2BKSA

Crystal structure of renin-pf00074777 complex
Total Genus 83
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
83
sequence length
333
structure length
329
Chain Sequence
SSVILTNYMDTQYYGEIGIGTPPQTFKVVFDTGSSNVWVPSSKCSRLYTACVYHKLFDASDSSSYKHNGTELTLRYSTGTVSGFLSQDIITVGGITVTQMFGEVTEMPALPFMLAEFDGVVGMGFIEQAIGRVTPIFDNIISQGVLKEDVFSFYYNRDSELGGQIVLGGSDPQHYEGNFHYINLIKTGVWQIQMKGVSVGSSTLLCEDGCLALVDTGASYISGSTSSIEKLMEALGAKKRLFDYVVKCNEGPTLPDISFHLGGKEYTLTSADYVFQESYSSKKLCTLAIHAMDIPPPTGPTWALGATFIRKFYTEFDRRNNRIGFALAR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Equipotent Activity in Both Enantiomers of a Series of Ketopiperazine-Based Renin Inhibitors
pubmed doi rcsb
molecule keywords RENIN
molecule tags Hydrolase
source organism Homo sapiens
total genus 83
structure length 329
sequence length 333
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.4.23.15: Renin.
pdb deposition date 2005-02-18

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00026 Asp Eukaryotic aspartyl protease
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.40.70.10 Mainly Beta Beta Barrel Cathepsin D, subunit A; domain 1 Acid Proteases 2bksA02
2.40.70.10 Mainly Beta Beta Barrel Cathepsin D, subunit A; domain 1 Acid Proteases 2bksA01
3VF3A 4YCKA 2BPWA 1IZIA 3QVIA 3CIDA 4GJAA 3S43A 1XE6A 5P0AA 3ZKQA 4FSLA 1MPPA 1ZPAA 5PEPA 1GVWA 3G70A 1MIQA 2AVQA 4EYRA 5P8OA 4CPWA 1K6VA 5P4BA 1FQ7A 5P2GA 3LHGA 2PH6A 5P5RA 1LYBB 5JFUA 3PM4A 1EC0A 5ENMA 1OEWA 4EJKA 3BC4A 3NUJA 5P1BA 3VV6A 2ER9E 6APRE 5P2SA 4ZE6A 4Y4ZA 3VF5A 3LIYA 3OXXA 1GNMA 5AH7A 1META 5P89A 3ZL7A 4OBFA 4B1DA 5P6AA 3RTHA 2WF1A 5P6GA 4J0VA 5P3TA 1AAQA 1MRXA 4QJ9A 1K6TA 1DAZC 5P5FA 5P09A 2AOJA 5P0TA 3WZ8A 5P31A 5P37A 4JPEA 4Y3EA 3UDPA 2AIDA 4TRYA 2WF3A 5P15A 2PYMA 5I3YA 5P4EA 3KDDA 1KJHA 2FNSA 3U71A 3S56A 1W50A 4D8CA 1E81E 1PFZA 5P79A 4LXMA 3QROA 2I0DA 3WZ7A 3PEPA 4RCDA 5P6VA 5P3JA 3ECGA 3Q3TA 3IAWA 4R91A 5OYXA 5P7DA 4J55A 4YD3A 3RVIA 5P7LA 3OQKA 3GI6A 5P8AA 2PYNA 4OBDA 3PSGA 5P35A 4J0YA 1EBWA 5P2JA 4WY6A 1K2BA 2VIZA 1GNNA 5HCTA 5P1SA 2BBBA 2QMFA 3BHEA 4DJVA 2Q64A 5P4JA 4Q1WA 1IVQA 1HXWA 5P62A 3O99A 2Z54A 1UH9A 4OBJA 4LP9A 1AZ5A 5OZTA 