2ASIA

Aspartic proteinase
Total Genus 82
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
82
sequence length
357
structure length
356
Chain Sequence
GSVDTPGYYDFDLEEYAIPVSIGTPGQDFLLLFDTGSSDTWVPHKGCTKSEGCVGSRFFDPSASSTFKATNYNLNITYGTGANGLYFEDSIAIGDITVTKQILAYVDNVRGPTAEQSPNADIFLDGLFGAAYPDNTAMEAEYGSTYNTVHVNLYKQGLISSPLFSVYMNTNSGTGEVVFGGVNNTLLGGDIAYTDVMSRYGGYYFWDAPVTGITVDGSAAVRFSRPQAFTIDTGTNFFIMPSSAASKIVKAALPDATETQQGWVVPCASYQNSKSTISIVMQKSGSSSDTIEISVPVSKMLLPVDQSNETCMFIILPDGGNQYIVGNLFLRFFVNVYDFGNNRIGFAPLASAYENE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal structure of the aspartic proteinase from Rhizomucor miehei at 2.15 A resolution.
pubmed doi rcsb
molecule keywords ASPARTIC PROTEINASE
molecule tags Aspartyl protease
total genus 82
structure length 356
sequence length 357
ec nomenclature ec 3.4.23.23: Mucorpepsin.
pdb deposition date 1995-12-09

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00026 Asp Eukaryotic aspartyl protease
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.40.70.10 Mainly Beta Beta Barrel Cathepsin D, subunit A; domain 1 Acid Proteases 2asiA02
2.40.70.10 Mainly Beta Beta Barrel Cathepsin D, subunit A; domain 1 Acid Proteases 2asiA01
2F3EA 3NDTA 4GJ8A 1BDRA 3EKPA 1NH0A 3LPKA 2ZJLA 1FF0C 4QJ9A 4Y56A 1NPVA 3SLZA 2I1AA 2IGYA 5P3PA 3D1ZA 4DJOA 5P3EA 3BVAA 5I3WA 3GI5A 4LBTA 1ODYA 3PLLA 1XE6A 2F8GA 3JVWA 5OZGA 1FIVA 5P6YA 4Y5NA 1LYBB 4QJ8A 2PYMA 1EPOE 4Y4XA 4A6BA 4M8YA 4AUCA 1FQ5A 4RGHA 1HIIA 4J1HA 3ER5E 5P12A 4D88A 3GI4A 5P4IA 4L1AA 5P3SA 4CPSA 4F75A 1MTBA 3PGIA 5P5KA 3C9XA 3TKWA 4LAPA 2JJIA 1EBYA 5P4UA 5P5HA 5KAOA 4Q1YA 2G94A 3H0BA 5P2CA 3ZPSA 3NU3A 5P63A 5P5MA 1CPIA 4EJ8A 3ZMGA 3D1XA 5OZWA 5EZXA 2P4JA 1K6TA 4YOBA 3IVHA 2ZHVA 2OHPA 4I0DA 4OBZB 4BFDA 1A8GA 