3VYEA

Human renin in complex with inhibitor 7
Total Genus 90

The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
90
sequence length
340
structure length
335
Chain Sequence
LTLGNTTSSVILTNYMDTQYYGEIGIGTPPQTFKVVFDTGSSNVWVPSSKCSRLYTACVYHKLFDASDSSSYKHNGTELTLRYSTGTVSGFLSQDIITVGGITVTQMFGEVTEMPALPFMLAEFDGVVGMGFIEQAIGRVTPIFDNIISQGVLKEDVFSFYYNRDSLGGQIVLGGSDPQHYEGNFHYINLIKTGVWQIQMKGVSVGSSTLLCEDGCLALVDTGASYISGSTSSIEKLMEALGAKKRLFDYVVKCNEGPTLPDISFHLGGKEYTLTSADYVFQESYSSKKLCTLAIHAMDIPPPTGPTWALGATFIRKFYTEFDRRNNRIGFALAR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
EMPTYTVIII3 (153-156)S1 (8-15)TIV3 (98-101)TI'1 (15-18)TII1 (14-17)S14 (221-225)3H2 (119-121)S2 (19-26)S6 (86-99)TIV2 (27-30)S3 (31-38)TI1 (38-41)TI8 (217-220)S8 (126-129)TII2 (136-139)S4 (44-47)S5 (73-83)TI2 (48-51)AH1 (56-60)TI3 (52-55)S7 (102-113)3H1 (66-68)TI4 (69-72)AH2 (143-150)3H3 (133-135)S23 (323-328)S10 (174-178)S9 (157-162)TIV5 (165-173)AH4 (317-322)S24 (333-339)TII3 (177-180)TI6 (182-185)S11 (186-194)TIV6 (195-198)TIV7 (215-218)TII4 (197-200)TII'1 (210-213)S13 (213-216)O5 (259-296)S12 (202-210)TIV9 (306-309)TIV10 (307-310)S22 (313-315)TI11 (291-294)TI9 (226-229)AH3 (236-246)TI10 (251-254)S16 (249-250)O2 (285-287)3H5 (281-283)S17 (255-258)S19 (275-279)TIV8 (271-274)S21 (300-302)TI12 (329-332)TIV11 (328-331)TVIII2 (115-118)3H4 (259-264)S20 (295-298)S15 (232-234)S18 (268-272)Updating...
connected with : NaN
molecule tags Hydrolase/hydrolase inhibitor
source organism Homo sapiens
publication title Design and discovery of new (3S,5R)-5-[4-(2-chlorophenyl)-2,2-dimethyl-5-oxopiperazin-1-yl]piperidine-3-carboxamides as potent renin inhibitors
pubmed doi rcsb
molecule keywords Renin
total genus 90
structure length 335
sequence length 340
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.4.23.15: Renin.
pdb deposition date 2012-09-24

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00026 Asp Eukaryotic aspartyl protease
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.40.70.10 Mainly Beta Beta Barrel Cathepsin D, subunit A; domain 1 Acid Proteases 3vyeA02
