1T6EX

Crystal structure of the triticum aestivum xylanase inhibitor i
Total Genus 86
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
86
sequence length
381
structure length
362
Chain Sequence
LPVLAPVTKDPATSLYTIPFHDGASLVLDVAGPLVWSTCDGGQPPAEIPCSSPTCLLANAYPAPGCPAPSCKPCTAYPYNPVSGACAAGSLSHTRFVANTTDGSKPVSKVNVGVLAACAPSKLLASLPRGSTGVAGLANSGLALPAQVASAQKVANRFLLCLPTGGPGVAIFGGGPVPWPQFTQSMPYTPLVTKGGSPAHYISARSIVVGDTRVPVPEGALATGGVMLSTRLPYVLLRPDVYRPLMDAFTKALAAQARAVEAVAPFGVCYDTKTLGNNLGGYAVPNVQLGLDGGSDWTMTGKNSMVDVKQGTACVAFVEMKGVAPAVILGGAQMEDFVLDFDMEKKRLGFSRLPHFTGCGGL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structural basis for inhibition of Aspergillus niger xylanase by triticum aestivum xylanase inhibitor-I
pubmed doi rcsb
molecule tags Hydrolase inhibitor
molecule keywords xylanase inhibitor
total genus 86
structure length 362
sequence length 381
ec nomenclature ec 3.2.1.8: Endo-1,4-beta-xylanase.
pdb deposition date 2004-05-06

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
X PF14541 TAXi_C Xylanase inhibitor C-terminal
X PF14543 TAXi_N Xylanase inhibitor N-terminal
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.40.70.10 Mainly Beta Beta Barrel Cathepsin D, subunit A; domain 1 Acid Proteases 1t6eX01
2.40.70.10 Mainly Beta Beta Barrel Cathepsin D, subunit A; domain 1 Acid Proteases 1t6eX02
3IN4A 2WEDA 4TRZA 1YTGA 2NXDA 5P6FA 3HD8A 5P5NA 2F3EA 1HVRA 3VV7A 2Q5KA 2AOJA 4FRIA 1FIVA 3F9QA 1EPPE 1HXWA 3ZMGA 5P3NA 4GJDA 4OBZB 2NXLA 5FIVA 5P1WA 1PPLE 2AVMA 5P1RA 5OZKA 5P7PA 5OZ4A 3GW5A 4YCKA 3UDHA 5P1VA 3EM3A 5P4XA 1SH9A 5P4LA 2A1EA 5P4TA 5OZ1A 3NU4A 3IGBA 4CMSA 1BVGA 3NDTA 5P4OA 4NJTA 4J55A 5HE4A 4LL3A 3TKGA 1MUIA 1D4KA 2QI0A 3NUJA 3ER5E 3O9DA 5P0KA 1QS8A 2QZWA 5P48A 1LS5A 1TCWA 5OZBA 3K5GA 1E81E 4EJDA 5AH6A 2VA7A 5OYUA 5P80A 4Y3FA 5OZZA 2V16C 2CENA 2PWRA 4FM7A 5KQFA 4DPFA 5P65A 3PB5A 2ER0E 2PYMA 5ER2E 1MT7A 3VLAA 4EP3A 3OUDA 3H5BA 4TRYA 5P0WA 1D4JA 