1EPPE

Endothia aspartic proteinase (endothiapepsin) complexed with pd-130,693 (mas phe lys+mtf sta mba)
Total Genus 80
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
80
sequence length
330
structure length
330
Chain Sequence
STGSATTTPIDSLDDAYITPVQIGTPAQTLNLDFDTGSSDLWVFSSETTASEVDGQTIYTPSKSTTAKLLSGATWSISYGDGSSSSGDVYTDTVSVGGLTVTGQAVESAKKVSSSFTEDSTIDGLLGLAFSTLNTVSPTQQKTFFDNAKASLDSPVFTADLGYHAPGTYNFGFIDTTAYTGSITYTAVSTKQGFWEWTSTGYAVGSGTFKSTSIDGIADTGTTLLYLPATVVSAYWAQVSGAKSSSSVGGYVFPCSATLPSFTFGVGSARIVIPGDYIDFGPISTGSSSCFGGIQSSAGIGINIFGDVALKAAFVVFNGATTPTLGFASK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Analyses of ligand binding in five endothiapepsin crystal complexes and their use in the design and evaluation of novel renin inhibitors.
pubmed doi rcsb
molecule keywords ENDOTHIAPEPSIN
molecule tags Hydrolase/hydrolase inhibitor
source organism Cryphonectria parasitica
total genus 80
structure length 330
sequence length 330
ec nomenclature ec 3.4.23.22: Endothiapepsin.
pdb deposition date 1994-07-27

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
E PF00026 Asp Eukaryotic aspartyl protease
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.40.70.10 Mainly Beta Beta Barrel Cathepsin D, subunit A; domain 1 Acid Proteases 1eppE02
2.40.70.10 Mainly Beta Beta Barrel Cathepsin D, subunit A; domain 1 Acid Proteases 1eppE01
3DV1A 5AH9A 3UQWA 5P2LA 1MT9A 2UXZA 2QHCA 1DMPA 5HDUA 3UFLA 2ER0E 1LF4A 4Y3EA 3TPRA 4K4PA 5P52A 2IENA 1HTGA 3T7QA 4Q1YA 3MSKA 1NPAA 1TCXA 3QP0A 1BDLA 5P3OA 5OZPA 5P22A 4FSLA 3SM1A 5HU0A 5P6UA 4GJCA 4Y57A 3PMYA 1EPLE 3IXJA 3SPKA 3EL9A 5P34A 5DQ2A 3EXOA 3RTHA 4F73A 5P00A 1HPOA 5OZEA 5P71A 4BFDA 1LYAB 4I8WA 1LYAA 1IIQA 4Y3YA 3IVIA 2QI6A 5OZZA 2FDDA 5P26A 1BWAA 3CIDA 2ZJNA 2CEMA 4FL8A 1HTEA 2IL2A 1FQ6A 5OYRA 4DQBA 1T6EX 3S2OA 4CPSA 4APEA 1AXAA 5P8RA 4YD5A 5OYQA 3L58A 1DP5A 5P1LA 5P7WA 5E5KA 4LHHA 4K4QA 5P15A 1D4JA 4J1CA 5P0GA 3CICA 6FIVA 2P3BB 