1EPPE

Endothia aspartic proteinase (endothiapepsin) complexed with pd-130,693 (mas phe lys+mtf sta mba)
Total Genus 80
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
80
sequence length
330
structure length
330
Chain Sequence
STGSATTTPIDSLDDAYITPVQIGTPAQTLNLDFDTGSSDLWVFSSETTASEVDGQTIYTPSKSTTAKLLSGATWSISYGDGSSSSGDVYTDTVSVGGLTVTGQAVESAKKVSSSFTEDSTIDGLLGLAFSTLNTVSPTQQKTFFDNAKASLDSPVFTADLGYHAPGTYNFGFIDTTAYTGSITYTAVSTKQGFWEWTSTGYAVGSGTFKSTSIDGIADTGTTLLYLPATVVSAYWAQVSGAKSSSSVGGYVFPCSATLPSFTFGVGSARIVIPGDYIDFGPISTGSSSCFGGIQSSAGIGINIFGDVALKAAFVVFNGATTPTLGFASK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Analyses of ligand binding in five endothiapepsin crystal complexes and their use in the design and evaluation of novel renin inhibitors.
pubmed doi rcsb
molecule tags Hydrolase/hydrolase inhibitor
source organism Cryphonectria parasitica
molecule keywords ENDOTHIAPEPSIN
total genus 80
structure length 330
sequence length 330
ec nomenclature ec 3.4.23.22: Endothiapepsin.
pdb deposition date 1994-07-27

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
E PF00026 Asp Eukaryotic aspartyl protease
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.40.70.10 Mainly Beta Beta Barrel Cathepsin D, subunit A; domain 1 Acid Proteases 1eppE02
2.40.70.10 Mainly Beta Beta Barrel Cathepsin D, subunit A; domain 1 Acid Proteases 1eppE01
4N00A 3ST5A 5P5JA 3WZ8A 5P0SA 4KB9A 5P1RA 4DH6A 1TQFA 5P2WA 1HIIA 5P80A 2ZJHA 5OZEA 1EBYA 4Y5NA 5KR1A 4U7QA 5P1AA 1LYWB 5P1CA 2FNTA 5P37A 3TKWA 2AVVA 5P0RA 3ZKXA 3IXKA 4J1CA 1ZBGA 1C6XA 2FDDA 5OZ7A 3Q3TA 5P14A 5BWYA 4Y54A 5P4YA 3FX5A 4BELA 4ZPEA 2O4LA 2G20A 5COKA 3O9LA 1W50A 4YD4A 5OZ4A 1TSQA 3S2OA 2Z4OA 5P5SA 3CKTA 1EPOE 1FFIC 6UPJA 4YA8A 3Q6YA 3R1GB 5OZ5A 1T7IA 1AM5A 1HVRA 5ISKA 1EC2A 5HD0A 