3VSXA

Human renin in complex with compound 18
Total Genus 80
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
80
sequence length
340
structure length
340
Chain Sequence
LTLGNTTSSVILTNYMDTQYYGEIGIGTPPQTFKVVFDTGSSNVWVPSSKCSRLYTACVYHKLFDASDSSSYKHNGTELTLRYSTGTVSGFLSQDIITVGGITVTQMFGEVTEMPALPFMLAEFDGVVGMGFIEQAIGRVTPIFDNIISQGVLKEDVFSFYYNRDSENSQSLGGQIVLGGSDPQHYEGNFHYINLIKTGVWQIQMKGVSVGSSTLLCEDGCLALVDTGASYISGSTSSIEKLMEALGAKKRLFDYVVKCNEGPTLPDISFHLGGKEYTLTSADYVFQESYSSKKLCTLAIHAMDIPPPTGPTWALGATFIRKFYTEFDRRNNRIGFALAR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Design and optimization of novel (2S,4S,5S)-5-amino-6-(2,2-dimethyl-5-oxo-4-phenylpiperazin-1-yl)-4-hydroxy-2-isopropylhexanamides as renin inhibitors
pubmed doi rcsb
molecule keywords Renin
molecule tags Hydrolase/hydrolase inhibitor
source organism Homo sapiens
total genus 80
structure length 340
sequence length 340
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.4.23.15: Renin.
pdb deposition date 2012-05-11

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00026 Asp Eukaryotic aspartyl protease
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.40.70.10 Mainly Beta Beta Barrel Cathepsin D, subunit A; domain 1 Acid Proteases 3vsxA02
2.40.70.10 Mainly Beta Beta Barrel Cathepsin D, subunit A; domain 1 Acid Proteases 3vsxA01
5P3UA 1MVPA 2IENA 1VIJA 3Q70A 5P01A 2EWYA 1Z1HA 4Y3DA 4AMTA 1XN2A 2QAKA 1OEXA 3AIDA 2UPJA 5P0LA 3QN8A 1YTGA 2WF3A 5P3DA 3K5FA 2IKUA 3OQ7A 2F8GA 3SAAA 5OZLA 2RSPA 3OADA 1J71A 2PC0A 5KR1A 1D4HA 3QVIA 3NU6A 3EKWA 3UDMA 1QS8A 4Y3ZA 1MEUA 5P7TA 2QD8A 5P4YA 3KT2A 1W5VA 2R5PA 3GGUA 5P05A 5OZTA 3RTHA 1FF0C 4GJ9A 2QHZA 4J0PA 1KZKA 3O9EA 3NLSA 3S8IA 4B1CA 3INDA 3BUHA 3KDBA 3OK9A 4OBFA 3TPRA 5P2KA 3TLHA 5HDVA 3OU3A 4BFDA 5OZ4A 3FV3A 