3Q6YA

Endothiapepsin in complex with a pyrrolidine based inhibitor
Total Genus 77
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
77
sequence length
330
structure length
305
Chain Sequence
STGSATTTPIDSLDDAYITPVQIGTPAQTLNLDFDTGSSDLWVFSSDGQTIYTPSKSTTAKLLSGATWSSGDVYTDTVSVGGLTVTGQAVESAKSTIDGLLGLAFSTLNTVSPTQQKTFFDNAKASLDSPVFTADLGYHAPGTYNFGFIDTTAYTGSITYTAVSTKQGFWEWTSTGYAVGSGTFKSTSIDGIADTGTTLLYLPATVVSAYWAQVSGAKSSSSVGGYVFPCSATLPSFTFGVGSARIVIPGDYIDFGPISTGSSSCFGGIQSSAGIGINIFGDVALKAAFVVFNGATTPTLGFASK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Endothiapepsin in complex with a pyrrolidine based inhibitor
rcsb
molecule keywords Endothiapepsin
molecule tags Hydrolase/hydrolase inhibitor
total genus 77
structure length 305
sequence length 330
ec nomenclature ec 3.4.23.22: Endothiapepsin.
pdb deposition date 2011-01-04

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00026 Asp Eukaryotic aspartyl protease
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.40.70.10 Mainly Beta Beta Barrel Cathepsin D, subunit A; domain 1 Acid Proteases 3q6yA02
2.40.70.10 Mainly Beta Beta Barrel Cathepsin D, subunit A; domain 1 Acid Proteases 3q6yA01
5P8RA 3GGUA 4GMIA 2XFIA 4QJ7A 5OZYA 4ZE6A 3U7SA 1D4YA 2F80A 3PHVA 5P7VA 2JYSA 3LZYA 5P74A 1FMUA 4RLDA 3URJA 3UFLA 1K6VA 4H3IA 5KAOA 4GIDA 4EJKA 4EYRA 2BPZA 1D4SA 2HC0A 5P7SA 1SH9A 4I0ZA 4HVPA 3O9DA 4GJ5A 4WTUA 5P75A 3ZMGA 4F73A 3OU3A 5OYTA 3GGXA 3BGBA 3NU4A 5P88A 3UHLA 5P0KA 1M43A 1IZHA 1SIVA 2OHKA 4ZSQA 5P5BA 5I3YA 5P7XA 2AODA 5P0LA 5P0FA 4PZXA 5P1DA 2Q64A 4Y38A 3S45A 3I7EA 2NMZA 4Q5MA 4YDGA 2OHLA 1LF2A 1TCWA 5P76A 4DJXA 2VIYA 3K5FA 1IBQA 4I0HA 5P18A 3LIXA 4LP9A 1HPXA 5P2UA 5P89A 1PPME 5P27A 1BVGA 3UQUA 5AH6A 5P0GA 5P53A 2NR6A 5P3TA 5P6UA 5P5HA 1AAQA 3EMYA 3NYGA 1SGUA 4EHCA 5HD0A 1KJ7A 1CPIA 5P7ZA 1LEEA 5DQCA 1K6PA 4UPJA 2G69A 4Y3TA 4Y54A 3SKFA 2HPEA 1EC3A 5P5OA 1T6EX 5P8FA 5P82A 5P0WA 5P5RA 5P87A 2Z54A 4Y5LA 2BPWA 4L7GA 1W50A 1XL5A 4K8SA 1TSQA 3UDNA 4YD7A 4ZSPA 2B42A 3QAAA 1XN2A 2I4VA 1NSOA 5P68A 4GZFA 2Q3KA 1B6PA 1BXQA 4Y50A 4KE0A 5P57A 3EKXA 3KF0A 3EKVA 