1EPPE

Endothia aspartic proteinase (endothiapepsin) complexed with pd-130,693 (mas phe lys+mtf sta mba)
Total Genus 80
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
80
sequence length
330
structure length
330
Chain Sequence
STGSATTTPIDSLDDAYITPVQIGTPAQTLNLDFDTGSSDLWVFSSETTASEVDGQTIYTPSKSTTAKLLSGATWSISYGDGSSSSGDVYTDTVSVGGLTVTGQAVESAKKVSSSFTEDSTIDGLLGLAFSTLNTVSPTQQKTFFDNAKASLDSPVFTADLGYHAPGTYNFGFIDTTAYTGSITYTAVSTKQGFWEWTSTGYAVGSGTFKSTSIDGIADTGTTLLYLPATVVSAYWAQVSGAKSSSSVGGYVFPCSATLPSFTFGVGSARIVIPGDYIDFGPISTGSSSCFGGIQSSAGIGINIFGDVALKAAFVVFNGATTPTLGFASK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Analyses of ligand binding in five endothiapepsin crystal complexes and their use in the design and evaluation of novel renin inhibitors.
pubmed doi rcsb
molecule keywords ENDOTHIAPEPSIN
molecule tags Hydrolase/hydrolase inhibitor
source organism Cryphonectria parasitica
total genus 80
structure length 330
sequence length 330
ec nomenclature ec 3.4.23.22: Endothiapepsin.
pdb deposition date 1994-07-27

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
E PF00026 Asp Eukaryotic aspartyl protease
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.40.70.10 Mainly Beta Beta Barrel Cathepsin D, subunit A; domain 1 Acid Proteases 1eppE02
2.40.70.10 Mainly Beta Beta Barrel Cathepsin D, subunit A; domain 1 Acid Proteases 1eppE01
3SA6A 3Q4BA 2G1RA 4JP9A 3VV8A 4EXHA 4OBZB 3EBZA 1HOSA 5OZOA 5P77A 2VJ7A 5P4MA 5P8PA 4YCKA 1D4KA 3NWQA 1MT8A 4FSLA 4LHHA 5P6FA 5P4FA 1FQ6A 5P86A 3EM4A 4H3GA 3QRMA 3FIVA 4R8YA 4Y3GA 1FF0C 3T7QA 4F74A 1EBZA 2QNNA 5P88A 5I3VA 3S85A 4JOOA 2PQZA 5P7LA 3EKPA 1NH0A 5P7MA 2ZJKA 1KJHA 2HPFA 3UDHA 1SGZA 2VJ9A 4RYCA 3O9AA 3PLLA 2JJJA 4YD5A 1E80E 4BFBA 5P7YA 3SKFA 1QDMA 3ZLQA 4DPFA 4L1AA 5ENMA 2ZJMA 3LZSA 4XX4A 1APUE 5P4AA 1FEJC 3BVAA 3OXXA 4NJVA 3S7LA 5P42A 5P61A 3OY4A 5KAOA 3TL9A 5P5ZA 5P2JA 5P5EA 3MSLA 5P1VA 1LV1A 1YTIA 1Q9PA 1MPPA 4PZWA 3T11A 5AHCA 