3OADB

Design and optimization of new piperidines as renin inhibitors
Total Genus 40
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
40
sequence length
171
structure length
171
Chain Sequence
SLGGQIVLGGSDPQHYEGNFHYINLIKTGVWQIQMKGVSVGSSTLLCEDGCLALVDTGASYISGSTSSIEKLMEALGAKKRLFDYVVKCNEGPTLPDISFHLGGKEYTLTSADYVFQESYSSKKLCTLAIHAMDIPPPTGPTWALGATFIRKFYTEFDRRNNRIGFALARH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Design and optimization of new piperidines as renin inhibitors.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Renin
molecule tags Hydrolase
source organism Homo sapiens
total genus 40
structure length 171
sequence length 171
chains with identical sequence D
ec nomenclature ec 3.4.23.15: Renin.
pdb deposition date 2010-08-05
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.40.70.10 Mainly Beta Beta Barrel Cathepsin D, subunit A; domain 1 Acid Proteases 3oadB00
2BB9A 5P0IA 5P10A 5P89A 4X7IA 2VNNA 4Y37A 3EBZA 2OHQA 4RVJA 4R92A 3EM4A 3WZ6A 2AZBA 4DQBA 4R5NA 6FIVA 1ZSRA 4Y3TA 3NXEA 3UTLA 5P49A 1HVCA 5IE1A 1APVE 2QNPA 3PHVA 1PPKE 1RV7A 4DQGA 3B80A 1BAIA 5I3WA 1CZIE 3PSGA 5P0TA 5P5ZA 3ZKIA 3PBDA 4CPUA 3FV3A 3GW5A 4A4QA 5P3WA 3NDTA 5P4IA 5COPA 1K1UA 2ZHTA 3KT5A 1YTGA 3VV8A 2FGUA 4OC6B 3EL4A 2PQZA 3TNEA 2NMZA 4KE0A 2P83A 5P15A 3Q5HA 1Z1HA 1AM5A 2HIZA 2P3DA 4ZLSA 4Y4BA 3WSJA 4Y45A 1FLHA 3S7LA 2J9KA 2IL2A 2WECA 4LHHA 5P1FA 5OZ5A 1UH8A 1A8KA 3NU5A 5P8BA 2O4LA 1C70A 3ST5A 1EBWA 5DR8A 1GNNA 2ANLA 3UDYA 5EZZA 3UQRA 3BVAA 5P56A 4YOBA 5OZBA 1RQ9A 3NLSA 5P8PA 5P07A 5P6EA 2QCIA 3OU4B 4Y4TA 5P72A 5P7CA 1QBUA 2VS2A 1KZKA 5P3YA 3HDKA 3QBHA 5P5RA 2NNKA 5B18A 2R5QA 2ZHRA 4FLGA 3CMSA 1N49A 3CICA 4J0VA 3DM6A 1MT9A 5OZGA 4DJOA 4UPJA 2IRZA 2AZCA 1QBSA 5P4VA 4Z2ZA 2G1SA 3O9LB 4OBZB 1DPJA 5P32A 1HPVA 2PC0A 1C6ZA 5P57A 5JODA 2OHNA 3BUHA 2WF2A 2O4NA 5DR1A 4Y3JA 2AOIA 5DQCA 5P7AA 3PWRA 