3T7XA

Endothiapepsin in complex with an inhibitor based on the gewald reaction
Total Genus 88
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
88
sequence length
330
structure length
330
Chain Sequence
STGSATTTPIDSLDDAYITPVQIGTPAQTLNLDFDTGSSDLWVFSSETTASEVDGQTIYTPSKSTTAKLLSGATWSISYGDGSSSSGDVYTDTVSVGGLTVTGQAVESAKKVSSSFTEDSTIDGLLGLAFSTLNTVSPTQQKTFFDNAKASLDSPVFTADLGYHAPGTYNFGFIDTTAYTGSITYTAVSTKQGFWEWTSTGYAVGSGTFKSTSIDGIADTGTTLLYLPATVVSAYWAQVSGAKSSSSVGGYVFPCSATLPSFTFGVGSARIVIPGDYIDFGPISTGSSSCFGGIQSSAGIGINIFGDVALKAAFVVFNGATTPTLGFASK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Endothiapepsin in complex with an inhibitor based on the Gewald reaction
rcsb
molecule keywords Endothiapepsin
molecule tags Hydrolase/hydrolase inhibitor
total genus 88
structure length 330
sequence length 330
ec nomenclature ec 3.4.23.22: Endothiapepsin.
pdb deposition date 2011-07-31

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00026 Asp Eukaryotic aspartyl protease
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.40.70.10 Mainly Beta Beta Barrel Cathepsin D, subunit A; domain 1 Acid Proteases 3t7xA02
2.40.70.10 Mainly Beta Beta Barrel Cathepsin D, subunit A; domain 1 Acid Proteases 3t7xA01
5HE5A 4FL8A 4ZSRA 3D91A 5ENMA 4CMSA 4ZPGA 4Y4XA 3VV8A 3UDKA 3UDMA 5P57A 3DM6A 3UQRA 2AQUA 3EM4A 4HZTA 1APWE 3EM3A 4YCKA 1YTJA 2ZHVA 1BVEA 5P6IA 4GB2A 3CICA 1Z1RA 5P3VA 5P4YA 3PLLA 4NJVA 1IDBA 4J0VA 4RGHA 4Y3ZA 5P5CA 1TSQA 5P75A 4B0QA 4L1AB 1APVE 3BGBA 5P5WA 3ER3E 1W5VA 1WBKA 3URIA 5HDVA 4HDBA 4Z22A 5I3WA 4LC7A 2VA6A 5P4FA 5P0IA 3A2OA 4Y3SA 4GJ6A 2G1NA 5P59A 5OZCA 5P5DA 4ZEAA 3S43B 5P7ZA 2QI0A 3L59A 3K5CA 4OD9B 2AZCA 5P06A 2PSVA 4RCFA 5P6QA 4LHHA 3RVIA 3JVYA 2I4VA 3CIDA 4LP9A 1F7AA 3KT5A 3UDHA 1M0BA 5F00A 4DFGA 2AOFA 5P7UA 2ER7E 3LPJA 3LINA 5P0TA 5P89A 1IZDA 3O9BA 4GJ7A 4DQFA 4DQHA 2AOIA 3ZPSA 3LZYA 1QDMA 2VJ7A 2RMPA 5E5JA 2QI5A 1VIJA 3EL4A 5P71A 4PZWA 