2ER9E

X-ray studies of aspartic proteinase-statine inhibitor complexes.
Total Genus 75
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
75
sequence length
330
structure length
330
Chain Sequence
STGSATTTPIDSLDDAYITPVQIGTPAQTLNLDFDTGSSDLWVFSSETTASEVDGQTIYTPSKSTTAKLLSGATWSISYGDGSSSSGDVYTDTVSVGGLTVTGQAVESAKKVSSSFTEDSTIDGLLGLAFSTLNTVSPTQQKTFFDNAKASLDSPVFTADLGYHAPGTYNFGFIDTTAYTGSITYTAVSTKQGFWEWTSTGYAVGSGTFKSTSIDGIADTGTTLLYLPATVVSAYWAQVSGAKSSSSVGGYVFPCSATLPSFTFGVGSARIVIPGDYIDFGPISTGSSSCFGGIQSSAGIGINIFGDVALKAAFVVFNGATTPTLGFASK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title X-ray studies of aspartic proteinase-statine inhibitor complexes.
pubmed doi rcsb
molecule keywords ENDOTHIAPEPSIN
molecule tags Hydrolase-hydrolase inhibitor
source organism Cryphonectria parasitica
total genus 75
structure length 330
sequence length 330
ec nomenclature ec 3.4.23.22: Endothiapepsin.
pdb deposition date 1990-10-20

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
E PF00026 Asp Eukaryotic aspartyl protease
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.40.70.10 Mainly Beta Beta Barrel Cathepsin D, subunit A; domain 1 Acid Proteases 2er9E02
2.40.70.10 Mainly Beta Beta Barrel Cathepsin D, subunit A; domain 1 Acid Proteases 2er9E01
2AVOA 5P7MA 5EZZA 3K5FA 3QROA 4Y5KA 5P10A 2O4NA 2NXLA 2VA6A 3EKXA 5CONA 4Y3ZA 3SKFA 4M8XA 1PSNA 4QGIA 5HE5A 3SM2A 3MSJA 5PEPA 2PYMA 4Y48A 5P6LA 2BPZA 1HEGE 5KQZA 4Y37A 1HPSA 2IDWA 5P5AA 4LXMA 1FMUA 4J0VA 5P4ZA 4J17A 3UQXA 2R8NA 5P2JA 5P3OA 2FDDA 3RSVA 5OZ0A 1KJ7A 3MWSA 1U8GA 2RENA 2JJJA 2G1OA 1MESA 5I3WA 1G0VA 2FXEA 5OZGA 2G20A 2Z4OA 3LZVA 4M8YA 3EL0A 4Y4DA 4R93A 3PJ6A 5P4JA 5P4VA 1LS5A 4D8CA 5P72A 1HTFA 3SA7A 5P5XA 3HBOA 5P1NA 2I0AA 5HCTA 1HWRA 1NPVA 1YM4A 1EPNE 4YHQA 1C6YA 3URIA 3S54A 5P71A 7UPJA 3BUFA 3TPRA 5KR8A 3D1XA 3GGVA 2B7ZA 4PZXA 2BB9A 1VIJA 4KE1A 5P1IA 4TRYA 5P0OA 3PI5A 5P30A 1MUIA 4B72A 4DQCA 2XYFA 5P5MA 