3L3AA 5P3OA 5CLMA 5P5NA 5P7YA 5P02A 5P87A 1C6YA 2G1OA 3VLBA 4I0HA 4LXAA 5P6SA 2QNQA 4B05A 5P3AA 5P0GA 3O9DA 5OZ2A 5P2TA 3BVBA 1LYBA 4Y3AA 4AA9A 5P14A 4HDPA 1BVGA 1ENTE 4Y56A 3NU4A 4BELA 3K4VC 3MSLA 3PMYA 2XFIA 5P0UA 1FGCC 5P5MA 3IN3A 1LV1A 2ZYEA 2XFKA 4OD9B 1W5WA 4B1CA 3NWQA 5AH7A 3FNTA 5P1GA 5P1RA 4RGHA 5P8LA 1HVSA 5P6YA 5COKA 4EHCA 1HEGE 3VFAA 1TQFA 4B70A 3IAWA 2V11C 1T6GA 5KQXA 4FM7A 2ZE1A 1LYWB 1B5FA 3RTHA 3EKVA 3LZUA 5OYZA 4GB2A 1EC2A 4MC6A 4N00A 3S85A 3RTMA 5P0LA 2QP8A 5P20A 1EBKC 4YCYA 5P6AA 4QLHA 2WF4A 2Z54A 2NXMA 5P0NA 5AH8A 2VIZA 5P8KA 5P2NA 2P4JA 2HPFA 5P0OA 4Q1WA 1AJXA 3JVYA 5P39A 1E80E 2QMFA 5DQ2A 4CPTA 1FG8C 5P4XA 3HAWA 5P6UA 3OOZA 4EP3A 1EPNE 1HWRA 1XN2A 3TPRA 1K6PA 4YBIA 1EPLE 1D4YA 2HB4A 4DI2A 3OHFA 5P4SA 4K4RA 1LEEA 3VSXA 5P8TA 2QK5A 3CKPA 2WEDA 2WL0A 5OZYA 3GGVA 4MC9A 1ODYA 5OZEA 5P11A 3H5BA 5P03A 2ASIA 4Y4UA 3OGPA 5P3ZA 3UDNA 3R4BA 5OYUA 5P54A 4LBTA 3PLDA 2FLEA 2G1RA 5P74A 1LS5A 1APTE 4LXMA 2AOFA 5P7SA 4YA8A 4F76A 5P3GA 3I7EA 5P45A 3DV1A 3K5CA 8HVPA 3OADA 3D1ZA 5OZ7A 1KJ7A 2I0DA 3DCKA 3T7PA 5HD0A 3OQKA 1NH0A 5OYSA 5P34A 2BPVA 3INFA 4DJXA 4OBDA 2VJ6A 5DR7A 1T7IA 3SKGA 2I4WA 5P1CA 1FQ7A 2R9BA 3PWWA 3K5GA 5E5JA 5P2HA 4Y47A 3NSHA 4I8WA 3SACA 1HVJA 4Y5NA 4FIVA 5P2AA 4RRSA 1HRNA 5P8CA 4ZEAA 2IKUA 2AQUA 1B6KA 5P60A 4GMIA 1J71A 5P52A 2QMGA 2RMPA 3SA3A 5P30A 2O4PA 3LIZA 5HVPA 4J0PA 2WKZA 5P5OA 2QHYA 2OHKA 2ZHVA 1OEXA 4LP9A 5I70A 2G69A 5P6OA 3KM4A 1KJFA 5P70A 5P7NA 5ER2E 3SA5A 2ER9E 4I0GA 2H6SA 4Y3PA 5P0AA 5KQFA 1T6EX 4PYVA 3MXEA 4PPHA 3NDXA 1HSGA 1HTRB 4HZTA 5P3JA 3SM2A 5P0DA 2QI4A 5P1NA 2Q5KA 5P0RA 5P5EA 4PEPA 5P6DA 1IDBA 1UH7A 5OZQA 5P8SA 3DK1A 4NPUA 2ER7E 3BUFA 5P78A 5P86A 3UDQA 1QS8A 2V10C 5P05A 1MRWA 2O4SA 3EKXA 5OYWA 1AAQA 4Q1NA 5P58A 3LITA 4KB9A 5P0FA 3QRMA 1OD1A 4LL3A 3G70A 1YT9A 2I4DA 3FNUA 3OUAA 1ODWA 1AIDA 1LF2A 1ODXA 1D4HA 4TRWA 3UQWA 3PCZA 4Y4JA 4H3FA 