2V12C

Crystal structure of renin with inhibitor 8
Total Genus 83
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
83
sequence length
337
structure length
333
Chain Sequence
GNTTSSVILTNYMDTQYYGEIGIGTPPQTFKVVFDTGSSNVWVPSSKCSRLYTACVYHKLFDASDSSSYKHNGTELTLRYSTGTVSGFLSQDIITVGGITVTQMFGEVTEMPALPFMLAEFDGVVGMGFIEQAIGRVTPIFDNIISQGVLKEDVFSFYYNRDSSLGGQIVLGGSDPQHYEGNFHYINLIKTGVWQIQMKGVSVGSSTLLCEDGCLALVDTGASYISGSTSSIEKLMEALGAKKRLFDYVVKCNEGPTLPDISFHLGGKEYTLTSADYVFQESYSSKKLCTLAIHAMDIPPPTGPTWALGATFIRKFYTEFDRRNNRIGFALAR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Structure-Based Drug Design: The Discovery of Novel Nonpeptide Orally Active Inhibitors of Human Renin
pubmed doi rcsb
molecule keywords RENIN
molecule tags Hydrolase
source organism Homo sapiens
total genus 83
structure length 333
sequence length 337
chains with identical sequence O
ec nomenclature ec 3.4.23.15: Renin.
pdb deposition date 2007-05-21

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
C PF00026 Asp Eukaryotic aspartyl protease
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.40.70.10 Mainly Beta Beta Barrel Cathepsin D, subunit A; domain 1 Acid Proteases 2v12C02
2.40.70.10 Mainly Beta Beta Barrel Cathepsin D, subunit A; domain 1 Acid Proteases 2v12C01
2FDDA 4DJOA 5P37A 4A6CA 1E5OE 3DK1A 5KQZA 5OZCA 2G20A 2Q55A 2BBBA 1K6CA 1A94A 2UPJA 2OHKA 1FQ7A 1NH0A 1IVPA 3D1XA 5P7HA 3LIVA 5IS4A 4RLDA 5P6QA 3PLLA 4ZSPA 3CKPA 4GMIA 5P04A 2QAKA 5P85A 5COKA 4LXAA 3S45A 1W6HA 5P7PA 4DQFA 5KR1A 3R1GB 1MEUA 3SACA 3QPJA 5P0EA 5P59A 3LPJA 3L3AA 5P7DA 3OADB 5SY2A 5HCOA 2AOGA 5P3YA 1AAQA 5P1EA 4YD4A 2RMPA 4Y3EA 4DPIA 5P8CA 5OZZA 2G69A 1MESA 2QI4A 4B70A 3T7PA 3PSGA 5P08A 5P5CA 2PK5A 4J0TA 5AH7A 4PZWA 3VV8A 3PM4A 3PHVA 4XX3A 4A6BA 4EQ0A 4Y58A 3T7XA 5P8IA 4K9HA 2QU2A 3KA2A 5P24A 1EAGA 1HSIA 3O9FA 3SQFA 2I4XA 3PB5A 1FGCC 4YOBA 5P6NA 4ZSQA 2QD8A 2V12C 4YA8A 4YHQA 5OYRA 2R5PA 4LBTA 3LNKA 5P5ZA 5P8JA 