2O40A 4Y3RA 3OUDA 5P7BA 1AAQA 5P7KA 1BDRA 2ZHVA 3SAAA 2ZDZA 1FEJC 2WEZA 4Y43A 4Y5GA 1ER8E 3QN8A 4Y3LA 3Q3TA 5P6JA 5P89A 5P6DA 5P69A 1MT9A 2IGXA 3QIHA 4CP7A 4BFDA 5OZZA 4K4PA 3URJA 3DUYA 5P29A 4NJUA 2QK5A 1M0BA 3K5GA 4PZWA 2ER0E 3UPJA 1OHRA 3OU1B 5P7ZA 1TZSA 5P8GA 1WBMA 4I11A 4GMIA 2QNNA 2FLEA 5AH6A 2HB2A 1AXAA 4LXAA 5P1UA 1J71A 3VSWA 2I4VA 1EPPE 5P5HA 5DQ2A 5P2XA 2FNSA 2CENA 4ZLSA 1EC2A 3LIXA 3T3CA 2HC0A 1RV7A 2F3KA 3L59A 3SA6A 3BXRA 3EM4A 5P54A 1HVLA 8HVPA 1LYWB 5P4TA 2B8LA 2R3TA 2FDEA 5P16A 3S7LA 5P2SA 2PC0A 5ER2E 4ZSQA 3WB4A 4OD9A 3EM3A 5P0LA 3NDXA 5P1DA 4Q1XA 1K1UA 4U7QA 5P39A 1MRXA 5P7YA 1SIPA 5P7CA 3SA4A 2WHHA 3ECGA 3OXVA 3EMYA 3GGUA 5P44A 2ZJMA 1EPME 3KDBA 3PWWA 3OAGA 5P26A 5P6QA 3O9DA 3VUCA 4X7IA 3CMSA 5KR2A 5P35A 2QD6A 3N4LA 4I0FA 4I0JA 1YT9A 3GI4A 3NLSA 4EXGA 5OZQA 2F81A 1BWBA 5P8CA 1QS8A 1A30A 1HPOA 1D4HA 4IVSA 4FCOA 3WB5A 5P3TA 1F7AA 1EC1A 3QRVA 3KMXA 1IDBA 5P22A 4LHHA 4GJ7A 1ZSFA 3T11A 2ZGAA 1W50A 3ZKMA 5P2DA 1HHPA 2QI1A 5AH8A 5FIVA 2Q63A 2QI7A 1HEFE 1EPOE 4GB2A 4PPHA 3TPJA 3O9CA 2I0DA 1SDUA 3GI6A 3R2FA 5OZCA 4Y3PA 4J1FA 2CEJA 1HTRB 5P6BA 5P3HA 2NTRA 5OYUA 5P7DA 1FFIC 3O99A 2ZHTA 2IS0A 4H3GA 5DPZA 1K2CA 1PPKE 3O9FA 4K9HA 4Y41A 5P0BA 3ZL7A 3OQAA 5P6ZA 3FNSA 2WF3A 5P3RA 1MPPA 2HAHA 5P1MA 3O9LA 3NWXA 2ER7E 2G1YA 4Y3EA 3DOXA 5P52A 3O9BA 1IVPA 1SDTA 2JYSA 4Y3NA 3IAWA 1FQ8A 4DJYA 1IZDA 3JW2A 5P32A 1FQ4A 4EP2A 2VIEA 5F01A 3IXKA 5P3KA 5HTZA 3U71A 4J0PA 5P76A 4Y45A 1EBYA 5P5PA 3ER3E 4RVJA 4Y5AA 5KR0A 5P0VA 1BV7A 5KQYA 3INFA 5P03A 1HOSA 1D4YA 4L1AA 1RNEA 3UTLA 4EJ8A 4HDFA 4S1GA 5P2FA 2G26A 3IVIA 4OBKA 5OZHA 1K6PA 3EL1A 1XS7D 4Q5MA 1KJGA 1BXOA 2P83A 3Q6YA 1W6IA 5P3DA 4DQHA 2V11C 3LPJA 5OZJA 4I0HA 5P6SA 5P67A 3R0YA 2P3DA 3ZKXA 2QI0A 3D3TA 1HVKA 5P5NA 3OXCA 5P07A 4Z50A 1EPLE 5P4BA 1EC0A 3OTSA 4Y6MA 2WJOA 1W6HA 2P4JA 1ZP8A 5P18A 5OZ5A 3U6AA 3Q4BA 5P2LA 5P59A 4J55A 4TVGA 2B8VA 3BVAA 5P4YA 3APPA 5HCOA 5P3JA 1NH0A 5P3YA 4EYRA 2FXDA 2F3EA 3ZKNA 1FQ6A 