2ER0E

X-ray studies of aspartic proteinase-statine inhibitor complexes
Total Genus 77
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
77
sequence length
330
structure length
330
Chain Sequence
STGSATTTPIDSLDDAYITPVQIGTPAQTLNLDFDTGSSDLWVFSSETTASEVDGQTIYTPSKSTTAKLLSGATWSISYGDGSSSSGDVYTDTVSVGGLTVTGQAVESAKKVSSSFTEDSTIDGLLGLAFSTLNTVSPTQQKTFFDNAKASLDSPVFTADLGYHAPGTYNFGFIDTTAYTGSITYTAVSTKQGFWEWTSTGYAVGSGTFKSTSIDGIADTGTTLLYLPATVVSAYWAQVSGAKSSSSVGGYVFPCSATLPSFTFGVGSARIVIPGDYIDFGPISTGSSSCFGGIQSSAGIGINIFGDVALKAAFVVFNGATTPTLGFASK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title X-ray studies of aspartic proteinase-statine inhibitor complexes.
pubmed doi rcsb
molecule keywords ENDOTHIAPEPSIN
molecule tags Hydrolase/hydrolase inhibitor
source organism Cryphonectria parasitica
total genus 77
structure length 330
sequence length 330
ec nomenclature ec 3.4.23.22: Endothiapepsin.
pdb deposition date 1990-10-20

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
E PF00026 Asp Eukaryotic aspartyl protease
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.40.70.10 Mainly Beta Beta Barrel Cathepsin D, subunit A; domain 1 Acid Proteases 2er0E02
2.40.70.10 Mainly Beta Beta Barrel Cathepsin D, subunit A; domain 1 Acid Proteases 2er0E01
2NMZA 5OZ2A 5TOLA 2QMPA 4N00A 3TPJA 3EL0A 5P0FA 3HAWA 5P04A 5P7MA 4F76A 2UXZA 2J9JB 4AA8A 3RVIA 2Q11A 2RMPA 1BWBA 2J9JA 5T4SA 3EC0A 2ZHVA 5OZHA 4B1DA 2P4JA 7HVPA 3FKTA 1KJGA 1FFFC 2VJ6A 5P4UA 5P1JA 5P1HA 5P6IA 3OUCA 2ER0E 3C9XA 4Z2ZA 1HSIA 1ZTZA 4EPJA 1OEXA 2WEAA 5KR0A 5P75A 4DH6A 3PVKA 3GGAA 2G22A 5P1KA 5P1YA 2V00A 2QI5A 2FDEA 5OYXA 5P8CA 3NU4A 3GGXA 4H3IA 1SP5A 4OD9B 5P6TA 1A94A 3CYXA 2ZJIA 4DQGA 4OD9A 2QD7A 5P15A 1LEEA 4U7QA 5P3ZA 3UDYA 1SIVA 1QBSA 1A9MA 3TOHA 2F3FA 3D20A 1EPPE 2WF1A 3LHGA 5P1IA 1LF4A 5P7QA 3VLAA 4Y5CA 2ZDZA 2P8HA 2WF0A 2HIZA 4YD7A 5P4ZA 5P8AA 5DQ4A 4BELA 2PSGA 5P0ZA 3EKXA 3BRAA 5P37A 5P4GA 3L5CA 