2V0ZC

Crystal structure of renin with inhibitor 10 (aliskiren)
Total Genus 84
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
84
sequence length
340
structure length
338
Chain Sequence
LTLGNTTSSVILTNYMDTQYYGEIGIGTPPQTFKVVFDTGSSNVWVPSSKCSRLYTACVYHKLFDASDSSSYKHNGTELTLRYSTGTVSGFLSQDIITVGGITVTQMFGEVTEMPALPFMLAEFDGVVGMGFIEQAIGRVTPIFDNIISQGVLKEDVFSFYYNRDSSQSLGGQIVLGGSDPQHYEGNFHYINLIKTGVWQIQMKGVSVGSSTLLCEDGCLALVDTGASYISGSTSSIEKLMEALGAKKRLFDYVVKCNEGPTLPDISFHLGGKEYTLTSADYVFQESYSSKKLCTLAIHAMDIPPPTGPTWALGATFIRKFYTEFDRRNNRIGFALAR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structure-Based Drug Design: The Discovery of Novel Nonpeptide Orally Active Inhibitors of Human Renin
pubmed doi rcsb
molecule keywords RENIN
molecule tags Hydrolase
source organism Homo sapiens
total genus 84
structure length 338
sequence length 340
chains with identical sequence O
ec nomenclature ec 3.4.23.15: Renin.
pdb deposition date 2007-05-21

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
C PF00026 Asp Eukaryotic aspartyl protease
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.40.70.10 Mainly Beta Beta Barrel Cathepsin D, subunit A; domain 1 Acid Proteases 2v0zC02
2.40.70.10 Mainly Beta Beta Barrel Cathepsin D, subunit A; domain 1 Acid Proteases 2v0zC01
3OXWA 2J9JB 2ZJJA 3OAGB 5P37A 3APPA 1DW6C 1ZPAA 2FGVA 3NWQA 5P0JA 5HCOA 4R8YA 4Y4AA 1ODWA 2ZJIA 3O9EA 1QRPE 4ZPEA 5P48A 5UPJA 3K4VA 3PHVA 3IVIA 1W6HA 5DR7A 4H3GA 3S2OA 2F81A 2R3WA 4Y4DA 5P0IA 3OUDB 3NWXA 5P1XA 4B00A 5P7VA 4AA9A 5P56A 4JECA 1FIVA 1SDVA 4DPIA 2HIZA 4Y5KA 5P00A 2WF4A 4DQHA 3PJ6A 4B70A 1YX9A 3EMYA 3TKGA 1N49A 1KJGA 4QJ8A 4QJ7A 1AJXA 5DR1A 5P1TA 4Y43A 1IZDA 1HSGA 3T3CA 5P4TA 3U6AA 3QI1A 3EM6A 4HZTA 4CPTA 5HE5A 3UDYA 2O40A 2MIPA 3SA6A 1LYBB 5P3IA 3EL1A 