1E80E

Endothiapepsin complex with renin inhibitor merck-kgaa-emd56133
Total Genus 84
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
84
sequence length
330
structure length
330
Chain Sequence
STGSATTTPIDSLDDAYITPVQIGTPAQTLNLDFDTGSSDLWVFSSETTASEVDGQTIYTPSKSTTAKLLSGATWSISYGDGSSSSGDVYTDTVSVGGLTVTGQAVESAKKVSSSFTEDSTIDGLLGLAFSTLNTVSPTQQKTFFDNAKASLDSPVFTADLGYHAPGTYNFGFIDTTAYTGSITYTAVSTKQGFWEWTSTGYAVGSGTFKSTSIDGIADTGTTLLYLPATVVSAYWAQVSGAKSSSSVGGYVFPCSATLPSFTFGVGSARIVIPGDYIDFGPISTGSSSCFGGIQSSAGIGINIFGDVALKAAFVVFNGATTPTLGFASK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Refinement of Four Endothiapepsin Inhibitor Complexes. Crystallographic Studies of Cytochrome Ch from Methylobacterium Extorquens and Inhibitor Complexes of Aspartic Proteinases.
rcsb
molecule tags Hydrolase/hydrolase inhibitor
molecule keywords ENDOTHIAPEPSIN
total genus 84
structure length 330
sequence length 330
ec nomenclature ec 3.4.23.22: Endothiapepsin.
pdb deposition date 2000-09-15

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
E PF00026 Asp Eukaryotic aspartyl protease
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.40.70.10 Mainly Beta Beta Barrel Cathepsin D, subunit A; domain 1 Acid Proteases 1e80E02
2.40.70.10 Mainly Beta Beta Barrel Cathepsin D, subunit A; domain 1 Acid Proteases 1e80E01
3VV7A 4B77A 3O9IA 3OOTA 3U7SA 4I0FA 5P6OA 5P76A 3HAWA 1AZ5A 1EEDP 3CMSA 3UDYA 5P1XA 4RCEA 3GI0A 5KOQA 2VNNA 4EP2A 4Y5GA 5P2WA 5P0GA 5P56A 5P0LA 4OC6B 3QPJA 5P8DA 1QBSA 1W5YA 4OBDA 2ZHTA 5P5ZA 2BPYA 4Z22A 3OUCA 1SGZA 5P25A 3CICA 2AOFA 5P1HA 5P1TA 1AM5A 1BDQA 1XDHA 5P77A 1QRPE 3EKPA 5OYTA 1FLHA 4Y35A 1HPVA 3INDA 1LF2A 5HDZA 1T3RA 2FDDA 3O9FA 2PH8A 4F75A 5P4SA 5P85A 3PCWA 5OYXA 3MXEA 5P5GA 3DCKA 4I8ZA 5P3TA 5P42A 5OZBA 1FG8C 5JFPA 