2G1RA

Ketopiperazine-based renin inhibitors: optimization of the c ring
Total Genus 83
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
83
sequence length
333
structure length
333
Chain Sequence
SSVILTNYMDTQYYGEIGIGTPPQTFKVVFDTGSSNVWVPSSKCSRLYTACVYHKLFDASDSSSYKHNGTELTLRYSTGTVSGFLSQDIITVGGITVTQMFGEVTEMPALPFMLAEFDGVVGMGFIEQAIGRVTPIFDNIISQGVLKEDVFSFYYNRDSENSQSLGGQIVLGGSDPQHYEGNFHYINLIKTGVWQIQMKGVSVGSSTLLCEDGCLALVDTGASYISGSTSSIEKLMEALGAKKRLFDYVVKCNEGPTLPDISFHLGGKEYTLTSADYVFQESYSSKKLCTLAIHAMDIPPPTGPTWALGATFIRKFYTEFDRRNNRIGFALAR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Ketopiperazine-Based Renin Inhibitors: Optimization of the "C" Ring
pubmed doi rcsb
molecule keywords Renin
molecule tags Hydrolase
source organism Homo sapiens
total genus 83
structure length 333
sequence length 333
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.4.23.15: Renin.
pdb deposition date 2006-02-14

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00026 Asp Eukaryotic aspartyl protease
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.40.70.10 Mainly Beta Beta Barrel Cathepsin D, subunit A; domain 1 Acid Proteases 2g1rA02
2.40.70.10 Mainly Beta Beta Barrel Cathepsin D, subunit A; domain 1 Acid Proteases 2g1rA01
5P5AA 5P47A 2AVVA 2WHHA 1SGZA 5P5HA 1K6CA 3BXSA 5F00A 4L1AB 3VV6A 5P27A 5P0JA 1SIVA 4FM8A 2VIYA 4H3JA 2NNKA 2V10C 5P5DA 4PEPA 2FXDA 5P55A 5P1OA 4PHVA 2FMBA 1B6MA 5OZIA 4EYRA 2FDEA 1HTGA 3T7QA 3LITA 3QBFA 3UDJA 4RRNA 5P8BA 3EXOA 1NH0A 1YG9A 3G6ZA 1FF0C 2ZJNA 1EPOE 2QAKA 5P80A 2P3DA 5OZ0A 3LIQA 5P6MA 1VIJA 5HCOA 1G0VA 5P51A 5P4WA 2QU3A 2IGYA 1LYWB 3KDCA 5AH8A 1HPOA 1KJ7A 5P7ZA 1PPLE 2P8HA 3FSMA 5P3MA 3TOFA 1EEDP 2VKMA 5P1ZA 5OZYA 5P72A 5CLMA 3UF3A 5P2MA 3FNSA 1M43A 3AUPA 4AMTA 5P4NA 5P2YA 4F74A 