1AXAA 2AOCA 1HPSA 3PSGA 2QI4A 3TOGA 4Y39A 3SA3A 3KFRA 5PEPA 3NU3A 5DR8A 3LIQA 2WF3A 1LYAB 2FMBA 2Q11A 1C6ZA 5P11A 5ISJA 2BKTA 3FIVA 1NSOA 2VNNA 5P6SA 2QNPA 5P7GA 5P0DA 4JOOA 4EWOA 4I0JA 5I3YA 3UTLA 1MERA 2R43A 3NDUA 5P3BA 5HE7A 5P8QA 4WY1A 2VKMA 2PWCA 3FX5A 5P4XA 1IDAA 4AMTA 4EXGA 5P8LA 5P4OA 1HBVA 5P35A 1APUE 1GNOA 5P8HA 3G70A 1Z1RA 4NPTA 4Y41A 1XN2A 3LIYA 3R1GB 3ZKXA 1FMXA 5P0NA 1PPKE 4RCFA 5P0GA 2B7FA 4GJ6A 5P72A 3INFA 4YOAA 4F73A 5P3WA 5ER2E 2PQZA 5P7TA 5OYQA 1OHRA 4ACXA 4LBTA 4Y5PA 3PMUA 3UDNA 5P06A 2JJIA 5P4EA 4M8XA 4JPEA 2IRZA 5P4HA 5OYSA 4Q1NA 5DR3A 5P30A 1ZTZA 3U7SA 5P3VA 5KR1A 3PLLA 3ZPTA 3NUOA 3NU4A 4JP9A 3PGIA 5P3HA 2QNQA 2O4LA 1TW7A 5P0VA 3UQXA 4BEKA 5OZHA 4PZWA 5E5JA 5P39A 1PSNA 3VFAA 3BHEA 2F3EA 3OU4B 3AIDA 4A6CA 2FNSA 5P3CA 3ZKMA 2AVMA 5ENMA 5P8PA 4RCEA 5OZ4A 4Y3SA 4UPJA 2WECA 1HVJA 5P4DA 2PH8A 3OWNA 4R95A 2J9KA 1SH9A 3FKTA 2AIDA 5OZFA 2VA5A 3SM2A 4OBFA 4TRWA 1RV7A 5P4AA 2AVQA 4HE9A 5P7IA 5P74A 2QMFA 4L7HA 3R0WA 5P0KA 5HTZA 1BWAA 3CYWA 1YM4A 4B1EA 1SBGA 3VYFA 3EL4A 2AOIA 5ER1E 3VF7A 3PMYA 4Y54A 3QBHA 3S7MA 3BC4A 2WHHA 5OZWA 5P0MA 5P87A 5P8RA 2QI1A 1T7IA 3Q6YA 5P53A 2ZJHA 3OHFA 5P5WA 4XXSA 2ZGAA 4Y3ZA 1HTFA 4PHVA 5OZJA 5P2DA 3UFLA 2UY0A 4J1IA 3HAWA 2ZHSA 4S1GA 3ZKQA 3LHGA 2IL2A 2OHPA 4YD4A 3QROA 4K4RA 5DR0A 4ZSPA 1FFFC 1GNMA 4LAPA 3EL0A 4Y38A 1XE6A 5APRE 4GJDA 3EKXA 4K8SA 5P2EA 5DQ1A 5P19A 2UXZA 5I3VA 3EKVA 4Q5MA 3BGCA 2QU3A 1FMUA 4Y35A 3CIBA 3VSWA 5P25A 1EC1A 5HU0A 5P5KA 1PSAA 3A2OA 3OTYA 5HU1A 1IIQA 5P0PA 4YD5A 3I8WA 4Y3JA 3CIDA 5OZTA 2F3FA 3H0BA 5DQ4A 3UQUA 2JE4A 4Y5GA 1HTGA 1MT9A 5IVQA 1D4HA 1J71A 5P5GA 5P8GA 2QMDA 3VFBA 5P1HA 3OXXA 4Y48A 5P76A 5P4RA 2V11C 3OXCA 1HOSA 5P5YA 1CZIE 3OQFA 5E5KA 2G20A 5P2HA 3OADA 5P75A 3WB4A 1D4JA 2QZWA 4NPUA 1ENTE 4YCYA 5P3MA 3T7PA 4APEA 5P0OA 1ZP8A 4X2LA 