3CKP | Genus

Total Genus 93

The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	93
sequence length	392
structure length	379
Chain Sequence	KKGSFVEMVDNLRGKSGQGYYVEMTVGSPPQTLNILVDTGSSNFAVGAAPHPFLHRYYQRQLSSTYRDLRKGVYVPYTQGKWEGELGTDLVSIPHGPNVTVRANIAAITESDKFFINGSNWEGILGLAYAEIARPDDSLEPFFDSLVKQTHVPNLFSLQLCGAGASVGGSMIIGGIDHSLYTGSLWYTPIRREWYYEVIIVRVEINGQDLKMDCKEYNYDKSIVDSGTTNLRLPKKVFEAAVKSIKAASSTEKFPDGFWLGEQLVCWQAGTTPWNIFPVISLYLMGEVTNQSFRITILPQQYLRPVESQDDCYKFAISQSSTGTVMGAVIMEGFYVVFDRARKRIGFAVSACHVHDEFRTAAVEGPFVTLDMEDCGYNI

The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

loadScript /static/js/j2s/core/package.js

loadScript /static/js/j2s/core/corejmol.z.js

loadScript /static/js/j2s/core/corescript.z.js

JSmol exec jmolApplet0 start applet null

Jmol JavaScript applet jmolApplet0__6724341416723694__ initializing

Jmol getValue debug null

Jmol getValue logLevel null

Jmol getValue allowjavascript null

AppletRegistry.checkIn(jmolApplet0__6724341416723694__)

vwrOptions:

{ "name":"jmolApplet0","applet":true,"documentBase":"https://genus.fuw.edu.pl/view/3CKP/A/","platform":"J.awtjs2d.Platform","fullName":"jmolApplet0__6724341416723694__","codePath":"https:/static/js/j2s/","display":"jmolApplet0_canvas2d","signedApplet":"true","appletReadyCallback":"Jmol._readyCallback","statusListener":"[J.appletjs.Jmol object]","syncId":"6724341416723694","bgcolor":"white" }

setting document base to "https://genus.fuw.edu.pl/view/3CKP/A/"

Jmol Version: 14.29.13 2018-04-17 17:17

java.vendor: Java2Script (HTML5)

java.version: 2018-01-28 23:38:52 (JSmol/j2s)

os.name: Mozilla/5.0 AppleWebKit/537.36 (KHTML, like Gecko; compatible; ClaudeBot/1.0; +claudebot@anthropic.com)

Access: ALL

memory: 0.0/0.0

processors available: 1

useCommandThread: false

appletId:jmolApplet0 (signed)

Jmol getValue emulate null

defaults = "Jmol"

Jmol getValue boxbgcolor null

Jmol getValue bgcolor white

backgroundColor = "white"

Jmol getValue ANIMFRAMECallback null

Jmol getValue APPLETREADYCallback Jmol._readyCallback

APPLETREADYCallback = "Jmol._readyCallback"

callback set for APPLETREADYCallback Jmol._readyCallback APPLETREADY

Jmol getValue ATOMMOVEDCallback null

Jmol getValue AUDIOCallback null

Jmol getValue CLICKCallback null

Jmol getValue DRAGDROPCallback null

Jmol getValue ECHOCallback null

Jmol getValue ERRORCallback null

Jmol getValue EVALCallback null

Jmol getValue HOVERCallback null

Jmol getValue IMAGECallback null

Jmol getValue LOADSTRUCTCallback null

Jmol getValue MEASURECallback null

Jmol getValue MESSAGECallback null

Jmol getValue MINIMIZATIONCallback null

Jmol getValue SERVICECallback null

Jmol getValue PICKCallback null

Jmol getValue RESIZECallback null

Jmol getValue SCRIPTCallback null

Jmol getValue SYNCCallback null

Jmol getValue STRUCTUREMODIFIEDCallback null

Jmol getValue doTranslate null

language=en_US

Jmol getValue popupMenu null

Jmol getValue script null

Jmol getValue loadInline null

Jmol getValue load null

Jmol applet jmolApplet0__6724341416723694__ ready

script 1 started

platformSpeed = 8

Viewer cachePut cache://localLOAD_/file/5cfe87c54111f19cfca5e368/pdb.gz

Viewer cachePut https://genus.fuw.edu.pl/file/5cfe87c54111f19cfca5e368/pdb.gz

FileManager.getAtomSetCollectionFromFile(/file/5cfe87c54111f19cfca5e368/pdb.gz)

loadScript /static/js/j2s/core/corezip.z.js

The Resolver thinks Pdb

loadScript /static/js/j2s/core/corebio.z.js

Time for openFile(/file/5cfe87c54111f19cfca5e368/pdb.gz): 749 ms

reading 379 atoms

ModelSet: haveSymmetry:false haveUnitcells:false haveFractionalCoord:false

1 model in this collection. Use getProperty "modelInfo" or getProperty "auxiliaryInfo" to inspect them.