4I0FA 1AJXA 3PBDA 4Y4UA 5P7RA 1HPVA 3I25A 4BELA 4WY1A 3PLLA 4OBZA 5P1PA 3HBOA 1W51A 5P3XA 5P78A 4YE3A 2CENA 5P2ZA 3SM1A 4QJ9A 5P5NA 3CIDA 4YD3A 2ZHSA 5P06A 1TZSA 3T7PA 4Y45A 2OHQA 5P1KA 1ZJ7A 3BUGA 2RMPA 2FLEA 4Y56A 5OZNA 3TL9A 1T7KA 5P0UA 3BUHA 4AA8A 5P7LA 1W5YA 2IQGA 5P5GA 1C6XA 5P39A 3VYEA 5P6RA 3U7SA 1HSGA 5P8DA 1HTRB 5P5WA 5P7EA 1HWRA 3KF0A 3VLAA 3O9FA 5P6XA 3SPKA 5P4AA 5DQ2A 5P5MA 2OAHA 1EPME 5P6LA 5P1MA 6UPJA 4FCOA 3IN4A 3NDXA 5P4CA 4Y4BA 4NJVA 3NDTA 3INEA 5JFUA 3UHLA 4PYVA 1EPNE 3O9IA 5P6EA 2NXLA 5P3WA 4Y3RA 2HB4A 5P4QA 5I70A 2BPXA 2QI4A 3CMSA 1XL2A 2AZ8A 2ZJJA 3OU4A 4DJPA 1EC2A 2ZHVA 4I0HA 3EM6A 5P3LA 3RVIA 4LAPA 5P0FA 5P0EA 1EC3A 5P3DA 3Q3TA 2JXRA 1KJGA 3PM4A 4J1HA 3EM4A 1FLHA 4Y4ZA 3NUOA 5P7AA 2QHCA 4J0YA 5P03A 3SA4A 3LHGA 1EBZA 3I8WA 3RU1A 1D4SA 3OXVA 4FLGA 4Y3YA 3OK9A 2BKTA 5P14A 3INDA 4DV9A 2QU2A 3FNUA 5P8JA 5P3EA 3LIXA 5P7PA 3QI1A 2PH8A 3VSXA 1MTBA 3PLDA 4KB9A 3BVAA 5P28A 3VCMA 4Y4EA 1E81E 3TKGA 4MC1A 3VV8A 5E5KA 2VNNA 3IN3A 3R2FA 5P0NA 4S1GA 1T6GA 5P05A 3ZLQA 1T7JA 2G26A 2ER7E 2G1YA 2OHRA 2AOEA 4I8WA 2V16C 3I7EA 5DR7A 4Y5EA 4FAEA 1RNEA 5P3QA 2O4NA 3NU5A 1MSMA 3FX5A 3G70A 3GGXA 4ER1E 1NPWA 2AODA 5P3OA 4RYCA 1MRWA 3MSKA 2BKSA 5F01A 4DVFA 2I4QA 3EL9A 5P1SA 3KM4A 1META 5P7JA 3PI5A 3DV5A 5P7MA 1MVPA 2WEDA 5P8QA 1ZPKA 4I0ZA 2A1EA 4Y3NA 1B5FA 4Y3AA 5P73A 2JJIA 2OHTA 1HVJA 5P6YA 4FSEA 4DJYA 3TOGA 3OADA 3VFAA 4OBZB 4HE9A 4APEA 2O4LA 2QI3A 5P53A 3UQPA 3EKTA 2HM1A 5DGWA 1M4HA 1D4KA 2B7ZA 1FFFC 3PSYA 5P4PA 3DUYA 1PSNA 1BBSA 5P6SA 4AZYA 4BEKA 2O40A 5SZ9A 3L5EA 4DQBA 5P36A 3R4BA 3BRAA 5P0BA 5P8NA 1ER8E 4DJWA 5HVPA 4GJDA 1CPIA 2WF2A 2I4XA 3QVIA 2JE4A 5P0MA 3LINA 3FNTA 3OTYA 2VNMA 3OQ7A 5P6CA 3CIBA 5P5TA 4U7VA 2Z54A 5P2GA 5T4SA 1YTGA 4Y5AA 1EPLE 1DMPA 3BHEA 3VF7A 1QDMA 3DV1A 3Q6YA 5SY2A 5P3ZA 3DOXA 