3C9XA

Crystal structure of trichoderma reesei aspartic proteinase
Total Genus 80
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
80
sequence length
329
structure length
329
Chain Sequence
ETGSAPNHPSDSADSEYITSVSIGTPAQVLPLDFDTGSSDLWVFSSETPKSSATGHAIYTPSKSSTSKKVSGASWSISYGDGSSSSGDVYTDKVTIGGFSVNTQGVESATRVSTEFVQDTVISGLVGLAFDSGNQVRPHPQKTWFSNAASSLAEPLFTADLRHGQNGSYNFGYIDTSVAKGPVAYTPVDNSQGFWEFTASGYSVGGGKLNRNSIDGIADTGTTLLLLDDNVVDAYYANVQSAQYDNQQEGVVFDCDEDLPSFSFGVGSSTITIPGDLLNLTPLEEGSSTCFGGLQSSSGIGINIFGDVALKAALVVFDLGNERLGWAQK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Statistical coupling analysis of aspartic proteinases based on crystal structures of the Trichoderma reesei enzyme and its complex with pepstatin A.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Trichoderma reesei Aspartic protease
molecule tags Hydrolase
total genus 80
structure length 329
sequence length 329
ec nomenclature ec 3.4.23.18: Aspergillopepsin I.
pdb deposition date 2008-02-19

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00026 Asp Eukaryotic aspartyl protease
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.40.70.10 Mainly Beta Beta Barrel Cathepsin D, subunit A; domain 1 Acid Proteases 3c9xA02
2.40.70.10 Mainly Beta Beta Barrel Cathepsin D, subunit A; domain 1 Acid Proteases 3c9xA01
5SXNA 3KFNA 4I8ZA 3QRVA 4FM8A 3CYWA 1HVLA 2BPWA 2QI7A 5P6ZA 4J1HA 3CYXA 3DOXA 1AJVA 4HLAA 3EM3A 5P7EA 2NXDA 2V0ZC 2QI6A 3VSXA 2ZHVA 4HZTA 5HDUA 2IS0A 3R0YA 3O9GA 5P0YA 5OYWA 4I0GA 1HVKA 2RKGA 4YD4A 2QNPA 3G6ZA 4JPEA 4Y43A 5P2SA 3B7VA 4L1AB 3UCBA 3ZKSA 5KQFA 5OZZA 6FIVA 3AUPA 5HD0A 2OHKA 2FLEA 4RCFA 5PEPA 5P66A 3INFA 3SM1A 5P4EA 1NSOA 4CPTA 5OZ7A 3MXEA 1TSQA 5P1OA 3QRSA 5P8DA 2FGUA 5P10A 1HOSA 1EBWA 1OEWA 2EWYA 3O9CA 4Y36A 4PZXA 2QHYA 5AHBA 5P60A 4ZLSA 1YT9A 2PMAA 4Y56A 3KN0A 2G26A 4YOBA 5P4TA 4Y3YA 4Y4DA 3TLHA 4FS4A 1GVWA 5OYQA 4Y3AA 5FIVA 3OADA 3OUDA 5KAOA 3BGCA 3PSUA 4NJUA 