1ZAPA

Secreted aspartic protease from c. albicans
Total Genus 90
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
90
sequence length
342
structure length
341
Chain Sequence
QAVPVTLHNEQVTYAADITVGSNNQKLNVIVDTGSSDLWVPDVNIDCQVTYSDQTADFCKQKGTYDPSGSSASQDLNTPFSIGYGDGSSSQGTLYKDTVGFGGVSIKNQVLADVDSTSIDQGILGVGYKTNEAGGSYDNVPVTLKKQGVIAKNAYSLYLNSPDSATGQIIFGGVDNAKYSGSLIALPVTSDRELRISLGSVEVSGKTINTDNVDVLLDSGTTITYLQQDLADQIIKAFNGKLTQDSNGNSYEVDCNLSGDVVFNFSKNAKISVPASDFAASTQGDDGQPYDKCQLLFDVNKANILGDNFLRSAYIVYDLDDNEISIAQVKYTSASSTSALT
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structure of a secreted aspartic protease from C. albicans complexed with a potent inhibitor: implications for the design of antifungal agents.
pubmed rcsb
molecule keywords SECRETED ASPARTIC PROTEINASE
molecule tags Aspartic protease
total genus 90
structure length 341
sequence length 342
ec nomenclature ec 3.4.23.24: Candidapepsin.
pdb deposition date 1996-01-16

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00026 Asp Eukaryotic aspartyl protease
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.40.70.10 Mainly Beta Beta Barrel Cathepsin D, subunit A; domain 1 Acid Proteases 1zapA02
2.40.70.10 Mainly Beta Beta Barrel Cathepsin D, subunit A; domain 1 Acid Proteases 1zapA01
4Y44A 2AOHA 4DI2A 5P6PA 1EBKC 3UQWA 5DPZA 4B1DA 1AJXA 4J5JA 3LIZA 2XFJA 5HE7A 5P0YA 1A30A 3F9QA 2Q3KA 1QS8A 1HVSA 2ZHVA 3NDWA 4NPUA 5P70A 3KA2A 4YDGA 1GVTA 4Y35A 4J0VA 3NLSA 3TPJA 5OYVA 4HA5A 2BPXA 4CPRA 1HIHA 5P2QA 2BKSA 3U71A 3OXCA 5P66A 5P8NA 2UY0A 1MUIA 3KFNA 4FIVA 3NUJA 4A6CA 4YD5A 5P09A 5P0NA 5P7AA 3L5DA 2BPZA 3L5BA 3EL4A 1F34A 1PPLE 4CKUA 4CP7A 3HAUA 1F7AA 5P3PA 3UDRA 3SQFA 2AOIA 3VV7A 5P7VA 1LYWA 3TPRA 2QU2A 1ZPAA 3OQ7A 3R0WA 5ER2E 2AOGA 4ZPGA 2QI7A 3BHEA 4GJDA 5P8BA 3BXSA 3O9EA 3LIQA 2F3FA 1B6MA 2R5PA 2OHKA 3Q70A 5P26A 5DQ5A 1FIVA 4GYEA 2Q63A 6APRE 1PPKE 5AH8A 1EPPE 2PQZA 3JVYA 4RCDA 5P7GA 3L3AA 