3TOHA 3S85A 1D4LA 4HLAA 3L59A 3D1YA 2QD6A 5IVTA 5P6LA 1FMXA 4BFDA 5P5EA 2QU2A 5P6EA 1HPOA 1B5FA 3BUHA 5P6CA 5P19A 5P0EA 3INEA 4H3IA 1APUE 4GJ9A 5P4CA 4DFGA 4RVXA 5OYUA 2AOJA 5P8RA 3O9CA 5OZ8A 3Q4BA 3LZSA 1CPIA 1LV1A 1APTE 5HDZA 2QHCA 1LF2A 2BPVA 3EKTA 4K4RA 5OZ3A 3EL5A 2ZHUA 2NXDA 5P1YA 5P8VA 4FRIA 3K5FA 4CP7A 3UDRA 3T7QA 2FIVA 5P5YA 5P3GA 4Y3YA 2WJOA 4DV9A 2R3TA 5OZVA 2AZCA 5P0IA 5P5TA 2Q55A 1IZIA 1HTEA 2G1YA 3HAUA 1LEEA 4OBHA 3EKVA 5KR0A 3WB4A 1FQ7A 5P6GA 1HHPA 4I0HA 4K9HA 1EAGA 5I3YA 5OYWA 1GVTA 3DM6A 3UDPA 4Y3PA 5P75A 3K4VA 1XE5A 1W51A 4YHQA 2J9JB 5P7TA 2IQGA 2V13A 3BHEA 3VSWA 1RL8A 1PSAA 1MSMA 3N3IA 3EM6A 5P3ZA 3O9AA 1MEUA 4LXAA 4YDGA 4XXSA 3CYWA 2ER6E 3ZPSA 3CIDA 3CYXA 1LZQA 4ER1E 3LHGA 2BPWA 1CMSA 5P2OA 5P5XA 3VLBA 3OADA 4EHCA 5P4ZA 1PSOE 3MWSA 2HS2A 4ZPFA 1HSGA 4ZSQA 5P84A 1FMBA 4UPJA 5E5JA 5P7AA 3QN8A 2OHPA 4YOBA 1A30A 3O9IA 2FLEA 5P3HA 4I8WA 1YX9A 3BXRA 3R2FA 4HZTA 1RNEA 4AZYA 3KFSA 3O9GA 1HWRA 5P58A 5P3JA 1ZLFA 1C6ZA 5P2XA 3DCKA 5P4KA 1GNOA 1SH9A 5P1HA 1HRNA 5P4SA 3VUCA 2ZJJA 1K1UA 5P6DA 4I0EA 2JJJA 5P1SA 1BDQA 3IVIA 5P71A 3OXXA 1EC1A 3S8IA 2BQVA 4Y3TA 4DI2A 3SAAA 4ZE6A 3ZPUA 2AOHA 1XL2A 4HEGA 3CMSA 3DCRA 4CPUA 5P8KA 5P1XA 1T6EX 5JFUA 1EPNE 5P2BA 4PYVA 5P4FA 2WF3A 2HM1A 4DJVA 4YDFA 5HU0A 1YTJA 3UQPA 1HVHA 3SA7A 1DP5A 1QBSA 3ECGA 5COPA 4FS4A 4AA8A 4DJUA 4M8YA 3BVBA 3QS1A 3S7LA 5P1NA 5PEPA 1SDVA 1B6KA 2P3AA 3CIBA 3KDCA 3KT2A 3LIXA 4Y4WA 3R0WA 4LBTA 3EM3A 2AVSA 4J1KA 3VEUA 2AODA 3SA3A 5DQ4A 5P2IA 1NPAA 2P3BB 1MTBA 1TSUA 3D20A 1B6PA 2PWCA 2A4FA 1HIHA 2AZ8A 2R8NA 3T3CA 4Y4EA 3NUJA 4DUSA 5JODA 3D91A 3G6ZA 2MIPA 1HVKA 4JPCA 3SA8A 5P6JA 5P50A 4Y53A 5DR8A 1BILA 3VV6A 3LIZA 1TW7A 2BB9A 2V11C 1K6VA 4Y5KA 3O9FA 4GMIA 3DV5A 5IS4A 3OOZA 1DIFA 4RCFA 5P3FA 4CPTA 4JPEA 4R93A 5P8FA 2ZJIA 5P8JA 4FAFA 5P08A 5P66A 1DMPA 2WECA 4PZWA 