3OTYA 1Z1HA 4FRKA 7HVPA 3IXOA 3UDPA 4Q1NA 5P8SA 2F8GA 2WF2A 3ZKGA 5P8OA 4J1HA 4XX3A 3ZKXA 1JLDA 1META 2RSPA 4B1DA 3WB5A 5HTZA 4EP2A 3O9AA 5KR1A 4FL8A 4DQGA 5P0HA 4ZIPA 4EJDA 2VKMA 1FMXA 2ER7E 1HXWA 1SIPA 1YM4A 2ASIA 5ENKA 5P0IA 3OXWA 3TOGA 1EC2A 1AJXA 3PMYA 5P05A 5P6TA 2PSVA 2PYNA 5EZZA 4KB9A 5P6SA 1M0BA 1GNMA 1XS7D 5P85A 3UQRA 1BXOA 3O9EA 4D89A 3K5GA 5P78A 4D88A 3SAAA 2Q55A 4GJ7A 5P2IA 5OZCA 1Z8CA 2VA6A 4I0GA 2OHPA 5I70A 4Y5PA 5P59A 3B80A 3O9FA 3BUHA 1D4LA 3ECGA 1GVUA 4D83A 3UCBA 4EXHA 2QZXA 3EC0A 3O9GA 4Y4TA 3EM3A 1ODYA 4I0JA 2IS0A 5P6MA 2AQUA 3NLSA 1LYAB 3PJ6A 3BRAA 4J1CA 3NR6A 4GJBA 1UH8A 5P0QA 1BWAA 2ZJLA 3SA8A 5P52A 2QI0A 2ZJMA 2ZHUA 5P42A 5DR7A 2AOGA 5OYYA 1TQFA 3NDXA 3CMSA 4L1AB 1W6HA 4B1EA 3IA9A 5P1TA 2A4FA 2OHTA 2FS4A 4Y4BA 2QI7A 4EQJA 4JP9A 1IZEA 5P6RA 1YX9A 5P37A 5P49A 4D8CA 4PEPA 4TVGA 5AGZA 5P31A 3PM4A 5P17A 5P5SA 4NPTA 4Y51A 5P25A 3MWSA 3LZVA 3AUPA 3S85A 3QRVA 2P3CA 3IN4A 2AZCA 2F3FA 2Z4OA 5P5DA 2NPHA 4Y4XA 4DQCA 5HVPA 4Y3LA 3BHEA 4KE1A 1EPNE 1GVXA 4HDFA 5CONA 3S2OA 5P64A 3R0WA 1PSOE 1MERA 5HDUA 4OC6A 1C70A 2OHUA 2VIZA 1W51A 1ZAPA 5P8AA 5AHBA 5HE7A 5DQ4A 3UDQA 1CZIE 3OUCA 4OBFA 5P4BA 3TPRA 4TRWA 1ZPAA 5P6OA 2FDPA 2IRZA 5P6BA 3MXEA 2ZJKA 2O4SA 5P2EA 4Z4XA 5HDVA 4FM8A 5P10A 2HM1A 5P1OA 1A30A 3Q4BA 3UDMA 4Y3MA 5P5VA 2G21A 3O9LA 3DUYA 5P70A 3O9BA 1FB7A 2O40A 5P3FA 6FIVA 1GKTA 3BVAA 5DR4A 2AVQA 5P6FA 5P3HA 2AOHA 4DJWA 4QJAA 5P1UA 4EJLA 3U6AA 3A2OA 5P3SA 5OZZA 4R91A 5P1XA 1AXAA 1FFIC 5P5ZA 1NH0A 4NKKA 2QAKA 5IVQA 2BBBA 4Y3WA 4F74A 2PK5A 3SA5A 1TZSA 5AHAA 5P6WA 1HTGA 3L5DA 3R2FA 3ST5A 4TVHA 2I4QA 1D4KA 5P7NA 2G26A 5HCTA 2MIPA 3QP0A 4DJYA 2NNPA 2SAMA 4Y4UA 4Z2ZA 5P35A 5P6AA 1B6MA 1MT9A 1LYWA 3PWMA 4NJUA 5P2AA 4KUPA 3QBFA 1FG8C 3AIDA 1EEDP 5P8DA 2J9KA 3EKPA 4Q1YA 3QIHA 1FQ8A 3SM1A 5P2CA 4DJPA 4Y44A 5P4GA 5DQ1A 5P8CA 4Y35A 2Q63A 3OUBA 4HDBA 2QNPA 4JPEA 2IEOA 1OEWA 4ER1E 5P8NA 3DOXA 5P73A 2QNNA 1BIMA 1BAIA 4OBGA 2CENA 4QJ9A 5AH7A 5P5MA 5FIVA 3APPA 5P0BA 1ZBGA 1MIQA 5P6JA 5P1BA 2PWCA 5OZSA 4GJ6A 2AZBA 3M9FA 5JG1A 5JFUA 5BRYA 2IGYA 2HPFA 3RVIA 4F76A 4GJ9A 1EC0A 2VJ6A 5P0CA 4HDPA 1VIKA 4Y4JA 