3EKYA 5P5VA 5P2ZA 5P72A 4D89A 2I4WA 2OHKA 3BUFA 4Z22A 1HVCA 1UH9A 5OZJA 4DVFA 4GB2A 3O9EA 3OGQA 5OYRA 2IGYA 3KFNA 2VNNA 4YD3A 5C9DA 2NPHA 3JVWA 1A8KA 5P1QA 4I0IA 5C9BA 1HXBA 5P2MA 3D1XA 2FS4A 2G1NA 5P3YA 5HDXA 3ZKGA 1B6KA 2WEZA 4ZSMA 3KT2A 3BVBA 1IDBA 2OHRA 5P0DA 1RL8A 4Y3NA 4I0EA 5OYSA 5P17A 5P8AA 5COKA 5OZPA 1META 5P79A 2R3WA 5OZWA 3UCBA 2IS0A 1PSOE 1ZPKA 5HTZA 3LITA 1MT9A 3QRSA 7UPJA 1ODYA 4Y4DA 5KR2A 5AHBA 5OZAA 2JXRA 3WZ6A 2NMYA 2QU3A 1TSUA 4PHVA 5P6HA 5P11A 4IVTA 1G35A 3OUDB 4I11A 1DPJA 5PEPA 5P40A 2QZXA 2AVMA 5P26A 2XYEA 1C70A 4AZYA 5P4BA 2RENA 2XYFA 3TH9A 5P8MA 1WBKA 1W5YA 5OZBA 4AMTA 1K2BA 3ER3E 2Q15A 2HB3A 3NXEA 1GNNA 3VEUA 4Y9WA 1GNMA 2ER9E 3UDMA 1K6TA 3PJ6A 3GW5A 3ECGA 2R3TA 4GZFA 4Y4GA 3OQKA 5P1PA 1EPRE 4DJVA 2OAHA 3PMUA 1KJ4A 1MIQA 2FGUA 3G70A 5OZZA 3S7MA 4DV9A 5I70A 3CICA 1FQ7A 2P3CA 5P7XA 1DAZC 2NNKA 4B00A 2VA6A 3UFNA 5P3GA 5P4VA 3GI0A 4DH6A 4N00A 4Z50A 2QI0A 4F75A 3NU9A 1SMEA 3NYGA 3NDWA 1LYBB 5P6TA 3OOTA 3UTLA 1HTRB 4LAPA 2BPWA 3LIXA 3OQDA 2WF0A 5P73A 1FIVA 2R9BA 3TNEA 3OK9A 2QMFA 3UDNA 5P4IA 5P7JA 5P6PA 4RRSA 5P6VA 4Y4UA 5P5GA 3QBHA 3DCRA 4K4PA 5P3IA 4J0TA 2BKTA 3DK1A 3UHLA 5DR1A 5P8RA 4FLGA 1BDLA 1PROA 1C6YA 3LIVA 4APEA 2UY0A 2Q64A 2IL2A 5P4NA 5P08A 5P7QA 4E43A 1BV7A 3ZPSA 3INDA 4CPSA 1BXQA 5OYWA 4FS4A 5P3DA 3VYDA 4OBZA 3VF7A 1XDHA 3AIDA 5P6NA 3QRVA 3PWWA 5ISJA 3I2LA 5P41A 5P7FA 3ZKNA 3VUCA 2OF0A 4Y4AA 5HCTA 4QJ6A 1SMRA 5P0AA 4I8ZA 4EQ0A 3EXOA 5P25A 4AA8A 1NPWA 4JPEA 3UF3A 4OBKA 5KR1A 3RTMA 5P0ZA 1EPNE 1LF4A 3K5DA 4BEKA 4B05A 3NU4A 5AH9A 3MSKA 3WB5A 4Q1NA 2V11C 5P4DA 3HZCA 5OZUA 4Y4ZA 3OXWA 4HDBA 3OQFA 5P6UA 3VSWA 2VIJA 5P6KA 5P6XA 4PEPA 5OZLA 4DJPA 4DQHA 3GI6A 5P89A 3EKTA 3O9CA 5P4LA 4DUSA 5OYTA 1HVJA 4A6BA 5KQXA 2QHZA 3PSUA 5P53A 3NDUA 4XKXA 3TKGA 3IVHA 4HDFA 1B6LA 1ZLFA 4J55A 2P4JA 1XE6A 3NDTA 4GJ6A 1DW6C 1AZ5A 5KQFA 5DQ5A 1VIKA 3SKGA 4DJXA 1SIVA 1ZP8A 4HDPA 5P5RA 2I0AA 3WZ7A 4J0PA 5P0HA 5P3HA 1HEFE 5P5WA 5HDVA 5P4SA 4ZPEA 2QK5A 5P38A 2FGVA 