1MSMA 5P5DA 2IEOA 3N4LA 5P6EA 5P0TA 1IZDA 4Y3XA 3QP0A 5P0WA 6FIVA 4FL8A 4F74A 4LXAA 5P5EA 1SMEA 1D4IA 2G94A 3R0YA 3ZMGA 5P53A 3U7SA 4DPIA 3SFCA 3NWXA 5P2JA 3UDQA 2BPXA 5P2IA 5OZ7A 2QMGA 2QZXA 3PWRA 4AUCA 4ACUA 5P4LA 3MXDA 5TOLA 5P6UA 5P0KA 2RKGA 4QJ2A 3BRAA 5AGZA 3KM4A 4H1EA 1AXAA 2NXMA 5P2YA 3OQDA 1MIQA 3OU4A 5P30A 3PBDA 4YD6A 4I11A 4YD4A 1T7IA 5P0VA 4Y5MA 4TRWA 3JVYA 5P3RA 3RSVA 3D20A 2I0DA 1Z1RA 1B6MA 5P0UA 4Y3MA 2AOEA 4GJ8A 3PMYA 2QI0A 3PSGA 5P3NA 1MUIA 3GI6A 5OZAA 3PM4A 1HXWA 1FQXA 2FDDA 1EBYA 6UPJA 2ZHSA 4I8WA 5P4EA 2Q3KA 4PZXA 4NJVA 3NWQA 2O40A 2VJ9A 1F34A 2V00A 1OHRA 1Z8CA 1SGZA 2FIVA 1D4JA 2JXRA 3SO9A 3HDKA 4FS4A 5P83A 3T6IA 1HSHA 5OYTA 5ER1E 4U7QA 5P5OA 1QRPE 5P8IA 5P6IA 3TOGA 3EL1A 4TRYA 5FIVA 1EPNE 2VJ6A 1IDAA 3D1YA 4I0HA 5OZHA 4I0DA 3SM2A 3INFA 4EP2A 4CPQA 5OYUA 4FM7A 1EEDP 5HCOA 5P5YA 4U7VA 3GGVA 3EKTA 3SPKA 3SA8A 4MC1A 3LIYA 2OF0A 2OHNA 5P4XA 1NSOA 4GB2A 5P14A 5P5JA 2HB3A 5P2GA 2JYSA 2V10C 5P0HA 5P5SA 1UPJA 4YCKA 2RMPA 1AJXA 4K4RA 5P2FA 3RVIA 5P3MA 3WZ8A 3T3CA 4EXHA 2QMPA 4Y3RA 1IVQA 1QDMA 3PCZA 1AZ5A 1YT9A 3OGPA 1YTIA 1K2CA 4HA5A 2P4JA 1TCXA 5P00A 1W6IA 2ER0E 2WL0A 5OZCA 5P32A 3FIVA 3OUCA 3DV1A 1IBQA 3CIDA 2ZE1A 5OYSA 4D88A 2CEJA 3G72A 4DJPA 5IVRA 2P8HA 2BKTA 1E82E 2G20A 3TNEA 4I10A 3OXWA 3L5CA 4B00A 3NXNA 1OD1A 3LINA 1EC0A 1HSIA 4L1AB 3O9CA 3O9HA 3ECGA 3KDDA 4Y3EA 5P8UA 4Y3JA 4DVFA 3Q4BA 3LPKA 5OZVA 1B6JA 5P4VA 2NMZA 5P0IA 4RZ1A 3I6OA 3SABA 1A30A 1EC3A 1M4HA 5P73A 2P3DA 3PB5A 5P4MA 5OZ5A 5P1OA 5P04A 3UFLA 5P6LA 5P1LA 5P86A 5BRYA 1B6KA 5P6MA 3GGXA 1G2KA 4ZLSA 1NPAA 1LYBB 5P31A 4B77A 5P6BA 4FRJA 5P0OA 1AIDA 4CPWA 3K5CA 4Y3HA 3EL0A 3BHEA 4Y4EA 1RNEA 3BC4A 5P0GA 1PPLE 3CKPA 3TPJA 3PHVA 2QD6A 4Y3PA 3LZYA 3FKTA 4GJ6A 5P4UA 5P3IA 5AHAA 1ZLFA 1AJVA 4DJQA 1SMRA 5OZ2A 4ZE6A 1MERA 1CMSA 4Y5PA 5OZKA 3QS1A 4Z2ZA 