1EPNE

A structural comparison of 21 inhibitor complexes of the aspartic proteinase from endothia parasitica
Total Genus 82
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
82
sequence length
330
structure length
330
Chain Sequence
STGSATTTPIDSLDDAYITPVQIGTPAQTLNLDFDTGSSDLWVFSSETTASEVDGQTIYTPSKSTTAKLLSGATWSISYGDGSSSSGDVYTDTVSVGGLTVTGQAVESAKKVSSSFTEDSTIDGLLGLAFSTLNTVSPTQQKTFFDNAKASLDSPVFTADLGYHAPGTYNFGFIDTTAYTGSITYTAVSTKQGFWEWTSTGYAVGSGTFKSTSIDGIADTGTTLLYLPATVVSAYWAQVSGAKSSSSVGGYVFPCSATLPSFTFGVGSARIVIPGDYIDFGPISTGSSSCFGGIQSSAGIGINIFGDVALKAAFVVFNGATTPTLGFASK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title A structural comparison of 21 inhibitor complexes of the aspartic proteinase from Endothia parasitica.
pubmed rcsb
molecule keywords ENDOTHIAPEPSIN
molecule tags Hydrolase/hydrolase inhibitor
source organism Cryphonectria parasitica
total genus 82
structure length 330
sequence length 330
ec nomenclature ec 3.4.23.22: Endothiapepsin.
pdb deposition date 1994-07-27

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
E PF00026 Asp Eukaryotic aspartyl protease
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.40.70.10 Mainly Beta Beta Barrel Cathepsin D, subunit A; domain 1 Acid Proteases 1epnE02
2.40.70.10 Mainly Beta Beta Barrel Cathepsin D, subunit A; domain 1 Acid Proteases 1epnE01
5J25A 3EKQA 2G24A 5P48A 3FSMA 6FIVA 1K6VA 1K6TA 2AOEA 3WZ7A 4NPUA 3S8IA 4XKXA 5P0LA 4ACXA 1ODWA 4Y58A 5I3XA 2HB2A 4FL8A 4D85A 3VLBA 3SA5A 2WF0A 5P0JA 4J1KA 2G26A 5P84A 5P8FA 5P3HA 1RL8A 3FX5A 5HDZA 2QCIA 4ZSPA 2R9BA 2AZBA 3S7LA 4LAPA 4J1EA 3K5FA 5P89A 3S43A 4Y5KA 3UDKA 1SGZA 3LZYA 4JECA 4R5NA 5P17A 5OZWA 5P40A 4AA9A 4J1HA 5KQXA 2QI6A 3LITA 2QMPA 5P0OA 1M43A 2PMAA 5P71A 3DM6A 5P8JA 2F3EA 3G6ZA 3S85A 5JFPA 5P3MA 1PFZA 2IQGA 3EM4A 4HDPA 3KDDA 5P2VA 1KJ4A 5P66A 1ZSRA 1GNNA 3HDKA 2G21A 3JW2A 2G1OA 2AOGA 3SA7A 3O9HA 5OZ6A 5P5TA 1CZIE 5P22A 3EM6A 3GI0A 3IVHA 4RRNA 1YTJA 