3PI5A 1SBGA 4APRE 5P2SA 1LF4A 4LP9A 5P58A 4AA8A 2QI6A 1E81E 1EBYA 5OZ1A 4MC1A 4A6CA 5OYWA 3B80A 1B6LA 1FGCC 5P1OA 3D1XA 5BWYA 1EC3A 5P7OA 4OBHA 3VYFA 1D4HA 4CP7A 3N4LA 4Y3SA 5SY2A 5P6CA 4QJ8A 5P08A 4LXKA 1FQ8A 1MVPA 4J1FA 4DJPA 5P81A 3UTLA 4BELA 1ZPKA 2BPWA 5P2LA 1META 4KB9A 2OAHA 5P8NA 3HVGA 5IS4A 1MTBA 5P49A 1J71A 5P8BA 2FNTA 4FS4A 3NU4A 5P5BA 4OD9B 3LIZA 4K4RA 3T7PA 4FM8A 3IGBA 4OBZB 1EC1A 5P34A 3UDRA 6APRE 1LV1A 3DV1A 1G35A 2G20A 4Y3HA 5P4FA 2ZJKA 4Y3XA 4CPTA 5P8KA 2OHNA 3INFA 5P3JA 1T6EX 1UH8A 3EL1A 5P4ZA 1C6XA 2OHQA 4Y4TA 4YCKA 4Y58A 1SIPA 5P2FA 5P6XA 1C6ZA 3OADA 5OZLA 2AOCA 3BGBA 1IBQA 3OU1B 2AVOA 3I7EA 4B1DA 3D20A 5P1AA 4AZYA 2VJ6A 1ZTZA 4D8CA 5KR1A 5P64A 4L1AA 3ZLQA 1LF3A 3UDQA 1JLDA 3TOHA 4B72A 2XFJA 5AHBA 2NR6A 2IKOA 5P4DA 5OZHA 3PWMA 4YCYA 2BB9A 4JPEA 1BWAA 1MRWA 3KFPA 5ISKA 5P1GA 5C9DA 3GW5A 2O4KA 4Y3MA 2BPVA 4DUSA 4L7JA 2Q3KA 5P0YA 5P87A 4DPIA 5P3VA 4TRYA 5OZ9A 3VV6A 4AMTA 4EXGA 3PJ6A 1HVCA 4RRSA 3EKWA 4Y3DA 1HVRA 1MSNA 3O9DA 1LYAA 3WB4A 3EL5A 5P4NA 4AA9A 3GGVA 4DJUA 4EJKA 3O9GA 4CPWA 1WBKA 5P2GA 5P8LA 3NXNA 3I2LA 5P6ZA 5AH7A 3IXJA 5DQ2A 1FMUA 5OZMA 4TRZA 5DQ1A 5P1RA 4YD3A 5P1MA 3OUDA 3ER5E 3GI6A 5P6RA 3QI1A 1LYBB 2FDPA 5P6VA 1FMXA 5P6YA 2F3KA 4I12A 5P8RA 4Y4UA 4ER2E 1BV7A 2B60A 5P4CA 5P2CA 5P60A 4PZWA 2WECA 3K1WA 2ZE1A 4Y3LA 5DGWA 3RSVA 4FAEA 1BAIA 5P35A 3K5GA 5P7WA 5P1BA 2O40A 1XN3A 5P33A 3OHHA 5P8QA 5P2EA 4LAPA 5PEPA 4CMSA 2QI5A 5P5RA 4FRKA 3LITA 5P40A 4LXMA 3EKTA 4Y3PA 4NJUA 4HVPA 4Y3FA 5OZJA 4ZSPA 5P0QA 3ZKXA 1K1TA 3NXEA 2V0ZC 4H3GA 5HVPA 4GJ8A 3N3IA 3GGUA 1C70A 2UXZA 4K9HA 4Y50A 5P6WA 3LPIA 1PPLE 5P4EA 4ZEAA 3S7LA 3CKRA 3O9CA 4Y5EA 5P51A 4QJ9A 5COKA 2IGYA 1MEUA 4GJ5A 5T4SA 4RGHA 2WEDA 2QMGA 2PWRA 4Q1YA 1APUE 2Q5KA 4Y3GA 3IXOA 2G22A 4GJAA 2PH6A 4Y6MA 1K2BA 4JP9A 2ZJIA 3T7QA 5E5KA 2B8VA 2HIZA 5P3OA 