2G20A

Ketopiperazine-based renin inhibitors: optimization of the c ring
Total Genus 82
5010015020025030001020304050607080
Genus TraceResidueGenus

The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
82
sequence length
333
structure length
333
Chain Sequence
SSVILTNYMDTQYYGEIGIGTPPQTFKVVFDTGSSNVWVPSSKCSRLYTACVYHKLFDASDSSSYKHNGTELTLRYSTGTVSGFLSQDIITVGGITVTQMFGEVTEMPALPFMLAEFDGVVGMGFIEQAIGRVTPIFDNIISQGVLKEDVFSFYYNRDSENSQSLGGQIVLGGSDPQHYEGNFHYINLIKTGVWQIQMKGVSVGSSTLLCEDGCLALVDTGASYISGSTSSIEKLMEALGAKKRLFDYVVKCNEGPTLPDISFHLGGKEYTLTSADYVFQESYSSKKLCTLAIHAMDIPPPTGPTWALGATFIRKFYTEFDRRNNRIGFALAR

The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
EMPTYS6 (81-94)S1 (4-10)S2 (14-21)TI'1 (10-13)TI6 (221-224)TIV1 (9-12)AH2 (111-115)S9 (152-157)AH5 (312-316)TIV3 (22-25)TI4 (64-67)AH1 (51-55)S3 (26-33)TI1 (33-36)3H2 (128-130)S7 (97-108)TI2 (43-46)3H1 (61-63)S5 (68-78)TI5 (78-81)TIV4 (93-96)AH3 (138-145)TIV5 (106-109)S8 (121-124)TIV8 (192-195)TIV6 (132-135)S22 (318-323)S10 (169-173)TVIII2 (148-151)TII2 (172-175)S13 (216-220)TIV7 (163-166)TVIII3 (161-164)3H3 (178-180)S11 (186-189)TI9 (324-327)TIV14 (323-326)TI8 (302-305)O1 (195-197)S12 (197-205)TII3 (212-215)TIV9 (205-208)AH4 (231-240)S21 (308-310)TIV11 (246-249)S15 (244-245)TIV10 (245-248)S19 (290-292)O4 (254-291)S16 (250-253)3H4 (254-259)3H5 (276-278)S17 (263-267)TIV13 (267-270)TIV12 (266-269)S18 (271-274)TVIa1 (301-304)S23 (328-333)S4 (39-42)TI3 (47-50)S14 (227-229)S20 (295-297)TI7 (286-289)Updating...
connected with : NaN
molecule tags Hydrolase
source organism Homo sapiens
publication title Ketopiperazine-based renin inhibitors: optimization of the
pubmed doi rcsb
molecule keywords Renin
total genus 82
structure length 333
sequence length 333
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.4.23.15: Renin.
pdb deposition date 2006-02-15

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00026 Asp Eukaryotic aspartyl protease
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.40.70.10 Mainly Beta Beta Barrel Cathepsin D, subunit A; domain 1 Acid Proteases 2g20A02