5FIVA 1K1UA 5P01A 4COEA 2HPEA 2QI1A 5P84A 5KQYA 3SAAA 3RTNA 3O9LA 3SM2A 5P8QA 5P57A 5C9BA 3I2LA 2AOJA 2UPJA 4QJAA 1UH8A 2XFIA 4QJ6A 2P8HA 2RKFA 5SZ9A 4CPXA 3VYFA 5ISKA 4K4RA 4L1AB 2QMDA 3EM4A 3T7PA 5P0XA 4AUCA 2R3WA 5P0KA 3EC0A 1QBTA 3ZOVA 5P31A 1ER8E 4CPSA 4XX3A 2XYFA 5P6NA 5P7HA 5P34A 3QBHA 5P7MA 1KJ4A 5OZRA 5P78A 4EPJA 4Y3PA 1MPPA 4FL8A 5P10A 1BDQA 2G24A 4H3IA 3KDCA 5KR8A 2FMBA 5OZQA 1SDVA 3RTMA 4ZIPA 4I0IA 3CMSA 2QZKA 3IVHA 3TPLA 1MESA 4AA8A 1FMUA 5OYWA 5P3DA 4YOAA 5P8AA 5P8FA 3ZKQA 5P19A 5IS4A 5P3NA 4RVIA 3OHFA 5P4PA 5P2OA 5P18A 5AGZA 3QIHA 2Q54A 4Y39A 2EWYA 2I4WA 1B6LA 5OYZA 3OOZA 1HTFA 2AVSA 5EZZA 5DR7A 2WHHA 4I10A 4MC9A 3O9HA 1FGCC 5P4GA 4M8YA 4DJWA 3G70A 5P1GA 3IN3A 4ACXA 2R38A 3IN4A 4MC2A 2WF4A 1SIVA 3OUDB 5P6KA 3PVKA 2UXZA 1T7JA 5P36A 3DUYA 2ER7E 2QHYA 2OHSA 3R2FA 4Z2ZA 2IKUA 2ZJHA 5P4FA 1VIJA 3GW5A 4WY1A 2B7ZA 2P4JA 3PMUA 4FAFA 4FS4A 3UTLA 1IDAA 4I0HA 2QMFA 4LAPA 5P1TA 5P0VA 2ZGAA 7UPJA 4I0JA 5P8PA 2PC0A 1EBWA 3VFBA 4FGXA 4UPJA 2F3KA 4DPFA 1TQFA 3UDYA 5BS4A 3WB5A 1LF3A 1BILA 2XFKA 4A4QA 3RTHA 3VEUA 5P1HA 3MXEA 5P22A 1AZ5A 4FRKA 2WECA 3VF5A 3JVWA 1GNOA 3QRSA 3SPKA 4GZFA 1NSOA 5OZOA 1M0BA 1SGZA 1FKNA 4D88A 1SH9A 3FNTA 4Y5PA 3DV1A 2I4VA 1EC3A 1XN3A 2H6SA 3GGUA 2OHRA 4YOBA 5P65A 5P5WA 1QDMA 5P4SA 4K4PA 5P4UA 3ZKNA 5DGUA 1W50A 4J0TA 3S43A 5P7BA 1SIPA 3UDQA 5P1CA 2AVMA 4DQBA 1BDLA 3H5BA 4X7IA 5P8GA 2QHZA 1YX9A 4R93A 5OZCA 4DJYA 1C70A 1YM4A 3GGXA 3VF7A 1EAGA 4Y4DA 3NU6A 3L5EA 1EPME 5P6QA 2BPWA 3IVIA 1PROA 2VIEA 4E43A 3O9LB 3VFAA 3EM3A 1W6HA 5P2DA 5P03A 5P2HA 2AOCA 5P81A 2Q5KA 3UDKA 4Y4WA 3ER3E 4B0QA 1BAIA 5P73A 5OYXA 1UPJA 4B00A 3IA9A 5P4ZA 2HS1A 2NMYA 2AZ9A 5P60A 2RMPA 1RL8A 3S2OA 1AAQA 3VLAA 5KOQA 4Y4AA 4YBFA 1HVHA 5P6IA 2V13A 1OHRA 5P8TA 3VSXA 5P04A 5ER1E 3S56A 5OZSA 1YTGA 3O9CA 2O40A 5P3LA 5P1FA 1DIFA 2AVOA 2HAHA 5P2JA 4DV9A 2QD7A 3VSWA 5OZ5A 4OBDA 1APWE 1APTE 4H3GA 4DVFA 3EL9A 3NDXA 1G6LA 5OZ3A 1FEJC 2V12C 5EZXA 5P6RA 1GVVA 4Z50A 2PH8A 5P2FA 