3OTYA 1SBGA 2ZJMA 3PHVA 4J54A 5P7RA 5P2DA 3LIZA 5P68A 4Q1WA 2OHTA 2QD7A 5P20A 3U7SA 5OZ4A 2O4PA 1APVE 2P3CA 3BUHA 2FGVA 3R0YA 5I3YA 4HA5A 2J9KA 1WBMA 3OHHA 4FRIA 3SM2A 4NJUA 5P1XA 4FRJA 4Y5CA 4Y3EA 5KR1A 1LS5A 1NPAA 5P1IA 3ZKSA 4I12A 3S2OA 4L7JA 5P3UA 5OZ8A 2V00A 4I11A 5KOSA 5P8IA 2QU3A 5P36A 4I0JA 3PWRA 5TOLA 3URLA 4D83A 3NU5A 4ZE6A 5AH6A 1APUE 4TVHA 3OXWA 1D4YA 4GJ8A 2QI5A 3VLAA 2I4QA 2XYEA 4F73A 3UDHA 3VYDA 5P4BA 2R8NA 3QP0A 2QI4A 2NNPA 2Q11A 2G1SA 4YBIA 5P6MA 5P1KA 3NDUA 5P0FA 5SZ9A 1MSNA 4OBGA 4UPJA 5OYWA 5P29A 5P33A 3OU4A 3L5BA 3K1WA 4PHVA 3A2OA 1EBKC 5P5DA 5P8NA 1IBQA 3QBFA 5P57A 3SM1A 1QBTA 2VNMA 3OOZA 4J0YA 1HTGA 5P6HA 4D88A 1T7KA 5P4LA 3UDPA 1B5FA 3PSGA 3SO9A 3EKTA 5P0WA 5P3GA 4L1AB 3OQKA 4L1AA 5P8VA 5P42A 3HVGA 4Y3AA 4X2LA 1MVPA 5P0GA 4AMTA 4BFBA 4YE3A 3VF3A 4F75A 1T6EX 4RCEA 1K6CA 2QK5A 4PZWA 1LV1A 2P8HA 4A6BA 1BV9A 3TNEA 2FXDA 3CYXA 2Q55A 2VA5A 2AVMA 2VIZA 5P06A 4RVIA 1MRWA 3D91A 3QN8A 5P3KA 5P70A 3HLOA 4I0HA 5HE7A 5HTZA 2AQUA 2VA6A 2ZJHA 5P1ZA 5P28A 2I0AA 1BXOA 1G35A 4GMIA 3PBZA 5OZAA 2FMBA 2F8GA 1YX9A 4ZIPA 5IS4A 4FAFA 4DPFA 1K1TA 4Y4JA 3NUOA 5P4GA 4Y44A 5KR8A 4HDBA 3VV6A 1OHRA 2PH8A 4J55A 4YD7A 4COEA 4E43A 1AJVA 4LBTA 4J0PA 4Y47A 5P4KA 1Q9PA 4JPEA 5HVPA 4FM7A 4DJPA 2HPFA 4DQFA 2OHSA 3KMXA 5DR7A 4QJ7A 4LC7A 5JG1A 5P7YA 4EXGA 2NNKA 3UDQA 3IXJA 5P2SA 1SIPA 3OHFA 5P2RA 4R95A 5P3EA 5P26A 2ZHSA 5P1OA 2B7FA 3ZKGA 5OZ5A 2PQZA 1G2KA 4J17A 1FMUA 2IKOA 5P6PA 2BBBA 5SY2A 5P23A 3GGAA 3QPJA 2VJ7A 3EL0A 5P8TA 2FDEA 5P7XA 3LZVA 1LYWB 1LYWA 3I7EA 5IVRA 5P85A 4A4QA 5P7BA 2ZYEA 5OYZA 5P88A 1DP5A 3D3TA 4PZXA 2R5QA 4RVJA 3T7QA 4Y3PA 3UCBA 5OZLA 4FM8A 5P04A 5P7NA 5P76A 3L59A 4J1IA 1FG6C 1IZDA 2RMPA 5ISKA 4Y3WA 3HAWA 5DR0A 4TRYA 1LF2A 5P5HA 1ZAPA 5P1GA 5OZCA 1PROA 3KM4A 4FM6A 4FS4A 5P2EA 5P1VA 3WB5A 5P00A 3EKPA 4Y3HA 3PSYA 3TOGA 3VSXA 1CPIA 2AZ9A 3CKRA 3INHA 3LPJA 1FEJC 3OTSA 2QHCA 2OHNA 5B18A 1CMSA 4Q1XA 1BIMA 1VIKA 5P53A 1RV7A 5P3VA 1Z1HA 3BUFA 3T7XA 2OHPA 5P6IA 