5HDXA 2VS2A 4I12A 3PGIA 3OQKA 3KMYA 3SA8A 5ER2E 4L6BA 1ZSFA 1GNOA 3R0WA 1F7AA 5P44A 2MIPA 4FS4A 5P01A 4HEGA 1AJVA 1FGCC 5P0TA 1QBUA 3IA9A 1FIVA 5OZTA 3SLZA 2WF1A 2QD7A 5P4XA 4Y5PA 4J1KA 1FFIC 3CYWA 3L3AA 5AH9A 2AOGA 2I0DA 2QZKA 3D20A 1APUE 4Y35A 3RTNA 5P1IA 3SKFA 1T3RA 3OU4B 2BPYA 1HOSA 2FNSA 2G1OA 4Q5MA 1AAQA 1GVWA 1EC0A 5P5PA 3VF3A 5P00A 3R1GB 5P6QA 1BAIA 5P7HA 3NXEA 5P5UA 5P0AA 2IDWA 4TVGA 4I0DA 5P83A 3ZOVA 4Y4JA 4YCYA 1AVFA 4FRIA 3K5DA 5P16A 1XE5A 5P6FA 3O9GA 2CEJA 3EMYA 3PCWA 1MT7A 3OOZA 3WZ6A 1TCWA 5P0DA 3ZKSA 2QD6A 2OHMA 3EM3A 1ZPAA 1FMUA 2G27A 5JG1A 4ZPEA 4Y47A 3VLBA 3IXKA 2BPZA 3HAUA 5P67A 3TPJA 5P40A 4Y58A 3EL1A 1HEFE 1GNNA 5P69A 5P09A 3ZKNA 4RROA 5HD0A 3NLSA 2WKZA 1IZIA 3K5GA 5P3IA 1ENTE 1RL8A 3NU9A 5OYRA 3NU3A 5OYVA 4B00A 4OD9A 5P71A 3EKPA 2AOFA 3H5BA 2PSGA 2ZE1A 5P35A 4QJ2A 4D85A 2QI0A 4Z50A 4Y3XA 3UDNA 3OUCA 1FQ7A 2VJ7A 5P8RA 4DJQA 5P0IA 5P52A 5P2DA 2B8LA 4Y3TA 4LP9A 4RYGA 1LYBA 4J1EA 1HIIA 4KUPA 3G72A 5P2VA 5AGZA 1HVIA 2WF3A 4DPIA 4K4QA 3TLHA 4Y5LA 1A8GA 1ME6A 5P07A 1IDAA 4Y5NA 4YHQA 3ER5E 2XFIA 3CKRA 3C9XA 3ZKMA 2JJJA 4NPUA 3OHHA 4R92A 4DFGA 5P6AA 4ZSRA 2ZHRA 3QRVA 1HVLA 2PWRA 2VA5A 5P5IA 1FQ5A 5P0PA 2RKFA 4R95A 3RSVA 4X7IA 1FMBA 4Y4DA 1F34A 4Q1XA 4I10A 5P5YA 2AVQA 5P0HA 5P4VA 2F3EA 4DQFA 4RVXA 3PWRA 2R3WA 5P8UA 3S43A 2XYFA 5KQFA 4L7JA 5P5KA 3S2OA 3LZSA 5OZ6A 2F3KA 4Y3LA 2QMFA 1KJFA 1PPME 4HVPA 1FKNA 2AZ9A 5P49A 3O9DA 4COEA 1SMRA 5P0OA 4D88A 4D83A 3WSJA 5P1EA 2G1RA 4RCFA 5P0CA 1TCXA 5P5SA 3O9AA 3OWNA 2PC0A 4LC7A 3OAGB 1LF2A 4FIVA 4DJOA 3L5BA 5P2UA 1WKRA 3GI4A 5DR3A 4J0VA 5P4RA 3EKWA 5P22A 3AIDA 5P68A 5KOQA 2P4JA 1ZLFA 3KFSA 4Y39A 5B18A 4MC2A 5P6NA 5OZSA 2RSPA 2AZBA 3U6AA 4WTUA 4GJ6A 2BBBA 5P6ZA 2O4PA 4HDFA 4R91A 1BDQA 3ZPUA 1TQFA 2QHYA 5P60A 5P2EA 5P6PA 2P83A 1XE6A 4GJCA 3SFCA 3L5FA 