3VYFA

Human renin in complex with inhibitor 9
Total Genus 85
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
85
sequence length
340
structure length
336
Chain Sequence
LTLGNTTSSVILTNYMDTQYYGEIGIGTPPQTFKVVFDTGSSNVWVPSSKCSRLYTACVYHKLFDASDSSSYKHNGTELTLRYSTGTVSGFLSQDIITVGGITVTQMFGEVTEMPALPFMLAEFDGVVGMGFIEQAIGRVTPIFDNIISQGVLKEDVFSFYYNRDSSLGGQIVLGGSDPQHYEGNFHYINLIKTGVWQIQMKGVSVGSSTLLCEDGCLALVDTGASYISGSTSSIEKLMEALGAKKRLFDYVVKCNEGPTLPDISFHLGGKEYTLTSADYVFQESYSSKKLCTLAIHAMDIPPPTGPTWALGATFIRKFYTEFDRRNNRIGFALAR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Design and discovery of new (3S,5R)-5-[4-(2-chlorophenyl)-2,2-dimethyl-5-oxopiperazin-1-yl]piperidine-3-carboxamides as potent renin inhibitors
pubmed doi rcsb
molecule keywords Renin
molecule tags Hydrolase/hydrolase inhibitor
source organism Homo sapiens
total genus 85
structure length 336
sequence length 340
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.4.23.15: Renin.
pdb deposition date 2012-09-24

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00026 Asp Eukaryotic aspartyl protease
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.40.70.10 Mainly Beta Beta Barrel Cathepsin D, subunit A; domain 1 Acid Proteases 3vyfA02
2.40.70.10 Mainly Beta Beta Barrel Cathepsin D, subunit A; domain 1 Acid Proteases 3vyfA01
4GJBA 4Y4JA 5BS4A 5P45A 3OXCA 3HAWA 4GZFA 4CPRA 4HEGA 3QRMA 3D1XA 3OQAA 2I4VA 2PYNA 3SA7A 3L59A 5P1EA 1EPME 1EBWA 5P1OA 5P1YA 4EHCA 1FQ7A 4J5JA 2B42A 5P2SA 2HM1A 5P5RA 3QVCA 1K2CA 4YD5A 1SGUA 1U8GA 1RQ9A 2RSPA 5OZRA 2BPYA 5P7GA 5P68A 5P5VA 2G24A 5P29A 5P57A 3O9EA 4H3FA 3PI5A 2G1RA 1ZLFA 5P5EA 1SDVA 3UHLA 4DJOA 5APRE 4Y51A 1SDUA 1EC1A 4Y3PA 5P6GA 4FM8A 3OQKA 4TVHA 5P8OA 3UTLA 3BUHA 3ZPTA 5P6WA 2B60A 4Y4TA 1D4HA 5P6AA 3EMYA 1D4LA 2AVMA 