1E82E

Endothiapepsin complex with renin inhibitor merck-kgaa-emd59601
Total Genus 83
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
83
sequence length
330
structure length
330
Chain Sequence
STGSATTTPIDSLDDAYITPVQIGTPAQTLNLDFDTGSSDLWVFSSETTASEVDGQTIYTPSKSTTAKLLSGATWSISYGDGSSSSGDVYTDTVSVGGLTVTGQAVESAKKVSSSFTEDSTIDGLLGLAFSTLNTVSPTQQKTFFDNAKASLDSPVFTADLGYHAPGTYNFGFIDTTAYTGSITYTAVSTKQGFWEWTSTGYAVGSGTFKSTSIDGIADTGTTLLYLPATVVSAYWAQVSGAKSSSSVGGYVFPCSATLPSFTFGVGSARIVIPGDYIDFGPISTGSSSCFGGIQSSAGIGINIFGDVALKAAFVVFNGATTPTLGFASK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Refinement of Four Endothiapepsin Inhibitor Complexes. Crystallographic Studies of Cytochrome Ch from Methylobacterium Extorquens and Inhibitor Complexes of Aspartic Proteinases.
rcsb
molecule keywords ENDOTHIAPEPSIN
molecule tags Hydrolase/hydrolase inhibitor
total genus 83
structure length 330
sequence length 330
ec nomenclature ec 3.4.23.22: Endothiapepsin.
pdb deposition date 2000-09-15

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
E PF00026 Asp Eukaryotic aspartyl protease
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.40.70.10 Mainly Beta Beta Barrel Cathepsin D, subunit A; domain 1 Acid Proteases 1e82E02
2.40.70.10 Mainly Beta Beta Barrel Cathepsin D, subunit A; domain 1 Acid Proteases 1e82E01
5OZHA 4L7JA 4CMSA 4Z2ZA 3LIZA 3PI0A 2ZHVA 3TPPA 3PCWA 3K4VC 3OQ7A 3LPKA 5HD0A 3RTNA 4Y6MA 4Q1XA 1G2KA 1XE5A 5KAOA 2VJ9A 1OEWA 3QS1A 5OZKA 2WEZA 5P2ZA 5P87A 3ER5E 2H6TA 3L5CA 5P5SA 5KR0A 1HWRA 1C6ZA 5CONA 4AA8A 3LIYA 3NU9A 1MT8A 4I0DA 3LZSA 3M9FA 5P7MA 4RROA 4QJ9A 2O40A 3BUFA 1BVEA 4F74A 5P7DA 4WY6A 5P3OA 5P4ZA 3S43B 3VFBA 3IXOA 5P0IA 5P7FA 1W5XA 4K4RA 5OZBA 4DPFA 1BWBA 1EC2A 5P81A 1APVE 4CKUA 2O4SA 4YE3A 2XFJA 2WF2A 1MT7A 4J1HA 1HVHA 4OC6A 5ISJA 4NJUA 2I4XA 3R0WA 1T7IA 2WF0A 1IZIA 5P5MA 1YTIA 3S85A 2F3EA 4DQGA 3VYEA 1XL2A 5P84A 3LNKA 2HPEA 4J54A 1FQ5A 5DR4A 5P28A 3CKRA 5OYUA 