1Z8CA 2QU3A 4JP9A 2B8LA 1CPIA 1TZSA 3QN8A 2FNSA 4HDPA 4DH6A 4J1FA 3QIHA 3FNSA 3UPJA 5P3RA 4D88A 3PRSA 5BWYA 2WF4A 2HC0A 4YD4A 3VF7A 4QJAA 5P2HA 4H3JA 5P7KA 5DR1A 1SP5A 1K1TA 3KDCA 2RMPA 1APTE 3TTPA 1XN3A 5JFUA 5OZJA 3O9FA 5P5RA 5P1IA 1KJHA 4MC2A 3FV3A 4CP7A 4EYRA 2P3BB 4Y4DA 2AVOA 4R91A 3RU1A 5P30A 4F76A 1MPPA 4YDFA 2PYNA 3KDDA 1IBQA 5P8UA 4U8WA 1IZHA 1M0BA 3D1YA 4RRNA 1W6HA 4D83A 1HTEA 1FGCC 5OYRA 2OAHA 1C6YA 3PWMA 2IRZA 5P8JA 5P69A 1HEGE 4RYCA 4PZXA 5P2QA 3ZOVA 3UQXA 4RRSA 1HIIA 4Y4ZA 2QI7A 5OZMA 5P6DA 3DCRA 5OZQA 3O9BA 5P7AA 3KFNA 1LYAB 2CEJA 5DQ5A 4Y3AA 4Z22A 2HB2A 5P3LA 4APEA 2WF2A 4IVSA 5P5AA 5OYSA 5I3VA 1BBSA 5COPA 3DM6A 5P2NA 2ZGAA 5P5SA 3I8WA 5P8LA 4EXHA 2ER9E 3LZVA 4JPCA 2AODA 5AH8A 5P2SA 4ZPGA 4Y56A 5P4VA 3FIVA 4I0HA 1MT8A 4M8YA 4Q1WA 5DQ2A 3L5EA 1K6CA 2XFKA 5P3XA 1HSIA 2WEBA 2WHHA 4I8ZA 3TOHA 2OF0A 3BUFA 5P8IA 4Y51A 2FDDA 5P5QA 5P7OA 4ZSMA 5P5KA 5HDUA 3NU3A 3SO9A 2OHSA 3I7EA 4Q1XA 4K8SA 5P1YA 3UFNA 4B00A 4E43A 1J71A 5DGUA 5OYVA 5P00A 4I10A 3UTLA 3OU3A 5P7BA 3OWNA 5P6TA 4JPEA 5P6IA 4D8CA 5APRE 4FRSA 5P8MA 3OXWA 5DR4A 5P1BA 4ZE6A 1EBWA 4CPXA 3QBFA 1MERA 3ZKXA 5KOQA 5P8PA 2VA5A 3ZL7A 3LZSA 4Y44A 4OBDA 1K6VA 3TL9A 6UPJA 4AA8A 1GNNA 5P22A 4DUSA 1Z1HA 5IVSA 1T7KA 1PSNA 4HE9A 4DJVA 3INEA 1D4IA 1MTBA 1XL2A 5JODA 1NPWA 1PROA 2ASIA 4HDBA 3MXDA 3EKTA 5OYZA 3SLZA 3ZPUA 1SIPA 1LF3A 5HE5A 5P4EA 4L7HA 4X7IA 1QDMA 4Y5KA 1ODWA 5P0UA 5P1JA 1K2CA 4ZSRA 5JG1A 5HVPA 3NYGA 3NXEA 1SGUA 2QK5A 3K5FA 3ZKSA 1FMUA 1ZSFA 3GI0A 4N00A 1ME6A 1AXAA 4ACXA 1F34A 2VIYA 3VSXA 2UPJA 4CPWA 5P2WA 4OBJA 4Y5PA 2NMZA 3RVIA 3IVIA 5COOA 1SDTA 3PCWA 1APUE 3B7VA 5P4ZA 3UDQA 3RSXA 4EHCA 5P53A 5P44A 3NU9A 5P8OA 5OZYA 3I2LA 1A9MA 1EBKC 3UDPA 1A8KA 3OTYA 3CYXA 3KMXA 1HPSA 5P5OA 2Q64A 4A6BA 1BVEA 1FQ4A 1FQXA 5C9FA 4JOOA 5P41A 4XKXA 5T4SA 1AJXA 3BGBA 5P81A 3SFCA 5P6XA 1ZPKA 2FLEA 5P4AA 1NH0A 5P2LA 4RVXA 1HTGA 3UDMA 1G35A 5AH7A 4Y4UA 3VV8A 5P1CA 3O9CA 1HVIA 3KN0A 4OBGA 2BPVA 2PWCA 3MSJA 5P3QA 1QBRA 3CYWA 