Default Van der Waals type for model set to Jmol

379 atoms created

ModelSet: autobonding; use autobond=false to not generate bonds automatically

Time for creating model: 25 ms

Adding embedded #jmolscript: select ({0:378});backbone only;select *;

platformSpeed = 8

cartoonsFancy = true

sheetSmoothing = 1.0

traceAlpha = true

loadScript /static/js/j2s/core/corescriptcmd.z.js

specularPower = 9

ambientPercent = 20

antialiasDisplay = true

Script completed

Jmol script terminated

loadScript /static/js/j2s/J/g3d/HermiteRenderer.js

loadScript /static/js/j2s/J/renderbio/BioMeshRenderer.js

loadScript /static/js/j2s/J/render/MeshRenderer.js

loadScript /static/js/j2s/J/shape/Mesh.js

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

molecule tags	Hydrolase
source organism	Homo sapiens
publication title	Synthesis, SAR, and X-ray structure of human BACE-1 inhibitors with cyclic urea derivatives pubmed doi rcsb
molecule keywords	Beta-secretase 1
total genus	93
structure length	379
sequence length	392
chains with identical sequence	B, C
ec nomenclature	ec 3.4.23.46: Memapsin 2.
pdb deposition date	2008-03-16

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF00026	Asp	Eukaryotic aspartyl protease

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
2.40.70.10	Mainly Beta	Beta Barrel	Cathepsin D, subunit A; domain 1	Acid Proteases	3ckpA01
2.40.70.10	Mainly Beta	Beta Barrel	Cathepsin D, subunit A; domain 1	Acid Proteases	3ckpA02