3OU3A 3SABA 3LNKA 2P3BA 3N3IA 3D1XA 5P8PA 1BIMA 2O40A 2PSUA 5P02A 5P40A 1EBYA 5P51A 1GVTA 2WECA 4GJBA 4Y5PA 5P36A 3DOXA 1D4HA 4Y3LA 4Y48A 5P7NA 2WEZA 1QRPE 5P1SA 2G21A 5P4MA 5P5RA 1DAZC 3SA4A 5P5QA 2G20A 4I0GA 5P3IA 4Y4AA 3UQUA 3CKPA 1EPPE 4R92A 5P1TA 4Y4JA 1VIJA 5P3DA 2IKUA 1FQ4A 3ZKGA 4GJ5A 5P4EA 2Q5KA 2RSPA 1VIKA 1PROA 3KT5A 2P3AA 4LP9A 3FV3A 5P7EA 3OHFA 5IVRA 2QD7A 3D3TA 2AVOA 1MRXA 5P3EA 1KZKA 1EEDP 1MESA 2OHRA 4Y50A 3TL9A 1RPIA 2FGVA 3L5CA 5P62A 1FG6C 1K2BA 3KYRA 3PWWA 4RCEA 3VFAA 1IVPA 5OYYA 3H5BA 5P0RA 4J17A 5P3KA 5P4XA 5P3ZA 4DPIA 5CONA 3VSWA 5P6SA 1JLDA 5P7PA 2ZYEA 5KOQA 4Y3PA 2QZLA 1OD1A 4NPUA 4Y3XA 1DPJA 1PPME 1HVSA 3EL5A 4YOAA 3WB4A 2AVVA 4LXMA 1SBGA 3K5DA 2FLEA 4MC2A 4F75A 5P19A 5OZRA 3WSJA 5DQ5A 4LL3A 5P5NA 5P0HA 4NJTA 4EHCA 3BVAA 4U7QA 5P3LA 3TTPA 3OAGB 4YA8A 3OAGA 2QZKA 3NU9A 3VFBA 2PK6A 2AZBA 4J0PA 3G6ZA 4J55A 1ZPAA 4RYCA 4ZPEA 3SLZA 3UDPA 1M43A 3OQDA 5KQXA 3DCKA 3GGVA 2R5PA 5P6DA 1ENTE 2ZHSA 3O9BA 5P7GA 1YM4A 2R38A 4DJVA 5ENKA 5DPZA 3OXWA 4PHVA 1MRWA 2OHQA 5P1NA 3NDTA 4DQHA 5P1AA 2FMBA 5P63A 5P35A 1B6MA 2FXEA 3HDKA 5P3YA 4F74A 1MVPA 5P1YA 3ZMGA 5P1KA 5P60A 2ZHVA 4YCKA 4Y35A 2NXLA 2Q3KA 5HE7A 5DR0A 3SA7A 3PB5A 3ZKIA 4Y5LA 4DQCA 3PM4A 3PJ6A 1A8GA 3AIDA 4EJ8A 2VA5A 4E43A 1SH9A 3L5DA 4MC6A 3KN0A 5P5DA 1G35A 3HVGA 3BGBA 5P6FA 4Y5EA 1LYBA 4NJSA 4RCDA 1ZLFA 1BV9A 3IN4A 2O4LA 5P1BA 4I0DA 3G72A 3QPJA 5P0CA 5P5EA 3H0BA 4Y4DA 5OZAA 2Q55A 1WBMA 5P0EA 5P2UA 3VEUA 2WF0A 1HIVA 2VIJA 3I8WA 4GJ7A 4EJLA 5HU1A 4WY1A 3DJKA 1QBTA 3KMYA 5P7VA 3HD8A 1ZAPA 5P8UA 2HB2A 5P5CA 5P7IA 1E82E 1YTGA 5HVPA 4Y5GA 4YOBA 3O9EA 3OTYA 5E5JA 2JXRA 5P86A 5P2MA 3UPJA 4QJ8A 2R9BA 3OOZA 1HVHA 1HIIA 3L5BA 2G69A 5OZMA 2HPEA 1AJXA 5P83A 3LZYA 2QNQA 3IGBA 5P6VA 5OZKA 3O9HA 4EXHA 3LIVA 2QI0A 4U7VA 5P0JA 2RKFA 3BC4A 5HDVA 3QI1A 3UQXA 2AIDA 5BS4A 5P0IA 2ZHTA 2FDEA 5P18A 1HTRB 4L1AB 5OZTA 4Y3MA 5I3VA 3GGAA 2OHLA 4L1AA 1LZQA 4ACXA 5P75A 5T4SA 4B1EA 1TQFA 1HEGE 2F3EA 2G1SA 5B18A 2QI7A 4GMIA 4H3JA 