1IBQA

Aspergillopepsin from aspergillus phoenicis
Total Genus 79
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
79
sequence length
325
structure length
325
Chain Sequence
SKGSAVTTPQNNDEEYLTPVTVGKSTLHLDFDTGSADLWVFSDELPSSEQTGHDLYTPSSSATKLSGYSWDISYGDGSSASGDVYRDTVTVGGVTTNKQAVEAASKISSEFVQDTANDGLLGLAFSSINTVQPKAQTTFFDTVKSQLDSPLFAVQLKHDAPGVYDFGYIDDSKYTGSITYTDADSSQGYWGFSTDGYSIGDGSSSSSGFSAIADTGTTLILLDDEIVSAYYEQVSGAQESYEAGGYVFSCSTDLPDFTVVIGDYKAVVPGKYINYAPVSTGSSTCYGGIQSNSGLGLSILGDVFLKSQYVVFNSEGPKLGFAAQA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structure of aspergillopepsin I from Aspergillus phoenicis: variations of the S1'-S2 subsite in aspartic proteinases.
pubmed doi rcsb
molecule keywords ASPERGILLOPEPSIN
molecule tags Hydrolase
total genus 79
structure length 325
sequence length 325
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.4.23.18: Aspergillopepsin I.
pdb deposition date 2001-03-28

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00026 Asp Eukaryotic aspartyl protease
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.40.70.10 Mainly Beta Beta Barrel Cathepsin D, subunit A; domain 1 Acid Proteases 1ibqA02
2.40.70.10 Mainly Beta Beta Barrel Cathepsin D, subunit A; domain 1 Acid Proteases 1ibqA01
3FX5A 2NXMA 3CYXA 4B1CA 5OYSA 2V16C 4L7HA 3RSXA 5OZ0A 5P55A 3IXJA 2JJJA 3ZMGA 4J55A 5ISJA 2P3DA 3LPJA 1TSQA 3L5CA 4QJ8A 3VV7A 5I70A 1HHPA 5HTZA 2FDPA 3EL4A 5P4YA 1KJHA 4I0GA 5P0MA 4Y50A 2ZE1A 3PI5A 2Q54A 4I0JA 3NYGA 2Q5KA 5P0YA 3UCBA 4B0QA 5P4ZA 5P37A 2ZHUA 2IGXA 1HPVA 1T7IA 2QD8A 1HIHA 3INHA 3VYEA 5KR2A 3HDKA 5P4IA 4Y5EA 3VFBA 1D4SA 2FDDA 4L7JA 5SXNA 4RRNA 5P3ZA 5P6EA 5P00A 1LF3A 4X2LA 5P4GA 5P52A 5P3WA 5OZAA 2QNNA 2PSGA 5P6SA 5P0LA 5P1XA 5P28A 5P7FA 3QAAA 4Z2ZA 4Y35A 5P8NA 3GI6A 3L3AA 4J5JA 4Y3LA 3KDDA 1LYWA 4DJXA 1HVSA 5P6JA 3I6OA 3OAGA 5P8KA 3KM4A 3ZLQA 5P48A 4CMSA 3DM6A 1HVCA 3NDUA 5P3XA 1EBZA 2Q3KA 5OZYA 3C9XA 4FGXA 