2G1SA

Ketopiperazine-based renin inhibitors: optimization of the c ring
Total Genus 84
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
84
sequence length
333
structure length
333
Chain Sequence
SSVILTNYMDTQYYGEIGIGTPPQTFKVVFDTGSSNVWVPSSKCSRLYTACVYHKLFDASDSSSYKHNGTELTLRYSTGTVSGFLSQDIITVGGITVTQMFGEVTEMPALPFMLAEFDGVVGMGFIEQAIGRVTPIFDNIISQGVLKEDVFSFYYNRDSENSQSLGGQIVLGGSDPQHYEGNFHYINLIKTGVWQIQMKGVSVGSSTLLCEDGCLALVDTGASYISGSTSSIEKLMEALGAKKRLFDYVVKCNEGPTLPDISFHLGGKEYTLTSADYVFQESYSSKKLCTLAIHAMDIPPPTGPTWALGATFIRKFYTEFDRRNNRIGFALAR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Ketopiperazine-Based Renin Inhibitors: Optimization of the "C" Ring
pubmed doi rcsb
molecule keywords Renin
molecule tags Hydrolase
source organism Homo sapiens
total genus 84
structure length 333
sequence length 333
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.4.23.15: Renin.
pdb deposition date 2006-02-14

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00026 Asp Eukaryotic aspartyl protease
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.40.70.10 Mainly Beta Beta Barrel Cathepsin D, subunit A; domain 1 Acid Proteases 2g1sA02
2.40.70.10 Mainly Beta Beta Barrel Cathepsin D, subunit A; domain 1 Acid Proteases 2g1sA01
2NMYA 5KR2A 3NXNA 4EYRA 5P14A 1BWBA 1HIHA 5P8TA 4GJ7A 3HW1A 4I0ZA 1IZIA 2WL0A 4R95A 2UPJA 1HVHA 1EEDP 3CIDA 3S45A 2UY0A 3BUHA 2QK5A 3AUPA 4J5JA 2BPXA 4I11A 1K6PA 2HPFA 3NDWA 2G24A 5P85A 1HTFA 5OZ9A 5P7SA 3TH9A 5P3MA 1C6YA 3BGCA 3UDHA 2QHCA 3DCRA 2Q63A 5P3NA 3MSKA 5P3ZA 4CP7A 5P35A 2AQUA 1ODXA 3ZMGA 5P72A 5P0XA 4ACUA 2J9KA 4Y50A 5P4FA 1UH7A 2VNMA 5P0GA 2WEDA 4GB2A 5COKA 4D83A 5P3LA 2IGXA 3DM6A 5OZSA 3UDKA 1FFFC 4B00A 5P4XA 1META 5P16A 3PRSA 3R0YA 1AAQA 2IKOA 3T11A 1SBGA 4CMSA 4PPHA 5P7LA 1AIDA 4QJAA 2HC0A 3HDKA 5SXNA 1CPIA 1YX9A 4ZPFA 1HVIA 1EPRE 4DQGA 3OUBA 3F9QA 2NXMA 2PYMA 4CPQA 5OZ8A 4Y4BA 1XE5A 5P0CA 4DJVA 4Y4TA 3OGQA 5P5MA 1WBKA 