3EKPA 5AHCA 5P09A 4Y3GA 3FX5A 5P1ZA 5JFUA 4Q1NA 2OHTA 3S45A 5P6IA 3UQPA 2VS2A 4PYVA 4B78A 2VIEA 1HTFA 1W5XA 8HVPA 5P82A 1BBSA 1E81E 5P4FA 5KQYA 3UHLA 5P72A 5P6WA 1EPRE 4RGHA 3L3AA 2APRA 4HEGA 4Y38A 4GJ8A 1T3RA 4EXGA 5P66A 2OAHA 5P2TA 5BWYA 3OU1B 4Z50A 1B11A 2FIVA 5P7JA 3OU1A 2H6TA 1PSAA 2QD6A 1PPKE 5P7SA 3HZCA 3VYEA 5P7XA 2R5QA 1GNMA 4XXSA 3U6AA 1GVXA 3KMXA 1D4SA 1HVKA 3BGCA 2AOGA 5P3HA 5P5GA 5C9DA 4FS4A 2B8VA 4ZPFA 1BVEA 1BXQA 1GVVA 1FQXA 1RV7A 4QJ9A 3WZ8A 2QNPA 1MTBA 2QMDA 1B5FB 1EPME 1B5FA 1MPPA 3PSGA 2JYSA 5P16A 4HDBA 1DW6C 5P33A 5P2FA 1K6VA 2PH8A 2I4VA 5P5XA 3NXEA 3VSXA 5P0XA 4MC9A 1LEEA 3TOHA 1IZEA 1DIFA 2V10C 4OD9B 1XE6A 4OD9A 1T7JA 5P6ZA 5P8AA 2JJIA 3Q6YA 4A6CA 2QU2A 3PCWA 4J1KA 3VV6A 4TRWA 4BELA 3SA3A 5HDZA 9HVPA 3PHVA 5P5JA 3EL1A 4N00A 4QJ2A 4Y53A 3NR6A 5P8DA 5KQFA 2WF3A 4RVJA 2VIYA 3K4VC 3ZPSA 4Y39A 3VLBA 1HEFE 4Y4ZA 3MWSA 4EP2A 1FQ7A 1G2KA 5P8JA 2QZXA 4BFBA 4ER2E 4NJUA 5SXNA 5P20A 1SMEA 5P7FA 5AH7A 5P41A 5DR4A 2O4KA 3MSLA 2NMYA 3LPIA 5UPJA 2R8NA 5P8LA 4I0IA 5P5IA 3M9FA 1KJ7A 1N49A 3EBZA 4J0VA 2MIPA 5P5UA 3KA2A 4YDFA 1Z8CA 5P4HA 5P3UA 4OBGA 5P2GA 2PSVA 4IVTA 1MSMA 5P28A 2QP8A 3EC0A 3NU5A 1YX9A 4K4RA 5P74A 3LZVA 5P5TA 3IXOA 2VA6A 5P3RA 1BAIA 2XFJA 1PSNA 5P2KA 1B6LA 3S7LA 3BUFA 5P89A 4RLDA 4KE1A 5P3NA 4DJXA 4UPJA 3L59A 4XX3A 4NPTA 5OZIA 3I6OA 1YG9A 1APWE 1A30A 2V13A 1Z1HA 3OQFA 1KJGA 5DR8A 5P0AA 5P6XA 5JFPA 3K5CA 3SA5A 4FM6A 5ISKA 4Y37A 2B8LA 5HE4A 5P6BA 5P2EA 4Q1XA 5P8EA 5P29A 4Y44A 5JG1A 5P4OA 4YCTA 5OYTA 1EBZA 4J54A 2EWYA 1ZSRA 1LV1A 5P3FA 5P6KA 2AODA 1SP5A 4PPHA 3OQAA 4NKKA 2IEOA 2QMFA 4L7JA 4DJOA 5HE5A 2PMAA 4A4QA 5P6GA 5OZ0A 4EQ0A 5DR7A 3S7MA 3OADB 5OZYA 2AVQA 4FM8A 3OADA 2IGXA 4I0HA 3KF0A 3HAUA 1XE5A 5HD0A 4DJYA 2QMGA 4LAPA 3SFCA 4RVIA 4DQEA 5P5BA 1KJHA 5P5FA 2RENA 3B7VA 5P30A 4OC6B 3ZLQA 2IGYA 1ZJ7A 4OC6A 2IDWA 3TPJA 3JW2A 3NUJA 4FRKA 5P7HA 3TH9A 3ECGA 5P17A 5P56A 5P5VA 3GI4A 5OZBA 1MUIA 2O4NA 2WF4A 3I7EA 3PI5A 1FQ8A 2AZ9A 3LPJA 3UQRA 5P49A 1EPOE 