4HDBA 4XXSA 5OYYA 2OAHA 3KFPA 4DQGA 1LYAA 2AVSA 5DGUA 5KQFA 4AUCA 5P45A 4LC7A 5P85A 5P1TA 2P3BA 4LBTA 4RCDA 5P0TA 5P4SA 4CPQA 5OZKA 2QMFA 3RTHA 1OEWA 4Y57A 1RL8A 4RCFA 5T4SA 3DK1A 5SZ9A 4Y3WA 3PB5A 1W5WA 3L58A 3MXDA 3QBHA 4I1CA 2V10C 4J1EA 3FSMA 4JP9A 3CKRA 4GJ6A 1HVIA 3HW1A 4Y3DA 1HPXA 5P3BA 1ZPAA 5I70A 1LYBB 3CIDA 4YBIA 3O9LB 3FKTA 5P0QA 3S53A 5P3WA 2O4PA 5P15A 1K6CA 3TPPA 3CYXA 4Y3FA 3UFLA 2OHMA 5P5OA 4CPTA 5JFPA 1D4JA 4DH6A 3OADB 4CPUA 5P6MA 1GVUA 3NDTA 5OYZA 3T7XA 1YX9A 1SP5A 5P6VA 3PI0A 3R0WA 3SFCA 5ER1E 3B7VA 5JG1A 1TW7A 3VV7A 5P3FA 5OZ3A 3D1YA 5P8DA 2IKUA 3UDRA 1FG6C 5P7NA 5P2WA 4U7VA 5P2AA 5P2CA 3OWNA 5P5CA 1B5FA 3NYGA 5P4RA 3LINA 1HSHA 4OC6B 3SM1A 5P06A 5P2UA 5P5QA 4TRWA 1PROA 1HXWA 3Q70A 3S43B 5P25A 4K8SA 2Q5KA 2AOIA 4QJ7A 1XE6A 2IRZA 2QHYA 3SABA 2V16C 1QBSA 3LZYA 3PM4A 1FIVA 4Y5CA 2PSVA 5BS4A 4YOAA 1F34A 4DJQA 4EJKA 2AQUA 4RZ1A 4Y54A 5P8MA 1HPVA 3OQKA 5P8NA 2AZBA 5P74A 2ASIA 5AHCA 5OYQA 3KMYA 4Y3XA 4DJRA 3PSYA 1Z1RA 1PSAA 1BIMA 1YG9A 3ER5E 5P08A 2AOHA 2AIDA 5P41A 4XX3A 2FDPA 2ZJIA 2R5PA 3OK9A 1ZSRA 3PMYA 3LPIA 2QNPA 3FNTA 2OF0A 4RRSA 1SBGA 5TOLA 5P1ZA 5P7FA 2QNQA 4FGXA 4WTUA 5OZEA 5P8SA 3QBFA 5C9DA 6UPJA 4LAPA 5P28A 3I8WA 3RVIA 4XX4A 3S7MA 3CICA 2NNPA 5P40A 2OHPA 2OHSA 5IVTA 1BVEA 2WEBA 3EKQA 4Z4XA 5P7AA 4CMSA 3HAUA 2WF2A 3UDYA 5P3LA 2Q3KA 3S85A 3K1WA 4DUSA 4DV9A 4EHCA 3C9XA 5P1QA 2I4WA 3PBDA 1ODXA 4PEPA 4EJLA 3OOTA 2HS2A 4DPFA 1Z1HA 2ANLA 4YD3A 4RYGA 1ODWA 5P46A 4Y51A 4FLGA 4Y4EA 3RU1A 1W51A 4FM8A 1HSGA 2V0ZC 5P14A 5DQCA 5P5GA 3VF7A 4R5NA 4H3IA 5P0ZA 1IDAA 4Y3TA 5P1EA 3TL9A 3CKPA 4HE9A 2G69A 3GW5A 3KFNA 4KE0A 4Y5MA 1EPQE 2XFKA 2F8GA 2IKOA 3IXOA 5OZMA 5SY3A 2QZKA 5P02A 1W5VA 2AVVA 1ODYA 3KFSA 5OZDA 5ISKA 5P0EA 5DR8A 4Y36A 5P86A 3LITA 3VV6A 4RRNA 2BKTA 4Q1YA 4QJ8A 5P6EA 1SGUA 4OBGA 1K6TA 4WY1A 4YOBA 4GJ8A 5P5JA 4GYEA 3NXEA 5OZIA 4I0ZA 5AHBA 3EL5A 3EKPA 2AODA 2FNTA 5P13A 2RKFA 6FIVA 5P8RA 1A8GA 3H0BA 4L7HA 5P81A 5OZSA 4ZIPA 2F80A 1PPME 