3VYFA 5P2VA 4H1EA 1ZAPA 3DCRA 1W51A 4EQJA 3SKFA 4FAEA 4Y53A 5P4ZA 4EJDA 1MPPA 2VIYA 5P3BA 3O9FA 3Q6YA 5P2EA 5OYTA 3JW2A 5OZJA 5P33A 3TLHA 5P08A 5OYVA 3OGQA 4IVTA 2BPZA 1KJGA 2BBBA 2P3AA 4Y3GA 4WY1A 3R1GB 4A6CA 2B42A 3KFRA 5P1MA 5P18A 5BWYA 3SA4A 3AUPA 3RTNA 4J17A 5P23A 3OQDA 5P0ZA 1ZTZA 2OHLA 5P75A 4L7JA 4NPTA 1EPPE 2G1YA 5I3XA 4Y3XA 5P26A 3OAGB 3O9HA 2AIDA 4Y9WA 2IS0A 5P1SA 5IVTA 2BPXA 2QZXA 1MIQA 5P6TA 3VG1A 1SDUA 3OU1A 1EBYA 2QHCA 1ZBGA 5OZ8A 1QDMA 4ZPEA 3A2OA 3TTPA 1IVPA 5P7FA 4FRKA 4ZSRA 5P2CA 5P4EA 1GVWA 3SA7A 1EAGA 4LC7A 2IDWA 4FCOA 1APWE 1HVRA 3OQ7A 3Q3TA 2XYEA 2IQGA 5BRYA 1MERA 5P2XA 3QIHA 2P3BB 4OBZA 4Y5PA 5OZOA 2IENA 3G6ZA 2R3TA 4CKUA 2ZJKA 4D83A 2VA5A 5P3QA 4DJQA 2FDDA 2P8HA 5P2SA 3FKTA 4NKKA 5DQ4A 4Y43A 5P4JA 4RZ1A 4XKXA 2APRA 3OXXA 1ZLFA 1HHPA 4Y3YA 2A4FA 5P4RA 3S53A 5P2KA 4KE1A 5P4CA 2QHZA 4EJ8A 4EQ0A 5ISKA 2CEJA 3Q4BA 2RKGA 3QI1A 1SGUA 9HVPA 3QRSA 5OZUA 1FIVA 3TPPA 5P7HA 5P1VA 3Q70A 4APRE 3O9BA 1F7AA 3O9GA 3ZL7A 5P5HA 4OD9A 5P0JA 2UY0A 1BXQA 1G2KA 4R93A 4Y44A 3HVPA 5P3VA 5P81A 1TCXA 2WJOA 4Y54A 5P00A 1BIMA 1D4JA 1K6TA 4CPWA 1LYWA 2WF0A 3NU6A 4U8WA 5SY2A 3IA9A 3QN8A 3ZOVA 3VF5A 3SA9A 4I0IA 5IVSA 1MTBA 3BC4A 1SDVA 3HW1A 2IGXA 5KOSA 3SA8A 3DV5A 5P5JA 1XL5A 5P5AA 4RVIA 5PEPA 3T7XA 4Z22A 2QZLA 3OHHA 5HCOA 5HTZA 5P6KA 3MXDA 2WHHA 5P4DA 2FXEA 5DR0A 1WBMA 4NJUA 5P8UA 4B72A 4WTUA 4COEA 2JE4A 5P73A 1W50A 5P4UA 5C9FA 5P7LA 2QI0A 5P16A 5P7QA 5AHCA 5P3UA 1SIPA 3PVKA 3DUYA 5AHAA 1SP5A 5P0KA 2NPHA 4RYGA 5P6GA 3WZ7A 5P5YA 3UDRA 2V16C 2OHTA 5P06A 2FNSA 5P2LA 4S1GA 3VV7A 1W5XA 4R91A 5P7VA 5P4GA 1YTJA 5P5XA 4BFDA 1SGZA 5OZWA 3LZYA 5P71A 4I0EA 4J1KA 4RCFA 5P1OA 5P4NA 3UQXA 4RCDA 2AOJA 4JOOA 5P8JA 3EC0A 5P2MA 2ZJJA 2OHRA 2AZ9A 1B11A 5P28A 1HVIA 2WEZA 3WB4A 4MC1A 3FX5A 2G26A 5P2ZA 1FQ6A 5P6CA 4FRSA 1IZDA 1PSNA 4DPFA 3UFNA 4LAPA 5P5CA 4TVHA 5P2QA 1T7KA 5P1IA 4AUCA 4DH6A 2R3WA 5OZ4A 