3VSWA

Human renin in complex with compound 8
Total Genus 88
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
88
sequence length
340
structure length
340
Chain Sequence
LTLGNTTSSVILTNYMDTQYYGEIGIGTPPQTFKVVFDTGSSNVWVPSSKCSRLYTACVYHKLFDASDSSSYKHNGTELTLRYSTGTVSGFLSQDIITVGGITVTQMFGEVTEMPALPFMLAEFDGVVGMGFIEQAIGRVTPIFDNIISQGVLKEDVFSFYYNRDSENSQSLGGQIVLGGSDPQHYEGNFHYINLIKTGVWQIQMKGVSVGSSTLLCEDGCLALVDTGASYISGSTSSIEKLMEALGAKKRLFDYVVKCNEGPTLPDISFHLGGKEYTLTSADYVFQESYSSKKLCTLAIHAMDIPPPTGPTWALGATFIRKFYTEFDRRNNRIGFALAR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Design and optimization of novel (2S,4S,5S)-5-amino-6-(2,2-dimethyl-5-oxo-4-phenylpiperazin-1-yl)-4-hydroxy-2-isopropylhexanamides as renin inhibitors
pubmed doi rcsb
molecule keywords Renin
molecule tags Hydrolase/hydrolase inhibitor
source organism Homo sapiens
total genus 88
structure length 340
sequence length 340
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.4.23.15: Renin.
pdb deposition date 2012-05-11

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00026 Asp Eukaryotic aspartyl protease
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.40.70.10 Mainly Beta Beta Barrel Cathepsin D, subunit A; domain 1 Acid Proteases 3vswA02
2.40.70.10 Mainly Beta Beta Barrel Cathepsin D, subunit A; domain 1 Acid Proteases 3vswA01
2I4VA 2AOGA 5OYXA 1KJ7A 5P67A 2B60A 2HS2A 3LINA 3S7LA 4Y56A 4Z2ZA 3EBZA 4Y5LA 4ZSQA 5P8EA 1UPJA 3NUJA 3SLZA 2FGVA 4AMTA 4NPTA 1GVTA 4I0FA 4EQ0A 5IVRA 3IAWA 4H3FA 3UTLA 2FDEA 2RSPA 4ACUA 1HPSA 3O9DA 2QP8A 2BPVA 3ER5E 1XN2A 3R2FA 4ZLSA 2FIVA 5CLMA 1IDAA 5P1SA 3HBOA 3LZSA 3QAAA 1XE5A 2I0DA 1SBGA 4YE3A 2G26A 4MC2A 5P72A 4PPHA 3UFLA 5IS4A 5P7OA 1W51A 5HVPA 4J0TA 5P2OA 1KJFA 2P4JA 5JFPA 1GNNA 3KFSA 5P6TA 4OBGA 2QK5A 1TQFA 1ZP8A 2QMDA 3UDYA 1BWAA 5OZ9A 5P41A 4I0GA 4RZ1A 5P24A 4Y5NA 5SY3A 3CKPA 1LF3A 3PVKA 5P2AA 5P6LA 5P51A 4L7JA 5P40A 1LYBA 5P1DA 2BKSA 5P6UA 1YT9A 3BC4A 3D3TA 