2H6SA

Secreted aspartic proteinase (sap) 3 from candida albicans
Total Genus 93
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
93
sequence length
340
structure length
340
Chain Sequence
QTVPVKLINEQVSYASDITVGSNKQKLTVVIDTGSSDLWVPDSQVSCQAGQGQDPNFCKNEGTYSPSSSSSSQNLNSPFSIEYGDGTTSQGTWYKDTIGFGGISITKQQFADVTSTSVDQGILGIGYKTHEAEGNYDNVPVTLKNQGIISKNAYSLYLNSRQATSGQIIFGGVDNAKYSGTLIALPVTSDNELRIHLNTVKVAGQSINADVDVLLDSGTTITYLQQGVADQVISAFNGQETYDANGNLFYLVDCNLSGSVDFAFDKNAKISVPASEFTAPLYTEDGQVYDQCQLLFGTSDYNILGDNFLRSAYIVYDLDDNEISLAQVKYTTASNIAALT
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title The crystal structure of the secreted aspartic proteinase 3 from Candida albicans and its complex with pepstatin A.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Candidapepsin-3
molecule tags Hydrolase
source organism Candida albicans
total genus 93
structure length 340
sequence length 340
ec nomenclature ec 3.4.23.24: Candidapepsin.
pdb deposition date 2006-06-01

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00026 Asp Eukaryotic aspartyl protease
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.40.70.10 Mainly Beta Beta Barrel Cathepsin D, subunit A; domain 1 Acid Proteases 2h6sA02
2.40.70.10 Mainly Beta Beta Barrel Cathepsin D, subunit A; domain 1 Acid Proteases 2h6sA01
4I11A 2QI7A 4I8WA 1HPVA 3NU4A 4J1IA 4L7JA 2BPVA 1HSIA 5OZLA 1D4LA 3EKYA 3WB4A 5P0JA 5P3RA 5P2OA 3TPRA 3CKPA 3FSMA 4Y3TA 5P48A 5P59A 1CPIA 1W5XA 1GVXA 2QAKA 3BUHA 1XL5A 1FQ6A 4Z50A 4EQJA 2OHPA 2R3TA 2AVVA 5P0SA 5KR1A 2APRA 3NSHA 2QI4A 1W6HA 5P7MA 5SZ9A 3RSXA 2IKOA 2ZJLA 2FNSA 5P78A 4Z4XA 3DV5A 4I0JA 3U6AA 3UDHA 3NR6A 5P33A 1AJVA 5P1TA 3VG1A 4Y4XA 1B6MA 4LXMA 3T7XA 5P6PA 3AUPA 4J5JA 4FM8A 4R93A 2ER9E 5P5RA 3OAGA 2O4NA 5P6XA 3O9BA 4DJWA 4MC6A 3DK1A 5P4DA 3NXEA 1FIVA 3PWRA 1B5FB 1GVWA 3NDXA 3BHEA 3TLHA 3VF3A 2F8GA 1FLHA 1MIQA 4M8YA 5P31A 4B70A 1YT9A 5DPZA 2HS1A 4R95A 3OUDB 3G6ZA 4XKXA 4YBIA 