3OOTA

Crystal structure analysis of renin-indole-piperazin inhibitor complexes
Total Genus 90
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
90
sequence length
337
structure length
337
Chain Sequence
GNTTSSVILTNYMDTQYYGEIGIGTPPQTFKVVFDTGSSNVWVPSSKCSRLYTACVYHKLFDASDSSSYKHNGTELTLRYSTGTVSGFLSQDIITVGGITVTQMFGEVTEMPALPFMLAEFDGVVGMGFIEQAIGRVTPIFDNIISQGVLKEDVFSFYYNRDSENSQSLGGQIVLGGSDPQHYEGNFHYINLIKTGVWQIQMKGVSVGSSTLLCEDGCLALVDTGASYISGSTSSIEKLMEALGAKKRLFDYVVKCNEGPTLPDISFHLGGKEYTLTSADYVFQESYSSKKLCTLAIHAMDIPPPTGPTWALGATFIRKFYTEFDRRNNRIGFALAR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Discovery and optimization of a new class of potent and non-chiral indole-3-carboxamide-based renin inhibitors.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Renin
molecule tags Hydrolase
source organism Homo sapiens
total genus 90
structure length 337
sequence length 337
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.4.23.15: Renin.
pdb deposition date 2010-08-31

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00026 Asp Eukaryotic aspartyl protease
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.40.70.10 Mainly Beta Beta Barrel Cathepsin D, subunit A; domain 1 Acid Proteases 3ootA02
2.40.70.10 Mainly Beta Beta Barrel Cathepsin D, subunit A; domain 1 Acid Proteases 3ootA01
4B70A 5P0SA 4DVFA 5P22A 1TW7A 2WF4A 2QMDA 3G6ZA 3HAUA 4YHQA 5P7UA 2NR6A 2FGUA 3OTSA 1SDTA 5P2RA 4ZPGA 5P49A 5P78A 1LYWA 5P56A 5DQ2A 5P5DA 5P0BA 1HSIA 5P2BA 2IL2A 5C9DA 2G21A 3INFA 3NSHA 5I3VA 1M43A 3TOGA 5TOLA 2WEAA 3QROA 4Y3NA 5IVRA 5P12A 5P53A 3QBFA 3OQDA 4JOOA 5P3TA 3QBHA 5P4CA 5P3JA 2PWCA 1ZSFA 5P1EA 1T6EX 1DPJA 1MEUA 3PJ6A 4Y4UA 3SKGA 1Q9PA 1HPSA 5OZEA 2WECA 2AIDA 4N00A 2B7ZA 4BEKA 3UHLA 5OZ4A 5P25A 3D1ZA 4DJPA 3K5GA 3O9AA 1W50A 2XYEA 3SQFA 3JW2A 3LZYA 2IS0A 3JVWA 1K6TA 2VKMA 3QI1A 4ZE6A 2IDWA 5P40A 1B11A 5P4MA 1RPIA 4L1AA 1YTGA 1Z8CA 4NJUA 4Y4EA 5P6KA 1F7AA 4PPHA 5OZPA 