1GVUA

Endothiapepsin complex with h189
Total Genus 82
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
82
sequence length
329
structure length
328
Chain Sequence
STGSATTTPIDSLDDAYITPVQIGTPAQTLNLDFDTGSSDLWVFSSETTASEVQTIYTPSKSTTAKLLSGATWSISYGDGSSSSGDVYTDTVSVGGLTVTGQAVESAKKVSSSFTEDSTIDGLLGLAFSTLNTVSPTQQKTFFDNAKASLDSPVFTADLGYHAPGTYNFGFIDTTAYTGSITYTAVSTKQGFWEWTSTGYAVGSGTFKSTSIDGIADTGTTLLYLPATVVSAYWAQVSGAKSSSSVGGYVFPCSATLPSFTFGVGSARIVIPGDYIDFGPISTGSSSCFGGIQSSAGIGINIFGDVALKAAFVVFNGATTPTLGFASK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Five Atomic Resolution Structures of Endothiapepsin Inhibitor Complexes: Implications for the Aspartic Proteinase Mechanism
pubmed doi rcsb
molecule keywords ENDOTHIAPEPSIN
molecule tags Hydrolase/hydrolase inhibitor
total genus 82
structure length 328
sequence length 329
ec nomenclature ec 3.4.23.22: Endothiapepsin.
pdb deposition date 2002-02-27

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00026 Asp Eukaryotic aspartyl protease
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.40.70.10 Mainly Beta Beta Barrel Cathepsin D, subunit A; domain 1 Acid Proteases 1gvuA02
2.40.70.10 Mainly Beta Beta Barrel Cathepsin D, subunit A; domain 1 Acid Proteases 1gvuA01
1ZAPA 2AVOA 5P4BA 1Z8CA 3O9LB 5P1PA 3N4LA 3UDYA 5P4FA 1B6MA 2O4KA 3QRSA 4NJSA 4EPJA 4Y5MA 3URLA 1K1TA 1OHRA 3LITA 4ER1E 3FX5A 1B6LA 3UTLA 3BGBA 5P4UA 3JW2A 5IE1A 2P8HA 3OOTA 4BFBA 4M8XA 1HTRB 3K5GA 6UPJA 2OF0A 3PSYA 5P1TA 3VG1A 2P4JA 5IVSA 5OZRA 3QBHA 2QHYA 5HCOA 2ASIA 2H6TA 5P11A 3L58A 1FMXA 3TPJA 3PI5A 4QLHA 1BAIA 4FLGA 4DUSA 1DPJA 2QI5A 4K9HA 5I3WA 2FDEA 1EBYA 3SA3A 4FE6A 4R93A 5B18A 5P34A 5HDUA 5OZHA 4WTUA 5P4PA 5P6VA 2XFKA 3VFAA 5P72A 4R5NA 5P0NA 3IN3A 4J1CA 3QN8A 3PSGA 2V11C 3Q70A 4Y4JA 1DAZC 5HE5A 5OZCA 2AZ8A 4OBGA 3S56A 5P3BA 3OQKA 3OUAA 3LPIA 4ZPEA 5P2UA 2BB9A 3QIHA 4GJ7A 5OZAA 2WEAA 1NPWA 1ZPKA 4Y4DA 5HTZA 3TOGA 3O9AA 5P60A 1MESA 