2.40.70.10 Mainly Beta Beta Barrel Cathepsin D, subunit A; domain 1 Acid Proteases 2g20A01
3PMYA 5OZNA 2FGUA 1RV7A 2F8GA 5P0PA 3TOFA 1WBKA 5HVPA 3HD8A 5P3LA 2G1OA 4GMIA 3L5CA 5ER2E 1HHPA 4Z4XA 3KN0A 1K1UA 5HD0A 5P2WA 4CPSA 4ZE6A 5P7BA 1HTRB 1MPPA 2Q11A 1IIQA 4QJ7A 3ST5A 4Y5MA 5OZ5A 2NXDA 2Z4OA 3PEPA 2R3WA 5OZTA 2NMZA 4GZFA 4DQEA 1IZEA 2UXZA 1FMUA 3I8WA 5P45A 2AOIA 5P01A 3QBFA 4AMTA 5P7RA 1CZIE 1PPLE 2F81A 3OQFA 1YM2A 5P8CA 3FIVA 3UDMA 2ZJHA 4PPHA 1OHRA 5DQ1A 2WF2A 1TZSA 3HW1A 2SAMA 3Q5HA 1QDMA 4YHQA 3LPKA 5OZWA 4AA9A 1MERA 5P4VA 2O4NA 2J9KA 2WF1A 5OZ1A 2AVOA 4QJ8A 3Q3TA 1QBRA 5P4NA 5P6UA 4Y4ZA 5P8JA 1PSAA 5C9FA 5P7ZA 5P6EA 2BPVA 5P1XA 4R95A 2AQUA 5APRE 5P4MA 2B42A 5KQXA 1AJVA 5P5IA 3S43B 5P8VA 1D4IA 5P76A 1FMXA 3OU4A 5P2HA 3ZKGA 4ER4E 2QZKA 3NU6A 4Y45A 3FV3A 3NU4A 3TPPA 2QI3A 3LINA 5P7PA 3DUYA 5OZ6A 4K4RA 3SAAA 4Q1XA 1GNOA 5P8EA 3KFRA 5P1PA 2QNPA 5DR3A 3ZMGA 2AZ8A 4EQJA 5P7CA 3BUGA 4D83A 4GIDA 3WZ7A 1HSIA 5P29A 5P3HA 3KF0A 1NPVA 2VJ9A 5P4OA 4FRIA 3KFNA 5P5WA 5SZ9A 1EC0A 2R43A 3APRE 4M8YA 3OXWA 4Y5PA 3URIA 4QJ9A 1B5FB 1RQ9A 1WBMA 1ZPAA 3ER3E 5COPA 1DPJA 5OZRA 3TKGA 5OYXA 4AUCA 4DQGA 3MXDA 4OBZA 1AJXA 4L7JA 4D8CA 3SA3A 3O9BA 3QRVA 4DJQA 5P6GA 5P3YA 4Y57A 5P46A 4KE0A 1LYWB 2QHZA 1W50A 2FIVA 3BXSA 5P4FA 5P6VA 4ACXA 3H5BA 2HPFA 1G2KA 1ENTE 5KR2A 1K6TA 3A2OA 5P8MA 2F3KA 1BDLA 2IGXA 5P2AA 4JECA 3PSUA 4YD5A 3N4LA 3PB5A 2FNSA 5P44A 5P8RA 4FRSA 3PGIA 5P1WA 5P4CA 5HU0A 5CLMA 2HS2A 3O9DA 5I3VA 1VIJA 5P5YA 2WEDA 3PI0A 2VS2A 1BWAA 5KR1A 5P0FA 1HIHA 5P3ZA 1HWRA 5P0CA 4Y5EA 3JW2A 3VV6A 4L1AA 3I25A 2R5QA 1MT9A 4NPTA 2IKOA 5P22A 3QP0A 4EXGA 4PZWA 5P2XA 4Y3MA 3WSJA 2QHYA 1FQ8A 3OAGA 3T3CA 4HLAA 3VF3A 5KR8A 4FLGA 3UQUA 1EPRE 4DPIA 4RCEA 4Z22A 5P5JA 4YOBA 1EC1A 4OBHA 3QAAA 5KQYA 4Y5NA 5P5TA 4YD3A 5HDZA 4DJUA 2WEBA 5P2RA 1GVXA 4TRYA 5P40A 4HEGA 4FAFA 4I8WA 3VYEA 4GJDA 4DQBA 2ANLA 3L5BA 4LL3A 5P72A 1IDBA 4B1DA 5P7YA 3OUCA 3QVCA 5P20A 5OZ0A 3S2OA 4H3FA 2AVMA 2O4LA 5P79A 4DQHA 1EPLE 1IVQA 1EC3A 5P07A 3GW5A 2XYFA 3OUDA 3I7EA 5P8QA 3S85A 1ZBGA 5P47A 1MUIA 5JODA 3D3TA 4J1HA 4K8SA 4Y3EA 4Y4JA 5HE5A 5P43A 4Y3GA 5HDXA 1C6XA 5P2SA 5P1SA 1FF0C 2NXLA 2G1SA 3HVGA 4HA5A 4CPWA 1QBTA 