3GI5A 3VF3A 2H6TA 1Q9PA 3APPA 4LL3A 2RENA 1FQ7A 5P8TA 3FSMA 5P2TA 2F80A 7UPJA 3G70A 1BAIA 5P4OA 3S45A 3IGBA 4Q5MA 4DJVA 5P35A 5P6RA 4DJRA 4Y3LA 2IRZA 4QJ7A 5P0LA 3TOGA 5P47A 2VJ7A 5P5NA 5ISJA 4F75A 2V16C 1FGCC 4ZPEA 1ER8E 5EZZA 1MPPA 5P5EA 2BPYA 4Y3PA 3KFNA 5P5QA 2RKFA 5P5OA 5P0HA 5HVPA 2H6SA 2ZHTA 4GJDA 1QDMA 4D88A 3TKWA 2PYMA 5P6PA 1T7JA 3L3AA 5OZ5A 5FIVA 1W5YA 2FDPA 3GGVA 5P4MA 5OYYA 3N4LA 4YOAA 2ZJNA 5P6MA 5P6YA 5P05A 4MC1A 3OGPA 4FRIA 5OZYA 3IN3A 4Q1NA 1MVPA 4Y4XA 5P43A 2QZWA 3S54A 1ODYA 2G21A 3R2FA 4YD5A 5P8UA 1IDBA 1EC3A 3VEUA 1DMPA 4XX3A 1TZSA 1BXOA 1G35A 2QMFA 4Y3NA 1SGUA 2WECA 2PH6A 2AOHA 2NXDA 4LP9A 3UQUA 1IZHA 5P64A 3O99A 3EMYA 2FXEA 3LIZA 5OZEA 2OHTA 5AH7A 3SA9A 4PHVA 4J17A 4KE0A 4EP3A 3DV5A 2O4KA 3GGUA 3O9HA 1JLDA 3ER3E 4K4QA 2FGUA 3FNTA 3HVGA 2QNNA 3ER5E 1ZSFA 3EKTA 3VV7A 1HRNA 5P5FA 5P5IA 1W5VA 1C6XA 5P0CA 5P7DA 2FNSA 5I70A 1RL8A 4WY1A 4YHQA 4F74A 4I0GA 1TCWA 2NPHA 2XFIA 5P1AA 2QNQA 5P8BA 4Y4TA 3BC4A 5P6KA 4YD3A 1J71A 2IL2A 3VUCA 3I2LA 5P11A 3NWXA 4Z50A 1HXBA 4JECA 4R91A 3MSLA 2FGVA 2G27A 3NXEA 4NJVA 4DQCA 5P6BA 5P52A 4YDFA 3LPIA 1LF2A 4Y4EA 3G72A 4ACUA 4FRJA 5OZDA 2WF4A 4J1IA 3JW2A 5P3AA 3UQPA 3PGIA 5P3BA 2ER7E 5OYZA 5P5JA 3U7SA 4LAPA 4FE6A 2P83A 4H3FA 5ER2E 6FIVA 4Y3DA 1PSOE 5C9DA 3LZSA 1APUE 5P08A 2AOGA 4Y39A 5P0KA 2Q55A 1ME6A 2BPWA 2AZCA 2Q64A 3INDA 4Y35A 4QJ6A 5P7ZA 2R43A 1CZIE 3PLDA 2PWCA 3GI4A 3KMYA 5P2VA 3T11A 1B6PA 1ZLFA 5P4VA 1RV7A 2B7ZA 5P17A 3RSXA 4DJPA 5ENKA 3UDJA 1HVLA 4ZLSA 1K6PA 3UQXA 5P02A 4DPIA 4KE1A 3HD8A 5P7FA 1YTJA 5P01A 3OTSA 4QJ2A 1BDRA 4XXSA 5HE5A 2ZHUA 2ANLA 4L6BA 5P18A 1FMXA 5P24A 3Q5HA 3PI0A 3OOZA 1T7KA 3WSJA 4L7GA 3NU5A 4D85A 3T3CA 1HTGA 2VA5A 3OAGB 3QAAA 3S56A 4L7JA 5DPZA 4R5NA 5P7RA 5P2DA 1BDLA 5OYTA 5HE4A 3BXSA 4CPRA 1XDHA 1LYBA 2OHMA 3KDCA 3OAGA 4B1CA 2AVQA 3Q3TA 2ZHRA 3KFPA 1HHPA 1PPLE 3K5FA 2P3CA 2JJJA 5OZ7A 1XN2A 4X7IA 3NDXA 4RVJA 2PK6A 1ZSRA 1LV1A 5P56A 3PMUA 4LXKA 5P00A 5P3LA 4KUPA 3VSWA 3ZOVA 