1IZEA

Crystal structure of aspergillus oryzae aspartic proteinase complexed with pepstatin
Total Genus 84
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
84
sequence length
323
structure length
323
Chain Sequence
AATGSVTTNPTSNDEEYITQVTVGDDTLGLDFDTGSADLWVFSSQTPSSERSGHDYYTPGSSAQKIDGATWSISYGDGSSASGDVYKDKVTVGGVSYDSQAVESAEKVSSEFTQDTANDGLLGLAFSSINTVQPTPQKTFFDNVKSSLSEPIFAVALKHNAPGVYDFGYTDSSKYTGSITYTDVDNSQGFWGFTADGYSIGSDSSSDSITGIADTGTTLLLLDDSIVDAYYEQVNGASYDSSQGGYVFPSSASLPDFSVTIGDYTATVPGEYISFADVGNGQTFGGIQSNSGIGFSIFGDVFLKSQYVVFDASGPRLGFAAQA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Crystal structures of Aspergillus oryzae aspartic proteinase and its complex with an inhibitor pepstatin at 1.9A resolution.
pubmed doi rcsb
molecule keywords aspartic proteinase
molecule tags Hydrolase/hydrolase inhibitor
total genus 84
structure length 323
sequence length 323
ec nomenclature ec 3.4.23.18: Aspergillopepsin I.
pdb deposition date 2002-10-02

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00026 Asp Eukaryotic aspartyl protease
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.40.70.10 Mainly Beta Beta Barrel Cathepsin D, subunit A; domain 1 Acid Proteases 1izeA02
2.40.70.10 Mainly Beta Beta Barrel Cathepsin D, subunit A; domain 1 Acid Proteases 1izeA01
1F34A 3VF5A 2ZHVA 4YCYA 2QP8A 5P3GA 3NR6A 3SKGA 1D4KA 1AJXA 5AHBA 3KFRA 1OHRA 3PSYA 3INDA 5P5UA 2VIJA 2OHMA 2G94A 4I0JA 4Y45A 2QI4A 1D4SA 2XYEA 3RTNA 5KOQA 1C6YA 3PHVA 5OZOA 3R0YA 2JYSA 1GVVA 5OZSA 3TPLA 1FQ8A 4EXGA 5P1UA 2UXZA 1EPQE 3HAWA 2ER7E 4ZPGA 3ZKXA 5P89A 5P49A 2JE4A 3OU4A 2IKUA 1W51A 2EWYA 5P2IA 5P73A 5AHCA 2ZHSA 4CPRA 4NPUA 1EC0A 5P6OA 1MT7A 3LZUA 3HW1A 5P7SA 4Y4AA 5P1AA 2V13A 4RLDA 4YBIA 1EC3A 4Y3LA 5P2EA 1BV7A 3EMYA 3QRMA 3TKGA 3FIVA 4L7GA 5P4PA 5IE1A 4OBHA 3ER5E 5KQFA 5P53A 1K2CA 3ZKNA 3EKXA 4BFBA 3OQ7A 3GI4A 3UHLA 1K6VA 5CONA 1Q9PA 4B05A 4ZSRA 1ZBGA 1RPIA 3N4LA 2R43A 5P4CA 3SM2A 