1EEDP 5P3AA 5P4ZA 1E80E 5KR8A 3OUBA 4RCDA 5OZUA 5P7AA 3S54A 5P2EA 3KDBA 4YOBA 3O9DA 2P3BB 2PSUA 3G72A 4J1FA 2PH8A 4HA5A 4B05A 5P8DA 4YCYA 4QJ6A 1MRXA 5DQ2A 4Y5PA 5P5GA 4B00A 4DV9A 1K6CA 3ST5A 3OQ7A 3NXNA 4E43A 4FE6A 3VYFA 2AZ9A 3L38A 4X2LA 5OYRA 5P70A 2BPXA 2J9JA 3PBDA 5P68A 4DQEA 5P53A 5P41A 3ZKQA 5KQYA 1SH9A 5P28A 4LXKA 5P0RA 4QJ8A 4QLHA 1FLHA 3RU1A 1DW6C 2QZLA 2QAKA 2HPEA 4I10A 5HDZA 3LIXA 5HE4A 3BXRA 5ISKA 1LYBA 1HVRA 1XE5A 5P0XA 3HZCA 4BFDA 1SP5A 1ODWA 2FMBA 5P4KA 4R92A 2Q3KA 2PK6A 5C9DA 4GYEA 5OZQA 3OY4A 1DIFA 2XYFA 4PZXA 4DJQA 4Y53A 5P5QA 1ZPAA 4GZFA 1ZSFA 2R5PA 5P7SA 5B18A 5P4JA 3EKXA 1WKRA 2HS1A 3IVHA 4Y6MA 4Y48A 5P11A 1MPPA 4QJ7A 4NJTA 4OBKA 5P29A 2NXLA 4J1KA 3K5FA 2FGVA 4RROA 3DV5A 1EPLE 3ZL7A 3SM1A 1W50A 5P0HA 3S85A 2H6SA 5P80A 1FFIC 5OZWA 3APPA 5P2IA 2O4PA 3S7LA 3VG1A 4Y45A 2FNTA 2QHYA 4AA8A 5P6PA 2QMFA 1PSOE 5DR1A 3LIYA 5OZIA 5HTZA 5OZNA 4RYGA 5COPA 3UQPA 5P2TA 3OAGA 1MEUA 4H3GA 2ZE1A 3HBOA 3S53A 5P6OA 3LPKA 5P8HA 1IVPA 4Y3WA 5P8GA 1K6PA 1XL5A 4J0ZA 2AOEA 1FKNA 2O4KA 3S8IA 1TCWA 3NDTA 4RRNA 1FG6C 5HD0A 5P4BA 2IGXA 4Y4GA 5P7CA 5KQZA 4L7JA 3SA9A 5T4SA 2R9BA 1K1UA 2PC0A 3QRMA 4J0PA 1EC3A 3JVWA 5P87A 3R1GB 2ZYEA 4R5NA 2F8GA 3PMYA 3GI4A 5F01A 5P4DA 1A30A 5OZDA 1VIKA 2ER0E 5P4TA 2VNNA 5JG1A 3VF3A 5P5VA 3TLHA 4GJ9A 5P0AA 4QJ2A 3T7QA 5P0KA 5P69A 2ZJMA 4LAPA 3O9IA 5P3FA 2UY0A 4HEGA 4LBTA 2XYEA 4B1EA 5OZHA 1M4HA 1CPIA 5OZ4A 5P6LA 5P3OA 3NWXA 3SFCA 5IE1A 3ZKNA 5P1AA 4EJ8A 2VNMA 5P4PA 5P3UA 5P3CA 4KUPA 4Y3PA 1KJGA 1D4IA 3TOGA 5EZXA 4Y5MA 2BB9A 2G1YA 4GJDA 2P83A 1MESA 2G27A 3NWQA 5P3TA 1YG9A 3BRAA 5CONA 1E5OE 5P0ZA 4Y4UA 5P3IA 3S7MA 3OU1B 5P8SA 2F81A 4I12A 1T3RA 4YD7A 2A4FA 4CPXA 4Q1NA 3INHA 4Y5KA 4COEA 4OBZB 3PM4A 5P27A 4F75A 5P1XA 3KFNA 3QVIA 5P2WA 3L5DA 1HBVA 1LF2A 5P1FA 5P5XA 5P78A 5P37A 2QI6A 2QI3A 5OYTA 5P3HA 3TL9A 2A1EA 3Q4BA 5P0PA 5P34A 5P2OA 3UTLA 4RVXA 2QU2A 4K9HA 2MIPA 4K8SA 3NR6A 5P7BA 5P67A 1XE6A 3OK9A 1Z1HA 1HXWA 3T6IA 3FNUA 