3UDNA 2I1AA 3BC4A 2PH6A 5P83A 2B60A 4Y3MA 5P0CA 1HVJA 5SY2A 3NDXA 3PMYA 5P10A 3Q5HA 5DR0A 3O9AA 3QRMA 3RTHA 5P8SA 4COEA 1KJ7A 3ST5A 5OZHA 3FX5A 5OZTA 2XFJA 2PK6A 5SY3A 4DJUA 2G22A 3GI6A 3RTNA 2OHKA 1BDLA 3HZCA 3NWXA 5P4PA 5P4UA 5DR3A 4U7VA 4R93A 2R43A 1DAZC 5P5HA 3NDUA 1EEDP 4J0TA 3HVGA 1YT9A 2IKOA 3BUHA 5P4GA 5P89A 2J9JB 2AZCA 1AIDA 5P7TA 5KQZA 1G6LA 3GI4A 5P76A 5DR7A 3A2OA 4ER2E 5OYXA 3S7LA 1B5FA 1EC3A 5P66A 3SA4A 2VS2A 4RLDA 1FMBA 3PHVA 3TLHA 4ER4E 1MSNA 4RGHA 2B7FA 3LIYA 2OHUA 5P3YA 1G2KA 2F80A 1C6ZA 1HOSA 4J54A 4Y4TA 3PGIA 4F73A 2Z4OA 5OZFA 5P5XA 1F7AA 1W50A 1HWRA 5BRYA 5P0IA 5P7GA 4Y4GA 4YD6A 1SMEA 3LPIA 5P4MA 5OZPA 5P56A 1RNEA 5CONA 3TOGA 3EKVA 5P1DA 2R3WA 5P2FA 1B6KA 4FM6A 4X2LA 1LEEA 4FAFA 1TCXA 2FDEA 3Q70A 5P6BA 3OGPA 1YM4A 1IVQA 5HDVA 3LITA 2QZLA 5P3JA 4A4QA 3EKQA 3SABA 5P71A 3QP0A 5P7DA 5P6RA 3OHHA 3O99A 3QVCA 5OZWA 5P7WA 4K9HA 5OZ7A 2G94A 3PBDA 2V11C 4NPTA 5P38A 5P6JA 2PMAA 4QJ8A 4J1HA 3JVWA 1EC0A 4F75A 4RVJA 1B6JA 3VV6A 2XYEA 3NR6A 4GZFA 5KR0A 5OZ0A 3FSMA 3QAAA 5P0DA 5P4NA 4J0ZA 1SMRA 1TQFA 5KR1A 5KQYA 5HCTA 1ZTZA 5P88A 1WKRA 5P12A 3N4LA 5DR8A 4FAEA 2IL2A 5P04A 4FS4A 5P2UA 4CKUA 3ECGA 3UQUA 1MESA 2APRA 4M8XA 1KJGA 4ZEAA 2WF0A 5OYTA 5DQCA 5P0BA 4TVGA 1RV7A 3EL4A 4EQJA 2AOFA 3BRAA 5P8HA 2NMYA 5P2AA 1AJVA 5P2IA 3OY4A 4J1KA 5P2CA 5HCOA 3CMSA 1FQ7A 2G1NA 3SA7A 5P7XA 4ZPEA 5P5TA 1DMPA 3MXEA 5OYYA 5OZ8A 3QS1A 1MTRA 5P5LA 2ZYEA 5P7MA 1RPIA 5P51A 4Y6MA 2ZJKA 3OAGB 4CPRA 2PSUA 3PM4A 3VYEA 5P3GA 2QI4A 2WEZA 5P7JA 3S7MA 5IS4A 1SDVA 4AMTA 3BGCA 4RYGA 3ZLQA 4DFGA 1FG8C 5P7YA 2PSGA 4DVFA 3B80A 3K4VC 5P57A 5P3SA 5P27A 5P2RA 5EZZA 2ZHVA 5E5JA 4Y3PA 4FRJA 1IDAA 1ZJ7A 1YTJA 3IVHA 4CPTA 2V00A 3MSLA 5SZ9A 4L6BA 4NJUA 3PSUA 3INDA 2AOEA 5P60A 3UF3A 3L3AA 2PK5A 4OC6B 2NR6A 4OD9B 5AGZA 3NLSA 6FIVA 1W5XA 5OYQA 5P0YA 4Y3XA 3ZPTA 1LYWA 4OBHA 3TH9A 5P2BA 3PEPA 1YTIA 3WZ6A 2HIZA 4KE0A 5OZXA 1HPXA 3TPLA 3VFBA 3OXXA 1E5OE 2O4PA 5P0SA 4FIVA 3UHLA 2OHQA 4YA8A 2VJ9A 1AVFA 5P67A 