GA 1B6MA 5P46A 4Y47A 2OAHA 5P58A 4DFGA 5P1SA 4ER2E 2JJIA 5P4YA 5P7HA 3VFBA 4DQBA 5DQ4A 1HVSA 3O9BA 4X7IA 2V0ZC 1YTGA 1NPWA 4PZXA 2G1OA 5KQYA 1HVCA 3GI0A 5P4RA 5P7KA 4CPRA 3GGXA 3IN3A 2VA5A 1D4KA 5P3YA 5P6LA 2FIVA 2VKMA 3TKGA 2ER7E 3UDKA 1YTJA 2AOCA 3OUAA 4R93A 5DQ5A 4B0QA 5P8TA 3NXNA 4NPTA 4B05A 1A8KA 5P56A 3RTNA 3FV3A 5P6IA 1AJVA 1HHPA 2WJOA 3BUHA 3OHFA 4U7VA 5OZHA 5OYYA 3ZKQA 3VSWA 1FQ8A 2R9BA 4OBHA 3CICA 4B72A 4WY1A 4ACUA 5P78A 2PQZA 5P8QA 1GVXA 5AH7A 5OZRA 2QI6A 4Y5LA 2F8GA 1D4HA 5P0EA 2IGXA 2HM1A 3PHVA 5OZUA 2I4QA 5OZNA 3SA7A 5I3VA 4FIVA 5P71A 4QJ6A 1HOSA 1ODWA 3PBZA 5OZWA 2I4DA 5OYZA 2V12C 3SQFA 5KOSA 4TVHA 5DQCA 5P15A 3O9EA 2AOFA 5P8IA 5P55A 3LIYA 4R92A 4Y50A 2HB4A 1D4YA 2P3BB 2NNKA 4YD3A 4YD6A 4X2LA 5KR0A 3RTHA 4Y3MA 4HZTA 5DGUA 1W51A 1SIVA 1G6LA 3C9XA 3EL5A 3L3AA 4CPSA 4DJQA 3OAGB 5P5JA 1T6EX 3QI1A 5P59A 2QI4A 3TNEA 2FDPA 3UFLA 4I11A 5P54A 1HTFA 3Q4BA 1BV7A 3LPIA 1KZKA 1IZIA 5DR4A 5OZJA 2B7FA 1IZEA 1HSIA 3ECGA 2OHQA 5P27A 2ZJNA 2WEBA 4LC7A 2PSUA 5P63A 2BB9A 2CENA 4KE1A 4OD9A 1HVHA 4Y41A 3OTSA 5P6TA 3A2OA 4ZSQA 3N3IA 2VNNA 4I0HA 1LYAA 2O4NA 3TKWA 3IVIA 5P8MA 3TH9A 3K4VC 4EJDA 5P4JA 3PWMA 2IS0A 1MESA 1K2BA 1T7IA 3HZCA 4B00A 1YTHA 1FQ7A 5P6BA 2WECA 5P1UA 3H0BA 3BGBA 3D91A 1LF4A 2IKOA 3HAWA 3BC4A 4MC9A 5P7PA 4DQHA 4NPUA 5AHAA 1SMEA 2Z54A 4M8XA 1META 1RL8A 4TVGA 3VEUA 3LIVA 5OZGA 1M43A 3FNSA 4K4QA 1KJGA 4D8CA 5P40A 4FLGA 4LBTA 4Y39A 3INDA 3BUGA 3DCKA 3VV7A 4ZPEA 3S53A 1HIVA 5OZIA 5P4SA 3GW5A 5P7TA 1K6VA 4HDBA 5P36A 2RENA 3SA9A 5P5QA 4DJYA 5P0XA 5P19A 3OWNA 1EAGA 1EPQE 3VV8A 4A4QA 4DJXA 3FNUA 5P57A 3NU3A 5P7XA 3Q3TA 1FG8C 4CPQA 2PSVA 1YX9A 5P3LA 5AH6A 5OYSA 4GJ8A 2OHPA 3K5DA 5P28A 4J0ZA 1BVEA 3FIVA 3EM6A 5P13A 4Y3TA 5AHCA 5P8JA 5P35A 4OBDA 2OHKA 2IRZA 