4EJLA 5P40A 5P8RA 5P8LA 4NJSA 1XL2A 3UQRA 5P2IA 6UPJA 1VIJA 3WB5A 4APRE 1K6CA 1E80E 9HVPA 1EBZA 5P8JA 3GI0A 4Y3SA 1HIHA 3VSXA 4ZSMA 2FLEA 1Z8CA 3NDUA 3L59A 4A6CA 2XFKA 3PSGA 5P2UA 1EBYA 5P1CA 1IBQA 2F8GA 4DQEA 1LS5A 1HPSA 1KZKA 4Y36A 4YDGA 4XX4A 5P2KA 3EXOA 2Z4OA 5P0QA 1IDAA 1SMRA 3KFSA 4ER2E 5KQFA 3HAUA 4Y47A 3T7QA 5OZBA 5P3QA 4YE3A 5KR2A 5EZXA 5P5VA 5P6NA 5P3PA 5OYRA 1T6EX 2FIVA 3CKTA 3SQFA 4FIVA 1GNOA 5P6XA 4CPSA 5P2JA 1D4HA 1MESA 5P0BA 5DQCA 5P54A 4OBJA 5P4NA 4QJAA 3U6AA 2QZKA 3LIYA 4GJAA 2VIJA 4ZSRA 5P4DA 1E81E 4Y5PA 4YCYA 4CKUA 3VV6A 4DQHA 4APEA 2QP8A 5DR4A 3NUJA 1MT8A 2O4PA 4OC6B 1EBWA 5P1LA 5KR1A 4I12A 3GI6A 1D4YA 5P3EA 5P5AA 5P33A 4OC6A 2QZLA 3ECGA 3NSHA 5OZKA 2NNKA 5P7JA 5P6CA 4Y5MA 5P42A 2AZ9A 3UQWA 2ZHSA 5P2YA 3ZPUA 4GIDA 4J1EA 5HDVA 5P6QA 4DV9A 5P73A 5P7XA 2HPEA 4ZIPA 5P1XA 1SMEA 3EKWA 3OXXA 3VG1A 4J5JA 3UDRA 1VIKA 3PSYA 1D4SA 3K5GA 1IZDA 4Y4AA 1FQ4A 3S8IA 4J54A 5P5GA 2WHHA 4Y3JA 1ODXA 5P7LA 3T6IA 3NR6A 3LNKA 1G6LA 2PWRA 3NLSA 2P3DA 4FLGA 4FM6A 4NPUA 2VA7A 1EC1A 5OZXA 5P8GA 4Y3XA 5P5KA 3SPKA 2WEZA 4HE9A 5AHAA 2RKGA 4LBTA 4U7VA 1HVKA 1HPOA 1E5OE 5P07A 3BUFA 3FX5A 3EL9A 4DPFA 3IN4A 5P0XA 1T3RA 2Q5KA 3ZPSA 1FLHA 4B72A 3SACA 2VIEA 2XFJA 4H1EA 1LYWB 5P1MA 1KJ7A 2OHNA 5P4AA 5P1RA 5P0DA 5OZSA 1M43A 1LYWA 3O9IA 4EYRA 2I4UA 3QRSA 5P32A 1K6VA 2BB9A 3BGCA 5HDXA 4EP2A 5IVRA 3UDQA 3R0WA 3IAWA 3FV3A 1HVHA 1EPME 3LITA 4Y56A 5P22A 5IVSA 1DPJA 1BILA 5P4IA 2HM1A 3SKFA 4Y4GA 1QBRA 3SA7A 5P0AA 5P0OA 4FRKA 1AXAA 5P82A 2IGXA 2FS4A 5KAOA 1UH9A 2VIZA 2WEBA 1UPJA 3UDNA 3IA9A 4RCEA 4Y4WA 3CKPA 3PMYA 4Y5GA 3QBHA 3AIDA 5P6WA 5P4SA 2UY0A 4Q1YA 3URJA 4I0ZA 3OUAA 3OQAA 2V0ZC 5P67A 2IKOA 3PI5A 3ZL7A 5P3KA 2OHSA 5P7SA 1MT7A 2HC0A 3PM4A 4L1AB 3D91A 5P6DA 4M8XA 3QS1A 5P4BA 1HOSA 2ZJJA 4L1AA 5P1FA 3EKQA 5P0MA 5OZ9A 3UHLA 3K4VA 5P3WA 2AOJA 5HD0A 4Y5LA 4DJUA 3CIBA 3TLHA 2BJUA 3EL4A 3ZKMA 4AUCA 1YM2A 4AA9A 4I8WA 2R3TA 1WKRA 5P3SA 3HZCA 2BKSA 4DFGA 4CP7A 4RGHA 1EC2A 4Y3AA 