1FMXA 4HZTA 3OU3A 1QBRA 5ER2E 1G35A 1WKRA 5P2GA 1ENTE 4X2LA 1MIQA 5P4TA 1RPIA 4DJOA 1GVTA 4Y4WA 1GVXA 1ZPAA 5P02A 3D3TA 3K5DA 3TOHA 3GGAA 4ACXA 4H3IA 5P7WA 1SP5A 1XN3A 2PC0A 3KA2A 5P88A 5JODA 3OQKA 2QI4A 4ZPGA 3VSWA 3VV6A 2F80A 5P31A 5EZXA 2AOGA 1XL2A 5P63A 5P12A 4YD5A 2V12C 5P0WA 4Y43A 2R38A 5P23A 4ZSMA 1YTJA 2NNPA 2OHPA 5P54A 3SACA 5P7FA 2AOEA 3ZOVA 2OHUA 5HDVA 4NJSA 2FDEA 3VYDA 5J25A 2ZYEA 1EC1A 3ZKMA 1DAZC 5P3HA 4GJ8A 5P15A 5P4YA 3TPPA 3OTYA 2ZHRA 5P6KA 3CYXA 4ZLSA 2XFIA 1AXAA 4Y3TA 3QAAA 3HBOA 4YD6A 4Y5PA 5P51A 2ZGAA 5P7EA 2PSGA 5ER1E 5P03A 4I0HA 4BFBA 4DQBA 3PWMA 5P0BA 3SQFA 4XX3A 4J54A 3NU3A 4OBFA 2IENA 4L7HA 5KQFA 2QCIA 3IXOA 1IZHA 1TZSA 4U8WA 4CPXA 5OYTA 5P81A 1DW6C 1TQFA 3SA8A 3QVIA 1GNNA 1SIVA 3FX5A 3TPLA 5P4IA 1TW7A 1KJFA 2Q15A 2ANLA 5FIVA 2IRZA 3BUFA 4Y4ZA 4FIVA 4Y3LA 3ZPTA 3MSLA 5P1VA 5P6HA 4RCDA 5P30A 4Y56A 3EL0A 6UPJA 4DPIA 3O9BA 5P43A 4D85A 5P1QA 1YG9A 1YTHA 2QMDA 1AM5A 1FKNA 2JJIA 5KQXA 2UXZA 5P36A 2P83A 4ER2E 1B11A 4MC6A 5BRYA 3OU1A 3OQFA 4RZ1A 5P6GA 1G2KA 5P3CA 3LIVA 5TOLA 4Y45A 1HXBA 2HS1A 3KFPA 5HCOA 1TCXA 2AIDA 4BELA 4GJ9A 2OHSA 5P8FA 2V00A 1MUIA 1A8GA 5P8JA 2R9BA 5P4OA 4Y3SA 1A94A 1QRPE 5P0FA 1HTGA 5P7YA 4J1EA 3ZKXA 3QRSA 1J71A 1MT8A 1CZIE 4EXHA 1T6GA 3K4VA 3NXEA 2BJUA 4Y4JA 2BPYA 3D1YA 4FE6A 4Y3QA 5P6OA 3VF3A 1HVLA 1PSNA 1A30A 5P1KA 4DJPA 1XDHA 1A9MA 5P3XA 5P5PA 5P5WA 3DV5A 3UDQA 1HXWA 3NDTA 5OZ6A 1LYBA 3D1ZA 1B6KA 1B6LA 5P7RA 5P0YA 5P8PA 4Y4EA 5P1SA 1BV7A 5P33A 1BWAA 3NU6A 3ST5A 2VJ9A 4OBZA 5P5XA 1TCWA 2B8LA 2SAMA 5KOSA 2G1NA 2FMBA 5JG1A 1OHRA 2WF1A 3RTMA 4TRYA 5P11A 5P0TA 4I0EA 3RTHA 1W5WA 2A4FA 5P38A 1K2CA 3UDJA 1GKTA 3QP0A 4NJVA 3TOFA 4JP9A 1W5YA 2IGYA 1SGZA 2F3KA 4YA8A 2VA5A 3OXVA 3O9IA 4EJDA 5OZOA 3U71A 5P7NA 1MPPA 3URJA 2FNSA 5P5EA 5HE5A 5JFUA 5HDXA 2NNKA 2R43A 5P8MA 5P2KA 5P47A 5C9DA 2RKGA 4I0IA 5P52A 1B6PA 4Y4UA 2ZDZA 2BPVA 4RVIA 1SMEA 2OHLA 2BQVA 5P8IA 3OQAA 4LC7A 3OUCA 5C9BA 3BVBA 5P7JA 2WEZA 3SFCA 5P1IA 