2V12C

Crystal structure of renin with inhibitor 8
Total Genus 83
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
83
sequence length
337
structure length
333
Chain Sequence
GNTTSSVILTNYMDTQYYGEIGIGTPPQTFKVVFDTGSSNVWVPSSKCSRLYTACVYHKLFDASDSSSYKHNGTELTLRYSTGTVSGFLSQDIITVGGITVTQMFGEVTEMPALPFMLAEFDGVVGMGFIEQAIGRVTPIFDNIISQGVLKEDVFSFYYNRDSSLGGQIVLGGSDPQHYEGNFHYINLIKTGVWQIQMKGVSVGSSTLLCEDGCLALVDTGASYISGSTSSIEKLMEALGAKKRLFDYVVKCNEGPTLPDISFHLGGKEYTLTSADYVFQESYSSKKLCTLAIHAMDIPPPTGPTWALGATFIRKFYTEFDRRNNRIGFALAR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Structure-Based Drug Design: The Discovery of Novel Nonpeptide Orally Active Inhibitors of Human Renin
pubmed doi rcsb
molecule keywords RENIN
molecule tags Hydrolase
source organism Homo sapiens
total genus 83
structure length 333
sequence length 337
chains with identical sequence O
ec nomenclature ec 3.4.23.15: Renin.
pdb deposition date 2007-05-21

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
C PF00026 Asp Eukaryotic aspartyl protease
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.40.70.10 Mainly Beta Beta Barrel Cathepsin D, subunit A; domain 1 Acid Proteases 2v12C02
2.40.70.10 Mainly Beta Beta Barrel Cathepsin D, subunit A; domain 1 Acid Proteases 2v12C01
3HZCA 3VF3A 3TLHA 5HE5A 2NPHA 1MPPA 4Y4AA 5P3EA 1B5FA 3UQXA 3FKTA 2QNQA 5P2JA 5P6FA 5P4MA 4J55A 1HIVA 4J5JA 4FM8A 1XL5A 4LXKA 1A94A 4GJBA 3BGBA 1K1TA 1YTHA 3QI1A 5P7FA 3KF0A 4DJRA 4RCFA 2R3WA 4GJ6A 3SA5A 3CKRA 1BV7A 2QNNA 3F9QA 4GJDA 3EL1A 3QPJA 5P1TA 1ER8E 1EPQE 4Y3AA 5P5ZA 5P80A 2PQZA 2PMAA 3OWNA 5P6GA 2G69A 3T7XA 5UPJA 3CKTA 5P5YA 5P33A 4I0DA 3UDRA 2EWYA 5P18A 3INDA 5OYQA 5P1SA 5P5BA 3DM6A 1SIPA 3B80A 4PEPA 5P4EA 5P51A 2B42A 3TL9A 3NYGA 4ZLSA 5HDVA 5P5FA 3LZSA 4Q5MA 5KQFA 2QMFA 5P7SA 5P4FA 3RVIA 3HD8A 5P30A 4R5NA 4FRJA 2APRA 4I12A 5E5KA 3FV3A 4F74A 1HPXA 1QBTA 5P0AA 5P1QA 1HTGA 4Y3GA 3O9BA 5P4XA 2ZJHA 3Q4BA 4KE0A 5P5XA 