2ZJKA 3PCWA 4M8YA 5P1NA 4GJ7A 3BGBA 5P6ZA 5P4TA 4LC7A 3TNEA 2O4LA 5IS4A 5P7YA 2F3EA 5P0GA 5P5YA 5P4XA 3OY4A 4PEPA 2OHUA 3OQKA 4RCDA 4Y5NA 3L58A 4D89A 1FMBA 4GJ6A 3Q6YA 1FG6C 4I0JA 4DUSA 1FQ6A 2O4SA 5IVTA 1G2KA 3NWQA 5P7WA 5P1TA 5C9BA 5COKA 4QJ9A 4B1EA 2UPJA 2PK5A 3HLOA 3L38A 5P03A 3OHFA 1HPXA 2JJIA 4I0DA 2VIYA 5P44A 2IS0A 4Y44A 2WF2A 3EM6A 4GJBA 5P84A 4R95A 5OZFA 5P3HA 5OZIA 5I3VA 2IQGA 4DVFA 3NDWA 2WKZA 3R0YA 3EBZA 1IVPA 4D8CA 2G1OA 4Y5KA 2QU2A 1B6KA 5P3OA 1OHRA 5P4YA 4U8WA 3VLBA 1FQ5A 5P4EA 3L5EA 5P0IA 4Y3YA 4D83A 1HTFA 4I8ZA 2NMYA 1FIVA 2G26A 5P7KA 5P8VA 4YA8A 1MIQA 3K5DA 1UH7A 1TSUA 4OBHA 5P3MA 3URLA 5P88A 1T7IA 3R1GB 1LYAB 4JPCA 1WBMA 3OXWA 5P0PA 3ZKGA 1GVUA 2APRA 2XYEA 4Y3EA 1ZP8A 2V13A 2WL0A 3IVHA 1APTE 5F01A 3APRE 5P5WA 3S85A 3NU3A 1PROA 1W51A 3PWWA 5P4JA 5OYVA 1BDQA 4IVSA 2OHKA 1K6TA 3UDPA 3OXVA 4K9HA 2RSPA 4DQFA 3PCZA 5P0WA 3N3IA 4RYGA 3ZLQA 2PSVA 4DQBA 4NKKA 2QCIA 4A6BA 5AH9A 1K1TA 5P4PA 3OOTA 5P63A 1UH8A 5P68A 2I4WA 4YCTA 1EAGA 4HLAA 1SDUA 2ZYEA 5P2MA 5P8HA 5P16A 3IXKA 5P30A 4Y3QA 3KT5A 1K2CA 1HVJA 5P2EA 5KOQA 5P41A 3OHHA 5BS4A 1C70A 5P2RA 5P79A 3EKYA 2I4DA 4IVTA 2NNPA 5P6SA 5P8OA 2VJ9A 2AOCA 4MC9A 5SZ9A 1W50A 5P0RA 1GKTA 1YT9A 5P8PA 5P7IA 3F9QA 4PZWA 5JFPA 3HBOA 2I4VA 1PSNA 4NJTA 4FSLA 4GYEA 4J55A 4MC6A 4LXMA 5P0UA 3VF5A 4DJWA 4Y3HA 4YBFA 1W6IA 3LINA 3MSKA 3SA8A 2VA6A 5P86A 3B80A 3CIDA 3PJ6A 5P2GA 4A4QA 2QHCA 2P3AA 3RTMA 5P4RA 3QBFA 5HCTA 1EPNE 5OZWA 5P2CA 3UTLA 1GNMA 1NPVA 2QD6A 5P6OA 4R93A 2VKMA 1AM5A 2QHYA 5OZOA 5P0EA 5P0SA 4F73A 4HA5A 3KT2A 2R5PA 3QN8A 3L5BA 4OBZB 5J25A 1QRPE 5SY2A 5P2LA 1IZEA 5UPJA 2AODA 4OBZA 4AZYA 4Y50A 2B60A 1ZAPA 5P58A 3PEPA 2O40A 3D1XA 1EPRE 2PC0A 3MXDA 4Y3WA 3QRVA 2O4NA 4TRYA 3UFLA 3PB5A 4Y48A 1ZPAA 1N49A 1QBUA 2BBBA 4L7HA 3INFA 3OK9A 5DQ5A 3PLLA 2VNMA 5COPA 3S7MA 5P8DA 1MSNA 3PRSA 5P4KA 3UCBA 5P3JA 1C6ZA 4OBGA 1EPQE 4WTUA 4K4RA 5P2WA 5P6FA 1AVFA 5P34A 4X2LA 1GVVA 3O9EA 4QJ8A 3ST5A 2NXLA 3O9DA 3LIQA 1Z1HA 