3MSJA 3SLZA 3KF0A 5P45A 5P7RA 5OZYA 3ZPUA 4J0ZA 1B6PA 3EKWA 5OZTA 5P4EA 2H6SA 5P1UA 2AVSA 4Y3AA 5P18A 1LYAB 4R91A 4K9HA 2QMDA 4Y3PA 5P60A 3RU1A 4YDFA 2I4DA 4DQGA 5P6NA 2ZJHA 2RKGA 7HVPA 5DQ4A 5OYQA 5OYSA 5P79A 5P0ZA 5AH7A 1VIKA 1HPOA 1C6ZA 4TRWA 1SDVA 1LZQA 5P0DA 2QK5A 1FMXA 1AM5A 5I70A 3APRE 3D1ZA 2FDDA 2AVQA 1EBKC 2PH8A 2QU3A 4GYEA 5P88A 3D1XA 3IN4A 4I0EA 4Y3QA 3OGQA 4TVHA 2AQUA 1TCXA 3S7MA 3DCKA 3VV8A 5OZ5A 2P3BB 1G2KA 2F3FA 3JVYA 3H5BA 3A2OA 1HVSA 3PBDA 3FIVA 5P3EA 3I6OA 5P8IA 3RVIA 5P2LA 3S54A 5OZVA 1MSNA 1HSGA 4OC6B 2IEOA 3SKFA 4GJ7A 5P8OA 2ZJKA 4F73A 3ZOVA 1MTRA 2NXLA 3OXXA 5P4OA 2PK5A 4DJPA 4J0VA 3S85A 2QI3A 2VJ7A 4ZPEA 5P5DA 5P73A 1HWRA 4PZXA 2QHCA 5P53A 1A8KA 4DJVA 1LV1A 1W51A 3GGXA 4CPRA 4QJ7A 3I7EA 3EL9A 3ER3E 2WF1A 3PCWA 3GGVA 3UF3A 2AOEA 1ER8E 3KFNA 3NYGA 1BV7A 2ASIA 4D85A 3ZMGA 1M0BA 2BJUA 5OZUA 1FG8C 3APPA 3S43A 3NDTA 4FGXA 5P2TA 5P2QA 4YCKA 4APRE 3K5DA 4R5NA 5P2ZA 2G1YA 1HXWA 4YD4A 5P5AA 3SA8A 2R8NA 4OBJA 2BPYA 2HB3A 3G72A 2PSGA 4RVXA 3L5EA 5P1KA 2OHSA 3NXNA 5P16A 1DAZC 4XXSA 1UPJA 5P7QA 5P6HA 5P8UA 3RSVA 5P2IA 1T3RA 4CP7A 4ZE6A 4Y3DA 4ZSMA 1FMBA 3OXWA 3OUCA 3SQFA 1K6PA 3HW1A 3NU6A 2PSUA 1NSOA 4H3FA 3INFA 1D4SA 3K4VC 4AMTA 2H6TA 1LF2A 4AUCA 1HEFE 4OBGA 5P54A 3SACA 6FIVA 5AHAA 1M43A 2J9JB 5C9BA 1MERA 3ZPSA 3PSGA 5P35A 3PCZA 5T4SA 5P37A 4FCOA 1ODXA 4QJ2A 1YM2A 1FQXA 2JJJA 2CENA 4L7HA 1EEDP 1ZSFA 5IVSA 4EHCA 3S7LA 1TSQA 4Y57A 4Y39A 4B1DA 1T7JA 5P5TA 1PPME 5OYZA 1GVUA 1EPOE 2P4JA 1XE6A 5P34A 3NU9A 5P8JA 4J0YA 5P0AA 3L3AA 4AA8A 5P1YA 4F76A 5HD0A 2FXEA 2FS4A 4Y4BA 4NPTA 1GVVA 4H1EA 4YD6A 1OD1A 5P8SA 4CPXA 3MXEA 5P6OA 1QDMA 4Y3MA 3PRSA 3MXDA 3OADB 1GNNA 1FG6C 4LL3A 2I1AA 1OEWA 1WKRA 3VYFA 5P7OA 3UQPA 4GB2A 4EJLA 2QHYA 1FMUA 2NNKA 3LPJA 2AOFA 2QMGA 1FF0C 1C6XA 5P7HA 1IZIA 2PMAA 3ZPTA 1HVCA 4Y53A 2ZJJA 5P6RA 5P85A 4A4QA 2ZHSA 2XYFA 1AVFA 1A9MA 5P7VA 5OZOA 3IGBA 4EXHA 5P71A 2P3DA 2PWRA 3OU4B 3FV3A 5P6KA 5P1JA 5P28A 3VSWA 3NWQA 5P7NA 4IVSA 1SBGA 