4ER4E 1XS7D 3BXSA 1IZEA 4Q1NA 2J9KA 3VV8A 4J1KA 5P3RA 5P00A 4UPJA 2WEZA 5OZHA 1ZLFA 1T6EX 4APEA 4CPUA 3GW5A 5KR8A 1APWE 1WBMA 4CPXA 3NU9A 1Z1RA 2QI3A 3NSHA 5P8CA 4F76A 4OC6A 1G35A 5OZXA 5P53A 1XDHA 1QBSA 3KMXA 1XL2A 2BPXA 5C9BA 4GJ5A 1K6VA 5ENMA 3BUGA 2OHLA 4YD5A 3EKPA 2HIZA 1PSAA 1ZJ7A 3EBZA 5OYUA 1RL8A 1YG9A 4WY6A 3U7SA 4Y5CA 3VFBA 2UY0A 1KJ7A 3GGVA 2IKOA 1APUE 5P07A 5P6EA 5P13A 3PWMA 3CMSA 2WF2A 1FMBA 3OUCA 5P23A 5P65A 4COEA 5OZWA 4R93A 2QI0A 3Q3TA 5OZRA 3OXXA 4YBIA 3VF7A 1NH0A 5P85A 5P5AA 8HVPA 4HA5A 4Q1WA 3SAAA 7HVPA 1ODXA 3PSUA 5P3MA 4B1DA 4PPHA 4DJUA 5P7AA 5P8EA 1HIHA 4U7VA 3UQRA 2QZWA 3VLBA 1BDQA 3KFRA 5P8OA 5OZ1A 3KDDA 3OADB 5P5NA 1LYWA 3PHVA 1NPWA 5P7EA 5P5JA 4I0IA 5P47A 1HPOA 5P0NA 3UDNA 3KN0A 1AM5A 1TCXA 5P6XA 3QRMA 4J0YA 1PFZA 2BPZA 3A2OA 5P8FA 3ER3E 4GB2A 5EZXA 5P8GA 1F34A 3BGCA 3TTPA 3URIA 3ZKNA 2MIPA 1TSQA 4MC2A 4FIVA 5P7LA 2OHTA 4YOAA 5P1JA 1J71A 5OZ6A 3SQFA 5P1IA 2J9JA 2I4UA 4K9HA 5P2NA 1GNOA 2FLEA 2B7FA 1FQ5A 5OZVA 2OHNA 5P08A 4Y3HA 1OHRA 1A8GA 1RQ9A 1B6PA 4XKXA 3O9FA 5P8HA 3UFNA 1EBYA 3L5EA 3OQDA 2UPJA 2SAMA 5P63A 2QHYA 4J1EA 3UCBA 3R4BA 5P5MA 5P4ZA 1AIDA 4Y57A 2WF3A 2PK5A 4CP7A 2ZE1A 5P7PA 5P0YA 5OZOA 5DR7A 1IBQA 1RPIA 3T11A 4Y5EA 3IN4A 1ODWA 5P3VA 2QHCA 1IZHA 3SPKA 2HS2A 3LIXA 3LITA 3ST5A 3ZKGA 2V13A 2NNPA 3VSWA 5F01A 2BJUA 5JG1A 2QU3A 2AOHA 3PCWA 4LXMA 1TW7A 2Q15A 5P4NA 4WTUA 3NR6A 5OZ9A 5OYSA 4Y3PA 4CPTA 5E5JA 4DJYA 2XYFA 1HVHA 3PEPA 5COKA 4ZIPA 1W6HA 5AHAA 1EC2A 5P2TA 3PCZA 2HC0A 4F75A 3RTHA 2JYSA 4WY1A 4RYGA 3VFAA 2G20A 1LV1A 4Y38A 4GIDA 1C6YA 1YT9A 2OHPA 3TPLA 5P6SA 5P2RA 5P77A 1GVUA 5COPA 5P4QA 4Y4UA 3UFLA 5OZLA 5HE7A 4DJWA 2PWRA 5P8PA 5P01A 3EKVA 3HW1A 4QJ7A 1HVSA 5P6MA 1EPME 4LL3A 5IE1A 4Y4JA 1FKNA 5P4PA 4Y45A 5C9FA 1FQ4A 4GJCA 1MSNA 2OHUA 5P7UA 1G0VA 5OZ5A 4EJDA 5P7BA 4Y3SA 5P3CA 3UQUA 2FS4A 5SY3A 5P43A 4AA8A 2P83A 5OZTA 3L5CA 4J0ZA 1E81E 5P72A 5P3ZA 3MSJA 4XXSA 1NPVA 3SA8A 4B77A 3L58A 3ZLQA 1FB7A 2HPFA 1HXBA 