5ENMA 2PSUA 2F3KA 4EJ8A 1W5VA 4GJCA 5OZNA 2R38A 4Y38A 5P4VA 3VLBA 3ER5E 5P26A 2XYEA 3PVKA 2ZJMA 4X2LA 5JG1A 1FMXA 4B72A 5P4LA 1IZDA 3O9DA 5P4TA 4DQHA 4IVTA 1EPPE 5P5MA 4Y5GA 1TSUA 5HTZA 2VKMA 3HLOA 1YTGA 5P0SA 1YTHA 5P8AA 3BRAA 5P52A 1QS8A 3N3IA 1HEGE 1IZHA 2IS0A 2AZCA 5P22A 2CEJA 3SA9A 5P3MA 4R92A 1LYWB 1GVUA 3K4VC 3PMYA 3EKQA 5OYUA 3OXCA 3MSKA 2WEBA 5P8PA 4FRSA 5P0CA 1PPLE 2EWYA 5P0MA 2RKGA 5P12A 1EC0A 1PFZA 3EXOA 1HVHA 1MSNA 5EZZA 2V0ZC 1GVTA 4YBIA 1EPME 5P16A 4D89A 4YD7A 5P1XA 5P7OA 1C6XA 1BXOA 1UH8A 4Y5LA 5P6GA 1UPJA 4Y3ZA 4Y36A 3MXDA 5CLMA 5P0BA 5P7WA 5P6HA 4I1CA 5KR0A 3VLAA 3VFBA 1YT9A 1ODYA 2PH6A 4GJDA 5IVQA 5P7IA 1ODWA 5T4SA 2UXZA 5PEPA 2HS2A 3Q4BA 4KE1A 5P5IA 5P8GA 1W5XA 4Y5CA 3EKXA 4OBFA 5EZXA 5P4OA 4YDGA 5P0FA 2Q5KA 2NR6A 5P14A 3D1YA 1HVRA 5ER1E 3RVIA 4LHHA 3NR6A 5P7XA 4I8WA 1G6LA 4OBDA 3U7SA 5P1RA 4FGXA 5F01A 5P68A 3QRSA 2VJ7A 5P1OA 2G22A 1NPWA 3FIVA 4TRYA 4PZXA 5BRYA 2ZE1A 2Q11A 1WKRA 3S54A 6FIVA 1TCWA 4JPEA 7HVPA 1BILA 5P1SA 3QVCA 4M8XA 3AIDA 2NXMA 5P61A 3PMUA 4GJBA 4Y5MA 3ZKNA 4FM6A 2BKSA 3G6ZA 3T11A 2ASIA 1D4YA 5HVPA 1HVKA 1XE5A 1TQFA 3TOFA 1EEDP 4FM7A 1ER8E 4Y3SA 3GI6A 5OZ3A 3ECGA 3S8IA 1VIJA 4F74A 5P62A 3H0BA 4TRWA 5P8NA 1XDHA 5E5KA 2OHMA 1LYBB 2QI6A 5P6RA 4J1CA 5P4CA 4I0HA 5P5DA 2VIYA 4Y3AA 3EL9A 5P0AA 5IVTA 3FSMA 3RU1A 2BJUA 5OZRA 3OQDA 2A4FA 3UTLA 5P3HA 1VIKA 1NPAA 2G1RA 4FCOA 4J55A 4B1EA 5P3GA 4J1IA 5OYYA 3VV6A 1D4HA 1LEEA 1AZ5A 1W6IA 4H3JA 2AOIA 4Y3WA 5P44A 5P5BA 4I0IA 4TVGA 1SBGA 2WKZA 5OZIA 4QJ2A 5P2KA 5IVSA 4LXMA 5P1FA 4CMSA 4AA9A 3HVPA 5P8OA 3KT5A 2Q15A 5APRE 5HU1A 2Q3KA 1RQ9A 2QZKA 4NKKA 2Q64A 4FL8A 3NUOA 2ANLA 1JLDA 1KJHA 2APRA 4J17A 1HVLA 4PPHA 1C70A 5P0YA 4ZSRA 5OYSA 4DUSA 2QD7A 3KM4A 1AJXA 1B6MA 5P4SA 1K6VA 2FNSA 5P7CA 1HHPA 3F9QA 2OHPA 1MVPA 4ER1E 5P3KA 3BGBA 1OEXA 3QVIA 5P6WA 4AA8A 2PSGA 5P5RA 3WZ6A 2O4NA 1APVE 3OADA 2G1OA 3O9AA 4Y3YA 3RTNA 3T7QA 3OOZA 4Y5PA 2QMPA 5P3TA 5P3QA 4TVHA 5P8QA 1AXAA 1D4JA 5P0PA 