1HPVA 1GNMA 5P4AA 3UDMA 3CIDA 5P7VA 4ER2E 2VIYA 2O4KA 4YOAA 3S2OA 1NH0A 5OZKA 5P74A 2ZE1A 5P8RA 1EC1A 2OAHA 4Z22A 5P8FA 5P7UA 1HVSA 5KR8A 5P89A 3OHHA 3OU1B 1HEFE 3OADB 2NMYA 4GYEA 4Y3EA 2P3DA 4QJ6A 1HXBA 4K8SA 1EC0A 5P55A 4U7VA 3OY4A 4J0YA 5P57A 1MUIA 2H6SA 5P3DA 1B5FA 2A4FA 2J9JA 5P7GA 1D4SA 4Q1YA 5OZ6A 4R8YA 1XS7D 2AOCA 1HPOA 1MIQA 3WB5A 5DGUA 5P1PA 2J9KA 2F8GA 3U71A 4FCOA 4OD9B 3L5DA 3K4VA 2OHLA 5P5EA 4L7JA 2QD6A 4DQCA 3LZVA 3APRE 4Y3LA 4J17A 5P3JA 1BXQA 2AOJA 5ENMA 3CIBA 5P8JA 2QI0A 1SGZA 1HTFA 5OYRA 5HE7A 1J71A 3GGAA 3MSJA 5P4PA 1UH9A 1BVGA 1XN2A 5P2QA 2OHPA 3VLAA 5C9FA 3T3CA 1NPVA 3S53A 2VA7A 4RROA 3EKTA 1W5WA 3WB4A 1IDBA 4U7QA 5P0EA 2ZJJA 3OTSA 5P72A 3UTLA 5P2NA 2B60A 5OZJA 2WF4A 2RSPA 1WBMA 5OZ9A 4DJXA 5F00A 1DAZC 5P3UA 1FEJC 4APEA 3T11A 2IKOA 2VS2A 3L5EA 5P6MA 4B00A 4I0JA 1W6IA 2HC0A 2PK5A 5P11A 2G1SA 1QBRA 3NUOA 4H3JA 1Z1HA 2ER0E 5ER1E 1KJ7A 5P7QA 2CENA 4AMTA 5P31A 1ZLFA 4S1GA 5P77A 4Y37A 3EL1A 2PWCA 1FLHA 4Y5NA 1LYWB 3BVBA 1LYBB 3GI5A 5P1TA 3T7QA 5P2OA 5P82A 5P2MA 5P24A 3QRMA 2ZJNA 3ZPTA 4DQFA 2FMBA 1PPKE 1AIDA 3D91A 3PWWA 5P41A 4J0TA 2HB4A 4RZ1A 1K1TA 4GJDA 1YM4A 3GI6A 4J0VA 5P8EA 4Y4TA 4YBFA 4DJYA 1TCWA 3LHGA 1EBYA 5P4SA 3DV1A 5P5CA 3HDKA 3NWXA 2IGXA 5OZYA 1MESA 3U6AA 5HVPA 2ASIA 5P8GA 5P23A 5P0HA 5DQCA 3NWQA 4E43A 1HEGE 5IVTA 2WL0A 4DJUA 5EZXA 2ZJKA 3VSWA 5KOSA 3EKQA 5JFPA 5P3AA 3VYEA 4Y5KA 5P4OA 5P6GA 4COEA 5HCTA 1T7KA 4BELA 3LIQA 3LZSA 5OZUA 5P4XA 3MWSA 2F3FA 3A2OA 5P1WA 5P68A 5P6LA 4KE1A 3SQFA 4QJ7A 5P2LA 2QMDA 1TW7A 5P0QA 2QAKA 2FS4A 5P8TA 5P7JA 3R4BA 4B72A 3Q6YA 3KDCA 3OXXA 5P6HA 4LXKA 5J25A 3OAGA 5OZFA 2IQGA 2JE4A 4EQ0A 5P1ZA 4Z4XA 4JP9A 1ZP8A 3PGIA 2I4XA 3IA9A 5P4QA 1KJGA 1GVTA 4Y48A 4ER1E 3S85A 1BVEA 4FM6A 3OUAA 3KFRA 4ZIPA 1HPXA 3VFAA 4NJTA 5P5IA 5P2XA 3RTHA 3JVWA 2UY0A 2BB9A 3VEUA 1G6LA 4B1CA 1W5XA 1K2CA 2XFKA 1C70A 2O40A 2BPXA 2VA5A 3DCRA 1OD1A 4I0EA 3NSHA 1M4HA 4JECA 4GZFA 5P0VA 4X2LA 4QGIA 4YCKA 1DW6C 4GJCA 5P5TA 5P3ZA 1RV7A 3LIVA 