3O9DA 3OU1B 4Y43A 4TRYA 4CPQA 5P2XA 3URJA 4D83A 2QNPA 2IQGA 5P66A 2V0ZC 4Y4EA 4AMTA 2O4LA 5P3DA 3TOFA 5P6NA 3Q70A 3NU5A 3FNTA 5P6PA 2PYNA 4ZEAA 2G1RA 4I0ZA 3UHLA 3KFSA 4YD7A 5P1PA 3O9CA 3DV1A 5P22A 4RROA 1LF2A 3B7VA 5P4LA 4OBGA 3BUHA 4DI2A 4RRNA 4B00A 1YM4A 2VIYA 1YTGA 5P0SA 5IVQA 1DW6C 4MC6A 1EC0A 4I0HA 1APVE 1Z8CA 6UPJA 1PPLE 1HTEA 3PI0A 3UDHA 2BKTA 3VCMA 5P6QA 2QMDA 4FRIA 5P3WA 1ZAPA 5P1EA 1IZIA 5ISJA 4K8SA 4Y3RA 5P2FA 5OZBA 4FM6A 5P0FA 3KDCA 4GJ9A 1QBUA 5P4SA 3D3TA 1PROA 5P3YA 3EL9A 4H3IA 4EQJA 1C6XA 1NSOA 3NU6A 2G24A 2NXLA 3GGAA 1META 2ZJKA 5P7CA 4Y54A 5HU1A 4Y5NA 2G21A 5P14A 5P32A 5P2IA 3EM4A 2RENA 3QBHA 3SFCA 1SMEA 1MRWA 2WECA 5P54A 4HEGA 1FMXA 5P5TA 4DVFA 1C70A 2ER7E 4HDPA 5P2CA 5OZUA 4QJ6A 5P52A 1LF4A 3U6AA 5P10A 2ANLA 2QZXA 5P25A 3LHGA 4LP9A 5J25A 3S53A 1RNEA 5P1GA 2AZ9A 5P38A 3R2FA 2ZJMA 4FRSA 1HVCA 3URLA 4OBDA 3H0BA 4YDGA 4OBKA 5P05A 3K5CA 4Y9WA 2AVSA 1IDBA 3OTYA 4Y5PA 5SXNA 1LEEA 1FMUA 2AZ8A 3HAWA 4NPTA 2OHMA 3RTNA 1N49A 1E80E 5P7ZA 5P20A 3WZ6A 4HZTA 3LZVA 3PVKA 1HSHA 2PSVA 2H6SA 7UPJA 1VIKA 3TKGA 5P39A 1FIVA 4Y3NA 5HVPA 3EC0A 5IVTA 1W5WA 2AOIA 4EXHA 4YBFA 1BAIA 1UH8A 3VYDA 5OZKA 3G70A 5P3TA 4Y48A 3S7LA 5P5PA 3EKTA 2AODA 1AJVA 4I10A 1E5OE 4KUPA 3SO9A 2A4FA 5P1HA 1AVFA 4Z2ZA 1B6LA 2VA5A 4RCEA 5P7KA 3PBZA 4GJ8A 5P2UA 1MTBA 4I11A 2O4NA 4L6BA 3D1YA 3O9LA 5P89A 5OZGA 4NKKA 1EC1A 5DQ4A 2WEDA 4Y41A 3CYXA 4FM7A 5P3SA 5P88A 5P19A 5P8VA 5P7JA 1HVJA 3O9IA 3PLDA 3UQPA 4DV9A 5DR4A 5P6UA 2R5PA 1EPOE 4GYEA 3UPJA 5DPZA 5P7WA 2AOCA 5P5KA 5OZMA 3LIVA 3QS1A 5OZYA 4JPEA 5P7NA 1Q9PA 4Y5MA 5P8UA 1EPPE 1UH7A 3I6OA 5P8LA 3BHEA 4E43A 3ZPUA 5P1RA 3ZKSA 2R3TA 3I2LA 4DQBA 2IGXA 3OOZA 1K2BA 5P2LA 5P78A 4TVGA 2FDEA 2PYMA 5P5DA 5HU0A 3QVCA 5P1MA 3IXKA 1OEXA 4BELA 1SDVA 4Y4GA 3PMUA 1AZ5A 3OAGA 5P7XA 3H5BA 1IDAA 5P0WA 1TCWA 4R95A 3DJKA 4OBZB 3EXOA 3SACA 3LINA 5OZSA 5P6LA 4ZSPA 1EBZA 3OY4A 3S2OA 2QD8A 4J0TA 5P36A 5P31A 3UTLA 5KR0A 4DFGA 1T7IA 4L1AB 2VIJA 3FSMA 5T4SA 