3EKTA 5P1QA 4JOOA 3HAUA 2PH6A 4B05A 5P3LA 3UDKA 3TKWA 5ISKA 5OZJA 4Y3RA 1HEGE 2AIDA 1WBKA 4FRSA 3BGCA 5KR2A 5P0NA 2FGUA 3LZYA 3QBFA 5P2FA 2FDPA 4Y4ZA 3KMXA 2G1SA 4U7QA 5P4GA 3NUOA 2AOIA 2CEMA 2IDWA 2NNPA 3UHLA 2BBBA 5P4WA 2IGXA 5P14A 2Z4OA 3EMYA 1OEXA 4DUSA 1DMPA 2WL0A 5P46A 1FB7A 2JJIA 1D4HA 5P0TA 5P80A 2FMBA 3L5FA 5P4MA 3OY4A 2HB4A 3I25A 4I0ZA 5HCOA 5KAOA 2VNMA 5ENKA 2ZJNA 5P2HA 5OZRA 4Y3NA 1BV9A 3FNSA 3KMYA 3PGIA 5AH9A 4Y38A 5P24A 4LC7A 2ZDZA 5P5LA 5P8FA 1IIQA 5EZXA 2P8HA 2IKUA 3SFCA 1LYBA 3AIDA 4DQFA 4NJUA 3TPPA 5P2JA 4HLAA 5OYVA 3LIYA 5P7EA 3CICA 5P5JA 4Q5MA 5P0EA 2F3EA 3VV6A 4Y3HA 4J1CA 1ZJ7A 3O9EA 3OOZA 3EL1A 2IRZA 2OHMA 3PEPA 3O9LB 3QRMA 2OHRA 5I3WA 4DJOA 3VFAA 4JECA 1BDRA 3PI0A 3UDQA 1G6LA 5P05A 3T7QA 5P3VA 2RENA 1E82E 3O9CA 5OYUA 1QBSA 5P3AA 5P5OA 3EL4A 2IS0A 1BXQA 1ZPAA 2VA5A 3BVBA 1ZBGA 3KT5A 4MC2A 3LPKA 5OZBA 2JXRA 4GJ6A 4F74A 1BIMA 3JW2A 3LINA 4UPJA 4B1EA 5P22A 4Y3XA 4Y56A 3QN8A 3Q3TA 3SA7A 4YCTA 5P3ZA 4Y4EA 2VA6A 5AH6A 2I4XA 4B1CA 3LIZA 4FL8A 3OUAA 4HDPA 5JFUA 2F81A 1YTHA 1HVJA 5P5UA 3OTYA 3VV7A 5HTZA 5P49A 2G1OA 4RCDA 5P2NA 6APRE 5P07A 3OHFA 5P0LA 4EQ0A 4OBHA 5KR8A 1HIVA 2R38A 2JYSA 4FSLA 4Y41A 4Y4TA 4MC1A 2Z54A 3EBZA 3OU1B 2PK6A 5P7KA 1EBYA 2QNQA 4LBTA 1F7AA 4WY6A 3D91A 5DQ1A 5P6WA 5P77A 4YCYA 2VIZA 3TH9A 4Y3SA 4RROA 5P57A 4OBZA 3TOGA 1BBSA 2B8LA 2OF0A 3OXCA 2O4LA 3HDKA 4HA5A 5P8RA 3NU5A 1Z1RA 1HIIA 2WJOA 5P23A 1BVGA 2VKMA 4Y5LA 2EWYA 4ZEAA 2PSVA 3QROA 3BRAA 4Y37A 5COOA 5COPA 2UXZA 4FSEA 2B7FA 3OQAA 1C70A 3IVIA 2QD8A 1TW7A 1QBRA 5P4XA 5P82A 5P4YA 5I3YA 5P8TA 3OQFA 5HU0A 5EZZA 3KA2A 4Y44A 5KR0A 3BUFA 5P0XA 5P38A 5DR4A 1HOSA 2I0AA 4Y54A 1HTFA 3TOFA 3O9AA 3FNTA 1EC0A 2R9BA 4Y3YA 5P08A 4E43A 3TPLA 3D1YA 5P1EA 5P06A 1W5YA 5I3XA 4RVIA 3UQXA 1G0VA 2WEZA 3URLA 2VA7A 5P4SA 5P2AA 5P02A 3FNUA 5P62A 5P3CA 2V0ZC 1QBTA 1YTIA 2FGVA 4ZSQA 1KJFA 5P5IA 5P84A 5DR7A 5P6VA 5P3KA 4DQHA 4Y3ZA 4B78A 5COKA 1UH8A 1MPPA 3Q6YA 3OOTA 3OAGB 1ME6A 5P1HA 5SY2A 3DUYA 