3GGXA 1B6KA 2G1RA 5P87A 2XFIA 4J0ZA 2RMPA 3NU6A 1WKRA 5OYVA 3SO9A 4FIVA 4Y56A 1RL8A 4Y41A 5P4GA 4B77A 2OHSA 2OF0A 1PPLE 2F80A 1QBRA 5P8MA 1K6TA 1FKNA 4YCYA 1QDMA 1W5YA 5P0OA 3KDCA 1YT9A 3G70A 1FGCC 4H3GA 4KE0A 3KDBA 3OOTA 4X2LA 5P0BA 3INFA 3SAAA 5ENMA 2QI4A 3NWXA 2PK5A 1GKTA 4DPFA 5KR1A 5P03A 4B1DA 5P0MA 5P1EA 4Y3TA 2UY0A 1ZBGA 1LYWB 3HLOA 1LYWA 2B7ZA 2QI5A 3O9DA 4U8WA 2NTRA 1HBVA 3R0WA 4Y3SA 4YDGA 5P7CA 1NPWA 3TLHA 1FEJC 1T7KA 4XKXA 4YBFA 2FXDA 4CPUA 3DV5A 2QI3A 5IVTA 2AVMA 4GYEA 1YM2A 2I4DA 2R43A 1XN3A 1SMRA 1EBKC 1D4IA 4ZSPA 2PYNA 3UDKA 1IDAA 3VYDA 5P4TA 5P2IA 2AOCA 3ER5E 5P61A 4R5NA 4Y6MA 2HM1A 4Y54A 3BUHA 3PWMA 1BWBA 5DQCA 5P6QA 4JP9A 5KQZA 1C6XA 4FM7A 5P65A 5P2RA 3T6IA 4XX4A 4HLAA 2ZE1A 3VV7A 1TSQA 5P5AA 5SZ9A 5P2AA 1YTHA 5P0WA 3QS1A 4Q1WA 4Y5AA 5OYUA 2P3CA 7UPJA 5P5SA 4Y43A 1HSGA 3SA8A 2ZJMA 4HA5A 2P3DA 5OZ2A 4B00A 2VJ7A 4B05A 3PSUA 1K2CA 5P1GA 4Y3JA 5P4RA 3RTMA 5P3JA 5P0UA 2AOIA 3QRMA 5P14A 5P2ZA 4I0ZA 1B6PA 3K5GA 2I4WA 2PH6A 2WEAA 2Z54A 5P1CA 2G94A 1E80E 3D1YA 5P6OA 5IE1A 5OZ8A 3LINA 5P6MA 5OZJA 3LHGA 5COPA 5APRE 2I4XA 3NSHA 5DGUA 3K4VA 1W5WA 3BHEA 4K9HA 5P4UA 5P0PA 5P53A 4JPEA 5P85A 3EKTA 1ZP8A 3ZKNA 3R0YA 5P59A 1FB7A 1PFZA 5EZXA 3APRE 5P3PA 2SAMA 3TPLA 6APRE 4Y3WA 4AMTA 5P1PA 4DH6A 2I0AA 1ZPKA 3BVBA 4AA8A 1HPXA 2ASIA 5P8OA 2WEDA 3D91A 3OQ7A 3QVCA 4GZFA 3CKTA 4RZ1A 1EC2A 3RU1A 5P6AA 5P5OA 5I3WA 2AQUA 1MEUA 3Q70A 3A2OA 4Y4BA 5P7UA 2P83A 2VNMA 3SACA 2AOEA 2J9JB 1BV7A 2J9JA 2QK5A 3NUOA 5P4PA 3I2LA 5OZ7A 3OU4B 4RRNA 1KJFA 4OBZB 3IVHA 4OBZA 1D4YA 3S54A 2O4PA 3EKXA 3Q5HA 2FNTA 1K6CA 5P84A 3OTSA 4Y58A 5P3MA 4EJDA 5OZGA 4DV9A 3INEA 1MT8A 1ODWA 1HVLA 5DGWA 5P3SA 1ODXA 1HRNA 1APUE 5P4QA 4TRZA 5P38A 1HVRA 5P80A 3EM4A 3OGQA 5P2NA 1G0VA 3EKYA 3EKQA 4Y5CA 1HVJA 4ZLSA 3B80A 1CMSA 2QHYA 5P37A 5P76A 3ZKSA 4H1EA 2Q64A 4Z2ZA 4HDPA 5P04A 4DQFA 5P6LA 5P23A 4FAEA 4BEKA 2Z4OA 3FKTA 4ZSMA 1ZSFA 5P4YA 3NDWA 5P7AA 5AHAA 5OYSA 1LF3A 4Y3DA 5P5KA 4EQJA 4J1FA 1HIHA 1FMUA 4I10A 1OHRA 1SDVA 