4L6BA 3NU3A 3UQRA 2BJUA 5P5NA 3LZUA 5P6TA 5P1BA 4NJTA 4YA8A 4FLGA 3OU3A 3R4BA 3MSJA 1HRNA 5BS4A 2NXDA 3SKGA 4FIVA 4Y3QA 3IGBA 5P6ZA 1HSHA 3CKPA 4EP3A 5P5XA 2I4VA 4Z50A 5P2TA 3TH9A 2AZCA 6UPJA 3NU6A 3PBDA 3HVPA 4NJVA 1IDBA 1T7JA 1ODYA 5P3IA 3ZKXA 5P8LA 4N00A 3BGCA 2PYMA 1HVJA 3ZLQA 2WF1A 5P7SA 3HZCA 1BXQA 2ZHUA 1MIQA 2F81A 5P1NA 4L7HA 3OUBA 5P4VA 5P1PA 1MPPA 5P67A 1HVRA 1WBKA 4A6CA 5P58A 1BVEA 2WJOA 1BDQA 4PEPA 4Y53A 3MWSA 4U7VA 1UH9A 4DQGA 5P0AA 2RKFA 2HM1A 3T6IA 3N4LA 5P3BA 5P8RA 3GI5A 1LF4A 2NXMA 5P63A 1TZSA 2FDPA 5P3DA 5P7PA 2ZJJA 3K5DA 4APEA 2G22A 1FQ6A 1HTFA 2AOJA 5P2KA 3VSWA 4B70A 5P0KA 1MERA 5P6WA 3KYRA 3NXEA 1ZP8A 4Y3LA 1SP5A 3Q3TA 5ER1E 5P5IA 2V10C 3ZPUA 2WF3A 3HAUA 5P0TA 3CIDA 3H5BA 1BDRA 4Y4TA 4AZYA 4OBJA 5DQCA 3PEPA 2I4WA 5P5VA 4H3GA 2ZJIA 3ZPSA 3BXRA 1N49A 1W6IA 1APTE 4JP9A 3RVIA 1NSOA 4Y3ZA 3KA2A 2IS0A 1XE5A 5P6FA 1IZHA 5AGZA 3KFNA 4GJ7A 5P1EA 1MEUA 6APRE 4M8XA 3INFA 5P7HA 2WEDA 4Y48A 3L5EA 3NU9A 2PH6A 3G70A 5P69A 3PLDA 3TPLA 2H6SA 3S54A 1FLHA 5OZYA 5OYRA 5OYQA 4J0VA 1XDHA 4FSLA 2XYFA 1AM5A 4B1CA 1ER8E 5P5LA 4Y35A 2I4DA 2OHKA 1HVCA 1MUIA 2QNQA 5P2YA 5P8MA 1W51A 3HW1A 3DV5A 5P16A 5P15A 7UPJA 3OXVA 3T7PA 1HIIA 3KMYA 2I4XA 4YHQA 3LHGA 5P5GA 4Z22A 4DJVA 3PI5A 4H3FA 3UHLA 1META 4H3JA 4RGHA 2P3BB 2P3BA 2QU2A 3KN0A 2G27A 2XFKA 4OC6A 5P4UA 3S53A 5P5QA 2VNNA 3ZL7A 5P7JA 5OZ1A 5P80A 5P5OA 3BVBA 1FQXA 1SIVA 2IRZA 4GJCA 4Y3MA 1W5VA 5P3WA 1SDVA 2AZ8A 5P41A 3KFPA 5P3XA 4APRE 5P30A 5P2JA 3NWXA 5P6BA 1LYAB 1LYAA 5P1UA 5P2CA 5P2XA 3S43B 1HVKA 4YDGA 5P24A 2WF4A 2UXZA 4RLDA 5HU0A 2QI7A 4J1CA 1LYBB 1LYBA 4Y3DA 4K8SA 3OQDA 4DJYA 5OZOA 5P8OA 5P4RA 4YOAA 5P0HA 3UFLA 2R43A 2HS2A 2BKTA 1IVPA 2CENA 2JJIA 1SH9A 1HVSA 3OQ7A 3I25A 2FLEA 4AA8A 5OZ3A 4U8WA 4ZPEA 5P7ZA 3VUCA 5P0RA 1GVXA 4FGXA 3SA8A 1AJXA 3D20A 4EWOA 1NPWA 1GNOA 4CKUA 5P6QA 1NPVA 4IVSA 5P3RA 1MRXA 5P0EA 5P2ZA 1XN3A 5DGUA 2HB3A 3Q70A 5OZPA 2F80A 2PC0A 1GVTA 4TRWA 3EL4A 2IDWA 2IKUA 3QBHA 5P0CA 1BVGA 4F74A 1HTEA 