5P7TA 4OBZA 1D4KA 1A8KA 1GVVA 2QMPA 5P5EA 2R5QA 3OXVA 3VLBA 3SKFA 1FQ8A 1BVEA 5P53A 1LYBA 3IVIA 4Y3JA 4YHQA 1ZSFA 1CMSA 5OYWA 5IVSA 3Q70A 2Q11A 3IGBA 4GIDA 2BPXA 4Y5LA 1SIPA 4J17A 4K8SA 3SA8A 5P47A 5OZCA 1HWRA 1XN3A 4Y37A 1MTBA 4Y3PA 2IKUA 4Y4WA 3OU4B 3TKWA 3FSMA 1AIDA 2VNMA 4ZLSA 5P2BA 5OZZA 3KDBA 3HW1A 3TPPA 5P3NA 5P7BA 3NDXA 1T6EX 1OD1A 2Q63A 2QZWA 5P2RA 5HDZA 4HLAA 2PMAA 5P23A 5P8FA 1FQ4A 4HDFA 3HBOA 5P68A 5I70A 5P27A 3NU6A 5P4KA 1SIVA 1C70A 5P3CA 2OHMA 4L7HA 3O9FA 5P0SA 3UF3A 4D83A 5P7CA 2RKGA 5P3FA 1HSHA 5P1QA 1T3RA 5P5IA 4EQJA 2I1AA 3UQPA 2FDDA 2NR6A 3ZKIA 1TCWA 4DQGA 4RCEA 4K4QA 4COEA 4EPJA 5P5KA 3IXOA 5HE5A 6UPJA 5OZBA 3PJ6A 4GB2A 4YDGA 4Y4GA 4J0TA 5P33A 2V11C 2I4XA 4DPIA 3AIDA 5P3WA 1KZKA 5P42A 3ST5A 5P8RA 3OUBA 5P4TA 5P6FA 4Y4AA 4ER4E 3NU9A 5KR2A 4OBKA 4HA5A 1HPXA 1HVSA 4ZSRA 5P8HA 4B1EA 5P4MA 5OYZA 5P8UA 4Y38A 3K1WA 3ZOVA 2WEZA 2QU2A 4U7VA 3L3AA 1HTRB 3GI0A 4CKUA 2F3EA 2HB2A 5P5YA 4FAEA 1GVXA 5P3IA 3MXEA 5DPZA 3UCBA 3FV3A 4FAFA 1BDQA 5COPA 2WJOA 2OHUA 4OBHA 5P8PA 5DGUA 1ZBGA 3UDJA 2I4DA 3OU4A 4FM8A 5OZIA 4F73A 1QDMA 4GMIA 3URLA 2NMZA 3L5CA 3NYGA 1TSUA 5IE1A 3EKVA 1YG9A 3OXCA 2ANLA 2PH8A 5P32A 2QAKA 3TLHA 5CONA 5P46A 3I25A 5P6SA 3IXJA 4FRSA 4L1AB 5BRYA 4Y5CA 2PWCA 3OHFA 5P19A 1A8GA 2NNPA 5OZ6A 5P0YA 1MT8A 1CZIE 4Y48A 1LF3A 2V00A 2IKOA 5OZOA 5P4PA 5P7XA 3LPKA 5P6YA 5OZSA 7HVPA 4R93A 3VFAA 1SGZA 5P4UA 5P6NA 4LHHA 4NJSA 5P48A 3HVGA 1ODYA 4EP2A 3O9LB 3CICA 3DCKA 1ZJ7A 1ME6A 4DI2A 2I4WA 5P1CA 5P3MA 2NXDA 3TPRA 4Y5MA 1HVCA 4J0ZA 1W5YA 3EKXA 2VA6A 4CPRA 5DR8A 3GW5A 3QP0A 4FLGA 4EWOA 5P87A 5P7WA 4KUPA 3PSUA 5EZZA 5KOQA 5P3BA 5P4XA 3SACA 5OYYA 5P4FA 5P70A 1FLHA 5OZXA 4LC7A 5P8GA 2ZJHA 1CPIA 4I1CA 3NDWA 5P6MA 4HVPA 1EC1A 5P5TA 2HB4A 4BEKA 4Y3NA 5P3EA 1BWBA 5P1HA 3Q6YA 3TOGA 3KDCA 1PPME 3T6IA 2F81A 2QHYA 3D20A 5P6RA 2CEJA 5P7AA 5P3XA 4YE3A 4GJBA 4Y4JA 2WECA 3EBZA 3VEUA 4XX3A 3S8IA 4DJPA 1BWAA 5P2FA 3OOTA 4GZFA 1LYAB 2PSUA 3UQXA 1M4HA 2G94A 1AXAA 5P5OA 1ER8E 3CYXA 1W51A 4L1AA 2ZJMA 2BKTA 3VYDA 4Y9WA 5P7QA 5ER1E 3VSXA 4FGXA 3MSJA 5P65A 3MXDA 4Y35A 2BQVA 2AOFA 5P67A 5P76A 5OZRA 3OGPA 4Y3SA 2B7FA 5P7NA 3G6ZA 2ZDZA 2PC0A 3H5BA 2I4QA 4Y44A 5P57A 1EC2A 3O9LA 2OHRA 