3VCMA

Crystal structure of human prorenin
Total Genus 77
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
77
sequence length
335
structure length
335
Chain Sequence
LTLGNTTSSVILTNYMDTQYYGEIGIGTPPQTFKVVFDTGSSNVWVPSSKCSRLYTACVYHKLFDASDSSSYKHNGTELTLRYSTGTVSGFLSQDIITVGGITVTQMFGEVTEMPALPFMLAEFDGVVGMGFIEQAIGRVTPIFDNIISQGVLKEDVFSFYYNRDSLGGQIVLGGSDPQHYEGNFHYINLIKTGVWQIQMKGVSVGSSTLLCEDGCLALVDTGASYISGSTSSIEKLMEALGAKKRLFDYVVKCNEGPTLPDISFHLGGKEYTLTSADYVFQESYSSKKLCTLAIHAMDIPPPTGPTWALGATFIRKFYTEFDRRNNRIGFALAR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Human Prorenin Structure Sheds Light on a Novel Mechanism of Its Autoinhibition and on Its Non-Proteolytic Activation by the (Pro)renin Receptor.
pubmed doi rcsb
molecule keywords prorenin
molecule tags Hydrolase
source organism Homo sapiens
total genus 77
structure length 335
sequence length 335
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.4.23.15: Renin.
pdb deposition date 2012-01-04

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00026 Asp Eukaryotic aspartyl protease
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.40.70.10 Mainly Beta Beta Barrel Cathepsin D, subunit A; domain 1 Acid Proteases 3vcmA02
2.40.70.10 Mainly Beta Beta Barrel Cathepsin D, subunit A; domain 1 Acid Proteases 3vcmA01
1LF3A 5I3VA 4I0IA 3T7QA 4J1CA 3PSGA 5P8DA 3PWRA 3CIBA 5P3FA 1NH0A 2FDEA 5P0TA 3SM1A 4Y3ZA 1MSMA 3ST5A 3SA6A 4ZPGA 5P2AA 4D89A 4LXMA 3NUOA 3ZPSA 1DMPA 2RKFA 1EPNE 4FRJA 5F00A 4R92A 4Y51A 1ZSFA 5P5PA 5KAOA 1CZIE 1A94A 3LPIA 5P14A 1W5VA 1T3RA 5P56A 3K5FA 5P3WA 1WBMA 5HDVA 5P0PA 3KFSA 5KQYA 2QD7A 3HDKA 4Q1NA 3TNEA 3RU1A 5P54A 4EHCA 4OBZA 3VV7A 5P4RA 2IDWA 5E5KA 5P04A 5P78A 1FF0C 2ZYEA 5P4KA 1B6JA 3NXEA 1TSQA 1PPKE 2G27A 5CONA 3EC0A 4Z2ZA 3OAGA 3RVIA 2R43A 