1BBSA 1QBRA 3KDBA 5OZ6A 5KQFA 1IZIA 2VJ6A 3OUCA 4GYEA 3K1WA 3O9GA 3DUYA 5P16A 5P6DA 3VCMA 3BC4A 2B8VA 1AIDA 5ER1E 4YE3A 3CYXA 1NSOA 2V11C 3NUJA 2HPFA 2QI5A 5HDVA 3ZPUA 2ZHRA 3MXDA 3OAGA 2PC0A 4HDBA 5P7AA 5P8AA 5P50A 1AJXA 1SGUA 4RZ1A 1ME6A 3UDHA 3LZSA 5P34A 1HVSA 2H6TA 4K8SA 4OBDA 1MSMA 5P1NA 3FV3A 3PLDA 4R5NA 2QZXA 2PH8A 1QBUA 2HB3A 2V00A 2FDEA 1ODWA 5P46A 3M9FA 3ZPSA 3HVGA 2QCIA 3UDMA 4ZIPA 3NR6A 4CPXA 1Z1HA 1C6XA 1KJHA 3RTHA 5P6JA 5P0HA 4Y3JA 5OZUA 5P5MA 5P2AA 3OQ7A 3TKGA 5P3AA 3DOXA 1UH8A 3B80A 3UF3A 4FRIA 4HA5A 1K2BA 4LHHA 5P2TA 3R0YA 5P0NA 5P2LA 3QS1A 4XX4A 3ECGA 2JJJA 2OHUA 4CPSA 5P57A 3LIQA 4Y58A 3GI6A 3URJA 4Y4GA 5P8NA 4Q1XA 4Y5BA 5P2ZA 5P2OA 1AVFA 1ZLFA 3KT2A 3QP0A 4WTUA 5P1PA 2HC0A 5HU0A 1XE5A 5P7GA 1HTGA 3WZ6A 2Q54A 1T7IA 5P88A 1IZHA 2VIJA 1PSOE 2Q63A 4YDGA 3EL9A 2VA6A 5OZLA 4U8WA 3RSVA 3KM4A 3PRSA 2PSGA 2RMPA 8HVPA 5P3OA 4Y3EA 2VIZA 5P8TA 3VUCA 4YDFA 5P7FA 4DQGA 3OUDB 3ZL7A 4KUPA 5P8RA 3OUAA 1RNEA 3PMUA 5P03A 4DPFA 4WY1A 3RTNA 4I0FA 1AJVA 1T6GA 5HTZA 4Y57A 2ZE1A 4CP7A 1MERA 1ZPKA 2WF1A 3T7XA 2G27A 2AZBA 4OBKA 5P8KA 5CONA 4RCFA 3UDJA 3TPJA 2FDPA 4Y3YA 1B6JA 4EP2A 3KFSA 4GJ7A 4J1KA 4RLDA 5P0VA 1D4JA 2R3WA 4LAPA 4HEGA 3QVCA 3SAAA 5P27A 2WF3A 4J1EA 4H3JA 4ZPEA 4Q1NA 3AIDA 3D20A 4QJ6A 1D4SA 2BPXA 3OQFA 3QIHA 2I4VA 5AHBA 5P6YA 3OXWA 4CKUA 5ENMA 5P7SA 4DJOA 2NMYA 4J1FA 1YG9A 4QJ8A 2OHRA 4AMTA 3IXKA 3VYFA 1FB7A 2AOFA 3EKXA 2WL0A 4DQBA 2QK5A 3GW5A 3BUFA 1HVKA 5P5YA 2V13A 4NKKA 5OZBA 3EL0A 4ZLSA 4GJ6A 5KOQA 2HPEA 4HZTA 5HU1A 4JECA 5OYTA 3S56A 5P6TA 3GGAA 5OYQA 1E80E 4Y4XA 4ER1E 1GNOA 3OADA 2A4FA 3ZKXA 2BPVA 2BQVA 5P5BA 1KJFA 1NPWA 4Y50A 5P29A 2IENA 2HAHA 5P3ZA 2OHNA 2AOGA 3NU5A 5P82A 3TPRA 3LPIA 5P19A 2I0AA 1QBSA 4JPEA 3FSMA 4DV9A 2XFKA 5P6ZA 1FQ7A 1MUIA 1CZIE 4TRZA 1YT9A 2APRA 4OBJA 5P1GA 5P36A 4Z4XA 4J1IA 3I6OA 4RCEA 5P7TA 4GJDA 3SLZA 4CPWA 4DJXA 1PFZA 2R38A 1HVLA 4Y56A 5P64A 2I4DA 5OYXA 3ZKSA 1W5XA 4Y5NA 2P83A 2QU3A 4ZSRA 3DJKA 3TL9A 4MC1A 1ENTE 1W6HA 