1MTRA 5HE4A 3BRAA 4Y4EA 5P8JA 4GJDA 5P2YA 1HPSA 4N00A 2OHQA 1WBKA 5P3PA 3QIHA 5P8SA 5P24A 1D4LA 3OQ7A 1XE5A 4LBTA 2AODA 2R38A 5P71A 5P8VA 2QU3A 4YD5A 3EM6A 5DQ1A 5P77A 5DR7A 3EL0A 2F8GA 4AMTA 1KJFA 4TVGA 2BPVA 4RCFA 1VIKA 4XXSA 5P1EA 3GI4A 5P8BA 4I0ZA 1KJGA 3S53A 5P0KA 4A6CA 4TRZA 5P61A 3OU1B 4I0EA 5P2WA 1EPRE 3A2OA 4DUSA 3KFPA 3OGQA 4XKXA 5HE7A 1D4YA 2XFIA 3EKYA 3Q5HA 1QBRA 5P5GA 5P7UA 1SBGA 1NPVA 2VIYA 4F74A 5P7IA 5P01A 4F75A 1LYAA 5P16A 5P03A 5P0DA 2EWYA 1Z1RA 1GVTA 5OZUA 2QI3A 3LPIA 3JW2A 4L7GA 3SM2A 5OYRA 4DJYA 1AVFA 2IGYA 5P2HA 4RVXA 4Y39A 3CKRA 2F3KA 5C9FA 5P3QA 4D85A 1EPLE 2NPHA 3KFNA 3WSJA 3SAAA 5P2QA 1Z8CA 5P0RA 5P8EA 3HZCA 3T7PA 2UPJA 3VF7A 5P0CA 5P0QA 5P7YA 3UDKA 3OXWA 1ZSRA 3URIA 3T11A 5DR0A 1HPOA 5P4WA 5P5HA 2QD8A 4A6BA 1YT9A 5P26A 5COOA 5P8TA 3I6OA 5P36A 5P4VA 4MC1A 5I3XA 5P85A 3TTPA 3FKTA 3K5FA 4FS4A 1KJ7A 4I0FA 3C9XA 5AHBA 3BXSA 3UDHA 4H3IA 1WKRA 5P17A 5P4RA 2P3CA 3EMYA 1W5WA 3HD8A 5P41A 1XS7D 5HU1A 1ZP8A 3M9FA 2APRA 5P2EA 5F01A 1GKTA 2QD6A 3HLOA 2MIPA 5OZWA 3INEA 3OU1A 5P3LA 3VUCA 2FLEA 5P8IA 4DQBA 4H3JA 5P52A 1K6PA 5DR3A 2P3BB 4H3FA 3VV7A 5P1TA 4AZYA 5P5LA 2FDPA 5P4IA 4Y45A 3KMYA 5P4LA 5P34A 3O9EA 3ER5E 3UQRA 3DCRA 2QZKA 2RENA 4GJ6A 3S2OA 3LZVA 1XL5A 5P3AA 4GYEA 1T7IA 1DIFA 1XDHA 1HVRA 3PBZA 2IQGA 3PVKA 5P49A 3O9HA 5P5VA 5P29A 3UDQA 2BKSA 4DQCA 4L7JA 4Q1NA 3OUDB 4RGHA 2ZYEA 2WKZA 4Y3XA 5OZHA 4ER2E 1APWE 3QN8A 2I0AA 4I12A 3MSKA 4YOBA 4PZXA 2OAHA 1HVHA 4OC6B 1IIQA 3NR6A 1YM4A 3I2LA 1D4HA 4Y50A 3DUYA 2B42A 2I4UA 2G1NA 5P4ZA 5BWYA 5P7HA 1TCXA 4NPTA 4Y3GA 5P2LA 5SZ9A 4QGIA 5P8QA 5P0VA 3DK1A 4YD7A 1FIVA 5P0MA 5AH6A 2R43A 3UFLA 1HVIA 2AOIA 1T6GA 3QS1A 5SXNA 3R0YA 5KQYA 2JXRA 1BDLA 4I0DA 4J1HA 2V10C 4Y3AA 5P2DA 4XX4A 2HC0A 5P30A 1NPWA 3LITA 1HTGA 3EM3A 5P1JA 1HIHA 5P1YA 4RROA 1MVPA 2P3BA 4J5JA 4CPSA 5OZ2A 3SPKA 4J1EA 5OZVA 1B6PA 3IXKA 5P4NA 5P6CA 1SDVA 2VA5A 4ER1E 7UPJA 2BJUA 2F80A 1K2CA 5DQCA 3RSXA 2O40A 5P72A 2R3WA 3TKGA 3TPJA 3R1GB 1EEDP 1UPJA 5COKA 1RNEA 2FS4A 1ENTE 3D91A 5P8NA 3PWMA 5P13A 3QRSA 3DV1A 1AJXA 3K5GA 5P3SA 2ASIA 1PPKE 5P6PA 1APTE 4Y54A 4H3GA 5P1DA 3L5EA 2FGUA 5P2MA 3PLDA 4APRE 2P83A 3OUDA 5P08A 5P7ZA 1QS8A 4Y3HA 5P64A 1A9MA 3ZKXA 2O4LA 