5P24A 1IBQA 4Y50A 1LF2A 2UY0A 5P08A 5P8TA 1MIQA 3M9FA 5P32A 2BBBA 3S7LA 5P2GA 4K4RA 3NU9A 1HVJA 5KQYA 5P4JA 1LZQA 5P2WA 5P7EA 5I70A 5EZXA 5P86A 4Y4WA 4J1CA 5BS4A 1Z1HA 2XFKA 2WF1A 3LHGA 4YDGA 1MEUA 2AOEA 5HE5A 2WF2A 4GZFA 5P1IA 3RSVA 4XX3A 2IENA 5SY2A 4Q1NA 5P2OA 2V16C 4FM6A 3BUHA 2QMPA 3FNTA 2OHKA 2FXDA 6APRE 1M43A 5OZ1A 4X2LA 1FGCC 1G2KA 3BXRA 4LXAA 4AUCA 2HB3A 4MC6A 5P5RA 1HPVA 1YTIA 2QI7A 3HVGA 3NU5A 5P7MA 3CKRA 5DQ1A 3FNSA 4YCKA 3S56A 5P5CA 5P6NA 5P25A 5P1ZA 3SQFA 4F76A 4J5JA 1SMEA 3DJKA 4A6CA 5KR0A 1LYAA 1W6HA 5P79A 5ENMA 4Y3AA 2G69A 4NJSA 2HPEA 4FAFA 2OHNA 3KF0A 1D4IA 5P1GA 3UDJA 1PSOE 5P6WA 4DJQA 3D1ZA 2OHPA 5P18A 4DPFA 3LNKA 1SMRA 5OYYA 5P7VA 4ZIPA 5OZMA 3OQFA 4Y3TA 5P62A 5OZKA 5P0NA 1EBWA 5P3QA 5P3MA 4B00A 4FL8A 4UPJA 1IZDA 1Z1RA 4COEA 2F3KA 1META 5P8MA 3PWMA 2R8NA 5P34A 2BPVA 4FRKA 5P1EA 4Y54A 2ZDZA 5P16A 5P02A 4K4QA 5P1KA 4PZWA 3OTYA 5P1DA 4NKKA 4Y5PA 2HB2A 4GJAA 4PPHA 4EHCA 3L38A 1B6MA 2J9JA 5P8DA 5P59A 3SA4A 4FAEA 3UDMA 1XE6A 5P7XA 3SAAA 5P81A 1G35A 2QNPA 4KE1A 5OZPA 4J0TA 4N00A 5F01A 3SA3A 5P0HA 2AQUA 1MRXA 1MT9A 5OZ5A 5P3JA 3PI0A 4Y4EA 2CEJA 1K2BA 3EKTA 2V0ZC 3WB4A 3SM1A 5P36A 2AOCA 5P6MA 2G26A 4QJ2A 3VEUA 5OZUA 1PROA 2ZJHA 3PWRA 3R0WA 1GVUA 1AIDA 4HLAA 2G22A 3UDNA 4AMTA 3DK1A 5P1HA 3VUCA 5DQCA 5KR1A 1KJ4A 4PZXA 4APRE 1FMUA 3OY4A 3FSMA 1LYBB 5P1PA 1EPNE 1WBKA 2P83A 5P6IA 2H6SA 4CPTA 4DQEA 4AZYA 2WF4A 3CKTA 4OBFA 5OZ6A 4PEPA 5P0CA 3C9XA 3GI6A 3Q70A 2JJIA 5P68A 1IDBA 2ANLA 3MSLA 1ZTZA 5P75A 2P3BB 1C70A 5P5NA 4K8SA 2ZJLA 2FMBA 2F8GA 2G21A 3UDKA 1OD1A 4LC7A 3NXNA 1FQ4A 3KA2A 2NXLA 3R4BA 5P5WA 4R5NA 1QBSA 4H3GA 4RVIA 1MT8A 5P57A 1W50A 1RNEA 2VA7A 5P5ZA 1BDRA 3VYDA 3BVAA 4Y4UA 2VJ7A 3UDQA 1EBKC 4M8XA 3MWSA 1HVLA 3ZLQA 5P1XA 4KE0A 2OHSA 5P4EA 2FXEA 5DPZA 1BDLA 2PK6A 2BJUA 3VV7A 3TL9A 4ZPEA 2I4UA 4OBGA 5P2XA 4J1FA 5OZGA 2XFIA 5P82A 3UQRA 2FGUA 4NJUA 2P3DA 4GB2A 3K5FA 4WTUA 2AIDA 5P45A 1E82E 1HTGA 3T6IA 5HU0A 4F73A 4H3IA 4U7VA 5P4LA 4Y3PA 4TRWA 