1A94A 3BC4A 5P47A 4Y3NA 2IS0A 2RKGA 4R91A 4OC6B 3DJKA 3T7XA 4ZLSA 2HB4A 3INDA 3D1YA 2QD6A 5P79A 1BXOA 5P85A 1FQ6A 3LNKA 1E82E 4XX4A 4J17A 3EKTA 2VIJA 5P72A 3DCRA 2NMZA 4Y5CA 3S7MA 5P52A 1UH9A 3OXVA 5P4RA 3L58A 1D4SA 3OADB 2WF2A 5P4JA 1IDBA 2FS4A 3SA8A 4Y5NA 3NU5A 5P7QA 2IL2A 3IGBA 1BV7A 3SKGA 4AA9A 2PWCA 1RQ9A 3OQFA 3LPIA 5P2RA 4YHQA 5P0QA 1AJVA 4YA8A 5P00A 3KN0A 2VJ7A 4OBJA 1B11A 4OBFA 3QS1A 5P5XA 4D89A 4BFBA 4NJSA 2HM1A 3D1ZA 3K4VA 5P41A 5P2GA 5P2SA 4BFDA 1ODWA 3EM6A 5HU0A 2BPYA 4J1CA 4L1AA 2NXMA 4HDFA 1ZSFA 5OZ7A 4YD7A 5P83A 3BVAA 5JFUA 5P1UA 5P7JA 5OZNA 4QJ2A 5UPJA 3DV5A 4Q1NA 3CKRA 4R5NA 1M4HA 1OEWA 5APRE 1KJFA 2FNTA 4KB9A 5P6GA 3KDBA 4Y4BA 1EPLE 1MSNA 2WF3A 2QZWA 4KE1A 3CKTA 4FM6A 4NKKA 1EBYA 5SY2A 2NNPA 3GI5A 1Q9PA 2A1EA 3WZ6A 4J55A 3K5FA 5HE5A 1EC0A 2CEJA 3K1WA 5P44A 2ZHRA 5OZHA 5P16A 5P5HA 1FG6C 3Q6YA 2I0DA 3NXNA 3KMYA 1MTBA 5OZKA 5P15A 2FDPA 4FAEA 4DQHA 3D3TA 3LINA 4Q1XA 1HEFE 1YM2A 5P1JA 3S7LA 4GJ5A 3RSVA 5BRYA 4K4QA 3DOXA 5IVQA 1NH0A 5P8JA 1IBQA 4Y3RA 5SY3A 3OGQA 2BPVA 2R8NA 5ENMA 5PEPA 4R95A 3O9FA 4HEGA 1XL2A 2B7FA 3Q5HA 5IE1A 9HVPA 5P7IA 2AOEA 5C9DA 1BDRA 5P25A 1FQ5A 3TOFA 2JYSA 3OUDA 3OXXA 4APRE 1K2BA 1W5WA 5OYSA 2PYNA 5P4KA 3INFA 5P67A 2VNNA 5P5QA 1XL5A 4J0ZA 4EP3A 5P76A 2NTRA 2NXDA 3KDDA 4EJKA 2G1OA 4JPCA 2B8LA 5P7OA 5COOA 5P82A 3URLA 5P3AA 4DJQA 2G1RA 2QU3A 4Y43A 4Y51A 5P0CA 3OQAA 3ZL7A 4OBKA 4Y3XA 1DMPA 1E80E 2FDEA 3EKPA 4OD9B 4RLDA 5J25A 2ER9E 3IAWA 2OHTA 5IVRA 2HPFA 2IKOA 5KAOA 2CEMA 3TLHA 5P3HA 4NPTA 1M43A 3RVIA 5P1MA 1EC1A 4FM8A 1TCXA 3O9BA 4Z4XA 1W6IA 3ZKSA 6UPJA 1FB7A 3UDHA 2QD8A 1MT8A 3Q3TA 5OZXA 3TOHA 2V10C 2QMGA 1MRWA 3EKVA 2WEAA 2OHNA 2P3AA 1D4HA 3QROA 2IENA 3PGIA 4RVXA 4Y3MA 3NU3A 1ODXA 4Y41A 5ENKA 4EJ8A 1HSGA 4KE0A 3BRAA 3O9DA 5P07A 5P7LA 1ZBGA 3INHA 3OQKA 4QJ7A 3O9GA 5P8EA 4B1CA 5JODA 4J54A 4YE3A 2HIZA 1HRNA 4CPUA 3GGAA 5P3BA 3ZKXA 1ZPKA 5CLMA 1BXQA 5P46A 5P4MA 1FQ4A 4RRSA 3OOTA 4PPHA 5P3UA 3PB5A 2I1AA 4RGHA 5F00A 