5SXNA 2ER0E 2I4UA 1KJ7A 2RENA 5P5RA 3I8WA 5ISJA 3CICA 2AIDA 3TTPA 5UPJA 1SGUA 5P1QA 3O9AA 4LXAA 3VV8A 3UQUA 3SFCA 1SDUA 1BILA 1G0VA 2QZWA 4R91A 5P3FA 5P0MA 5CONA 5P0ZA 5OZRA 5P11A 2NMYA 4Y3RA 2JJJA 4R93A 4K4QA 2PWCA 2AVQA 1J71A 2ZJKA 1BWBA 3O9EA 4ACUA 1RQ9A 2O4NA 1B6KA 1VIJA 3TLHA 4EJ8A 3NDXA 3FIVA 5P65A 2PWRA 2ER7E 5P8DA 1ME6A 3OU4B 3DCKA 5P75A 1FFIC 4ZEAA 3UF3A 4HE9A 5P86A 5P4IA 2UY0A 5P1LA 1IIQA 1D4HA 4MC6A 5P8CA 3TOHA 2NPHA 1PPLE 1D4SA 1TSUA 2CEJA 1FKNA 4Y5GA 4BEKA 3DV1A 2R38A 1B5FB 4OBFA 3QRMA 1C6XA 1SDTA 2QHYA 5P2GA 5P72A 5OZ0A 5P0UA 5P7OA 5P0XA 4LXKA 4DI2A 4DH6A 5P3TA 2R5PA 4CPWA 1KZKA 1HPOA 5P7EA 4I8WA 5P7AA 4RCFA 4RVXA 5P45A 5HDUA 1G6LA 3U71A 1K2CA 1F34A 5P7GA 2NR6A 4HEGA 5HCOA 3MSKA 4ZPFA 3CIBA 9HVPA 2AOCA 5HU1A 3UTLA 5P5SA 5P8AA 4F76A 5P03A 4FAEA 1E82E 3S45A 1NH0A 3OXXA 2V16C 1FF0C 5P8BA 3TKWA 2IGXA 1B6LA 4Y3TA 2JE4A 3TPRA 5I3WA 5P7FA 2O40A 4JPCA 4EJLA 3RSVA 4B05A 5ER2E 5P5KA 5P0SA 5P7TA 2Q64A 1DMPA 4YCTA 5OZBA 5P7LA 4KUPA 3UDNA 3CKTA 3NWQA 4GJDA 2Q3KA 2HS1A 5P4WA 2BQVA 4R8YA 3O9FA 3UQWA 3NSHA 1EPNE 5BWYA 5P4JA 5P6EA 2ZHTA 4EJKA 5P7MA 3QRSA 4CPTA 4Y4BA 5IVQA 5P6NA 3EMYA 3PMUA 3EC0A 5HDXA 2JXRA 5BRYA 1PSOE 1AXAA 5P5PA 4YCKA 5F01A 3ZKIA 3S56A 3KDBA 2I1AA 3DK1A 4YD5A 4QLHA 3SLZA 5P5MA 3PJ6A 4DJQA 5P6OA 2F3KA 3RSXA 1APWE 3QRVA 2FDDA 3SA6A 2O4SA 1HPSA 5P2HA 4X7IA 5OZEA 1W50A 1EPLE 5P2MA 2WEAA 1XL5A 2BKSA 4CP7A 2G1NA 4L7GA 5P4FA 3H0BA 1MT9A 5P55A 3R0WA 5OYUA 1HVLA 4OBHA 5KR2A 5P8SA 5KR0A 5OZQA 1FQ7A 2AOHA 1FQ8A 5P78A 2V12C 1QBRA 3PI0A 2QD8A 3UQPA 2BPYA 5SY3A 4Y45A 1EPOE 5P5AA 4Y4EA 3OQAA 1FIVA 1C6ZA 3EKYA 4Y5MA 1B6MA 3URIA 2BPXA 3ZKNA 5P8KA 2HB4A 5OZZA 5DR8A 1TSQA 3BHEA 3FNTA 3EKXA 5P6UA 4S1GA 2G1RA 5AHCA 1HIHA 3BVAA 5P8UA 1XE6A 2VJ9A 3VV7A 2JYSA 5PEPA 1HSIA 2QAKA 3EL5A 2G69A 1D4IA 3U6AA 5OZSA 3VFBA 4B77A 2EWYA 2AODA 2PK5A 5P2QA 1KJGA 3PRSA 2HC0A 3F9QA 3O99A 5P4OA 4EQ0A 4JOOA 3GW5A 4Z4XA 5P1MA 1HXWA 3PMYA 5HE4A 5P3QA 1TQFA 5DR1A 2VIJA 4Y3GA 3VEUA 1AZ5A 1GVUA 