2ASIA

Aspartic proteinase
Total Genus 82
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
82
sequence length
357
structure length
356
Chain Sequence
GSVDTPGYYDFDLEEYAIPVSIGTPGQDFLLLFDTGSSDTWVPHKGCTKSEGCVGSRFFDPSASSTFKATNYNLNITYGTGANGLYFEDSIAIGDITVTKQILAYVDNVRGPTAEQSPNADIFLDGLFGAAYPDNTAMEAEYGSTYNTVHVNLYKQGLISSPLFSVYMNTNSGTGEVVFGGVNNTLLGGDIAYTDVMSRYGGYYFWDAPVTGITVDGSAAVRFSRPQAFTIDTGTNFFIMPSSAASKIVKAALPDATETQQGWVVPCASYQNSKSTISIVMQKSGSSSDTIEISVPVSKMLLPVDQSNETCMFIILPDGGNQYIVGNLFLRFFVNVYDFGNNRIGFAPLASAYENE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal structure of the aspartic proteinase from Rhizomucor miehei at 2.15 A resolution.
pubmed doi rcsb
molecule keywords ASPARTIC PROTEINASE
molecule tags Aspartyl protease
total genus 82
structure length 356
sequence length 357
ec nomenclature ec 3.4.23.23: Mucorpepsin.
pdb deposition date 1995-12-09

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00026 Asp Eukaryotic aspartyl protease
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.40.70.10 Mainly Beta Beta Barrel Cathepsin D, subunit A; domain 1 Acid Proteases 2asiA02
2.40.70.10 Mainly Beta Beta Barrel Cathepsin D, subunit A; domain 1 Acid Proteases 2asiA01
2P3BB 3PRSA 5P5IA 3BUHA 3INEA 5P27A 5P3CA 4EPJA 3IGBA 3OXXA 4UPJA 2V11C 5OZDA 5P15A 1GNMA 5P4ZA 2G20A 5P83A 3SABA 3KFNA 1B6KA 1NH0A 3D20A 5P1BA 2QI4A 2J9JB 5P7CA 4YDFA 1XL2A 2WEZA 3WB4A 1HTGA 1IZDA 3TH9A 4YA8A 2VS2A 4Y3FA 2I4XA 5P2GA 1W6HA 5P7JA 1K6TA 5P4TA 5P7UA 4F75A 5P1LA 4Y47A 3S85A 4R5NA 1WBMA 4QJ9A 3WSJA 1YG9A 3OU1B 5P20A 1ODWA 2APRA 3ECGA 5HD0A 4YD4A 2F81A 4CPRA 1ZTZA 5P1CA 4YBFA 5AGZA 5P8TA 4WY6A 4HDFA 3APPA 5P1YA 3ZMGA 2O4KA 5OZUA 5P5OA 9HVPA 3VUCA 2AOJA 4NPTA 3CMSA 3I8WA 2FGUA 5P4EA 5P57A 3O99A 5P6SA 2F8GA 3UDYA 5KR8A 5P54A 1DIFA 5P8VA 5KQXA 2O4PA 1FMXA 5P8GA 4I0HA 6UPJA 5DGWA 4HDBA 2ZDZA 3T7XA 2QHYA 4ER1E 5P8RA 3BHEA 3WZ8A 3WZ6A 3QBFA 3EKPA 5DR3A 2WEBA 3VFBA 4H3GA 1XN2A 4K4QA 