5DR3A 4NJUA 5P5BA 1LYBB 3NUJA 5P0HA 5P1QA 2IQGA 3UQPA 3L5DA 5CLMA 2AOJA 5CONA 5P0SA 1W50A 1XN3A 5P1XA 5P22A 1W6HA 1MTBA 5P5PA 5HCTA 4B70A 5P6DA 3OQDA 5OZBA 5COPA 5P37A 5J25A 4NJVA 1ZP8A 2WF2A 5P4BA 4GMIA 1ME6A 3GGUA 2QI5A 5IVRA 4J1CA 4AA8A 1EC0A 4L6BA 4I1CA 1FFIC 2VIJA 3ER5E 1KJFA 5P3WA 3NLSA 1W6IA 3NDXA 5P73A 1K6PA 3SA3A 5P2OA 5P2CA 4WTUA 1MSMA 3EL4A 1FGCC 2AOGA 5P31A 3CYWA 1T6GA 3OU1B 5P4KA 3IGBA 3D1YA 3S8IA 4QJ2A 5P8UA 1FF0C 3VSXA 4E43A 1QS8A 3FX5A 4EQJA 2QU3A 4D88A 3OUCA 3WZ7A 1HPXA 4DJOA 5P14A 2AVOA 3KT2A 4XXSA 3PI5A 5P4NA 1UPJA 4Y57A 1D4JA 3KMXA 3LZSA 3PSYA 1G35A 1QBRA 5F01A 5P2VA 5B18A 3VG1A 1MEUA 5ER1E 5FIVA 2PWCA 5P5DA 2VJ9A 3T11A 2BQVA 5HE4A 3QRVA 1MT9A 3UDQA 5P0QA 3Q6YA 2WEAA 4RYCA 3VUCA 5P1LA 2PC0A 3NU6A 3OUDB 5SY3A 4R95A 4YCYA 4Y3FA 2ZJJA 1HWRA 1PSOE 5P47A 5P7FA 5P0KA 3QROA 3ZKMA 6FIVA 5P1ZA 1GNNA 2A4FA 5HU1A 1MRWA 1ZAPA 4Y56A 3U6AA 1EPME 2R38A 2OHTA 3ZPTA 3SA6A 5P3PA 1WBKA 3PB5A 4J17A 3ER3E 5P0VA 5HDZA 5OZLA 5OZ1A 1TSUA 3SKGA 1WBMA 5P81A 3IA9A 5P1TA 4Y5GA 5P5MA 5P20A 5C9FA 3FKTA 1T3RA 2PH6A 5P09A 4DVFA 1ZPAA 4I10A 5OZEA 2AIDA 2P3DA 3NU9A 3OAGA 4Y3QA 3SM1A 5HVPA 1KJ7A 5OZVA 4Y5MA 4EXHA 4J1HA 2VA7A 1J71A 4GZFA 4JECA 5P70A 3EBZA 5P06A 4L7JA 5P8BA 2R5PA 5P1YA 1ZBGA 1HXBA 5ISKA 1HVLA 3G6ZA 7UPJA 1A8GA 5P0ZA 3URLA 1YTIA 4HE9A 4GYEA 4QJ7A 3BRAA 5P7GA 4ZE6A 3TPJA 1IVPA 5C9DA 5P2FA 3PEPA 3S43B 4DJWA 4Y36A 2FGUA 4CPWA 5P0LA 2FLEA 5I70A 2HAHA 1ODYA 3O9FA 4IVTA 5P6CA 5P86A 5OYRA 4Y5KA 3UQRA 1DPJA 4OBGA 2ZHSA 5P17A 5P6GA 3O9LB 2O4KA 3KDCA 4FAEA 1YM4A 1SIPA 1PFZA 5P75A 4Z4XA 5P0GA 2AVQA 1NPVA 3O99A 3LPKA 2QMDA 3INEA 4EQ0A 1ZPKA 5P04A 3OADA 5P2JA 1K6TA 4FRJA 4YE3A 5OZQA 5OYQA 1AAQA 3T6IA 4LL3A 1K2CA 3UF3A 2O4SA 2QNQA 4ZSPA 1FB7A 5P5AA 1FMUA 4IVSA 1BVGA 