3O9LA 5P83A 5P1DA 1EC0A 2O4KA 4M8YA 2XYFA 3GGXA 3S53A 5SY2A 9HVPA 1QBSA 1QS8A 5OZDA 3LINA 4D83A 1DPJA 2AOJA 5P2XA 2CEMA 5P6QA 3O9HA 3VF3A 3K5DA 5P1CA 3NU5A 3QAAA 5P6HA 3AUPA 5OZ9A 2A4FA 4B78A 2V13A 1ER8E 2P3BA 4H3FA 5FIVA 3D91A 2FXEA 5P5MA 4Y4GA 3QS1A 2FXDA 2QMPA 5P2RA 2PSVA 2V00A 4I1CA 4FS4A 1QBRA 4EP2A 2G27A 3KFSA 3RVIA 3NLSA 3VLAA 6FIVA 1MSMA 5COOA 1UPJA 2NPHA 1APWE 2NNKA 2WKZA 2ZYEA 5P4IA 5P3KA 4MC2A 5P4MA 3PWMA 2AVSA 2XYEA 7UPJA 5P0WA 5P5ZA 4DQFA 4R5NA 3SKGA 1IZEA 5P1PA 5P7PA 2B42A 4B1CA 1SMRA 5P73A 4YD7A 5EZXA 4R93A 3HD8A 5P08A 1LYWB 5OZBA 3CYXA 3I2LA 3IXOA 3URIA 4R92A 1FKNA 2I4WA 2I0DA 3N4LA 2HAHA 5P4VA 5P7JA 3RSXA 3DK1A 1ODXA 3LIXA 3VUCA 4OBHA 1G35A 5P1RA 4LP9A 4OBJA 3PVKA 1EEDP 3SABA 1SGZA 5P1ZA 1T3RA 2IS0A 2HC0A 2WEBA 5P0QA 2I4VA 1K6TA 3PI5A 5P62A 1U8GA 1ZSRA 5P4PA 3BRAA 3Q5HA 5P65A 5OZ2A 2NXLA 1HHPA 4I12A 3OY4A 5KOQA 1A30A 1EPQE 4CPRA 4U8WA 5BWYA 5P3XA 5P2JA 2B8LA 5P49A 1NPWA 4J1EA 2VA7A 1T7JA 5P09A 5P2ZA 5OZMA 1EBWA 1T7KA 5P7HA 5P1YA 4J5JA 5I70A 4PYVA 5P3LA 3OQDA 4Y58A 3SA8A 3WZ8A 5P8AA 2OHLA 5P78A 3OOTA 4YDGA 4F75A 5F00A 3G72A 1MUIA 3S56A 4X7IA 5P70A 1XN3A 5SXNA 1BBSA 5P1MA 3ZOVA 1LEEA 1LF4A 3VCMA 4Y4ZA 5OZ8A 4RRNA 1FEJC 4Y3XA 4Y5LA 4BFDA 4K4PA 4Y50A 3VSXA 5P6GA 1MRWA 5P42A 1IVPA 4FRIA 2QCIA 3GI5A 3APRE 2ZE1A 4Y45A 5P68A 2QD8A 4OD9B 2RMPA 2Z4OA 3UFNA 3OHHA 3SKFA 4Y3WA 1TSQA 1B11A 4Q1YA 5HDXA 4L1AA 3LZUA 3CKPA 3OTSA 5P3YA 2P4JA 2I4QA 2JJJA 4HDBA 1K2CA 1EPOE 2VIZA 3LNKA 5P5UA 1EPNE 1E5OE 1APVE 1LV1A 1HEGE 2AVVA 1BV7A 5P7BA 4DPFA 2NMZA 4EYRA 4GMIA 5P8IA 5P8FA 2PK6A 1B5FA 5P0LA 4QJ6A 3WB5A 4Q1XA 5OYWA 5OZ3A 4XX3A 5OZ5A 1EBYA 2QK5A 4J17A 2BPWA 3FNTA 5P52A 4Y3QA 2ZHRA 5P67A 2O4SA 5P6UA 4U7QA 5P66A 5IE1A 3N3IA 3OGPA 5KQZA 4IVSA 4Y3RA 2Q63A 1WBMA 1KJ4A 2P3DA 4QGIA 4J1FA 4BFBA 3GI6A 5OZKA 5HE4A 5P50A 