5OZIA 5P3YA 5P6LA 2WF0A 3SKFA 4PZXA 3I8WA 5P7UA 3GI4A 5P7RA 2ER0E 3QAAA 3UFNA 1HVJA 3OQDA 4Y4ZA 2XYEA 3O9AA 5P0BA 2Z54A 4GIDA 3PWRA 3APPA 5P1VA 5P6HA 1AXAA 3HBOA 5P33A 3UPJA 5P8HA 3PLLA 5P5IA 3I6OA 3LPJA 1KJ7A 4U8WA 4Y50A 3G6ZA 3C9XA 2JJJA 3K5GA 4Y3WA 3TPPA 1AIDA 4Y5LA 3VV6A 4DJXA 3S45A 4EXHA 5I3WA 3B80A 3S54A 2P3BB 5KQFA 3SM1A 5P7FA 4CPWA 5KQZA 4WTUA 1FMBA 4PZWA 3VF3A 4Y3ZA 3T7QA 4Y4UA 4FSEA 2FLEA 2VKMA 3PSYA 4J1FA 5OZZA 5P35A 2Q55A 4GJBA 4NJUA 3QVCA 4J1HA 1NPVA 2VJ9A 3A2OA 4FSLA 2ZHSA 4Y3DA 3QN8A 1AM5A 1C6ZA 3TNEA 4OC6A 1DP5A 5P7YA 2ZE1A 4J0PA 5P4TA 5P5UA 2HS2A 3PI0A 1T3RA 4J0YA 1BVGA 2QI3A 3EKQA 1SP5A 1LYAB 3ER5E 1T7KA 5P7NA 4TVGA 1E5OE 5P6FA 1DW6C 4LHHA 1NPAA 5P80A 3HLOA 3OU1B 2WJOA 3OADA 1EPNE 4U7VA 5P29A 3S53A 3ZLQA 1A8KA 5OZUA 5OZTA 5P4AA 1UH7A 4FCOA 5OZFA 3EKWA 4YBIA 1YG9A 3PI5A 3WZ8A 5P8OA 2ZJLA 3FKTA 1HWRA 3EL5A 3NR6A 5P6BA 5P3SA 2FGUA 4DPIA 8HVPA 2F3EA 1MEUA 1DPJA 1B5FB 1GNMA 1YTIA 5P5YA 1A8GA 2PSVA 5P63A 4EXGA 4Q1WA 4YCYA 1MIQA 4M8XA 5P3VA 3VYDA 3QRVA 5P8SA 1IZHA 3MSKA 3LPKA 5P4CA 4I0EA 4HLAA 3S8IA 2JXRA 1Z8CA 5P3MA 1IZIA 3OWNA 5I70A 5P5TA 2PK6A 2G22A 4DQEA 4GJ7A 3SFCA 2JE4A 1AVFA 3DK1A 4I11A 5P68A 5P2XA 3FV3A 3LZSA 2G26A 2QAKA 3VLBA 1HIVA 5P8IA 2V11C 5P8DA 3SA3A 3S85A 4RZ1A 5P0LA 2FGVA 4Y5MA 1QRPE 3K4VC 4ZSRA 1K6TA 4Y3JA 5P6CA 3HDKA 5COPA 4WY6A 2I4UA 4OBGA 4F74A 3PJ6A 2J9JA 4K8SA 4Z22A 3UHLA 5B18A 3NDTA 3PWWA 3QPJA 4ZSPA 1HVRA 1WBKA 1ZTZA 4K9HA 5P7SA 5P3RA 5P32A 1B6PA 4I8ZA 1WBMA 3SLZA 2NR6A 5OYUA 2VIZA 1CZIE 4PHVA 4Y3LA 1MT7A 5P27A 3OXWA 1HHPA 5P49A 2AVVA 3HVPA 4Y3YA 5DQ4A 5P53A 5HE4A 3T6IA 1SDUA 2G1NA 4TRWA 3HZCA 2IQGA 3M9FA 5OZ0A 5P4YA 5P3FA 3UDNA 2O4PA 3ECGA 5P1WA 3ZPUA 3BVBA 4GB2A 4Y9WA 2QI5A 4GJCA 1FF0C 4FRIA 1KJGA 2R9BA 3UDPA 2R43A 1ZSRA 4FLGA 5DR3A 3PSUA 1C6XA 4Y57A 5P4BA 1W5YA 3HD8A 5P1KA 4B77A 5P4XA 4LC7A 4DUSA 2AOFA 5P0ZA 1RV7A 4EWOA 5C9FA 4OD9A 4YD4A 1TCWA 3PBDA 5P7XA 5E5KA 5P0TA 2HC0A 5P6VA 1HIIA 4Y5AA 5P0JA 5IVSA 4L7HA 3PSGA 