2ER0E

X-ray studies of aspartic proteinase-statine inhibitor complexes
Total Genus 77
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
77
sequence length
330
structure length
330
Chain Sequence
STGSATTTPIDSLDDAYITPVQIGTPAQTLNLDFDTGSSDLWVFSSETTASEVDGQTIYTPSKSTTAKLLSGATWSISYGDGSSSSGDVYTDTVSVGGLTVTGQAVESAKKVSSSFTEDSTIDGLLGLAFSTLNTVSPTQQKTFFDNAKASLDSPVFTADLGYHAPGTYNFGFIDTTAYTGSITYTAVSTKQGFWEWTSTGYAVGSGTFKSTSIDGIADTGTTLLYLPATVVSAYWAQVSGAKSSSSVGGYVFPCSATLPSFTFGVGSARIVIPGDYIDFGPISTGSSSCFGGIQSSAGIGINIFGDVALKAAFVVFNGATTPTLGFASK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title X-ray studies of aspartic proteinase-statine inhibitor complexes.
pubmed doi rcsb
molecule keywords ENDOTHIAPEPSIN
molecule tags Hydrolase/hydrolase inhibitor
source organism Cryphonectria parasitica
total genus 77
structure length 330
sequence length 330
ec nomenclature ec 3.4.23.22: Endothiapepsin.
pdb deposition date 1990-10-20

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
E PF00026 Asp Eukaryotic aspartyl protease
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.40.70.10 Mainly Beta Beta Barrel Cathepsin D, subunit A; domain 1 Acid Proteases 2er0E02
2.40.70.10 Mainly Beta Beta Barrel Cathepsin D, subunit A; domain 1 Acid Proteases 2er0E01
2I0DA 5OZ7A 4Q1NA 4U7VA 1G35A 2QHCA 3SLZA 2Q54A 2P83A 2AZ8A 3OOZA 5P65A 4Y3WA 4LC7A 2CEMA 5P5ZA 1SGZA 5FIVA 1Q9PA 2HB3A 2NNPA 4Y4BA 1B6LA 4B05A 2B8LA 4GJBA 5P7YA 1SBGA 3EXOA 2G1OA 4RYGA 5EZZA 4A4QA 1E80E 3HLOA 2MIPA 2G69A 3I8WA 5P30A 2BKTA 4YOAA 2ER6E 3OUBA 1K6VA 5P7HA 2WF2A 5P4BA 3S54A 3NLSA 3HVPA 1BDLA 5P5LA 4FLGA 2Z4OA 3OXWA 4QJAA 4J1HA 2OF0A 1HVIA 4Y50A 4DQCA 3G6ZA 2H6SA 1EBYA 5P7AA 3O9GA 3DJKA 4Y53A 2V10C 5P6YA 3TOFA 1UH9A 2IRZA 2FS4A 5P24A 2A4FA 2VJ9A 2WL0A 1GVTA 2AOIA 1TCWA 5OZQA 5KR8A 3MSLA 4OC6B 5P33A 5COOA 4BELA 5COKA 5P7MA 4LXAA 3OAGB 5P01A 4F75A 2PSVA 4Y3MA 2HC0A 1YM4A 3IVIA 5P8GA 4RVIA 3UPJA 5P4IA 2CEJA 