2AZBA 5P2LA 5P80A 4B77A 3NXNA 1HSHA 2QD8A 1K6TA 4Y3AA 2G1YA 5P36A 4EJKA 4J0TA 5P2FA 3PI0A 5P4GA 2PSUA 4FL8A 3UF3A 3PM4A 2G20A 3S85A 1AJVA 4XX3A 1MRXA 1MIQA 5P2GA 5SXNA 5OZOA 2I4UA 2G26A 5P8TA 5P1CA 5OZWA 3URIA 5P5BA 1SGZA 2R5QA 5P23A 2PYMA 3GGVA 4YCTA 4GZFA 5P4WA 5P7RA 4D88A 1DMPA 1IVPA 2JXRA 2FGVA 4OBKA 4Y4TA 4DJXA 3ZKSA 5P09A 1QRPE 2B7ZA 1GVVA 1YTJA 2JJIA 1EBWA 5P1MA 4YD7A 4D83A 4NKKA 5UPJA 2IGXA 4I0ZA 4I0IA 4FRSA 4Y54A 4LBTA 4FIVA 5OZLA 4FSLA 2QZXA 1FIVA 4MC1A 4I12A 3ZKNA 1FEJC 1FFIC 5P05A 4IVTA 2VJ7A 5P7NA 1KJGA 1WBKA 4EQ0A 4FGXA 2XFJA 3VV6A 4Y53A 5P0YA 1W51A 1WBMA 1HPXA 3PJ6A 4NPTA 4J0VA 5P2OA 2F3FA 2AOHA 5P5SA 1TZSA 4Y4UA 2VS2A 5P8AA 2Z54A 1EPRE 1EPPE 3C9XA 4Y5PA 5P5MA 2FNSA 5P3VA 4XXSA 5CLMA 1QBTA 4JPCA 2IGYA 3KYRA 5P6DA 5P0CA 1MSMA 2VA7A 3OHHA 3I8WA 2AZCA 3KFPA 5P7JA 2PYNA 3HAUA 2V0ZC 3OQAA 4YDGA 1EPME 1NPAA 3MXEA 3OHFA 3K4VA 3HBOA 1BWBA 2NR6A 4E43A 1PROA 1YTHA 5OZZA 1QDMA 5P0ZA 2HB3A 4OBFA 1HVHA 3VSWA 2J9KA 5P3RA 5P3OA 3EC0A 2QHCA 4AZYA 2OHLA 4U7QA 2QNQA 3LIVA 4D85A 4DV9A 2HM1A 3NU3A 5P3IA 3QRMA 1VIJA 1XL5A 4Y43A 1C6XA 1E82E 1JLDA 5P8LA 4DQGA 1G2KA 4Y3JA 2I4DA 1MT8A 2WEZA 2R8NA 5P5PA 3TNEA 6FIVA 1BWAA 1PPKE 5OYUA 5P63A 3IN4A 3INEA 5P6GA 2RMPA 7UPJA 5P1WA 1EPLE 2HPEA 2VA5A 5P7CA 2IDWA 3L3AA 3PMUA 1D4SA 4I0HA 5P0DA 4LL3A 5P84A 5P1LA 3KM4A 2BPWA 4DI2A 3FNUA 4RRNA 4NPUA 4JECA 2F3EA 1HTFA 3EL9A 1YTGA 3PWRA 3BGCA 3KDBA 3RTHA 3OQDA 4Y3PA 1UH7A 5OZ4A 5P1KA 2QD6A 4RVIA 2BPVA 2VIZA 1META 2HB2A 5P2SA 3PLDA 6APRE 1BDLA 3KT2A 1ZSFA 5P86A 4DJQA 4PZWA 3SKGA 2I4XA 3WB4A 1FQ5A 5P0GA 5SY2A 4JP9A 1BXOA 1KJ7A 2IKOA 3NU4A 3OUDB 4ZSQA 5OZKA 1YG9A 4AMTA 1MT9A 1HTGA 1G0VA 4RYCA 5P58A 1HIIA 5SY3A 4QJAA 5P74A 4RCDA 3Q6YA 5P5IA 2QD7A 5P6AA 3TTPA 4X2LA 3NU6A 1W50A 3BUFA 4LAPA 5P1XA 4F76A 1HBVA 4Z2ZA 3UQRA 5P5OA 5P64A 5P4DA 1ODWA 4Y3ZA 5OZNA 4IVSA 1QBUA 3EMYA 3DK1A 5P8GA 2WJOA 1M43A 5P4RA 2G69A 2JYSA 2ZHUA 4TRWA 5P7PA 1CPIA 1TCWA 2Q3KA 4B70A 4K4QA 5DQ4A 5OZXA 