5P8UA 6FIVA 3U71A 4CPWA 1K1UA 4Q5MA 4BFDA 3FNUA 5P39A 4DPIA 4CPTA 4YCYA 5P4GA 4Y5BA 5P36A 2OHNA 4FRSA 1GVTA 3PVKA 4GJDA 3BGCA 5P7CA 3VCMA 1SDVA 1EPPE 4ER2E 3UQWA 1HVLA 5P12A 1PSAA 3WB4A 5DR8A 1ZBGA 4RGHA 3SM1A 3JW2A 2A1EA 1EPME 1QBUA 3ST5A 5P5XA 1FQ5A 5P83A 3LHGA 3O9IA 1HPVA 2AVVA 4ZE6A 3LPJA 5P1XA 2G1SA 4WY6A 2AOFA 1XN3A 1Z8CA 1G6LA 3D3TA 4MC2A 5P48A 3UFLA 1HSHA 1NSOA 3NLSA 4ACXA 5P6WA 6UPJA 2QU2A 4RZ1A 3SPKA 5EZZA 2BPYA 5OYXA 2HM1A 5P2TA 5P5YA 2AOJA 5ENKA 1YM4A 4Y3RA 1APWE 3L59A 3OUDA 4Y35A 2BB9A 2QAKA 5P1GA 5P1ZA 2NR6A 4AA9A 2NNPA 3ZKQA 2V13A 3F9QA 2G26A 4EP3A 1HTGA 5P0KA 5P4OA 2R43A 5OZKA 5B18A 3GGVA 5P47A 3FV3A 3OWNA 4L6BA 1FFFC 3PLDA 5KOSA 4EJKA 2V0ZC 4AUCA 1BWBA 4Q1YA 3L38A 5P4YA 5P2SA 4R91A 4Y4TA 5P1AA 2PK5A 5JG1A 4Y5MA 5P5UA 5P10A 3OQ7A 2B8VA 3NU3A 3PB5A 4D8CA 1OD1A 3PI5A 4Y45A 5AGZA 4GJAA 4L7GA 2ZJLA 3LIZA 1NPAA 5P3JA 3QVIA 3UDQA 3S54A 2OHTA 1EEDP 5P4EA 1IZHA 1ME6A 1HVIA 2JE4A 1LYBA 2FLEA 4Y5CA 1AJXA 4Y48A 4WY1A 5P8QA 1BV9A 5P0PA 3OUCA 5DR4A 3KN0A 3H5BA 3QBFA 5P6MA 1GNOA 4JECA 1W5XA 1HPSA 4H3FA 2G24A 4J17A 2Q3KA 1SP5A 1A9MA 4J1KA 1MEUA 3N4LA 1FG8C 5P4QA 1AAQA 1PPME 4HE9A 4GJ9A 5P55A 4RYGA 1CZIE 3NU6A 1U8GA 3O9FA 3OXVA 5IVQA 3BRAA 4DQGA 3OHFA 4Y41A 2G94A 2HS1A 1A94A 5P30A 5P3PA 1J71A 5COOA 5P6IA 4ER4E 3KF0A 3EM6A 3HBOA 5P2BA 4FM6A 1YTHA 5P5HA 4Y3AA 1SH9A 5P75A 4I0DA 4DJRA 3DM6A 1CMSA 2HC0A 3N3IA 1B5FB 2FXDA 1BWAA 4RLDA 1C6ZA 1W50A 3L5CA 3SQFA 2G20A 4L7HA 5P1HA 5HU1A 3ZPTA 5P05A 5P24A 2WF3A 3L3AA 2PSUA 4NJTA 5P62A 1FQXA 2F8GA 5I3YA 2PMAA 1MRXA 2ER0E 4Y3XA 5P4WA 1FGCC 4J0VA 2A4FA 5P7UA 1F7AA 1HRNA 3INEA 3I7EA 3UDPA 2F3KA 3L58A 1DMPA 3GGAA 5COPA 4B77A 3Q5HA 3CKPA 4LBTA 1LYWB 4ZSPA 2CENA 3DOXA 3FKTA 4I10A 4FSEA 2O4SA 5DQ1A 5P16A 4D88A 4RROA 4Y4XA 2FIVA 1KZKA 4YD6A 5P0BA 4Y36A 5P29A 3LPIA 5IVRA 2VIYA 2J9KA 4H1EA 2IKOA 4R92A 3PHVA 5KR8A 4CPXA 5BRYA 4ZLSA 3TOHA 3ZPUA 2VA7A 3D1YA 5P0RA 4I12A 1HIIA 3EKQA 2ZHRA 5P5IA 4DQFA 5P1JA 5P28A 1MVPA 3URJA 4Q1XA 4R5NA 5P03A 