5P7KA 4UPJA 5P8KA 1CMSA 5P5FA 4DQCA 4FM7A 4Y58A 4CPUA 4FS4A 5P70A 5P7MA 1A30A 2R38A 2G27A 3HLOA 4FGXA 4D83A 5P8HA 3NWXA 2IKOA 4BELA 1AVFA 2VKMA 3R4BA 2B7FA 5SY3A 3GGVA 2FDPA 2WJOA 3BC4A 2JYSA 2G20A 4Y3XA 2CEJA 4Y3LA 2NNKA 2AZ9A 3L5EA 4RCEA 2Q55A 1MSNA 4TVHA 5P7CA 5P33A 3U71A 1YM4A 2R3WA 1IZHA 4LHHA 5P0HA 4GJ9A 3SA3A 2WEAA 1KJGA 2WEDA 1W5YA 4GYEA 3L59A 4Y4AA 1G35A 5P80A 5P8MA 3QBHA 2I4QA 5P72A 4GJBA 5P68A 5UPJA 3INHA 5AHCA 5FIVA 5HU0A 2J9JA 1E82E 5OYUA 2FXDA 2QMPA 3L5DA 3B80A 3Q70A 3EXOA 4PEPA 5JG1A 4FCOA 1EBKC 5P20A 5OZFA 5P3IA 5EZZA 5P51A 5P1DA 5P30A 5P8FA 5OZ1A 3OOTA 3ZKMA 2FNTA 4Y3FA 2V13A 3UDKA 5P0DA 3LIVA 4N00A 3PJ6A 4Y3DA 5P03A 4J0VA 3Q6YA 5P2RA 1BWAA 1DW6C 5P6XA 3PMUA 2BPZA 2FGVA 3QPJA 5P6GA 4K4QA 5P50A 4D89A 1Z1HA 5P89A 2QI0A 1FKNA 5P6WA 1BXQA 2HB2A 2IL2A 3SAAA 5P1WA 4EJLA 2P3CA 3CKPA 3K5CA 5OZZA 4DQFA 3O99A 5P2EA 3MSLA 1XS7D 4X2LA 5I3YA 5SXNA 3QBFA 4IVSA 2AOHA 3SA7A 3HD8A 5P5RA 2R5PA 1QBRA 2B8LA 4J0ZA 4Y5GA 3S8IA 5P2FA 4ZLSA 4ZSMA 5P6QA 3OTYA 5P34A 5P7SA 3PSGA 4DQHA 2HAHA 1VIKA 5P4VA 1GNOA 2QHZA 4JECA 3ZOVA 3MSKA 4J1IA 5HCTA 4Y3JA 3ZLQA 2G1OA 4Y9WA 4KUPA 3KMXA 5OZ9A 3FSMA 1IVPA 3T7PA 3EL4A 3CICA 3EKTA 5IS4A 5P52A 5P09A 2WECA 4DQEA 3EMYA 1GVXA 5P7VA 1ER8E 1TSQA 1G2KA 4I0JA 5P2QA 5P11A 2G21A 3OU1B 2QI1A 5HE4A 5P6VA 3LITA 5P7JA 5DQ2A 4OBKA 4OBJA 3UDYA 3O9LA 5JFPA 5P0YA 4CPXA 1K6CA 4FRJA 4HVPA 2BPXA 2R5QA 5OYZA 1SDVA 3LPJA 4ZPFA 5HDZA 1HEFE 5PEPA 2V11C 5T4SA 4Y4EA 1HIHA 4Y5EA 1MVPA 5I3XA 3KMYA 4ZSQA 4NJVA 3DK1A 5P53A 4FIVA 2IS0A 2G1RA 3KDDA 2IGXA 5AH6A 1QRPE 5P0GA 5OZJA 3VYDA 1MT7A 8HVPA 3MWSA 3UTLA 5P2LA 1SBGA 2I4UA 2OHMA 1GVWA 3PB5A 1SGZA 3VFAA 1T7IA 3D20A 1LYAB 5P8DA 2WEZA 4Y3EA 5P5NA 5KQYA 2PSUA 5P32A 5P28A 3FNUA 4RYGA 4B05A 1HWRA 3QRSA 5P3JA 2G1NA 3GI6A 5P7GA 4MC6A 4A4QA 3I25A 3LZSA 3OAGA 