5P8CA 5KQYA 5P29A 3O9IA 5JFUA 1ENTE 4RVIA 5P7SA 1QBUA 1HBVA 5P4JA 1AAQA 1SIPA 2NXLA 4M8YA 2AQUA 4F74A 4R95A 9HVPA 2IEOA 4DUSA 3APPA 3HD8A 5P2CA 1F7AA 1MSNA 3FSMA 3Q70A 1APWE 4D88A 1G0VA 4OBGA 3L59A 4B05A 3TPRA 3EXOA 3EL5A 5P0NA 2AVSA 3ST5A 4KB9A 1A30A 1B6JA 2VKMA 4Y41A 5P2YA 5ISJA 4B77A 1MSMA 2ZYEA 1ODYA 5OYSA 5P44A 4OC6B 2QHZA 5P3FA 3CICA 5OZIA 5SY3A 1D4HA 1MRXA 3T7XA 5P54A 4J55A 5P0JA 1ODXA 3GGVA 4DVFA 5P18A 2G1OA 1IVQA 2OHNA 3NU4A 4Y4GA 1FMUA 5P3GA 5OZBA 1LF4A 5IS4A 2WF3A 3PB5A 4OBHA 5JODA 4RYGA 3D1ZA 2WKZA 2NTRA 2R38A 5P3OA 5P4KA 5P2AA 4DJWA 2SAMA 2NMZA 5P20A 2QI3A 3VV8A 2I1AA 1HIIA 3VYFA 1DP5A 3CMSA 4Y3PA 3K1WA 5P3TA 3IN3A 5P5KA 5P6IA 1EAGA 2Q64A 3PMUA 5P00A 3URJA 5IVRA 4DQBA 4XKXA 4Q1XA 5P1NA 1ODWA 2P3AA 4PPHA 5P5GA 3IVIA 5DQ1A 3OHFA 5P52A 3SA4A 3GGUA 5TOLA 2XYEA 5P1EA 5P4GA 5P58A 5DR7A 1E80E 1HPSA 4EJDA 3LNKA 1MTRA 4I10A 5P07A 4IVSA 2VJ9A 1MTBA 5P6YA 3SKFA 2QCIA 4B1DA 4F76A 5JG1A 5P7OA 3I25A 4DJOA 2VJ6A 5AGZA 3BXRA 2I0DA 3UFLA 3PSGA 1W6HA 5P76A 4RCEA 3TH9A 2G22A 3Q4BA 5P5LA 4Y4ZA 3S8IA 3EKWA 3OWNA 4Y4AA 5F01A 5P4RA 1FFFC 3KM4A 3I7EA 5P0DA 4Q1NA 1FQXA 5COPA 4DJVA 3VFBA 5P7MA 2AOEA 1HSHA 2Z54A 3VLBA 5P3IA 5P7RA 2RKFA 5BRYA 3FNUA 5P47A 2FXEA 2FDEA 2ZHTA 3R0WA 2V13A 4I0DA 3VV6A 5P7FA 3OK9A 1E82E 5P3XA 3DJKA 3NUJA 5KR1A 4NKKA 3I6OA 1EPQE 1EC3A 1SGUA 2B8LA 5P13A 5P4ZA 2O4LA 1SP5A 4L1AA 1SDVA 4CPRA 3BGBA 3N3IA 5P0CA 5T4SA 5P85A 4XX4A 4GMIA 2QMPA 5P59A 2QMGA 2B7ZA 1DPJA 5P0BA 1FKNA 5P3EA 4HVPA 4YE3A 5P1IA 4YD6A 4L7HA 3HBOA 5AH8A 5P1UA 1M43A 4FSEA 5P6EA 3O9EA 5P78A 4D89A 1GVVA 5P1AA 4NPTA 1W51A 3NLSA 5P5JA 4PZWA 3TKGA 4A6CA 4CP7A 3O9BA 2G20A 3S43B 2PQZA 4Y3DA 4OBZB 4YCYA 3OOZA 3WZ7A 4NPUA 4NJSA 5P83A 5P5FA 5P6WA 4RGHA 3AIDA 1ZSRA 2I0AA 3OU1A 3MSKA 3DUYA 1D4LA 1XN3A 3H5BA 2ER7E 1LEEA 4H3FA 1IZDA 2AOIA 2OHSA 1CPIA 3O9AA 4Y9WA 5HU0A 1VIKA 2MIPA 4Y4WA 5P5XA 1YG9A 5AH7A 3OQAA 5OZ4A 5P1MA 1VIJA 2WF1A 1PSAA 5P50A 2ZDZA 1IZIA 2G24A 1HIVA 1UH7A 5HU1A 3URIA 4TVHA 2XFIA 