4DQEA 1ZBGA 5ER2E 2OHQA 3PEPA 2OHNA 1KJHA 3Q6YA 3LZYA 4Y5BA 4DJRA 1KJ7A 5P16A 3SPKA 3FX5A 3UFLA 5P67A 5P4GA 1T6GA 1FG6C 1GNNA 1LF3A 3OQDA 1TZSA 2HB4A 3OTSA 3OHHA 3DCRA 1A8GA 5P06A 3OXVA 4I1CA 5DR4A 5AGZA 3CKTA 4MC1A 1EPQE 4NPUA 4B77A 5P87A 3CKRA 4Q1YA 1EEDP 2R38A 8HVPA 5C9BA 5P62A 5IVQA 2V16C 2JJIA 1J71A 2ZJMA 1IVQA 2I1AA 4OD9B 5P48A 5P3MA 5P6BA 3QN8A 4Q1XA 3IN3A 5P6JA 2BKTA 3NUJA 2G27A 4EYRA 1B5FB 4D88A 3C9XA 5P5IA 1Z1HA 4Y4AA 5IVTA 4E43A 4GJ6A 5P7PA 3G72A 1FQXA 3MXEA 3OK9A 4Y56A 3K5DA 3S45A 3OAGA 3VSWA 5P5BA 1M4HA 1BIMA 4K8SA 4J0YA 2OHPA 3KF0A 5P8AA 2AOJA 4FM6A 5PEPA 5P8KA 1SMRA 3SA5A 3APRE 3HW1A 5P8QA 1F7AA 2ER7E 2Q11A 4KB9A 2AIDA 5P0CA 5P6EA 5P2ZA 5DQ1A 1PSOE 2I4QA 4APRE 5P30A 4CMSA 2FIVA 2V11C 4BELA 3TLHA 4OBDA 1W50A 5P7ZA 2AZBA 3ST5A 3OGPA 5P3XA 3PLDA 3LINA 3QRVA 1T3RA 5HCTA 5OZ5A 5P32A 5KQYA 2B7FA 2JYSA 4LBTA 5C9DA 1PSAA 1XN2A 3EXOA 2VA6A 4DPIA 2R3TA 2AOFA 3G6ZA 2F81A 4FM7A 1OEWA 2OHSA 2RKGA 4I12A 3LIVA 3OOTA 5P2MA 4B1CA 2HS1A 4PPHA 4D85A 4J54A 5I3VA 4Y4DA 3OADB 4Y5LA 4HZTA 1BV9A 3OU4B 4EJ8A 4RVIA 5P4QA 4B78A 3INHA 1DMPA 3ZLQA 5P66A 2PH8A 2AOHA 5OZEA 5OZSA 1IIQA 1B11A 3GGUA 3TPLA 5IE1A 4I11A 5P07A 3ZKMA 5P05A 3PCWA 5KQZA 5P4BA 4H3GA 4XXSA 5OZDA 1XL2A 5JG1A 1HSGA 1PROA 1MSMA 1YTIA 3PLLA 3DV1A 4B70A 3L5DA 5P33A 5P7IA 5P0OA 2VJ9A 5T4SA 5P7KA 5P6TA 4PYVA 5P28A 4Y36A 4H3JA 4L6BA 3APPA 3RSVA 4FSLA 5AH8A 5P44A 5P3VA 5KR8A 1GNMA 4JPCA 1A94A 3NU9A 3GI4A 3PWMA 2ZHSA 5P55A 1ZAPA 1MEUA 1XN3A 5P1PA 4YCTA 4Y3HA 3TH9A 5P7RA 5P6XA 2JJJA 5P4HA 5C9FA 2WEDA 3EL1A 2J9KA 4GJ9A 1FMBA 5OZVA 5P3CA 4Y44A 1UH8A 1APTE 1HPXA 5I3XA 1GVWA 1HSHA 1E80E 4KE1A 2QNNA 3O99A 5P1KA 5P7QA 4I10A 3UDPA 2UXZA 4HA5A 4I0JA 5P7YA 4RLDA 3DUYA 1FLHA 1T7KA 5SY3A 3VV8A 2QNQA 1EPPE 5P2RA 4F76A 5P8EA 5P27A 2O4NA 2Z4OA 2FGUA 2NXLA 5P8CA 1OEXA 3VV6A 1FGCC 