3OQKA 3LIYA 4YDGA 5P8RA 2BQVA 5AHCA 3LZUA 5P5JA 5P22A 5P2JA 3KYRA 5P03A 2XFJA 4KE1A 3NU4A 1KJHA 2PWRA 5P6SA 1K2CA 5P8EA 1PPKE 4NJSA 2QMFA 3OU1A 5COPA 1SMEA 3PB5A 1K1TA 5P3EA 2ZE1A 3PSUA 3KMYA 3PRSA 3UCBA 2B7ZA 1G2KA 3UDHA 1YT9A 1RQ9A 2G21A 1FFFC 1HEGE 3VLBA 1K6TA 3ZMGA 2F3EA 4Q1XA 5OYRA 5OZKA 1D4YA 2IL2A 5P1JA 4KUPA 5AH6A 4RZ1A 2G26A 1M43A 4DJWA 2AVMA 4FRIA 5P6NA 5P3TA 1W6IA 4WTUA 5HU1A 3I2LA 3IXOA 5EZXA 5OYWA 7HVPA 5DR3A 3PMYA 3UDYA 2VA5A 4Q1WA 3OQFA 2IDWA 2IGXA 4MC1A 5P0JA 5P3MA 3NUJA 3SPKA 2PMAA 4YCTA 4CP7A 1FQ4A 4RROA 5P3RA 2R5QA 4YCYA 3L5DA 1Z1HA 3APRE 4Y4EA 1BDQA 4R5NA 2FDDA 4ZSQA 3QN8A 3H5BA 1SDTA 2NMZA 5AH7A 3T7QA 1GKTA 5P8HA 2BJUA 2WEAA 5T4SA 4DQGA 2ZJLA 2ZJHA 2JYSA 1D4SA 1CZIE 3MSJA 3PWRA 4I0ZA 1FQ5A 5P58A 4CPSA 5P88A 5P2TA 4OC6A 4L7JA 5OZRA 3CYWA 3ZL7A 4FRJA 5P4RA 5P8JA 2OHKA 2P4JA 1LYWB 3FIVA 3OAGA 5P0DA 3EKWA 5C9DA 5P17A 5P14A 5JFUA 3EKXA 5IVSA 4UPJA 8HVPA 5P7KA 3SM1A 4TVGA 5P79A 3QVCA 5C9BA 4ZPFA 4Y3LA 4QJ7A 5P78A 1HHPA 3R0WA 1FG8C 2FNTA 5BWYA 2NPHA 4Y5BA 1META 5P05A 2JXRA 3MWSA 5P8KA 1HRNA 3PJ6A 5APRE 3UDKA 5P11A 5P3OA 3TOGA 2P8HA 5P55A 4Y4UA 4Y4WA 3OQDA 4FRKA 2IGYA 1HVKA 4L7HA 5P5TA 3RTHA 1GVVA 2WF4A 4YCKA 4HVPA 4I8ZA 2NR6A 5IVQA 1FKNA 5P3ZA 5P75A 2ANLA 1APUE 3HDKA 5JFPA 1LZQA 1B6PA 2RKGA 5P48A 4EPJA 3PCZA 4EJKA 5AH9A 5P32A 2ZYEA 5P87A 1BV9A 3IGBA 4JPEA 4Y41A 2OHRA 5P5XA 2G27A 5P1GA 4TVHA 5OZZA 5P2KA 3QI1A 2VKMA 4PHVA 1MVPA 3OWNA 2R8NA 5P4DA 1EAGA 5P13A 1B6JA 4K9HA 1XN2A 2V16C 2HS2A 2QU2A 5P5NA 5OZYA 5P3BA 2ZHUA 1IZDA 5OZEA 3L5CA 5P39A 5P1RA 1W5WA 4LBTA 5P8CA 5P41A 4Y38A 3AIDA 5P6BA 4OBDA 1DIFA 4RCEA 5AHBA 2H6TA 5P1QA 4QGIA 2BBBA 3SA9A 3SKGA 1EBZA 1EPME 3VFAA 3KFSA 3INEA 2QU3A 4YD7A 2WEBA 1U8GA 1BILA 3OUDB 1K6PA 4YD4A 3VYDA 3NU3A 4DQBA 3S7LA 1MIQA 5P5EA 3PI5A 2IKOA 5P86A 5P3QA 1A30A 3EKTA 1K2BA 4X2LA 3EKVA 3SA5A 1T7KA 4GMIA 5HVPA 5HDUA 3GGUA 6UPJA 4K4PA 5P8TA 3OTYA 3CIDA 1LYWA 5P54A 4I0DA 1GNOA 4HEGA 4ZPGA 3N3IA 4YBIA 4Y5LA 1PFZA 