4J1IA 5PEPA 1DIFA 5IVSA 3NU6A 3OXCA 3PEPA 3TPPA 5P5FA 2PH6A 1IVPA 4YDFA 5DQ5A 2MIPA 4EP2A 1D4LA 4WY1A 5P0SA 4Y5BA 3ZMGA 4GZFA 4DV9A 4DQFA 2QNPA 5P07A 5AGZA 4Y3SA 1ZJ7A 3SKGA 3H5BA 3O9CA 4Y38A 4X2LA 2NXMA 2AQUA 3NDTA 4NJUA 3OY4A 4I0GA 4J1HA 3UQPA 3SA9A 3HVPA 2UXZA 4Y45A 1NSOA 3GGAA 2AZBA 5AHAA 3S8IA 1LYAA 4GJ6A 1K1UA 4D83A 2RMPA 4XX3A 4Y36A 5COPA 5P1VA 2BQVA 3IXKA 1LS5A 5P3QA 1BWBA 5P1UA 3R1GB 4OBZB 3QI1A 4I11A 4K9HA 3TOGA 3PGIA 3SA4A 3QP0A 5P76A 3KT2A 3DOXA 3FNTA 3SA3A 5P4FA 5AH8A 5ENKA 5OZFA 3RSVA 5OZAA 2VKMA 2F8GA 3OAGB 3MSJA 4Y43A 2IGYA 4Y48A 5P6QA 4ZE6A 3UQUA 5P7HA 1XE6A 3HVGA 2I4QA 4GMIA 5HCTA 1EPRE 2QI7A 1TCWA 4COEA 4FLGA 4I12A 1KJ4A 5HE5A 1HBVA 4BEKA 5P1JA 3EXOA 2P3CA 3IVIA 4Z4XA 4DQEA 2XFJA 3EM4A 2XFKA 5OZZA 1GVUA 1KJ7A 3D20A 4PPHA 3R2FA 1QRPE 5P5JA 2I4DA 1LYAB 4J0ZA 4D85A 5P2CA 3EKXA 5P87A 1GNMA 4KE0A 1SIVA 5OZLA 3TPLA 2Q5KA 2ZJHA 5P2WA 4APEA 1SH9A 1HHPA 3B7VA 3INFA 3NR6A 5HD0A 2AVOA 3T7PA 3PSYA 1Z1HA 4FM6A 3B80A 1GKTA 4DQBA 2FNTA 2I0DA 1G0VA 5P8PA 5P84A 4K8SA 2Q11A 3LIQA 4ER4E 5P5NA 3VFAA 4H3JA 3VF7A 3S54A 1MPPA 2IQGA 2PSGA 3NYGA 5OYVA 5P67A 5SXNA 5P63A 3O9IA 1BWAA 4ZEAA 5P1RA 2QD6A 4ZSMA 3VV8A 4EWOA 4B78A 1MERA 5P5ZA 3T6IA 4Y5LA 2HPEA 2WF4A 4RCEA 5P4YA 1AIDA 3C9XA 5P48A 5I3YA 1MIQA 5DQ1A 2HS1A 3OUCA 4Y3XA 2QNQA 3RTNA 3WZ8A 5P5KA 2I4VA 2QD8A 3INHA 5P25A 4Y3NA 2ZHUA 1XN3A 1MT8A 1DP5A 5P42A 3OUDB 6UPJA 4FRKA 2Q54A 2I4XA 2OHLA 5P8UA 5P88A 4J5JA 3HBOA 3VUCA 2ER9E 4Y3HA 3HAWA 5P4SA 3UDHA 3ZLQA 2R5PA 1MVPA 2H6TA 5P7ZA 1HVKA 3NLSA 2AVVA 1LYBB 4J1KA 1RNEA 1XE5A 4Y9WA 3QVIA 4Y3MA 5KOSA 3LZSA 1FQ7A 3DJKA 1D4IA 5P1XA 3F9QA 2ZJLA 4YD6A 5P1EA 5I3XA 1HPVA 5P2XA 5P39A 1T7IA 5HCOA 4Y3FA 5P6FA 3O9EA 3TH9A 3BVBA 5OZTA 5P6MA 3UFLA 2WKZA 4NJSA 4WY6A 5P0DA 5P4MA 4B77A 4U7QA 4DQGA 5P4AA 2QI1A 5JODA 1ENTE 1HPSA 1G35A 