3ZPSA 3HVGA 1IVPA 5P53A 5OZGA 2F80A 5P6ZA 3WB4A 4DUSA 1ZPKA 5P2LA 5HE7A 4GMIA 1MT9A 5DR3A 1T6EX 2I4XA 2I4DA 4HLAA 4Y3DA 3EKQA 2XFJA 3I2LA 3PSYA 3T7XA 1BAIA 3KT5A 5P7JA 5F00A 5P4WA 4DJXA 5P78A 3I25A 2VNNA 4FRJA 3Q4BA 5P0IA 4RRSA 5P79A 3UCBA 1ME6A 1DIFA 5P15A 5P54A 1MRWA 4MC2A 4YD4A 4RCDA 1Z1RA 1W5WA 5P6MA 1HXBA 3INFA 3KMXA 2OHLA 4DQBA 3SA6A 3ZMGA 5ISKA 3DOXA 4J1FA 2P3BB 3FNTA 1K1TA 4FCOA 4YDFA 4LXMA 3EKVA 2AODA 4OD9A 5P5GA 1GKTA 3O9LB 3UDJA 2QI5A 4I0FA 3L5BA 5P00A 5P4UA 5P3EA 2CENA 3TPJA 1BVEA 2AVQA 5P51A 3IA9A 2AQUA 3UDMA 4QJ2A 1KJFA 5P50A 3OAGB 5P5LA 3CIBA 3UF3A 4PHVA 3BXSA 3UQWA 5EZXA 5OZBA 1C6ZA 5P1HA 4RROA 5P1MA 2NXDA 2RKFA 1BXQA 3PJ6A 1RL8A 2Q15A 2G22A 3EM4A 5P7AA 1ODXA 2PMAA 1F34A 5P39A 1HPSA 2JE4A 1D4SA 5P2BA 1GNOA 3Q3TA 1LS5A 5AH6A 1W5YA 2P3AA 3ZKQA 3DV5A 4J1KA 4ZSRA 4R8YA 3S56A 2PH6A 1DW6C 4NJTA 4CPUA 1G6LA 2WEZA 3BHEA 2P3DA 3VFBA 4EQJA 4ACXA 5P4YA 4CKUA 4Y53A 5SY2A 5P5KA 2HS2A 1YTJA 2NR6A 4QJAA 5P7TA 3NYGA 5AHBA 1KJ4A 5OYRA 3GGVA 3NLSA 5OYXA 3BUFA 3IGBA 5P46A 4M8XA 3CICA 5P7LA 2QMPA 3SQFA 3QVIA 5OZPA 4Y3YA 4HVPA 3R1GB 5P04A 3OU1A 4NKKA 4YD7A 1K6VA 2IKOA 4HDFA 5P2YA 1MT7A 3EL9A 2IDWA 4FLGA 1TCWA 1C6XA 3L3AA 5P8TA 1FQ6A 1GVVA 1HIHA 3UDHA 2XFIA 3OADA 3OU4A 2QAKA 3R4BA 2QNPA 3TNEA 2XYEA 2PSGA 1G0VA 3L58A 5P8RA 2ZJKA 3OUCA 5P12A 1HIIA 5P84A 3M9FA 5OZ1A 3VLAA 4U8WA 5P3QA 2ZE1A 4NPTA 3JVWA 3I7EA 1HTEA 2F3EA 4D8CA 4Y3ZA 3OUDA 3L38A 3F9QA 3SM1A 1ZJ7A 4EJDA 5DR0A 5P6UA 3OXXA 1HVLA 5P2NA 4DJVA 1ER8E 1AVFA 3QBHA 4DI2A 5P5TA 1SDTA 2AOIA 3PWWA 5B18A 5IVRA 3IXKA 5P3PA 3QI1A 5HD0A 4TVGA 4UPJA 2QP8A 2QI1A 5P89A 1DP5A 4FS4A 4Y4WA 4OBGA 2AOGA 3DM6A 5P0BA 1MTBA 4YDGA 4RRNA 5P4OA 1EBYA 3LNKA 3IXJA 1LZQA 2BPVA 4IVSA 6FIVA 1AXAA 4QLHA 3GI5A 4WTUA 4J0TA 4Y48A 4YBIA 5P4JA 5TOLA 3GI6A 1IZDA 5P4CA 4Y3JA 3URJA 4ZPGA 5P20A 1CZIE 