3TTPA 4Y48A 3OQFA 4Y3NA 1GVWA 3IAWA 1FQ6A 3KM4A 1HPXA 3DUYA 1BWAA 4Y4AA 4CPSA 1C6YA 3ZKNA 1XN3A 5P0AA 3HZCA 2G21A 3LZYA 4Y37A 4Y3DA 3BXSA 4EP2A 1EPQE 3KDBA 3IGBA 4RYCA 1HVIA 4GIDA 4Y4DA 4Y44A 2WKZA 3EL9A 3HLOA 4HDBA 3AIDA 4EXHA 5P79A 3QVCA 1A9MA 1D4KA 4B78A 4OBZA 3UHLA 3GI4A 5HE7A 4Y3GA 5P7BA 3EM4A 3LPIA 2AOCA 2QI1A 2NNKA 2B60A 2VNMA 3UDMA 1HEGE 5AGZA 1DAZC 2PYNA 3PWMA 1J71A 1QBUA 5OZQA 1BVEA 5P7XA 5P2HA 4RCDA 5AHCA 1EPRE 5I3XA 5P0CA 5P1WA 4CMSA 3NU5A 5P1GA 1ZAPA 3WB5A 1GVXA 2AIDA 1FGCC 2Q54A 4F74A 1VIKA 5OZKA 4B05A 3UDYA 5P0FA 4E43A 5P3BA 1T7JA 1PFZA 4DJYA 1IDBA 5P1FA 3LZUA 3L3AA 3SA4A 3OTYA 4XX4A 2WHHA 5P1LA 5P77A 3CICA 5P8DA 4Y4UA 1EBWA 4LP9A 4I0GA 1ZPAA 5P5ZA 2PYMA 2P83A 5OYQA 2IS0A 4PEPA 1APVE 5P83A 5OZBA 3GI0A 3URIA 2OHKA 4J1HA 4ZSMA 2IKUA 3I2LA 4OBKA 3ZKIA 4CPRA 3OU1A 1LS5A 4WY6A 3K5DA 4Y4GA 2I4VA 5P01A 5JFPA 3GGXA 3GI6A 5OZOA 5P55A 3K4VC 2UXZA 4EJLA 5IVSA 5P4GA 2F8GA 1FIVA 1HPSA 4EWOA 1M4HA 5P5DA 5P2CA 2AQUA 3VSXA 1B6MA 4MC6A 4Y3ZA 1ZPKA 1IZDA 3DJKA 4B72A 4DQFA 5P1KA 2IDWA 1BXOA 2G1OA 1BIMA 8HVPA 4Y4ZA 2CEMA 4HA5A 3PWWA 5P7DA 2AVMA 5P6RA 4KE0A 5HDUA 2XYFA 1HTGA 2Q63A 3BGCA 2QNPA 4OD9A 5P3DA 1ODYA 4QJAA 4FM7A 5P5FA 2AVOA 2P8HA 3SFCA 2PK5A 2VA5A 4Q1XA 2I4QA 3WZ7A 4B1DA 5P7JA 5OZ9A 5P3MA 5OZIA 3S53A 6FIVA 4Y3SA 4RRNA 2BKSA 5P8NA 5UPJA 4X7IA 3S45A 3ZKGA 1HBVA 1RV7A 1KJ7A 5P2VA 4Y3MA 5P4OA 5DGWA 5P6HA 5P6PA 1EC3A 5P0HA 5P87A 3VF5A 1EPME 1NPWA 2VNNA 5OYVA 1AJXA 5OZGA 5P1QA 4Y3EA 5P2ZA 5OZ0A 2OHQA 1NPVA 5P47A 5OYSA 1AAQA 3RTMA 1NSOA 2ZHTA 5EZXA 3RTNA 3QI1A 4FSEA 2Q3KA 3FNTA 3N4LA 5P0WA 3G70A 3DK1A 5P7IA 4TRYA 5P40A 4EPJA 4Q1WA 4RROA 2O40A 4ZPGA 1ER8E 1HXBA 3LINA 1RQ9A 5OZWA 3UQUA 4XX3A 2XFJA 3O9EA 3U6AA 4YCYA 5P0KA 5P36A 3UQWA 5I3VA 3CKRA 3OQKA 3PWRA 5AH7A 5OYXA 1B5FB 4K4QA 5P7LA 5P69A 5P8PA 3VF7A 1HVJA 3KA2A 4Z2ZA 