5IVRA 3UDYA 3IA9A 5OZMA 5P1DA 2ZHVA 4J1HA 3I8WA 5P3SA 1AIDA 3OK9A 1B6JA 5P7BA 1SH9A 5P5KA 4I1CA 4DPIA 4CPTA 4KB9A 5C9FA 4L7GA 4RGHA 5P3OA 1BWBA 3HD8A 2VIJA 4ZSPA 4H3GA 3Q70A 1SMRA 2ANLA 4HDFA 2NPHA 5P3PA 1LYAA 2ZJIA 1RNEA 5P7AA 1BVEA 2WKZA 5OZAA 4B0QA 3WZ8A 4RVJA 4R8YA 5DR8A 5J25A 2QU2A 3PMUA 2AOHA 4RYCA 1HVRA 2OHQA 1K6TA 1HVLA 4IVTA 2F80A 3BXRA 5P3MA 1EPQE 5UPJA 3GI0A 3NU3A 2NMYA 4A6CA 3INEA 5IVTA 3KT2A 2RMPA 4Y9WA 1HRNA 5OZQA 3VLAA 5P6CA 5P7XA 4BEKA 3RTNA 2XFJA 3R0YA 1HVHA 5P6BA 2O40A 2Q11A 3T6IA 5P03A 3SM1A 3EC0A 1IZHA 4APEA 4D88A 3OQ7A 2WF4A 4DQBA 4OC6A 5P0YA 5KQFA 3SA5A 1N49A 2J9KA 3GW5A 4I0GA 2WF2A 1PPLE 5DR0A 2V11C 1XS7D 5P8GA 3KDBA 1G35A 3TKGA 5P6LA 3OXVA 4COEA 5P5CA 3SA4A 1BDQA 4Y5NA 2OHTA 5P7FA 2Q5KA 2BPZA 1IZDA 1SDTA 5P63A 4U7VA 4I8ZA 5P3TA 4LHHA 3ZKSA 3PI5A 5P6TA 2ER7E 5P5QA 4I0IA 1ODWA 3CKTA 5P70A 5P2DA 5HDVA 5OZ1A 1EPRE 4Z2ZA 2OHKA 4Y50A 1BWAA 4K4RA 1IVQA 3K4VA 3S43B 1SGUA 3NUJA 4ACUA 2FXDA 3C9XA 1EPNE 3BUGA 1RV7A 5P0CA 5P8EA 5P0FA 4YOBA 4D8CA 4BFBA 4YOAA 3RTMA 5P7TA 4NPUA 1QS8A 1YM4A 4RCEA 5P6EA 1FQ4A 5P8MA 5BWYA 5DQ5A 1KJHA 4I12A 3T3CA 4DJUA 2FIVA 4U8WA 2OHNA 3UTLA 5P5VA 3U7SA 3VYEA 4D83A 5P36A 4GMIA 5BS4A 5OYTA 5P6MA 1QBUA 4PPHA 5F01A 5P1LA 1FQ5A 5P0WA 4QLHA 3U71A 4R92A 1MSMA 4Y48A 5OZKA 1D4YA 4QJAA 5P3DA 1D4IA 5OZPA 5P0BA 2QI1A 5P89A 3VYDA 2I4UA 3CKRA 3EKXA 1DPJA 1T6GA 4I0FA 3HZCA 2BKTA 2QP8A 3PHVA 5P7ZA 2VS2A 3CMSA 3LNKA 4ZIPA 4JPEA 4Y3FA 5P17A 1FGCC 1FQ8A 2O4PA 2PYNA 3SA9A 3BXSA 5P00A 5OZGA 5P3BA 1RL8A 3CYWA 1GNOA 4N00A 5P0IA 5OZNA 4QJ6A 5P47A 5AHCA 4GJBA 3ER5E 1XE5A 1LYWA 5CONA 3PLLA 5P39A 5P51A 3URJA 6UPJA 1A8GA 5P5FA 1IDAA 2VIEA 5P6JA 3SKGA 2WEAA 1J71A 1K2CA 2ZJMA 1HIHA 2QZXA 2I4WA 1W5VA 4YE3A 3OHHA 3MWSA 3CIBA 3CYXA 4Y4UA 1ODYA 3WB5A 5OYRA 2NMZA 1HBVA 5P7GA 4I0HA 5P1RA 2P3AA 2Q3KA 3QPJA 1Q9PA 3EXOA 4Y3JA 3VFBA 5P1PA 1ZAPA 1WBMA 1YTGA 5P2WA 1ZTZA 1SGZA 5OYYA 2WEDA 1PROA 3UPJA 3GI6A 3L38A 4NJSA 3TL9A 1JLDA 5E5KA 4RZ1A 2G21A 4KE1A 5IE1A 