5DQ2A 4L7JA 4Z2ZA 3S43A 5P5OA 3URLA 2OF0A 3QVCA 3VV7A 3WZ7A 4ZIPA 1IDBA 4Q1WA 3HBOA 2OHUA 2VJ6A 5BS4A 5P5NA 4I11A 5P0BA 3JVYA 4MC6A 3NUJA 5P86A 2G1SA 1B6KA 2R8NA 5P2SA 3DJKA 3TH9A 1AAQA 4ZE6A 3TOFA 5IVRA 3Q70A 1APTE 5P2LA 2RKFA 2V0ZC 2BPYA 5P6DA 4ER4E 5HVPA 5P7XA 5P6MA 5P2TA 4Y3HA 4TRZA 1G0VA 3HDKA 3OK9A 5P7ZA 5P01A 3OGQA 2XFKA 1FQ8A 4Y36A 2PYNA 1XL5A 1Z1HA 5COKA 5OYVA 3BXSA 5JG1A 3URJA 3EKTA 5P5TA 1QDMA 5OZSA 3VYDA 1KJFA 3L58A 5P7DA 4KE0A 5P6PA 1M0BA 2OHQA 4DQEA 4PEPA 3Q4BA 5P8KA 2F80A 1K1UA 4Y4EA 3PLDA 1NH0A 1HIHA 4FM7A 3EBZA 4HDPA 4Y37A 4LHHA 5P6FA 1VIKA 4AZYA 2AZBA 5P31A 2VNMA 3SACA 5P59A 5P20A 3FSMA 3S43B 4QLHA 5P46A 3OUAA 4J0YA 5P6IA 3EKYA 2ZJNA 5P33A 4DV9A 1FB7A 3PM4A 2IKUA 1K1TA 4Y5AA 2IGYA 1D4LA 3KFPA 5P4QA 5HDUA 5P80A 5JFPA 1PFZA 2VIYA 3KA2A 1WBKA 5P7CA 2JYSA 1NPVA 3ZLQA 3ER5E 2FLEA 4ZSRA 3MWSA 2APRA 4KUPA 3ZKGA 2QMGA 5P2FA 3OXVA 1GVVA 3LZYA 2I4XA 2OHTA 5IVTA 4YOBA 2I4DA 1GKTA 2FDDA 5P85A 2VJ9A 1FG6C 3S7LA 4NJSA 1HRNA 4FM8A 2WJOA 3GI0A 5OZNA 2BJUA 5P2KA 4F74A 5P04A 3S45A 1FMBA 3S8IA 2F3KA 8HVPA 4YBFA 3L59A 2CENA 3VF5A 3NDTA 1G2KA 1EPME 1TCWA 4Y5BA 5OZOA 3EM4A 4PPHA 1KJ7A 2WL0A 5P38A 2XFIA 4DJYA 3UCBA 4AA8A 2Q15A 4DQGA 3DCRA 5P1IA 4GJCA 3M9FA 2XFJA 3IXJA 5P82A 1HXBA 2F8GA 5P3ZA 1IBQA 5P6RA 4FSEA 3TTPA 1HSHA 1ZLFA 3D20A 3VG1A 1MEUA 5OZGA 4Y3GA 1M43A 5P81A 5P8MA 3PEPA 5C9BA 2VS2A 5P6VA 4Y3EA 4LL3A 4ZSMA 5P1FA 2BBBA 3CKRA 4J0PA 5OZLA 2IENA 4Y47A 3DOXA 4XKXA 5KQFA 4Y3FA 2NR6A 4DJRA 1YTHA 5P3DA 4A6BA 1T6EX 5P3PA 5P4YA 1XDHA 4HEGA 2ER7E 5P4SA 1W5YA 1TZSA 4DJUA 5AHCA 1GVXA 2AOGA 3BVAA 1GVWA 2FS4A 5KR8A 5P8EA 3KMYA 4Y9WA 2ER9E 2Q55A 2QZLA 1K6VA 2BB9A 1IZIA 2OHNA 4GJBA 4JPCA 4Y51A 4YD3A 1E82E 3K1WA 1EC3A 5AH9A 4MC1A 1F34A 4F76A 2AOEA 4Y4JA 1KJHA 3UDKA 5HD0A 2WF1A 3Q3TA 5P2YA 3QRSA 2ZHUA 3NXEA 3I6OA 1ZJ7A 4B72A 