2.40.70.10 Mainly Beta Beta Barrel Cathepsin D, subunit A; domain 1 Acid Proteases 3vyeA01
1MSMA 5P5DA 1HSIA 3CYWA 1HVKA 2QK5A 1MESA 2HB2A 3WZ6A 4QJ8A 3B80A 4NPUA 5P4YA 3EKTA 2UXZA 4FSLA 2OHPA 4Y4EA 2UPJA 4ZLSA 5KOQA 3EL0A 5P0OA 5P8FA 4PHVA 1T7JA 4K8SA 1IVPA 3MSKA 2QD8A 5P2HA 2CEJA 3NXNA 4FE6A 3EL5A 5OZ0A 5P29A 2NMZA 1WBKA 4LP9A 1GVTA 3PHVA 4CP7A 4LHHA 5DR7A 5OZ7A 5P6KA 3RSXA 4AA9A 5P0UA 5P5LA 3OQ7A 2VA7A 3KMXA 4ZSRA 1OEXA 5DQCA 1IBQA 1DW6C 1BV9A 4RVIA 3HAUA 2WF4A 4DQBA 2QZKA 2ZJLA 1YTIA 5P6EA 1EPPE 3NDUA 2F81A 2NXDA 3PWWA 5SY2A 1K1TA 1EC1A 5P84A 3TTPA 1MT7A 2XFIA 4FGXA 4IVSA 5P6TA 3GI6A 4DJRA 4NJTA 3ZPUA 5P3WA 3ZPSA 4FRIA 3CIDA 4YCTA 5P4VA 1HRNA 5P3QA 2WKZA 3JVWA 1BWBA 1PSNA 5DR3A 3UCBA 3L5FA 5P1CA 3SM2A 5IVTA 5P0RA 1T3RA 2QCIA 1D4SA 3SA7A 5IVSA 2IKUA 3BC4A 5HDVA 4J55A 1HVJA 4Y3XA 3GW5A 2XYEA 2OHLA 5P1FA 2OHTA 4OBDA 4ZSQA 5P8SA 4GJ5A 3LIZA 4U8WA 5P2RA 5P5XA 5P7UA 3LIVA 5P8LA 3OUDB 3EMYA 5SXNA 2FXDA 5P2AA 3FKTA 5P68A 5C9FA 3CKTA 1EPLE 2Q5KA 2ZJJA 1OEWA 2VJ7A 4OBGA 5P6DA 3QS1A 4H1EA 4MC6A 5P4TA 5P4PA 2P8HA 2AZ8A 4Y3EA 3BRAA 5P7AA 2ZJKA 1EAGA 1APVE 5OZPA 2J9KA 3OXVA 1EBKC 2OHSA 5I3VA 1ENTE 3PMUA 1FQ4A 3PBZA 3HVPA 1RNEA 7UPJA 5P7NA 2VA5A 2VIJA 4Y3ZA 4AA8A 4DJVA 3IVIA 4QJ6A 4DJPA 4DH6A 2QMGA 3O9HA 1FQ7A 3QRMA 3KFPA 5AH8A 1PPLE 3VCMA 2AVQA 4DQFA 5P7PA 1LYBB 4ZIPA 4FIVA 1CMSA 2AZ9A 5P3KA 2IEOA 4DV9A 3TNEA 3O9DA 4M8YA 3FX5A 2FGVA 1CPIA 2WF1A 2FDDA 5P4KA 3KDBA 5P24A 4CMSA 4ER2E 5P5RA 2H6TA 3TL9A 3S7LA 5JFUA 5P6QA 1BBSA 2VS2A 4EJ8A 5P2SA 3NDTA 1IZEA 5P0PA 3SQFA 1D4IA 4MC1A 1HEGE 4N00A 5P20A 1UPJA 5P61A 3S54A 3GGVA 1META 5P7RA 5OZQA 3PEPA 5HU1A 4I0FA 5OZ2A 4Y3GA 4FAFA 1EC3A 5P6AA 3CMSA 1J71A 2IQGA 4Y6MA 3BVBA 5P4MA 2R43A 5P83A 5OZZA 3KT5A 4NJVA 2QP8A 2PYNA 5P0AA 1BIMA 5P86A 3KF0A 5P1OA 5P81A 3Q5HA 3HLOA 5P16A 5P6JA 4LXKA 5P1EA 5IS4A 2I1AA 2R8NA 3VSWA 2ZJMA 1M4HA 4DQGA 5BWYA 5KAOA 4U7VA 2NTRA 5B18A 2B7ZA 5P2DA 2BPVA 2Q15A 5P7YA 5P74A 2QD6A 1FQ8A 5P3HA 2AOJA 4I0IA 3IXOA 3L5DA 3QVIA 3UQXA 5DQ2A 5P3NA 5P64A 5P4WA 5HTZA 2J9JA 5P3IA 5KOSA 4J0VA 5P6HA 4Y5PA 4A6CA 3TLHA 3VSXA 4OBKA 3S43A 3PM4A 3MSJA 5ER2E 4PEPA 1XE6A 5P2IA 5OZTA 4Y4GA 2Z4OA 3VG1A 3OUAA 5P7VA 2FMBA 5P5TA 1FQ6A 5P6SA 5OYUA 