3PM4A 5P4AA 5ENMA 5P5YA 1IZDA 3APRE 3BHEA 4EJ8A 1QS8A 4Q1YA 3OUBA 3QS1A 5FIVA 2AVMA 1U8GA 3O9GA 5P3TA 3TH9A 3GGXA 5P5KA 2ZJJA 5P45A 4R5NA 1IIQA 5C9BA 4YD7A 4BFDA 1MEUA 4ZPEA 5P7KA 3LHGA 3Q4BA 5P4PA 4R92A 5OZYA 3UQRA 2V10C 1EC0A 5P1XA 2IL2A 2O40A 4LAPA 4NJUA 5P1QA 3VYEA 5BWYA 1SP5A 4ER4E 3T6IA 3DV1A 1BAIA 5DGUA 1A30A 3R1GB 4F76A 5OYUA 2AZBA 5P4FA 3OUAA 4YOAA 5EZXA 4FIVA 5P8LA 5P2NA 2APRA 4F74A 4YBIA 5P2CA 3CICA 4CPXA 3NU3A 5P0UA 1NSOA 3TPLA 2BJUA 3DK1A 2UXZA 9HVPA 4EJKA 2FLEA 2QHCA 4DVFA 2WF3A 3I6OA 2QZWA 3SFCA 5P78A 3QBHA 3BVAA 2I0AA 3OXWA 4LBTA 5P3SA 5P4SA 4I0ZA 3NDTA 5HDXA 5P60A 5OZ7A 5IE1A 1E81E 3RSXA 5P0TA 1HOSA 4GJBA 4R91A 4H3GA 3EXOA 4WTUA 5F00A 1FG8C 2QMGA 4DQGA 4Y44A 1E82E 2BB9A 3IA9A 1LYAB 4I0EA 4Y3WA 5P38A 1BXOA 3OGPA 4R8YA 5P7UA 5P8SA 5P04A 2H6TA 3CKRA 5HU1A 2PK6A 4OBHA 5P1GA 4I8WA 2FMBA 1G6LA 2Q11A 3UDRA 2OHPA 4J0ZA 1APVE 2F3EA 5P0SA 2AIDA 4FSLA 4DJXA 4I12A 3EKTA 4LXAA 3O9BA 3NXNA 5P5EA 3S45A 5P2SA 5P43A 5P6EA 5COKA 5P3YA 5JG1A 5KQXA 2QI3A 2PWCA 3I25A 1RV7A 1W5WA 5DQ4A 1IVPA 3HW1A 3SA3A 2G21A 3GI4A 3CKTA 5P3KA 1MRXA 2P8HA 3T11A 3L3AA 5P1CA 3D20A 3BGCA 5P1EA 3OU4B 4DQHA 4OBZA 5P15A 5P1UA 5P6VA 5P03A 4RCFA 3EKVA 2P3DA 3TOFA 2WF1A 3HAWA 5P01A 1EPLE 5OZPA 3URLA 1HVKA 4DQFA 5P18A 4GJ6A 5P2IA 2ZE1A 1APTE 3O9LA 1VIJA 2FXDA 2QI7A 3UFNA 1KZKA 5P2DA 5P5SA 5P1LA 5P0PA 3KM4A 2P3BB 1G0VA 4XX3A 4Y4ZA 3KFNA 3ZKXA 4K4PA 4EQJA 3BRAA 4L6BA 4J55A 5SXNA 4Y3XA 1FG6C 3HLOA 5OZ0A 1D4HA 4NPUA 2OHRA 3FNTA 1ZBGA 1RQ9A 4Y41A 2QI0A 4MC1A 1BV7A 3VF3A 4J1IA 4NJSA 1LYWB 4YD4A 6UPJA 3FKTA 4N00A 3TTPA 2ASIA 5ER1E 5B18A 3UQUA 1A94A 2QCIA 3EKPA 4FCOA 1BDQA 3R4BA 3S56A 5P3WA 4EXHA 2Z54A 5P0NA 5OZBA 5P61A 3K5FA 3K5CA 4XXSA 2QAKA 1APWE 5P5ZA 2FXEA 5ENKA 2IS0A 5P3AA 5P0VA 5P1HA 2SAMA 3NYGA 3EKQA 5P2FA 2NPHA 5P7MA 5IVTA 2QI6A 3PGIA 1TZSA 5P8MA 2ER6E 3IVIA 1HXWA 3APPA 5KAOA 5P56A 5BRYA 1SMRA 4Z22A 5P4RA 2Q55A 5OZ8A 2G1NA 1FQ5A 4YCTA 5OZJA 3O9HA 5P7DA 3PI5A 2F3KA 4HE9A 2ANLA 5HE4A 3D1YA 