3IN4A 1A8GA 2G94A 1EAGA 2XYEA 3UFLA 3IN3A 1DW6C 3UQRA 4HDBA 1IZDA 3NR6A 1QBUA 4LHHA 5P63A 3APPA 3DJKA 1FF0C 1NPWA 5P4JA 5P2RA 5P4VA 3NU6A 5P7RA 2VA6A 1GVXA 3NDUA 5SZ9A 1W5XA 4I10A 3KFNA 4EWOA 5P0EA 2VIYA 1E82E 3RTNA 3TKGA 3O9LA 2ZJHA 3QAAA 4B00A 1KZKA 3L59A 4J0VA 4JECA 4U8WA 2QK5A 1ZJ7A 3R4BA 2VJ7A 4RYCA 2OHMA 4FRSA 5P0VA 5J25A 5AH9A 5P3AA 3DV5A 1NH0A 4UPJA 4I0IA 5P4PA 3PMYA 1ODXA 3VF3A 2P3BA 2PQZA 4APEA 4GJ7A 2IL2A 3EL9A 2FXDA 1HIHA 5P4OA 5P61A 5P67A 5P8MA 1B6PA 1ODWA 3SLZA 5P6TA 1SGUA 3VYEA 2IQGA 2Q55A 1MT9A 4J1EA 5P24A 2VNMA 3APRE 3VSWA 5P2VA 3NU3A 4K8SA 3OU4B 5P7HA 1EBKC 3GGXA 5P3ZA 5P07A 3FNUA 2Q11A 2G24A 5P6AA 2QD7A 4I11A 5P1NA 1PPME 4L6BA 4PYVA 4A4QA 3TL9A 3U71A 3NDWA 5DQ4A 2PSVA 7HVPA 3QVCA 5HE4A 2Q54A 3JVYA 2J9JB 8HVPA 5P71A 2AZ9A 4N00A 3SA7A 2AVSA 5P0RA 1BDLA 4QJAA 1WKRA 1ZSFA 5KR0A 2Q15A 5P7ZA 3URJA 2V00A 1NPAA 3LPJA 1EBWA 5EZXA 4Y3EA 5P3IA 3L5BA 3BUGA 4Z4XA 1RQ9A 1HXBA 3UCBA 4HDPA 3QN8A 4BFBA 5P4YA 5P0UA 4M8XA 2PK6A 4X7IA 2AOJA 1YTGA 4Y3YA 3L58A 5P5LA 1HSHA 1FQ5A 5UPJA 3EKVA 3S53A 5OZNA 1AAQA 5P5HA 1GNNA 2UPJA 1VIKA 2AVQA 3CYXA 5P6GA 4I0HA 5P83A 5P4LA 3GGAA 1M4HA 3DOXA 5P7JA 2OHKA 5P75A 1EPPE 3FIVA 3R0WA 2FGUA 2QI4A 1BWBA 3OAGB 3FX5A 3QROA 4PHVA 3SKFA 2OHRA 4FL8A 3ST5A 1AXAA 4FIVA 5P0FA 5P6IA 2JXRA 3M9FA 3D1ZA 3L5EA 1MRXA 5P26A 3UQWA 2FLEA 3KYRA 5P53A 3UPJA 2VA7A 4CPQA 1EBZA 4Q5MA 5P5YA 2B8LA 4QGIA 1PROA 1NSOA 4CKUA 2V11C 2AOEA 3OQFA 3PB5A 5DR4A 2AVVA 3IVIA 4YD6A 5P3HA 3GI5A 4DJWA 5P01A 1MIQA 4HLAA 1B5FA 5AHAA 3H0BA 5DGUA 3LHGA 5P7UA 4BEKA 4XXSA 5P2IA 3EMYA 4DH6A 4EHCA 4J55A 3PRSA 2QD8A 4I0JA 4QJ2A 5P06A 5OZVA 2G21A 4NPTA 5P88A 3O9HA 2G1RA 3SA6A 4YD7A 5KAOA 5P1DA 4J54A 4DVFA 3QBFA 4WTUA 3NSHA 3KF0A 1HIIA 3PHVA 4Y5NA 4YDGA 3RTHA 4TVHA 2PYMA 3EKQA 5P2AA 5P13A 1OEWA 1ME6A 2QP8A 5OZQA 2QMDA 2ZHVA 4PZXA 