4LXKA 5P47A 3AUPA 3BGBA 3OHFA 4GJ5A 5OZ8A 4FLGA 3ZKSA 1EC3A 3O9CA 4Q1XA 5OZRA 2AOIA 5OZHA 1TW7A 5P48A 4EJDA 5P65A 3LINA 2Q64A 1APVE 4I0FA 3PI0A 1C70A 2AVMA 1BVEA 1U8GA 1DAZC 2BB9A 3RTMA 4WTUA 3HAUA 3T7QA 4F74A 5P7AA 5P49A 1SDUA 1ZLFA 4Y44A 1HOSA 2NTRA 3NXEA 3SM1A 1SIPA 5P8VA 3UDNA 4OBDA 2ZJKA 4YHQA 3GW5A 4GJ6A 1BVGA 1SMEA 5P4ZA 3OU4A 3FIVA 1EPPE 1B6KA 3BRAA 3Q5HA 3NDUA 4OC6B 5ENMA 1XL5A 1TCWA 2ZHSA 1ZTZA 2QNPA 5P1ZA 2OHRA 2PYNA 5P5TA 4J5JA 3L58A 4Y41A 1BILA 5HCOA 2WHHA 5P7HA 3APRE 3EKXA 5P6DA 1GVUA 2ANLA 2IDWA 5P8AA 2RKGA 2FDDA 5P0QA 3S2OA 2AVOA 3PEPA 5C9FA 3OUDA 4CPTA 5IVQA 4RVJA 2NR6A 3EKWA 4JP9A 5P00A 5E5JA 4HZTA 3FNTA 1YM2A 4FM6A 4GJAA 5P3OA 1QBUA 3SQFA 3NUOA 3OGQA 5P6RA 2FLEA 5C9BA 3VV7A 5P1PA 3OQKA 5P1JA 4Y53A 1APTE 1LYWB 6APRE 5P22A 2FMBA 5AGZA 3ZKGA 3VLBA 5P3FA 2P3AA 5KR1A 5P05A 1G6LA 2QHYA 5P1LA 2A4FA 5OYWA 5P8GA 2VIEA 4H1EA 2AZCA 1HRNA 3DV1A 5P0MA 3OXCA 5P60A 1LEEA 2IKUA 1ZBGA 5P3QA 2R8NA 1HIVA 4LL3A 5P3UA 2R3TA 5P0NA 3T6IA 1FGCC 5OZKA 3NWQA 4YBIA 4EWOA 3KT5A 3UFNA 5P7UA 1B6MA 3VYFA 5P1IA 5P7RA 1UH9A 2ZDZA 4J0PA 5OZUA 5P7EA 4YE3A 4Y5PA 1YTIA 2AZBA 3KT2A 5P54A 3MSJA 3S43A 2P3BA 5OZ3A 1PPME 5P88A 4Y4GA 1MUIA 5OZ0A 1PROA 2IENA 3APPA 3OXXA 3R0WA 4EJKA 3LIXA 4AMTA 4D85A 4B0QA 3UFLA 4J1EA 1TZSA 3VUCA 2NXLA 4ZE6A 3UHLA 3S53A 5BWYA 5P4TA 1FFIC 4CMSA 5P3MA 3EL9A 4Y3RA 1IZEA 5HE5A 1EBZA 3WB5A 2F3KA 4EXGA 3SACA 3INDA 4K4PA 3WB4A 4A6CA 5DQ4A 3TPPA 4DJVA 2Q5KA 3F9QA 3ZKQA 1WKRA 3NSHA 5OZ6A 5P3TA 3UPJA 2O4LA 3O9IA 5P4DA 3O9DA 5OZMA 3WSJA 5P4CA 1FQXA 4YBFA 4J55A 3VV8A 5DGWA 3EL0A 2QMDA 5DR8A 2QD7A 2PH6A 5P74A 4Y4DA 3KFRA 5P6LA 5P1OA 5P24A 3LZVA 1NSOA 2RKFA 3OQAA 4ZPGA 1EEDP 3SA6A 4MC9A 5P0KA 4EQ0A 1DMPA 5P0ZA 4EP2A 5P07A 1T7KA 2VJ7A 4DUSA 3L5FA 3NU6A 2Q54A 1A9MA 4I0ZA 5P2OA 5P5EA 1B5FB 5P86A 2UXZA 