5P8TA 4I0IA 5P8FA 1FIVA 3O9FA 3UDPA 3VUCA 4FAFA 2AVVA 2O4PA 5P85A 4J5JA 5P63A 1GVUA 5DR1A 1XN3A 3O9EA 3UDMA 2Q11A 1HWRA 5P74A 1Z8CA 3AUPA 3PMYA 1BDLA 1PPKE 3LPKA 3KMXA 4FM7A 3O9IA 5P0PA 5P1ZA 5P0VA 5P62A 4ACXA 1DAZC 3WB5A 5P0RA 2F81A 3MXEA 4I0FA 2CENA 2RMPA 3IXJA 2OHQA 5ER2E 3KM4A 4FS4A 5P7GA 4E43A 4YOBA 3MWSA 4ER4E 3H5BA 2H6SA 1FMBA 4ZPEA 4FSLA 1GNNA 3NYGA 5P5VA 5P6JA 1D4HA 2WEBA 3IVIA 1B6JA 5P14A 4EJLA 4WY6A 1A30A 3T7PA 3O9LB 4LXAA 5P19A 4HE9A 5IVTA 3QBHA 5P2MA 2V11C 5P1WA 2Q55A 5P7PA 5OZFA 5FIVA 1XS7D 1MT8A 1FGCC 4EJDA 5P3FA 3PMUA 5P0OA 1BBSA 4Y4BA 5P0TA 2IQGA 4ZPFA 4OBHA 5P10A 3OQKA 1G35A 5HTZA 2AZBA 5P35A 1IZDA 2CEMA 3F9QA 3L5DA 4OBJA 5P5FA 5ER1E 5P03A 4Y44A 3OXVA 3NWXA 1HPVA 5P6KA 4DJUA 4DJPA 3EKPA 1AM5A 5P6IA 4Y54A 5P50A 4Y3PA 1EEDP 5P37A 4H3GA 2B60A 3RTNA 2AZ8A 5P81A 5IS4A 3ZKNA 5COKA 1FG6C 2AVOA 3QVCA 3WZ6A 5P56A 5T4SA 8HVPA 1B6LA 4J0PA 1HVKA 4Y37A 4AMTA 4CPQA 5P8AA 3IAWA 4FLGA 2ZJNA 4QJ6A 3BRAA 5P0JA 3EL4A 1EPOE 5P1OA 1M0BA 2PYMA 4TRWA 5APRE 5P4NA 4CPTA 4ER2E 4Y4GA 1KJGA 4U7VA 5P4WA 1TW7A 3RU1A 3UFLA 4CP7A 1A9MA 4R92A 5P3WA 1B6KA 4L7GA 4L6BA 2APRA 3I25A 1IDAA 2ZHRA 4YCTA 2F80A 5OZTA 5P1QA 3INHA 4Y5CA 3OHFA 3DK1A 2ZDZA 4J0TA 5P87A 3S85A 5P5IA 5OYUA 3OTYA 4Y48A 2IEOA 3TKWA 4Y3FA 4TVGA 2P3BA 3HVPA 5OZ2A 1A8GA 5KR2A 5P2GA 1HPSA 2QU3A 5P6UA 4I0ZA 4D85A 5P7FA 3TOHA 5P8BA 4EJKA 1E81E 2B7ZA 1ME6A 3S8IA 2G27A 2Q5KA 1HSIA 5OZ9A 4Q1NA 2BJUA 1HOSA 1LV1A 3ER3E 5P2RA 1K1UA 1LYAA 4KE0A 4Y4JA 3OQAA 5P61A 1PSOE 5P6GA 3HLOA 5P4CA 2AIDA 5P7IA 4DJYA 4FE6A 2HS2A 2A4FA 4RCFA 5OZHA 5P58A 4B78A 2HC0A 1QBUA 3G72A 5P52A 5P2YA 4Z22A 3L5CA 2PH6A 5P2HA 3T11A 2B7FA 1DP5A 2WF2A 2AOGA 2SAMA 5OZCA 5P1NA 4DJQA 4RZ1A 2RENA 2R3TA 5P0WA 1FQ8A 1GVVA 3OXXA 5P68A 3CKRA 4J0VA 1SDVA 5P7QA 2ZHUA 3BVAA 1IZEA 1HVJA 5P1TA 4Y35A 3UCBA 2P83A 4Y4UA 5P5YA 4Y56A 2FGVA 4Y4DA 1SDUA 1DW6C 5P26A 3NXEA 5P0XA 3INDA 1FMXA 5OZ0A 3LPIA 3SPKA 5DQ1A 1Z1RA 3EKYA 2ZHVA 3OUBA 2UXZA 5P1IA 5P5PA 5P8EA 5P5DA 5JFUA 5P4DA 1HIVA 6UPJA 2AODA 4GJ6A 4HZTA 4YD7A 2HB2A 1PROA 3IGBA 5P2BA 3ZKQA 2PSGA 2G1RA 4Q1XA 2OHPA 3I2LA 1LF3A 3APRE 5AH8A 2O4LA 4Y3EA 3FIVA 3VLBA 5P4GA 5JFPA 1T7IA 4DPIA 1UH7A 5P47A 7HVPA 3O9HA 3UDYA 1WKRA 2P3AA 1AIDA 1ZBGA 3URIA 4NPTA 5P5XA 1MESA 3Q4BA 3S43B 4CMSA 3FKTA 3D3TA 5P3MA 5P0NA 4ER1E 4Y3YA 3SABA 5P1HA 2QMGA 5OZDA 5P6FA 3OK9A 2OHUA 5OZZA 2QZXA 4J1CA 4ZLSA 4DJXA 4LXKA 3L3AA 4I1CA 3O9LA 5P4JA 1SH9A 4Y50A 4EP3A 4Y4XA 1FEJC 4YA8A 5P6NA 1LF2A 4Y3ZA 3SAAA 4FAEA 4HDFA 1PFZA 2FIVA 3DV1A 3NU4A 5P7TA 4Y5KA 3S54A 2QD7A 2UY0A 4YCKA 