3R0WA 2FGVA 3BVBA 4Y4GA 3IXOA 5P43A 4GJ5A 2QCIA 2NTRA 1TW7A 5P8MA 5P8JA 1DPJA 4Y5GA 2AVVA 4D89A 5E5KA 4KE0A 3FKTA 5P1IA 3OQFA 1JLDA 2BJUA 4DH6A 1UH7A 5P09A 1PPKE 1QBSA 5KQFA 4HDPA 5P61A 4J0ZA 5P3BA 3IVHA 3QS1A 1AJXA 4KUPA 5P7SA 5P2TA 1B6MA 4DFGA 1SBGA 5P14A 4JOOA 2NMYA 4K4RA 3RTMA 1HVIA 5P2QA 1META 1CPIA 5P4VA 5P5DA 4DPFA 4XX4A 1B6LA 1XS7D 5P5HA 4B05A 2BPXA 4Y57A 1FG8C 5HVPA 4ZE6A 4GJ7A 2BQVA 3QRSA 4DJPA 2UY0A 2R5PA 2VNMA 2WECA 5P6YA 3LIZA 5P1VA 2ZJNA 3KYRA 3KA2A 2WKZA 2QI7A 5P37A 2AZCA 2P3BA 2QMGA 3L5FA 3SA8A 1XE5A 5P5SA 1YG9A 1NH0A 4FE6A 5P8SA 4GB2A 3K5CA 3O9LA 4JP9A 2FLEA 1APWE 5P40A 5P7BA 3UFNA 4Z22A 3HD8A 3I6OA 3QBFA 3OU3A 3KFPA 1YTGA 3FNSA 3CMSA 4Y45A 3BVAA 1IDBA 2OF0A 4R95A 5P2CA 5P3IA 2QD7A 2BBBA 5KOSA 5P6KA 5P22A 5OZKA 1EPLE 5P63A 2VIYA 1GVTA 4GIDA 4Y3XA 3HAUA 4B0QA 3K5GA 5P7DA 2QI3A 3D91A 3PGIA 3BGCA 1RNEA 5P4MA 1K6CA 2ER9E 4AA9A 5AHAA 2V0ZC 3KMYA 4Y5CA 3PM4A 2VS2A 1HWRA 1BWAA 5P4EA 1APUE 1LF2A 2VIEA 4LL3A 7UPJA 4LXKA 5P1WA 1EPRE 1FFFC 4DQHA 2ANLA 4L7HA 1HTGA 2PK5A 2ZHVA 5P0RA 5I3YA 3VUCA 2R3WA 5OZTA 1FEJC 2O4LA 1T7JA 5OZUA 1FB7A 5JODA 4CPXA 3IAWA 2R8NA 1EPOE 3D20A 5HDXA 5UPJA 2WF4A 4Y5PA 4NJVA 3HBOA 2ER0E 3URIA 5P4IA 3OU1B 2QMDA 2NMZA 2A1EA 2Z54A 3PRSA 1D4JA 5ER1E 1HVJA 1HEFE 3MWSA 4YD3A 4WY1A 5P8LA 5P58A 4NJSA 5P7NA 5P3HA 3UQRA 5P4XA 3S43A 4X7IA 1RPIA 1W6IA 4EQ0A 1G2KA 5P7UA 3UDYA 5OZ7A 5P0YA 3NDXA 5P1ZA 2XYFA 5P74A 5P6OA 1UPJA 3S8IA 3TKGA 3GW5A 5P1BA 1LF4A 2QI6A 3UDKA 3NU3A 4ER4E 1CMSA 3B80A 3N4LA 3RU1A 1K2BA 5P1NA 1IZEA 5P23A 5KQXA 1HVRA 1HEGE 5OZQA 3OUDB 4I0HA 4YA8A 2IENA 5P7FA 1MSNA 5CLMA 5P13A 5P3KA 5P4AA 2ZYEA 1MTRA 5P3AA 2BKSA 5OZAA 1W51A 1FFIC 5P6LA 5ISJA 2Q3KA 5P1SA 3OGQA 3NXEA 4Y38A 5P2HA 5P4TA 2P8HA 3S2OA 1NPWA 1TSQA 2QU3A 3S7LA 5P7OA 3ZKNA 3SA3A 1MRXA 1FQ5A 1W5XA 3WZ8A 1IZIA 1PFZA 5P1TA 