1XL2A 3FKTA 5P0AA 1ENTE 1D4LA 3DOXA 2XYEA 3ZKQA 5P0ZA 3QP0A 1B6KA 3SA8A 5P3VA 2V13A 1ZAPA 3DUYA 2ZHRA 5P69A 2IEOA 4OBHA 4DQEA 1GVXA 4ER1E 6FIVA 4J54A 1APWE 2AIDA 5ER2E 1T6GA 1LEEA 3RSVA 5P0SA 3UTLA 4EJDA 3O9HA 3UDNA 3NU5A 4GJCA 3RTNA 4A6CA 2HB2A 5P34A 4EJLA 1OEWA 3LPJA 4RRSA 5P7FA 3ZPUA 2G1RA 5P51A 4TRWA 1HTEA 1XE5A 2G1SA 5P27A 5P0WA 5P1IA 5P3YA 5P19A 1DMPA 5OYVA 1JLDA 2ZJIA 4H1EA 5P8MA 5P8NA 1PSOE 2Q11A 3UFLA 3OADB 5P68A 1AJVA 3KDBA 3Q3TA 5OZ0A 3BUGA 2I4XA 2XFIA 4J1EA 3GGVA 5F00A 1K6CA 5P2CA 4NKKA 2PWCA 3QVIA 3EKPA 3K5GA 3UDRA 5P6DA 5P56A 3OQ7A 3QROA 3TKWA 1HIIA 1W6HA 3CKTA 3PMUA 2JJIA 4DV9A 4EHCA 5I3WA 1QBTA 3HD8A 5P1LA 5P6MA 4R91A 3SO9A 2AOFA 3EL5A 4XXSA 4COEA 5P7QA 5P3XA 3U71A 2UXZA 4QJ2A 1HPXA 1KJ4A 5OYSA 5P6XA 2HM1A 3NU6A 3MXEA 5P85A 5OYYA 1HVCA 5P8LA 2OHQA 3DM6A 5KAOA 4B1CA 4I10A 2OHLA 4BFBA 2QI7A 4AMTA 3OUDA 1SGUA 3HAUA 1ZP8A 5I3YA 1GNNA 6APRE 5E5KA 2VIZA 3LIQA 4Y45A 5P2UA 5P1XA 3OTSA 4DJXA 2QNNA 5P4NA 1SH9A 3FX5A 5P4TA 3NUOA 4U8WA 5P7PA 1ER8E 5P36A 5P35A 4L7GA 3K4VC 4K4QA 2AODA 2R38A 4GJ9A 5OZCA 4PYVA 3LZVA 5P3AA 3L5BA 4Y3ZA 5P07A 1EC3A 5P7JA 5P4MA 4R93A 5E5JA 3NU9A 3KFNA 1AAQA 3IA9A 5OZNA 1YTGA 1WBMA 5P4HA 4Y4GA 1B5FB 2QMPA 5P1SA 1ZLFA 2B7FA 3PVKA 5JG1A 4BEKA 2QZKA 3M9FA 3KDCA 4ZSPA 3VF3A 1QBRA 5P0PA 5DQ5A 1T7JA 4Y58A 5DR0A 3BVAA 5DR1A 1KJFA 3D1YA 3O9LB 1D4JA 4H3JA 5P6RA 2XFKA 5P1DA 2P3DA 4Z4XA 5AHAA 1HOSA 3EM3A 5TOLA 3JVYA 5P8SA 4J1KA 1ZSFA 3LHGA 3K1WA 5HE4A 3TKGA 5P8BA 3SAAA 4K8SA 3T3CA 5HU0A 5KR2A 3UDJA 1HTFA 4Y39A 3LPIA 5P2YA 4GYEA 2ZHSA 3D91A 3UQWA 4BFDA 1W51A 3OADA 5P4PA 3EL4A 4X7IA 3UQPA 5P2IA 4I0GA 5P6FA 4I0EA 3LNKA 4HE9A 3PSGA 5P6AA 1EPQE 3QBHA 1XDHA 1IIQA 2AOJA 3INFA 4D83A 4DQFA 3OU4B 4FSLA 2QNQA 3UQUA 3HBOA 5P5OA 3NDUA 1FGCC 5P1YA 2WF1A 2R3TA 4ZLSA 4Y4DA 5I70A 4F74A 4DH6A 3ER5E 4PEPA 5P1NA 2JE4A 4YD6A 4NJTA 5P6ZA 4MC6A 3R0YA 3UQRA 4KB9A 1FG6C 1D4KA 1A8GA 3IVHA 4RCFA 5P82A 1MESA 5DGWA 5P2MA 2NXLA 3R2FA 4Y3EA 3TTPA 4IVTA 4Y3AA 