1K6PA 3FSMA 1HIHA 4Y51A 1C6ZA 3DV5A 3OU1A 3Q70A 4X7IA 4U7VA 5P30A 4YCKA 3PWRA 5OZ3A 5P5DA 1MTRA 2ZJIA 3EL5A 1AJXA 4QJ2A 5P47A 4HEGA 3EMYA 3K4VC 5P3UA 1YTIA 2AZ8A 3N3IA 4D85A 4I10A 1EC3A 3L38A 4D83A 2WF2A 1DPJA 4H3IA 1W5VA 3ZOVA 3S43A 2OHQA 3FNUA 5PEPA 3ZL7A 5P62A 2VJ9A 3BUFA 4WY1A 1AAQA 4JP9A 2CEMA 2R3WA 4AA9A 3UQWA 1ZAPA 4KUPA 4XKXA 3FNSA 5AH6A 2V0ZC 3SA6A 5P4YA 1FQ6A 4FM6A 5TOLA 5P8OA 3KDDA 5P4XA 2AODA 1TCWA 1BDRA 5P11A 5P66A 5P73A 3VG1A 4TVGA 4EWOA 3NWXA 4TRYA 2G69A 4K4RA 4AZYA 1ZPKA 5P2LA 3PRSA 5P1PA 3CIBA 4J1CA 3CIDA 3QP0A 1LS5A 4WY6A 3DJKA 3UDPA 2I4WA 3BGBA 1ZTZA 3LZUA 4L1AA 4E43A 5P55A 5OYRA 2RKGA 1EPRE 2VIZA 1HVLA 5P8FA 5P00A 1K1UA 1B5FB 4CPSA 3NU5A 1OEXA 3OAGB 4Y48A 5P7QA 3VFAA 2J9JB 5P0QA 1EBKC 5P3VA 3RTMA 4QJAA 4B77A 1DMPA 4FAFA 5P36A 1HVCA 4UPJA 5P2QA 4ZEAA 4U8WA 2OHSA 3ZPSA 1HTFA 4B72A 1T3RA 3KMXA 3VEUA 2IEOA 4R95A 4CPWA 2ER0E 2WECA 5P59A 1ZJ7A 5OZWA 2VIEA 1SIVA 3DCKA 4Y5AA 2NTRA 2OHLA 2JYSA 1FFFC 2OHMA 4CMSA 4Y3AA 2ZHTA 3LIZA 3GGAA 4YOBA 5CONA 2WL0A 3OQKA 3Q5HA 3S54A 5P8QA 2O4KA 1FFIC 1ZSRA 4QJ6A 5P08A 1FIVA 3HAUA 5P0WA 5P1AA 3UDKA 5OZNA 5P2RA 2PC0A 1XDHA 5P6MA 5OZKA 4ACXA 5P6SA 1KJ4A 4NJVA 3ZKNA 1C6YA 5P3IA 3VV7A 5P3BA 3G72A 4Q1WA 1F34A 2P3CA 4BEKA 1HVJA 3VLAA 3LPIA 5OZRA 1E5OE 4RRNA 5P71A 5OZ1A 3EL4A 3UCBA 4HDFA 5DPZA 1SDUA 4Z50A 1FQ8A 5P5JA 4ZSPA 4Y5BA 1AXAA 2Z4OA 2VKMA 4I0JA 3RU1A 1NH0A 3OADB 5P0DA 2Q54A 2QD7A 2R8NA 4Y38A 5P5FA 3WB5A 3S8IA 3SA8A 2ZJLA 1D4LA 5P5CA 1WBMA 5P07A 2WHHA 2NNKA 4H1EA 2QHYA 1HIIA 5P7XA 1AM5A 5P6HA 1BWBA 4PZXA 5P44A 4Q5MA 1JLDA 2UPJA 1PPME 1FQ4A 5P79A 5P58A 3TPRA 2NNPA 5P3QA 4PYVA 1C6XA 4DJOA 5OZMA 5BS4A 5P0XA 2QI4A 2QI5A 1LV1A 5P19A 1LF2A 5P3JA 5P85A 3LIYA 5P8HA 2WF4A 4Y4UA 1NPWA 2A4FA 5P3XA 3IN4A 1W50A 5UPJA 3TLHA 4FM7A 2IRZA 4CP7A 3L5EA 1ER8E 4FS4A 3SA7A 2NMZA 5P02A 3ZMGA 1FMXA 5OZIA 1PSNA 3KFPA 2ER9E 5P2HA 3OUDA 4Y3TA 1HSHA 4FM8A 5P27A 5DR1A 5P6PA 3EKWA 5P0CA 4Y53A 3OWNA 3NU4A 5P7WA 4EJDA 1G35A 4YDFA 4H3JA 6FIVA 