1KJFA 3ZKQA 1OEXA 2P3CA 4Y4WA 5P2XA 4CPUA 2O4NA 1MEUA 4D85A 5OZEA 3DK1A 3EC0A 4KB9A 3SAAA 1LYBB 5KR2A 3SM1A 2Q15A 5P1PA 1AM5A 4Y4AA 1QBTA 3OQ7A 3K5CA 2P83A 3OUBA 4H1EA 3CIDA 2HS1A 3OQFA 5P5CA 5P8TA 4Y4JA 5P0HA 4Y3GA 1A8GA 2HB3A 5P1NA 4EJLA 3OOTA 5P47A 2FMBA 4Y48A 1IZDA 5OZLA 3CKPA 4GMIA 5B18A 3UQWA 4EJKA 2NXMA 3UQPA 3O9GA 4PHVA 2F81A 5AHCA 4LXMA 3R0YA 5I70A 5P0XA 5P37A 1YG9A 3OU4A 5P40A 4UPJA 1Z1RA 1FQ6A 4Y41A 3APPA 4PPHA 5P0MA 4TRWA 2QMDA 2OHPA 4Y45A 2QHCA 5P4SA 3HLOA 5KOSA 2HAHA 3LIXA 1BWBA 4XXSA 5HDXA 4J0PA 3L5BA 2ER7E 5P18A 4HZTA 5P0ZA 1YX9A 2RSPA 3S43A 4GJ9A 3OU1B 4WTUA 5P1AA 5JFPA 4ZIPA 5P0EA 2G1OA 4Y37A 2OHMA 8HVPA 7HVPA 4R5NA 2EWYA 1PFZA 4Y5MA 4B0QA 4F74A 5P11A 1UPJA 5P5GA 5P5UA 2BBBA 4Y3YA 3Q6YA 4RZ1A 4DJWA 1BV7A 1IZEA 4L7JA 3KFSA 5P25A 5P7QA 5P78A 3K4VA 4Y4BA 5P43A 5P2OA 4ER1E 4LC7A 3ZKGA 1EPRE 3ZKMA 4Y50A 2VIJA 4XX4A 3SACA 3R1GB 4ZSPA 5P5DA 2H6SA 1ZLFA 3DOXA 5P4JA 4FSLA 1T3RA 4Y5LA 5P1ZA 7UPJA 3D20A 3PWRA 3S8IA 5P15A 4Y47A 2Q3KA 2QAKA 4EXGA 4BELA 3QRSA 4HA5A 3IXKA 3HDKA 5P58A 1HBVA 3KT5A 5P5JA 1EC1A 2QD7A 5C9BA 3QVIA 3BXRA 4J0VA 3SA5A 4K4RA 4Y3WA 1HTRB 1FFIC 2V0ZC 4K4PA 3LIVA 4OBZA 4Y5EA 1HPVA 5P6EA 5P2ZA 1BV9A 5ISJA 2G69A 2V10C 5P7CA 3D1XA 4YD3A 3EMYA 4Y43A 4B1EA 2IEOA 4GJ5A 1PSAA 1DW6C 3OADB 1MRWA 5F00A 4J0YA 3U71A 5P03A 2XYFA 1FF0C 2IGXA 5P3EA 1XL5A 1MSMA 4MC6A 3VG1A 1GKTA 4Y3NA 4Y9WA 5DPZA 3NXNA 5P09A 5P1KA 2I4VA 3EM6A 5P7EA 1KJ4A 1FB7A 4GJ6A 4Y5BA 2F8GA 4DQEA 2H6TA 4I0GA 5P5IA 1IZIA 1GNMA 4DPIA 1KZKA 1ER8E 3PI5A 3R4BA 3TPPA 4ZSQA 4AUCA 2A4FA 4FE6A 4FRKA 2RENA 3GGUA 5PEPA 5P0VA 3IA9A 2RKFA 2I4WA 5P20A 1IVPA 3LPKA 2ZJHA 4A6CA 3SKGA 5P0RA 2HS2A 3UQRA 3WZ8A 2QHYA 5P1UA 1XE5A 5IE1A 1EPLE 5P6KA 1LF4A 4APRE 5P5MA 1HVHA 5P4RA 2BKSA 5P6GA 4YDGA 5HU1A 3ER3E 1BIMA 5P8NA 1VIJA 3NDWA 2I4QA 2QI1A 2VIZA 3GGXA 5P8FA 5P17A 2G1YA 2FXEA 1CZIE 1BILA 1QBUA 2WJOA 5P2VA 2P3BA 5P8CA 4EP2A 4FCOA 5J25A 3GI5A 3SQFA 2O4LA 5F01A 3IAWA 4DJPA 4HVPA 5P7IA 5P3TA 3M9FA 1LF2A 3HW1A 