4QLHA 4CPUA 1C6XA 4GYEA 1EC2A 4YOAA 2ZHRA 5BWYA 1UH7A 5HTZA 1PPKE 4FM7A 4M8YA 3OU4B 5P11A 5P3NA 2P4JA 5P4DA 1BBSA 5P8BA 5OYSA 1IZEA 5P43A 3LPJA 1OEXA 3U7SA 5P0FA 3URIA 5P3TA 3G72A 4DV9A 4I0HA 3QAAA 4I11A 4DQFA 1YTGA 2ZHUA 5P2RA 1ENTE 4DPIA 5P0IA 2QI3A 3QBHA 3IN4A 4Y3EA 3BUFA 1T7JA 3LINA 4I0EA 5P3SA 5P6LA 4Y5LA 3NU4A 5P6ZA 5P6PA 2PSUA 5HD0A 2CENA 5P15A 5OYZA 5P22A 5HCTA 5P4YA 4DQHA 2ASIA 3BXSA 5ER1E 5P3EA 3KDCA 5P0PA 4J0YA 5P1SA 3PVKA 5P5GA 4XX4A 1YG9A 3ZPTA 4Z22A 2PH8A 3T7PA 3PWWA 1A30A 5P0SA 5P6XA 2IRZA 5P5PA 5OZ2A 2QZXA 2PH6A 5E5KA 4R8YA 5HCOA 5I3VA 2WEAA 2G1NA 2PQZA 1ZSFA 2WEBA 2OHTA 5P4MA 5COOA 2P3AA 5P7KA 1KJHA 3QRSA 5P7FA 3UDPA 1QBUA 3R2FA 2O4KA 1LYBA 2OHUA 3GGXA 3IN3A 3O9GA 4DJUA 1QBTA 3N3IA 3CYXA 5F00A 4Y53A 3CIBA 1KJGA 2B7ZA 3OU1B 1GVWA 1F7AA 5DQ5A 4K9HA 4YCTA 5OZ7A 5P0YA 3H5BA 1XL2A 4QJ9A 2NMZA 4Y3MA 5P4QA 3QROA 4Y5MA 5P1LA 4Y4TA 3FNUA 4GJDA 4Y39A 5P3UA 4HZTA 4IVTA 1NPAA 3D91A 2O4NA 1APWE 1LYAB 1MESA 3UQUA 2ER6E 5P80A 5P3DA 4GIDA 4Y3RA 4ER4E 3PBZA 4J1KA 5P47A 4CP7A 3SA8A 4Y3HA 3PB5A 5P2AA 5KR8A 3G70A 1DAZC 4RCDA 4DJRA 3U6AA 3OUCA 4AA9A 5KOSA 3HZCA 2ZE1A 4QGIA 1SDVA 1FQ7A 3VV8A 1W5YA 2WHHA 3WSJA 3JVYA 4Y3WA 5P84A 1D4YA 1EEDP 1APUE 5DGUA 4Y3DA 3OOZA 1CZIE 2QZLA 3TLHA 2VA5A 2I4WA 5P5BA 2G24A 3DM6A 5P0OA 5P67A 4YHQA 3ZPSA 3EXOA 4EP3A 2I4DA 1XDHA 2HAHA 2A1EA 3OOTA 1SIVA 5P61A 1BWBA 3WZ7A 2J9JB 1FG8C 1EBYA 3L5DA 1ER8E 5OZBA 5P7RA 1A8GA 2Z54A 4ER2E 3MXDA 1MERA 5P4TA 3QS1A 1E5OE 4F74A 3TPJA 5P52A 1W5XA 4L6BA 2QI5A 1FEJC 5P3AA 2OAHA 3S2OA 2QNQA 5OZXA 1MUIA 5P23A 1A9MA 1MPPA 1QS8A 2WKZA 4Y43A 4B70A 3HBOA 1HSGA 2VKMA 3RTHA 3PSUA 2HS1A 2BPWA 4HDBA 3D1YA 3OADA 1PSAA 2RKFA 3FV3A 2A4FA 1HHPA 4TVHA 4CKUA 2G1OA 2IL2A 2AVOA 3UDHA 3PSGA 5P0ZA 1IZIA 1EPPE 1B5FB 1D4JA 1QRPE 4DJVA 1ZPKA 3VYFA 4RRNA 2IEOA 5P40A 3RTMA 3VSWA 5P4ZA 2QMGA 4YD4A 3DCKA 5KQXA 2AOGA 2O4LA 2Q54A 3NU6A 5OZ0A 3NWQA 1PPLE 5P2VA 2BPXA 2QI6A 5P5OA 3OGQA 4LXKA 2OF0A 5P5QA 5P87A 4EXHA 1W5WA 3MXEA 