1LEEA 3NUOA 3N3IA 2HM1A 5P20A 4B70A 5P33A 3PLLA 2QI7A 3CYXA 1PPME 3TH9A 1A8KA 5P0JA 4ZSMA 4EQJA 3U6AA 4LC7A 5P35A 3APPA 5ISJA 3L5EA 2I4QA 5APRE 2J9JA 3KYRA 4DJXA 5P1QA 5P48A 5P7HA 3IA9A 4CPSA 5AHBA 5P5WA 2NR6A 5P6XA 5P6DA 5HDXA 5P57A 2ZHUA 1RV7A 4L1AA 4Y47A 4ER2E 5P8QA 5COKA 3UCBA 5P69A 2R9BA 4QJ7A 5P13A 3QRSA 2CEMA 3VYDA 4Y3QA 5P7SA 5OZMA 4QJ6A 5HTZA 5P1UA 5P6QA 5I3VA 5P2QA 5P5QA 5P4PA 1SH9A 5P10A 4Y4DA 5P1AA 2Q55A 3BGBA 3DV5A 1BILA 1BXQA 4GMIA 1BIMA 5P50A 4I0IA 1IVPA 1DMPA 2PYMA 2IGXA 1EPPE 1FMUA 1DPJA 1HWRA 5P23A 3URIA 3K5DA 5P1WA 5P0CA 5P5LA 4PEPA 5P09A 1W6HA 2QNPA 1LYWA 1ZAPA 4TVHA 5P46A 3QRMA 1HVRA 1W50A 5P59A 1HVSA 4Y39A 5KR8A 3CKTA 1YG9A 4LHHA 2JE4A 5I3XA 1APWE 4FSLA 5P7RA 5P3OA 1T7KA 5P5KA 5HE4A 4IVTA 5P5ZA 3SA7A 4TRZA 4CMSA 5DQ4A 2R8NA 1GKTA 5P3SA 5P4RA 1A94A 3VLBA 5P7QA 2ER6E 1APVE 5OZOA 5P5TA 3OWNA 5P4DA 3SM1A 4DQCA 5P62A 3UDNA 2AODA 5P8BA 2QI3A 2B8VA 3ZL7A 1UH8A 4Y3WA 1KJHA 5P82A 3I2LA 3OUBA 2WF2A 3OXXA 3DJKA 2I1AA 4LXMA 1YM2A 1BBSA 3LZUA 2PSGA 1FLHA 2FDEA 2WEAA 3TL9A 2BQVA 1QBTA 4Y4ZA 4EPJA 3UQWA 1A9MA 5PEPA 2G22A 4DQHA 4Y4JA 4OBGA 5P3HA 3VV6A 3KF0A 5AHCA 1ZSFA 5P7KA 1SGUA 3QBHA 3S7LA 4Y3FA 5P87A 2QP8A 1YTHA 5P2MA 4Y5AA 5P1GA 3Q5HA 2OHSA 4Y5NA 5P0BA 1HVIA 5P3VA 3VFBA 5P26A 2IKOA 3PVKA 1D4SA 5P6TA 4AA8A 5P0ZA 4OBKA 5OZNA 1BV7A 1JLDA 4CKUA 1RQ9A 2VIZA 3S85A 3PWWA 3VYEA 5P8AA 5EZXA 4GJCA 1ODWA 3UTLA 3NR6A 3MSJA 5P88A 3ER5E 3ZKGA 2NNKA 5P56A 5F01A 5C9DA 1HPVA 1XL5A 2RENA 1ZPAA 3OOZA 3PSUA 4Y43A 1MRXA 5P89A 5P1SA 5P6KA 1G35A 3EBZA 1FFFC 1B11A 4Y5EA 5P75A 1NH0A 4ZPEA 2A4FA 5CONA 4J1EA 5P36A 5P0RA 5P2XA 5P7FA 4FRIA 2PQZA 1FEJC 2FXDA 3C9XA 5B18A 5P8TA 4NJTA 3EM3A 1B5FB 1CZIE 5P4ZA 5P2DA 2AVSA 5KR2A 5OZPA 1HTFA 3F9QA 3H0BA 2VJ7A 1BXOA 5P0EA 2G1NA 1UH9A 3O9LB 3Q3TA 4GJ5A 3PWMA 5P81A 2AZCA 4Y3NA 2JJJA 5P3XA 