5ENKA 5P2SA 5HU0A 2I0AA 5P4KA 3APPA 5P3EA 5ER2E 1TQFA 1RL8A 4GJ9A 4QJ2A 4Y3EA 1QBRA 5P67A 1EBYA 1FQ6A 3O9IA 5HDUA 3TPLA 4Y4TA 4APRE 1B5FA 4R5NA 5P3YA 4FM7A 4EJ8A 5JFUA 4B77A 4Y41A 3T6IA 3SA4A 6UPJA 3EL9A 2IDWA 1BBSA 2F8GA 5P59A 5P6IA 4R91A 1MSMA 2Q11A 4J0ZA 3UQRA 1EBWA 3ZKIA 3QIHA 2UY0A 1Z1HA 5P7VA 3WZ7A 2VA7A 2QAKA 4Q1NA 2A1EA 1EC3A 2WEAA 1SDVA 1W5WA 4NKKA 4OBFA 5OZXA 1LEEA 4L1AA 5COOA 1GNMA 5P3OA 2WF0A 3G70A 3VLBA 5P7PA 2Q63A 3SA9A 4NJUA 3R4BA 3ZPUA 4Y58A 1BVGA 4YCKA 2ZGAA 3LHGA 1K1TA 3DUYA 1FGCC 3ZKXA 4OBGA 3INEA 2IS0A 1HTRB 3PHVA 1HXBA 4NPTA 4RVJA 5P62A 1HPXA 4OD9A 4PEPA 4JOOA 3S53A 4YA8A 4EJLA 4GIDA 5P8AA 4ZEAA 3EM3A 5P1BA 7UPJA 1HSGA 5P5FA 3SA7A 4HZTA 3BVBA 4U7VA 2ZJHA 5OYTA 5OZOA 3NWQA 4Y4ZA 1W5XA 5P7AA 3ZPSA 3NUOA 4J1FA 2V11C 4HLAA 2Z4OA 3MXEA 1YTHA 4QGIA 2BJUA 2AOHA 2PK6A 1KZKA 4FM8A 2QI5A 5OZHA 4Y4WA 1B6PA 4CP7A 4ER4E 3UF3A 2MIPA 1EEDP 5P1TA 4APEA 2ZJNA 2B60A 3OADB 4Y43A 5P0BA 3OQDA 2ZJMA 4DQFA 5J25A 2QMGA 4K4PA 4Y4XA 4Y54A 2R3WA 3NU5A 5P1DA 5P2WA 3G72A 4DJOA 4AZYA 2FNTA 2VIZA 1LS5A 3DV1A 3KDBA 1FMUA 4M8XA 2OHLA 4Y5LA 5P2VA 4PZWA 4LP9A 5P2DA 4R93A 4GJ5A 1MT7A 3HW1A 1MT9A 5P8EA 4M8YA 3OXVA 5CLMA 5OZQA 5P73A 3WSJA 5P1CA 4Y5PA 2QMDA 3PMYA 4Y3XA 2R9BA 1AXAA 4ACUA 4QJAA 5OZUA 3GI5A 3K4VC 3O9BA 4Y5NA 1EPNE 4LAPA 3VV6A 2QMPA 3OUAA 3LITA 5P3RA 4TRWA 3ZKQA 4RCEA 5P7GA 3BGCA 2J9JB 5P4WA 4B1DA 5OYUA 5OZSA 5P2TA 5AH8A 3ZKMA 1SMRA 5IVSA 3WZ6A 3BUGA 1W6IA 3CKPA 3H0BA 5P4LA 5P4NA 5P0KA 3QRVA 4RVIA 5AGZA 3KYRA 3EKXA 2ER6E 3UQXA 4FRSA 1KJ4A 1FQ8A 2QI3A 2F3KA 3VCMA 1PSAA 1CZIE 5P70A 3SM1A 5P2LA 1LYBA 3SQFA 3OU1B 3UDPA 1ENTE 3NLSA 2EWYA 3EXOA 1MTBA 5P4SA 2ZDZA 4S1GA 3FIVA 3SLZA 2APRA 5P49A 3CKRA 3S45A 3D1YA 3I8WA 5P4BA 4B72A 2RMPA 1FQ5A 1YG9A 2ZHTA 5P42A 2R3TA 5P3GA 5P6CA 1BVEA 3EKVA 3QVCA 5P8OA 2P3CA 5ENMA 1ZP8A 4YD7A 3TKWA 3RU1A 2G21A 2BKSA 2R38A 4Y3JA 4YE3A 2R5PA 2PH6A 1OEWA 2UPJA 1WKRA 1IZHA 5P10A 5P6BA 5P03A 2RKGA 2V0ZC 4A6BA 3EM4A 4JECA 3S43B 1BILA 