3PRSA 1RPIA 3S7LA 2QHCA 4Y3MA 2HS2A 4FM6A 2G1RA 3PI5A 1HBVA 2QCIA 5DR4A 2I4VA 4OC6A 5P1MA 3PSYA 1RL8A 4B70A 4CPQA 4CPXA 2H6SA 2JJIA 2OHTA 3TNEA 5AH9A 3D1ZA 2JE4A 4EXHA 1SMRA 3QBFA 3L58A 3R0WA 5P0EA 5P1OA 4QJ8A 5P84A 1BV7A 1LEEA 2ZJJA 5P2XA 5OZYA 5P6TA 5P6ZA 4EP3A 4Y5BA 1FFFC 1FQXA 4Z50A 1M43A 2JJJA 2PWRA 5OYSA 1EPQE 2RMPA 3PMUA 1D4SA 1G35A 2F3FA 3T3CA 2V16C 4HDBA 1SMEA 3LIVA 1YTGA 3ZKNA 1APVE 3IA9A 4GJ7A 3L38A 3NLSA 5P11A 1MUIA 3MWSA 5KAOA 5ISKA 1HTEA 5P10A 3L5FA 5OZ1A 2P8HA 2V12C 5P1LA 2AOCA 5OZMA 2G20A 5UPJA 2NTRA 1B6JA 3OU3A 5P1VA 5P4SA 4AA9A 4HDPA 1ZLFA 4FRIA 3SA4A 5AHAA 3VV8A 3SA5A 5P44A 1AJVA 4DJWA 2O4PA 4QJ7A 5JODA 5OZ5A 5P7GA 3OAGB 1T7JA 1E80E 2HPFA 5P05A 3DOXA 2ZE1A 5P54A 3BVAA 1KJ4A 3OWNA 1LYWB 3EKTA 2XYEA 3O9IA 5P50A 8HVPA 2IL2A 3APRE 4M8XA 2OHPA 1MESA 4CPTA 3NDTA 1D4IA 5P8MA 5HDVA 1SDTA 2OHLA 2B7ZA 4YD6A 3BGCA 5OZ0A 1EBKC 3SQFA 1G2KA 4Y4XA 2RSPA 2G27A 3SFCA 1YM2A 5DGWA 2V13A 4ZPEA 2UXZA 5P22A 5P1ZA 2QNNA 1BDRA 4HZTA 4TRWA 1K1TA 4K9HA 4U8WA 5P6BA 2AQUA 1T7KA 5P0UA 5P1IA 5P75A 3QPJA 4YCTA 3NU5A 2AVVA 5FIVA 4Y3LA 2AOEA 2QZXA 1UH7A 1FMUA 5P0BA 3PBDA 1W5XA 4NJTA 3TOFA 1IDBA 2J9JB 2P4JA 1HXBA 4I8WA 4Y3FA 3NU4A 2WF2A 3KT5A 1B6KA 2B8LA 4Y5AA 4IVSA 1IDAA 2QP8A 1LF2A 4S1GA 4I8ZA 3UDMA 5IS4A 3UDNA 3S45A 5P2AA 4DJXA 4B78A 5P8CA 3LZYA 3LNKA 5OZ7A 1HEGE 4OBGA 4KE0A 4DQFA 5P0IA 4NJUA 5P82A 2PK5A 3PWWA 5T4SA 1DPJA 3NDUA 5OZKA 5P6KA 3OAGA 4ZSQA 4PYVA 2P3DA 5KQXA 5DQ5A 5P3RA 5ENKA 3OTYA 2QI5A 3B80A 1EAGA 4K4RA 5P3DA 1UH8A 2AOHA 5IVRA 5P06A 1LYWA 6FIVA 5F00A 3OK9A 5P12A 1F34A 4R8YA 3ZPUA 4Y43A 1WBMA 5DQ4A 3LZSA 4B05A 2VKMA 3KFSA 4CPUA 4JPCA 1W6IA 4LAPA 5P4QA 1ODXA 2ZGAA 4I0HA 2FXDA 5E5KA 5OZLA 5P7EA 4YBIA 4WTUA 5SY2A 4Y5NA 4EXGA 1DP5A 1YTJA 3PWRA 5P25A 3UQWA 3AUPA 4NPUA 3OUAA 3H0BA 3K4VA 3DJKA 3S7MA 3R2FA 5DR1A 4CMSA 4R92A 3OADB 2AZBA 1A94A 2ZJKA 4DH6A 3BVBA 2J9JA 2XFKA 2HPEA 5TOLA 2J9KA 2Q15A 3GGUA 4DJRA 1FMXA 4DJOA 5IVTA 1EPPE 1W6HA 3INFA 3L5DA 1PSNA 1SGUA 5P20A 3D1XA 5P1RA 5P7KA 2IS0A 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 3VF3 A;  4YCK A;  2BPW A;  1IZI A;  3QVI A;  3CID A;  4GJA A;  3S43 A;  1XE6 A;  5P0A A;  3ZKQ A;  4FSL A;  1MPP A;  1ZPA A;  