5OZWA 1CPIA 5P7XA 5P7MA 5P19A 5P6PA 5P1CA 4OBDA 4EWOA 2G69A 5CLMA 1XE5A 3TKGA 3O9BA 3QRVA 5P39A 1E80E 4Z4XA 5DR3A 4Z22A 4Y58A 1ER8E 3LZSA 1EBKC 5OZ6A 3IAWA 2P83A 3OTYA 1EPLE 4ZSQA 2G1RA 5P25A 2ZJIA 1SDUA 1KJ4A 4RYCA 2G1YA 4N00A 3O9DA 5P8RA 3O9IA 5HVPA 3PCWA 1BAIA 3INEA 5P29A 1ZP8A 4CPTA 4YCYA 1HIHA 3NU5A 8HVPA 3GI4A 1W51A 2WECA 1B6PA 2ZJLA 5P65A 2O4KA 4B72A 1GVTA 3OXVA 5P7NA 2QU3A 1GVVA 1HEFE 2FNSA 3LIVA 5P3QA 2BB9A 2R43A 3NSHA 1HEGE 5P74A 2XFIA 1IDBA 3TTPA 1B6LA 4YBIA 3NDWA 2OHQA 3IVHA 5P4BA 4KE0A 5UPJA 3JVWA 3LIZA 3INHA 4Y5GA 3CMSA 1GNMA 1MT8A 1HHPA 2G26A 3BXSA 3BXRA 1FMXA 1G0VA 1C6ZA 1ODYA 5P2RA 5AH7A 4EJDA 2NXDA 3VV8A 5ENMA 5P41A 1PFZA 4APEA 2BBBA 2OHUA 1QBUA 1ZPKA 1BDQA 1W5XA 4QJ9A 4YD3A 1C6XA 2R38A 5IVSA 2HC0A 5IVTA 1PSNA 5P2SA 5P0MA 2ZHRA 4H3JA 3S56A 4APRE 3BGCA 1MPPA 5P5MA 4H3GA 3NDTA 4HLAA 3DUYA 4FRKA 4Y36A 5P3GA 4YOBA 3T11A 3Q6YA 4K4PA 2QI6A 3VF5A 2ZGAA 3R2FA 3O9LA 1FIVA 2I4UA 2WF0A 5P7LA 1HBVA 3WZ7A 5P5UA 3EM6A 5J25A 1HVCA 3FNSA 5P0PA 4B05A 5P4QA 4QGIA 2IRZA 4UPJA 5DQ2A 3KMYA 5OZIA 3OAGB 4J5JA 5P84A 4GJ7A 3MWSA 4Q1WA 3S2OA 5I3YA 1LZQA 4LBTA 4HE9A 5SY2A 4EP3A 3M9FA 1K1UA 1U8GA 1HPOA 4PPHA 4J0ZA 2HIZA 2RKFA 3NUJA 3UDYA 4Y3SA 4WY1A 3ZKNA 2NNPA 3TPPA 1FQ8A 3KFSA 3APRE 1PROA 5P79A 2FS4A 5DR4A 1E5OE 3NU9A 5OZEA 4S1GA 3HBOA 3CKRA 4I0GA 5P0XA 4R95A 5P1DA 2QMDA 1KJ7A 3SLZA 4QJAA 5P1MA 4RRNA 6APRE 2IS0A 4R92A 4GJDA 2AOHA 2AOIA 4OBJA 4GYEA 5P7AA 3S43B 4U8WA 5P7OA 1T6GA 4JPCA 2WEBA 3T7XA 4R8YA 4YE3A 4I12A 2I0AA 5HD0A 5IVQA 3EL9A 5P8SA 5P2NA 3K5GA 5P3TA 5OZDA 5P8MA 1FQ4A 3T7PA 4DH6A 5P3WA 2AVQA 5P8CA 3PRSA 3S53A 4J1HA 4XX4A 4XX3A 4RVJA 4EYRA 2Q64A 2IGYA 2ER9E 3L38A 2AOGA 4D89A 4HDPA 4A4QA 1QBSA 4B78A 5P6FA 5IE1A 5P64A 5P03A 1AAQA 5P0DA 3OQFA 2QU2A 4D85A 4FRSA 5OZ0A 4DJVA 1K6VA 2B7FA 4L7HA 3RTNA 5OZRA 1SBGA 5P8NA 5P8PA 