1D4JA 4GJAA 3OQAA 5P1JA 3SA4A 2Q63A 6UPJA 5P0EA 5P72A 4KB9A 5P39A 5OZBA 5P3KA 1SDTA 1B5FA 1TSUA 3TH9A 2AOCA 4F73A 2ZJNA 4RVIA 4Y3AA 4ZPFA 5P0BA 5P7RA 2QZWA 1C6XA 5DQ1A 2VIYA 4I0HA 5P83A 3OUDB 4YA8A 5P7QA 2IDWA 3UQWA 2PMAA 2Q55A 5P2XA 1FFFC 5P5ZA 4Y3LA 5P82A 1B6LA 3IXKA 2R3TA 2WEAA 2G69A 2FDEA 5P8UA 4R8YA 4I0IA 3PBZA 5P2BA 3FV3A 1PPKE 5HU1A 3K5GA 1UH8A 2OHSA 2Q5KA 2AOJA 4Y3DA 3VLAA 1MVPA 3O9CA 3SABA 1KJHA 2VIJA 4Y44A 5DPZA 4B1DA 2HM1A 5P07A 5P05A 3IN4A 5DQ5A 2G20A 4QJ9A 4CKUA 3WB5A 5P18A 3ZKIA 4NKKA 2NXMA 4Q1XA 5P2GA 4F76A 5P8PA 1ZP8A 3HAWA 2QI1A 5P6EA 5P5JA 3PHVA 4YHQA 5P3XA 2FXEA 2I4XA 4FIVA 1F34A 1AJXA 3QPJA 5P32A 1EBWA 4DJWA 5IVTA 5IS4A 1HVCA 3LIZA 3ZKMA 1G2KA 4Z50A 3RSXA 5P63A 4ZIPA 3EL1A 2JJJA 3F9QA 5P1LA 2CENA 2AZ8A 3CIBA 4J54A 1LYAA 4MC1A 1QS8A 3PI0A 4BFBA 5P26A 1BWAA 5P6VA 3SQFA 2QD7A 1A9MA 3PWWA 2AOHA 3TNEA 2IRZA 4DPIA 4EQ0A 3NDUA 5P6DA 5P3GA 5P0FA 4Y4AA 5P8VA 5DR7A 1FQ8A 1K6TA 1TCXA 3MXEA 2QMDA 1IZIA 2WEZA 3I25A 4B77A 2WKZA 2ZHTA 4HVPA 2VS2A 2WEBA 4I11A 5P1IA 3VUCA 2AVMA 1PSNA 2J9KA 2Q15A 3OHHA 5P0UA 3DK1A 5P8AA 4N00A 4J1IA 1K1TA 1GKTA 2G22A 3EKWA 2ZDZA 5P10A 5P8LA 3AUPA 3B7VA 2WF1A 5DQ4A 1NPAA 4K4PA 5P2DA 3GGXA 5ER2E 5P6SA 2P4JA 5P5RA 1G35A 4FLGA 1EC1A 3VSXA 5OZTA 1B6MA 2HS2A 4GJCA 3FSMA 3DCKA 1FQ6A 4APRE 4I0FA 4J1CA 5P13A 5P38A 3GI5A 1A8KA 5DR8A 5OZLA 3INDA 1IIQA 5P2KA 5P74A 5P3LA 2VKMA 4I0GA 2G1OA 3HVGA 3SPKA 4L7HA 5OZVA 5P49A 1MIQA 4DJPA 1QBUA 1ODYA 1EBZA 2QU3A 2QI7A 4KE1A 5P00A 4DJRA 4UPJA 5P31A 5P42A 4DJXA 5KR1A 2AVQA 5P2LA 3INFA 3TPPA 5P47A 3T7PA 4D88A 5P48A 1OHRA 3CKTA 1BBSA 3S45A 4FAFA 5P4MA 5P8JA 2F3EA 3OXXA 5P62A 5P4IA 1AZ5A 1JLDA 4RZ1A 5OZFA 1EPNE 3VCMA 1BV7A 3QROA 3KFRA 4Y5AA 3L5CA 4XX3A 4RRSA 4RYCA 5P73A 3DCRA 3KFPA 3URJA 4D83A 3FNSA 2FXDA 2HPFA 5P88A 1KJ4A 4I0EA 5P4WA 3QIHA 3UDPA 2V0ZC 1YTHA 2QNPA 1T7JA 4PYVA 3LITA 3NYGA 5KQXA 1CMSA 5P7PA 1LF4A 3IA9A 4M8YA 2OHRA 1LYWA 5P7XA 5P64A 5P7WA 3OU1A 1HPVA 3OOTA 3VFBA 