1MRWA 2AOEA 5P1TA 2WF0A 3S8IA 2WHHA 2PWCA 4Y41A 4GJ6A 4BELA 3Q4BA 3LPIA 2NXLA 4I0EA 1QRPE 1YTGA 1XE5A 3UFNA 5P6OA 5B18A 3I6OA 4FL8A 3RU1A 5P53A 1B11A 1NSOA 1ZP8A 4DQGA 4F74A 3L38A 3D1YA 4GIDA 2QI7A 4GJ7A 1AXAA 1IBQA 1ODXA 5P31A 4NJTA 2IKUA 4XX4A 5OZTA 4B1CA 3OUDB 4YCYA 5P42A 4K9HA 2AZBA 1C70A 4LL3A 3EKQA 1FQXA 3SKFA 1B6PA 5OZIA 5P78A 5P86A 3O9BA 3TKWA 5HE4A 5AH9A 5J25A 5P2IA 5P4SA 2BPVA 3Q3TA 1HVSA 4Y3XA 5P6UA 5P13A 1SBGA 2Q11A 3VV6A 2AVVA 3EL9A 4PHVA 3DCKA 1QS8A 4TRZA 1C6XA 5COOA 2G1RA 1ME6A 1MESA 5P2VA 4EJDA 2XYFA 3T6IA 2R9BA 4Y5KA 4EWOA 2NNPA 1K1TA 1IZEA 5KR1A 5OZ8A 4E43A 5P4KA 4CPSA 5P40A 5P3MA 2IKOA 4RRSA 1AIDA 5P4WA 1FLHA 2WJOA 5P8PA 2I4WA 4Y3LA 4NJUA 1K2BA 4RVJA 2OHPA 3QAAA 1XE6A 2AZ9A 5I3WA 3PCWA 3Q5HA 5P11A 4OBFA 4DJPA 5OYUA 4Y38A 4Y5EA 3L3AA 2AZ8A 4R8YA 5P7WA 1QBUA 5P5UA 1F7AA 3QN8A 5P4FA 4QJ8A 2QHCA 5OZ6A 3UFLA 4S1GA 1VIKA 1G0VA 3UDNA 5P1QA 5P63A 3KDBA 2QU3A 4HA5A 5AHAA 5P55A 5HVPA 3QS1A 1DW6C 2G27A 5P6TA 4LXMA 1MTRA 4RVIA 5APRE 5P3VA 2VA6A 2PK5A 5P3TA 2QP8A 3MWSA 3LNKA 4N00A 4RROA 4A4QA 5OYVA 4JOOA 1MIQA 5P6IA 5P26A 2ZHTA 5OYSA 1T6GA 3NSHA 5KR0A 3VLAA 1D4SA 5OZ9A 5P0CA 5P8DA 5P5ZA 3ZKXA 2PQZA 3UDKA 5P84A 3SKGA 5ENMA 5OYXA 5P2OA 1D4HA 3SA9A 1W5WA 5P3XA 3NU3A 4Y54A 5OZXA 1W51A 5DR4A 4HEGA 3DUYA 4R92A 5P6QA 1BDRA 1B5FA 5FIVA 5P1VA 5SXNA 2VIJA 1HVIA 1TCWA 1ENTE 5IVQA 5AH8A 2CENA 1B6LA 1EPQE 5P72A 1WBKA 2JE4A 4NJVA 1APWE 2HB4A 5P5FA 2IGYA 4OBZA 2CEJA 4I8WA 1HTFA 2FDDA 2IS0A 1MSMA 1A8KA 1TSQA 4I0ZA 3K5FA 5P5WA 3DV1A 5OZZA 2ZHVA 3UDMA 1EBWA 1HPVA 3DK1A 1VIJA 3PSYA 5P58A 3GGXA 5P4QA 5P0DA 2F3FA 5P30A 3OGPA 3G6ZA 1KJHA 4ACUA 5P5PA 2QI0A 1FQ8A 2IDWA 5P0GA 3LIYA 5P4RA 2AOHA 4X2LA 2AODA 3OOTA 3PBZA 3OWNA 4Y3SA 3S53A 1C6YA 3ER3E 4Y53A 5P4CA 2R3WA 1FQ5A 4Y5MA 4GJ8A 1RL8A 4I0GA 4H3FA 4TVHA 5HU1A 5P5YA 4F76A 3IXJA 3U71A 2ANLA 2P3BA 3N4LA 2Z4OA 3EM3A 4GJAA 2QMFA 1N49A 2V12C 2VJ7A 5P3OA 4MC1A 4GJDA 1HIVA 5TOLA 4U8WA 5P7IA 4FRJA 1HVCA 2G1NA 2AOCA 5P8OA 5P3ZA 