5P2VA 4Y3MA 2WEBA 4IVTA 2O4PA 1ZAPA 1KZKA 5P2EA 5OZZA 4RCFA 2CEJA 2HB2A 4Y35A 4B0QA 2G21A 3A2OA 3OK9A 2G22A 5P13A 3CICA 4Y4XA 3NU9A 2XYFA 3VCMA 3KFRA 3M9FA 5OZIA 3RSXA 2B60A 3WZ8A 5P29A 2QMFA 2P3BA 4DJRA 3NUJA 3K5FA 3VLBA 3NDXA 3SA7A 1W51A 4HDBA 4WY6A 4GJAA 5P4NA 4F76A 3S8IA 4I10A 4EP2A 3QVCA 2QI7A 1FMBA 5P25A 1HPOA 5P0UA 1MTBA 1PPME 3NWXA 4H3FA 2AOHA 3OU1B 2AODA 1QBTA 5P6JA 3QRMA 3UQPA 4R91A 5P3SA 5P0HA 5I3YA 4Y3GA 3KF0A 4Y37A 5P1DA 1T7IA 3KM4A 1BIMA 2ZHUA 1PSOE 3PM4A 3QRVA 1F34A 5P0IA 4L7GA 4UPJA 5AH9A 3EKXA 3IVIA 5P7PA 1K2BA 2WECA 1ZTZA 5P5QA 2G1YA 2AOIA 5P87A 4GIDA 1PROA 5AGZA 4BEKA 3QBHA 5P64A 2QNPA 3UF3A 3Q4BA 2OHTA 5HCTA 2R8NA 5P2FA 5P8HA 4PZXA 2OHNA 3FIVA 4JECA 5OYRA 3L58A 3EL4A 5P71A 3NU4A 5IVRA 1EBWA 5P2DA 5OYSA 3I8WA 4I0FA 3L38A 3SA9A 5P0DA 2B8VA 2IKUA 4R92A 1BXOA 1FQ6A 3SPKA 1LYBB 4Y51A 3UDPA 3G6ZA 3QS1A 1Z1HA 5P3KA 1EPLE 3WZ6A 2OHKA 4DQEA 3KMXA 2I0DA 4OBZB 3JW2A 5OZEA 3K5GA 5OYQA 1ZJ7A 4KUPA 1BDQA 5KAOA 1YTGA 1LV1A 4K8SA 4K9HA 4Q1YA 5P3JA 3MSJA 5OZDA 4Y38A 5OZXA 1SDVA 3WB4A 3INEA 2OHQA 4Y3JA 3LITA 3K5CA 2G26A 4MC1A 5P5KA 5HE4A 5P1RA 5P0QA 5P1OA 3PMYA 1HWRA 5P86A 3FV3A 5P5NA 3ZPUA 3UQUA 1IIQA 5P8VA 5P7QA 5P7MA 4DUSA 1ZSRA 4JPCA 3PB5A 5P2UA 3I7EA 4Y47A 5P2NA 4RLDA 1SGUA 4L1AA 5P8RA 3OADA 2P3DA 4Y39A 4FAFA 2BKSA 1YM4A 3NYGA 5P2MA 4Y5LA 5P4EA 5SY2A 5P4PA 3GI0A 3GW5A 1M4HA 5P6PA 4YDGA 4Y4AA 2IEOA 5P6XA 1MT9A 3DK1A 3JVYA 2IL2A 3IN4A 5P3GA 4GJ5A 5P7DA 4J55A 3L3AA 5AHAA 3GI6A 4Z4XA 2AVVA 5P1HA 1XN2A 4K4PA 3S7LA 2QZLA 5P1AA 4KE0A 3S54A 4DJXA 1HVRA 1BBSA 4EJ8A 2MIPA 1NPAA 4J0TA 2P3BB 4Z50A 1IZDA 3R4BA 5OZRA 5P0NA 4DQFA 4OBDA 1FF0C 5P5RA 2FGUA 2I0AA 3APRE 4RRNA 5ISKA 4DI2A 4GZFA 1D4LA 3LIXA 4FS4A 1HVCA 3NR6A 5P0LA 3OU4A 4Y5EA 5P5UA 3LZSA 3K1WA 5P8LA 1IVPA 2Q55A 5P58A 3NUOA 4ZSQA 5F00A 4H3GA 5P2HA 1XL5A 2RENA 3IAWA 3PLLA 4B70A 4JPEA 5OYUA 1FQXA 5P80A 1QBSA 2F3EA 5ENMA 4Y4DA 3PWWA 3H0BA 3JVWA 3SA4A 4DQCA 5P4KA 4Y5CA 1BV9A 2P8HA 5P4DA 5I3WA 3EM4A 