5P5EA 4A6CA 1TSUA 2ZDZA 3RTHA 2UPJA 4DQHA 4WY6A 4Y3ZA 3EC0A 4FE6A 4U7QA 1AXAA 2NXMA 2OHUA 1BDLA 5P4YA 5OZMA 5KQZA 4JOOA 4YD6A 1BXQA 5P3PA 5OZHA 5P7UA 1TW7A 4J17A 1MTRA 4EHCA 1MIQA 3GI5A 2ZJLA 3DJKA 3IVHA 3NYGA 1UH8A 4ACXA 1OEXA 4Y3JA 4ZE6A 4EP2A 5P8PA 5P08A 4OD9B 1HHPA 3EKXA 4RLDA 3F9QA 4QJ8A 1J71A 3B80A 5P0LA 3KN0A 5P19A 5P8FA 1D4HA 4DH6A 3UTLA 2JYSA 5P12A 3TNEA 3IGBA 5P4BA 5JODA 4CPXA 1D4YA 1E80E 3CICA 3T11A 2IGXA 2ZHUA 3IXJA 4B1DA 2QHZA 1SDUA 1LYBB 3K4VC 5P8CA 3ST5A 3ZPTA 2WJOA 2HPFA 5P2OA 7HVPA 3UCBA 2J9JA 3OGPA 1FEJC 4Y43A 4RVIA 4LXKA 5ENMA 3VSWA 3QPJA 3K4VA 2R38A 3UQXA 2I4VA 5P85A 3K1WA 5OYSA 1GVVA 2FNTA 4HDBA 4Y6MA 3VEUA 3ZMGA 3SABA 3VFBA 2OHKA 3UDQA 4DQGA 5OZCA 1HEGE 2PYNA 3OUDA 2AVSA 4NJSA 1EC1A 5OZBA 4Y5CA 5P2NA 1E82E 3B7VA 5P2HA 5P2QA 2WEAA 4H3IA 3EBZA 4OBGA 1B6JA 1DPJA 4EXHA 5P4LA 3S43B 5P6JA 3R0YA 4I0JA 5OZ7A 1LF3A 5P7DA 4CMSA 1GVTA 2BQVA 3TPRA 2PSVA 4AUCA 2RKGA 4XKXA 4ACUA 4Y50A 2Q63A 4H3FA 4APRE 5P7WA 5KR1A 3TPLA 5P1VA 1Z1HA 3ZKQA 1K1TA 4Q1WA 4TRYA 3LPIA 2PSUA 3BGCA 5OZPA 1OHRA 4EJKA 3I6OA 5P74A 4Y48A 4EQJA 2NMYA 3GI0A 4GZFA 2NXDA 1AZ5A 3CKTA 3Q70A 2ZHTA 5P0SA 5P5JA 5P8KA 2PMAA 5IVQA 1GVUA 3PJ6A 4OBFA 4E43A 5P7SA 1VIKA 5P02A 1C6YA 2PWCA 5P4MA 1LEEA 2HB2A 5P3KA 3OTSA 5P1RA 5P1FA 3L58A 3HDKA 2FGVA 4K4RA 1FQ8A 5HDUA 2Q64A 1HVRA 5P3GA 2ER6E 4CPSA 2VJ9A 4Y4GA 2HB3A 2F8GA 2FDDA 5OYXA 1YTHA 5AH7A 2H6SA 5P24A 2B8VA 1BXOA 5P3JA 4FSLA 4KE0A 4DQCA 5P3NA 3UDPA 2B42A 5P3TA 2XFJA 3OXXA 3EL4A 5P1QA 5P70A 3BVBA 5P0XA 2UXZA 3T6IA 1BV7A 3GGVA 2QI6A 1SDTA 1E5OE 3MXEA 1SIPA 4Y3MA 5HE5A 2G1SA 1FMXA 5P7BA 4J55A 4Y5KA 4Y3PA 1IZEA 5P4JA 3DK1A 2HIZA 2V11C 5P0ZA 1HPXA 3PVKA 4GJ9A 4FM6A 4YDGA 4FRSA 3HAWA 1EPPE 2OHNA 4TRZA 2OHPA 3URIA 2Z4OA 4JP9A 1A94A 4F73A 1HVCA 1G2KA 5P5BA 4A4QA 4OBJA 1EBKC 4J0PA 4Y3WA 3OUBA 5P8GA 