1PPKE 5P7LA 5P0NA 5HD0A 5P63A 3FV3A 4NJTA 5P0OA 4Y54A 2CEMA 5AHAA 5AH6A 3L58A 4RGHA 2J9KA 3KMXA 3TKWA 5P13A 2G24A 2WHHA 4Q1XA 2AOHA 5OZEA 5ISJA 5P4UA 3VYEA 1A8KA 1B6PA 4H3IA 2RKFA 5P20A 4YD5A 5P0HA 1YX9A 3OU3A 3NWQA 5P6IA 5P72A 5JODA 5P2TA 3OUCA 1HEFE 4Y57A 5OZSA 3R2FA 4QJ9A 3RTHA 3EL0A 1ZSFA 5P4DA 3U71A 3UDNA 3QBFA 1XL2A 4Y9WA 3PCZA 4LC7A 2ZDZA 4R91A 3VUCA 3K5FA 2G26A 4Y3JA 4I0EA 1MT9A 1QBSA 2BPWA 4AMTA 3UDMA 1T7KA 5BS4A 5P8BA 4LL3A 2PWCA 4OD9A 1BVGA 1CZIE 5P2HA 5P75A 1YTJA 2I4UA 5P2CA 1HTRB 2WEDA 1EPOE 3O9HA 3D91A 5OZQA 3EBZA 3SA8A 3T3CA 4FIVA 4Z22A 4Y50A 4PEPA 4LAPA 4YCYA 4AZYA 1KJ4A 5P43A 2AOFA 4H3GA 2O40A 5OZGA 3NWXA 1MTBA 5P69A 2AVQA 1PSNA 5ER2E 1EC3A 3O9CA 1HBVA 2XFKA 2V00A 3TOHA 3L5BA 5OZLA 2FXDA 2OHUA 5OYWA 3EM4A 2QI5A 3O9EA 2G27A 3BHEA 4N00A 4U7QA 2NMYA 1FKNA 2OF0A 3EKVA 2OHTA 4B05A 2P3CA 5P2AA 4EJDA 1MT8A 3ZOVA 3Q5HA 2AOCA 3OTYA 2MIPA 5P4RA 4DH6A 2AVVA 5P2EA 4Y3NA 5BWYA 5P3LA 5DGUA 5P46A 3LZVA 3CIDA 5KQFA 3KFSA 4Z2ZA 4RYCA 5P1YA 1EBWA 5OZWA 5P7JA 3EL4A 3OU4B 4RZ1A 5P47A 1HVCA 5OZJA 2AODA 1TSQA 3TLHA 3NDXA 4CPWA 5P3CA 2WF2A 1B11A 4FSLA 5P6TA 5P81A 5P3WA 1ME6A 1B6JA 5OZ1A 2B7ZA 3OU1B 4Y6MA 5P8UA 5C9DA 5P88A 5P1UA 4YOAA 4Y53A 3KDCA 4R8YA 3HD8A 2P3BB 5P2RA 3WB5A 1EBKC 5P78A 4Y3TA 4DJWA 1FIVA 3VSXA 3OGQA 4Y3HA 4HVPA 4B00A 1ZPAA 5P1DA 4DJYA 5P5OA 2IRZA 2QI1A 1ENTE 5P6OA 3UQRA 3GGXA 4B77A 1E80E 5P6PA 2WF3A 3S2OA 5DQCA 1HPXA 3O99A 4L6BA 1J71A 5OZYA 2QP8A 4Y4EA 3AUPA 1FQ5A 1HIHA 5I3XA 4RYGA 1WBMA 3ZKMA 1APUE 3NDUA 5P6MA 5P6JA 4DJQA 1U8GA 1K2CA 1ZSRA 4Y5BA 1AIDA 4BFBA 4Y4DA 3MXEA 3VF5A 5P01A 2V13A 1FFFC 4R5NA 3OOTA 3M9FA 4H3FA 5P0RA 3UCBA 4NJUA 5OZDA 5P1BA 4B0QA 4GIDA 1FQXA 5DQ4A 5P6KA 2JXRA 3OXWA 4ER2E 1Z1RA 1BBSA 3KF0A 5P2IA 5P48A 1SIPA 4GJ8A 4EXGA 1SMEA 5P6VA 3LIZA 2G1SA 5OZ0A 5P76A 1D4LA 4Y3GA 1FQ6A 1HSGA 2SAMA 4Y4WA 4E43A 5P8HA 1HXBA 3K5DA 2HB3A 3UQXA 3I7EA 1LF4A 2XYFA 5AH9A 5P4BA 3RSXA 3EM6A 1HIIA 2R3WA 5DQ1A 5P6XA 4Y39A 4BEKA 5P7EA 5P4IA 