4GB2A 4Y5BA 3VF7A 1C70A 1GKTA 3UDMA 3SO9A 1CMSA 4Y44A 3O9AA 3RTMA 1MPPA 5P7WA 3SACA 2PQZA 5F00A 5P6OA 4F76A 1ZPAA 1ODYA 4B1EA 4ER1E 1MVPA 2QD7A 5T4SA 3OHFA 4Y5GA 2AVSA 1HSIA 3NDWA 5P83A 4I1CA 1HVRA 3VFAA 3RSVA 2OHKA 5P68A 3L58A 3D1XA 1T7JA 4H3FA 4Y36A 5P86A 1KJ7A 4K9HA 5P6TA 2FMBA 5SY2A 4GYEA 1HOSA 4Y3AA 2VJ6A 5OZBA 5P78A 6APRE 4Z4XA 4RCFA 5P1VA 4A4QA 1M4HA 5P3TA 3O9CA 5BRYA 2VIYA 5OZLA 1AAQA 2QNPA 4FM6A 1RV7A 5P7UA 4U8WA 1TZSA 4Q5MA 3RTNA 5P0QA 2HPFA 1IZEA 2P3BA 5P13A 4GJ6A 1SDUA 3IGBA 4Y5CA 5P6HA 1XE5A 3D20A 4I10A 4DPFA 4Y37A 1FKNA 1EPOE 4LBTA 2P4JA 3UQWA 2AIDA 3CIBA 4X7IA 3LIQA 4YOAA 1EPPE 5OZ1A 4OBZB 5P1AA 2P8HA 3LZSA 4D83A 5P4DA 5P57A 2V10C 3JW2A 4Y5KA 4HDBA 3OU4B 3KFNA 2V13A 1W50A 1ZAPA 3Q6YA 4KUPA 3ZPTA 4Y5MA 1FFFC 1G35A 5P0WA 5P7KA 3PCZA 5P6QA 2OHQA 1K6VA 1YT9A 3EMYA 5P2FA 1ZJ7A 4I0EA 5P1EA 5P0SA 5P4MA 3OGQA 5P0JA 1FIVA 3TKGA 4CPSA 4Y56A 5P7MA 1AIDA 1U8GA 5P38A 3U71A 1SBGA 5I3WA 1MRXA 5P7ZA 4Y38A 4HVPA 3GI0A 5P51A 4I0HA 5P33A 5ISKA 5EZZA 2Q64A 1HTGA 3UPJA 3UDJA 4Z22A 3GW5A 5P3JA 2Q55A 4YBIA 4DJPA 4FSLA 1FFIC 1PFZA 3QN8A 3PB5A 4FRKA 2VNMA 5P36A 4COEA 5P07A 2PWCA 3LZVA 5P5DA 2XYEA 1MRWA 3LIVA 2G1NA 5OZWA 3TL9A 4Y48A 2OHSA 1ZBGA 3BRAA 5P7XA 2O4SA 5P0AA 2JJIA 5P75A 1NSOA 4MC1A 5OZTA 3N3IA 1GNNA 5HE4A 1EPRE 4LXMA 4TVHA 3OHHA 5P61A 5P5NA 3PEPA 5P2EA 3PCWA 1SP5A 5OZPA 3O9HA 5OZVA 4YDGA 4D89A 1BDLA 2FXDA 3OQKA 1PPKE 5P4UA 3NDTA 5P8LA 3DJKA 3S54A 4CKUA 1DP5A 5OYYA 1CPIA 4DJWA 5P2AA 5P2RA 2QK5A 1GVVA 3APRE 4Y5AA 5P44A 4CPRA 5P35A 1C6ZA 2F3EA 5P7BA 2VKMA 5DQ1A 5P8IA 1SGUA 1XDHA 2AQUA 4XKXA 5P5HA 5DQ5A 3T7QA 3PBDA 4ACXA 3LPIA 1AZ5A 4JP9A 1BWAA 3VEUA 5P1JA 1HVLA 3U7SA 2QI6A 5P0IA 5SZ9A 7HVPA 5COPA 3R1GB 3HVPA 4FRIA 1FG8C 4I12A 3R0WA 4OC6A 1B6LA 4Y3QA 4PYVA 4A6CA 3QI1A 2PSUA 1IZDA 3O9LA 3NUJA 3S56A 4HE9A 2ER7E 4KE0A 3OOTA 5B18A 1UPJA 5I3XA 2NMZA 4DJYA 3KMXA 4TRZA 4GJ7A 1T6GA 5AH7A 3OUDA 2ZJIA 5P8UA 5OZJA 5IVRA 4J1KA 4ZIPA 3EKPA 1DPJA 1HBVA 4HA5A 