2ZYEA 4DUSA 1D4HA 2P4JA 3CIBA 1RV7A 5P0UA 1PSOE 3ER5E 5P03A 1ENTE 4Y36A 3KA2A 5P7DA 4YA8A 4TRZA 3PLLA 4Y3ZA 2PSGA 3VF5A 2ZHUA 5P16A 5OYWA 3R0WA 3SKFA 2AOEA 3S85A 5P06A 3OQAA 4NJSA 2PSUA 4QJ2A 4Y3EA 5P0MA 1T3RA 5P0ZA 1F7AA 3S43B 5P3KA 1A30A 1FG6C 4J0PA 5P67A 5P71A 1WKRA 4KE1A 3JW2A 3TOGA 1BWAA 4PYVA 1ZPKA 1LF3A 3T7QA 1BVEA 5P0DA 5OZNA 1E82E 4R92A 1KZKA 2Q5KA 3OQFA 5P4RA 4S1GA 1UPJA 2AZCA 3EL0A 3SABA 4DPIA 5P6IA 3UQWA 5P5HA 4JOOA 1HVRA 3LIZA 4B1EA 1SH9A 3T7PA 2ZJJA 5P34A 5DR1A 2NR6A 3ZPTA 1YX9A 5P6JA 5ENKA 2QP8A 1MESA 4EPJA 3QAAA 5P2AA 1FGCC 3SM1A 5P8AA 2I4XA 1DPJA 5P0XA 5P61A 1SGZA 6FIVA 3NXNA 5P2DA 2OHRA 3LNKA 2IDWA 3OXCA 2VS2A 5P5OA 2VIEA 3PWWA 3S7MA 5P2YA 2WKZA 3NWQA 1FFFC 5DQ1A 5KQZA 9HVPA 3VV7A 4PZXA 4NJTA 1MT9A 2B7ZA 1W51A 5OZJA 2QMPA 2OHSA 4Y53A 1ZSFA 4Y3YA 2VJ7A 4Y3XA 3ZKQA 5OZEA 4Y4BA 5P1CA 3OUDB 5DQ2A 4Y3DA 1DP5A 4TRWA 4DJQA 2BKSA 3S8IA 2G27A 2AIDA 3IVHA 5KOQA 4Y3TA 1MEUA 5P3XA 1XN3A 3K5DA 2VJ9A 1D4SA 1MVPA 2G1NA 3LZUA 1W50A 5P50A 3APPA 5P74A 4OD9B 4Q1YA 2NXMA 5P8JA 2WJOA 5OZZA 5AH7A 2I4WA 5IS4A 2CENA 2RMPA 4Y5LA 4DQEA 5P2MA 3VYEA 2QI5A 3PGIA 5P8DA 1EPRE 3QN8A 3G6ZA 2BB9A 4Y4ZA 5P2HA 2I1AA 1TZSA 3FNSA 4KB9A 3GI5A 2FNSA 2ZHVA 5P60A 5P8RA 5P4HA 2I4VA 1M0BA 2XFKA 4HVPA 3QIHA 1HTFA 2F8GA 4Y4WA 5P5WA 5HD0A 1XE5A 3LIYA 2FMBA 5OZDA 2NMZA 5P1LA 2QI4A 2AOFA 4Y5BA 1SDUA 4Y4DA 5KR1A 4Y3QA 1HTRB 4EJLA 2IKUA 3MSKA 4J1IA 2OAHA 3GGUA 4I8ZA 5P2EA 2P3BB 5P5QA 1CZIE 5P3AA 4K4RA 2QD7A 3G72A 2V00A 5P3HA 5P0IA 4B05A 5P73A 4Y5AA 3PSYA 4QJAA 3OHHA 4Y3WA 1PSNA 4HDBA 2O4SA 1UH9A 3U71A 1CPIA 4Y3LA 2G1SA 3IVIA 5P3BA 5P46A 2FDDA 3PMYA 3GI4A 2G94A 3JVWA 5I3YA 5P12A 3RU1A 1B5FB 3IGBA 3EKWA 4YOBA 5P0GA 4IVSA 1BXQA 4OBZA 4YD6A 5AH9A 5DR8A 4CPSA 4Y3JA 5OZFA 3ZOVA 5P79A 1D4YA 1MERA 2Q3KA 5P11A 1AJXA 4HE9A 4EP2A 4IVTA 5P81A 2PWCA 1MT7A 1KJGA 4R91A 3OUBA 2I4DA 3EM6A 5P1XA 4D8CA 4YD3A 2O4KA 5P1WA 1GVVA 4JP9A 4EYRA 5P5RA 2OHQA 3NDWA 4MC1A 2ER6E 5P4GA 5OZ0A 4ZSQA 5P64A 5P8KA 