1LF3A 4PHVA 4D88A 5P1CA 4H3FA 2I4QA 3BGBA 1ZPKA 4AZYA 1W5XA 3EKWA 2FMBA 5OZBA 3T7PA 5P3CA 5P43A 4GZFA 4FSLA 3OU4A 2MIPA 3CIBA 2QHCA 3R4BA 2VJ7A 5P6UA 4E43A 3EC0A 5P7RA 1NPAA 1E82E 3UFNA 5P60A 2XFJA 5P5WA 3DV5A 1HTGA 4AA9A 3I7EA 3IXJA 4Y3YA 4FRKA 1YTHA 4GJ9A 1HVRA 1T6EX 4N00A 1YM2A 4Y3AA 3VLBA 1MEUA 2HB4A 1CMSA 5P8LA 3VSXA 5P7IA 3UDQA 4Y4UA 3EKTA 4Y3MA 2AZ9A 3OTYA 1ZLFA 5P65A 5P48A 5P7GA 3VCMA 5P4IA 5P23A 3QI1A 3UDHA 1MTBA 4J54A 1WKRA 5P0GA 3PMUA 3G6ZA 1FFFC 5P12A 5P7VA 5OZAA 2QZLA 4J1HA 4H1EA 3SLZA 4ZEAA 4ZPEA 4Y4WA 1FGCC 3ZOVA 1EBWA 4BEKA 1ZAPA 3OUAA 2AOEA 4H3JA 3GGXA 5P1AA 4Y5NA 1EPRE 1META 4F73A 5P2EA 4I0IA 4F75A 4QJAA 4DQBA 1AZ5A 2PK5A 3OHFA 5IVRA 5P5TA 5P6HA 5B18A 4OBZA 3NU5A 4Y58A 1T7KA 5HDVA 5P8QA 4J0TA 3TNEA 3PSGA 7HVPA 3UF3A 5P6FA 4Y5EA 5P5UA 5P7XA 5HU0A 2WEDA 1FQXA 4YDFA 5P0JA 4RYCA 5P4LA 5P1LA 2HM1A 3L5DA 2QI5A 4FS4A 4ZPFA 3BVBA 1FQ5A 4ER4E 4EQ0A 5OZ9A 4X2LA 4BFBA 3OGPA 2PWCA 5P3ZA 5P0SA 4QJ6A 1OEXA 3VFBA 3LZSA 1C6XA 2V13A 2G21A 1FB7A 3OUDB 3T6IA 5OYVA 3PRSA 5P61A 3TKWA 3KFRA 5OZVA 3UDKA 3IN4A 5P3MA 1JLDA 5P7TA 3QVIA 3ZKQA 3KM4A 5C9FA 4F76A 5P7LA 2P3AA 3DM6A 2FS4A 3FIVA 4EQJA 3KA2A 3OUBA 4I0GA 3L5FA 4FAFA 3DCRA 1EEDP 2Q15A 5P1BA 3O9IA 4COEA 5OZRA 1XL5A 3I25A 3IA9A 3R1GB 3UQUA 1MVPA 2BQVA 2VJ6A 2XYEA 4HZTA 3VG1A 1HRNA 5P2RA 1DP5A 2HIZA 1FMBA 1E80E 5P8BA 4GJCA 1PSOE 3VYEA 1GVTA 3PGIA 1BILA 2RSPA 2PH6A 3OY4A 5P8IA 3VV8A 4KUPA 2PMAA 1GVVA 5P57A 5OZTA 4A6BA 4Y53A 1G2KA 1BDLA 1ZBGA 5HU1A 1DMPA 5SXNA 3BUGA 4B0QA 3O9GA 1LF2A 3EM6A 2QAKA 5P6RA 4Y4BA 1AIDA 1GKTA 1UH9A 2PH8A 1BWAA 5P05A 2NPHA 5P6PA 1SH9A 5OZOA 2I1AA 3TOHA 1BV9A 1LF4A 1TSQA 3MSKA 5HDUA 5P5FA 4NKKA 3NU9A 1SGZA 3LIZA 5P17A 3SKGA 3NU3A 3DV1A 2J9JA 2QMGA 5P1FA 4OD9B 2QD7A 2ZHUA 3HAWA 3RSXA 3WZ6A 2BKSA 5P1PA 4JPEA 2FGVA 3MXEA 2JJIA 5HD0A 1APTE 2VNMA 3EBZA 2NXMA 5P1KA 5P8VA 2I4DA 4OBZB 4OBJA 3OAGB 2BJUA 4HLAA 3HLOA 1MIQA 5P6OA 2WF1A 5OYSA 3UHLA 3VF5A 5OZNA 1HSIA 3ZPUA 1HXBA 2WF0A 1FQ7A 