4U7VA 2G21A 2OHUA 1EAGA 2QI7A 2QNPA 1FQ4A 1EC2A 5P6EA 3SO9A 3OTSA 1BXOA 5JFUA 5P2CA 1LS5A 1BBSA 3KT5A 3VF5A 4LL3A 5DPZA 5P1RA 3APRE 3I25A 2BJUA 4I0JA 5P52A 3U6AA 2PYMA 2PSVA 2B7ZA 3D1ZA 5P0LA 4A6CA 4LXMA 5HDUA 5AH8A 4EJ8A 2B60A 4RVJA 5P2WA 1QS8A 1IVQA 5P01A 1W51A 4QJ7A 2NTRA 4YE3A 3QS1A 4X7IA 1KJ7A 5P63A 4EJLA 4OBFA 1HSGA 2G1YA 3HVGA 2QMGA 1EC3A 3TPRA 1MTBA 3FX5A 5P69A 2QZLA 3Q6YA 1D4YA 4HZTA 3VLBA 5P2KA 5P1DA 5AH6A 1SIPA 3Q3TA 5OZ4A 1LZQA 3VV6A 2G69A 5P56A 2P8HA 5OZ1A 4DJYA 1IZIA 1A8GA 3VYFA 2WECA 5P00A 5P46A 3OTYA 3LNKA 5P19A 4FAEA 2BBBA 4Y6MA 5P35A 3BHEA 2QNQA 5P1WA 2QMPA 5OZGA 5P0FA 3DV1A 4B70A 3CYWA 4Z4XA 2IRZA 4Y54A 4A4QA 4RCFA 4Y5EA 5P5CA 3NR6A 4YA8A 2QP8A 9HVPA 5P3MA 5P3OA 1UH8A 5P0CA 5P4CA 3TPLA 5HE5A 4Y3PA 2F80A 1GVUA 1MERA 5P5QA 3S43B 3O9GA 5P2YA 3OADB 4J1IA 5P1YA 3VG1A 8HVPA 3O9LB 4RCDA 2VA5A 2ZGAA 5OZ0A 2BPZA 4Y38A 1XS7D 4CKUA 4Y3HA 1AXAA 1XL2A 4B1DA 4ZEAA 2B7FA 4DFGA 3OU1B 4J5JA 4OD9B 4KE1A 4Y39A 3JVYA 5P7RA 4Y3LA 5P0QA 5P8HA 4LXAA 3EC0A 4K9HA 5OZ8A 5P64A 2HS2A 1XE5A 1D4LA 5CONA 5P2LA 4Y3SA 2B8LA 2WF2A 1ZSFA 2PH8A 3T6IA 3B7VA 5HCOA 4EXGA 5OZVA 3PEPA 3HD8A 2WJOA 3DUYA 3EKWA 1AM5A 3NWXA 5P54A 4NPTA 2ZHTA 3SABA 1LEEA 1HPOA 5OZNA 3K5GA 4DQCA 1FKNA 3BUHA 1G2KA 1AVFA 3A2OA 4B1EA 2F81A 4QJAA 5OZEA 4H3JA 4TVHA 5P2DA 3IXKA 5OZ3A 5P14A 3OQAA 5P4UA 3IN3A 5P3CA 3IAWA 2PSGA 2IENA 1GVXA 3DJKA 3BXRA 5P02A 5P7DA 2QI4A 1BVGA 3MSJA 5OZ7A 2AODA 5P5OA 2Z54A 2UXZA 2ZDZA 5HU0A 5P18A 4I0HA 5P8DA 3UDJA 5P6SA 3INHA 1YTGA 3KDDA 1B6MA 3QROA 2V10C 3PBZA 1B5FA 5HDZA 5P8VA 3TOGA 3OOZA 5JFPA 1E81E 1HWRA 3NU5A 3T7PA 3QAAA 3PCWA 1MRWA 5P2QA 1EPOE 3IA9A 1F34A 5P5MA 7HVPA 3K4VC 4ZIPA 5P60A 2OHSA 5EZXA 2XFJA 3R0YA 3O9DA 5E5JA 2QZWA 5P1SA 5P0MA 4QJ9A 3PM4A 2WF4A 2IDWA 5P7ZA 3SA7A 3L5DA 2I4XA 5SXNA 2AQUA 2BKSA 3BGBA 5DQ4A 4DI2A 1LYWA 3R2FA 3ER5E 1MT7A 5P45A 5IS4A 1FLHA 4FCOA 3VFBA 2HIZA 2NMZA 1APTE 5P32A 4Y5AA 5P3EA 1M0BA 1PSNA 1TQFA 4GJ5A 3VSXA 5P1BA 3ZKXA 5P2HA 3PSYA 4YDFA 2AOHA 3RU1A 4B72A 