1W6HA 5P2EA 5P5OA 4AUCA 4YOBA 5P8FA 2NR6A 3FNSA 4B00A 4CMSA 4YCYA 1B11A 5P2DA 5P8RA 2G1NA 1XDHA 1UH7A 5P0GA 1D4KA 3TPRA 2F3EA 5P8JA 2V10C 5DQ4A 2BBBA 5JG1A 3URLA 4KB9A 4UPJA 5DGUA 2FNSA 5P83A 2SAMA 2G26A 1FLHA 3TKWA 2QHZA 4OBJA 3UQXA 3K4VC 1FQ5A 4NKKA 5P1NA 5DR4A 5P50A 5I3WA 1Q9PA 3O9AA 4MC6A 3PBZA 1VIKA 4YD3A 4HE9A 5P1CA 3BHEA 2O4PA 1K1TA 3T11A 5P47A 3KF0A 2I4WA 3S85A 5P44A 3S45A 3EL9A 4Y53A 1NPVA 4Y5PA 3LZVA 4DVFA 4I0JA 3O9GA 5HVPA 1MRWA 2Z4OA 5P8SA 1HWRA 3VSXA 4U8WA 3TOHA 3I25A 5P6ZA 4Y54A 2JYSA 4YCTA 4GIDA 2PC0A 4J55A 1HVSA 2AODA 5P03A 1PSNA 3KYRA 2ANLA 5P7IA 4QJ9A 3JVWA 4RGHA 1ZP8A 3TLHA 4L7HA 1EPPE 3QROA 5P7GA 4HEGA 4B1DA 4AA9A 4RROA 5P00A 4EJ8A 5P74A 2AZCA 5P0EA 5P6XA 5OZQA 5IVQA 4BFDA 3OHFA 4B1EA 4N00A 3BGBA 5P7LA 3SO9A 1APWE 1QBUA 2QMDA 5P24A 5ISKA 2R5QA 5P0MA 1GVVA 5P6NA 1PSAA 2RENA 1RL8A 5OYUA 5P1QA 4OBFA 4RVXA 1ZBGA 2ZJJA 3OXWA 3PB5A 5P3ZA 4B70A 5P6CA 3FKTA 1T6GA 5P43A 1WBKA 4OBDA 4Q1XA 5P3UA 5P8HA 1HTEA 1YTGA 2A1EA 5P0RA 2G1OA 4FE6A 3VCMA 2VJ9A 4FAEA 2BKSA 3L5EA 5OZSA 3DV1A 3UPJA 2QAKA 1YT9A 5P2FA 1LF2A 3O9DA 3OGPA 1IBQA 2IRZA 5P7SA 3SFCA 5KQXA 2OHSA 2WHHA 4PYVA 5P2GA 1PSOE 1HSHA 1EPOE 3UDPA 1AM5A 5P5YA 4LC7A 3S56A 4QJ2A 3CKRA 1K2CA 5P3KA 1HSGA 2BJUA 5OZMA 3N3IA 2QHYA 5P3YA 5P85A 2PYMA 5P7NA 5P75A 4XX4A 3LIVA 1IZHA 4Y47A 5P7PA 3G6ZA 3K5DA 5P4UA 3UF3A 2VJ6A 3UDMA 3KM4A 1HIIA 5OYSA 5P5UA 2ZE1A 1B5FA 3BC4A 5IE1A 5P64A 5OZ8A 5P17A 2O4SA 2P3DA 4DQCA 1A30A 2CEJA 4DI2A 2Z54A 3EL0A 2OHQA 3BXRA 1META 1FIVA 3KMXA 5SZ9A 2FDPA 1SIPA 4DJVA 4F76A 3UDQA 4F73A 5DGWA 4I0DA 2VJ7A 1ER8E 5P79A 5E5JA 4I10A 1BDQA 1K6CA 5P77A 1RV7A 3VFBA 4EP3A 3O9BA 2QZXA 3CYXA 3TKGA 5P2SA 2WEZA 3KFRA 5P2RA 1EC3A 2FMBA 2O4NA 3VLBA 4ACUA 2VNNA 5OZHA 5P7WA 3KMYA 5P7YA 3GI4A 5P7RA 4A6BA 1HVRA 3QIHA 5BRYA 5P8MA 5P4LA 3LZUA 4A4QA 1SGUA 3CKPA 