4ZPFA 5SXNA 5OYTA 5OZXA 1APVE 2CEMA 3NU4A 1EBZA 5P5QA 3MSJA 2HPFA 3DJKA 1MPPA 5P3YA 5P3NA 1HVHA 4EP3A 5P0NA 2VIJA 3U6AA 5P1RA 4APEA 3ER5E 1B6JA 2ZHTA 2VIZA 2WF3A 1HVKA 5P2AA 1LV1A 3R2FA 5P2KA 4XX3A 3FIVA 5P0EA 2QZLA 5OZNA 3PMYA 4J1HA 4EJKA 1E82E 3H5BA 2ZJLA 3BUGA 2BPZA 5COPA 3U7SA 4RZ1A 5P5CA 2F8GA 1AJVA 2PSVA 1K6PA 5P4DA 3SLZA 4YOBA 3LZSA 3TPPA 2G26A 1QBUA 2AOEA 2XFKA 4GJCA 5COKA 5P6VA 5P8BA 3SKGA 3ECGA 1MUIA 5P6RA 3VYFA 1IBQA 5DGUA 4EWOA 4TRZA 5HCOA 3TKWA 4ACUA 2I0DA 5JFUA 3GGAA 4TRYA 5P7XA 2IL2A 3HVPA 1ZP8A 1D4YA 3BGBA 5P2XA 3TOGA 5P3GA 2SAMA 3ZOVA 2ZHRA 5P70A 5P2FA 2B8LA 5DPZA 5P0UA 1FF0C 4Y5AA 3KDBA 3O9HA 5P0XA 2QK5A 3SO9A 1TSUA 2FMBA 4AMTA 1ZTZA 5P2IA 4Z50A 2J9JB 3VF3A 5P11A 5HDUA 5P8GA 1YM4A 3O9BA 3AIDA 4Y47A 5KR2A 5OZZA 1Q9PA 5P60A 4U7QA 3NXNA 3OOZA 4J55A 2QI4A 2IGYA 4K9HA 1T7IA 3S7MA 3QROA 5P0LA 1BVGA 2HC0A 4L1AA 4OBHA 3QP0A 2Q63A 1XDHA 5KAOA 5DR1A 5ENKA 3UQUA 1QDMA 3QIHA 1BBSA 1C70A 4HDBA 4L7JA 3SAAA 1HPVA 3UPJA 1WBKA 1FMXA 3O9CA 5P24A 4OBJA 5P71A 4J0VA 1WKRA 2WF0A 5OZJA 1VIJA 3K1WA 3PBDA 5P2OA 3TL9A 5P56A 1UH9A 2H6TA 4DV9A 5HTZA 4S1GA 2PYMA 5OZFA 1MESA 3ZKGA 1FIVA 2IGXA 4HE9A 4Y3GA 3S53A 2WL0A 3ZKSA 1ZPAA 1LYWA 5P7VA 5OZCA 4GJAA 3ZPUA 5P5WA 5P0DA 4PZWA 5P18A 3EL0A 3LIYA 3O9GA 5P0MA 4ZSMA 5P85A 4LXAA 2QD6A 1HPOA 4I0GA 4RYGA 4Y3QA 3UDRA 5P02A 5HDZA 3PCZA 1HOSA 2ZHUA 4Q1NA 1FKNA 5OYQA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 4GJB A;  4Y4J A;  5BS4 A;  5P45 A;  3OXC A;  3HAW A;  4GZF A;  4CPR A;  4HEG A;  3QRM A;  3D1X A;  3OQA A;  2I4V A;  2PYN A;  3SA7 A;  3L59 A;  5P1E A;  1EPM E;  1EBW A;  5P1O A;  5P1Y A;  4EHC A;  1FQ7 A;  4J5J A;  2B42 A;  5P2S A;  2HM1 A;  5P5R A;  3QVC A;  1K2C A;  4YD5 A;  1SGU A;  1U8G A;  1RQ9 A;  2RSP A;  5OZR A;  2BPY A;  5P7G A;  5P68 A;  5P5V A;  2G24 A;  5P29 A;  