1LF3A 3BVAA 1PROA 3EKYA 5P3QA 3I2LA 2IENA 4YBIA 4DJUA 5P7OA 5P8LA 2J9KA 3O9DA 5SY2A 1E82E 3CIBA 1HSGA 4QJ6A 4GYEA 4AZYA 1BVGA 1BIMA 4Y5PA 1SGZA 3OU1A 4QJ7A 2Q55A 4Y4XA 1DMPA 1HEGE 1T7KA 5P3YA 4CPQA 2QNPA 4Y51A 5E5KA 4ZSPA 5P0OA 3TPPA 5JODA 4PYVA 3SO9A 5IVTA 3NU5A 3UCBA 5P38A 2F3EA 3AIDA 3KT2A 2WL0A 2ZJKA 5P01A 2BJUA 3CYWA 1W5VA 1GNNA 2BKSA 3PSUA 4Y35A 4K4PA 4ZSQA 4GJ5A 3JVWA 3R1GB 3GW5A 4JP9A 4KUPA 3VCMA 1EC2A 3SA4A 5I70A 3ZPTA 2BKTA 4A6BA 2JYSA 1YTHA 5DQCA 5P22A 5P5MA 1HIHA 5OZFA 5COPA 1G2KA 4DJXA 4OBZB 1MT7A 3T7PA 1T6EX 1MVPA 3NUOA 1C6ZA 7HVPA 5E5JA 5P43A 1LEEA 3MSKA 4WY1A 4NJSA 5P16A 4I0IA 3RSXA 3LIVA 3UDJA 5JFPA 1M4HA 5P0WA 5P6DA 5P4UA 2ZJLA 2AOGA 3LPJA 3OUDA 2RMPA 2XFIA 3BVBA 4Y3AA 3UDHA 4I10A 1PSNA 5P4XA 1APTE 5P7RA 5P7DA 2VJ9A 3CYXA 2BPWA 5P4MA 5P1ZA 3D1ZA 2WKZA 2QNQA 2I4UA 3FKTA 3L5FA 3G70A 4RYGA 1EBZA 1W50A 4BFDA 4Q1WA 4PZWA 3O9FA 3RTMA 3S56A 4ZPGA 5IVRA 5AHCA 2WEAA 4Y4BA 2UY0A 4GB2A 3U7SA 3LPKA 3S7MA 3SA7A 5P0BA 3O9LB 4Y58A 5P8AA 5P4VA 3QPJA 5P67A 1HVKA 3TOGA 5P2KA 1HRNA 3BC4A 3NDTA 1OHRA 4Y57A 4PEPA 5P5CA 4J5JA 3D1XA 1MRXA 1BV9A 4R91A 3D3TA 2ZYEA 1SMRA 3C9XA 4DVFA 5P8CA 4EQJA 3EKTA 1KJFA 1IIQA 4ZE6A 5P6NA 3GI0A 3UQXA 4D89A 3O9GA 4EP2A 5P3WA 3RVIA 8HVPA 3D91A 4Y9WA 3LZYA 3OU4A 4LBTA 3R4BA 5P5DA 3OHHA 5JFUA 2QU2A 2NTRA 4DPFA 5OZ2A 3L5BA 4Y3GA 2BPZA 3T11A 4TRYA 5P7SA 5P37A 3GGUA 1W6IA 5IE1A 5OZBA 3UQUA 5CLMA 1FF0C 2ZHSA 1K2CA 3PGIA 3UQPA 5P3AA 5P0JA 4PZXA 4DUSA 1TCXA 2VKMA 1EPME 5OZ1A 1EPPE 2QNNA 5OYQA 3HAUA 1WKRA 3HD8A 3PM4A 5P7NA 3QVCA 3R0WA 5ER2E 3EKVA 4B70A 1JLDA 2ER0E 4YOAA 2AOIA 2PMAA 3GGVA 1A30A 1XS7D 5JG1A 5P65A 5P60A 1G35A 5P2BA 3FX5A 2QI6A 4DQEA 4Z2ZA 5P2YA 2FXEA 3CIDA 1BVEA 5P6LA 1SIPA 5CONA 1HTEA 4HVPA 4KB9A 2R5PA 5KOQA 5P1XA 5P0ZA 5P6HA 1Z1RA 1FMBA 3PBDA 5P3GA 2RSPA 1HSHA 2P83A 4J0YA 4Q1YA 4RYCA 4Y3ZA 1OEXA 3TPJA 5P5HA 1EPNE 5OYZA 5P3FA 2HS1A 1E5OE 3TNEA 4B1EA 3GI5A 2G21A 3T7QA 2WF2A 4Y3QA 5P0VA 3M9FA 4OBDA 2V00A 1B6JA 3O9CA 3PMUA 5P85A 