5P2AA 4Y5MA 3G6ZA 3SACA 4Y58A 4XX4A 5P6RA 5P4PA 5P2CA 5P3KA 2QMFA 5P5MA 5P3AA 2QI1A 5P84A 2IENA 4Y43A 5P3PA 3I8WA 4J1HA 2FDDA 4LP9A 1XL2A 5P28A 5OZ3A 5P3UA 1EC3A 2NXDA 4GB2A 1BVGA 3RSXA 5P6DA 1W5YA 3EKWA 2WKZA 4Y45A 5KR1A 5P11A 5P77A 5P0CA 3HW1A 5P09A 1M4HA 3QRMA 1B5FB 5P4RA 3SM2A 3T6IA 5TOLA 5KQYA 4DQEA 4Y5AA 2XFIA 1FQ7A 5P1UA 1VIJA 3ST5A 4BEKA 5P24A 1UPJA 2F3FA 3UDQA 3URJA 5P5LA 4K4PA 3KA2A 3WZ7A 3LIQA 4OBKA 5P29A 5P4IA 2PK6A 1E82E 5DR8A 2I4DA 1APUE 3NWQA 5P5NA 5P8JA 4TVHA 5P7RA 3R4BA 1KJFA 4MC1A 1F34A 2IS0A 5P2UA 4EWOA 5IVRA 5P5WA 3TPPA 5OZ8A 5DR7A 5KOSA 2I4XA 3R2FA 5P5UA 5P5BA 3MXDA 1EPME 5OZWA 5P44A 3LPJA 4OBFA 1G6LA 4K8SA 5OZJA 4RYGA 5OZYA 5P1CA 5P8DA 5P2IA 5OZLA 5P4QA 4GJ8A 1FF0C 3EM4A 5OZOA 2AQUA 2A1EA 1HVLA 4GJ5A 5KQFA 2AZ9A 5P32A 5P7EA 3VEUA 4YD5A 1NH0A 2IDWA 3D1XA 4YD3A 4B0QA 2NR6A 5JODA 2VJ7A 5OZUA 3K5FA 1MSMA 5P23A 4AUCA 3DCKA 1WBMA 1QBSA 3SA5A 1RV7A 2VJ9A 2V00A 3HBOA 5P3LA 3Q70A 5OZPA 1PSNA 2RKFA 3VG1A 3ZL7A 2BPYA 2BBBA 4JOOA 1GKTA 5P2SA 3LITA 2QZLA 3KT2A 1TCWA 2FDPA 4NPUA 4DJVA 4M8XA 2R9BA 2ZJLA 1IDBA 2P8HA 1KJ7A 4U8WA 1T7JA 1EC2A 3SLZA 3O9GA 4Y5NA 5P2EA 2VIJA 3QN8A 1GNOA 2Q63A 5P0AA 4Y57A 2Q3KA 1HXWA 1NSOA 3NU9A 2HM1A 5P38A 3VV7A 5P57A 5P8KA 1SIPA 1SGUA 5P00A 1C70A 2XYFA 5HE7A 5P6SA 5P6AA 4Y5LA 3D1ZA 1APTE 5P6VA 5P1DA 2HB4A 2PYNA 5P8UA 2QU2A 4D83A 5P3ZA 5F01A 3ZKMA 3BVBA 5P65A 4RYCA 2AZCA 3TPLA 5C9DA 1E5OE 2PWCA 1HBVA 3BUFA 1HVRA 5OZAA 1AAQA 4OBDA 2BPZA 5P60A 4DV9A 5HCTA 4YOAA 2V13A 5P3QA 2PMAA 2Q15A 5P7CA 5P4KA 3I6OA 3OGPA 5P7MA 5P69A 4YBIA 1OD1A 1A8KA 5P1MA 3S43A 1WBKA 4DI2A 3UHLA 1YTIA 3RTMA 3VF3A 5OZ6A 4I11A 3VF5A 1FG8C 3R0WA 5P80A 2QZKA 5P1RA 5P0IA 4DQHA 3KDDA 3OAGA 5P4ZA 2B8LA 5KOQA 2WF3A 3SA3A 5IVSA 3NXNA 2ZHSA 1SP5A 2FXDA 5OYTA 3PEPA 1T7KA 5P3XA 5HDVA 5KQXA 2WF4A 3QPJA 5P72A 5DQ5A 4IVTA 2BPVA 4FRIA 5P45A 2VA7A 2RKGA 4DJOA 4QJ9A 1BIMA 1A94A 2I4VA 3NDUA 2F3EA 3S53A 5HDUA 5P4MA 1T6EX 4Q1WA 6FIVA 2ZJIA 3BXSA 5P71A 3QAAA 3CKPA 2WEDA 5KAOA 3M9FA 5BWYA 4Y53A 3JVYA 3O9DA 2WF0A 3PVKA 1K6PA 1NPAA 5OZBA 3DM6A 3C9XA 4GYEA 3KDCA 4ACUA 3IXKA 4Y4EA 1B5FA 2QI3A 3HAUA 3QIHA 2VA5A 4EQ0A 1D4SA 5DPZA 5P7XA 3T3CA 3G70A 1ZPKA 3SKGA 5HVPA 4H3JA 4HA5A 4Y5PA 5P8OA 9HVPA 4PZXA 2VNNA 1QDMA 5AH6A 5P53A 3CYXA 3EKTA 1MTBA 2BKTA 4D88A 1LZQA 3S56A 5P08A 5OZEA 1LS5A 1D4YA 5P4XA 4Y4WA 5CONA 3UPJA 1TCXA 5P7LA 5AGZA 3GI6A 1T6GA 1HTRB 4WTUA 3L5BA 2AOFA 2B42A 3EKQA 4J1FA 2QI5A 4J0ZA 2NXLA 3KYRA 5P6BA 1FKNA 4I0EA 5P1VA 2ZJJA 5P59A 4EXHA 5P7VA 2HIZA 5P5QA 2JE4A 5P16A 5P3IA 2OHTA 3HDKA 2G20A 5P7NA 