2O4KA 1RNEA 5DPZA 4NJVA 4B72A 4OBFA 1EEDP 3JVWA 5P7GA 5P2NA 5P3JA 5OZAA 3G72A 3VG1A 3KFPA 3TH9A 5P3UA 5P46A 5P42A 1EC1A 2PQZA 2P3AA 3OXVA 1XE6A 1EPLE 2ZJMA 2R43A 5P6JA 5P5HA 5HDXA 2B8VA 5OZ1A 1HPVA 1MT7A 3ZPTA 1B5FA 3UDMA 3K5FA 5OZUA 5P5PA 4EQJA 4M8YA 5KOQA 3VF5A 3I25A 1QBSA 3RSXA 3ECGA 3O9LA 3KT2A 1A94A 1HSIA 4Y3PA 5P6KA 1XN3A 1BBSA 2HS1A 5ISKA 4JP9A 1LS5A 2AQUA 3GI4A 5P7XA 3IXJA 5P8AA 5KR1A 5P45A 5P15A 1WKRA 4EWOA 5P3WA 4YD3A 4Y5PA 5KOSA 3OGPA 4Y3FA 5OZ3A 4D8CA 1LYAB 4GJAA 9HVPA 3NDWA 3QIHA 4IVSA 5P4ZA 3SFCA 1GNMA 1NPAA 3GI5A 1NPWA 4YDFA 1LF4A 3T6IA 4H3FA 5P62A 3WZ8A 3FNSA 4EJ8A 2RMPA 5P7TA 3S53A 4EP2A 4ACUA 2AZCA 1BXOA 3BUFA 2V0ZC 5P0XA 4YBFA 1QBUA 4WY6A 3OU4A 4Y57A 3TL9A 3O9AA 1HSGA 3KDDA 5P6QA 3BXSA 5P6GA 2PSGA 3VFBA 2G94A 1KZKA 3ZPSA 5SY2A 4Z50A 2P3BB 3R1GB 4PZWA 5P74A 2PYMA 2VJ7A 2WJOA 5P40A 5IS4A 1MERA 5P89A 4J1IA 2QZWA 5P2VA 5DQ1A 2QMDA 3B7VA 4B1EA 5P60A 5IVTA 2G24A 4ZIPA 3SA6A 1FLHA 4HDBA 3K5DA 4RGHA 5B18A 4YOBA 1W5YA 3T11A 2B42A 5OZBA 4NPUA 3MXDA 5P5VA 3DV1A 2VJ6A 1HIVA 5OYQA 3S43B 3PHVA 4OBKA 5HCTA 1E5OE 1HVHA 4Y56A 3QAAA 4DJUA 3GGXA 5P3CA 4RYCA 5P02A 1FQ8A 1ODWA 4Y5MA 3FNTA 5P38A 3R4BA 4GJ7A 2Q55A 4Y6MA 5P7BA 3D1XA 4K4RA 3OGQA 2PH6A 1B11A 3QBFA 3LZYA 3S45A 5SY3A 4D89A 3EKQA 1UPJA 3QRMA 3FSMA 1BDRA 5P4CA 5P5AA 5P4VA 2F80A 1UH8A 1YTJA 2IQGA 2QZLA 5OZVA 2VIEA 4Y47A 5P0MA 4H3IA 3IXKA 3HVGA 4I11A 3UQXA 4FGXA 3D20A 4B70A 4FAFA 2QI1A 3VYFA 5P0IA 1HVRA 1MPPA 1ZPKA 2PC0A 1FF0C 5P16A 5DQCA 4FS4A 5OZFA 3ZKIA 3LIXA 3I6OA 5P18A 5OYZA 5P8OA 5ENKA 2WKZA 1LYAA 3NR6A 5P5MA 5I3XA 1IZEA 4I8WA 5P5UA 5P5IA 1TCXA 1FMUA 3L38A 1IDBA 3EM4A 3O9CA 4Q1YA 5P5BA 1OEXA 2VNNA 1MTRA 5P1CA 3LINA 3PBZA 5P2DA 4Y3RA 4OD9B 4EP3A 2OHUA 5P00A 3VF7A 3BUHA 1MT8A 5OZLA 5SZ9A 5P2ZA 3TOHA 3Q5HA 5P1MA 4Y3NA 1BV7A 1VIJA 1FQXA 1ZTZA 3T7XA 5CONA 5P1VA 5J25A 2I4UA 4DPFA 4GJDA 4J17A 2P3BA 1VIKA 3GGAA 2PSUA 2HPEA 5OZ5A 2I4DA 4Y3DA 5P5KA 4Y3JA 5P8PA 3PSYA 3LZSA 1EC2A 1GVWA 5P3LA 1BXQA 