4I0ZA 4DPIA 1B5FB 3CYWA 5P1KA 5P2YA 3LHGA 1LF4A 4ZSRA 3VF5A 5C9FA 2AOEA 3T3CA 8HVPA 2O4KA 3WB5A 3S53A 1QBSA 5P1TA 4I8ZA 3EKPA 5OYYA 5P59A 3OADA 1BXQA 4R8YA 3KDCA 1B6KA 5P5HA 5P70A 4Y3YA 3BVAA 5HE4A 2HS2A 2ZHRA 5P3TA 4YHQA 4YBIA 1YTJA 5HE7A 3O9HA 5P86A 3FNUA 1CPIA 1IZEA 3BUFA 4FAFA 2OAHA 3PHVA 1XS7D 2QK5A 4OBHA 1W51A 5P7BA 1SGZA 4EXHA 2IKOA 5P6SA 4M8XA 1T6EX 5P45A 5P2LA 5P0IA 2VA6A 7UPJA 2IGXA 1E81E 5P80A 3QAAA 3U71A 3IGBA 3MSKA 1FFIC 1FQ6A 3O9LA 5P1MA 2CEMA 4RLDA 3OU4A 1WKRA 3R4BA 2BPZA 3LITA 5P51A 1NPAA 2RSPA 5AH9A 5P5XA 1MT9A 5P53A 3UCBA 3G72A 4GYEA 2ZJIA 4Y39A 2ZJNA 3OUBA 2V16C 1PPLE 4AZYA 4Y3RA 2ZHTA 3R0YA 3SLZA 5DQCA 1KJHA 3GI5A 2QI3A 1LEEA 5P08A 1HVIA 5P8BA 4YE3A 4Y44A 5P38A 1ZPAA 4D88A 5P36A 3OADB 5P7VA 5P6PA 5P4BA 3IA9A 3UFNA 5P0YA 4Y5MA 4Y5NA 1HIHA 4TRYA 2QHCA 5P2MA 5P4JA 5P0AA 1F7AA 1BILA 2QMGA 4NPUA 5P71A 2I4UA 4LXAA 5OZGA 5KOQA 2B8VA 2JXRA 3CKTA 5FIVA 3D1XA 4QJ7A 1D4SA 5P28A 4FM7A 1HEFE 2H6SA 1TSUA 2G94A 3QBFA 3SM2A 5P3PA 3H0BA 4Y3PA 3NUJA 4TVGA 5DR8A 1BXOA 4GJDA 5OZUA 2VIJA 2NMZA 2FXEA 5P6OA 5KR8A 3OWNA 5P7QA 3OU4B 2R8NA 3OQKA 5P6EA 4Y35A 5P4WA 5P0HA 3ZKIA 1N49A 5OYZA 2AOFA 2AVSA 3S43A 2J9JA 5HDZA 5DQ2A 1PPME 2PK5A 5P10A 4Y3EA 4J54A 4Y3GA 3NU9A 5P8IA 5OYTA 4B72A 5P2BA 4TRWA 5P6BA 3VF3A 1W5YA 3VG1A 4QLHA 4YA8A 4Y4ZA 2B7ZA 5OZ9A 4JOOA 4R5NA 4I0FA 1YG9A 5P8GA 3ZPTA 3DM6A 3NU3A 5P0FA 5P6HA 1GVXA 2BKTA 1FG6C 3SKFA 2BB9A 4JP9A 5OZ3A 5P01A 5P31A 3BGCA 5P4NA 3GW5A 2VNMA 1A9MA 3I7EA 5P0LA 1ODXA 5P1IA 5P61A 3ZL7A 1SDTA 1UH9A 3ZKGA 4CPQA 3S7MA 3CMSA 3ZKSA 4Y5AA 4RYGA 3KFNA 2R3TA 2QI6A 5OZ7A 5P81A 2J9JB 1KZKA 3MXDA 1EEDP 1PFZA 5P57A 1A8GA 1AXAA 5OZXA 4CKUA 5P06A 2QP8A 5P8NA 5P29A 1HIVA 5OZOA 5P3BA 2PYNA 3NWXA 2G22A 1APVE 4Y4DA 3INEA 3OOTA 3NDXA 3PMYA 5P3VA 5P05A 1D4HA 4AA8A 3L3AA 4GJAA 5IS4A 3EKTA 5KR2A 4OBGA 