1M43A 4J0ZA 1SMRA 3TLHA 5P0CA 1QDMA 5P8KA 5BWYA 3WZ7A 2AZ8A 5P4KA 4Y38A 5P1WA 5P3VA 1GNNA 3PVKA 3VF3A 2FGUA 4B1EA 4LP9A 5IVSA 5P70A 4ACXA 2UPJA 5AGZA 3IN3A 5I3VA 2QMPA 1C6ZA 3SA5A 4KB9A 3VYFA 1XDHA 5JODA 3EL4A 1FF0C 4ZSMA 5KOSA 1ZTZA 2QD8A 1APWE 5P8OA 4NJSA 1M4HA 5P24A 3K5DA 2HB3A 1IZIA 3K4VA 1N49A 3PSUA 4JECA 4RLDA 5OZ1A 3BGCA 5OZ4A 3RTMA 2APRA 1BXQA 5IE1A 3KYRA 4EPJA 1CZIE 1FMXA 4Y5PA 2VIYA 3BXSA 4EP3A 1MTRA 3PWRA 5IVQA 5P4FA 1B6PA 5DR7A 3NSHA 5P0MA 1B6LA 3CYWA 4B77A 3ZMGA 4L7GA 4Y4TA 2QP8A 5DQ5A 1RQ9A 3L38A 1TSUA 4JPCA 3O9AA 4Y4GA 1G6LA 5P55A 5P2YA 1A94A 5P7WA 3U7SA 1HIVA 3OQFA 3OUCA 4RVIA 4HA5A 3EKVA 5P0XA 1D4IA 3EL9A 4B05A 2QZWA 9HVPA 1HTEA 4APRE 4K4RA 3S45A 4L1AB 4OBFA 5P58A 3O9HA 5P1RA 3LIVA 3HD8A 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 2AVO A;  5P7M A;  5EZZ A;  3K5F A;  3QRO A;  4Y5K A;  5P10 A;  2O4N A;  2NXL A;  2VA6 A;  3EKX A;  5CON A;  4Y3Z A;  3SKF A;  4M8X A;  1PSN A;  4QGI A;  5HE5 A;  3SM2 A;  3MSJ A;  5PEP A;  2PYM A;  4Y48 A;  5P6L A;  2BPZ A;  1HEG E;  5KQZ A;  4Y37 A;  1HPS A;  2IDW A;  5P5A A;  4LXM A;  1FMU A;  4J0V A;  5P4Z A;  4J17 A;  3UQX A;  2R8N A;  5P2J A;  5P3O A;  2FDD A;  3RSV A;  5OZ0 A;  1KJ7 A;  3MWS A;  1U8G A;  2REN A;  2JJJ A;  2G1O A;  1MES A;  5I3W A;  1G0V A;  2FXE A;  5OZG A;  2G20 A;  2Z4O A;  3LZV A;  4M8Y A;  3EL0 A;  4Y4D A;  4R93 A;  3PJ6 A;  5P4J A;  5P4V A;  1LS5 A;  4D8C A;  5P72 A;  1HTF A;  3SA7 A;  5P5X A;  3HBO A;  5P1N A;  2I0A A;  5HCT A;  1HWR A;  1NPV A;  1YM4 A;  1EPN E;  4YHQ A;  1C6Y A;  3URI A;  3S54 A;  5P71 A;  7UPJ A;  3BUF A;  3TPR A;  5KR8 A;  3D1X A;  3GGV A;  2B7Z A;  4PZX A;  2BB9 A;  1VIJ A;  4KE1 A;  5P1I A;  4TRY A;  5P0O A;  3PI5 A;  5P30 A;  1MUI A;  4B72 A;  4DQC A;  2XYF A;  5P5M A;  2O40 A;  4Y3R A;  3OUD A;  5P7B A;  1AAQ A;  5P7K A;  1BDR A;  2ZHV A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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