4HDBA 2VS2A 4EHCA 5P4HA 1NPVA 2ZJLA 3L5CA 2FXEA 3O9IA 3UPJA 5P5JA 1EBYA 1T3RA 3TKGA 3UDQA 5P4WA 3ER3E 3L5DA 1GNNA 1EPLE 1BWAA 3O9LA 3S7LA 3HW1A 2B60A 3OHFA 1ZTZA 5P70A 5CONA 1PROA 4EYRA 5P8VA 5KOSA 2I4QA 3NXNA 5P1MA 5P3FA 5P2XA 2WF1A 5P1TA 3PCWA 3T6IA 3UQWA 5P2QA 3KFNA 5P2YA 4Y4ZA 4L7JA 3S7MA 3PLDA 5P83A 3TPPA 5OYVA 2BB9A 4I0DA 3S53A 3B80A 3TPRA 5AH8A 1LYAB 2OHSA 1AM5A 3UDRA 4APRE 5P30A 2IKUA 2PC0A 3IVHA 3GI0A 1FMUA 5OZUA 4BFDA 5P2NA 3UDJA 2IENA 5P1HA 3K1WA 3PEPA 3NDTA 1HSHA 6APRE 3QP0A 1HWRA 2QI3A 1B6LA 5P87A 1GNMA 2G94A 5P3JA 1MERA 1OD1A 2HPEA 3SPKA 5P3PA 1LF2A 5P4KA 3D3TA 2VA5A 3HZCA 3SKFA 3MSLA 2NNKA 2UY0A 5P6ZA 5B18A 3BVBA 3VEUA 3QBHA 5SXNA 3I2LA 1M4HA 2O4LA 4ZEAA 2JYSA 4U7VA 4L1AB 1CPIA 5P5EA 2IQGA 2O4SA 2WECA 2ZJJA 2HS1A 5P0ZA 2WJOA 4HEGA 4FE6A 5SY3A 4FS4A 5P1VA 5P5HA 4MC2A 4CPTA 5P5UA 5E5JA 3URJA 3BUHA 5HDUA 4EP3A 2VIZA 5P7TA 1UH7A 4Y3RA 1Q9PA 3JVWA 2ZJKA 4J1KA 2FS4A 1SH9A 1IBQA 5P6FA 3L5FA 3S43B 5DR7A 2ZYEA 3VF7A 4JPCA 2ER9E 5OZBA 5P5AA 3WB4A 3OGPA 5P09A 4Y5NA 1PPME 1WBKA 2F8GA 5P41A 2ZGAA 4Y4GA 2PQZA 2P3AA 4GZFA 1ZPKA 3IAWA 5P03A 5P51A 2NMZA 4OBKA 5P3UA 1GKTA 3OHHA 3LPIA 3PI0A 5P5FA 4OBGA 1OEWA 2VA7A 4MC1A 5P1NA 4GJ9A 3DV5A 1DIFA 3QRVA 5P5YA 4Y37A 1T7JA 4Q1YA 5P7ZA 3LHGA 3PWRA 4Y47A 1ZJ7A 4EWOA 3BC4A 2IEOA 3LIQA 5P7SA 5KQXA 1YM2A 1MSMA 2R43A 1G2KA 1HXWA 7UPJA 1QDMA 1C6ZA 5P23A 3L38A 1TCXA 1RNEA 2QZXA 3KDDA 4HDPA 5P28A 3OUAA 5OZTA 2Z4OA 4D85A 1K6PA 3CKTA 3I8WA 3OQ7A 4D8CA 3QAAA 2HB4A 2FMBA 1SP5A 4NJSA 3QROA 5P3SA 5P1JA 2ZHTA 4CKUA 1EBZA 4JECA 5I70A 2PH8A 3U6AA 3EL5A 2P3BA 4Q1WA 4ER4E 2OHRA 4OC6B 5P7BA 4KB9A 3LIXA 4EP2A 5P2DA 1ZBGA 1BV7A 1IZIA 5DR8A 1KJGA 1MRWA 5P27A 3OUDB 4DQGA 4CPXA 4ZPEA 2IGYA 1RL8A 4YD3A 2XFJA 9HVPA 3FKTA 3BXRA 2AOJA 4MC9A 4Y3PA 5P4XA 5P79A 3PRSA 1NSOA 2B42A 4H1EA 4B78A 5P1PA 4RCEA 4UPJA 4HZTA 2G21A 5OZ5A 5OZXA 2P83A 2AZ9A 3B7VA 4Y3LA 3PWWA 2I4DA 5P3DA 2H6SA 3IGBA 5P31A 5KR2A 5P42A 4TRZA 2PK6A 4EPJA 5KR8A 4HDFA 3LITA 