3EXOA 1PSAA 3SO9A 4HDPA 3ZKSA 2OHKA 1W5YA 3NXNA 2APRA 4H3IA 2Q55A 2QI5A 1HXWA 4J17A 2I1AA 1EBZA 5E5JA 2G27A 5P72A 3GI4A 5OZFA 4JOOA 5OZXA 3SA5A 2O4KA 5P5WA 3BHEA 3B80A 5P5UA 2PSVA 3O99A 3DCRA 1QBRA 3UF3A 5P80A 2G24A 3Q6YA 1Z1HA 1T7JA 5OYYA 4QJ6A 2PWCA 5P2EA 1HRNA 5OZ1A 2AVSA 2NNKA 1DP5A 3KDCA 4LXAA 5P1LA 4DJQA 5P7SA 5P3BA 4LP9A 1E82E 1FG6C 1FG8C 3D1YA 4YOAA 1HVRA 4A4QA 2I4WA 5P4KA 3OUDB 4EP3A 5P57A 4I12A 1DPJA 2BB9A 2R8NA 3NDXA 5P55A 2AZCA 5P6HA 1HIVA 1IDAA 5J25A 4YD5A 3GGXA 1UH8A 3EM3A 4Z4XA 2VIYA 2I4DA 4EP2A 4OD9A 2NMZA 3FSMA 5I3YA 6UPJA 5P0QA 4I0ZA 3TPLA 4D8CA 3MSLA 5P4SA 2P3BA 3KA2A 1HVKA 5P0GA 5P5GA 5OZ6A 4ZIPA 3HVPA 2OF0A 2V00A 3TL9A 1PSOE 6APRE 5P0UA 1T6GA 3B7VA 2QK5A 3RVIA 2A1EA 3OHHA 4LAPA 2B42A 5P7XA 4DQHA 4J0ZA 2H6SA 4Y57A 4RVIA 3OADB 5OZWA 4ACXA 2AOHA 1RV7A 5P0SA 4GB2A 5P5DA 4RVXA 3UDJA 5P3PA 3PSGA 3U6AA 5BWYA 2G21A 2QI1A 5P4JA 3T11A 4XX4A 4JP9A 5I3WA 6FIVA 1IDBA 4B0QA 2QHZA 2UPJA 2B8VA 5DR0A 5P7OA 1CMSA 5P7WA 5OZUA 3SABA 5P82A 5P1TA 5P8LA 3S8IA 3S43A 5P14A 5P85A 5EZXA 2IL2A 3OQKA 3KFSA 5P6PA 3ZKGA 2QCIA 3NUJA 1C6XA 4EYRA 2QAKA 3VG1A 5P75A 4L1AB 5OZTA 1FGCC 1LF3A 3UQPA 2HB3A 3DOXA 3NWXA 2AVOA 7UPJA 5SXNA 2QD8A 3IN3A 1B6KA 3EL9A 3A2OA 3CMSA 5P4RA 2NTRA 2V13A 5P2UA 5I3VA 1IZHA 2I4VA 3OU1B 1TQFA 4QLHA 3IXKA 3NLSA 4Y4WA 2AOIA 3UFNA 4PYVA 1ZBGA 4Y3GA 5P01A 5P8OA 4Y3AA 3UQRA 2JE4A 5P5NA 1WKRA 2V12C 3GGVA 3VF5A 4B00A 5OZPA 2G94A 4IVSA 1W50A 2HAHA 3FV3A 5P1ZA 3ECGA 1EBKC 2ZJHA 1A8GA 3QP0A 4DQCA 2WL0A 5P73A 2PYNA 2ANLA 3I2LA 5JFUA 3VV6A 2OHNA 5ER2E 5SY2A 5P3GA 4YBFA 4GYEA 1BIMA 2AQUA 4HA5A 2QHYA 5P6XA 4L7HA 5P69A 4LXKA 1SIPA 2PSGA 1NPVA 4Q1WA 4J1KA 4Y4EA 5KQFA 3ZKNA 3HBOA 4N00A 1RQ9A 5DQ1A 3OUAA 2ZJIA 4FIVA 5P1IA 5BRYA 3VF3A 4I8ZA 3SACA 4DH6A 5P3SA 5COOA 3OY4A 1RNEA 2PC0A 1ZTZA 3SAAA 5P79A 4Y5CA 4FAEA 2R5PA 3BGCA 5C9BA 2F8GA 1TCXA 4FRJA 5P1YA 3Q5HA 3PM4A 5P4LA 1F34A 3G72A 3U7SA 3O9HA 2WEBA 4S1GA 1BXOA 4Y3EA 4FS4A 2RSPA 2BQVA 1HTGA 5P0FA 3K5CA 3Q70A 3ZKQA 