3QPJA 1WBMA 3PHVA 5P0YA 2UPJA 3IGBA 5P3IA 3UPJA 5AHCA 2VIYA 5P52A 1SGZA 5P20A 1EAGA 2OHSA 3ZPTA 3N4LA 5UPJA 1FLHA 1HHPA 4ZSPA 2PWRA 4OBHA 3VFBA 5P1OA 1OEXA 5P5FA 4I0HA 1AAQA 2B8LA 1A94A 3GGUA 3G70A 4XXSA 3PM4A 5P3HA 5P62A 1APUE 4B1CA 2QMGA 5P87A 3OY4A 3UFLA 2JJIA 1YTIA 2Q15A 4GB2A 1MT9A 4AA9A 5P70A 1EC3A 5P73A 5KR8A 3PSYA 4HE9A 3ZMGA 1GNNA 3O9DA 1HRNA 5P4EA 4DJUA 5P65A 2NPHA 4XX3A 3PVKA 5OZQA 5P5EA 3PEPA 5P74A 1BDRA 5P0AA 3OU3A 3PMYA 1HEGE 1PROA 4OBFA 2WHHA 2NXLA 2BPWA 2RSPA 1KJGA 3DV1A 5P5SA 1HXBA 3ZKNA 5P0EA 5P04A 5P5LA 2QHZA 3T11A 2QZWA 5P7HA 2ZHVA 3APPA 4UPJA 5ER2E 3EXOA 5SY2A 3S43A 5PEPA 5P85A 2A1EA 3I7EA 5P5KA 1EPNE 5P2YA 5P2UA 3LPJA 3RTMA 3TLHA 4NPUA 4F76A 1EBWA 1MSNA 5KAOA 5T4SA 5COKA 2Q64A 1WBKA 3EM3A 1LV1A 2FXDA 5P8JA 5P1XA 1BWAA 4R8YA 3T7QA 5SY3A 1SH9A 5ISKA 3BXRA 4DJQA 2P3BA 2JYSA 4HDFA 2VJ7A 4F73A 5P0PA 1FGCC 2XFIA 5P6FA 3T3CA 1GNMA 2G22A 2WEBA 4A4QA 4K4RA 5P45A 5P79A 2BBBA 5OYSA 5C9BA 3SA8A 4H3FA 5BWYA 5P72A 1OHRA 1IIQA 3K4VC 5P7BA 4TVGA 2QHYA 5IVSA 2R3TA 2F3EA 3O9CA 5J25A 5DR8A 4Y3RA 2AQUA 1QDMA 3EKVA 4CPQA 5HD0A 2QHCA 2FNSA 4LP9A 5P3NA 3EKYA 5P1UA 5P8DA 2PK5A 2BJUA 3KA2A 4I10A 5P23A 3PI0A 2AZ9A 4NJVA 5P7QA 5KOSA 5P75A 5P4IA 2HS1A 1FQXA 1NPAA 5OYWA 1ZBGA 1W5YA 3SO9A 4RRSA 5P4YA 2AZ8A 1W5WA 5P5PA 5P3UA 2V0ZC 2VIEA 5P6LA 1AM5A 2AVQA 3K5CA 4MC9A 3TTPA 5P18A 3OU1A 1SBGA 1E5OE 2I0DA 1EC1A 5F01A 5P4XA 5P2IA 5P8EA 5P1QA 4QGIA 2MIPA 1LYAA 4LL3A 3UCBA 5P43A 3L38A 2AVOA 3KFNA 2ZHUA 5OZGA 3EKWA 4EYRA 3EKQA 2AZCA 3WSJA 5P5NA 3VLAA 5P2HA 5P0XA 3MWSA 4L6BA 1W51A 3KT5A 3PI5A 4Y3QA 1LYWB 4M8XA 4DFGA 4Q5MA 5HE7A 2G1YA 3L58A 3CICA 5P83A 2NXDA 1VIJA 3PWWA 1EPLE 4X7IA 5P3VA 5P7PA 1KJ4A 3LIZA 4OD9A 5P8UA 5P7XA 4DUSA 1BXOA 5P07A 5DQ4A 1MT8A 5P7NA 5P0JA 3S2OA 5P2VA 1EEDP 2HB4A 3R0WA 4HDPA 2FIVA 5P4UA 1D4KA 2ZJMA 4CPTA 4A6CA 3MXEA 5P84A 3S7MA 2ZGAA 3UQRA 3BUHA 5P5ZA 5P8VA 4QJ2A 4OBZA 4EWOA 5DQ5A 5HE5A 3TPLA 5P4OA 1GVVA 5P31A 1IBQA 2OAHA 4OD9B 3INDA 2UY0A 4K4PA 4Y53A 