5P57 A;  3O9E A;  4H3F A;  3PI5 A;  2G1R A;  1ZLF A;  5P5E A;  1SDV A;  3UHL A;  4DJO A;  5APR E;  4Y51 A;  1SDU A;  1EC1 A;  4Y3P A;  5P6G A;  4FM8 A;  3OQK A;  4TVH A;  5P8O A;  3UTL A;  3BUH A;  3ZPT A;  5P6W A;  2B60 A;  4Y4T A;  1D4H A;  5P6A A;  3EMY A;  1D4L A;  2AVM A;  4DQE A;  1ZBG A;  5ER2 E;  2OHQ A;  3PEP A;  2OHN A;  1KJH A;  3Q6Y A;  3LZY A;  4Y5B A;  4DJR A;  1KJ7 A;  5P16 A;  3SPK A;  3FX5 A;  3UFL A;  5P67 A;  5P4G A;  1T6G A;  1FG6 C;  1GNN A;  1LF3 A;  3OQD A;  1TZS A;  2HB4 A;  3OTS A;  3OHH A;  3DCR A;  1A8G A;  5P06 A;  3OXV A;  4I1C A;  5DR4 A;  5AGZ A;  3CKT A;  4MC1 A;  1EPQ E;  4NPU A;  4B77 A;  5P87 A;  3CKR A;  4Q1Y A;  1EED P;  2R38 A;  8HVP A;  5C9B A;  5P62 A;  5IVQ A;  2V16 C;  2JJI A;  1J71 A;  2ZJM A;  1IVQ A;  2I1A A;  4OD9 B;  5P48 A;  5P3M A;  5P6B A;  3QN8 A;  4Q1X A;  3IN3 A;  5P6J A;  2BKT A;  3NUJ A;  2G27 A;  4EYR A;  1B5F B;  4D88 A;  3C9X A;  5P5I A;  1Z1H A;  4Y4A A;  5IVT A;  4E43 A;  4GJ6 A;  5P7P A;  3G72 A;  1FQX A;  3MXE A;  3OK9 A;  4Y56 A;  3K5D A;  3S45 A;  3OAG A;  3VSW A;  5P5B A;  1M4H A;  1BIM A;  4K8S A;  4J0Y A;  2OHP A;  3KF0 A;  5P8A A;  2AOJ A;  4FM6 A;  5PEP A;  5P8K A;  1SMR A;  3SA5 A;  3APR E;  3HW1 A;  5P8Q A;  1F7A A;  2ER7 E;  2Q11 A;  4KB9 A;  2AID A;  5P0C A;  5P6E A;  5P2Z A;  5DQ1 A;  1PSO E;  2I4Q A;  4APR E;  5P30 A;  4CMS A;  2FIV A;  2V11 C;  4BEL A;  3TLH A;  4OBD A;  1W50 A;  5P7Z A;  2AZB A;  3ST5 A;  3OGP A;  5P3X A;  3PLD A;  3LIN A;  3QRV A;  1T3R A;  5HCT A;  5OZ5 A;  5P32 A;  5KQY A;  2B7F A;  2JYS A;  4LBT A;  5C9D A;  1PSA A;  1XN2 A;  3EXO A;  2VA6 A;  4DPI A;  2R3T A;  2AOF A;  3G6Z A;  2F81 A;  4FM7 A;  1OEW A;  2OHS A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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