1OEXA 5P7UA 4ZSPA 4PHVA 4AZYA 3PJ6A 5P8CA 5P4FA 2O4KA 2G1SA 4I0GA 2WL0A 2IKOA 3TPRA 1DMPA 3KFNA 2I0DA 5OZ4A 3PWMA 2MIPA 3UDNA 1HVIA 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2RSPA 3D91A 5P7OA 4R95A 3FSMA 1SDTA 5P6YA 5P43A 2WEZA 3QP0A 1NPWA 2FDEA 3IVHA 4WY1A 5P1AA 4RLDA 3TOGA 1BILA 3OY4A 4B00A 2CEJA 1FQXA 3PCZA 1IIQA 4Z2ZA 3OU1B 3KDBA 1LEEA 2QMPA 4B72A 3OOTA 3PI0A 4TRZA 3NSHA 4GIDA 3VYDA 5OZRA 1FFIC 5P6EA 1LYWB 1EPRE 3PLDA 5P0BA 1YM4A 3SFCA 4EYRA 1OEWA 4QGIA 3ZPTA 2HB3A 1APWE 2HAHA 2BB9A 4KUPA 1AJVA 5P4HA 1DIFA 3K4VA 4Y3JA 1PSAA 1META 5P8IA 3EL1A 4MC6A 1HSHA 5P7SA 1ZJ7A 2ASIA 3SA4A 1G0VA 5P82A 3ZKSA 3GI4A 5P25A 3S45A 2OHNA 3LIVA 5P0HA 5P4YA 4DUSA 5P20A 5P83A 2ER9E 5P8LA 4U7QA 2R5PA 1EC1A 4LHHA 3PGIA 2ZYEA 1GVWA 2FNSA 4QJ8A 2IGXA 2PH8A 3UF3A 5E5KA 1TSUA 1FQ6A 1QS8A 4HVPA 3OUDB 3Q5HA 4Y3DA 5DR3A 5P2NA 3NDXA 3B7VA 5P4UA 4RCEA 5P3NA 5KR8A 1HPOA 5P1GA 4DH6A 1BDRA 5P17A 3Q3TA 3KN0A 4F76A 4J0YA 2QCIA 4OC6A 1ZTZA 5I3XA 4D89A 2FMBA 5P8SA 2QD6A 5EZZA 4DFGA 4NJVA 5P2WA 3O9BA 1RQ9A 1W51A 3AIDA 4CPRA 5DGWA 1BWAA 4HLAA 3R1GB 1BV9A 3ZMGA 2PSVA 1FLHA 3KFRA 4GJ7A 2QI4A 5P0GA 2NNPA 4ZSQA 1EC0A 3IN4A 5P2LA 1W6IA 3L38A 4FSEA 3L59A 5P6CA 5COOA 1U8GA 1BV7A 5P5AA 1TZSA 5P3SA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 5P4O A;  3NU5 A;  4I8Z A;  2NXM A;  5P40 A;  1MRW A;  2I1A A;  3UDR A;  1LF4 A;  2AOE A;  5SY2 A;  3VV8 A;  2FGU A;  4X2L A;  3WSJ A;  3IN3 A;  2JXR A;  3VCM A;  3WZ8 A;  5P2Z A;  5OZG A;  4DJR A;  4RVI A;  2IGY A;  3NR6 A;  1EPL E;  3FNS A;  4UPJ A;  5P5R A;  1HHP A;  2J9J B;  4ZPG A;  5DGU A;  3ZPU A;  3R0Y A;  3RSV A;  2FXE A;  4LL3 A;  1QBR A;  3OGQ A;  1EPP E;  2BPX A;  1GVX A;  3LZV A;  2QP8 A;  4R91 A;  4CPS A;  4J1K A;  5IVQ A;  1XE5 A;  5P07 A;  5P79 A;  3TL9 A;  1MTR A;  5KR0 A;  4DQF A;  2G1N A;  1ZLF A;  3OOZ A;  5P6Z A;  3QI1 A;  3EKX A;  3NU3 A;  2G22 A;  1EPN E;  5DR4 A;  4K4R A;  1Q9P A;  3PRS A;  3LIY A;  1C6Z A;  5P6H A;  4Y3T A;  4QJ7 A;  1ODY A;  4YE3 A;  2G1O A;  1APV E;  3FV3 A;  2HPF A;  1BDQ A;  5P3O A;  4YBF A;  2Q64 A;  5P7Y A;  5P7H A;  1MT7 A;  5P8H A;  4RGH A;  2XYE A;  3OXC A;  4QJ2 A;  1HRN A;  3RVI A;  3QRV A;  2I0A A;  5I70 A;  3SQF A;  4RVX A;  5P2O A;  1HXB A;  3D1Y A;  4PPH A;  3MSJ A;  5P0M A;  5BRY A;  5OZN A;  2J9K A;  2WEC A;  1B6M A;  4J54 A;  1HVH A;  3NDT A;  1MVP A;  1MUI A;  4Y9W A;  5F00 A;  3K5D A;  5P3H A;  4YDF A;  1CPI A;  2QAK A;  5P0L A;  5I3W A;  3GI5 A;  5SXN A;  2FLE A;  5P7W A;  4Y3S A;  2OHS A;  1SGZ A;  2WHH A;  