3OUDB 3OXVA 5P16A 5P87A 5P82A 2IKUA 1K6PA 5COKA 3VYFA 1HVKA 1M43A 5P4KA 1YTHA 1D4HA 3ZKIA 1G0VA 5DGWA 3VUCA 1LYAA 5P08A 3HVPA 2OHNA 3OQAA 2V13A 2PH8A 5P5WA 1UH8A 5P7NA 3T7PA 3O9IA 5P5YA 5HE7A 3EL0A 1NPAA 3S45A 2O4SA 5E5KA 4LAPA 4Y38A 4DQGA 2I0AA 1HVLA 5P19A 1C6XA 1ZAPA 5I3YA 4BEKA 2ZJNA 1TSUA 4GJCA 3GGVA 2QMFA 1DP5A 1QBSA 4J17A 9HVPA 5IVRA 4Y58A 1W6IA 3SA6A 3K1WA 3LZYA 4QGIA 1WBKA 2JE4A 3QI1A 4Y3DA 2FXDA 3H0BA 4RCEA 3WSJA 4FM8A 4I1CA 4B77A 5OZNA 1C70A 2XFIA 1META 5P2TA 2ZHTA 5ISKA 1DIFA 1M4HA 2QD6A 4B78A 1BAIA 4NJVA 3S85A 3SA9A 5P31A 1APVE 4J1CA 2ZHRA 1ZP8A 5P8AA 3QBHA 1Q9PA 2JJJA 1AAQA 1XDHA 1HPOA 1D4SA 5P3PA 3AIDA 5P7SA 3DJKA 1TW7A 2WL0A 1A94A 1OD1A 4DQFA 1N49A 4GIDA 1MIQA 1DPJA 3IXOA 3TOFA 1CMSA 4DI2A 4Z50A 4QJ2A 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 3IN4 A;  2WED A;  4TRZ A;  1YTG A;  2NXD A;  5P6F A;  3HD8 A;  5P5N A;  2F3E A;  1HVR A;  3VV7 A;  2Q5K A;  2AOJ A;  4FRI A;  1FIV A;  3F9Q A;  1EPP E;  1HXW A;  3ZMG A;  5P3N A;  4GJD A;  4OBZ B;  2NXL A;  5FIV A;  5P1W A;  1PPL E;  2AVM A;  5P1R A;  5OZK A;  5P7P A;  5OZ4 A;  3GW5 A;  4YCK A;  3UDH A;  5P1V A;  3EM3 A;  5P4X A;  1SH9 A;  5P4L A;  2A1E A;  5P4T A;  5OZ1 A;  3NU4 A;  3IGB A;  4CMS A;  1BVG A;  3NDT A;  5P4O A;  4NJT A;  4J55 A;  5HE4 A;  4LL3 A;  3TKG A;  1MUI A;  1D4K A;  2QI0 A;  3NUJ A;  3ER5 E;  3O9D A;  5P0K A;  1QS8 A;  2QZW A;  5P48 A;  1LS5 A;  1TCW A;  5OZB A;  3K5G A;  1E81 E;  4EJD A;  5AH6 A;  2VA7 A;  5OYU A;  5P80 A;  4Y3F A;  5OZZ A;  2V16 C;  2CEN A;  2PWR A;  4FM7 A;  5KQF A;  4DPF A;  5P65 A;  3PB5 A;  2ER0 E;  2PYM A;  5ER2 E;  1MT7 A;  3VLA A;  4EP3 A;  3OUD A;  3H5B A;  4TRY A;  5P0W A;  1D4J A;  1Z8C A;  2QU3 A;  4JP9 A;  2B8L A;  1CPI A;  1TZS A;  3QN8 A;  2FNS A;  4HDP A;  4DH6 A;  4J1F A;  3QIH A;  3FNS A;  3UPJ A;  5P3R A;  4D88 A;  3PRS A;  5BWY A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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