3PGIA 5OYUA 3F9QA 5P5VA 3EBZA 2QAKA 5P5MA 4GB2A 2Q63A 1DPJA 5I3VA 1D4LA 3UF3A 5DR8A 1HVSA 4FM7A 3WB5A 1AJVA 1KJGA 4R92A 5P10A 5P3LA 1A94A 1VIJA 2NMYA 5P11A 5P3UA 4EJLA 1XL2A 3PLDA 5DR7A 4Y5PA 4Y4DA 4EYRA 5P2HA 5P44A 5HE5A 4ZSMA 2V12C 1K6VA 4ZE6A 3OGPA 3OQAA 4S1GA 4Y39A 2HPEA 5P3XA 4ZIPA 3D91A 4EJDA 4YD5A 5P59A 1MUIA 2WJOA 4FAFA 4Y4WA 3TOGA 4D88A 4R8YA 2F80A 5P4TA 1NPVA 1DIFA 1YX9A 1MSMA 4DQFA 4YDFA 5HU0A 2RSPA 3MXDA 3S8IA 5OZ8A 3OUBA 1HEFE 5OYRA 5CONA 5P0HA 4L1AB 3T6IA 3VF5A 1HTFA 2B7ZA 4CPXA 2Q64A 4ER1E 5HDVA 5OZ3A 3KN0A 4CPSA 1RPIA 3UQXA 3JW2A 3SA8A 2NPHA 4RCDA 1TQFA 4GYEA 3SM2A 2G1NA 4Y48A 5DPZA 1XL5A 2CEJA 1HVIA 5P8FA 1IDBA 3I25A 3AIDA 4Y53A 4XKXA 4DQCA 2G1SA 2IKUA 1SDVA 4Y5KA 5OZOA 3OQDA 3RTMA 1SP5A 5OZ7A 3S7MA 2NTRA 4NJSA 2PMAA 5E5JA 1CPIA 1HRNA 1FB7A 4DQGA 2JE4A 4U7VA 1FKNA 5P7IA 3R0YA 3KM4A 5OZAA 5P80A 5P4MA 3C9XA 2XFKA 2ZYEA 3INEA 3NWQA 2OHUA 4XX3A 2I4DA 4OD9A 3ECGA 3LIVA 3OUDB 5OZRA 2QHZA 3URLA 4QJ7A 4OBZA 4ACUA 3LIQA 4ZPFA 3Q70A 5P6PA 1QDMA 2IS0A 4Q1WA 5HDUA 2FDEA 3L5FA 3JVWA 1E80E 2G1YA 4MC6A 1AVFA 1IDAA 5P0PA 3EL4A 2HB3A 5COPA 5P48A 3OQ7A 4Z50A 4Y54A 5P52A 5AGZA 4OBKA 4J0YA 5P0DA 3VSXA 1FEJC 1HPOA 2QCIA 3QVIA 5OYYA 3H5BA 1EPME 1BILA 4F74A 1G6LA 1IZEA 5P6KA 4LC7A 5P66A 4YHQA 5P2KA 5AH8A 3ZPSA 1FQ7A 2BPXA 3ZPTA 3FV3A 1FQ4A 4I0EA 4QJ6A 5P31A 3IXKA 3KDBA 5P46A 2A1EA 3OXXA 4DQHA 5HCTA 4EQJA 5P0CA 3D1YA 6UPJA 5P16A 2PK5A 3BHEA 1UPJA 5P17A 5I70A 5P19A 2ZHRA 2ER6E 5IVRA 2I4VA 2VIJA 4Y43A 5P45A 4Y38A 3G6ZA 3QRSA 5P5JA 4Y56A 5P7AA 4Q1XA 1ZPAA 1GKTA 1LZQA 1CMSA 1LS5A 5C9BA 4RVJA 2QI7A 3KDCA 2O4PA 3T11A 1ZP8A 5P0TA 4F76A 2VIZA 5P4IA 4FSLA 3UFNA 3VEUA 5P29A 2P3AA 3SACA 5EZZA 5P3NA 4GIDA 4R91A 2HS2A 5DQ5A 5P1IA 2BPZA 5P0JA 2IDWA 4LBTA 2G27A 4DQBA 4B78A 1KJFA 2XFIA 5P2XA 1KJHA 3T3CA 5P3QA 3EM4A 4Y3AA 5P3MA 5JFUA 