4Y5GA 4I8ZA 4I0EA 5P6TA 3KA2A 5P18A 2V0ZC 3HW1A 4HA5A 5HE4A 5P3RA 2ZGAA 2O4SA 5P7TA 3OHFA 1HPSA 5P6BA 2J9JB 1K6TA 4OBDA 3UQUA 5IE1A 4XX4A 2FDPA 5OZ2A 4RCDA 5TOLA 2QK5A 4MC6A 4U8WA 4CPRA 4JPCA 5P5LA 2HS2A 5E5JA 2I0AA 5OZ4A 3HZCA 3QAAA 4GJ7A 1SGUA 4FRJA 1BV9A 4J0TA 1BIMA 1YM2A 2IL2A 2NMZA 3OUDB 3PCZA 2G69A 1N49A 2QD8A 3UQRA 4R93A 3QVCA 4FAFA 3LZVA 5P88A 2WF4A 1G6LA 1QS8A 3QIHA 2I1AA 1MRXA 5P4GA 4Y3EA 1IVPA 4Y3QA 1MERA 4D8CA 1DW6C 5OZGA 2AOIA 5P84A 3ZPSA 1RQ9A 3QBHA 5COOA 5P7QA 2R3TA 3U71A 2F80A 2WF0A 3EKVA 5P5OA 3TPPA 1NSOA 5P6HA 3KDDA 5HE7A 5P2TA 4EQ0A 3NDWA 1UPJA 1UH7A 4YA8A 5P8OA 3OAGA 4EXGA 5OZLA 1SMEA 2AQUA 2ZYEA 3VG1A 1LF4A 3S54A 2AVOA 3ECGA 5ENKA 2IKUA 5P2FA 3LZUA 4FGXA 5P6UA 3TKWA 4NPTA 4B1CA 5P4FA 2PYMA 2ZJHA 5P4OA 1BWBA 1PSOE 4NKKA 3OQDA 4EP3A 1B6KA 5C9DA 3QRSA 4EPJA 1XN3A 3QS1A 3ZKXA 3UDMA 1APWE 1PFZA 3NU6A 3O9LB 5P8EA 5I3XA 4GJBA 4DJVA 3SA3A 3L5CA 4F75A 5P5VA 4Y3DA 1GNMA 3PWMA 1YX9A 4YOAA 5P89A 1PSAA 3PRSA 3LNKA 4RRSA 1HIVA 4BFBA 3PBZA 3N4LA 2ER9E 6APRE 1YT9A 1HXWA 5P48A 5HTZA 4K8SA 4B1EA 5APRE 2VA7A 5P81A 4YD5A 3WB5A 5P50A 2XYEA 2UY0A 3CYXA 1B6LA 1HIHA 2PH6A 1UH9A 1BVEA 1XN2A 1CMSA 2ER0E 3S8IA 2G21A 4B70A 5P30A 5P8IA 3IAWA 5IVRA 4FM7A 1QRPE 5DQ4A 2HS1A 5I3VA 5P0RA 2QNNA 2A4FA 3GW5A 5P2RA 1IZDA 5SY3A 3T7XA 3JVWA 2OHLA 5EZXA 3O99A 9HVPA 4I11A 4Y4AA 2OHSA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 5P5A A;  5P47 A;  2AVV A;  2WHH A;  1SGZ A;  5P5H A;  1K6C A;  3BXS A;  5F00 A;  4L1A B;  3VV6 A;  5P27 A;  5P0J A;  1SIV A;  4FM8 A;  2VIY A;  4H3J A;  2NNK A;  2V10 C;  5P5D A;  4PEP A;  2FXD A;  5P55 A;  5P1O A;  4PHV A;  2FMB A;  1B6M A;  5OZI A;  4EYR A;  2FDE A;  1HTG A;  3T7Q A;  3LIT A;  3QBF A;  3UDJ A;  4RRN A;  5P8B A;  3EXO A;  1NH0 A;  1YG9 A;  3G6Z A;  1FF0 C;  2ZJN A;  1EPO