4CPXA 2B7ZA 3D1YA 3EL5A 2G22A 2QI6A 3HD8A 1FMBA 5P51A 1BV7A 5SXNA 5P4OA 5ENMA 5P2YA 2FMBA 3LZVA 4Y3HA 4HEGA 5P8GA 1YG9A 4J1EA 2WF3A 1D4LA 1YTIA 4XX3A 4Z4XA 5I3VA 3IN4A 3CIDA 2B60A 5P55A 2R5PA 3UQPA 1HEFE 4OBFA 3U6AA 3VV6A 3L59A 1FMXA 4Y4DA 3L58A 5P65A 5P5BA 3KF0A 3OXCA 1K6VA 4HVPA 3IXKA 4DJPA 3PLLA 4CPRA 1UPJA 5T4SA 1DW6C 3KFNA 1T7JA 4Y48A 5P1XA 2R8NA 4GJ7A 5SZ9A 4YHQA 2VA6A 1LYAB 3C9XA 4FM8A 2NNPA 3KT2A 2WF1A 1GVTA 1A94A 5P5FA 4Y3MA 3TOFA 4J54A 3PGIA 5OZSA 3L38A 4WY6A 2OHSA 3RSVA 5KAOA 4CP7A 1B6LA 2AODA 2IGYA 4I0FA 3EKYA 2Q64A 3OXVA 2OHPA 2H6TA 3OWNA 4JPCA 1A30A 5P35A 5KR2A 5P7KA 2VIEA 3TOGA 1BWAA 1BVEA 2Q63A 5HU1A 3T11A 1DP5A 2AOGA 4Y3SA 3UCBA 5P7XA 5P2BA 1ZPAA 4D85A 2OF0A 5OYRA 3N3IA 3B7VA 4YBFA 3ZMGA 4GJBA 5P6RA 3HAUA 5KQZA 4JP9A 3OQAA 2HAHA 4PZXA 4Y5MA 4Y57A 5P1LA 3SM1A 3WZ8A 3ZKNA 1F34A 4GJ6A 5OZ6A 2I4QA 4EXGA 5P5TA 3ZKMA 4AZYA 4Y3ZA 5P80A 5P62A 1GVXA 5DR4A 2CEMA 1NPAA 1ZPKA 2ZGAA 1EEDP 3BXRA 7UPJA 1G6LA 3I8WA 1XS7D 3N4LA 4Y4XA 1SMRA 1MRXA 2PSUA 4RYCA 3URLA 4OBJA 4EYRA 4AA8A 4Y3LA 5P2OA 5P8AA 2I4UA 1HTGA 1FFFC 1AZ5A 2O40A 4FE6A 4Y3QA 2QD6A 4I1CA 3OAGA 5P8HA 4B77A 3HVGA 3QAAA 6APRE 2O4KA 5P7PA 5P50A 4FS4A 5P4KA 5P3MA 5P4PA 3URIA 2Q55A 4YCKA 3NDUA 4ER4E 1XL2A 3ZKQA 3EL1A 3IXOA 3O9EA 1TSUA 2FGVA 4PZWA 2PH8A 1WBKA 2F3FA 3EKQA 4APEA 4DJYA 1A9MA 3DOXA 3PEPA 5P79A 1VIJA 5P6VA 1SH9A 1AXAA 5P3XA 2PK6A 5P5DA 4DJRA 3UFLA 1OEWA 5OZ9A 5P4QA 3K5FA 2RSPA 3F9QA 5DQ1A 4GJCA 2B8VA 5P3SA 3DJKA 3UDKA 1APUE 3EKTA 4ACUA 1DIFA 3ER5E 1D4KA 3OUDB 5SY3A 5P0WA 5P8DA 5P7UA 5P4AA 1QRPE 1YTHA 2CENA 3D3TA 2QAKA 2OHMA 3K1WA 5OZIA 3L5CA 4Y50A 5AH9A 1BILA 1LYBB 1M43A 3VYDA 4HLAA 1PSAA 4ZIPA 1HBVA 4Y4ZA 5P84A 3S2OA 1U8GA 2XYFA 5F01A 5P0MA 3T3CA 3GI0A 1EPQE 1MVPA 4ACXA 4XXSA 4BEKA 2AVMA 4GJAA 1FFIC 3L5FA 3VCMA 2AVSA 2AVOA 5P77A 3RVIA 1EBZA 5P0CA 4YDFA 5P6JA 1D4IA 2VJ7A 3SFCA 5OZKA 1GKTA 4Y4AA 4Y41A 4Y3NA 