5P5XA 5KR2A 5P3AA 1OHRA 2Q55A 3OUBA 4Y3GA 1T7JA 4J1FA 4Y38A 1AVFA 3LZUA 4Y5CA 5P7VA 4Y5EA 3L5FA 5P4FA 3ZL7A 3BVBA 3KDBA 4J55A 5KQXA 2Q5KA 5KQFA 3EKXA 6UPJA 4Y4DA 1QBUA 5P7SA 2FNTA 2IEOA 2FDDA 5OZ6A 3SLZA 5P8CA 3L59A 4COEA 1EPPE 5P87A 3S85A 2QZXA 3PM4A 4UPJA 5SXNA 4FM6A 2HB3A 3APPA 2BKTA 4H3IA 5P1VA 3QS1A 5P2DA 5EZZA 2FMBA 3LPJA 4RVJA 4ER4E 4HA5A 4ZPFA 5P2HA 4OBKA 1IZDA 4EJKA 3NDUA 5P5WA 2QI0A 2CEMA 3UDJA 5KR1A 2JJJA 1APVE 1G0VA 3INFA 2R3WA 5P89A 4Y58A 4AUCA 4YD4A 3VF5A 5P8NA 3UDYA 4EP2A 3IAWA 4EWOA 2ZHUA 3BHEA 1YT9A 5OZ5A 4I12A 3S7MA 5P7OA 4HDFA 2QI7A 4BELA 4J0PA 4D83A 5P23A 2NXMA 5P6OA 2QNNA 3S2OA 1ZTZA 5P1EA 4QLHA 3GI6A 2AVMA 4LP9A 1EBZA 3KFRA 4B78A 4TRYA 2G24A 3LINA 3UQUA 5OZMA 5JODA 5P4XA 1ZLFA 5P1GA 4Y4JA 3TLHA 4Y4BA 2HC0A 2HB2A 3KN0A 4GJBA 4HEGA 1D4SA 1GKTA 5P5VA 1B11A 2QHZA 5UPJA 4NKKA 1BWAA 3AIDA 4FL8A 1UH9A 3EC0A 4B1EA 5P7QA 2XYFA 4TRZA 5APRE 4Y4TA 2ER0E 1CZIE 1HVJA 1QDMA 3JVWA 3R4BA 3K5CA 2G26A 3T7XA 1APTE 5P26A 1LYWB 3UQWA 2NMYA 5P2WA 5P3DA 2QCIA 3BXRA 2I1AA 3S7LA 3UDNA 4Y4WA 3D3TA 4Y3WA 1SBGA 2WF4A 4RCFA 5P29A 4H3JA 4EJ8A 5P3OA 3JW2A 3KM4A 1PSAA 2QMGA 4B77A 5P5EA 2PK5A 5F00A 5P80A 2ER6E 3D1XA 2PWRA 5OYVA 2FXDA 4J54A 1SP5A 1FG6C 4YCKA 4ZLSA 5P4LA 3UDHA 5P7AA 3S56A 2H6SA 3NXEA 1FEJC 2IDWA 5P0AA 5P5NA 1BDLA 1MERA 1AIDA 5DGWA 2QK5A 5IS4A 5P3BA 2Q3KA 4Y5NA 4RZ1A 5P0TA 5P32A 1Z8CA 5P6EA 1LF3A 2QZWA 4RVIA 4Y3HA 3TOGA 1XE5A 4DQFA 1FLHA 2PSGA 5OYTA 5P5KA 2A1EA 5P7NA 2B8VA 3RTMA 4RRSA 1XE6A 4I8ZA 2QD8A 4OBJA 5P3FA 4Y4EA 2P3AA 5P5CA 4FSLA 4L1AA 5OZ7A 3HD8A 4DQGA 1LZQA 1NSOA 5OYUA 2G22A 4Y4GA 3UDRA 5IVSA 1F7AA 1ZSFA 1RQ9A 5P4OA 2V00A 5P8EA 1BDQA 1BXOA 2NXDA 5OZXA 5P3GA 3GI5A 3K4VA 4OBZA 5P3IA 4MC2A 5P5FA 4B1CA 1GNOA 3I6OA 5P60A 5P0IA 2AOHA 5P67A 2AQUA 