5OZ5A 5P7BA 4Y3FA 5P30A 5P4JA 5P4XA 3VFBA 3SA6A 1CMSA 5P0WA 5P2EA 5P1OA 4CPTA 4I0JA 2ER9E 3EM4A 5AH9A 3L38A 4LHHA 4LP9A 3SAAA 8HVPA 3RU1A 5AH6A 5P4AA 3UFLA 3O9EA 1FQ4A 2O4NA 3M9FA 2ANLA 2VIYA 3SM1A 5OZ1A 5AHCA 3KF0A 2BPZA 4Y3DA 2ZJIA 1BIMA 4NJTA 3NUJA 2I4VA 4WY6A 1ZSRA 5CONA 3L5BA 5COKA 2IQGA 3TL9A 5P25A 5P4ZA 5EZXA 3WZ7A 4DJRA 4YA8A 5P6TA 4RGHA 5P5NA 3VYFA 5P79A 3TKWA 4GJ6A 3PBZA 3T11A 5P2MA 2QNPA 2VIJA 1MVPA 4CPXA 4Y5AA 5P76A 1EEDP 3ECGA 2WF4A 5BWYA 4ZEAA 1KJFA 4LXKA 5JODA 3DUYA 1GVXA 4Y3YA 1BV9A 1RL8A 5AH8A 3NWXA 1IDBA 5P07A 2QMGA 3WZ8A 4B05A 5P31A 1MRWA 1N49A 3SQFA 2AQUA 3BXRA 3OADA 2QK5A 4HLAA 5P6JA 4XKXA 1F34A 5P5XA 5P67A 3OADB 1YT9A 5AH7A 1XS7D 2OHTA 4ER4E 4HZTA 3EKXA 5P6MA 5P1RA 2FXEA 5P5ZA 4JOOA 3LIQA 3QROA 1FF0C 2MIPA 3OUBA 4FM6A 5P4OA 5P6PA 1MPPA 4WY1A 2PSVA 3IVHA 5I3XA 3IXOA 2FNTA 3LZUA 4KE1A 3KMYA 3PCZA 4YD5A 2AODA 1TW7A 4NJUA 4J1FA 4AUCA 4ZLSA 4Y3HA 5P5QA 2G1OA 1Z1RA 3EKQA 1C6YA 3EL4A 5KR2A 1HSIA 1HVCA 5P3NA 4Y5NA 3NSHA 5P6WA 5OYSA 4Y3EA 2ZHVA 3BHEA 1D4JA 5OZGA 5P3PA 5HDVA 4QGIA 5DQ2A 5P7QA 5COOA 1T7IA 5P69A 1EPQE 5OZSA 2J9JB 5P3DA 4GJDA 2P83A 4JPEA 5P00A 3Q4BA 5P0RA 4B1DA 4Y3LA 4QJ2A 3HZCA 5P0KA 1B5FA 4EQJA 2AZ9A 1AZ5A 4CP7A 4Y45A 1B5FB 3LZVA 5OYTA 2O40A 4Y5CA 5P8IA 5JG1A 5P5WA 3PSUA 5DR3A 1KJ4A 5P1JA 5OZFA 5OYQA 2PH8A 3B80A 5P87A 4RROA 2QMPA 4ZPGA 3DCRA 4B00A 3SA7A 5P0LA 4RCFA 5HVPA 1D4IA 5OZMA 3VCMA 5P33A 3INHA 5P4SA 3OQFA 4CMSA 5P8NA 4Y36A 5P47A 4GJAA 3OQ7A 3OAGB 1GVUA 5P75A 5ER2E 5P41A 3ZKIA 5P56A 3KFRA 5P8SA 1FQ7A 1M0BA 3S43A 3LIZA 2HIZA 3D1XA 1HPVA 3S43B 3INFA 4L7JA 3FKTA 5P59A 5P54A 5OZ2A 3GI5A 1FQXA 5P0SA 5C9DA 4J54A 2WHHA 2VNNA 2APRA 1FB7A 1BDQA 3SKFA 3OGQA 1ZTZA 1W5VA 1FG6C 1ME6A 5P43A 4YCKA 1B6PA 2CENA 1T6EX 4H3FA 4R91A 3T7PA 3VF3A 2G1NA 4YD4A 2B8LA 5P85A 3ER3E 5P3MA 2HS1A 3D1ZA 3SA8A 3BXSA 1A9MA 5DQCA 3SA4A 4TVHA 1IZHA 3VSXA 1Q9PA 5P4EA 1SGUA 2FLEA 3CKTA 3BUHA 2JE4A 3UPJA 2PSGA 5P83A 3GGAA 4KUPA 5P5CA 2QMFA 3TH9A 