3TLHA 3NYGA 1DP5A 5P5XA 3UDPA 4Y4BA 1IVPA 4FRJA 3O9LB 5OYSA 1SMRA 2ER0E 3PSGA 4Y4JA 4LXAA 2AOHA 4Y5LA 1FQXA 1YTHA 1APWE 2PC0A 3BUFA 3LNKA 2WL0A 2WF3A 3LIXA 3EKYA 2WEBA 1B6KA 2P3BB 4E43A 5P6BA 1PSAA 3ZKSA 5P41A 3HVPA 4B05A 4Y4XA 5P32A 4DQEA 2ZHSA 2FS4A 5P37A 1IZHA 2ER7E 1MERA 3PLLA 2QI3A 3WZ7A 5OZPA 1PSNA 2F3EA 5P4BA 5P50A 1FIVA 5P4QA 3ZMGA 4YA8A 3CKTA 1APVE 5ENKA 2WEZA 3PMUA 5DQCA 5OZ2A 3TTPA 3LIYA 3O9AA 4JPCA 5P7TA 1MPPA 5P4RA 3K4VA 1FG6C 2QMFA 5P7MA 2SAMA 2WF2A 5I3WA 1Q9PA 2BKSA 3PWRA 4Q1NA 5P3KA 2RENA 2XYFA 2H6TA 1HHPA 4MC2A 5SY3A 3EM3A 2QZWA 3T7XA 2ZJMA 3PBZA 3BC4A 5OZFA 2V16C 2BQVA 3S2OA 1LEEA 2P8HA 5P5EA 4ZSRA 5P1EA 5JODA 5P7NA 3HW1A 3PSUA 1K6PA 2AZCA 5P4KA 5KOSA 5P5UA 5P7KA 2ANLA 4D83A 3Q3TA 4J1HA 5OYZA 3BGCA 3FSMA 1ER8E 3LINA 1D4SA 5ISJA 2ZDZA 4RCFA 2F3FA 4GJCA 3ZL7A 1OD1A 4Y5BA 1N49A 1YTIA 3EXOA 4R95A 1W5VA 3TPJA 5P8JA 2AIDA 4KE0A 3VF7A 5P30A 5P72A 4R93A 3SA9A 5P2YA 5HTZA 3OTSA 5BS4A 4EJ8A 3K5FA 3KFRA 3BXRA 1PPKE 3SM1A 3QBHA 4DV9A 5P8GA 3KA2A 5P27A 1MT7A 3KDDA 1HPSA 4RLDA 1BVEA 3QRMA 5P8EA 1ZSRA 3OU4A 4Y37A 4WY6A 2HM1A 3EL0A 3GI4A 3KMXA 1LYWB 3OQKA 5P5DA 3OXWA 5P84A 4FSEA 5I3XA 1SMEA 4DPFA 2IRZA 1TZSA 5P7LA 5P0ZA 1XN2A 2RKGA 2HAHA 2J9JA 1A9MA 3DM6A 5OZGA 3O9EA 3SKGA 1MT8A 1IZIA 2RMPA 4U7QA 2BKTA 3VYDA 5OZEA 4NJTA 2O4LA 5P04A 5IVSA 3LZUA 4DI2A 1RNEA 5OZ0A 5P79A 2OHPA 5KQFA 1HXWA 2ZHUA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 3VV7 A;  4B77 A;  3O9I A;  3OOT A;  3U7S A;  4I0F A;  5P6O A;  5P76 A;  3HAW A;  1AZ5 A;  1EED P;  3CMS A;  3UDY A;  5P1X A;  4RCE A;  3GI0 A;  5KOQ A;  2VNN A;  4EP2 A;  4Y5G A;  5P2W A;  5P0G A;  5P56 A;  5P0L A;  4OC6 B;  3QPJ A;  5P8D A;  1QBS A;  1W5Y A;  4OBD A;  2ZHT A;  5P5Z A;  2BPY A;  4Z22 A;  3OUC A;  1SGZ A;  5P25 A;  3CIC A;  2AOF A;  5P1H A;  5P1T A;  1AM5 A;  