5P78 A;  4Y39 A;  5P5Z A;  3L5F A;  3GW5 A;  2AVS A;  5P8R A;  4Y36 A;  4CPX A;  2V16 C;  2WJO A;  5C9F A;  3OAG B;  5P42 A;  5P1J A;  1D4L A;  3NUO A;  1FQ5 A;  5P7B A;  4EPJ A;  3APP A;  5P49 A;  3VSW A;  2QD8 A;  5ENK A;  3OUC A;  1BXO A;  5P67 A;  5P86 A;  1AZ5 A;  2NPH A;  5UPJ A;  5P88 A;  4GJB A;  3EMY A;  5HE4 A;  4Y5G A;  4RVJ A;  3QRO A;  1HTG A;  1ER8 E;  4Q1Y A;  2P3D A;  3UQW A;  1XE6 A;  1BXQ A;  4DPF A;  4FIV A;  3UTL A;  4NJU A;  5P41 A;  5P48 A;  1MIQ A;  1LYB A;  2JJJ A;  2AOC A;  4FRK A;  5P6T A;  1FB7 A;  4GJA A;  4OD9 A;  1B11 A;  3BGB A;  4Y3M A;  4J55 A;  3SO9 A;  3ZLQ A;  2PSU A;  5P3J A;  4MC2 A;  5P5T A;  4QJA A;  4Q5M A;  1MT9 A;  4A6C A;  1EAG A;  5P6P A;  2ZGA A;  3UQR A;  3BHE A;  1KJH A;  4FCO A;  5P02 A;  4F74 A;  3SM1 A;  4HEG A;  3JVW A;  2ZE1 A;  2R8N A;  3EXO A;  3K4V C;  5P7A A;  1HTE A;  2ZJH A;  1ZPA A;  3GI0 A;  4OBZ A;  5P7K A;  5P22 A;  5IE1 A;  3NLS A;  2VNM A;  2NMZ A;  1XN2 A;  4ZIP A;  2R38 A;  1AVF A;  3OAD A;  2HPE A;  5P12 A;  4R93 A;  2O4N A;  4HDP A;  1K6C A;  1FQ4 A;  1G2K A;  5P1F A;  7UPJ A;  1KZK A;  5P8Q A;  4B1E A;  3RTH A;  4Y3W A;  4EXG A;  5P3T A;  4Y3H A;  5P6O A;  4B05 A;  1C6Y A;  1W6H A;  3UQP A;  5P6L A;  2QZW A;  5OZV A;  3OU4 A;  4XKX A;  3QRS A;  4RRS A;  4APR E;  5AHA A;  3DUY A;  1FMU A;  4XX3 A;  2Z54 A;  4LXM A;  5C9B A;  4Y6M A;  4R5N A;  3PWR A;  4DQG A;  1HPX A;  2G69 A;  1XDH A;  3BXR A;  5P2V A;  3LIZ A;  5P0U A;  1IVQ A;  1W50 A;  5DQC A;  2QK5 A;  1W5V A;  4LC7 A;  1ZAP A;  5B18 A;  5P64 A;  1AXA A;  5P3R A;  3PSG A;  5P5S A;  5AHC A;  3MSK A;  5P0S A;  5P01 A;  2O4S A;  5P1S A;  3K1W A;  3UDK A;  4Y3L A;  5P33 A;  4B77 A;  2P3B B;  5P46 A;  3KFS A;  4XXS A;  2IL2 A;  2PC0 A;  3A2O A;  4YHQ A;  5OZM A;  1SIV A;  2V12 C;  4I0D A;  5P6W A;  4F75 A;  5P05 A;  3HZC A;  2AOJ A;  3GGA A;  5SY3 A;  2J9J A;  2QNQ A;  5P15 A;  1LYA B;  5HDZ A;  5HU0 A;  5P76 A;  4H3F A;  4R8Y A;  2JYS A;  1GNM A;  3FNT A;  3EL5 A;  2VJ6 A;  4AA9 A;  2XFJ A;  5OYS A;  1MRX A;  3FX5 A;  4MC9 A;  5P36 A;  3CKT A;  2ZJM A;  5P3C A;  5P70 A;  4LBT A;  2P3C A;  5P0E A;  1K2C A;  4PYV A;  2VIZ A;  5HE5 A;  5HCO A;  3LZS A;  5P0K A;  5P06 A;  1MER A;  3ZKI A;  3PB5 A;  3OQ7 A;  2PQZ A;  5P1E A;  5P2F A;  3KF0 A;  5P1Y A;  2FS4 A;  2PK5 A;  2WF1 A;  3OXW A;  5P66 A;  5P1X A;  4FL8 A;  3PBD A;  4YD6 A;  1YTH A;  3PM4 A;  3HAW A;  6APR E;  3PBZ A;  1F7A A;  4CPW A;  2H6T A;  2F8G A;  4RCD A;  4J1I A;  3UDJ A;  2ER0 E; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