3Q4BA 5P81A 3APRE 2AVVA 3IN3A 3Q6YA 3D1XA 2QMFA 4OD9B 4OD9A 3QI1A 1KJFA 2P3DA 2FNTA 4RYCA 5AHAA 5P4SA 1GKTA 4NJSA 4I0FA 2VA7A 2HPEA 3FKTA 2RKGA 4D89A 1IZIA 5P0PA 2OF0A 2BPVA 5P8EA 4Y5NA 2XFIA 1T6GA 5P1RA 5P60A 2P3AA 5OYXA 4I8ZA 1MT8A 2WEBA 1T3RA 4ZSRA 3EM3A 4WY6A 4B0QA 5KAOA 5COOA 1TCXA 3NXNA 4U7QA 3WZ8A 1OEWA 3KFSA 2B42A 2FGUA 4DQHA 2FS4A 5P4YA 5OZ7A 4D8CA 1DPJA 5P6GA 3PWWA 3QS1A 1HVIA 5P0VA 3LIYA 1HTRB 4FSEA 3GGXA 3PWMA 4DJWA 3LNKA 1KJHA 5FIVA 4FCOA 3WB4A 3D1YA 3QVCA 3EL1A 5DQ5A 5AH7A 3VCMA 1QDMA 5P27A 3BXSA 5P87A 5P1YA 2QNPA 2QD6A 1PSNA 3M9FA 1SMRA 3OWNA 1FGCC 1E5OE 2O4KA 3UQXA 4GZFA 4I0IA 5P5ZA 1ZTZA 2QHZA 3BRAA 4Y4UA 2ZDZA 5P1WA 2ZHRA 5C9FA 2XFJA 2R3WA 1YM2A 3QIHA 4Y3XA 1FB7A 4Y38A 2P83A 3TL9A 3N3IA 5P51A 5OZXA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 5J25 A;  3EKQ A;  2G24 A;  5P48 A;  3FSM A;  6FIV A;  1K6V A;  1K6T A;  2AOE A;  3WZ7 A;  4NPU A;  3S8I A;  4XKX A;  5P0L A;  4ACX A;  1ODW A;  4Y58 A;  5I3X A;  2HB2 A;  4FL8 A;  4D85 A;  3VLB A;  3SA5 A;  2WF0 A;  5P0J A;  4J1K A;  2G26 A;  5P84 A;  5P8F A;  5P3H A;  1RL8 A;  3FX5 A;  5HDZ A;  2QCI A;  4ZSP A;  2R9B A;  2AZB A;  3S7L A;  4LAP A;  4J1E A;  3K5F A;  5P89 A;  3S43 A;  4Y5K A;  3UDK A;  1SGZ A;  3LZY A;  4JEC A;  4R5N A;  5P17 A;  5OZW A;  5P40 A;  4AA9 A;  4J1H A;  5KQX A;  2QI6 A;  3LIT A;  2QMP A;  5P0O A;  1M43 A;  2PMA A;  5P71 A;  3DM6 A;  5P8J A;  2F3E A;  3G6Z A;  3S85 A;  5JFP A;  5P3M A;  1PFZ A;  2IQG A;  3EM4 A;  4HDP A;  3KDD A;  5P2V A;  1KJ4 A;  5P66 A;  1ZSR A;  1GNN A;  3HDK A;  2G21 A;  3JW2 A;  2G1O A;  2AOG A;  3SA7 A;  3O9H A;  5OZ6 A;  5P5T A;  1CZI E;  5P22 A;  3EM6 A;  3GI0 A;  3IVH A;  4RRN A;  1YTJ A;  3OTY A;  1SBG A;  2ZJM A;  3PHV A;  4J54 A;  5P7R A;  5P2D A;  3LIZ A;  5P68 A;  4Q1W A;  2OHT A;  2QD7 A;  5P20 A;  3U7S A;  5OZ4 A;  2O4P A;  1APV E; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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