3NU6A 4I11A 5KQYA 5P23A 4Y5MA 2I4WA 3OAGA 4MC9A 3KN0A 3OOTA 2VIEA 2R43A 1SGZA 2QZWA 5P32A 5P60A 1ZSFA 5P3EA 5P11A 4Y58A 4QLHA 3ZKQA 3FV3A 3B80A 1E82E 5P8QA 3SA9A 2AOFA 3INFA 3IVHA 5P6QA 1F7AA 1UH7A 5P2RA 4EXGA 1BDLA 4OBGA 1META 2NMYA 4GJ6A 2G69A 3O99A 3F9QA 3BC4A 2HB2A 1TZSA 1ODWA 2B8LA 1A8GA 3KFNA 4Q1YA 1TCWA 1SIPA 3PMUA 5P57A 4H1EA 3S56A 4DJQA 2APRA 4TVHA 3PCWA 1HIVA 5P4PA 2V0ZC 3UQRA 4K8SA 2VS2A 5P42A 5P4BA 4WTUA 3S43A 5P2YA 4U8WA 5P2UA 2Z54A 2FGVA 5P4XA 2CENA 5P7WA 4D8CA 2PH8A 4EJDA 4ACUA 1K2BA 4RGHA 5P2GA 2OHTA 1HPVA 4L7GA 4Y4JA 4EYRA 1SIVA 5P86A 5OZAA 5P6KA 2QNQA 5SXNA 4GJ7A 1E81E 4Z50A 4ZEAA 2NNPA 1SMEA 3GGAA 3IXOA 1SBGA 3T6IA 1K1TA 1LF3A 3ZKSA 3ZMGA 3OADB 2A1EA 2R5PA 5P4LA 1K6CA 3FKTA 5P5OA 3INDA 4IVTA 4Y5AA 3UFLA 1C70A 5P8UA 4B1EA 2PSUA 1EPLE 3QRSA 1JLDA 3PLLA 2I0DA 3PI5A 5AH6A 2QMGA 2G1RA 5P20A 5P5QA 3EXOA 4YD3A 2FS4A 5DR1A 1MT9A 2G27A 3BUFA 1FG8C 1D4YA 1ZJ7A 1MSNA 4Y5GA 1AVFA 2I4DA 5P27A 3SO9A 3UF3A 5OZZA 5P10A 1MT8A 3FNSA 4J55A 1FEJC 5P03A 5P4EA 3ZKMA 2WF2A 4PPHA 4ER2E 1HVSA 5DR0A 5OZ1A 4JECA 5P2QA 4Y9WA 5P2LA 3NU4A 3OXCA 1Z8CA 4PHVA 3OGQA 5P8LA 1G6LA 1UPJA 5P4AA 3MXDA 1XL5A 5P78A 2VJ7A 5P6WA 3EBZA 2HPEA 5KQXA 4I12A 5P7FA 1BDRA 2ZHVA 2WF1A 4OBFA 5P49A 2CEJA 5APRE 5P64A 4L1AA 5P3IA 5F01A 5ENKA 1BVGA 5P3YA 4YD5A 5P4UA 3EC0A 5P1UA 5P5CA 5ER2E 2OAHA 3NR6A 2QI3A 4B70A 3OU3A 3LZVA 4J0ZA 5CLMA 1K6PA 5P3LA 3JVWA 3UTLA 1UH9A 3OQDA 1MRWA 5JG1A 2QP8A 4ZLSA 1U8GA 1HTFA 3A2OA 5HU1A 4H3JA 5P5KA 1D4SA 5P0YA 1LYAA 3NU3A 4DQCA 3OK9A 5P28A 3LIQA 4PZXA 3M9FA 5P48A 1QS8A 1YT9A 3OQ7A 2J9JA 4Y3RA 2I0AA 5P5HA 5P0BA 3L38A 5P3AA 3OY4A 5IVRA 3MXEA 4I0JA 2AVQA 1IDAA 2F80A 5P0UA 5P5AA 4DQEA 3OHHA 4QJ7A 2BKTA 5OZXA 3IN3A 5P5VA 1YM2A 5OZYA 2HIZA 4HVPA 2QCIA 1GVUA 4FM8A 5AH8A 5P7KA 3TL9A 4YCTA 5P0DA 1EPPE 4NPTA 1AXAA 4J17A 4Y50A 3PCZA 5OZ6A 