5FIVA 4BELA 4GYEA 4U8WA 1RNEA 2NXDA 3O9IA 4B72A 4Y5GA 4K4RA 3UFNA 3UDJA 5P50A 1T7JA 5T4SA 2WECA 5P16A 3EM6A 3SABA 3NR6A 3KMXA 5P18A 2AOGA 2Q54A 3OTSA 4Y4GA 1HRNA 3PGIA 2WF2A 2V12C 2PWCA 3EKTA 3OWNA 3D20A 3ZKMA 4FCOA 4CPQA 4FRKA 1GVTA 3VF7A 5P7AA 2AVVA 3K5FA 4J0PA 5P5HA 1DP5A 4EXHA 4Y3SA 5P3JA 1FMBA 3NDUA 5P3AA 5E5JA 5P38A 5P20A 2QCIA 4ZSMA 3PWMA 3KA2A 3UQUA 5P65A 2R3WA 3WSJA 4I0DA 2ZJHA 5P02A 3DOXA 5DGUA 9HVPA 3PWWA 5OZQA 5P3GA 5P6EA 4GJ9A 4DFGA 5P5JA 2I0DA 4Y5BA 1IIQA 1RPIA 5KAOA 4QJ9A 3OGPA 2QZKA 5BS4A 2OHSA 5P2TA 5P01A 5OZBA 1PSAA 1D4LA 4CPRA 1QS8A 3PMYA 5P48A 3ZPSA 1BBSA 3Q5HA 4Z22A 3DJKA 2AVQA 4Y4EA 1HVRA 3OU4B 1BXQA 2AOEA 1HOSA 2PQZA 1W5YA 2ZDZA 3OXVA 1QBSA 3H5BA 4Y4WA 5DQ1A 2BPXA 5P4KA 4DJYA 4L6BA 2V16C 1A30A 2B60A 3S53A 1T3RA 5P8FA 4ZPFA 3SACA 4RYGA 1HVIA 3GI6A 3PB5A 1GKTA 4I0EA 5P4IA 1APWE 3TOHA 2PK5A 5P1YA 5P1FA 5HU1A 2ZJMA 5OZIA 4ZE6A 3A2OA 1FFFC 3S2OA 1VIKA 1AJXA 4R95A 4CPUA 4J1HA 3ZOVA 4ACXA 1TQFA 5P3WA 4F73A 5OZUA 5P6HA 3U71A 2QI7A 4GJCA 1ODYA 5KR1A 4Y58A 5P7EA 4EJLA 4YDFA 5P1UA 4FRIA 1C6ZA 4I10A 5P2JA 4TVGA 3QBFA 4NJVA 3BVBA 5P0PA 5P6YA 3ZKQA 1PSNA 1Z1HA 5P2XA 5P5DA 3NLSA 3F9QA 1SMEA 3OXXA 3QS1A 4F75A 3JVYA 3R1GB 4X7IA 5KQZA 2A1EA 5P4MA 1HTEA 5P3CA 5P7LA 2XYEA 4APEA 4L7HA 5OZ9A 5P28A 4FM8A 5P68A 1B6JA 5P5VA 3SA9A 2SAMA 4YD3A 2I1AA 5JFPA 1PPLE 3TOFA 4K4PA 1TSUA 5P2AA 4QJ6A 4RCEA 4LXMA 4Y57A 2F80A 3EKVA 4RVJA 3CIBA 4EWOA 1D4YA 1XE5A 5P29A 3OUDA 1PPME 1A8GA 1ZJ7A 2QI3A 5OYVA 1AVFA 3PRSA 5P8DA 2V00A 5P26A 1BDRA 1LEEA 4ZSPA 5P40A 5P37A 1YM4A 1ENTE 2ZHSA 5P77A 3KDDA 2QZWA 2QNNA 4ZSRA 5P5TA 1HIHA 3SFCA 4Y4AA 5P61A 2BQVA 3NU5A 3EBZA 4PHVA 3HW1A 3HDKA 3AUPA 5P6FA 2VA6A 1GNMA 5P2NA 4PEPA 2HAHA 2I4WA 2ZJKA 4Y51A 5P81A 2P3DA 5DR4A 5KQXA 2Q63A 1IZEA 2G22A 5PEPA 5P2VA 4Q5MA 3BC4A 2P3CA 3HVPA 2QI1A 3PVKA 5AHAA 5P0MA 4H3JA 4GIDA 1HVJA 3LNKA 5P52A 3EM3A 4FS4A 1E81E 5P0TA 4DJPA 1XL2A 3L5EA 3NYGA 4FRJA 5P1IA 4DJWA 4HDFA 4Z50A 5ENKA 3KFSA 3Q3TA 