5KQYA 3K4VC 5I3XA 4EPJA 1DPJA 4Y3ZA 2G94A 5P10A 4FL8A 5P1FA 4HDFA 1SH9A 5OZBA 3R2FA 3SM2A 2VIEA 5P2WA 4RROA 5P2ZA 3LINA 4DJUA 3OAGA 5P6WA 4EQ0A 3ZLQA 2AOFA 5P8BA 1RNEA 4Y5AA 5OZKA 5P67A 5CONA 5P3PA 4FSLA 1IZEA 3AIDA 5HVPA 1W5XA 5P7ZA 2PYNA 2VKMA 1RL8A 5I70A 5OYXA 3OOTA 2QU3A 1D4SA 1AZ5A 3EM6A 1ME6A 5P3VA 5SZ9A 2QD8A 1AJVA 1MESA 5P06A 3KDDA 5IVSA 1K6VA 2I1AA 3GGUA 4Y9WA 5KQZA 1TSUA 1KJHA 1QS8A 2AZBA 5P6EA 3RSVA 4TRZA 2XYEA 5P59A 1E80E 5P4RA 3LPKA 1HTEA 3SLZA 3D1XA 5P6RA 3T6IA 5P00A 4JOOA 4L1AB 2ER9E 5OYWA 3OADB 1EC3A 5P4BA 5P5OA 5P1CA 5P3IA 5E5KA 2AVOA 1FLHA 3GGXA 3NWQA 4DH6A 2QHZA 5P78A 1B6JA 3BVAA 3LNKA 3TOGA 2RSPA 3I6OA 2VJ7A 4YD3A 3EL5A 3O99A 5OZGA 3BC4A 5P6TA 1HRNA 3LZYA 5AHBA 5P6LA 5DR3A 3IA9A 2BKTA 5P46A 4RVXA 2O4LA 3BXRA 5P6MA 2NXLA 1U8GA 1FIVA 4HE9A 5P48A 1IDAA 5OZHA 3TNEA 1HPVA 5P0KA 2HB4A 3TKWA 1EPME 4GJBA 5P1NA 3VUCA 1MSMA 1MVPA 2HPEA 3DOXA 1RQ9A 4EJLA 3MXDA 1ZLFA 5P37A 3WB5A 5P3QA 1EPQE 2ER7E 1ODYA 2VIJA 5P3DA 2BBBA 4QJ9A 5P2SA 5OZLA 1NSOA 3OU4B 4YDFA 4DPFA 3IVHA 3PGIA 3DUYA 2CENA 5P75A 4LXAA 4CKUA 4HDPA 1HSIA 3EXOA 5OZ3A 2JE4A 4J1FA 2B42A 1AJXA 3QPJA 5AH7A 3KDCA 4EP3A 5F01A 3PMUA 5P8SA 3OY4A 4RGHA 3O9GA 4OC6A 3MXEA 5KR8A 3N3IA 5IS4A 4FM7A 3BGBA 5P7IA 2Q54A 3QI1A 5CLMA 5COOA 2IDWA 3PCWA 4YOBA 1MTRA 2FXDA 3PJ6A 2V16C 3EKVA 4HA5A 3LHGA 1IBQA 5T4SA 5P2YA 5P8EA 3S43A 2Q5KA 1G6LA 1BVGA 5P0SA 3C9XA 5OZYA 2F3FA 4MC2A 5P68A 4Q1XA 3FNSA 3ER5E 4TRWA 5P6NA 3OAGB 5P28A 5I3VA 5P2OA 2PQZA 5P6QA 3T7QA 5P4AA 1XS7D 4NPUA 5P0PA 4Y3YA 3URIA 6FIVA 5DQ1A 3BUGA 5P4SA 4KB9A 4I1CA 3SM1A 5P4ZA 1MERA 1PSAA 3BRAA 2I4QA 3QN8A 3BHEA 4M8XA 4MC9A 4GJDA 2HB3A 3CKTA 2QI1A 1MEUA 2WF2A 2AZ8A 3O9AA 4ZSPA 4Z22A 3U7SA 5P2CA 4PHVA 3TLHA 1FFIC 5P6CA 2ER6E 3ZPSA 4B78A 3SA5A 2P3AA 1LS5A 4OBJA 4APEA 1BXQA 5P7AA 1UPJA 4NJUA 3R0WA 3NLSA 4HVPA 1LYWA 4J0ZA 5P4MA 3CIBA 5P66A 1FEJC 1BVEA 3OXWA 3O9CA 1APUE 4YBIA 4NJTA 2H6SA 2WF3A 4RVJA 1D4KA 5P5SA 2JJJA 4U7VA 2VJ6A 3O9HA 4Y48A 