1CMSA 3ZKGA 3PRSA 5P7EA 1B5FB 2QZWA 4YOAA 2WEAA 2FXDA 2PYNA 3U7SA 5P2JA 1EPME 5P5GA 3VSWA 5P19A 4F75A 3QBFA 2AOEA 5P43A 3QP0A 1EC3A 3FSMA 3R0WA 1KJ4A 1MSNA 4OC6A 1AVFA 4K8SA 2QMPA 5P1JA 5HU0A 2V12C 4Y36A 4ZSQA 5P8FA 3LIVA 3HLOA 5P8NA 2F81A 5AHBA 3CYXA 1XDHA 7HVPA 3KA2A 4XX4A 1HVLA 3AIDA 3CIBA 3BRAA 5P25A 4LXKA 4CPSA 2HB2A 4U7QA 2QD8A 5P1WA 2QZKA 2AVQA 3QPJA 5P1BA 2F8GA 2G21A 5P6BA 3U71A 3S43B 4RCEA 3ECGA 2RKFA 3OUBA 4M8XA 3ZLQA 1MTRA 5P3NA 5P67A 1VIKA 1XN3A 4PHVA 5P7RA 1SDTA 2ZHUA 5IVRA 3OU4A 4J55A 5P7BA 2AVVA 5P29A 3VLAA 3ZPSA 3PMUA 2NTRA 2R43A 4Y38A 4Y5CA 1TW7A 1IZEA 3VF7A 4FRIA 1ZJ7A 2ZJNA 3O9LA 1PROA 3O9AA 4YD3A 1FG6C 4KUPA 4I0JA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 2BB9 A;  5P0I A;  5P10 A;  5P89 A;  4X7I A;  2VNN A;  4Y37 A;  3EBZ A;  2OHQ A;  4RVJ A;  4R92 A;  3EM4 A;  3WZ6 A;  2AZB A;  4DQB A;  4R5N A;  6FIV A;  1ZSR A;  4Y3T A;  3NXE A;  3UTL A;  5P49 A;  1HVC A;  5IE1 A;  1APV E;  2QNP A;  3PHV A;  1PPK E;  1RV7 A;  4DQG A;  3B80 A;  1BAI A;  5I3W A;  1CZI E;  3PSG A;  5P0T A;  5P5Z A;  3ZKI A;  3PBD A;  4CPU A;  3FV3 A;  3GW5 A;  4A4Q A;  5P3W A;  3NDT A;  5P4I A;  5COP A;  1K1U A;  2ZHT A;  3KT5 A;  1YTG A;  3VV8 A;  2FGU A;  4OC6 B;  3EL4 A;  2PQZ A;  3TNE A;  2NMZ A;  4KE0 A;  2P83 A;  5P15 A;  3Q5H A;  1Z1H A;  1AM5 A;  2HIZ A;  2P3D A;  4ZLS A;  4Y4B A;  3WSJ A;  4Y45 A;  1FLH A;  3S7L A;  2J9K A;  2IL2 A;  2WEC A;  4LHH A;  5P1F A;  5OZ5 A;  1UH8 A;  1A8K A;  3NU5 A;  5P8B A;  2O4L A;  1C70 A;  3ST5 A;  1EBW A;  5DR8 A;  1GNN A;  2ANL A;  3UDY A;  5EZZ A;  3UQR A;  3BVA A;  5P56 A;  4YOB A;  5OZB A;  1RQ9 A;  3NLS A;  5P8P A;  5P07 A;  5P6E A;  2QCI A;  3OU4 B;  4Y4T A;  5P72 A;  5P7C A;  1QBU A;  2VS2 A;  1KZK A;  5P3Y A;  3HDK A;  3QBH A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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