5ENKA 3L38A 5OZ5A 2BPYA 2P83A 1E80E 2UXZA 7HVPA 1GVTA 5P24A 1D4IA 1IBQA 3VSXA 3OADA 2VIJA 5OZIA 3SA4A 1ODYA 4TVGA 5P2NA 5P0RA 4ZSPA 4RVJA 1DW6C 1FQXA 5P7TA 1GNNA 4XX3A 1APTE 5P31A 1MESA 5P2IA 2WJOA 1YX9A 3LPIA 4J55A 2JJIA 2QI0A 1B6PA 5P25A 4I1CA 1C6YA 3TTPA 1HPXA 1GVWA 1EC3A 1MERA 3DJKA 3OQDA 1D4KA 2PK5A 4J0YA 3PJ6A 5P7YA 1ODXA 3UQXA 3GI0A 2Q63A 2FDEA 2FLEA 5P8CA 5DGWA 4DV9A 1EPNE 4IVTA 2VA5A 5P8IA 1LYBA 4WTUA 5P3YA 1FQ6A 5P4HA 4R95A 3IVHA 3NR6A 5HCTA 5P17A 5P67A 1SDTA 5P2YA 2P8HA 4Y5LA 4EQ0A 2F80A 2XFKA 3OU1A 3T7XA 4Y35A 1AJXA 5OZ4A 4Y50A 4APRE 3WZ7A 4Q1YA 3SM2A 1PFZA 4Y9WA 1EC0A 3KFNA 2ZJLA 4YD6A 4J1IA 1MTBA 4CPUA 3Q4BA 1EBYA 3QRSA 4DQFA 1TSUA 4TRZA 5CLMA 2IGXA 3OWNA 3UDNA 5APRE 1ZJ7A 4QJ2A 3D20A 1M0BA 4QGIA 5HE5A 1Q9PA 3TLHA 5OYSA 5P0MA 4Y4BA 5AH7A 3VEUA 1YTHA 2Z54A 5P1BA 2FXEA 5P6ZA 3KDDA 5P2TA 3UCBA 5P0ZA 1LYWB 5P7RA 2AOFA 3PSUA 5P0JA 3FIVA 5OZZA 1K6PA 3EL1A 4OBHA 3JW2A 1M4HA 5P4DA 1FFIC 1MRWA 4RCEA 4Y5GA 2OHUA 1A94A 2RMPA 1K1TA 5B18A 4OD9B 5P3XA 5P7ZA 1UPJA 5COPA 3S54A 5P0KA 4YD4A 1T6EX 2ER0E 5P4VA 4Y3HA 3HDKA 5P7HA 1GKTA 3CKTA 4RCDA 2P3BB 5P6GA 5P05A 4CP7A 5P4PA 5OZDA 1K6CA 5P64A 5KQYA 1HOSA 3TNEA 3SA8A 3PWWA 3QN8A 4Y44A 4AA9A 1FMUA 1WBMA 1ZP8A 2ZJKA 4GJ8A 3L5EA 1EPRE 3UQWA 4B72A 4A6CA 2FNSA 5DPZA 4RYGA 1BBSA 1LV1A 5P7NA 3K4VA 5P3RA 3EC0A 3O9FA 5P42A 1HIHA 5SY3A 5F00A 4H3GA 4JPEA 4PZXA 4HDBA 1AM5A 5P18A 1MTRA 4R8YA 3RU1A 5P5IA 3PMUA 2XYFA 1AVFA 4YCKA 1HVIA 2AOEA 5P4MA 4GJCA 5IS4A 5P2QA 3OU3A 3OOZA 3R0YA 1SGUA 4Y3YA 3PMYA 1D4JA 3OHFA 1AIDA 1A9MA 5P3ZA 3UDPA 5P5JA 5P09A 3FNSA 5P3MA 1EPME 1ZLFA 3RTMA 4I10A 1MRXA 2G20A 3FNUA 3LINA 5KR1A 2MIPA 5HDVA 4CPRA 5P2CA 5AGZA 5P7CA 3T6IA 4R91A 5P5TA 1Z1RA 1YTGA 2ZHRA 2I4UA 1SDUA 3NDWA 3GGUA 4FRKA 1A30A 4F75A 3PBZA 5P1NA 5P2BA 3NDTA 5P6LA 1VIKA 3ST5A 1HPVA 5P6KA 3UDQA 3INEA 3S2OA 5KQZA 5P74A 1SGZA 5HCOA 3OAGB 3UDRA 3EKVA 1K2BA 2ZJNA 4YD7A 3QRVA 5P12A 4FM7A 4Z22A 3IAWA 4J1CA 5P6QA 5P66A 1A8KA 3R2FA 1FQ8A 3GW5A 