5P64A 2RSPA 5FIVA 3K5CA 1E81E 1ZAPA 5P60A 4YE3A 4Y4JA 4ZE6A 4Y3XA 4Y5EA 4GYEA 5P8LA 5P0KA 5P06A 1SDUA 1A8GA 5P80A 5SZ9A 1W50A 3ZMGA 5P7QA 4PYVA 3WZ8A 3ST5A 5P5QA 5P2VA 1HVSA 2JJJA 4EQJA 4M8YA 3IVIA 3SM1A 3OQAA 3VG1A 4DQCA 5OZ9A 1YM4A 2PSVA 2HB2A 2V11C 4YCKA 5P7MA 2F80A 5P82A 3Q70A 3MSJA 3CKRA 5HU0A 4Y45A 5P3AA 3WSJA 5P40A 5P4JA 2NTRA 4QJ7A 5DR1A 5P0JA 4RRSA 5P29A 5P0UA 1LYWA 2VJ9A 1GVWA 4LP9A 1IDBA 2NNPA 3SABA 2I1AA 5HCTA 5OZOA 5ENKA 5P86A 2BPXA 4CP7A 3SA4A 3NU9A 3D20A 5P11A 2R9BA 1B6KA 5F00A 3CICA 3EL1A 4D83A 4A4QA 2HIZA 2IGXA 3QIHA 4Y4XA 5P2SA 5P2JA 3EKTA 4KUPA 2I4WA 1G35A 1HVIA 5COPA 2Z54A 2ZHVA 1GVXA 5P5XA 3ZLQA 1ZLFA 2QHZA 2B8LA 3SFCA 3Q6YA 5P4EA 3IXJA 5OZ6A 1B5FB 4WTUA 5KQYA 5P7VA 5P32A 1T6GA 3IXKA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 2FDD A;  4DJO A;  5P37 A;  4A6C A;  1E5O E;  3DK1 A;  5KQZ A;  5OZC A;  2G20 A;  2Q55 A;  2BBB A;  1K6C A;  1A94 A;  2UPJ A;  2OHK A;  1FQ7 A;  1NH0 A;  1IVP A;  3D1X A;  5P7H A;  3LIV A;  5IS4 A;  4RLD A;  5P6Q A;  3PLL A;  4ZSP A;  3CKP A;  4GMI A;  5P04 A;  2QAK A;  5P85 A;  5COK A;  4LXA A;  3S45 A;  1W6H A;  5P7P A;  4DQF A;  5KR1 A;  3R1G B;  1MEU A;  3SAC A;  3QPJ A;  5P0E A;  5P59 A;  3LPJ A;  3L3A A;  5P7D A;  3OAD B;  5SY2 A;  5HCO A;  2AOG A;  5P3Y A;  1AAQ A;  5P1E A;  4YD4 A;  2RMP A;  4Y3E A;  4DPI A;  5P8C A;  5OZZ A;  2G69 A;  1MES A;  2QI4 A;  4B70 A;  3T7P A;  3PSG A;  5P08 A;  5P5C A;  2PK5 A;  4J0T A;  5AH7 A;  4PZW A;  3VV8 A;  3PM4 A;  3PHV A;  4XX3 A;  4A6B A;  4EQ0 A;  4Y58 A;  3T7X A;  5P8I A;  4K9H A;  2QU2 A;  3KA2 A;  5P24 A;  1EAG A;  1HSI A;  3O9F A;  3SQF A;  2I4X A;  3PB5 A;  1FGC C;  4YOB A;  5P6N A;  4ZSQ A;  2QD8 A;  2V12 C;  4YA8 A;  4YHQ A;  5OYR A;  2R5P A;  4LBT A;  3LNK A;  5P5Z A;  5P8J A;  5ENM A;  2PSU A;  2F3K A;  4EJ8 A;  1W5V A;  4GJC A;  5OZN A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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