3HW1A 5P2BA 1BDLA 1EC2A 1HIIA 5P4NA 3TNEA 4I10A 3OUCA 1LF3A 2G1RA 3KFNA 3O9CA 1W51A 5P6KA 5J25A 5P6LA 5P5PA 4RROA 4RCDA 5P10A 4RRSA 1FLHA 1AIDA 1OD1A 5P17A 4B0QA 5P1GA 4ZPGA 4DJQA 1B6LA 5P4WA 5P18A 5P3NA 5P3SA 1DMPA 5JFUA 5P1WA 3HVGA 1FQ4A 5JODA 5P7NA 3KYRA 1BVEA 2VJ7A 3B7VA 5P0HA 4KB9A 3GGUA 4APRE 5P6ZA 2EWYA 4NJTA 5P7EA 1EPLE 5P8JA 3PB5A 2HB4A 3T6IA 1FG8C 2V12C 1LZQA 5P3RA 5P0RA 1BXOA 4YCTA 5OZIA 5P79A 3I25A 5P6AA 4Y3YA 3RTNA 5P05A 5P77A 3SFCA 2OAHA 3OADB 3SAAA 1AM5A 5P5RA 1MTRA 4OC6A 4Y4XA 2ZDZA 1XE5A 3O9LB 3K4VC 2RKGA 1TCXA 4RVXA 5P45A 2WEDA 1SDTA 4OBZA 4Y3TA 3UQRA 5OZAA 4Y5MA 3I7EA 5IS4A 2AQUA 2G21A 4D8CA 4EP3A 4Y4UA 1MRXA 3SQFA 5P4LA 5P40A 1YTJA 2FIVA 4DH6A 3HLOA 3NU6A 2AZ9A 5P7SA 2P3BB 5P1OA 1B6PA 5OZ0A 3LPIA 4I0GA 5P1JA 5P6TA 4FAFA 3DV1A 2QI7A 3EL5A 3UDMA 2QZKA 3EKPA 3GI4A 3MXEA 5OYYA 3UHLA 4LXMA 3D1XA 3PWRA 2ZJMA 1HWRA 3EM3A 2HS2A 4L6BA 2G24A 3L5BA 5DQCA 3FNUA 5OYRA 1C70A 4ZPFA 4D89A 4EXHA 2G1OA 1HVHA 2PH6A 3TPLA 4H3JA 5P2NA 1JLDA 1SP5A 3KT5A 4HDFA 4FL8A 2BQVA 1K2BA 2A1EA 2AVOA 3HVPA 3IA9A 4QJ2A 5T4SA 3VEUA 1BDRA 3TKWA 3ZPSA 2J9JA 5P5EA 3TPJA 5P34A 3OAGA 4ER1E 1BV9A 2B7ZA 5P12A 5P0EA 5BRYA 4I0DA 2FDEA 3IXKA 5P2OA 4Y53A 5P4JA 5P8VA 4B1DA 5C9FA 1XS7D 5P7MA 5P0SA 1HXWA 5DR4A 3TPPA 1HSIA 3HAUA 5KR2A 3PSYA 3O9AA 2OHKA 4I8ZA 4EQ0A 4EQJA 1META 1K6PA 4Y4WA 5P57A 3OUDA 3MXDA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 3OXW A;  2J9J B;  2ZJJ A;  3OAG B;  5P37 A;  3APP A;  1DW6 C;  1ZPA A;  2FGV A;  3NWQ A;  5P0J A;  5HCO A;  4R8Y A;  4Y4A A;  1ODW A;  2ZJI A;  3O9E A;  1QRP E;  4ZPE A;  5P48 A;  5UPJ A;  3K4V A;  3PHV A;  3IVI A;  1W6H A;  5DR7 A;  4H3G A;  3S2O A;  2F81 A;  2R3W A;  4Y4D A;  5P0I A;  3OUD B;  3NWX A;  5P1X A;  4B00 A;  5P7V A;  4AA9 A;  5P56 A;  4JEC A;  1FIV A;  1SDV A;  4DPI