3S7LA 4APRE 4J0YA 5P5FA 5P0BA 5P12A 5P6IA 4F74A 2ZE1A 4FM7A 4YOAA 4KE0A 2WF0A 2FIVA 4DJVA 3SM2A 5P7WA 3QPJA 3PCWA 2QMDA 4Y5KA 4EHCA 5P27A 4RVXA 3H0BA 2G21A 4XX4A 5HDXA 2H6SA 5OYWA 5P1GA 4OD9A 5P1AA 5HE7A 4OD9B 1APTE 4GJBA 3PHVA 5P88A 5P6ZA 2IENA 5P6NA 3IAWA 1HIVA 3GGUA 3QRVA 3T6IA 2I4QA 4DVFA 3QVCA 5P19A 5P8JA 4L1AA 3FNSA 4L1AB 2XFIA 5P5AA 1BVGA 4GJ8A 5P8KA 3ZLQA 5P57A 2O4LA 3G6ZA 1MT7A 4DQFA 5OZTA 4U7VA 4EYRA 4I0GA 5P8RA 5P62A 5P32A 3MXDA 1SP5A 1LZQA 5P4HA 5P7KA 2VJ9A 3TPRA 1ZP8A 5F01A 1EC0A 4DJUA 2P3BA 5P6XA 4R8YA 3OY4A 2BKTA 2UY0A 3G70A 5P53A 5KR8A 3EL0A 2P3BB 5P2YA 5P8VA 5C9BA 5HE4A 3DM6A 1HEGE 3I7EA 1XN2A 1UH9A 4DQHA 5DPZA 2QP8A 3UCBA 2RSPA 3O9FA 2OHNA 4L7GA 5P6OA 5P7DA 5P06A 3R0YA 1HPOA 3ZL7A 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 1ZAP A;  2AVO A;  5P4B A;  1Z8C A;  3O9L B;  5P1P A;  3N4L A;  3UDY A;  5P4F A;  1B6M A;  2O4K A;  3QRS A;  4NJS A;  4EPJ A;  4Y5M A;  3URL A;  1K1T A;  1OHR A;  3LIT A;  4ER1 E;  3FX5 A;  1B6L A;  3UTL A;  3BGB A;  5P4U A;  3JW2 A;  5IE1 A;  2P8H A;  3OOT A;  4BFB A;  4M8X A;  1HTR B;  3K5G A;  6UPJ A;  2OF0 A;  3PSY A;  5P1T A;  3VG1 A;  2P4J A;  5IVS A;  5OZR A;  3QBH A;  2QHY A;  5HCO A;  2ASI A;  2H6T A;  5P11 A;  3L58 A;  1FMX A;  3TPJ A;  3PI5 A;  4QLH A;  1BAI A;  4FLG A;  4DUS A;  1DPJ A;  2QI5 A;  4K9H A;  5I3W A;  2FDE A;  1EBY A;  3SA3 A;  4FE6 A;  4R93 A;  5B18 A;  5P34 A;  5HDU A;  5OZH A;  4WTU A;  5P4P A;  5P6V A;  2XFK A;  3VFA A;  5P72 A;  4R5N A;  5P0N A;  3IN3 A;  4J1C A;  3QN8 A;  3PSG A;  2V11 C;  3Q70 A;  4Y4J A;  1DAZ C;  5HE5 A;  5OZC A;  2AZ8 A;  4OBG A;  3S56 A;  5P3B A;  3OQK A;  3OUA A;  3LPI A;  4ZPE A;  5P2U A;  2BB9 A;  3QIH A;  4GJ7 A;  5OZA A;  2WEA A;  1NPW A;  1ZPK A;  4Y4D A;  5HTZ A;  3TOG A;  3O9A A;  5P60 A;  1MES A;  2AZB A;  5P2L A;  5P80 A;  4B77 A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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