2I0DA 5P2KA 3KDBA 2AZ8A 5P3WA 2G1RA 1HVJA 1MUIA 5OZRA 2OHPA 5P4WA 2B7FA 3EM6A 5OZLA 2ZHTA 5P4IA 4Y3PA 3I6OA 2PH6A 5DQ2A 2QP8A 5HVPA 3SLZA 4RGHA 5OZJA 3PRSA 4Y41A 4DJPA 2G22A 3SKGA 2V0ZC 1GNOA 1LYWA 4Y3QA 1IVPA 5P6IA 3CKPA 5DQ4A 4I0FA 5P1KA 4APEA 3QVCA 5P4GA 3KT5A 1BILA 5P44A 3G6ZA 2HC0A 4Y4ZA 5P3TA 4Y3JA 5OZMA 4M8YA 2AIDA 1W5VA 1FF0C 1MT9A 1U8GA 1RPIA 4ER1E 5P6AA 4FGXA 4GIDA 5P2GA 4YHQA 1HPSA 1QDMA 1F7AA 5OYWA 1T7KA 5P6UA 3NWQA 4MC9A 3INDA 4HVPA 3SFCA 1LF4A 4Y56A 2CEMA 5OZ7A 4ZSQA 5P0XA 2IDWA 2JYSA 2ER6E 5P1DA 3URJA 5P50A 3SPKA 1FFFC 5P2OA 4HDFA 5P38A 2OAHA 4Y5NA 2IS0A 5P5XA 4NJVA 4EXHA 4Y5AA 1HEGE 2F3KA 2B60A 4FLGA 5ENMA 3T7PA 5P0EA 3UDMA 3EM4A 2PQZA 2NMYA 4NKKA 3BUGA 1FMXA 2ASIA 5DQ5A 5P26A 2QMGA 3O9EA 5P7KA 5OYVA 3R4BA 5P1MA 5P62A 5P1JA 2BPWA 4Y3LA 1NSOA 5P6YA 1D4YA 1ZPKA 5P7AA 2FGUA 3SA6A 4GMIA 3VLAA 4L6BA 2HS2A 4FE6A 3VSWA 3Q3TA 3WZ8A 5P03A 2ZJJA 5P2RA 5P29A 1HVLA 3TOFA 1LYBB 2NR6A 5P3DA 5P7EA 3L59A 5OYZA 2VA7A 5OZEA 2BKSA 3ZKXA 5OZ9A 4Y5MA 4RCFA 5P68A 4ACUA 5P6MA 5IVSA 4Y3TA 1EAGA 3KN0A 2G1OA 3EL0A 3UDHA 5OYTA 1J71A 3TKGA 3LIXA 5P3KA 5P8RA 3S56A 4Y4TA 2QU3A 3O9AA 3ZKMA 5P76A 3OGPA 5T4SA 1FIVA 3S45A 4I0GA 1FQ7A 3OAGA 2VJ6A 3HAUA 2AOGA 5ER1E 1B6MA 3NUOA 5P2LA 1UH9A 2QNPA 3KMYA 3PB5A 4GJ6A 1HEFE 5P04A 3BVBA 3D1XA 4Y3SA 5P0WA 4OBZB 1JLDA 4AZYA 5P5CA 5P2MA 5P1QA 2QNNA 4BEKA 5P6SA 5P1HA 2R5QA 1E81E 5IVTA 3O9BA 1SIVA 3FKTA 1SBGA 2VS2A 2HB4A 3NYGA 9HVPA 3EKYA 2G1SA 5P46A 2ER7E 4DI2A 3ZMGA 1XS7D 3BC4A 1B6JA 2BPVA 3O9CA 5P8MA 4EQJA 4FSEA 5P58A 4Y43A 3UDKA 1YT9A 4Y5KA 5P4YA 2QI3A 4R93A 5P4UA 1GVVA 2HIZA 2QD6A 4GJ7A 5DGUA 3NU4A 2OHTA 2VA6A 1APUE 2J9KA 3EKTA 1GNMA 5P7PA 4UPJA 5P49A 3OUBA 1OHRA 1LYAA 2QI7A 3L5BA 4OBGA 2AVQA 1EC1A 3URIA 3T3CA 2O4LA 1PPKE 2IKOA 5P78A 4J0VA 5KOQA 1MEUA 5P5AA 5P2FA 3IA9A 3I25A 3UDYA 1PPME 4J5JA 5P1PA 2VKMA 4RRSA 3HZCA 4A6BA 5OZ0A 1HIIA 5P83A 5P4QA 3WSJA 3ZPSA 5P1RA 5P3IA 2QZLA 2WKZA 2B7ZA 5P3QA 5HDUA 3OUCA 2BBBA 1HSHA 1T3RA 3D91A 3L5DA 