5HCOA 5P7FA 3OQFA 5P71A 2I4VA 1CMSA 5P6GA 3HZCA 2OF0A 1KJGA 3JW2A 3KF0A 3LZUA 5P0NA 2G1YA 5P77A 2QHZA 4I12A 3U6AA 4LC7A 4Y3DA 3T3CA 5P2TA 4Y3MA 3AUPA 2FGVA 4Y5BA 3VF5A 4EYRA 1PFZA 3L5EA 3HDKA 1BWBA 5P1HA 1UH9A 2WEDA 5PEPA 1SMEA 5P4HA 1EC3A 5P5SA 3O9IA 3IN3A 4CPXA 3ZKMA 4EXGA 3KDCA 2WECA 4Y43A 5P2LA 2UXZA 4Y56A 1QBRA 2V13A 4Y5CA 2I4DA 5P6VA 4OBGA 4D85A 1A94A 4HZTA 4Z4XA 4LXAA 4ZLSA 1LS5A 3I7EA 1K6VA 7UPJA 5P4IA 2B42A 1IDBA 2EWYA 1K6CA 5P49A 4JPEA 3FNUA 4GJ9A 5HE7A 3EM6A 2AVOA 3K5GA 5C9BA 3OU4B 3OUAA 4Y5LA 1YM2A 4HE9A 3NU9A 1OD1A 5P1EA 3SACA 2QZKA 5P1FA 5KR2A 3HW1A 4Q5MA 5P48A 3UDQA 5OZMA 4CP7A 1A8GA 4YD5A 4Y5AA 4ER2E 5P18A 5P88A 2PH8A 1BXOA 2NNKA 4ER4E 5P5JA 3ZKNA 1IDAA 1XL5A 2V0ZC 3L58A 1TSUA 5UPJA 5P05A 2P3DA 2Q64A 4I0DA 5IVSA 1GVUA 3INDA 5P3PA 5OZJA 1BWAA 4B1DA 5AHBA 5P7VA 5P07A 5P6JA 4A6CA 5P3HA 6APRE 3OK9A 4DQCA 5P8BA 2AVMA 4J0PA 5P2WA 5P89A 1BAIA 2QK5A 3JVYA 3QRSA 3NWQA 2P4JA 3PI5A 4H3IA 3OQKA 3OTYA 4K4RA 3DV5A 1EC0A 2PK6A 1NPWA 3BGCA 2IEOA 2OHKA 4FRKA 5P2ZA 4D88A 3L5DA 5P3RA 1HEFE 3VF7A 5C9FA 3SA3A 4MC2A 4Y4ZA 3KMYA 3KN0A 4RCEA 5P1WA 4Y37A 3PVKA 4J0VA 2QZWA 3LIZA 5P0UA 3PWRA 5P1PA 1ZBGA 5P52A 3BUFA 5P32A 4ZSRA 1ZSFA 2O4SA 3EL1A 4OBHA 3NUJA 3HLOA 1HPSA 3OXWA 3OADA 1LV1A 5P6CA 5P5GA 5P0QA 5P4OA 5P5TA 5P14A 5P51A 5I3XA 2MIPA 4Y4DA 4I0JA 3VYEA 3UQWA 1D4KA 5P4GA 2JJJA 2QMPA 2P3CA 3OXVA 3MXEA 5KOSA 1FG8C 4RRNA 3ZKGA 5P0LA 5P46A 4OBKA 5P8FA 2B8VA 5P8MA 5P25A 5P6ZA 1MPPA 5P7XA 3VSWA 3NWXA 4DJYA 3IN4A 2ZHRA 2CEMA 4CPTA 3H0BA 1M43A 5OZ4A 4L6BA 2VIEA 5P47A 2PSGA 1SH9A 3EL4A 3ER5E 5P3NA 3S7LA 1RQ9A 2VJ6A 5P29A 3O9LA 1AJXA 1HPXA 2VIYA 1LYBA 4DH6A 1IVQA 3PLDA 3ST5A 2G1OA 3OGQA 4DV9A 4J0TA 3OTSA 1ZLFA 3NDUA 1SDUA 5P1GA 1PSOE 5ENKA 5P7PA 3EMYA 2QI1A 5HDVA 5P0IA 5P5KA 3S54A 5P8NA 1EEDP 5P1RA 4Y4UA 1IZIA 3N3IA 3OQ7A 1DP5A 3NU6A 3VG1A 5DQ5A 5P0EA 4FM8A 4L1AB 1BDLA 3BRAA 1LYAB 5P44A 3PCZA 5OZ5A 2HB3A 3IVHA 4Y3JA 2NXDA 5DGUA 5BS4A 2OHTA 3OY4A 4IVTA 1SGUA 4JECA 5OZHA 