3KYRA 5P6IA 5P7SA 3EL0A 5P4VA 5P7YA 3PBZA 3HD8A 2Q64A 4RCEA 5OZQA 1HVRA 5P0FA 5P0YA 5P34A 1BDLA 1EEDP 1OHRA 2BPZA 5P8GA 1MSNA 5HE7A 5P8NA 3EM3A 4Y6MA 5P75A 5P6OA 5P29A 5P0RA 4YBFA 2QNNA 4Q1NA 4Y4AA 1IVQA 3GI0A 1ZLFA 3BUHA 5P8VA 5P88A 3QBFA 5P2WA 3TOGA 3BUGA 5AHCA 5DR8A 2VIYA 4GJCA 3PSYA 4L7HA 3PCZA 2FS4A 5P7EA 5P7TA 2G27A 1FMBA 1KJHA 2OF0A 4ER2E 4Y3EA 3RTHA 3M9FA 4DI2A 5OZDA 5P8BA 1B6JA 4LXMA 3BXRA 4OD9A 1LYBB 5SY2A 2O4NA 1D4JA 2AVVA 1NPAA 4Y3SA 4YDGA 5P4WA 1PPKE 5DR3A 3IVHA 1LEEA 1RNEA 5P4DA 5P65A 2QMPA 4K4QA 3SO9A 2B7FA 4RRSA 1AVFA 1T7KA 5OZGA 5P7IA 4QGIA 2ZJHA 5P2YA 5P5LA 2XFJA 2FDDA 5P0ZA 2QZXA 4YA8A 1IZHA 3VF7A 3TNEA 2OAHA 3TPPA 1AIDA 4GJ8A 5P5HA 5DR7A 5P8IA 3A2OA 2P3AA 5OYVA 1FQXA 3OTYA 5P37A 2G22A 4OC6A 4FRSA 2PK5A 4JPCA 1FMUA 5E5JA 2VJ6A 3TPJA 2PWRA 2XYEA 5P0KA 5P68A 3RSVA 3PWWA 4B70A 2RENA 1OD1A 5KQZA 3O9AA 5P1KA 1SH9A 4PHVA 3AUPA 2AOCA 3GW5A 4COEA 3UPJA 5P2TA 1YTGA 2WJOA 2FGUA 2AOEA 5P0MA 1IDBA 4DJQA 2PYNA 4U7QA 2XFIA 1EC2A 3OQ7A 4XX4A 5P3FA 4Y3GA 4DPFA 4FRJA 2PSVA 3NWQA 3OUCA 5P14A 1HTEA 1LF4A 3LITA 5P7JA 5P4CA 5P4ZA 5P6CA 2WEZA 1W5XA 1BXQA 1MRWA 3DM6A 2ZJNA 1LZQA 4D89A 2WEBA 5P31A 5ISKA 5P4QA 2QZKA 2CEJA 1KJGA 1MSMA 5I3XA 1IZEA 1K6TA 2I4DA 2WEAA 3PB5A 1ZPAA 4L7GA 1DIFA 3N4LA 3T7QA 3KDBA 4Y5CA 4HDBA 4J1EA 2HB4A 5EZZA 3ZKSA 2F8GA 4QLHA 5P1TA 4TRWA 5P6AA 5P3NA 8HVPA 1XL2A 2AOJA 3URIA 2WEDA 3U7SA 5P7PA 3VLBA 3HDKA 3WB4A 1MPPA 5P2JA 5P16A 5KR1A 5JODA 3EC0A 5COOA 1MIQA 5P7CA 3KT2A 3ZPUA 3R0WA 2NXMA 2QD8A 1XL5A 1E80E 2G1SA 2ZHSA 2BQVA 4X2LA 2OHNA 1D4SA 3KFRA 4DPIA 5KR8A 5P4NA 4ZSMA 2AZ9A 4OBZB 2ZJMA 4Y54A 5P89A 3DOXA 3ER3E 5P1IA 2F81A 4Y3PA 4Q1XA 3IN3A 4M8YA 4J0YA 2G1OA 3S7MA 1T6EX 3G6ZA 4OBKA 3O9LB 2JE4A 2J9KA 3OXCA 4Y50A 1HBVA 3RVIA 5OYZA 5P7LA 5APRE 5DQ1A 3UDJA 5P6KA 5DGWA 2BPWA 4I8ZA 3ZKQA 3D91A 6APRE 4YD6A 5HDUA 5P25A 4FLGA 5P26A 3QIHA 5AGZA 3LZVA 2F3FA 3PLDA 4RVIA 5P5MA 4Y5EA 3QRMA 2Q5KA 5P6WA 4B00A 1MUIA 4KE0A 3C9XA 2VNNA 3BXSA 4RCDA 5P1VA 5P5TA 