1FEJC 3LNKA 1PSAA 4FRJA 4HVPA 3WZ7A 1BV9A 1META 2AVSA 5P6BA 2HB2A 1LS5A 1MTRA 4AA8A 5P8OA 5P7VA 2IGYA 1HVIA 4L1AB 1HPVA 4Y3MA 5P5UA 4J54A 4GJ5A 3PCWA 5P7ZA 2G1SA 3UQWA 1HSHA 3KFRA 4I12A 5OZKA 5IE1A 1BDQA 4LC7A 2J9JA 2QI0A 5P2DA 2AOCA 4FGXA 4Y3LA 4Y3HA 2I1AA 5OYZA 1M0BA 4OC6A 3D91A 3APRE 5OZMA 1YM4A 4RCDA 5HE4A 3OAGB 2BB9A 2FMBA 3SA4A 2QAKA 3BUGA 3NDWA 2CENA 4I0ZA 4IVTA 5P51A 3OGQA 4DPIA 1D4YA 4EJDA 5P2QA 5P38A 1EC0A 5P14A 4Y5LA 5P4WA 3LPKA 1GVWA 5AGZA 4YOAA 5P1AA 4FIVA 4YD7A 3L59A 4Z22A 4J17A 2WF0A 4EP3A 1HBVA 1SIVA 5OZAA 5P0GA 3LITA 5JFPA 5P8IA 4IVSA 5P3CA 1TCWA 5P48A 3VSXA 2QNPA 2NMZA 4FSEA 4Y47A 1FQ4A 4GMIA 5P7EA 3EL1A 3TNEA 4Z50A 1E81E 3PWMA 7HVPA 1SDVA 3OXVA 5P58A 4ACXA 3R2FA 1RV7A 2BKSA 1HIVA 3ST5A 1FQ5A 5ISJA 4B00A 5P3WA 4JP9A 3LIVA 2QZLA 5BRYA 3C9XA 5P0MA 5P1DA 4FAFA 4R93A 1U8GA 4GIDA 1OD1A 5P3KA 3SKFA 2QU2A 1IZDA 3HD8A 5OZ8A 4JPCA 1EPRE 1IZEA 4OBGA 4Y43A 4GJAA 5DR4A 4BFBA 5P4RA 2F81A 4XKXA 5P4QA 3ZLQA 3K4VA 5P3BA 2B7FA 1RL8A 3SA5A 3NU9A 5P41A 5P3SA 4AUCA 4YD3A 4RYCA 3L3AA 3RVIA 2QI4A 5CLMA 2G69A 1LF4A 3SM1A 1APTE 2NNKA 4R91A 5P33A 5P2SA 4DJVA 3OHHA 3SFCA 4HLAA 1YX9A 3NDTA 2R8NA 2AOIA 4DJYA 1ZAPA 3Q6YA 5P13A 4J1CA 3T6IA 1TSQA 4Y3ZA 2ZJIA 3L5EA 4PEPA 5P0CA 4E43A 4B1EA 4EJLA 3PBZA 1CPIA 4FLGA 1GVXA 3NWQA 1FMBA 2I4UA 5P28A 5P44A 5P5VA 4Y4TA 4I0GA 3GI4A 4B0QA 2R43A 3OUBA 1C70A 3HZCA 2QI3A 2V12C 3HVPA 2J9KA 2CEJA 5P30A 2QI1A 2G20A 3VV7A 5P6GA 3L5BA 1UPJA 5P3RA 1FF0C 5OZ2A 3QAAA 3KMYA 2F3KA 3LZUA 3NXNA 1UH7A 5P8HA 2HIZA 3NU6A 5KQXA 4QJ7A 4Y4AA 4LXMA 4Y3GA 5F00A 2IKUA 4GZFA 3S45A 5P4GA 1DIFA 5P06A 3UQUA 3OADB 5P5WA 4FRSA 1QBTA 4YBIA 4EJKA 1K6CA 1SMRA 4DH6A 3KN0A 2ZJLA 5P2KA 3OQKA 4Q1WA 5P6RA 5P8FA 3NDXA 4TRWA 4FE6A 5P15A 5P01A 1F34A 4I0EA 5OYYA 4Y5EA 3SABA 3UDRA 5P2XA 5KR0A 3ER3E 4B1DA 2F80A 4Y4WA 3HDKA 1T7KA 2ER0E 3FNSA 1K2CA 1PPLE 5P1ZA 4GJCA 4Y3PA 5P59A 4Y48A 3UDKA 4FSLA 2IKOA 4I0JA 2FS4A 2PYMA 4GJ8A 5OZZA 3UDQA 4Y4JA 4GJBA 2QD7A 3BXSA 3IAWA 1HIIA 