5P7YA 2V0ZC 2IS0A 5P06A 1D4LA 2NXDA 5AH6A 2B60A 4I0FA 5P7ZA 5P13A 1UPJA 2WEBA 4DJRA 1B6JA 2NMZA 5P6JA 1FG8C 4R91A 2V00A 2F81A 5OZVA 4WTUA 3OXXA 5TOLA 2FGUA 5P79A 1IDBA 3IXKA 4YE3A 4ZSQA 3O9LB 3AUPA 4Y5BA 1ZTZA 5P54A 4RVXA 4ZPGA 5P12A 3FSMA 4CPXA 4GJ9A 1K1UA 1IBQA 2NR6A 3QAAA 3EMYA 2QNNA 3FIVA 2BBBA 2ER6E 5P44A 3O9FA 4CPTA 2VKMA 2OHMA 4L7HA 4I12A 1C6ZA 1HXBA 4Y3QA 5DR3A 4TVHA 4R95A 3HW1A 5P8FA 2ZJLA 3FNTA 3OUCA 3QBFA 4GIDA 1F7AA 4WY6A 3INHA 5P1OA 3SA9A 2NXMA 2HAHA 4EYRA 4CP7A 2UPJA 4YD7A 5KOSA 1FMBA 3VUCA 2O4SA 5P8IA 1QS8A 3S85A 5ER1E 4J5JA 4CPWA 5P8CA 4HE9A 2AZ8A 5P7LA 2BPWA 4D83A 1APTE 2HPFA 5IS4A 4Z4XA 3UDMA 2IRZA 5OZ3A 1AAQA 4I11A 3ZKXA 4KUPA 4ER1E 4FRIA 5P4BA 3UDHA 3D20A 4R8YA 5OZFA 1XS7D 1FMXA 5P5YA 4LXAA 2B7FA 3SKGA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 3DV1 A;  5AH9 A;  3UQW A;  5P2L A;  1MT9 A;  2UXZ A;  2QHC A;  1DMP A;  5HDU A;  3UFL A;  2ER0 E;  1LF4 A;  4Y3E A;  3TPR A;  4K4P A;  5P52 A;  2IEN A;  1HTG A;  3T7Q A;  4Q1Y A;  3MSK A;  1NPA A;  1TCX A;  3QP0 A;  1BDL A;  5P3O A;  5OZP A;  5P22 A;  4FSL A;  3SM1 A;  5HU0 A;  5P6U A;  4GJC A;  4Y57 A;  3PMY A;  1EPL E;  3IXJ A;  3SPK A;  3EL9 A;  5P34 A;  5DQ2 A;  3EXO A;  3RTH A;  4F73 A;  5P00 A;  1HPO A;  5OZE A;  5P71 A;  4BFD A;  1LYA B;  4I8W A;  1LYA A;  1IIQ A;  4Y3Y A;  3IVI A;  2QI6 A;  5OZZ A;  2FDD A;  5P26 A;  1BWA A;  3CID A;  2ZJN A;  2CEM A;  4FL8 A;  1HTE A;  2IL2 A;  1FQ6 A;  5OYR A;  4DQB A;  1T6E X;  3S2O A;  4CPS A;  4APE A;  1AXA A;  5P8R A;  4YD5 A;  5OYQ A;  3L58 A;  1DP5 A;  5P1L A;  5P7W A;  5E5K A;  4LHH A;  4K4Q A;  5P15 A;  1D4J A;  4J1C A;  5P0G A;  3CIC A;  6FIV A;  2P3B B;  3OU3 A;  3SAB A;  3LNK A;  2P3B A;  3N3I A;  3D1X A;  5P8P A;  1BIM A;  2O40 A;  2PSU A;  5P02 A;  5P40 A;  1EBY A;  5P51 A;  1GVT A;  2WEC A;  4GJB A;  4Y5P A;  5P36 A;  3DOX A;  1D4H A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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