4R92A 5P3NA 4Y54A 4YA8A 1HVSA 5P8KA 5P02A 1MSMA 4BFBA 1DAZC 5P7GA 3O9IA 5P88A 5P8JA 1EPQE 3MWSA 4LBTA 5P1AA 3HD8A 3PSYA 3CYWA 4FAFA 5P5BA 3OXCA 4I0HA 3HVGA 1XL5A 3PEPA 5P8VA 2ZJMA 1W6HA 1MIQA 5P6BA 1N49A 4ZPGA 3K5GA 3R1GB 4D83A 5P06A 3S7LA 1K6VA 2PYMA 2ER9E 1DIFA 5P11A 3DV1A 2ZHUA 5P86A 4TVHA 4PPHA 5P1VA 4D85A 5HE7A 1UH7A 4B05A 2ZYEA 3L5FA 2FXDA 2V11C 3G70A 5P8UA 3SKFA 3WB4A 1GVXA 1IZDA 3D1ZA 3PLDA 2QI6A 5AHAA 3I7EA 2NNPA 3RSVA 4GJBA 4ER4E 4ZE6A 3SA3A 3ZL7A 4KE1A 5P7VA 3HW1A 2EWYA 1AZ5A 2F3FA 5P1SA 5P7LA 4Y3MA 4D89A 4DJXA 5P56A 5P8AA 3VV7A 5I3XA 2RENA 1META 5P6CA 3DM6A 5P41A 4EHCA 3D3TA 3WB5A 4OBKA 5DQCA 1NPAA 5P8FA 4F73A 3DUYA 2QZWA 2V16C 1VIJA 4I8WA 4B78A 3KM4A 1OD1A 5P2AA 2HM1A 2XYEA 4PHVA 5P5LA 5P0HA 5HDXA 5P37A 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 5OZH A;  4L7J A;  4CMS A;  4Z2Z A;  3LIZ A;  3PI0 A;  2ZHV A;  3TPP A;  3PCW A;  3K4V C;  3OQ7 A;  3LPK A;  5HD0 A;  3RTN A;  4Y6M A;  4Q1X A;  1G2K A;  1XE5 A;  5KAO A;  2VJ9 A;  1OEW A;  3QS1 A;  5OZK A;  2WEZ A;  5P2Z A;  5P87 A;  3ER5 E;  2H6T A;  3L5C A;  5P5S A;  5KR0 A;  1HWR A;  1C6Z A;  5CON A;  4AA8 A;  3LIY A;  3NU9 A;  1MT8 A;  4I0D A;  3LZS A;  3M9F A;  5P7M A;  4RRO A;  4QJ9 A;  2O40 A;  3BUF A;  1BVE A;  4F74 A;  5P7D A;  4WY6 A;  5P3O A;  5P4Z A;  3S43 B;  3VFB A;  3IXO A;  5P0I A;  5P7F A;  1W5X A;  4K4R A;  5OZB A;  4DPF A;  1BWB A;  1EC2 A;  5P81 A;  1APV E;  4CKU A;  2O4S A;  4YE3 A;  2XFJ A;  2WF2 A;  1MT7 A;  4J1H A;  1HVH A;  4OC6 A;  5ISJ A;  4NJU A;  2I4X A;  3R0W A;  1T7I A;  2WF0 A;  1IZI A;  5P5M A;  1YTI A;  3S85 A;  2F3E A;  4DQG A;  3VYE A;  1XL2 A;  5P84 A;  3LNK A;  2HPE A;  4J54 A;  1FQ5 A;  5DR4 A;  5P28 A;  3CKR A;  5OYU A;  3EXO A;  1PSA A;  3SO9 A;  4HDP A;  3ZKS A;  2OHK A;  1W5Y A;  3NXN A;  2APR A;  4H3I A;  2Q55 A;  2QI5 A;  1HXW A;  4J17 A;  2I1A A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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