5OYTA 5P10A 1MRWA 4RYCA 3VSXA 1MTRA 5P8PA 5OZCA 2AZ9A 5P6DA 4OBJA 4A6BA 4J1HA 2BKSA 3NSHA 5T4SA 3SLZA 2VJ9A 3EM6A 1M4HA 5P5LA 3TNEA 1MSMA 3S53A 3LIZA 1WBMA 1BAIA 1DMPA 1EBZA 1K6PA 4OD9B 5P19A 3EKQA 4ZE6A 2O40A 4B0QA 6UPJA 5EZZA 5P3XA 5P5DA 4ZEAA 3OU1A 1AJVA 3OUDA 4TRYA 5P8LA 3LZVA 4J55A 2ZJMA 3ZOVA 5P77A 4RCEA 3CKPA 2FNSA 4HDFA 1T6EX 5P26A 5P58A 3D3TA 5OZLA 5P7DA 1A94A 3SFCA 5P5EA 2Q3KA 5P8KA 1HXWA 5P83A 3B7VA 3QPJA 4GJ7A 3KM4A 2I4XA 3OUBA 3OQDA 1HSHA 1D4HA 3L5FA 1HPOA 3SABA 5P1RA 5P5SA 4AA8A 5P3YA 5P5TA 5OZTA 4EP2A 3K5GA 2JXRA 1BILA 1UPJA 3GGAA 5P0TA 5P65A 1PFZA 1FFIC 3VFBA 3S54A 2F81A 3NYGA 5COKA 5P7CA 2IGYA 2B7FA 3LZYA 2AZCA 2BPYA 1B6KA 1NSOA 1GNMA 5P2UA 5P6GA 4OBZB 4Y56A 4Y5NA 3KFSA 2ER0E 2J9KA 3PMYA 4HEGA 5P71A 3LIQA 5E5JA 3NXEA 6FIVA 1B11A 3LZSA 2AOJA 5P29A 2NXDA 5P0KA 1SP5A 2ZJIA 1W6IA 5OYRA 4Y4GA 5P3RA 1T7IA 1EPRE 1HIVA 1BXOA 5P4HA 3O9AA 5P4UA 3UQPA 4DQGA 1MTBA 3VF7A 4EJDA 5P4NA 1QBRA 2PWCA 2WJOA 4DQBA 5HVPA 5P8EA 5DQ4A 3UCBA 2R5PA 4I0IA 5P76A 3OXWA 2QHZA 2G1SA 2R3WA 1GKTA 4I12A 5P6CA 4D89A 1VIKA 2QMDA 4Y4JA 3OAGB 3EKPA 3PLDA 3O9EA 1ME6A 4APEA 5P28A 1YTHA 1B6JA 3T3CA 4GJ5A 5P2HA 3TOHA 4FS4A 5P27A 5P14A 1YM4A 2FDDA 2PWRA 4I1CA 3TKWA 1EPLE 4U8WA 4JPEA 1B5FA 4Y3SA 3OU3A 3IGBA 5OZ9A 3KFNA 4FRJA 2Z4OA 5P1CA 3VLAA 4H3FA 5BRYA 4L1AB 3TOFA 2QI0A 3OWNA 3UPJA 1ZP8A 5P0WA 4EPJA 5P8AA 2R3TA 4Z4XA 5P41A 2FS4A 7UPJA 4GMIA 1LV1A 4Y35A 1IDAA 5P3IA 1T3RA 2V11C 2AVMA 3ZL7A 5P8SA 2PMAA 1ODXA 1FKNA 1ZSRA 5P66A 1BVEA 3HDKA 3O99A 2V10C 2VIEA 1HVHA 5P51A 3EKWA 5OZRA 4BELA 5P60A 4LBTA 4DI2A 3Q6YA 1W5VA 2NR6A 5P78A 3OK9A 2FDEA 5P1OA 5P6UA 5P3HA 1TW7A 5P74A 4BEKA 4OD9A 1DP5A 4EQJA 2WL0A 5P48A 5P7WA 1SBGA 4R95A 5OZ8A 3LPKA 5P1FA 3CYWA 4Y3GA 5P3BA 5P7OA 3S45A 2AODA 4B1EA 3APPA 1YX9A 2F80A 3EL1A 5P5HA 5P1TA 5P55A 1AVFA 2BPZA 3JW2A 4Y5KA 2Q63A 5OZJA 3SKFA 5P64A 4QJ6A 1K1TA 2QU2A 5P1JA 1DPJA 4YBFA 2VNMA 1LF4A 5OYUA 2Q11A 3HAUA 5P8RA 5P1VA 4EJKA 1DW6C 5HE7A 3INHA 3R1GB 5P6FA 