 5P8T A;  4I0I A;  5P8F A;  1FIV A;  3O9F A;  3UDP A;  3VUC A;  4FAF A;  2AVV A;  2O4P A;  5P85 A;  4J5J A;  5P63 A;  1GVU A;  5DR1 A;  1XN3 A;  3O9E A;  3UDM A;  2Q11 A;  1HWR A;  5P74 A;  1Z8C A;  3AUP A;  3PMY A;  1BDL A;  1PPK E;  3LPK A;  3KMX A;  4FM7 A;  3O9I A;  5P0P A;  5P1Z A;  5P0V A;  5P62 A;  4ACX A;  1DAZ C;  3WB5 A;  5P0R A;  2F81 A;  3MXE A;  4I0F A;  2CEN A;  2RMP A;  3IXJ A;  2OHQ A;  5ER2 E;  3KM4 A;  4FS4 A;  5P7G A;  4E43 A;  4YOB A;  3MWS A;  4ER4 E;  3H5B A;  2H6S A;  1FMB A;  4ZPE A;  4FSL A;  1GNN A;  3NYG A;  5P5V A;  5P6J A;  1D4H A;  2WEB A;  3IVI A;  1B6J A;  5P14 A;  4EJL A;  4WY6 A;  1A30 A;  3T7P A;  3O9L B;  4LXA A;  5P19 A;  4HE9 A;  5IVT A;  3QBH A;  5P2M A;  2V11 C;  5P1W A;  2Q55 A;  5P7P A;  5OZF A;  5FIV A;  1XS7 D;  1MT8 A;  1FGC C;  4EJD A;  5P3F A;  3PMU A;  5P0O A;  1BBS A;  4Y4B A;  5P0T A;  2IQG A;  4ZPF A;  4OBH A;  5P10 A;  3OQK A;  1G35 A;  5HTZ A;  2AZB A;  5P35 A;  1IZD A;  2CEM A;  3F9Q A;  3L5D A;  4OBJ A;  5P5F A;  5ER1 E;  5P03 A;  4Y44 A; 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 1HTE A;  2ZJH A;  1ZPA A;  3GI0 A;  4OBZ A;  5P7K A;  5P22 A;  5IE1 A;  3NLS A;  2VNM A;  2NMZ A;  1XN2 A;  4ZIP A;  2R38 A;  1AVF A;  3OAD A;  2HPE A;  5P12 A;  4R93 A;  2O4N A;  4HDP A;  1K6C A;  1FQ4 A;  1G2K A;  5P1F A;  7UPJ A;  1KZK A;  5P8Q A;  4B1E A;  3RTH A;  4Y3W A;  4EXG A;  5P3T A;  4Y3H A;  5P6O A;  4B05 A;  1C6Y A;  1W6H A;  3UQP A;  5P6L A;  2QZW A;  5OZV A;  3OU4 A;  4XKX A;  3QRS A;  4RRS A;  4APR E;  5AHA A;  3DUY A;  1FMU A;  4XX3 A;  2Z54 A;  4LXM A;  5C9B A;  4Y6M A;  4R5N A;  3PWR A;  4DQG A;  1HPX A;  2G69 A;  1XDH A;  3BXR A;  5P2V A;  3LIZ A;  5P0U A;  1IVQ A;  1W50 A;  5DQC A;  2QK5 A;  1W5V A;  4LC7 A;  1ZAP A;  5B18 A;  5P64 A;  1AXA A;  5P3R A;  3PSG A;  5P5S A;  5AHC A;  3MSK A;  5P0S A;  5P01 A;  2O4S A;  5P1S A;  3K1W A;  3UDK A;  4Y3L A;  5P33 A;  4B77 A;  2P3B B;  5P46 A;  3KFS A;  4XXS A;  2IL2 A;  2PC0 A;  3A2O A;  4YHQ A;  5OZM A;  1SIV A;  2V12 C;  4I0D A;  5P6W A;  4F75 A;  5P05 A;  3HZC A;  2AOJ A;  3GGA A;  5SY3 A;  2J9J A;  2QNQ A;  5P15 A;  1LYA B;  5HDZ A;  5HU0 A;  5P76 A;  4H3F A;  4R8Y A;  2JYS A;  1GNM A;  3FNT A;  3EL5 A;  2VJ6 A;  4AA9 A;  2XFJ A;  5OYS A;  1MRX A;  3FX5 A;  4MC9 A;  5P36 A;  3CKT A;  2ZJM A;  5P3C A;  5P70 A;  4LBT A;  2P3C A;  5P0E A;  1K2C A;  4PYV A;  2VIZ A;  5HE5 A;  5HCO A;  3LZS A;  5P0K A;  5P06 A;  1MER A;  3ZKI A;  3PB5 A;  3OQ7 A;  2PQZ A;  5P1E A;  5P2F A;  3KF0 A;  5P1Y A;  2FS4 A;  2PK5 A;  2WF1 A;  3OXW A;  5P66 A;  5P1X A;  4FL8 A;  3PBD A;  4YD6 A;  1YTH A;  3PM4 A;  3HAW A;  6APR E;  3PBZ A;  1F7A A;  4CPW A;  2H6T A;  2F8G A;  4RCD A;  4J1I A;  3UDJ A;  2ER0 E; 