3WB5A 2R38A 4DQGA 1BDLA 1VIJA 3L3AA 2WHHA 5P09A 3OUAA 2G22A 5P4UA 5P87A 3ZKXA 2ZJNA 5HCOA 5ER2E 2RSPA 1IZDA 4YDFA 2AVQA 2Z54A 3PM4A 3TPJA 5P3FA 1LYAB 4OC6B 4I0GA 4I0JA 5OZQA 3OADA 5P4TA 2WL0A 2FGVA 5P8BA 3SA7A 5P28A 2PH8A 3KM4A 1LS5A 5BS4A 2P3AA 3BUFA 4H3JA 5P24A 5P0RA 4YCYA 3OQKA 5P8QA 5HDXA 2PK6A 1XN2A 4L7HA 1ZPAA 5KOSA 3PRSA 3Q5HA 5OYZA 5EZZA 2QI7A 5P57A 2V16C 2OHKA 4YCKA 3NWXA 5P7HA 4DJOA 5P0JA 4D85A 4Y6MA 5FIVA 3N3IA 1DMPA 4NJVA 5OYYA 4NJUA 3PBDA 3EKQA 3HBOA 5COOA 5P2VA 2QMGA 4RZ1A 5IVRA 2O40A 1D4LA 1EBWA 5OZ8A 3SA4A 1W5VA 2B8LA 3I25A 5P7GA 3K4VC 1B6JA 3UDMA 5SZ9A 5P6VA 3S56A 2WF1A 1ME6A 1LYWB 4RYCA 2G1YA 3PB5A 5P3QA 4Q1XA 1XE6A 1AXAA 4Z4XA 3VV6A 2JJIA 3L59A 5P4KA 3GI6A 5P58A 5OYVA 4I0EA 4TVHA 1TSUA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 3HZC A;  3VF3 A;  3TLH A;  5HE5 A;  2NPH A;  1MPP A;  4Y4A A;  5P3E A;  1B5F A;  3UQX A;  3FKT A;  2QNQ A;  5P2J A;  5P6F A;  5P4M A;  4J55 A;  1HIV A;  4J5J A;  4FM8 A;  1XL5 A;  4LXK A;  1A94 A;  4GJB A;  3BGB A;  1K1T A;  1YTH A;  3QI1 A;  5P7F A;  3KF0 A;  4DJR A;  4RCF A;  2R3W A;  4GJ6 A;  3SA5 A;  3CKR A;  1BV7 A;  2QNN A;  3F9Q A;  4GJD A;  3EL1 A;  3QPJ A;  5P1T A;  1ER8 E;  1EPQ E;  4Y3A A;  5P5Z A;  5P80 A;  2PQZ A;  2PMA A;  3OWN A;  5P6G A;  2G69 A;  3T7X A;  5UPJ A;  3CKT A;  5P5Y A;  5P33 A;  4I0D A;  3UDR A;  2EWY A;  5P18 A;  3IND A;  5OYQ A;  5P1S A;  5P5B A;  3DM6 A;  1SIP A;  3B80 A;  4PEP A;  5P4E A;  5P51 A;  2B42 A;  3TL9 A;  3NYG A;  4ZLS A;  5HDV A;  5P5F A;  3LZS A;  4Q5M A;  5KQF A;  2QMF A;  5P7S A;  5P4F A;  3RVI A;  3HD8 A;  5P30 A;  4R5N A;  4FRJ A;  2APR A;  4I12 A;  5E5K A;  3FV3 A;  4F74 A;  1HPX A;  1QBT A;  5P0A A;  5P1Q A;  1HTG A;  4Y3G A;  3O9B A;  5P4X A;  2ZJH A;  3Q4B A;  4KE0 A;  5P5X A;  4ER4 E;  1XS7 D;  3BXS A;  1IZE A;  4Q1N A;  2J9K A;  3VV8 A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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