E;  2QAK A;  5P80 A;  2P3D A;  5OZ0 A;  3LIQ A;  5P6M A;  1VIJ A;  5HCO A;  1G0V A;  5P51 A;  5P4W A;  2QU3 A;  2IGY A;  1LYW B;  3KDC A;  5AH8 A;  1HPO A;  1KJ7 A;  5P7Z A;  1PPL E;  2P8H A;  3FSM A;  5P3M A;  3TOF A;  1EED P;  2VKM A;  5P1Z A;  5OZY A;  5P72 A;  5CLM A;  3UF3 A;  5P2M A;  3FNS A;  1M43 A;  3AUP A;  4AMT A;  5P4N A;  5P2Y A;  4F74 A;  4I0F A;  1AJX A;  3PBD A;  4Y4U A;  5P7R A;  1HPV A;  3I25 A;  4BEL A;  4WY1 A;  3PLL A;  4OBZ A;  5P1P A;  3HBO A;  1W51 A;  5P3X A;  5P78 A;  4YE3 A;  2CEN A;  5P2Z A;  3SM1 A;  4QJ9 A;  5P5N A;  3CID A;  4YD3 A;  2ZHS A;  5P06 A;  1TZS A;  3T7P A;  4Y45 A;  2OHQ A;  5P1K A;  1ZJ7 A;  3BUG A;  2RMP A;  2FLE A;  4Y56 A;  5OZN A;  3TL9 A;  1T7K A;  5P0U A;  3BUH A;  4AA8 A;  5P7L A;  1W5Y A;  2IQG A;  5P5G A;  1C6X A;  5P39 A;  3VYE A;  5P6R A;  3U7S A;  1HSG A;  5P8D A;  1HTR B;  5P5W A;  5P7E A;  1HWR A;  3KF0 A;  3VLA A;  3O9F A;  5P6X A;  3SPK A;  5P4A A;  5DQ2 A;  5P5M A;  2OAH A;  1EPM E;  5P6L A;  5P1M A;  6UPJ A;  4FCO A;  3IN4 A;  3NDX A;  5P4C A;  4Y4B A;  4NJV A;  3NDT A;  3INE A;  5JFU A;  3UHL A;  4PYV A;  1EPN E;  3O9I A;  5P6E A;  2NXL A;  5P3W A;  4Y3R A;  2HB4 A;  5P4Q A;  5I70 A;  2BPX A;  2QI4 A;  3CMS A;  1XL2 A;  2AZ8 A;  2ZJJ A;  3OU4 A;  4DJP A;  1EC2 A;  2ZHV A;  4I0H A;  3EM6 A;  5P3L A;  3RVI A;  4LAP A;  5P0F A;  5P0E A;  1EC3 A;  5P3D A;  3Q3T A;  2JXR A;  1KJG A;  3PM4 A;  4J1H A;  3EM4 A;  1FLH A;  4Y4Z A;  3NUO A;  5P7A A;  2QHC A;  4J0Y A;  5P03 A;  3SA4 A;  3LHG A;  1EBZ A;  3I8W A;  3RU1 A;  1D4S A;  3OXV A;  4FLG A;  4Y3Y A;  3OK9 A;  2BKT A;  5P14 A;  3IND A;  4DV9 A;  2QU2 A;  3FNU A;  5P8J A;  5P3E A;  3LIX A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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