4MC1A 2AZ9A 5KQXA 4OD9A 5P5DA 3EKPA 2QZLA 4BEKA 2QHCA 4YBIA 1YM2A 3QROA 1EPME 5P2KA 4I0ZA 5P6AA 3S7LA 5P1FA 3FX5A 1RPIA 4FE6A 3TOFA 3KFPA 4I0HA 5P8AA 3O9HA 4YDFA 5C9DA 1D4JA 1LZQA 4Y51A 2HS2A 1KJ4A 3KYRA 3UDHA 5OZVA 3NDTA 3VG1A 3PVKA 5P2RA 1NPAA 3ZKGA 4DQEA 5P0ZA 5P87A 2ZHRA 1PFZA 4EPJA 3CKTA 3OU3A 3G70A 1K6VA 5P3WA 1BWBA 2BQVA 1BDQA 4HA5A 1TSUA 4GIDA 2AVVA 2AZCA 4QLHA 1HTRB 4AZYA 4LAPA 4LXMA 2V00A 1AVFA 5P22A 1BV9A 3SA8A 5OZ3A 1HTEA 5P2ZA 5OYUA 4DQHA 2P3BB 3UDKA 3L58A 5APRE 2P83A 5P14A 1KZKA 4FLGA 5P4MA 1XL2A 5P7LA 5P6BA 5E5KA 3TPJA 3HW1A 5OZ5A 5P08A 5P26A 3ECGA 3ZOVA 2NNKA 1LYWA 5P7PA 4ZE6A 1LYBA 3SLZA 5P2GA 3WZ8A 5P6KA 3LPJA 1META 3D20A 5P5MA 5OYXA 5P27A 2F3EA 5P8HA 1AZ5A 4D8CA 3EL4A 4ZSPA 3K5FA 3EKXA 4K4RA 5P2HA 1IZHA 1HVJA 4Y3MA 2AZBA 5P3QA 1HVIA 1SDUA 3RVIA 2ZJLA 3TPPA 4H1EA 4Y3SA 2Q11A 4I0FA 2WJOA 5OZ0A 5OYTA 2QD7A 2HS1A 5P2DA 1SIVA 4D83A 4QJAA 3ZKNA 5E5JA 3T6IA 5OZLA 2I4VA 3OQFA 4MC2A 5IVSA 5P0AA 2IGYA 2PC0A 5IE1A 1G35A 4Y3GA 5KQZA 5OZOA 1BILA 3ER3E 2IKUA 1RL8A 5P4UA 1HTGA 1JLDA 3LPIA 5P0XA 5P81A 3EM6A 3PHVA 1U8GA 5CONA 5P42A 1IVPA 2IENA 4J1KA 1YX9A 1W50A 3L5CA 1C6XA 5P7ZA 3NDWA 5P3MA 5P3BA 1CZIE 2AODA 5P6SA 4GJ9A 5P02A 1F34A 1MT8A 5P8MA 3OQDA 5P73A 3PLDA 5OYYA 3LIYA 2HM1A 3UDYA 1K1UA 1LYAB 4BFDA 4Y3QA 3ZPUA 5HDXA 4Y4XA 3KT5A 2R3WA 5P0RA 1ZBGA 3SFCA 3URLA 4MC9A 4TRYA 5P4LA 4DPIA 1YTIA 2HB3A 4Y3ZA 2FNSA 4WY6A 5IVQA 3INDA 4Y3XA 2IDWA 5P1HA 4YD3A 5DGWA 4L6BA 2OF0A 5P37A 5P1VA 5P16A 1FQ4A 1G2KA 3INHA 4R93A 1D4KA 1K2BA 3QIHA 2ER6E 4R91A 5P1SA 3MXDA 1A8KA 3OXCA 2XYFA 2G1NA 5P4WA 4HE9A 2ZGAA 2ZJHA 2I4DA 3PLLA 4RVXA 2AVMA 1FQ8A 2PYNA 3KA2A 2APRA 2A1EA 1LF3A 3PWMA 4FRIA 5P34A 3PCWA 3L5BA 1ZJ7A 4Q1WA 2AVOA 5P5HA 1DMPA 1EPNE 1N49A 5P5PA 2FXDA 3IN4A 5P8NA 5AH6A 4H3GA 3EKVA 5UPJA 5P0SA 4LXAA 2QNNA 4Y3JA 4I11A 4DH6A 5P5WA 2ER9E 3K5GA 2O4NA 2R3TA 3UQPA 4YD5A 5P3KA 2HIZA 5P0KA 5P45A 1AXAA 2ZHSA 2F3KA 4Y35A 2BKSA 5P5RA 4DPFA 5P7IA 2JXRA 5P3RA 5P25A 3NDUA 2WEAA 