3UPJA 4LXAA 1HTRB 3I6OA 5P7NA 1XE6A 4Y5AA 5P4FA 2I1AA 5P7UA 5AH6A 3U71A 5P0NA 3KM4A 4ZSPA 2F3KA 3D1ZA 2MIPA 1W6HA 1SDVA 3I25A 4PPHA 1HXWA 2QI6A 5AHBA 2R38A 3T7XA 4Y38A 3B7VA 5HCOA 2PSUA 4RRSA 1E82E 3HW1A 5I3XA 3OGQA 5P2SA 5P85A 5P45A 5KOSA 1TCXA 5P5CA 3SAAA 2QZXA 5P7HA 5ENMA 5OZJA 4GMIA 4WY6A 5AGZA 1ENTE 5B18A 1Z1RA 4RCFA 2JYSA 3SA6A 2G20A 1EPOE 4R92A 4ZSQA 3D1YA 5P5XA 1HVCA 2HAHA 3RSVA 3TPLA 4CPTA 2PYNA 1MTBA 1YTIA 4OBKA 5P0VA 4ACXA 5P38A 3Q4BA 5P0YA 1RPIA 3VFAA 1EEDP 4TRZA 5HE7A 3BHEA 4FGXA 3O9FA 1FQ8A 2BQVA 5OZGA 2OAHA 4YD6A 5OZ3A 1APVE 4I11A 5P7PA 4J0VA 3SLZA 4EQJA 4Y4UA 2AQUA 4RLDA 4Z4XA 4ZPFA 2XYFA 5P4WA 3O9BA 1K2BA 5P2NA 5P3DA 5P1EA 4KB9A 1B6JA 1HIVA 5P5BA 1GVWA 2EWYA 5P6UA 5P3NA 2QI3A 4Q1WA 3LPKA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 2NMZ A;  5OZ2 A;  5TOL A;  2QMP A;  4N00 A;  3TPJ A;  3EL0 A;  5P0F A;  3HAW A;  5P04 A;  5P7M A;  4F76 A;  2UXZ A;  2J9J B;  4AA8 A;  3RVI A;  2Q11 A;  2RMP A;  1BWB A;  2J9J A;  5T4S A;  3EC0 A;  2ZHV A;  5OZH A;  4B1D A;  2P4J A;  7HVP A;  3FKT A;  1KJG A;  1FFF C;  2VJ6 A;  5P4U A;  5P1J A;  5P1H A;  5P6I A;  3OUC A;  2ER0 E;  3C9X A;  4Z2Z A;  1HSI A;  1ZTZ A;  4EPJ A;  1OEX A;  2WEA A;  5KR0 A;  5P75 A;  4DH6 A;  3PVK A;  3GGA A;  2G22 A;  5P1K A;  5P1Y A;  2V00 A;  2QI5 A;  2FDE A;  5OYX A;  5P8C A;  3NU4 A;  3GGX A;  4H3I A;  1SP5 A;  4OD9 B;  5P6T A;  1A94 A;  3CYX A;  2ZJI A;  4DQG A;  4OD9 A;  2QD7 A;  5P15 A;  1LEE A;  4U7Q A;  5P3Z A;  3UDY A;  1SIV A;  1QBS A;  1A9M A;  3TOH A;  2F3F A;  3D20 A;  1EPP E;  2WF1 A;  3LHG A;  5P1I A;  1LF4 A;  5P7Q A;  3VLA A;  4Y5C A;  2ZDZ A;  2P8H A;  2WF0 A;  2HIZ A;  4YD7 A;  5P4Z A;  5P8A A;  5DQ4 A;  4BEL A;  2PSG A;  5P0Z A;  3EKX A;  3BRA A;  5P37 A;  5P4G A;  3L5C A;  3GI5 A;  3VF3 A;  2H6T A;  1Q9P A;  3APP A;  4LL3 A;  2REN A;  1FQ7 A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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