1C6YA 2ZGAA 3KT5A 4HDFA 5P8CA 5P30A 4NJTA 3WZ7A 2PQZA 3Q6YA 5P0BA 5P23A 5P1GA 5P16A 5P5LA 1ODYA 1HVJA 1DW6C 1FB7A 4Y57A 4Q5MA 4A6CA 2F3FA 5OZ6A 1EC1A 3PRSA 3UQRA 3LNKA 5P6VA 5P7OA 5P3XA 3SABA 3NDUA 5P0VA 4J1EA 5DPZA 5P4EA 2O40A 4FIVA 4MC2A 4GB2A 1D4YA 4M8YA 4Y3AA 5P5GA 5P22A 1MTBA 2HB3A 5P2UA 2F3KA 3OQAA 3NXNA 3JVYA 4LL3A 3WB4A 1B6MA 3FX5A 4J17A 1BV9A 4TRZA 1IIQA 4B1CA 1GVWA 1EPQE 4FL8A 5P5VA 2QNNA 1SDVA 3ZKNA 3VV6A 5P0WA 1HSIA 1ZAPA 4CPRA 5P5EA 1PROA 2XYFA 5P1WA 1FQ4A 3KA2A 3OQFA 3PCWA 1QBTA 4RVJA 3K5CA 1YM4A 5P73A 4Q1YA 3ZPUA 1FEJC 5P62A 4RYCA 3QVCA 1DAZC 5P82A 3SQFA 5P6IA 2ASIA 4Y3LA 1EPME 4Z50A 3L5BA 4YBFA 5P0CA 5P49A 4R91A 4ZPFA 3FIVA 4Y37A 3QRMA 3LZYA 4E43A 1OHRA 3UTLA 3APPA 4RRSA 2XYEA 3RTHA 1HEGE 2OHTA 3OU1A 2Q55A 3IN4A 3L5DA 2OHUA 3GI0A 5P5TA 4K4PA 1F34A 3HW1A 1Z1RA 4CPUA 4DJWA 2NPHA 2QI0A 5AHCA 4U7VA 1BDRA 5B18A 4Y3QA 7HVPA 4TVHA 5P5CA 5P58A 4ZSQA 3SAAA 4HLAA 5P1AA 2G1RA 2WF2A 3AUPA 3PJ6A 5DR7A 4Y4GA 5KQZA 1YTHA 1LV1A 5J25A 1AZ5A 4HDBA 5DR3A 4HA5A 2AZ9A 3OUAA 4GJCA 3L59A 3QRSA 3NDWA 5P2JA 2AOCA 4Y4XA 5P37A 4ER2E 1M43A 3UHLA 1M0BA 4L1AA 3PLLA 1E82E 1EC2A 4Y58A 5HDUA 5P8TA 2P8HA 1XL2A 3EL5A 4IVSA 5P5MA 1BDLA 3SA7A 2VS2A 5OZ5A 1C6XA 2NXLA 5P8AA 2QMPA 4H3GA 4RRNA 4Y4WA 3NU4A 5ISJA 4KUPA 4GJ7A 2HAHA 5P4GA 5OYRA 1C70A 3D91A 2G69A 3OU1B 1HOSA 1IZIA 1APUE 1BVEA 2V12C 3PCZA 5APRE 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 1LF3 A;  5I3V A;  4I0I A;  3T7Q A;  4J1C A;  3PSG A;  5P8D A;  3PWR A;  3CIB A;  5P3F A;  1NH0 A;  2FDE A;  5P0T A;  3SM1 A;  4Y3Z A;  1MSM A;  3ST5 A;  3SA6 A;  4ZPG A;  5P2A A;  4D89 A;  4LXM A;  3NUO A;  3ZPS A;  1DMP A;  2RKF A;  1EPN E;  4FRJ A;  5F00 A;  4R92 A;  4Y51 A;  1ZSF A;  5P5P A;  5KAO A;  1CZI E;  1A94 A;  3LPI A;  5P14 A;  1W5V A;  1T3R A;  5P56 A;  3K5F A;  5P3W