1T7JA 3OHFA 3QBFA 2QMPA 5P8AA 4J1HA 4YE3A 5P1ZA 5P8NA 1HEFE 3OOZA 5APRE 3Q5HA 1GVVA 1T3RA 3L5DA 4Y3RA 3WZ7A 3PSYA 3OUDA 4Y4GA 3IN3A 5HU0A 3ZKNA 8HVPA 1Q9PA 5OZ4A 3ZKQA 4ZIPA 1KJ4A 4FAEA 1SDTA 3S2OA 5P7OA 5P04A 5P49A 4ZEAA 2ZHSA 4OBKA 5HE7A 4EXGA 5BWYA 2PSVA 4CPUA 5OYZA 2QI6A 5P7UA 3UQWA 3UPJA 2VA7A 4IVSA 5DPZA 5P6UA 2R3TA 5P0EA 5P7BA 4GJ6A 9HVPA 5P40A 5P4CA 5P5HA 4OC6B 3UQRA 1HEGE 3L5FA 3INHA 4Q1WA 4Y3HA 4QJ7A 5OZJA 1MRXA 5P1GA 1LEEA 1EBKC 5P4WA 3SABA 3FNUA 2B7FA 4LXKA 1M0BA 5DQ5A 2AVSA 3IXKA 1D4HA 3RTNA 5P50A 3DCKA 5COPA 4Y3PA 1EPPE 4GYEA 1TSQA 5SY3A 2J9JA 2R5QA 3S43B 1OD1A 1T7KA 3KDBA 3TPRA 3UTLA 5P74A 4ZE6A 2NPHA 1E81E 2Q3KA 1D4IA 1MRWA 2WKZA 3L59A 1OEXA 5P3YA 5IE1A 1CMSA 3I2LA 2NXDA 4B72A 5P2XA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 2NMY A;  5KR2 A;  3NXN A;  4EYR A;  5P14 A;  1BWB A;  1HIH A;  5P8T A;  4GJ7 A;  3HW1 A;  4I0Z A;  1IZI A;  2WL0 A;  4R95 A;  2UPJ A;  1HVH A;  1EED P;  3CID A;  3S45 A;  2UY0 A;  3BUH A;  2QK5 A;  3AUP A;  4J5J A;  2BPX A;  4I11 A;  1K6P A;  2HPF A;  3NDW A;  2G24 A;  5P85 A;  1HTF A;  5OZ9 A;  5P7S A;  3TH9 A;  5P3M A;  1C6Y A;  3BGC A;  3UDH A;  2QHC A;  3DCR A;  2Q63 A;  5P3N A;  3MSK A;  5P3Z A;  4CP7 A;  5P35 A;  2AQU A;  1ODX A;  3ZMG A;  5P72 A;  5P0X A;  4ACU A;  2J9K A;  4Y50 A;  5P4F A;  1UH7 A;  2VNM A;  5P0G A;  2WED A;  4GB2 A;  5COK A;  4D83 A;  5P3L A;  2IGX A;  3DM6 A;  5OZS A;  3UDK A;  1FFF C;  4B00 A;  5P4X A;  1MET A;  5P16 A;  3PRS A;  3R0Y A;  1AAQ A;  2IKO A;  3T11 A;  1SBG A;  4CMS A;  4PPH A;  5P7L A;  1AID A;  4QJA A;  2HC0 A;  3HDK A;  5SXN A;  1CPI A;  1YX9 A;  4ZPF A;  1HVI A;  1EPR E;  4DQG A;  3OUB A;  3F9Q A;  2NXM A;  2PYM A;  4CPQ A;  5OZ8 A;  4Y4B A;  1XE5 A;  5P0C A;  4DJV A;  4Y4T A;  3OGQ A;  5P5M A;  1WBK A;  1FMX A;  4HZT A;  3OU3 A;  1QBR A;  5ER2 E; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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