5P63A 5P0LA 4HE9A 3HDKA 2Q64A 4J1EA 4NPUA 3C9XA 2V00A 1LF4A 1BWBA 4YD6A 2UY0A 5P8GA 5P2NA 5P7VA 5P05A 4DQBA 1OD1A 4Y5CA 3VF3A 4Y4XA 1MT7A 1EC0A 3SABA 4DJOA 1DPJA 3EKYA 3LPJA 5J25A 3K5CA 3NLSA 2G1SA 2ZHRA 4OBZB 9HVPA 2F3EA 3PBDA 1K6TA 3S54A 4OC6A 2Q15A 4J1FA 4Y47A 5P7CA 5ISJA 5DR4A 2XFIA 1XS7D 4ACXA 2VA7A 4Y3JA 2HAHA 1WKRA 3T7XA 3OU4A 5P6TA 5P88A 3NDWA 2B7ZA 5P12A 4FE6A 4OBJA 3URLA 3O9HA 2VJ9A 4QJ9A 5P31A 2WF4A 2G94A 1A94A 1MUIA 4APEA 2QMFA 4I8ZA 4I0DA 2QMPA 5P1EA 1QBRA 5P65A 2IENA 1AJVA 2QZKA 2NPHA 3LIYA 5P67A 3SLZA 2QZXA 4JP9A 1BV7A 2FXEA 3UDQA 5P3SA 4YBFA 3EL1A 4I1CA 5P8MA 3TLHA 5IE1A 5P61A 3KMYA 5AHAA 4L6BA 4GJ5A 1SP5A 5P8TA 3R0YA 5P7UA 3SM2A 4RZ1A 5P6NA 2FXDA 4Y3XA 2NR6A 2XYEA 3BUGA 4A6CA 3OUBA 5DQ2A 2R9BA 4CKUA 2O4NA 4EQ0A 4D83A 3TNEA 5P6OA 2SAMA 3L5EA 5P3KA 1SMRA 4DJRA 1Z1HA 3QIHA 5P0TA 4M8XA 1XDHA 2VIJA 4F75A 3EKWA 3KT5A 1HOSA 5P34A 2QU3A 5P29A 5P76A 5P46A 5P0GA 1PPKE 3HD8A 1IIQA 3OUDA 3O9DA 5P3CA 2JXRA 5P6SA 1E5OE 3HW1A 1T3RA 5OZCA 5P7ZA 3VFAA 2NTRA 4CPXA 4K4PA 3NUOA 4DJPA 5T4SA 5HE5A 5OYRA 5P02A 1FF0C 3Q70A 5P41A 5P06A 1PSNA 5P6UA 5P4DA 3OTSA 1LYBA 4LL3A 5P4JA 3PB5A 1MPPA 3KFPA 4Y3HA 5OZDA 4R95A 4NJTA 4QJ6A 1FFFC 2OHNA 2WF0A 5HCOA 5P54A 3AUPA 3HAWA 4Y43A 3QVIA 3NDUA 3GGUA 3UCBA 5P30A 5SY2A 4Z22A 2G1NA 1APWE 4FCOA 4Y56A 5P0PA 5P4HA 2ZGAA 4LXKA 2Q5KA 4Y3FA 2IGYA 1NH0A 5P4IA 5P3QA 4BEKA 5OZJA 5P0MA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 4N00 A;  3ST5 A;  5P5J A;  3WZ8 A;  5P0S A;  4KB9 A;  5P1R A;  4DH6 A;  1TQF A;  5P2W A;  1HII A;  5P80 A;  2ZJH A;  5OZE A;  1EBY A;  4Y5N A;  5KR1 A;  4U7Q A;  5P1A A;  1LYW B;  5P1C A;  2FNT A;  5P37 A;  3TKW A;  2AVV A;  5P0R A;  3ZKX A;  3IXK A;  4J1C A;  1ZBG A;  1C6X A;  2FDD A;  5OZ7 A;  3Q3T A;  5P14 A;  5BWY A;  4Y54 A;  5P4Y A;  3FX5 A;  4BEL A;  4ZPE A;  