5EZXA 1BAIA 5P8RA 2OHRA 5P5TA 2OHNA 2H6TA 5P0RA 3VLAA 4EQJA 1HVHA 2I4UA 3QBFA 4ZLSA 5P5PA 2QZWA 1MERA 5F01A 2CENA 3VYFA 5P0EA 2IRZA 3CICA 5P2ZA 5KQFA 5P6XA 3UDKA 4F75A 3NU4A 4KB9A 5P43A 3OTSA 3PWMA 2OF0A 1DMPA 4Y3WA 3K5FA 1MSNA 1LV1A 3L59A 5P1HA 5P6FA 3UDRA 2HAHA 5DR7A 5P8JA 3I2LA 2A4FA 1LYAA 1GVWA 4Y4AA 3O99A 5IVTA 1FF0C 3D3TA 4F73A 5P8DA 5P6DA 1EC2A 5HDXA 2Z54A 3B7VA 4DFGA 3DK1A 5DR3A 5APRE 4I8WA 2QCIA 3MWSA 5DR8A 5P6NA 5P2KA 2PYNA 1FLHA 1BXOA 5P5MA 5P8TA 4BFDA 5P74A 5P1YA 2NNPA 3QRSA 3KFSA 5P5KA 3CKTA 3JVWA 2B7FA 3VF5A 1SMEA 4RYCA 1PROA 1F34A 3K5GA 2PK5A 2AOEA 3PSYA 4BFBA 1YTGA 1PSOE 4DQEA 5BWYA 1BIMA 5P6RA 5P6LA 3ZKSA 1XL2A 5AHCA 1SIPA 5P1KA 5P41A 4ZPFA 4I0ZA 3TOHA 1FQ4A 3UDNA 3IN4A 5P8BA 4GJBA 4ZSMA 4Y4DA 3SKFA 3OOZA 4Y4EA 2PWRA 4FRJA 3L5EA 3K4VA 4R92A 5OZDA 2BPZA 3SPKA 5P3UA 4EP2A 3URJA 1B6KA 1LF4A 3NU9A 1EPQE 1WBMA 5P1FA 5P8VA 2NPHA 1FQ7A 1FG6C 3OXWA 4EHCA 5P5ZA 3KF0A 2H6SA 3R2FA 3OQFA 4J1EA 4D88A 4XXSA 4J0YA 3PSGA 2SAMA 2G24A 5P19A 1HIIA 3MSLA 5P1NA 4PHVA 3FKTA 3O9FA 5P4RA 5P3LA 3OUBA 5P7OA 5P77A 1NPAA 5P15A 1MESA 1Z1RA 5ER1E 4K8SA 1C6YA 5P02A 3BVAA 5E5KA 3KDCA 2VJ7A 3DCKA 3KA2A 4J1HA 2ZJLA 4DJRA 1ODXA 4Y3PA 3DOXA 4Y3YA 1BXQA 4RRSA 4Y3DA 3WB4A 2UXZA 1HVKA 1GNOA 5P58A 3I25A 4YBFA 4RROA 5P7CA 2B8VA 5P3IA 5P89A 4BELA 5OZ5A 2BB9A 5P7HA 4IVTA 5P4HA 5P4FA 1A8KA 2VIJA 3INDA 2OAHA 5KR8A 3K1WA 4Y47A 5P8FA 1FMXA 4B00A 1TSUA 1VIKA 3G6ZA 2ZHVA 1HVIA 3HZCA 3IVHA 1GVUA 5C9FA 3T7PA 1QDMA 2WKZA 4BEKA 5P7SA 5P34A 1K2CA 2AODA 4Y3RA 4YCYA 5P27A 2RENA 2VNNA 1MEUA 3TPPA 3EL1A 2I4XA 1LYWB 2XFKA 3IA9A 2HIZA 5P60A 5P0DA 3OAGB 3CMSA 4HEGA 4ER2E 3T7XA 3S85A 4LC7A 3PMUA 2P3AA 4YDFA 5P4JA 1D4HA 5AH6A 1HPOA 5P79A 1LF2A 5OZ7A 4XX3A 2BPVA 5P5QA 3PWWA 2HB3A 2NMYA 5P6VA 2RSPA 2QHCA 1B6MA 3AIDA 3Q3TA 3LIYA 4DJVA 5P4TA 5P69A 5P4AA 5P81A 3KFRA 5P25A 5P46A 4J0PA 5P1MA 4QJ6A 2HS2A 2XYFA 3BC4A 1B5FB 5P1OA 1XN3A 4QJ7A 1E5OE 2QD6A 4ZSQA 5OYXA 1SDTA 5P3CA 3QS1A 5P0GA 5P01A 4CPQA 