1BDQ A;  1XDH A;  5P77 A;  1QRP E;  3EKP A;  5OYT A;  1FLH A;  4Y35 A;  1HPV A;  3IND A;  1LF2 A;  5HDZ A;  1T3R A;  2FDD A;  3O9F A;  2PH8 A;  4F75 A;  5P4S A;  5P85 A;  3PCW A;  5OYX A;  3MXE A;  5P5G A;  3DCK A;  4I8Z A;  5P3T A;  5P42 A;  5OZB A;  1FG8 C;  5JFP A;  3PI5 A;  1SBG A;  4APR E;  5P2S A;  1LF4 A;  4LP9 A;  5P58 A;  4AA8 A;  2QI6 A;  1E81 E;  1EBY A;  5OZ1 A;  4MC1 A;  4A6C A;  5OYW A;  3B80 A;  1B6L A;  1FGC C;  5P1O A;  3D1X A;  5BWY A;  1EC3 A;  5P7O A;  4OBH A;  3VYF A;  1D4H A;  4CP7 A;  3N4L A;  4Y3S A;  5SY2 A;  5P6C A;  4QJ8 A;  5P08 A;  4LXK A;  1FQ8 A;  1MVP A;  4J1F A;  4DJP A;  5P81 A;  3UTL A;  4BEL A;  1ZPK A;  2BPW A;  5P2L A;  1MET A;  4KB9 A;  2OAH A;  5P8N A;  3HVG A;  5IS4 A;  1MTB A;  5P49 A;  1J71 A;  5P8B A;  2FNT A;  4FS4 A;  3NU4 A;  5P5B A;  4OD9 B;  3LIZ A;  4K4R A;  3T7P A;  4FM8 A;  3IGB A;  4OBZ B;  1EC1 A;  5P34 A;  3UDR A;  6APR E;  1LV1 A;  3DV1 A;  1G35 A;  2G20 A;  4Y3H A;  5P4F A;  2ZJK A;  4Y3X A;  4CPT A;  5P8K A;  2OHN A;  3INF A;  5P3J A;  1T6E X;  1UH8 A;  3EL1 A;  5P4Z A;  1C6X A;  2OHQ A;  4Y4T A;  4YCK A;  4Y58 A;  1SIP A;  5P2F A;  5P6X A;  1C6Z A;  3OAD A;  5OZL A;  2AOC A;  3BGB A;  1IBQ A;  3OU1 B;  2AVO A;  3I7E A;  4B1D A;  3D20 A;  5P1A A;  4AZY A;  2VJ6 A;  1ZTZ A;  4D8C A;  5KR1 A;  5P64 A;  4L1A A;  3ZLQ A;  1LF3 A;  3UDQ A;  1JLD A;  3TOH A;  4B72 A;  2XFJ A;  5AHB A;  2NR6 A;  2IKO A;  5P4D A;  5OZH A;  3PWM A;  4YCY A;  2BB9 A;  4JPE A;  1BWA A;  1MRW A;  3KFP A;  5ISK A;  5P1G A;  5C9D A;  3GW5 A;  2O4K A;  4Y3M A;  2BPV A;  4DUS A;  4L7J A;  2Q3K A;  5P0Y A;  5P87 A;  4DPI A;  5P3V A;  4TRY A;  5OZ9 A;  3VV6 A;  4AMT A;  4EXG A;  3PJ6 A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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