1EPLE 3BHEA 3QN8A 1CMSA 4I0IA 1EPOE 3DV5A 4Y3HA 3D1XA 2CEMA 5P0PA 4GJ7A 3QP0A 4J5JA 3S7MA 3IAWA 5P1QA 1HVHA 4B78A 5P7BA 3VYDA 5P5YA 5AHCA 1FFIC 5OZNA 2CEJA 1LS5A 3Q5HA 5P70A 5KOQA 3FNSA 5P32A 1BDLA 5P8BA 4GJBA 4Y47A 1MRWA 2OHRA 3GI4A 5P88A 4OC6A 1OHRA 1LF2A 3OU4B 1D4IA 5P48A 2PSGA 2WF2A 5AHAA 5B18A 4XXSA 5P05A 3BC4A 4Y58A 4Y4EA 5DR8A 3EMYA 3NDXA 4QJ9A 3RTNA 1WBKA 2QK5A 2WEZA 5P6QA 4R92A 4D85A 2AIDA 3BUGA 4DJRA 4RRSA 3OQKA 4PHVA 2PSVA 1FG6C 2WHHA 3SM2A 3ZLQA 3ZPSA 2G27A 3GI0A 3N4LA 5P5SA 5HCOA 3VCMA 1FF0C 2ZJIA 1PSOE 1EPRE 3NR6A 5P4HA 2RMPA 3LPKA 5P43A 2I4UA 2O4SA 5P2BA 4Y6MA 5DR4A 4B0QA 3G72A 3TOGA 2B7FA 2FDPA 5P46A 2P3CA 2QNQA 3VV7A 5P75A 5P7XA 3HAUA 2Z4OA 2B8VA 2VIZA 1GVUA 5C9BA 4LBTA 3WZ6A 4EXHA 5DPZA 4Y57A 5OZGA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 5SXN A;  3KFN A;  4I8Z A;  3QRV A;  4FM8 A;  3CYW A;  1HVL A;  2BPW A;  2QI7 A;  5P6Z A;  4J1H A;  3CYX A;  3DOX A;  1AJV A;  4HLA A;  3EM3 A;  5P7E A;  2NXD A;  2V0Z C;  2QI6 A;  3VSX A;  2ZHV A;  4HZT A;  5HDU A;  2IS0 A;  3R0Y A;  3O9G A;  5P0Y A;  5OYW A;  4I0G A;  1HVK A;  2RKG A;  4YD4 A;  2QNP A;  3G6Z A;  4JPE A;  4Y43 A;  5P2S A;  3B7V A;  4L1A B;  3UCB A;  3ZKS A;  5KQF A;  5OZZ A;  6FIV A;  3AUP A;  5HD0 A;  2OHK A;  2FLE A;  4RCF A;  5PEP A;  5P66 A;  3INF A;  3SM1 A;  5P4E A;  1NSO A;  4CPT A;  5OZ7 A;  3MXE A;  1TSQ A;  5P1O A;  3QRS A;  5P8D A;  2FGU A;  5P10 A;  1HOS A;  1EBW A;  1OEW A;  2EWY A;  3O9C A;  4Y36 A;  4PZX A;  2QHY A;  5AHB A;  5P60 A;  4ZLS A;  1YT9 A;  2PMA A;  4Y56 A;  3KN0 A;  2G26 A;  4YOB A;  5P4T A;  4Y3Y A;  4Y4D A;  3TLH A;  4FS4 A;  1GVW A;  5OYQ A;  4Y3A A;  5FIV A;  3OAD A;  3OUD A;  5KAO A;  3BGC A;  3PSU A;  4NJU A;  1HPV A;  1GNM A;  5P4A A;  3UDM A;  3CID A;  5P7V A;  4ER2 E;  2VIY A;  2O4K A;  4YOA A;  3S2O A;  1NH0 A;  5OZK A;  5P74 A;  2ZE1 A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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