2QD7A 3EM3A 5P6XA 5OZ9A 2QMFA 4FGXA 5KOQA 5HCOA 5P5SA 1QRPE 2IKUA 3VFAA 3LZVA 2Q54A 8HVPA 5P8RA 4Y3PA 2VA6A 3VCMA 1Z1RA 4QJ8A 5P8OA 4Y53A 5BRYA 3EL0A 3OOZA 2F81A 3EKTA 3MXDA 3OXCA 5P62A 2NR6A 2P8HA 5P0FA 4ZSMA 5P4MA 2XFJA 4OBFA 5P5RA 1UH7A 5P4UA 4CPTA 5P3ZA 2VNMA 5P34A 4J1KA 3HDKA 1CPIA 5P2XA 3PVKA 2B60A 4OC6B 4HDPA 5P2GA 2O40A 4Y4UA 5P8HA 4HLAA 5P1BA 1HPVA 1HSHA 3UPJA 2AZBA 2VIEA 4EP3A 3PMUA 2ZDZA 3I25A 4Y51A 4KB9A 1HIIA 1IBQA 5OZCA 3PI0A 3QVCA 2V16C 5P1MA 2FS4A 2R3TA 5P69A 4K9HA 5OZSA 3PCZA 3MWSA 2ZJLA 4N00A 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 5OZZ A;  5KR8 A;  1W5W A;  2RKF A;  1HIH A;  4D89 A;  2XFI A;  4PZW A;  1EPL E;  3K5G A;  1SDT A;  5HU0 A;  5P7E A;  4DUS A;  1BV9 A;  5HDX A;  5IVQ A;  4YBI A;  3O9D A;  4QGI A;  5DR7 A;  3LIQ A;  5P6J A;  3NSH A;  5ENK A;  1UH8 A;  1BXQ A;  1ZSR A;  3L5C A;  4AA9 A;  4Y3E A;  5P2Z A;  3WZ8 A;  1QBT A;  2VIY A;  5HDV A;  3LZY A;  5OZF A;  4ACX A;  5ISJ A;  5I3W A;  3HAU A;  5P2I A;  9HVP A;  5DR8 A;  4Y3X A;  5P5Z A;  1BIL A;  3EKQ A;  3SAB A;  5P12 A;  1TSQ A;  4LXK A;  3H5B A;  4F76 A;  1LYW A;  1GNM A;  1MSN A;  5P8K A;  4YOA A;  2I0A A;  3RVI A;  2J9K A;  4PHV A;  4I0D A;  1LYA B;  1A94 A;  4BFD A;  3OXV A;  4DJP A;  3WSJ A;  1M4H A;  1PRO A;  5P45 A;  3EKP A;  4PPH A;  2JXR A;  2OHU A;  4DH6 A;  1B6L A;  2PK6 A;  3OQK A;  2WKZ A;  4L1A B;  4U7Q A;  3TOF A;  5P1W A;  1ODX A;  4JPC A;  4RLD A;  3PWW A;  5P08 A;  3UQX A;  3OGQ A;  4I0F A;  4Q1Y A;  4ZSR A;  2PH8 A;  3SAC A;  2VJ6 A;  5P6H A;  1E81 E;  3DV5 A;  4Y4Z A;  4I0E A;  4ZPG A;  5OZ2 A;  4YDF A;  3UCB A;  4NJT A;  1FMX A;  5P0B A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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