2UPJA 5KAOA 4FGXA 1NPWA 1RNEA 4Y4WA 3BUHA 1OEXA 3CKPA 4OC6A 4Y35A 2IKUA 4OBZA 5P08A 3SA7A 2O4SA 3MXDA 5OZRA 4TRYA 1GVWA 4Y4EA 2RENA 4FRIA 4GJBA 4EHCA 1TQFA 4J17A 4Z4XA 5P17A 1B6PA 4IVTA 3KDCA 2QCIA 4Y4ZA 3N4LA 2B8VA 1HRNA 1LEEA 4PPHA 3FX5A 1HXBA 2XFIA 3L58A 3WZ8A 5OYXA 2QP8A 5P4LA 4H3FA 3UDQA 2QMPA 5P33A 2P3DA 2NXDA 5P58A 5P22A 2NNPA 5P43A 1IZHA 5P3JA 5OZEA 3QBFA 4EJKA 5ER1E 5P0WA 1FIVA 5P6AA 3DJKA 5P4EA 1D4YA 1W5YA 4FCOA 4EP2A 3Q3TA 2R43A 3GGAA 1GNOA 2FIVA 4Y4DA 2WF3A 5P6CA 4Y43A 3CKRA 2OHMA 2ZHUA 5OZ8A 3EM6A 3KA2A 2AIDA 1HPSA 5P5MA 4DJUA 3BGCA 1T7IA 4H3IA 2OF0A 3PI5A 3WSJA 4HDFA 3PSUA 1MSMA 2RKGA 3OADB 3T7XA 5P61A 5P8IA 2IEOA 5P1ZA 2I0AA 4YD3A 3RSVA 2R5QA 3EMYA 3OQKA 3PWMA 3R2FA 3NU4A 4ACUA 5P3PA 5OZSA 3I8WA 3FNTA 4JP9A 5P0CA 5KR0A 4DH6A 5P6GA 2NMYA 3TKGA 5P09A 5P3YA 3CMSA 3SA6A 5P5IA 3BUGA 5AHBA 1GVXA 5OZ3A 3K4VC 5OYWA 3OU4A 2Q64A 5P7GA 2V12C 4DJVA 1FQ7A 5SXNA 3UDYA 3UQXA 2AVOA 3KT2A 4RVJA 4JOOA 5P40A 1A94A 3L3AA 3MSLA 5ISJA 2ANLA 1EPQE 5P6JA 1ZAPA 3UFLA 5P2YA 1BVGA 2WL0A 5P7DA 4EPJA 3O9LA 1EPME 1OD1A 3ZLQA 2O4NA 3QI1A 1MT7A 5JFPA 3IVIA 4H3JA 5P1DA 5P35A 1EBYA 3QBHA 3LHGA 3VV6A 2IQGA 3DOXA 3NLSA 4JPEA 5P84A 1IDAA 5P5SA 3LZUA 3UPJA 4Y3RA 2VIZA 1BV9A 1ODXA 3RTHA 1HTGA 3D1ZA 2F3KA 2F3FA 5P4HA 1NPVA 2BJUA 1FB7A 5P0LA 2G24A 4EQJA 3KDDA 2BBBA 2QNQA 1ENTE 1XS7D 4NPTA 4Y3HA 5P1TA 4I0DA 5P5OA 5P04A 4EXHA 4EP3A 4ZSQA 1HSGA 5P5HA 5P7OA 5HDUA 4PHVA 3SAAA 3EXOA 4EYRA 5P65A 2NTRA 3LPIA 3SA8A 4I0JA 4Y5EA 3EL5A 3PSYA 1HIVA 5OZ9A 3GGUA 3EKTA 4L1AA 5P7NA 5I3XA 4CPSA 3ZMGA 3O99A 4X7IA 5OZ7A 5TOLA 5P3WA 5P2FA 3R0YA 1HTFA 2BPVA 2ZHRA 1LF3A 2ER6E 5P7TA 3UCBA 3EKQA 4DVFA 2J9JB 2BKSA 3S43A 5AH7A 4R91A 2JJIA 5OYVA 4OD9A 5P8CA 3KF0A 5P77A 3IGBA 3VEUA 1HWRA 2FS4A 4I8WA 4OBHA 5I3YA 4Q1YA 4I8ZA 1BWBA 5P1BA 3OGPA 5APRE 3HW1A 4D89A 2QD8A 4XXSA 5P16A 1XDHA 4AUCA 5P5BA 4DQGA 5P6MA 5P5LA 2WF2A 3GI0A 3VV7A 2FNSA 5J25A 4YDGA 1SMEA 2QI4A 4Q1WA 4AZYA 4FM7A 1DAZC 3G6ZA 1MERA 