4DJWA 2QK5A 2FMBA 3G70A 2IDWA 5P3PA 3EL5A 5P4GA 5E5JA 3HVPA 5P42A 3MSKA 4YHQA 2ER7E 5E5KA 3PGIA 1D4YA 5P52A 4HVPA 5P7ZA 3ST5A 4DQFA 3H5BA 4Y50A 5P78A 4EHCA 3VEUA 2BKSA 4AA9A 5P1TA 3SKGA 5ER2E 1PSAA 3WB4A 2QI5A 4OD9B 5P5FA 2Z4OA 5P1XA 3KMXA 3OAGA 5I70A 2PH6A 1HSGA 7UPJA 4Y38A 5P8HA 3EKPA 5P7GA 3LIXA 5P1RA 1TQFA 3K1WA 1AM5A 5P6SA 4Y35A 5HE7A 4QJ8A 5P4IA 4B1DA 4I0EA 3O9GA 5P07A 4FGXA 4DJYA 4DQBA 4XXSA 5P8GA 3DCKA 3HVGA 5P3YA 4KE1A 1LYAB 5P37A 5DR8A 5P72A 5DR7A 5P63A 2ZYEA 2ZDZA 3KN0A 1IIQA 2F80A 5P08A 3VFAA 1HXBA 1TSUA 4RCFA 1ZBGA 2HB4A 3TOFA 2WF4A 2WJOA 5P2AA 4RLDA 1D4LA 3O9AA 1M0BA 1SDVA 1PPKE 2VNMA 3QPJA 4J1FA 5OZ8A 3O9FA 5OZ3A 1FKNA 1MESA 3BUFA 1K6PA 4J0YA 2ZHTA 3LNKA 2NXLA 5AH8A 4YD5A 4FM6A 1C70A 3BVAA 3IVIA 2G27A 5OZ1A 3EXOA 1MTBA 5OYVA 5P61A 5P6JA 5P1EA 1EAGA 3KFPA 3SA4A 3KT5A 4FAEA 4ZIPA 5P06A 1MSNA 2VIJA 3IXOA 5HDZA 4JPEA 5P1VA 5P3AA 1XL2A 1MRWA 1LYBA 2O4PA 4EXGA 1WKRA 1FG6C 5P2UA 1YM4A 3NXEA 5P4KA 3VSXA 1YX9A 5P8JA 4ER4E 5HE5A 4GZFA 2G24A 4Y56A 4DJOA 3RSXA 5P4FA 3LPJA 5P1KA 5P4JA 5C9BA 2F3KA 4HZTA 4M8YA 2ZHVA 1LF4A 4PYVA 1FB7A 2HS1A 3GW5A 3FSMA 4B0QA 3OQAA 1LF2A 1EPOE 3SA6A 4R91A 3ZPSA 2QI1A 3OADB 3NDXA 3DK1A 1FQ7A 1XS7D 1T6EX 3NDUA 4H3FA 2B8LA 3R1GB 2AVOA 2WHHA 4L7GA 5P7IA 4DV9A 5P4OA 2QZLA 3KA2A 1ENTE 1KJFA 3ZPTA 3UDRA 1LYAA 3I8WA 2H6SA 1APTE 4FLGA 5P22A 5P3CA 4YDGA 4PZWA 3OU1B 2V12C 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 5P3U A;  1MVP A;  2IEN A;  1VIJ A;  3Q70 A;  5P01 A;  2EWY A;  1Z1H A;  4Y3D A;  4AMT A;  1XN2 A;  2QAK A;  1OEX A;  3AID A;  2UPJ A;  5P0L A;  3QN8 A;  1YTG A;  2WF3 A;  5P3D A;  3K5F A;  2IKU A;  3OQ7 A;  2F8G A;  3SAA A;  5OZL A;  2RSP A;  3OAD A;  1J71 A;  2PC0 A;  5KR1 A;  1D4H A;  3QVI A;  3NU6 A;  3EKW A;  3UDM A;  1QS8 A;  4Y3Z A;  1MEU A;  5P7T A;  2QD8 A;  5P4Y A;  