2G22A 4ZSMA 3INFA 2ZJJA 3OAGA 3EL0A 1FQ6A 5BRYA 3EL5A 2Q15A 4WTUA 2QZLA 5IS4A 3KYRA 1CPIA 3PEPA 3UQRA 3BXSA 5OZPA 2FIVA 2QI3A 5AH7A 1KJ7A 4TVGA 1HVRA 5P24A 4Y4GA 5P8IA 3G72A 5HE5A 4OD9A 4CKUA 5P7LA 2PYNA 3OQAA 4ZPEA 2P3AA 4Y3NA 5OYRA 4DJQA 4J1KA 4RCDA 4XXSA 4DQHA 2OAHA 1KZKA 4RLDA 1BILA 5P8UA 1YTIA 2AZCA 1E81E 2V16C 3PB5A 3QROA 1W5YA 3O9EA 3SAAA 2BPXA 2AVQA 4CMSA 5P4LA 4I0FA 3KT5A 4Y6MA 3QRVA 5P4BA 5P56A 4FGXA 3LIXA 4FLGA 3VEUA 2QZXA 2Q63A 5P7GA 1QBSA 4Y36A 1AAQA 2FDPA 1HWRA 3L5CA 3OADB 5P4JA 4IVSA 3B80A 4FM6A 3ZKSA 3TPRA 1HVJA 5KQZA 1YTJA 5P08A 4AMTA 5HDXA 5P7EA 3HVGA 5OZSA 5P1MA 4Y3WA 2Z54A 4ZIPA 4OC6A 5OZ3A 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chains in the Genus database with same CATH topology
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 2P3B B;  3PRS A;  5P5I A;  3BUH A;  3INE A;  5P27 A;  5P3C A;  4EPJ A;  3IGB A;  3OXX A;  4UPJ A;  2V11 C;  5OZD A;  5P15 A;  1GNM A;  5P4Z A;  2G20 A;  5P83 A;  3SAB A;  3KFN A;  1B6K A;  1NH0 A;  3D20 A;  5P1B A;  2QI4 A;  2J9J B;  5P7C A;  4YDF A;  1XL2 A;  2WEZ A;  3WB4 A;  1HTG A;  1IZD A;  3TH9 A;  4YA8 A;  2VS2 A;  4Y3F A;  2I4X A;  5P2G A;  1W6H A;  5P7J A;  1K6T A;  5P4T A;  5P7U A;  4F75 A;  5P1L A;  4Y47 A;  3S85 A;  4R5N A;  1WBM A;  4QJ9 A;  3WSJ A;  1YG9 A;  3OU1 B;  5P20 A;  1ODW A;  2APR A;  3ECG A;  5HD0 A;  4YD4 A;  2F81 A;  4CPR A;  1ZTZ A;  5P1C A;  4YBF A;  5AGZ A;  5P8T A;  4WY6 A;  4HDF A;  3APP A;  5P1Y A;  3ZMG A;  2O4K A;  5OZU A;  5P5O A;  9HVP A;  3VUC A;  2AOJ A;  4NPT A;  3CMS A;  3I8W A;  2FGU A;  5P4E A;  5P57 A;  3O99 A;  5P6S A;  2F8G A;  3UDY A;  5KR8 A;  5P54 A;  1DIF A;  5P8V A;  5KQX A;  2O4P A;  1FMX A;  5P8G A;  4I0H A;  6UPJ A;  5DGW A;  4HDB A;  2ZDZ A;  3T7X A;  2QHY A;  4ER1 E;  5P8R A;  3BHE A;  3WZ8 A;  3WZ6 A;  3QBF A;  3EKP A;  5DR3 A;  2WEB A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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