3T7XA 3HZCA 3VG1A 2B7ZA 4RVXA 5P71A 1BAIA 5P2DA 2PSGA 4HDFA 5P59A 3TLHA 1OD1A 5P1EA 5P2ZA 1SGUA 2G24A 4Y6MA 5P5SA 5DGUA 3OK9A 3VYEA 4GJDA 2PK6A 3K4VC 2QD6A 3EBZA 1AZ5A 4I0HA 4OBGA 5P5AA 5P5JA 1HTEA 3KM4A 5P4YA 4J54A 4YOAA 4RVIA 1GVTA 3UDHA 5KOQA 4Y3GA 4WY6A 4ZPEA 4MC1A 2XFIA 4COEA 1QS8A 1D4SA 2IQGA 3OADB 5P4HA 3H5BA 1HEGE 4AA8A 4DQBA 4PPHA 2JXRA 3KFSA 2G1YA 2QI3A 5P2BA 1W5WA 3PSYA 4Y3TA 5OZ7A 4RCDA 3S85A 4Y4ZA 5AHAA 1T3RA 5P38A 5P6SA 1FB7A 5P1VA 2UPJA 5P35A 5P4EA 2FIVA 5P75A 5AH9A 5P3AA 4WY1A 2VA6A 3UCBA 3SA8A 1Z8CA 5P0LA 4Y37A 4NPTA 5HDVA 5OYSA 3OHHA 1APUE 5P81A 1CZIE 3DUYA 3I2LA 5I3VA 4JOOA 5P3LA 2HM1A 3K4VA 5ENKA 5OZQA 4I10A 2AOGA 2BPYA 5P8PA 5P02A 3R1GB 5P0RA 4YD5A 2V0ZC 2WF2A 5IVRA 5P8IA 5P76A 4Y5KA 1OEXA 2PMAA 1YT9A 3GGUA 5I70A 5P5YA 1PSAA 1KZKA 4OD9B 3QN8A 1ZJ7A 2UY0A 4Y4JA 3DCRA 4CPQA 1Q9PA 2QNNA 5P41A 1HVIA 5P5XA 5P3RA 4I8WA 2BKSA 1MTRA 2VA7A 5P6NA 4ACUA 5P5WA 3FV3A 3WZ7A 1AJVA 5P4RA 2BPWA 5P4OA 2P8HA 4DPFA 5P56A 1APWE 3VF3A 2I0AA 2ER9E 3L5CA 3IGBA 4H3FA 5DR3A 1B6JA 2AOJA 2V12C 2QU2A 5P2UA 4R91A 3VLAA 5P7DA 3KN0A 5P3VA 5P0PA 5P1TA 3NDWA 2QMFA 3HBOA 4DJRA 5P6UA 2I4VA 5P6TA 5P7ZA 1HSIA 2OHTA 5P2HA 4HLAA 2PWCA 5P31A 1LV1A 1G0VA 1AXAA 3SABA 4PZWA 3TTPA 5OZNA 5P66A 5P1FA 3O9HA 3B7VA 5DQ1A 5P0WA 4B1DA 1JLDA 5P14A 4DV9A 4NJSA 4I1CA 1E81E 5F00A 2WF0A 2HC0A 3BXSA 5P61A 1META 2HPEA 1D4JA 1GKTA 5P18A 3FKTA 5P0TA 5P69A 1LYBA 3DM6A 4GJ7A 1RNEA 3IN3A 3KDBA 4RRNA 6UPJA 5OZVA 4F76A 4B72A 5P62A 1T6EX 5P2MA 4ZEAA 3URLA 5P40A 5P3XA 3LHGA 3ZKXA 5P5QA 1EPME 1BDQA 3DJKA 4XX3A 5KQXA 1TQFA 5OZLA 4XX4A 3OXVA 4Y5MA 1XDHA 4U7QA 4J0TA 4RROA 5OZEA 5P4WA 1PPKE 3SO9A 2ZHRA 3OWNA 4FRSA 2WF4A 2P3DA 2XFJA 2ZE1A 4Y45A 3K5FA 2HB3A 5OYTA 2O40A 3CMSA 5C9DA 5P3YA 4FSEA 1K1UA 5OZ2A 5P2NA 4OBZA 2G26A 4QJ2A 2BPVA 4DJXA 1BBSA 