#chains in the Genus database with same CATH homology
 5P8T A;  4I0I A;  5P8F A;  1FIV A;  3O9F A;  3UDP A;  3VUC A;  4FAF A;  2AVV A;  2O4P A;  5P85 A;  4J5J A;  5P63 A;  1GVU A;  5DR1 A;  1XN3 A;  3O9E A;  3UDM A;  2Q11 A;  1HWR A;  5P74 A;  1Z8C A;  3AUP A;  3PMY A;  1BDL A;  1PPK E;  3LPK A;  3KMX A;  4FM7 A;  3O9I A;  5P0P A;  5P1Z A;  5P0V A;  5P62 A;  4ACX A;  1DAZ C;  3WB5 A;  5P0R A;  2F81 A;  3MXE A;  4I0F A;  2CEN A;  2RMP A;  3IXJ A;  2OHQ A;  5ER2 E;  3KM4 A;  4FS4 A;  5P7G A;  4E43 A;  4YOB A;  3MWS A;  4ER4 E;  3H5B A;  2H6S A;  1FMB A;  4ZPE A;  4FSL A;  1GNN A;  3NYG A;  5P5V A;  5P6J A;  1D4H A;  2WEB A;  3IVI A;  1B6J A;  5P14 A;  4EJL A;  4WY6 A;  1A30 A;  3T7P A;  3O9L B;  4LXA A;  5P19 A;  4HE9 A;  5IVT A;  3QBH A;  5P2M A;  2V11 C;  5P1W A;  2Q55 A;  5P7P A;  5OZF A;  5FIV A;  1XS7 D;  1MT8 A;  1FGC C;  4EJD A;  5P3F A;  3PMU A;  5P0O A;  1BBS A;  4Y4B A;  5P0T A;  2IQG A;  4ZPF A;  4OBH A;  5P10 A;  3OQK A;  1G35 A;  5HTZ A;  2AZB A;  5P35 A;  1IZD A;  2CEM A;  3F9Q A;  3L5D A;  4OBJ A;  5P5F A;  5ER1 E;  5P03 A;  4Y44 A;  3OXV A;  3NWX A;  1HPV A;  5P6K A;  4DJU A;  4DJP A;  3EKP A;  1AM5 A;  5P6I A;  4Y54 A;  5P50 A;  4Y3P A;  1EED P;  5P37 A;  4H3G A;  2B60 A;  3RTN A;  2AZ8 A;  5P81 A;  5IS4 A;  3ZKN A;  5COK A;  1FG6 C;  2AVO A;  3QVC A;  3WZ6 A;  5P56 A;  5T4S A;  8HVP A;  1B6L A;  4J0P A;  1HVK A;  4Y37 A;  4AMT A;  4CPQ A;  5P8A A;  3IAW A;  4FLG A;  2ZJN A;  4QJ6 A;  3BRA A;  5P0J A;  3EL4 A;  1EPO E;  5P1O A;  1M0B A;  2PYM A;  4TRW A;  5APR E;  5P4N A;  4CPT A;  4ER2 E;  4Y4G A;  1KJG A;  4U7V A;  5P4W A;  1TW7 A;  3RU1 A;  3UFL A;  4CP7 A;  1A9M A;  4R92 A;  5P3W A;  1B6K A;  4L7G A;  4L6B A;  2APR A;  3I25 A;  1IDA A;  2ZHR A;  4YCT A;  2F80 A;  5OZT A;  5P1Q A;  3INH A;  4Y5C A;  3OHF A;  3DK1 A;  2ZDZ A;  4J0T A;  5P87 A;  3S85 A;  5P5I A;  5OYU A;  3OTY A;  4Y48 A;  2IEO A;  3TKW A;  4Y3F A;  4TVG A;  2P3B A;  3HVP A;  5OZ2 A;  1A8G A;  5KR2 A;  5P2G A;  1HPS A;  2QU3 A;  5P6U A;  4I0Z A;  4D85 A;  5P7F A;  3TOH A;  5P8B A;  4EJK A;  1E81 E;  2B7Z A;  1ME6 A;  3S8I A;  2G27 A;  2Q5K A;  1HSI A; 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3CKPA

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