5P31A 2R5PA 2PWCA 4YD7A 5P1DA 4DV9A 2G1NA 3LIVA 4J0TA 1XN3A 5DR4A 3ZKSA 3FNTA 1D4LA 5P7VA 5P2IA 5P2LA 5P3UA 2P3BB 5P84A 4Y4UA 5P5AA 2HB4A 1PSNA 4B72A 2IRZA 1XL2A 5P86A 2H6TA 2PSUA 5ENMA 2V12C 2MIPA 1MRWA 5IE1A 4Y3PA 4COEA 3S54A 5P4HA 1QBSA 2PYMA 3L59A 5P48A 4Y5KA 5P4RA 4KE1A 3VV7A 4YOAA 4YCTA 5P71A 5P4WA 2BPYA 3VF5A 5OZZA 5P8NA 4MC6A 5B18A 1AXAA 1CMSA 1EPQE 3LZYA 3ZKMA 5P6IA 4K4PA 3FSMA 3OTSA 4FIVA 3N3IA 4B1EA 1W5YA 5P4PA 4D89A 2WECA 4R92A 3MXEA 2RENA 5P7UA 3U71A 3ZPTA 3K5CA 1TCXA 3Q4BA 1W5VA 3EXOA 3EM6A 3MSKA 4Y5BA 2PH6A 5P2GA 5COKA 5P4XA 5HDUA 5P0LA 4I12A 5P7NA 3BVBA 1SGZA 3HBOA 3HZCA 2ZJMA 4B0QA 5SY2A 1YTIA 1HVRA 3ZKXA 1OEWA 4Y3SA 3SA7A 3UTLA 2JJJA 3O9AA 3TKWA 2AVQA 5AH7A 3R4BA 3GI5A 5P00A 2ZGAA 3L5FA 3NLSA 5AH9A 2QI4A 4DPFA 3PHVA 5BWYA 5P36A 1FB7A 4Q1YA 3QI1A 3VFBA 2QMPA 2QNNA 1DMPA 3NDTA 5P7XA 4J1FA 1IBQA 1PROA 4TVHA 3VSWA 1BXQA 5OYWA 1FQ7A 5KOSA 4MC2A 2WL0A 5P0YA 3O9EA 4OBJA 1YTHA 3LPJA 5P0UA 5P5ZA 3SPKA 1GKTA 5DR7A 2I0DA 3UPJA 1APTE 2BQVA 5OZXA 5P8AA 1T6GA 2ER9E 5EZXA 4YDFA 4H3GA 2I4DA 5OZKA 4Y50A 2VA7A 2VIEA 5P75A 3PLLA 5P6TA 2ZHRA 3IXOA 2QD7A 2QK5A 5OZQA 4Y38A 4ER2E 5P5OA 4Y4TA 5J25A 2PMAA 4R5NA 2B8LA 3KM4A 2ASIA 4Y5AA 1HVHA 4Y4EA 2WF3A 2AVVA 5P0ZA 5P8KA 1HBVA 1FMBA 1W6IA 2F80A 1B6KA 1UH8A 3UDNA 1J71A 1HIVA 4J1CA 4QGIA 4Y4GA 3S43A 5P2YA 5DPZA 3IGBA 1GVVA 1PPKE 3VEUA 5P2BA 4RROA 4BFDA 2FDEA 4A4QA 3EBZA 1D4HA 4EPJA 2APRA 1KJHA 5P6PA 1TW7A 3DJKA 1FQXA 1A30A 5P7MA 1MESA 2FDDA 3SQFA 5ISKA 1APVE 1W6HA 4Y3AA 2FDPA 3UDPA 1N49A 3D1ZA 4Y3NA 5P59A 2QMDA 5P3OA 1T3RA 5AH8A 3GI6A 5P7LA 5P69A 4OC6A 5OZDA 4EWOA 2IENA 2VA6A 1APUE 2A4FA 1NH0A 2RMPA 2OHLA 3KT2A 2VA5A 1B5FA 4GJ6A 1UH9A 2ZJKA 2QI1A 3LZSA 4Y3DA 5P1RA 1SDTA 1GNNA 5P74A 3PVKA 1SDVA 1OEXA 3T6IA 4Y5CA 2I4XA 5P0KA 1T6EX 1K2BA 5P6WA 1HVIA 2I4WA 3NDUA 5OZEA 5P52A 5P23A 5AHBA 4R8YA 5HDVA 2G22A 1YG9A 5OZSA 1GVTA 4I0GA 3JVWA 1QRPE 5P5PA 4Y53A 3VYDA 5OZOA 3PMUA 1IZDA 1KJ7A 5OYZA 2ZJIA 5P7FA 5P4JA 3O99A 3LIXA 3M9FA 4FRJA 4HDPA 4U7VA 3NR6A 1Q9PA 5P0NA 2OHKA 2HAHA 2IEOA 3CKPA 1EBKC 5P66A 4J5JA 1ZPKA 2O4PA 3PWRA 2V11C 4Y4WA 4Z50A 5P58A 3LZVA 4RCDA 4YD4A 2P3AA 4Y39A 3D1XA 3SM2A 3D20A 4FM6A 4FGXA 