1HBVA 2ZJJA 5P3LA 2AVSA 4COEA 4LXKA 1YTJA 3OAGB 3O9HA 5OZSA 3IVIA 4CPUA 2R38A 5P49A 3SA4A 2QHCA 2OHLA 5P7SA 2SAMA 5HVPA 1EBYA 2ASIA 3KFPA 1VIJA 5P6BA 2RKGA 4Y3MA 5F00A 2HAHA 5P1LA 3I6OA 1HSIA 2AOIA 4Y5GA 5P3XA 4Y58A 5P2OA 4FRKA 2PH6A 1HXWA 2NXDA 3GGXA 3EL5A 3NDXA 4CPQA 4Y5PA 3BXSA 5P1MA 4OBGA 5P04A 5P50A 4GIDA 5P51A 2O40A 5P0XA 5P3FA 4NPUA 5KQZA 5OYZA 3PGIA 5P4JA 5P67A 4U8WA 1G0VA 3PI0A 5P7NA 5P8CA 4OBJA 5OZIA 2WEBA 5HE4A 2IGXA 5OZQA 5HD0A 4Y4WA 4XXSA 3EKVA 2V12C 5P7IA 2QD8A 3KDCA 4J54A 5DGUA 2AZ9A 1Z1HA 4DJQA 5P65A 4ZPGA 1K6PA 2RKFA 3OXCA 1FG6C 5OYVA 3GI5A 4Y53A 5IE1A 4I8WA 5CLMA 5P70A 5P3TA 2VKMA 3IN4A 5P1OA 3LPKA 4GJCA 5T4SA 5P6QA 1B11A 5P6ZA 2ZHVA 2MIPA 1OHRA 3LIQA 5OZ2A 1EBKC 1HVSA 3K5FA 1W5WA 2FDEA 2WEAA 4EP2A 3QI1A 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 3SA6 A;  3Q4B A;  2G1R A;  4JP9 A;  3VV8 A;  4EXH A;  4OBZ B;  3EBZ A;  1HOS A;  5OZO A;  5P77 A;  2VJ7 A;  5P4M A;  5P8P A;  4YCK A;  1D4K A;  3NWQ A;  1MT8 A;  4FSL A;  4LHH A;  5P6F A;  5P4F A;  1FQ6 A;  5P86 A;  3EM4 A;  4H3G A;  3QRM A;  3FIV A;  4R8Y A;  4Y3G A;  1FF0 C;  3T7Q A;  4F74 A;  1EBZ A;  2QNN A;  5P88 A;  5I3V A;  3S85 A;  4JOO A;  2PQZ A;  5P7L A;  3EKP A;  1NH0 A;  5P7M A;  2ZJK A;  1KJH A;  2HPF A;  3UDH A;  1SGZ A;  2VJ9 A;  4RYC A;  3O9A A;  3PLL A;  2JJJ A;  4YD5 A;  1E80 E;  4BFB A;  5P7Y A;  3SKF A;  1QDM A;  3ZLQ A;  4DPF A;  4L1A A;  5ENM A;  2ZJM A;  3LZS A;  4XX4 A;  1APU E;  5P4A A;  1FEJ C;  3BVA A;  3OXX A;  4NJV A;  3S7L A;  5P42 A;  5P61 A;  3OY4 A;  5KAO A;  3TL9 A;  5P5Z A;  5P2J A;  5P5E A;  3MSL A;  5P1V A;  1LV1 A;  1YTI A;  1Q9P A;  1MPP A;  4PZW A;  3T11 A;  5AHC A;  3EKY A;  5P5V A;  5P2Z A;  5P72 A;  4D89 A;  2I4W A;  2OHK A;  3BUF A;  4Z22 A;  1HVC A;  1UH9 A;  5OZJ A;  4DVF A;  4GB2 A;  3O9E A;  3OGQ A;  5OYR A;  2IGY A;  3KFN A;  2VNN A;  4YD3 A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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