1E5OE

Endothiapepsin complex with inhibitor db2
Total Genus 84
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
84
sequence length
330
structure length
330
Chain Sequence
STGSATTTPIDSLDDAYITPVQIGTPAQTLNLDFDTGSSDLWVFSSETTASEVDGQTIYTPSKSTTAKLLSGATWSISYGDGSSSSGDVYTDTVSVGGLTVTGQAVESAKKVSSSFTEDSTIDGLLGLAFSTLNTVSPTQQKTFFDNAKASLDSPVFTADLGYHAPGTYNFGFIDTTAYTGSITYTAVSTKQGFWEWTSTGYAVGSGTFKSTSIDGIADTGTTLLYLPATVVSAYWAQVSGAKSSSSVGGYVFPCSATLPSFTFGVGSARIVIPGDYIDFGPISTGSSSCFGGIQSSAGIGINIFGDVALKAAFVVFNGATTPTLGFASK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Refinement of Four Endothiapepsin Inhibitor Complexes. Crystallographic Studies of Cytochrome Ch from Methylobacterium Extorquens and Inhibitor Complexes of Aspartic Proteinases.
rcsb
molecule tags Hydrolase/hydrolase inhibitor
molecule keywords ENDOTHIAPEPSIN
total genus 84
structure length 330
sequence length 330
ec nomenclature ec 3.4.23.22: Endothiapepsin.
pdb deposition date 2000-07-28

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
E PF00026 Asp Eukaryotic aspartyl protease
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.40.70.10 Mainly Beta Beta Barrel Cathepsin D, subunit A; domain 1 Acid Proteases 1e5oE02
2.40.70.10 Mainly Beta Beta Barrel Cathepsin D, subunit A; domain 1 Acid Proteases 1e5oE01
5P7ZA 4ZIPA 4K9HA 3QI1A 5P6IA 1HTFA 5P4HA 3K5DA 3UQWA 4HLAA 4RVJA 5P01A 3O9IA 4AA8A 1YT9A 2P3DA 1M43A 3EKYA 2AOIA 1GNOA 3CIBA 1C6YA 1ZTZA 2P3BA 5P6VA 5P23A 3OWNA 3UDNA 3S45A 4Y57A 4U7QA 4B1EA 3UDQA 4Y3SA 4AA9A 4MC1A 4ER1E 3UDMA 4X7IA 4NJUA 3PHVA 4RCEA 1CZIE 2OHTA 5P5SA 2IL2A 3CICA 3JW2A 1LV1A 4J5JA 5KR8A 5P44A 3K4VA 5HDZA 5T4SA 3UDKA 2I0AA 3GI5A 4Y48A 5P1TA 2OAHA 1KJHA 4JP9A 2WEAA 3N3IA 5OYWA 4OD9A 5AHCA 4JPCA 5P3YA 2RKGA 4DH6A 1LYBB 5P5FA 5P3OA 3ZOVA 4D85A 2HB4A 3I2LA 2WEZA 4B00A 1W6HA 3EC0A 1LF3A 3HZCA 5OYSA 2BPWA 2QZWA 3EM6A 3PBDA 1E81E 2NMZA 3AUPA 3NDXA 3ZKIA 1XN3A 3TPRA 5AH9A 4RYGA 5P8SA 