2AZBA 1HIIA 4NPTA 4DVFA 5P13A 2NNPA 1LF3A 5OZYA 2QCIA 5P5AA 2BKTA 5AH8A 4CPXA 2WEDA 3IXKA 3OXVA 1B6LA 5OZQA 3TPPA 1HVCA 3K5CA 4OBDA 4DJYA 1ZJ7A 2ZHTA 5P6EA 4Y5CA 3IXOA 4HA5A 5P8GA 4FLGA 1ODYA 5OZAA 3PBDA 5P4SA 4A4QA 4I0GA 4F75A 3A2OA 4Y6MA 4ZPFA 2Q64A 1UH8A 4OBZA 2QNNA 5P0XA 5P42A 1J71A 1HRNA 4LAPA 5P0VA 3SA9A 5IVRA 5P1MA 5OZ4A 1KZKA 3AUPA 3EM3A 4Y48A 4I8ZA 4JPCA 5P4OA 5P4FA 5P69A 1HTEA 3HLOA 1XL5A 3URJA 3OADB 3VG1A 2PSGA 4OC6B 4JOOA 3QIHA 1YM2A 5HDUA 4D88A 2IDWA 4FSLA 3D20A 5P03A 5DGWA 3CMSA 3BVBA 3KT5A 2I0DA 1MSNA 2Q15A 1B6PA 4GJ8A 3QRVA 4Y4BA 2B60A 3OTSA 4HVPA 1LYWB 3OAGA 5P7HA 3ZKIA 1DIFA 4Y4ZA 5P4GA 5AGZA 5HDVA 5P6TA 1HOSA 3GGUA 2FNTA 2VJ6A 5P85A 5P7LA 5P1NA 4DQCA 5OYQA 3ZPUA 3EKVA 3EL4A 2WECA 4FM8A 5IVTA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 1F34 A;  3VF5 A;  2ZHV A;  4YCY A;  2QP8 A;  5P3G A;  3NR6 A;  3SKG A;  1D4K A;  1AJX A;  5AHB A;  3KFR A;  1OHR A;  3PSY A;  3IND A;  5P5U A;  2VIJ A;  2OHM A;  2G94 A;  4I0J A;  4Y45 A;  2QI4 A;  1D4S A;  2XYE A;  3RTN A;  5KOQ A;  1C6Y A;  3PHV A;  5OZO A;  3R0Y A;  2JYS A;  1GVV A;  5OZS A;  3TPL A;  1FQ8 A;  4EXG A;  5P1U A;  2UXZ A;  1EPQ E;  3HAW A;  2ER7 E;  4ZPG A;  3ZKX A;  5P89 A;  5P49 A;  2JE4 A;  3OU4 A;  2IKU A;  1W51 A;  2EWY A;  5P2I A;  5P73 A;  5AHC A;  2ZHS A;  4CPR A;  4NPU A;  1EC0 A;  5P6O A;  1MT7 A;  3LZU A;  3HW1 A;  5P7S A;  4Y4A A;  5P1A A;  2V13 A;  4RLD A;  4YBI A;  1EC3 A;  4Y3L A;  5P2E A;  1BV7 A;  3EMY A;  3QRM A;  3TKG A;  3FIV A;  4L7G A;  5P4P A;  5IE1 A;  4OBH A;  3ER5 E;  5KQF A;  5P53 A;  1K2C A;  3ZKN A;  3EKX A;  4BFB A;  3OQ7 A;  3GI4 A;  3UHL A;  1K6V A;  5CON A;  1Q9P A;  4B05 A;  4ZSR A;  1ZBG A;  1RPI A;  3N4L A;  2R43 A;  5P4C A;  3SM2 A;  5P24 A;  1IBQ A;  4Y50 A;  1LF2 A;  2UY0 A;  5P08 A;  5P8T A;  1MIQ A;  3M9F A;  5P32 A;  2BBB A;  3S7L A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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