3IN4A 3OGQA 3OADB 3TH9A 3TPJA 5DR8A 1HXWA 2QD8A 4J54A 1BAIA 1MTRA 3EC0A 1IVPA 4ZPEA 2PQZA 4Q1NA 5P03A 4ZSQA 3DCKA 4HE9A 1AVFA 4B00A 2F3FA 1ZAPA 3MSJA 4HVPA 5OYRA 5P6FA 2OHNA 2G69A 3URLA 4DUSA 4CKUA 2OAHA 4EJ8A 5P5KA 5P8BA 1RNEA 2G1RA 3WB4A 3O9GA 4UPJA 2NMYA 1DP5A 3INDA 5P1AA 3ZKIA 2QNQA 4Y43A 3CKTA 1APWE 4RVJA 4R93A 1LF3A 3WZ6A 5P1GA 5IVQA 3VLAA 3WZ8A 2QZLA 2BJUA 1QBUA 3IXKA 4J55A 3DM6A 3K5DA 1IZHA 3OGPA 4ZPGA 5P1JA 2QI0A 5P4IA 4DJXA 4H1EA 5HTZA 2B8VA 4L7HA 2BKSA 5P5EA 5P73A 3TPRA 4GJ9A 1TSUA 1T7IA 4ZEAA 4EJLA 5P13A 5OZCA 3UFNA 3BHEA 5P8TA 4K9HA 1SH9A 2NNKA 4KB9A 1LYAB 2P3BA 4JPEA 3UDYA 2ZDZA 5PEPA 3T7XA 1BVGA 5OZYA 4Y9WA 5ISJA 2OHSA 1HSHA 3ECGA 4DFGA 4A6CA 2VJ7A 2P83A 1D4YA 5P0XA 2BBBA 5P3TA 3PSYA 3NDXA 3T7QA 3OU3A 5P34A 5P6KA 3GGAA 1PSOE 5COOA 5P09A 4X7IA 3PJ6A 2IL2A 3R2FA 4Y56A 3QS1A 9HVPA 5P3QA 4RYGA 2PYNA 1EPPE 4K4QA 1TCWA 5I70A 5HU1A 3INFA 4BELA 5P1FA 5P6ZA 3CKRA 2PH8A 1LYBB 1JLDA 4NJTA 1BV9A 1D4KA 3ZKNA 5P08A 5P82A 5P62A 3G6ZA 4Y3XA 5F00A 1WKRA 1LF2A 1MEUA 5P10A 3OQDA 4JOOA 4F76A 2O4SA 1ZSRA 5P6JA 3I6OA 8HVPA 2AOEA 5P5UA 5P5SA 3O9IA 1AAQA 1YM4A 1FQ4A 1XL5A 2F3EA 2VIJA 3D91A 3UFLA 2XFIA 2WF4A 5P2JA 3OHFA 4EHCA 4Y3YA 3VLBA 5P1OA 4J0YA 3PCWA 3UDQA 4XKXA 5P8DA 3EL0A 5P7IA 1EPOE 1W51A 2FMBA 2BB9A 4APEA 4GJBA 4H3IA 1Z1HA 4Y4DA 5OZJA 2WEZA 4D88A 5P30A 5P18A 3OOTA 1BDQA 5P05A 1MTBA 2WF0A 2AOHA 2FXEA 2V16C 2HM1A 2XFJA 3OK9A 5P3SA 5HE7A 3NU3A 2Q64A 5P2OA 3ZPSA 4PHVA 2OHQA 2R8NA 3OQAA 3PWWA 4OBFA 1A94A 5P2CA 5P4QA 4PYVA 3BUFA 3SA6A 3SM1A 4I0DA 1ZJ7A 3ZKQA 5P5GA 1DAZC 5P6YA 4Y35A 5P1IA 2VIZA 4GJ8A 5P61A 4GB2A 3G72A 4Y44A 3TNEA 4LXAA 1C6ZA 5C9BA 4ZLSA 6UPJA 1HVSA 1HXBA 2CEJA 2ER6E 4B77A 1HEGE 3UDRA 1BILA 4DQFA 3SA4A 1SIPA 3OQKA 4B1CA 2JJIA 1BIMA 3BRAA 4XX3A 4D85A 2QI6A 4I0HA 4APRE 5OZ9A 4RZ1A 4EP3A 3K5FA 3C9XA 5P2FA 2FLEA 2QHCA 1SMRA 3DV5A 3QN8A 5JFPA 2HC0A 5P0JA 2VKMA 3ER5E 4PEPA 3HVPA 3MSLA 2WKZA 4CPRA 2QU3A 1SBGA 2BKTA 2IS0A 5AGZA 3FX5A 4DI2A 3HDKA 5C9DA 5P3GA 3FNUA 4LP9A 6APRE 1HTGA 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chains in the Genus database with same CATH topology
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