5P88A 1M0BA 2BJUA 4BEKA 3VFBA 2O40A 4Y3JA 4Z22A 5HU1A 5P68A 2FMBA 5P6MA 5P3DA 5P5PA 1LS5A 2NR6A 4HA5A 1YM2A 3DCRA 4Z2ZA 4J1FA 3OOZA 4DQGA 1AZ5A 5P1IA 3UQXA 4PYVA 5C9BA 3KYRA 4GJ6A 5P8RA 4ZSMA 2QU3A 4HVPA 2QI0A 3RTHA 5P15A 3PLLA 3JVWA 2V16C 1AXAA 5OZNA 3NWQA 5P0BA 5P42A 4JOOA 1AAQA 2V12C 4RRNA 3OQAA 1RL8A 5P2SA 4I11A 1SBGA 2VJ6A 5P74A 5OZYA 5JFPA 3ZKGA 2RMPA 5HDXA 5P55A 2WF0A 5P4AA 3NDTA 2FGUA 2XYEA 5P4UA 2HS2A 2R3TA 3G70A 4GJ8A 2AOEA 5P79A 1HIHA 1SGZA 2QZKA 4ER4E 1KJ4A 3L59A 3OQFA 3OQ7A 2PYNA 5PEPA 3L3AA 1APUE 1GNMA 5P5YA 2G24A 1ER8E 2IEOA 2ZDZA 5P16A 2QMGA 1ME6A 3KA2A 4FRIA 3PB5A 1T6GA 3TOGA 5P6AA 4M8YA 3EL4A 3GI0A 2BPXA 5OZ2A 1EBKC 5F00A 2R9BA 1G35A 3I25A 5P6YA 3INEA 5P1NA 4CMSA 2P4JA 3LZSA 5P3BA 1HEFE 3PRSA 4QJAA 5HDUA 3QP0A 2APRA 1Q9PA 1LYWA 2HC0A 2Q15A 5I3YA 1LZQA 4OBHA 5P4EA 2QMDA 1C6XA 5P4GA 4RGHA 4KB9A 3S7LA 5ISKA 4QJ6A 1DW6C 5DGWA 1QBSA 4FM8A 1FMBA 4Y4WA 2QMFA 4NKKA 3R0WA 3OGPA 5P72A 5P2HA 2Q64A 5P0PA 1UH7A 2G1OA 3HVPA 4FRJA 4AUCA 3VYDA 5IVRA 2WKZA 5P6RA 3EBZA 1E5OE 3A2OA 4YBIA 1ZSFA 5KQZA 1MRWA 3Q4BA 1FQ6A 3GI4A 5ENMA 5P4VA 2PWRA 1E80E 4UPJA 5DGUA 1BILA 5P1DA 4FAEA 2J9JB 3BXRA 4J0ZA 5P3UA 4EJKA 5P0JA 5P1QA 3ZPTA 1APWE 5JG1A 5P76A 5P51A 5P64A 3S53A 3H5BA 4DVFA 4QJ7A 3TNEA 5P7IA 3NXNA 5OYTA 1LF2A 8HVPA 1HPVA 1D4IA 4I0FA 3URJA 2H6TA 4FL8A 4Y5EA 2RKFA 3OU1B 4COEA 3KN0A 2F3FA 2Q55A 3BGBA 4L7HA 3LPJA 3SPKA 5P2VA 2R38A 2QI6A 3CKRA 5P56A 2A4FA 2V0ZC 2G26A 3DK1A 1MESA 5P6BA 4HDPA 3SA6A 4LXMA 3L5FA 5P3VA 5P04A 5F01A 3QAAA 5P83A 3IN3A 3AIDA 5P0FA 5OZTA 5P0KA 1A9MA 5P1FA 3OTYA 5P3IA 3HLOA 3Q5HA 2FXEA 1B6JA 2B8VA 1OEXA 5P4FA 4PPHA 2ZJJA 4Y9WA 2PH8A 2G1YA 4Y36A 1TSQA 5OZDA 2QD8A 3T3CA 1SDTA 5P7GA 5P80A 4DJPA 4J0PA 5P7VA 5P2KA 1BDRA 4LP9A 4TVGA 5OZ9A 2NXDA 1APTE 4J1KA 4RYCA 1B6LA 4OBGA 3H0BA 5P1JA 4J1IA 2FNSA 4PZWA 3BRAA 5P07A 4A6CA 3S85A 3ZPSA 4RRSA 5P4NA 5P2UA 4Y5GA 5IVSA 4TRZA 4IVTA 4Y4BA 2Q54A 3I6OA 3RVIA 4Y6MA 1HXBA 3IVHA 5P7CA 1IZIA 1NPVA 3APPA 3KF0A 