1T7JA 2QZKA 1XL2A 2ZGAA 3R0YA 4Y39A 5P4PA 5P39A 4EXHA 5P4NA 4TRWA 5P2XA 5P2KA 4Y5AA 5OZCA 3GI0A 5P8OA 4DFGA 2I4WA 4R95A 5P6BA 4H3GA 4K9HA 2OAHA 2HS2A 2OHNA 5P1HA 2FNSA 1MRWA 5P0XA 5P36A 3VF7A 1QBTA 3SKFA 3OU3A 5P6FA 3VFBA 5OYVA 5P2JA 3L5BA 3VSWA 2PH8A 2NMYA 5P5ZA 2AVQA 4R5NA 4M8XA 5DR7A 5P85A 1W51A 4B1CA 2AVSA 1AM5A 5P3BA 4H3JA 4B1EA 2OF0A 5P3GA 2QHCA 5KR2A 1ZPAA 1EBWA 1IVQA 1LF2A 4HDBA 1EC0A 4DJUA 5CLMA 5OZBA 3CIBA 3LNKA 1DPJA 1HVSA 4TVGA 3UDQA 5P7PA 4TRZA 5P23A 1HTGA 5P6MA 5P0OA 2V00A 5P5CA 5ISJA 5P08A 4D8CA 1B11A 1A94A 4I11A 2Z4OA 2QI5A 3TH9A 1HPVA 2NXMA 3G72A 5DPZA 4FRIA 1ZSFA 3INEA 5P55A 5P8LA 3RU1A 3QIHA 5OZIA 1HPSA 5J25A 1VIJA 4I8ZA 3BGCA 3PSUA 5P0BA 3S54A 2V16C 4QGIA 4DPIA 2QMGA 5OZSA 1MESA 3JVYA 4U7VA 4NJUA 3TPLA 3TPRA 3HVGA 5P5GA 4EP3A 3PBZA 5E5KA 5P7IA 4EQJA 3U6AA 3KYRA 5P1KA 4Q1NA 1NPAA 1K2CA 2RENA 3PRSA 2VJ6A 2JE4A 4YDFA 5P16A 3HW1A 2WKZA 3QAAA 2APRA 5P2YA 3BXRA 5JODA 4KB9A 5P1CA 1HVLA 1MRXA 4GIDA 5OYXA 2I4DA 3N3IA 3BUFA 2MIPA 3UQPA 3DV5A 3SA9A 4L1AB 5P7QA 4L7HA 3INFA 2H6TA 5ISKA 3GGAA 4FM8A 5COOA 5P3DA 3OY4A 1HSHA 3EM3A 1BDLA 3BUGA 3G6ZA 3L38A 4I0GA 3UDJA 4DVFA 3PHVA 2VA5A 3RSXA 1F7AA 2B8VA 5P44A 5P8QA 1UH7A 2O4NA 4AA9A 1PSOE 3D91A 4XKXA 1MPPA 4H3IA 5P6KA 3NU9A 3OU1A 4B77A 1FEJC 1F34A 1EPRE 1LS5A 5OZOA 1HVHA 4YD6A 5P7BA 1ODWA 3R2FA 5P7WA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 2F3E A;  3NDT A;  4GJ8 A;  1BDR A;  3EKP A;  1NH0 A;  3LPK A;  2ZJL A;  1FF0 C;  4QJ9 A;  4Y56 A;  1NPV A;  3SLZ A;  2I1A A;  2IGY A;  5P3P A;  3D1Z A;  4DJO A;  5P3E A;  3BVA A;  5I3W A;  3GI5 A;  4LBT A;  1ODY A;  3PLL A;  1XE6 A;  2F8G A;  3JVW A;  5OZG A;  1FIV A;  5P6Y A;  4Y5N A;  1LYB B;  4QJ8 A;  2PYM A;  1EPO E;  4Y4X A;  4A6B A;  4M8Y A;  4AUC A;  1FQ5 A;  4RGH A;  1HII A;  4J1H A;  