3O9IA 5DR7A 4FM6A 3MSLA 1EPME 2ANLA 3IXJA 5P39A 1ZP8A 4H1EA 3OU4A 3NUOA 2OHMA 3VYDA 1D4HA 5COOA 2Q55A 4YA8A 3JVYA 3QRVA 5P76A 1IVPA 2B60A 3EKTA 2FXEA 5BS4A 5JG1A 3URLA 4F74A 3BRAA 1MVPA 5P4AA 5ENKA 5P1BA 2I4QA 1QRPE 4YCTA 2G24A 4I8WA 3KFPA 4J55A 2ZHSA 2O4LA 1XE6A 1HPOA 1HOSA 3PCZA 5I3WA 5OYUA 2JE4A 2FNTA 4RRNA 2WEDA 1HSGA 1FG8C 5P26A 3K5FA 1HPXA 4PHVA 2F3FA 1XDHA 1HEFE 2FLEA 4FRKA 1FMXA 5AHAA 2OHKA 5P3MA 1APWE 5P42A 1DAZC 2O4NA 1PPME 3O9HA 5SZ9A 3BVBA 4H3GA 1LEEA 3F9QA 2IRZA 5P6OA 3OQAA 1WKRA 5P47A 4K4QA 2ASIA 2Q11A 5HDZA 5B18A 3OGPA 3WZ8A 3EM6A 4ZSQA 1ZPAA 5P7JA 3O9LA 4WY6A 3FNUA 5P2EA 5IVTA 3L5CA 3QRMA 5P0TA 4M8YA 1NPVA 5P71A 5P4NA 3SA7A 4Y3XA 3OHFA 2OF0A 2NNPA 5P8QA 1MRXA 1BAIA 3EC0A 4D85A 5P7IA 2PYNA 4Y6MA 3CYWA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 4B70 A;  5P0S A;  4DVF A;  5P22 A;  1TW7 A;  2WF4 A;  2QMD A;  3G6Z A;  3HAU A;  4YHQ A;  5P7U A;  2NR6 A;  2FGU A;  3OTS A;  1SDT A;  5P2R A;  4ZPG A;  5P49 A;  5P78 A;  1LYW A;  5P56 A;  5DQ2 A;  5P5D A;  5P0B A;  1HSI A;  5P2B A;  2IL2 A;  5C9D A;  2G21 A;  3INF A;  3NSH A;  5I3V A;  1M43 A;  3TOG A;  5TOL A;  2WEA A;  3QRO A;  4Y3N A;  5IVR A;  5P12 A;  5P53 A;  3QBF A;  3OQD A;  4JOO A;  5P3T A;  3QBH A;  5P4C A;  5P3J A;  2PWC A;  1ZSF A;  5P1E A;  1T6E X;  1DPJ A;  1MEU A;  3PJ6 A;  4Y4U A;  3SKG A;  1Q9P A;  1HPS A;  5OZE A;  2WEC A;  2AID A;  4N00 A;  2B7Z A;  4BEK A;  3UHL A;  5OZ4 A;  5P25 A;  3D1Z A;  4DJP A;  3K5G A;  3O9A A;  1W50 A;  2XYE A;  3SQF A;  3JW2 A;  3LZY A;  2IS0 A;  3JVW A;  1K6T A;  2VKM A;  3QI1 A;  4ZE6 A;  2IDW A;  5P40 A;  1B11 A;  5P4M A;  1RPI A;  4L1A A;  1YTG A;  1Z8C A;  4NJU A;  4Y4E A;  5P6K A;  1F7A A;  4PPH A;  5OZP A;  1BBS A;  1QBR A;  3KDB A;  5OZ6 A;  5KQF A;  1IZI A;  2VJ6 A;  3OUC A;  4GYE A;  3K1W A;  3O9G A;  3DUY A;  5P16 A;  5P6D A;  3VCM A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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