4YD7A 1KJFA 5OZ3A 4E43A 3EKWA 3INDA 1FEJC 1HSHA 3FIVA 5COOA 1FGCC 4WTUA 1DPJA 3I7EA 2RSPA 3EL0A 5P1MA 5HTZA 1HVIA 4ACUA 1WBKA 4Y4GA 3LIZA 2WF1A 3L5EA 2ER0E 5IVTA 5P8PA 5OZ1A 1MUIA 1UPJA 1MT8A 3OHFA 1APVE 4DQBA 1PFZA 1K6PA 1HIIA 1EC2A 5P5AA 4CPTA 3CKPA 1CMSA 2MIPA 1BWAA 3QPJA 5P6XA 4CKUA 3VLAA 3ZKQA 4KE1A 1BIMA 1GVUA 3L5CA 1YG9A 4H3IA 5DQ5A 4R5NA 1G0VA 5P0EA 1OEWA 4Y3FA 2O4PA 5KQFA 4MC2A 5DQCA 1SIPA 2QAKA 3NYGA 2PK6A 3FNTA 3TH9A 2WF3A 2J9KA 1B6PA 2EWYA 1HVLA 1HOSA 5KQXA 3EL5A 4D88A 2R5PA 2OHNA 5OZSA 4FRKA 9HVPA 1YTHA 5P7QA 5P4KA 5P8NA 3HVGA 5OYQA 1KJGA 4LC7A 1MSNA 2AQUA 4ZSRA 4OBZA 1J71A 3QRMA 4TVHA 1G6LA 1T3RA 4I10A 2ZHUA 4I0GA 3OK9A 3TPJA 5P3FA 3VEUA 2F8GA 2PWCA 5KR0A 2QD7A 5COPA 4YHQA 3TLHA 5P7WA 5P3HA 3DUYA 4B05A 4Y3RA 3HAWA 3PCZA 4Y5MA 4L6BA 5I3WA 5P78A 3EKVA 5P6KA 3S2OA 3U7SA 3EXOA 2FXDA 3OUDA 3K5FA 5P0CA 5P26A 1HSIA 1E82E 4JECA 4GB2A 5P7LA 3IN4A 4Y3GA 1DAZC 4Y3LA 2VKMA 5ER1E 3M9FA 3IVIA 2QHCA 5P1YA 5P5TA 1MTBA 1QS8A 5P0RA 1BDLA 3K4VC 2P83A 5BS4A 5AHBA 4F74A 3F9QA 1QBTA 4YCTA 5HVPA 5P4QA 4AZYA 4B77A 1FKNA 5P2GA 3SA7A 2PMAA 4RVIA 2VIYA 3INHA 2O4LA 4H3GA 4DV9A 3DM6A 3QROA 4YOBA 5P4LA 5P2CA 2NPHA 5P43A 3T6IA 5P8HA 2ZHRA 3L38A 5P3JA 1TCWA 1B6MA 4YCYA 1MTRA 5P62A 4R8YA 5P59A 2B7FA 4DQFA 2G94A 3NU4A 3OU4B 3PM4A 5APRE 4GJBA 3SAAA 5P4ZA 4OBKA 2PYMA 3UF3A 1XL5A 1FQ7A 4EXGA 1W51A 4Y35A 3GGXA 4FIVA 4I1CA 1QRPE 3K1WA 4JPEA 4R93A 3N4LA 5P36A 3S56A 1TW7A 3GW5A 3KDCA 3LIQA 5OYUA 2Z4OA 5JFUA 1W5XA 1FQ4A 3LZYA 1K1TA 5P34A 4YD5A 4ZSQA 4Y5LA 3WB4A 5AHAA 3CKTA 2AOJA 5P49A 5P6JA 1FQ5A 3MWSA 5OZGA 3UQPA 4B78A 1PPKE 4ZSPA 5P08A 2R43A 5KQYA 5P5WA 4Y4ZA 2AODA 4Y5BA 2FLEA 4OBFA 4BFDA 1EPNE 5P60A 1HIVA 5P8DA 2QNQA 1MVPA 2IKUA 1AJVA 3O9AA 5P8BA 4Y53A 1VIKA 4I0EA 2PC0A 5OZXA 5P0SA 3WB5A 3ZKNA 4CPWA 3R2FA 5P7FA 4Y4DA 4Y5CA 4DJVA 2BKSA 5C9DA 1SP5A 3OTSA 2BPZA 2AIDA 5P3ZA 5HU0A 1SDUA 5P2DA 1ZBGA 3QVCA 1HPSA 5P1CA 2Q3KA 4RZ1A 4YD3A 3LZVA 5SZ9A 3HAUA 5P0DA 3EKXA 1WKRA 4Y5AA 5OZKA 