3KT2 A;  1W5V A;  2R5P A;  3GGU A;  5P05 A;  5OZT A;  3RTH A;  1FF0 C;  4GJ9 A;  2QHZ A;  4J0P A;  1KZK A;  3O9E A;  3NLS A;  3S8I A;  4B1C A;  3IND A;  3BUH A;  3KDB A;  3OK9 A;  4OBF A;  3TPR A;  5P2K A;  3TLH A;  5HDV A;  3OU3 A;  4BFD A;  5OZ4 A;  3FV3 A;  1MSM A;  5P5D A;  2IEO A;  3N4L A;  5P6E A;  5P0T A;  1IZD A;  4Y3X A;  3QP0 A;  5P0W A;  6FIV A;  4FL8 A;  4F74 A;  4LXA A;  5P5E A;  1SME A;  1D4I A;  2G94 A;  3R0Y A;  3ZMG A;  5P53 A;  3U7S A;  4DPI A;  3SFC A;  3NWX A;  5P2J A;  3UDQ A;  2BPX A;  5P2I A;  5OZ7 A;  2QMG A;  2QZX A;  3PWR A;  4AUC A;  4ACU A;  5P4L A;  3MXD A;  5TOL A;  5P6U A;  5P0K A;  2RKG A;  4QJ2 A;  3BRA A;  5AGZ A;  3KM4 A;  4H1E A;  1AXA A;  2NXM A;  5P2Y A;  3OQD A;  1MIQ A;  3OU4 A;  5P30 A;  3PBD A;  4YD6 A;  4I11 A;  4YD4 A;  1T7I A;  5P0V A;  4Y5M A;  4TRW A;  3JVY A;  5P3R A;  3RSV A;  3D20 A;  2I0D A;  1Z1R A;  1B6M A;  5P0U A;  4Y3M A;  2AOE A;  4GJ8 A;  3PMY A;  2QI0 A;  3PSG A;  5P3N A;  1MUI A;  3GI6 A;  5OZA A;  3PM4 A;  1HXW A;  1FQX A;  2FDD A;  1EBY A;  6UPJ A;  2ZHS A;  4I8W A;  5P4E A;  2Q3K A;  4PZX A;  4NJV A;  3NWQ A;  2O40 A;  2VJ9 A;  1F34 A;  2V00 A;  1OHR A;  1Z8C A;  1SGZ A;  2FIV A;  1D4J A;  2JXR A;  3SO9 A;  3HDK A;  4FS4 A;  5P83 A;  3T6I A;  1HSH A;  5OYT A;  5ER1 E;  4U7Q A;  5P5O A;  1QRP E;  5P8I A;  5P6I A;  3TOG A;  3EL1 A;  4TRY A;  5FIV A;  1EPN E;  2VJ6 A;  1IDA A;  3D1Y A;  4I0H A;  5OZH A;  4I0D A;  3SM2 A;  3INF A;  4EP2 A;  4CPQ A;  5OYU A;  4FM7 A;  1EED P;  5HCO A;  5P5Y A;  4U7V A;  3GGV A;  3EKT A;  3SPK A;  3SA8 A;  4MC1 A;  3LIY A;  2OF0 A;  2OHN A;  5P4X A;  1NSO A;  4GB2 A;  5P14 A;  5P5J A;  2HB3 A;  5P2G A;  2JYS A;  2V10 C; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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