5P30A 1ZLFA 1LF4A 2AIDA 3UDKA 5P47A 5P45A 2J9JB 4HDBA 5DQ5A 4J1IA 4ACUA 5BS4A 4HVPA 1F7AA 5JFPA 2I4QA 2VJ9A 3MXEA 3WZ8A 3SA5A 5OZ1A 2IL2A 1TQFA 5P8HA 4Y54A 3UFLA 4Y45A 3O9BA 3L59A 3D1ZA 5P79A 4RCDA 3RTHA 1EPRE 1ZJ7A 1ZBGA 5P54A 2PWCA 3G6ZA 3OXCA 3I8WA 5P44A 2PYMA 1GVUA 4BELA 5OZRA 2Z54A 5P2CA 3LZVA 1GVWA 3VF5A 1UH7A 2BPWA 4K4QA 1G35A 5P3EA 3ZPTA 3UTLA 5P60A 1XL2A 5P26A 5P27A 4Y3NA 5P3GA 5P1GA 3HDKA 5P0GA 5P5BA 1QBRA 4Y5AA 4Y3WA 4I8WA 5P0TA 5P63A 3S45A 2AOIA 5P5EA 2G21A 4DPIA 2QMPA 3PJ6A 5P7IA 2OAHA 4I0JA 3DUYA 3OUBA 5AH6A 4YDGA 5I3WA 3JW2A 3CKPA 2AVMA 5P55A 5P1MA 5HE7A 5P7XA 5OZOA 3O9LA 2JXRA 3ER5E 5DGWA 5P34A 3QI1A 5SY3A 5ENKA 5F01A 5P5AA 3O9GA 5P5IA 3OQDA 1A94A 5DR8A 4F75A 3PBDA 1W6HA 3QPJA 5P0EA 1FQ5A 4JPCA 5P49A 3B7VA 4FRSA 3VYDA 4APRE 4YD4A 3VLBA 1ME6A 5OZJA 1KJHA 1CZIE 5P2FA 2PSVA 5P09A 3PI5A 4X7IA 4B1EA 5AGZA 3M9FA 5P6LA 3G70A 4CPXA 5P77A 5KQZA 4ACXA 4Y4TA 3MXDA 5P56A 5P6PA 2VNNA 4OBJA 2OF0A 3L3AA 2P3BA 3HW1A 5P03A 3L5EA 5P3CA 2BBBA 2QI3A 3PSGA 4QJAA 3U7SA 5P71A 1B6JA 1N49A 2IS0A 4DJQA 2F3FA 3EKYA 3OU1A 1HVHA 2BQVA 2QZWA 2O4LA 5OYYA 3R0WA 1APUE 1SIVA 4GJ7A 3OY4A 5P82A 5HCOA 4S1GA 4I0ZA 5P1YA 2ZJHA 1A8GA 4Y5LA 5P33A 5T4SA 3HAWA 4D83A 3VYEA 3S85A 1YX9A 5P5PA 4ER4E 1FMXA 2AOGA 5P04A 2BJUA 2H6SA 3DV5A 1K6TA 3D91A 1FG6C 2VIYA 4Y4BA 2FDPA 1EPOE 3SM1A 2QNPA 1HVRA 3UDPA 3PWMA 5C9DA 3RTNA 2A4FA 4DPFA 5P3JA 5P5GA 4EJKA 5P7LA 2P3DA 2B60A 4J0YA 1QRPE 1B6PA 4H3IA 1D4YA 3EM3A 5P5FA 3APPA 4Q1WA 5AHBA 1BDLA 5P2LA 3EKVA 3SFCA 4FM8A 1YG9A 5P11A 3IXKA 5P8DA 4MC2A 5OZDA 5P2TA 2FGUA 3KYRA 5OZBA 5OZ9A 5P7CA 5P87A 5P4OA 1KJ7A 1LF2A 5OZWA 1G6LA 3QP0A 3OQKA 5P89A 3L38A 4TVHA 5P2EA 5OZYA 1JLDA 3L5CA 5ISKA 3BGBA 1PFZA 1ZP8A 4DJOA 2HM1A 3FNTA 4JPEA 3DV1A 3LPJA 1RL8A 1BILA 2Q54A 3OU3A 3O9FA 3TOGA 2NR6A 4Y3QA 4J1CA 5P76A 5P8UA 1KJGA 4L7JA 3SA4A 4R92A 5P8OA 5P1SA 4OC6B 5P6FA 5OZKA 2MIPA 2ZE1A 3TPLA 2ZHSA 5P6BA 2QI6A 4PPHA 1D4LA 5P2UA 3NDXA 5OYTA 1YTJA 4RROA 5OZSA 3OK9A 1AJXA 5P7SA 3IAWA 5P4NA 3NU4A 1KZKA 4J0ZA 2VA6A 2RSPA 1Z1RA 1FEJC 2WHHA 3ZKIA 1HVSA 4Y4JA 5P0LA 1BXOA 2HPEA 1TSQA 2FXEA 1FLHA 4TRZA 3SA8A 4EXGA 5C9BA 4K4RA 2HB3A 5P8QA 5HD0A 2Q63A 4GJBA 4Y3SA 1D4KA 5P1LA 1TCXA 