5P00A 5DPZA 5OZBA 3Q70A 5OZRA 2QU2A 2HB2A 2Z54A 5P32A 3G6ZA 3D1XA 4J17A 4B72A 2QI3A 5P2IA 5P1UA 2IDWA 4U7VA 4FCOA 4D8CA 2OHQA 4I0JA 3VV8A 2HIZA 2F80A 5P38A 5OYXA 1PROA 1HTGA 5OZOA 5P7SA 5P5MA 2B7ZA 2WEDA 5P0GA 3SABA 4Y56A 1PPLE 3EM4A 2PSGA 1FF0C 1HTEA 3OUBA 4K4QA 5P10A 5P71A 2ZJLA 5P37A 1BBSA 1K6VA 4RCDA 3MXEA 1DIFA 2ZHSA 2AOHA 4I0HA 3PSUA 1NSOA 4HEGA 4YCKA 1SDVA 4GYEA 3WSJA 4B1DA 5P1ZA 2PK5A 4Y38A 2NXLA 3CIDA 2QCIA 2I0DA 2QZXA 2V00A 2VIEA 3KFSA 5DQ1A 3NU6A 3VFAA 1IDAA 5OZMA 1RQ9A 1PSOE 5P87A 1JLDA 5HCTA 5P6LA 4XXSA 3EM3A 1FQXA 4ACXA 2AVOA 3RSVA 2B60A 4OC6A 3BUHA 1XDHA 5P2ZA 5P4OA 5P7BA 2ER6E 3FNSA 5P5NA 5P4IA 2UPJA 1OD1A 5CONA 4DJUA 5P1OA 3OADA 3RU1A 3URLA 5C9FA 3UHLA 2VIZA 5P85A 3T7XA 1ZPKA 2AVVA 3LHGA 5P5HA 1ZSRA 1B11A 1XL2A 5P6WA 2XFKA 3NUJA 2NTRA 5HE7A 5P6QA 5P4BA 4CPXA 5P2MA 3O9LA 4DQHA 5I70A 2I4DA 5AH8A 2VJ7A 2Q5KA 4Y3XA 3OU3A 4EP3A 1XE6A 2Q63A 2ZHTA 2AZ8A 4Y3TA 5ENKA 5DR4A 5P1WA 5P4XA 4YDFA 5OZ8A 5P1XA 5P1GA 2VS2A 3UDYA 4DJXA 4Y50A 5P6HA 5P5LA 4FSEA 5AH7A 1TCXA 2HAHA 5P3LA 5JODA 3VSXA 2G1SA 4Y3HA 1GVXA 4APRE 4Y4XA 5P20A 1TZSA 4A6BA 4WY1A 3JVYA 1RNEA 5P2TA 1T7IA 4K8SA 5P02A 3ST5A 4J0TA 5P0YA 5P27A 4D89A 5P03A 5P2EA 5P0VA 1NPAA 1B5FB 3KT2A 5BWYA 2AVMA 5P65A 2WL0A 5OZVA 4DQEA 2FDDA 3ZKMA 5OZQA 5P5EA 1MEUA 5P6GA 5P8KA 3LPIA 5P6OA 3OAGA 4OBZB 4KUPA 5I3XA 1EBYA 3LIVA 3I8WA 3BXSA 4NJTA 4NPTA 4Y47A 4Y3DA 4R91A 1W5WA 5P17A 3ECGA 4OBDA 4LXKA 4LHHA 5P5XA 5P6PA 4Y5KA 3RSXA 3SA9A 3VF5A 5P18A 5KOQA 5TOLA 2QI4A 3LIYA 4ZPEA 5UPJA 3TKGA 4Y39A 1GNNA 2BPVA 3IXKA 5P1BA 2R5QA 3PGIA 6FIVA 4Y45A 4Y3WA 5P7NA 3OUDB 4TRWA 5P7OA 3QS1A 3QRVA 3D1YA 1PSAA 2IQGA 4WY6A 4DUSA 4Y3ZA 2NNKA 3IA9A 4FS4A 2G1NA 4J0YA 4Y3NA 4F73A 5P50A 4CPQA 3TTPA 3QBHA 5P2LA 1AIDA 3O99A 4GJAA 2V11C 3PMUA 1LEEA 5AH6A 3SM2A 2IENA 3SA8A 3LIXA 1B6KA 3HBOA 3SA3A 2IGXA 1C70A 3SQFA 2VJ9A 3U71A 1W50A 1A30A 4DJQA 3SO9A 5OZLA 3ER3E 2VNMA 4AMTA 5P4DA 3K5CA 5P1AA 3BGCA 3OQDA 3S54A 3VSWA 5P57A 3BUGA 5DR1A 1SIVA 