1HSGA 4QJ8A 4K9HA 4KB9A 5KQFA 3SAAA 5P3ZA 4K8SA 4APEA 3F9QA 5OZOA 3UHLA 4A6CA 1T7JA 4GJ5A 1DP5A 1A9MA 7UPJA 4Y3YA 4Y3HA 4RROA 3L59A 2A1EA 1FKNA 4PZWA 1B6MA 4JPEA 4DJRA 2NR6A 1EPPE 1J71A 3TOHA 1M0BA 2QU2A 2ZHUA 4AA8A 4GJDA 4Y5KA 1PFZA 2F80A 5P06A 5OZZA 4DQBA 5P46A 4ZPFA 4Y43A 5P10A 2HS1A 3IXKA 3LNKA 4BFBA 5OZ2A 3EL1A 1M4HA 4DJPA 2RKFA 3Q6YA 4Y36A 2B8LA 5ISJA 2HC0A 5P2BA 1EAGA 1YTHA 4Y4GA 5P7BA 2RMPA 4Y57A 5P42A 5KOQA 3SACA 5P81A 4Y37A 1T6GA 4B0QA 3HZCA 3OU1B 2QI1A 1YG9A 2IENA 4NKKA 1Z8CA 5I3WA 5OZVA 4J0VA 1A8GA 1CZIE 1HVIA 2BPYA 1CPIA 3UQXA 5P3MA 4Y3NA 3OQFA 3BVBA 3MSJA 5P6ZA 5IVSA 5OZFA 1PSAA 2G1RA 2HAHA 3CYXA 3S43B 5P0BA 2QHZA 5COPA 5P87A 1GVUA 2HB2A 2AVSA 5P35A 3GGUA 3ZLQA 2B8VA 3O9CA 3TL9A 5P6FA 1HVSA 1UH9A 1BIMA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 2I4V A;  2AOG A;  5OYX A;  1KJ7 A;  5P67 A;  2B60 A;  2HS2 A;  3LIN A;  3S7L A;  4Y56 A;  4Z2Z A;  3EBZ A;  4Y5L A;  4ZSQ A;  5P8E A;  1UPJ A;  3NUJ A;  3SLZ A;  2FGV A;  4AMT A;  4NPT A;  1GVT A;  4I0F A;  4EQ0 A;  5IVR A;  3IAW A;  4H3F A;  3UTL A;  2FDE A;  2RSP A;  4ACU A;  1HPS A;  3O9D A;  2QP8 A;  2BPV A;  3ER5 E;  1XN2 A;  3R2F A;  4ZLS A;  2FIV A;  5CLM A;  1IDA A;  5P1S A;  3HBO A;  3LZS A;  3QAA A;  1XE5 A;  2I0D A;  1SBG A;  4YE3 A;  2G26 A;  4MC2 A;  5P72 A;  4PPH A;  3UFL A;  5IS4 A;  5P7O A;  1W51 A;  5HVP A;  4J0T A;  5P2O A;  1KJF A;  2P4J A;  5JFP A;  1GNN A;  3KFS A;  5P6T A;  4OBG A;  2QK5 A;  1TQF A;  1ZP8 A;  2QMD A;  3UDY A;  1BWA A;  5OZ9 A;  5P41 A;  4I0G A;  4RZ1 A;  5P24 A;  4Y5N A;  5SY3 A;  3CKP A;  1LF3 A;  3PVK A;  5P2A A;  5P6L A;  5P51 A;  4L7J A;  5P40 A;  1LYB A;  5P1D A;  2BKS A;  5P6U A;  1YT9 A;  3BC4 A;  3D3T A;  3PM4 A;  5P4A A;  5ENM A;  5P5Y A;  1IZD A;  3APR E;  3BHE A;  4EJ8 A;  1QS8 A;  4Q1Y A;  3OUB A;  3QS1 A;  5FIV A;  2AVM A;  1U8G A;  3O9G A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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