3KN0A 1YT9A 1NSOA 5P2HA 5P81A 7UPJA 3URLA 4FSEA 4I0ZA 4Y3JA 2BQVA 2V13A 5HDXA 2P3BA 2P3CA 1B6KA 3OXCA 1HVIA 1IZEA 1D4SA 5BS4A 2Z4OA 1UPJA 3VYDA 5P6XA 3LZVA 3JW2A 4Y39A 2I1AA 4Y5BA 5CLMA 5HU0A 3GW5A 5OYYA 2APRA 1AAQA 5P1QA 3PLDA 1HPXA 3BHEA 3PGIA 1HTRB 2ZGAA 1APUE 1IBQA 3VSWA 1YTIA 1TZSA 4Q5MA 5P7HA 3TPJA 4DI2A 4GMIA 1CZIE 7HVPA 5P55A 3B80A 3OWNA 4Y54A 3NU6A 5P52A 5IVSA 3O9GA 3PSGA 3BXSA 5P6KA 4NJSA 3WZ6A 3ZKSA 2BPWA 5C9FA 3M9FA 4MC2A 5AHAA 1GVTA 5P7JA 5P60A 1T6GA 3ZKXA 1YX9A 2PK5A 3OUCA 5OZJA 2NNKA 1SDVA 5OZYA 1MT9A 2ER9E 3R4BA 2EWYA 5P24A 5OYZA 4TRZA 2B7FA 3OAGB 2WHHA 2NMZA 3TOHA 5P7LA 4Y37A 4AMTA 5P8BA 3QP0A 4Y3NA 4KE0A 5P5PA 1RL8A 5P8KA 5SY3A 5P86A 1HVKA 4ZSPA 1YM2A 1T7KA 1W5XA 2BKTA 5P5KA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 5HE5 A;  4FL8 A;  4ZSR A;  3D91 A;  5ENM A;  4CMS A;  4ZPG A;  4Y4X A;  3VV8 A;  3UDK A;  3UDM A;  5P57 A;  3DM6 A;  3UQR A;  2AQU A;  3EM4 A;  4HZT A;  1APW E;  3EM3 A;  4YCK A;  1YTJ A;  2ZHV A;  1BVE A;  5P6I A;  4GB2 A;  3CIC A;  1Z1R A;  5P3V A;  5P4Y A;  3PLL A;  4NJV A;  1IDB A;  4J0V A;  4RGH A;  4Y3Z A;  5P5C A;  1TSQ A;  5P75 A;  4B0Q A;  4L1A B;  1APV E;  3BGB A;  5P5W A;  3ER3 E;  1W5V A;  1WBK A;  3URI A;  5HDV A;  4HDB A;  4Z22 A;  5I3W A;  4LC7 A;  2VA6 A;  5P4F A;  5P0I A;  3A2O A;  4Y3S A;  4GJ6 A;  2G1N A;  5P59 A;  5OZC A;  5P5D A;  4ZEA A;  3S43 B;  5P7Z A;  2QI0 A;  3L59 A;  3K5C A;  4OD9 B;  2AZC A;  5P06 A;  2PSV A;  4RCF A;  5P6Q A;  4LHH A;  3RVI A;  3JVY A;  2I4V A;  3CID A;  4LP9 A;  1F7A A;  3KT5 A;  3UDH A;  1M0B A;  5F00 A;  4DFG A;  2AOF A;  5P7U A;  2ER7 E;  3LPJ A;  3LIN A;  5P0T A;  5P89 A;  1IZD A;  3O9B A;  4GJ7 A;  4DQF A;  4DQH A;  2AOI A;  3ZPS A;  3LZY A;  1QDM A;  2VJ7 A;  2RMP A;  5E5J A;  2QI5 A;  1VIJ A;  3EL4 A;  5P71 A;  4PZW A;  1EED P;  5P3A A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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