3ER5 E;  5P12 A;  4D88 A;  3GI4 A;  5P4I A;  4L1A A;  5P3S A;  4CPS A;  4F75 A;  1MTB A;  3PGI A;  5P5K A;  3C9X A;  3TKW A;  4LAP A;  2JJI A;  1EBY A;  5P4U A;  5P5H A;  5KAO A;  4Q1Y A;  2G94 A;  3H0B A;  5P2C A;  3ZPS A;  3NU3 A;  5P63 A;  5P5M A;  1CPI A;  4EJ8 A;  3ZMG A;  3D1X A;  5OZW A;  5EZX A;  2P4J A;  1K6T A;  4YOB A;  3IVH A;  2ZHV A;  2OHP A;  4I0D A;  4OBZ B;  4BFD A;  1A8G A;  5P7K A;  4UPJ A;  5P8K A;  1CMS A;  5P5F A;  4DQC A;  4FM7 A;  4Y58 A;  4CPU A;  4FS4 A;  5P70 A;  5P7M A;  1A30 A;  2R38 A;  2G27 A;  3HLO A;  4FGX A;  4D83 A;  5P8H A;  3NWX A;  2IKO A;  4BEL A;  1AVF A;  2VKM A;  3R4B A;  2B7F A;  5SY3 A;  3GGV A;  2FDP A;  2WJO A;  3BC4 A;  2JYS A;  2G20 A;  4Y3X A;  2CEJ A;  4Y3L A;  2NNK A;  2AZ9 A;  3L5E A;  4RCE A;  2Q55 A;  1MSN A;  4TVH A;  5P7C A;  5P33 A;  3U71 A;  1YM4 A;  2R3W A;  1IZH A;  4LHH A;  5P0H A;  4GJ9 A;  3SA3 A;  2WEA A;  1KJG A;  2WED A;  1W5Y A;  4GYE A;  3L59 A;  4Y4A A;  1G35 A;  5P80 A;  5P8M A;  3QBH A;  2I4Q A;  5P72 A;  4GJB A;  5P68 A;  5UPJ A;  3INH A;  5AHC A;  5FIV A;  5HU0 A;  2J9J A;  1E82 E;  5OYU A;  2FXD A;  2QMP A;  3L5D A;  3B80 A;  3Q70 A;  3EXO A;  4PEP A;  5JG1 A;  4FCO A;  1EBK C;  5P20 A;  5OZF A;  5P3I A;  5EZZ A;  5P51 A;  5P1D A;  5P30 A;  5P8F A;  5OZ1 A;  3OOT A;  3ZKM A;  2FNT A;  4Y3F A;  2V13 A;  3UDK A;  5P0D A;  3LIV A;  4N00 A;  3PJ6 A;  4Y3D A;  5P03 A;  4J0V A;  3Q6Y A;  5P2R A;  1BWA A;  1DW6 C;  5P6X A;  3PMU A;  2BPZ A;  2FGV A;  3QPJ A;  5P6G A;  4K4Q A;  5P50 A;  4D89 A;  1Z1H A;  5P89 A;  2QI0 A;  1FKN A;  5P6W A;  1BXQ A;  2HB2 A;  2IL2 A;  3SAA A;  5P1W A;  4EJL A;  2P3C A;  3CKP A;  3K5C A;  5OZZ A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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