A;  2HIZ A;  4Y5K A;  5P00 A;  2WF4 A;  4DQH A;  3PJ6 A;  4B70 A;  1YX9 A;  3EMY A;  3TKG A;  1N49 A;  1KJG A;  4QJ8 A;  4QJ7 A;  1AJX A;  5DR1 A;  5P1T A;  4Y43 A;  1IZD A;  1HSG A;  3T3C A;  5P4T A;  3U6A A;  3QI1 A;  3EM6 A;  4HZT A;  4CPT A;  5HE5 A;  3UDY A;  2O40 A;  2MIP A;  3SA6 A;  1LYB B;  5P3I A;  3EL1 A;  1AXA A;  2AOC A;  1HPS A;  3PSG A;  2QI4 A;  3TOG A;  4Y39 A;  3SA3 A;  3KFR A;  5PEP A;  3NU3 A;  5DR8 A;  3LIQ A;  2WF3 A;  1LYA B;  2FMB A;  2Q11 A;  1C6Z A;  5P11 A;  5ISJ A;  2BKT A;  3FIV A;  1NSO A;  2VNN A;  5P6S A;  2QNP A;  5P7G A;  5P0D A;  4JOO A;  4EWO A;  4I0J A;  5I3Y A;  3UTL A;  1MER A;  2R43 A;  3NDU A;  5P3B A;  5HE7 A;  5P8Q A;  4WY1 A;  2VKM A;  2PWC A;  3FX5 A;  5P4X A;  1IDA A;  4AMT A;  4EXG A;  5P8L A;  5P4O A;  1HBV A;  5P35 A;  1APU E;  1GNO A;  5P8H A;  3G70 A;  1Z1R A;  4NPT A;  4Y41 A;  1XN2 A;  3LIY A;  3R1G B;  3ZKX A;  1FMX A;  5P0N A;  1PPK E;  4RCF A;  5P0G A;  2B7F A;  4GJ6 A;  5P72 A;  3INF A;  4YOA A;  4F73 A;  5P3W A;  5ER2 E;  2PQZ A;  5P7T A;  5OYQ A;  1OHR A;  4ACX A;  4LBT A;  4Y5P A;  3PMU A;  3UDN A;  5P06 A;  2JJI A;  5P4E A;  4M8X A;  4JPE A;  2IRZ A;  5P4H A;  5OYS A;  4Q1N A;  5DR3 A;  5P30 A;  1ZTZ A;  3U7S A;  5P3V A;  5KR1 A;  3PLL A;  3ZPT A;  3NUO A;  3NU4 A;  4JP9 A;  3PGI A;  5P3H A;  2QNQ A;  2O4L A;  1TW7 A;  5P0V A;  3UQX A;  4BEK A;  5OZH A;  4PZW A;  5E5J A;  5P39 A;  1PSN A;  3VFA A;  3BHE A;  2F3E A;  3OU4 B;  3AID A;  4A6C A;  2FNS A;  5P3C A;  3ZKM A;  2AVM A;  5ENM A;  5P8P A;  4RCE A;  5OZ4 A;  4Y3S A;  4UPJ A;  2WEC A;  1HVJ A;  5P4D A;  2PH8 A;  3OWN A;  4R95 A;  2J9K A;  1SH9 A;  3FKT A;  2AID A;  5OZF A;  2VA5 A;  3SM2 A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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