2SAMA 3KMYA 5P6NA 4I12A 3PJ6A 4XX4A 4PZXA 2QI1A 2FIVA 4Y3MA 3R0YA 1BAIA 1FMXA 4GJ7A 3O9DA 5FIVA 2ZJIA 4J1HA 2OHKA 1EPME 5OZ4A 1KZKA 1QBUA 5EZXA 1HEGE 5P7KA 4LAPA 2P3BB 3EKPA 1IZDA 1LYAA 1N49A 1YTGA 1C6ZA 3BVBA 4EP2A 2P3CA 5HCOA 3ZL7A 4QGIA 2I4QA 4J54A 3OXWA 5P86A 3EMYA 2QD6A 3UFLA 3D1ZA 2Q11A 4EHCA 2NNPA 1PSNA 4GJDA 4MC9A 5P8UA 3TKWA 4QJ9A 5P39A 1BXQA 3URIA 5P7JA 3VV6A 4FAFA 5P24A 5P5CA 4Q1YA 2AOGA 3L5DA 3UDJA 5P0UA 2QP8A 5P5UA 2O4SA 4FE6A 1HHPA 3BHEA 2HS1A 4YA8A 2QZLA 5P6UA 3VUCA 1OHRA 5P77A 5P1SA 4DJYA 2RENA 3OHHA 2P3AA 4OD9B 5P4JA 3PI0A 5P6DA 5P7XA 3ZLQA 1IBQA 2B8LA 4KE0A 3L58A 1K6CA 3O9EA 5P8QA 5P22A 3VV7A 5P13A 3VCMA 2JJIA 5P2FA 4QJ8A 2PSUA 3PBZA 4Y3AA 1UH9A 4ZPGA 4H3JA 4RCFA 5P30A 4YDGA 1K6TA 4LL3A 3T7PA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 5P7Z A;  4ZIP A;  4K9H A;  3QI1 A;  5P6I A;  1HTF A;  5P4H A;  3K5D A;  3UQW A;  4HLA A;  4RVJ A;  5P01 A;  3O9I A;  4AA8 A;  1YT9 A;  2P3D A;  1M43 A;  3EKY A;  2AOI A;  1GNO A;  3CIB A;  1C6Y A;  1ZTZ A;  2P3B A;  5P6V A;  5P23 A;  3OWN A;  3UDN A;  3S45 A;  4Y57 A;  4U7Q A;  4B1E A;  3UDQ A;  4Y3S A;  4AA9 A;  4MC1 A;  4ER1 E;  3UDM A;  4X7I A;  4NJU A;  3PHV A;  4RCE A;  1CZI E;  2OHT A;  5P5S A;  2IL2 A;  3CIC A;  3JW2 A;  1LV1 A;  4J5J A;  5KR8 A;  5P44 A;  3K4V A;  5HDZ A;  5T4S A;  3UDK A;  2I0A A;  3GI5 A;  4Y48 A;  5P1T A;  2OAH A;  1KJH A;  4JP9 A;  2WEA A;  3N3I A;  5OYW A;  4OD9 A;  5AHC A;  4JPC A;  5P3Y A;  2RKG A;  4DH6 A;  1LYB B;  5P5F A;  5P3O A;  3ZOV A;  4D85 A;  2HB4 A;  3I2L A;  2WEZ A;  4B00 A;  1W6H A;  3EC0 A;  1LF3 A;  3HZC A;  5OYS A;  2BPW A;  2QZW A;  3EM6 A;  3PBD A;  1E81 E;  2NMZ A;  3AUP A;  3NDX A;  3ZKI A;  1XN3 A;  3TPR A;  5AH9 A;  4RYG A;  5P8S A;  5P88 A;  1M0B A;  2BJU A;  4BEK A;  3VFB A;  2O40 A;  4Y3J A;  4Z22 A;  5HU1 A;  5P68 A;  2FMB A;  5P6M A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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