4B78A 5P4QA 5P7JA 2ZJKA 4H1EA 1HPSA 5P5AA 3N4LA 1EC1A 2J9KA 5P7EA 2FIVA 1FMBA 5P5LA 2HB2A 5P5JA 1W5YA 5OZ2A 4TVGA 5P85A 3SA6A 2F81A 4L1AB 1DAZC 1K2BA 3KN0A 4HDPA 4OBHA 4Y45A 4KE1A 3Q5HA 5P2MA 3OQAA 1A9MA 1FEJC 1MTRA 2ER9E 2O4KA 5P8MA 2NXLA 3BGBA 4EXGA 5OZ3A 5I3VA 4MC6A 3OXXA 5P87A 3OY4A 2AOCA 1AJXA 3A2OA 4OD9B 6FIVA 2PYMA 5P2OA 3UTLA 2I4QA 5DPZA 4GJ8A 5P7LA 3NXNA 1XN2A 1A94A 1D4JA 3NU3A 4AA9A 2VA6A 1W6HA 4DQGA 3IVIA 2NNKA 3LIZA 1IDAA 3UFNA 4Z50A 4OBKA 3L5BA 4Y3SA 3BHEA 4LHHA 3KFPA 5P5GA 2QU3A 2BQVA 2RKFA 3SM2A 3KT2A 3OU3A 5JODA 5OZNA 3Q4BA 4NJTA 3TOGA 2QI7A 5P2JA 4FCOA 5P2XA 5P4VA 5OZ4A 3FNTA 2F3FA 5P11A 3S7LA 2HC0A 5OZ8A 4FL8A 4WTUA 2QHZA 4Q1WA 2OHTA 3LPKA 4NJSA 3FNUA 5SY3A 5P39A 2WF1A 5AH9A 4Y9WA 3PWRA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 3FX5 A;  2NXM A;  3CYX A;  4B1C A;  5OYS A;  2V16 C;  4L7H A;  3RSX A;  5OZ0 A;  5P55 A;  3IXJ A;  2JJJ A;  3ZMG A;  4J55 A;  5ISJ A;  2P3D A;  3LPJ A;  1TSQ A;  3L5C A;  4QJ8 A;  3VV7 A;  5I70 A;  1HHP A;  5HTZ A;  2FDP A;  3EL4 A;  5P4Y A;  1KJH A;  4I0G A;  5P0M A;  4Y50 A;  2ZE1 A;  3PI5 A;  2Q54 A;  4I0J A;  3NYG A;  2Q5K A;  5P0Y A;  3UCB A;  4B0Q A;  5P4Z A;  5P37 A;  2ZHU A;  2IGX A;  1HPV A;  1T7I A;  2QD8 A;  1HIH A;  3INH A;  3VYE A;  5KR2 A;  3HDK A;  5P4I A;  4Y5E A;  3VFB A;  1D4S A;  2FDD A;  4L7J A;  5SXN A;  4RRN A;  5P3Z A;  5P6E A;  5P00 A;  1LF3 A;  4X2L A;  5P4G A;  5P52 A;  5P3W A;  5OZA A;  2QNN A;  2PSG A;  5P6S A;  5P0L A;  5P1X A;  5P28 A;  5P7F A;  3QAA A;  4Z2Z A;  4Y35 A;  5P8N A;  3GI6 A;  3L3A A;  4J5J A;  4Y3L A;  3KDD A;  1LYW A;  4DJX A;  1HVS A;  5P6J A;  3I6O A;  3OAG A;  5P8K A;  3KM4 A;  3ZLQ A;  5P48 A;  4CMS A;  3DM6 A;  1HVC A;  3NDU A;  5P3X A;  1EBZ A;  2Q3K A;  5OZY A;  3C9X A;  4FGX A;  5ENK A;  5P2S A;  5HU0 A;  2I0A A;  5P4K A;  3APP A;  5P3E A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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