4GIDA 1SIVA 3QRVA 4DV9A 3UDPA 1XN2A 2P83A 4LAPA 5P2MA 4K4QA 5P2GA 2NTRA 3IXKA 4FLGA 3K1WA 4L1AA 3SABA 4ER2E 1W50A 3R4BA 2NXDA 1APVE 1D4KA 5P5SA 2OHLA 5P6DA 5P72A 4HZTA 4NJVA 2O4KA 4DH6A 1LF3A 4Y47A 3KFSA 1XDHA 5P3XA 3EM3A 4OBFA 4DJQA 3PSUA 5P1NA 5OZSA 5P8NA 4Y5BA 5OZWA 3WSJA 5P3YA 1LS5A 4Y3WA 2QZWA 3Q4BA 5ENMA 3S56A 3M9FA 4HVPA 1K2BA 4DQEA 1EPPE 5P6QA 4GZFA 4FRKA 5P2KA 5P1IA 2VJ9A 1A30A 4I0DA 1NPAA 5P8KA 5P0UA 5F00A 5P4ZA 9HVPA 1K1TA 1PSNA 4QJ9A 3SO9A 2G1NA 2WHHA 1MRWA 3UQWA 1LYBB 2BPWA 2JE4A 5P4JA 2FLEA 1YTJA 3UDRA 5P7SA 5P4RA 4WTUA 3L5CA 5P55A 2ZGAA 3SM2A 2FDEA 1MVPA 1ZPKA 1MT7A 5P3UA 4Y5PA 5P2BA 4M8XA 2I0DA 5P42A 5P61A 3NLSA 2G24A 3QAAA 3PWWA 1E5OE 2AZBA 7UPJA 3LZUA 3QS1A 5P4VA 3EKPA 3QVIA 5P67A 3S45A 2I4VA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 4I11 A;  2QI7 A;  4I8W A;  1HPV A;  3NU4 A;  4J1I A;  4L7J A;  2BPV A;  1HSI A;  5OZL A;  1D4L A;  3EKY A;  3WB4 A;  5P0J A;  5P3R A;  5P2O A;  3TPR A;  3CKP A;  3FSM A;  4Y3T A;  5P48 A;  5P59 A;  1CPI A;  1W5X A;  1GVX A;  2QAK A;  3BUH A;  1XL5 A;  1FQ6 A;  4Z50 A;  4EQJ A;  2OHP A;  2R3T A;  2AVV A;  5P0S A;  5KR1 A;  2APR A;  3NSH A;  2QI4 A;  1W6H A;  5P7M A;  5SZ9 A;  3RSX A;  2IKO A;  2ZJL A;  2FNS A;  5P78 A;  4Z4X A;  3DV5 A;  4I0J A;  3U6A A;  3UDH A;  3NR6 A;  5P33 A;  1AJV A;  5P1T A;  3VG1 A;  4Y4X A;  1B6M A;  4LXM A;  3T7X A;  5P6P A;  3AUP A;  4J5J A;  4FM8 A;  4R93 A;  2ER9 E;  5P5R A;  3OAG A;  2O4N A;  5P6X A;  3O9B A;  4DJW A;  4MC6 A;  3DK1 A;  5P4D A;  3NXE A;  1FIV A;  3PWR A;  1B5F B;  1GVW A;  3NDX A;  3BHE A;  3TLH A;  3VF3 A;  2F8G A;  1FLH A;  1MIQ A;  4M8Y A;  5P31 A;  4B70 A;  1YT9 A;  5DPZ A;  2HS1 A;  4R95 A;  3OUD B;  3G6Z A;  4XKX A;  4YBI A;  3MSJ A;  3SLZ A;  3KF0 A;  5P45 A;  5P7R A;  5OZY A;  3ZPU A;  4J0Z A;  1B6P A;  3EKW A;  5OZT A;  5P4E A;  2H6S A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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