1ZAPA 3H5BA 3RVIA 1BVGA 3ECGA 5AH9A 5P7OA 5P3PA 2R5PA 1FGCC 4Y3HA 5P40A 2BB9A 5OYXA 3OWNA 5P38A 2WEBA 3OQAA 5P6CA 3APRE 4I1CA 4JECA 5P01A 5P7JA 1MT9A 2HS1A 2XFKA 2HPFA 2IGXA 1BWAA 5P59A 1SGUA 5P1PA 3OADA 5P5NA 4Y36A 5ER1E 4GJ9A 1AVFA 5P00A 3GGUA 1HIIA 1DMPA 1SMEA 3DK1A 2P4JA 3HVGA 5P23A 4YD5A 2IDWA 3PCWA 3Q6YA 3BVAA 4LAPA 4DJUA 5DPZA 3D3TA 2G24A 4Y3FA 5P1VA 1W5WA 1BV7A 3PLLA 3ZLQA 1WKRA 3OADB 2V10C 1HVLA 5HDZA 5OZUA 3S56A 4L7HA 5P5YA 2WECA 5P6RA 5P7GA 5P8CA 3BXRA 3ZKGA 3NSHA 3D1YA 2G1SA 4Y50A 5P22A 1FQXA 3K1WA 2NNPA 5DR1A 3EKPA 5EZXA 3UPJA 3Q3TA 5P0KA 4J1EA 4K4PA 5P1RA 4CPWA 4DQCA 3LZSA 2B42A 2PMAA 4BFDA 4CPTA 1IDAA 5P67A 5P3DA 3EM4A 3NYGA 5P51A 5P19A 5P2MA 3O9IA 4R5NA 1HSGA 3UDMA 1QBUA 3VFAA 4EP3A 2QNQA 1E81E 1LYWA 3PSUA 1Z8CA 1HPVA 3IN4A 1HBVA 1K6VA 5P6OA 5P0JA 5OZVA 4D8CA 5DR4A 5KR8A 3OGPA 1HPXA 2I0DA 3UHLA 1GKTA 5P0VA 4B05A 2QAKA 5OZEA 1EPNE 3PLDA 2QI1A 1YM4A 4HE9A 3FNUA 4I8ZA 2HAHA 2P3CA 4XXSA 2G1OA 5P3FA 1LYWB 3SA3A 1W51A 4Y5BA 5P4EA 4Y39A 5P05A 1XN3A 3T7QA 3DJKA 4R91A 4QJ2A 5HDXA 1AAQA 3LHGA 2G26A 5FIVA 4D85A 3U6AA 3OXWA 5P75A 4RRNA 4Y5CA 5P0WA 4ZSPA 4Y58A 2AVOA 4B72A 5OZNA 5P7TA 5P3BA 4ER1E 5P4SA 6FIVA 2UY0A 1MPPA 1GVVA 4B77A 4J1FA 4FS4A 5P08A 2R3WA 3DCKA 1HPSA 5I3XA 2WJOA 5P39A 4KE1A 4RRSA 5P0CA 2R38A 3BHEA 5P62A 4EYRA 3INDA 4J0PA 5P4XA 5OZMA 4QJ7A 4FLGA 5P6IA 2IGYA 3BUHA 2APRA 1SDUA 2ZJIA 2B8VA 3TPRA 3OOZA 4ZSMA 1OHRA 4QGIA 1MIQA 4CPQA 2JJJA 2QMDA 1HVCA 5OYVA 1HPOA 4Y3PA 4YOBA 5P3LA 2FLEA 5P3RA 3ZKNA 4APEA 3BUGA 3SA6A 1EBWA 2WF0A 1W50A 3NUOA 4B1DA 3EXOA 4H3FA 4TRYA 1K6PA 3NUJA 1QS8A 4FRKA 3EM6A 1TSUA 5P7QA 4FRJA 1AJVA 4J17A 8HVPA 5OZXA 5OZFA 3INEA 4B1CA 4RVXA 5EZZA 1ZPAA 4B00A 5OZCA 4HLAA 3ZKQA 5P5QA 5P28A 5P8IA 3SKFA 2G22A 5P53A 2ER0E 3OHFA 5P1WA 1F34A 5P13A 5F00A 5P1IA 2AOHA 1RV7A 2AOCA 2QI7A 3NU3A 1MERA 4J1HA 5P6NA 2V11C 4YD6A 4AZYA 1EEDP 4YCYA 4DUSA 2ZHRA 1TZSA 3WZ7A 1M43A 4ZE6A 4ZEAA 4YBFA 4R93A 5P8VA 3S7MA 4RYCA 5P6MA 4FAEA 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chains in the Genus database with same CATH topology
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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