A;  1WBM A;  5HDV A;  5P0P A;  3KFS A;  5KQY A;  2QD7 A;  3HDK A;  4Q1N A;  3TNE A;  3RU1 A;  5P54 A;  4EHC A;  4OBZ A;  3VV7 A;  5P4R A;  2IDW A;  5E5K A;  5P04 A;  5P78 A;  1FF0 C;  2ZYE A;  5P4K A;  1B6J A;  3NXE A;  1TSQ A;  1PPK E;  2G27 A;  5CON A;  3EC0 A;  4Z2Z A;  3OAG A;  3RVI A;  2R43 A;  4J1I A;  5PEP A;  1DIF A;  5IVS A;  3NU6 A;  3OXC A;  3PEP A;  3TPP A;  5P5F A;  2PH6 A;  1IVP A;  4YDF A;  5DQ5 A;  2MIP A;  4EP2 A;  1D4L A;  4WY1 A;  5P0S A;  4Y5B A;  3ZMG A;  4GZF A;  4DV9 A;  4DQF A;  2QNP A;  5P07 A;  5AGZ A;  4Y3S A;  1ZJ7 A;  3SKG A;  3H5B A;  3O9C A;  4Y38 A;  4X2L A;  2NXM A;  2AQU A;  3NDT A;  4NJU A;  3OY4 A;  4I0G A;  4J1H A;  3UQP A;  3SA9 A;  3HVP A;  2UXZ A;  4Y45 A;  1NSO A;  3GGA A;  2AZB A;  5AHA A;  3S8I A;  1LYA A;  4GJ6 A;  1K1U A;  4D83 A;  2RMP A;  4XX3 A;  4Y36 A;  5COP A;  5P1V A;  2BQV A;  3IXK A;  1LS5 A;  5P3Q A;  1BWB A;  5P1U A;  3R1G B;  4OBZ B;  3QI1 A;  4I11 A;  4K9H A;  3TOG A;  3PGI A;  3SA4 A;  3QP0 A;  5P76 A;  3KT2 A;  3DOX A;  3FNT A;  3SA3 A;  5P4F A;  5AH8 A;  5ENK A;  5OZF A;  3RSV A;  5OZA A;  2VKM A;  2F8G A;  3OAG B;  3MSJ A;  4Y43 A;  2IGY A;  4Y48 A;  5P6Q A;  4ZE6 A;  3UQU A;  5P7H A;  1XE6 A;  3HVG A;  2I4Q A;  4GMI A;  5HCT A;  1EPR E;  2QI7 A;  1TCW A;  4COE A;  4FLG A;  4I12 A;  1KJ4 A;  5HE5 A;  1HBV A;  4BEK A;  5P1J A;  3EXO A;  2P3C A;  3IVI A;  4Z4X A;  4DQE A;  2XFJ A;  3EM4 A;  2XFK A;  5OZZ A;  1GVU A;  1KJ7 A;  3D20 A;  4PPH A;  3R2F A;  1QRP E;  5P5J A;  2I4D A;  1LYA B;  4J0Z A;  4D85 A;  5P2C A;  3EKX A;  5P87 A;  1GNM A;  4KE0 A;  1SIV A;  5OZL A;  3TPL A;  2Q5K A;  2ZJH A;  5P2W A;  4APE A;  1SH9 A;  1HHP A;  3B7V A;  3INF A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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