2O4L A;  2G20 A;  5COK A;  3O9L A;  1W50 A;  4YD4 A;  5OZ4 A;  1TSQ A;  3S2O A;  2Z4O A;  5P5S A;  3CKT A;  1EPO E;  1FFI C;  6UPJ A;  4YA8 A;  3Q6Y A;  3R1G B;  5OZ5 A;  1T7I A;  1AM5 A;  1HVR A;  5ISK A;  1EC2 A;  5HD0 A;  3TOH A;  3S85 A;  1D4L A;  4HLA A;  3L59 A;  3D1Y A;  2QD6 A;  5IVT A;  5P6L A;  1FMX A;  4BFD A;  5P5E A;  2QU2 A;  5P6E A;  1HPO A;  1B5F A;  3BUH A;  5P6C A;  5P19 A;  5P0E A;  3INE A;  4H3I A;  1APU E;  4GJ9 A;  5P4C A;  4DFG A;  4RVX A;  5OYU A;  2AOJ A;  5P8R A;  3O9C A;  5OZ8 A;  3Q4B A;  3LZS A;  1CPI A;  1LV1 A;  1APT E;  5HDZ A;  2QHC A;  1LF2 A;  2BPV A;  3EKT A;  4K4R A;  5OZ3 A;  3EL5 A;  2ZHU A;  2NXD A;  5P1Y A;  5P8V A;  4FRI A;  3K5F A;  4CP7 A;  3UDR A;  3T7Q A;  2FIV A;  5P5Y A;  5P3G A;  4Y3Y A;  2WJO A;  4DV9 A;  2R3T A;  5OZV A;  2AZC A;  5P0I A;  5P5T A;  2Q55 A;  1IZI A;  1HTE A;  2G1Y A;  3HAU A;  1LEE A;  4OBH A;  3EKV A;  5KR0 A;  3WB4 A;  1FQ7 A;  5P6G A;  1HHP A;  4I0H A;  4K9H A;  1EAG A;  5I3Y A;  5OYW A;  1GVT A;  3DM6 A;  3UDP A;  4Y3P A;  5P75 A;  3K4V A;  1XE5 A;  1W51 A;  4YHQ A;  2J9J B;  5P7T A;  2IQG A;  2V13 A;  3BHE A;  3VSW A;  1RL8 A;  1PSA A;  1MSM A;  3N3I A;  3EM6 A;  5P3Z A;  3O9A A;  1MEU A;  4LXA A;  4YDG A;  4XXS A;  3CYW A;  2ER6 E;  3ZPS A;  3CID A;  3CYX A;  1LZQ A;  4ER1 E;  3LHG A;  2BPW A;  1CMS A;  5P2O A;  5P5X A;  3VLB A;  3OAD A;  4EHC A;  5P4Z A;  1PSO E;  3MWS A;  2HS2 A;  4ZPF A;  1HSG A;  4ZSQ A;  5P84 A;  1FMB A;  4UPJ A;  5E5J A;  5P7A A;  3QN8 A;  2OHP A;  4YOB A;  1A30 A;  3O9I A;  2FLE A;  5P3H A;  4I8W A;  1YX9 A;  3BXR A;  3R2F A;  4HZT A;  1RNE A;  4AZY A;  3KFS A;  3O9G A;  1HWR A;  5P58 A;  5P3J A;  1ZLF A;  1C6Z A;  5P2X A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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