5PEP A;  1GVW A;  3G70 A;  1MIQ A;  2AVQ A;  4EYR A;  5P8O A;  4CPW A;  1K6V A;  5P4B A;  1FQ7 A;  5P2G A;  3LHG A;  2PH6 A;  5P5R A;  1LYB B;  5JFU A;  3PM4 A;  1EC0 A;  5ENM A;  1OEW A;  4EJK A;  3BC4 A;  3NUJ A;  5P1B A;  3VV6 A;  2ER9 E;  6APR E;  5P2S A;  4ZE6 A;  4Y4Z A;  3VF5 A;  3LIY A;  3OXX A;  1GNM A;  5AH7 A;  1MET A;  5P89 A;  3ZL7 A;  4OBF A;  4B1D A;  5P6A A;  3RTH A;  2WF1 A;  5P6G A;  4J0V A;  5P3T A;  1AAQ A;  1MRX A;  4QJ9 A;  1K6T A;  1DAZ C;  5P5F A;  5P09 A;  2AOJ A;  5P0T A;  3WZ8 A;  5P31 A;  5P37 A;  4JPE A;  4Y3E A;  3UDP A;  2AID A;  4TRY A;  2WF3 A;  5P15 A;  2PYM A;  5I3Y A;  5P4E A;  3KDD A;  1KJH A;  2FNS A;  3U71 A;  3S56 A;  1W50 A;  4D8C A;  1E81 E;  1PFZ A;  5P79 A;  4LXM A;  3QRO A;  2I0D A;  3WZ7 A;  3PEP A;  4RCD A;  5P6V A;  5P3J A;  3ECG A;  3Q3T A;  3IAW A;  4R91 A;  5OYX A;  5P7D A;  4J55 A;  4YD3 A;  3RVI A;  5P7L A;  3OQK A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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 3LIX A;  3EL5 A;  5P0L A;  4DJU A;  4IVT A;  1FG6 C;  3LIN A;  5KOS A;  2G1S A;  4RZ1 A;  2G22 A;  4ZIP A;  5P4A A;  1FKN A;  3FIV A;  3VCM A;  3O9G A;  4OBZ B;  3CIB A;  2CEN A;  1HTF A;  3PHV A;  5BS4 A;  2FGV A;  3LZU A;  3WZ6 A;  3CKP A;  3OAD A;  2ER6 E;  3EL9 A;  2NMY A;  1SDU A;  5P1F A;  4Y3Z A;  5P5U A;  1MT9 A;  3APP A;  4GJ5 A;  1B5F B;  2WF0 A;  1G0V A;  5P1K A;  3SKG A;  3T7X A;  3LIZ A;  1GVU A;  4Y5E A;  1EBY A;  3NUO A;  1ODW A;  4QLH A;  4I0G A;  3ZLQ A;  2HIZ A;  1MEU A;  3PCZ A;  4PPH A;  3PI0 A;  4X7I A;  5HDX A;  4DQH A;  3CMS A;  3B7V A;  5P6H A;  4BFB A;  2O4N A;  3UPJ A;  2OHS A;  5P5X A;  5P1A A;  4JOO A;  3CYW A;  4FE6 A;  5P7M A;  2QI4 A;  2ZJN A;  2WL0 A;  3K5C A;  2OHN A;  3PB5 A;  2VIE A;  3BUF A;  4A4Q A;  4Y4B A;  2A4F A;  3DV5 A;  4Y57 A;  5P2T A;  5P7O A;  5P40 A;  1A30 A;  5OZ4 A;  3UHL A;  3SA7 A;  1NPA A;  4B1C A;  5P5M A;  2IDW A;  3FNT A;  2FNT A;  3PCW A;  2FXE A;  3NSH A;  4Y4T A;  3OY4 A;  5OZ8 A;  3FX5 A;  3RSV A;  2V0Z C;  4RYC A;  5AH8 A;  5APR E; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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