5P71A 3ZKSA 3QRVA 5P10A 4Y4ZA 4QJ9A 4GJ6A 3ZLQA 2OHSA 5P6PA 5P4SA 4J0TA 3EM6A 3F9QA 5P0UA 4NJUA 2I0AA 1PPME 2O4NA 5P57A 3S43A 1HVSA 5OZIA 5P67A 2OHTA 2O40A 2P3CA 2QMGA 5OYTA 5P4AA 2ER0E 2OHMA 4M8XA 2J9KA 4Y3HA 2ZJJA 3EC0A 3L59A 4FE6A 1SMRA 4CPUA 4AA9A 5OZXA 5P12A 4JPCA 1IZIA 4CPTA 4Y51A 4DUSA 5OZ2A 5P0OA 2QZXA 3URJA 1F7AA 5P0EA 4J0VA 4Y5NA 1SDVA 1TW7A 3SM2A 2ASIA 4PPHA 5BRYA 1BVGA 4F73A 4J1FA 4Y3YA 1ZJ7A 5HE7A 5P2AA 3OHFA 5JODA 3VV8A 2WHHA 3SABA 5P5CA 3EKYA 4CMSA 1FMXA 3BRAA 5P5FA 3VV7A 5P37A 1YTIA 4PZXA 3O99A 2VS2A 1W5VA 2QAKA 4LXKA 5P6CA 5P3HA 2RSPA 1PROA 4Y5AA 5P6IA 2ZGAA 5OZMA 2HAHA 2IENA 3EL9A 5P0GA 2Q5KA 5P5RA 5OZTA 4Y37A 3B80A 4XX3A 1LYBB 5P23A 4L6BA 3OXXA 4I0JA 3PWWA 4QJ6A 4RVJA 3KM4A 3EMYA 5ER1E 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 2I0D A;  5OZ7 A;  4Q1N A;  4U7V A;  1G35 A;  2QHC A;  3SLZ A;  2Q54 A;  2P83 A;  2AZ8 A;  3OOZ A;  5P65 A;  4Y3W A;  4LC7 A;  2CEM A;  5P5Z A;  1SGZ A;  5FIV A;  1Q9P A;  2HB3 A;  2NNP A;  4Y4B A;  1B6L A;  4B05 A;  2B8L A;  4GJB A;  5P7Y A;  1SBG A;  3EXO A;  2G1O A;  4RYG A;  5EZZ A;  4A4Q A;  1E80 E;  3HLO A;  2MIP A;  2G69 A;  3I8W A;  5P30 A;  2BKT A;  4YOA A;  2ER6 E;  3OUB A;  1K6V A;  5P7H A;  2WF2 A;  5P4B A;  3S54 A;  3NLS A;  3HVP A;  1BDL A;  5P5L A;  4FLG A;  2Z4O A;  3OXW A;  4QJA A;  4J1H A;  2OF0 A;  1HVI A;  4Y50 A;  4DQC A;  3G6Z A;  2H6S A;  1EBY A;  5P7A A;  3O9G A;  3DJK A;  4Y53 A;  2V10 C;  5P6Y A;  3TOF A;  1UH9 A;  2IRZ A;  2FS4 A;  5P24 A;  2A4F A;  2VJ9 A;  2WL0 A;  1GVT A;  2AOI A;  1TCW A;  5OZQ A;  5KR8 A;  3MSL A;  4OC6 B;  5P33 A;  5COO A;  4BEL A;  5COK A;  5P7M A;  4LXA A;  3OAG B;  5P01 A;  4F75 A;  2PSV A;  4Y3M A;  2HC0 A;  1YM4 A;  3IVI A;  5P8G A;  4RVI A;  3UPJ A;  5P4I A;  2CEJ A;  3OQK A;  3LIY A;  4YDG A;  5P8R A;  2BQV A;  5AHC A;  3LZU A;  5P5J A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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