5P50A 4RYCA 5P7CA 1W5VA 1K2CA 2FXEA 5P56A 3VYEA 1RNEA 1APUE 3N4LA 2ZJJA 2I4DA 3SACA 5E5JA 5P7WA 5P5ZA 5P2LA 3QI1A 4ZPEA 5DR0A 1TZSA 3RSXA 4F73A 5P0AA 5P5CA 5HDZA 1J71A 5P43A 3QBFA 2ER6E 1GNNA 3SA9A 3O99A 4A6BA 2QI4A 3B7VA 3LIYA 3ST5A 3TTPA 4OBHA 4B78A 3DCKA 4Y3HA 4DJOA 2B42A 3UCBA 3LHGA 5P69A 1LF4A 1G0VA 2ZJNA 2O4KA 5P3TA 5P2BA 1IZEA 5P2YA 3FSMA 4EHCA 3MWSA 2P83A 3R4BA 5P7PA 5P5EA 1PPME 3QVIA 5OZ8A 5P06A 3OHHA 5P48A 1HPOA 5COKA 5P5RA 3BGBA 3GI6A 5P0IA 5P0PA 5P71A 4I0DA 5BWYA 5P7EA 3OU4B 5P5KA 4F76A 4F75A 4Y38A 2J9KA 4RYGA 5P0OA 3VG1A 2IGXA 2F81A 4LXAA 5P2NA 5P5DA 4PEPA 4HE9A 5P2TA 3SA4A 1TW7A 1TSUA 1EPQE 1META 4Y54A 3K5CA 1HVCA 4JPEA 3ZPSA 1QBSA 5HDXA 1MVPA 1YTJA 2P3BA 4NJVA 1OD1A 4GJ8A 5P4WA 1B6JA 4Y37A 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 4Y44 A;  2AOH A;  4DI2 A;  5P6P A;  1EBK C;  3UQW A;  5DPZ A;  4B1D A;  1AJX A;  4J5J A;  3LIZ A;  2XFJ A;  5HE7 A;  5P0Y A;  1A30 A;  3F9Q A;  2Q3K A;  1QS8 A;  1HVS A;  2ZHV A;  3NDW A;  4NPU A;  5P70 A;  3KA2 A;  4YDG A;  1GVT A;  4Y35 A;  4J0V A;  3NLS A;  3TPJ A;  5OYV A;  4HA5 A;  2BPX A;  4CPR A;  1HIH A;  5P2Q A;  2BKS A;  3U71 A;  3OXC A;  5P66 A;  5P8N A;  2UY0 A;  1MUI A;  3KFN A;  4FIV A;  3NUJ A;  4A6C A;  4YD5 A;  5P09 A;  5P0N A;  5P7A A;  3L5D A;  2BPZ A;  3L5B A;  3EL4 A;  1F34 A;  1PPL E;  4CKU A;  4CP7 A;  3HAU A;  1F7A A;  5P3P A;  3UDR A;  3SQF A;  2AOI A;  3VV7 A;  5P7V A;  1LYW A;  3TPR A;  2QU2 A;  1ZPA A;  3OQ7 A;  3R0W A;  5ER2 E;  2AOG A;  4ZPG A;  2QI7 A;  3BHE A;  4GJD A;  5P8B A;  3BXS A;  3O9E A;  3LIQ A;  2F3F A;  1B6M A;  2R5P A;  2OHK A;  3Q70 A;  5P26 A;  5DQ5 A;  1FIV A;  4GYE A;  2Q63 A;  6APR E;  1PPK E;  5AH8 A;  1EPP E;  2PQZ A;  3JVY A;  4RCD A;  5P7G A;  3L3A A;  5FIV A;  1K1U A;  5P01 A;  4COE A;  2HPE A;  2QI1 A;  5P84 A;  5KQY A;  3SAA A;  3RTN A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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