4Y3JA 3URLA 1HVCA 2F3EA 3PSUA 2WEAA 5E5JA 4GJAA 2ZHVA 4FAEA 2NTRA 4QJ6A 4RVIA 4OBHA 5P8MA 2NMYA 3T7XA 5DGWA 4J55A 5P3OA 5P80A 4Y5CA 2BPYA 3NU9A 3VUCA 3EXOA 4GYEA 3B7VA 3D1ZA 5P5JA 3PWWA 5P3RA 4Y6MA 4Y9WA 1HVKA 5P1ZA 2OHNA 1WBKA 1ZSFA 5P1HA 4OBJA 3QROA 4FGXA 1HPSA 1VIJA 5P3MA 4Z22A 4RYCA 3TKGA 4Y39A 1IZIA 5P8BA 1BWBA 1EPQE 3QRMA 4YE3A 5P1YA 3OUAA 5P62A 3ER5E 5HCOA 3OAGB 2O4KA 5P4JA 5P4YA 1QS8A 3KDBA 5P1IA 1G0VA 4EPJA 2P3BB 4DV9A 1C6XA 1HVSA 5OZ7A 3PMUA 3OOTA 1SGZA 3RTHA 3T7PA 5P2FA 2PYMA 3VSXA 2QD7A 3L59A 3ER3E 1F7AA 5P0OA 4AA9A 4ZEAA 3TNEA 5P00A 1ENTE 5JODA 2QI1A 3FIVA 3ZKIA 4J0VA 1KJFA 3GI4A 1FQ7A 5P2BA 1IDAA 3JVWA 1HTFA 2IQGA 5P6CA 3WSJA 5P6LA 3SFCA 3NU3A 3IGBA 3D3TA 1SMEA 2RKFA 2VJ7A 2AVVA 1FIVA 3S7MA 4Y3GA 5P72A 3SA4A 4Y3ZA 4CP7A 5P4FA 3PBDA 3R4BA 3OY4A 5P5WA 3OU1B 3OQDA 4FCOA 5P6HA 1OEXA 2OHMA 3OWNA 4CPWA 5P1WA 1W5WA 5P3VA 5P6YA 3PWRA 3PLDA 5OZLA 4RZ1A 5P3LA 1K1TA 5P3PA 5KQXA 4JECA 5P7OA 1BDQA 2AVSA 2P8HA 3I25A 3VV7A 2NNKA 5OZJA 3DV5A 2J9JB 1UH9A 5P7FA 2O4PA 2OHSA 3CKTA 1EBZA 3OTSA 2WEDA 3S53A 5P51A 4APRE 1SBGA 3HLOA 5P8KA 1MVPA 4X7IA 1ZTZA 5IS4A 5P8PA 2PK6A 1HVHA 2PMAA 5P03A 5P6IA 1W5VA 5OZ9A 5P7MA 5EZXA 4RVJA 1NPWA 4H1EA 1YG9A 5P1PA 3CICA 5P14A 5P2DA 1A9MA 3KMXA 4FSEA 1GVWA 4F75A 3UDJA 4DFGA 5P77A 5P12A 2AOEA 1C6ZA 5P2LA 4Y43A 2QMPA 1BDLA 5P3YA 3TOFA 5ER2E 4LHHA 1HTEA 4WY6A 3S43B 3Q6YA 2NXMA 2V0ZC 3LIZA 2FNSA 3R0YA 5P55A 5P0UA 4J0YA 4S1GA 3UQPA 1T6GA 3GGAA 4RCFA 4PPHA 5P3KA 3ZOVA 4LL3A 4RVXA 4Y45A 1E82E 5OZVA 3NDWA 5ISJA 3K4VC 3LPIA 4Y5KA 2AZ8A 5KOSA 1UH7A 2HS2A 1AJVA 1HVLA 5OYUA 3I6OA 5P5AA 5P5XA 1T3RA 2FNTA 5P7BA 1SDTA 4YBIA 1KJGA 3OQFA 5P45A 3UQXA 5P6KA 4LXMA 2VIEA 5OZMA 2IDWA 5DQ5A 1HRNA 2RKGA 2ZJJA 3DCRA 5P81A 4EQ0A 3D91A 4RRNA 3K4VA 4YD3A 3CYXA 2WF4A 2RMPA 2R3WA 2V12C 3KFRA 4ZSRA 4DPFA 4M8XA 1BILA 5P4LA 3PVKA 2A1EA 3LNKA 2HS1A 5OZ0A 2AIDA 3PSGA 1IIQA 4Y47A 2OF0A 4K9HA 1RL8A 2BJUA 2ZHSA 3L38A 3VCMA 2OHRA 2Q5KA 4Z50A 4I11A 2ANLA 3OU4A 5P0YA 1D4IA 3LITA 2QP8A 4Y3PA 5OZ2A 1W5XA 5SY3A 5P2XA 3LIYA 3NDUA 5P2VA 5P2OA 2IKUA 3KFNA 4Y58A 3N4LA 5AH9A 1K1UA 4CPXA 2I1AA 5P0VA 4B05A 6APRE 1MESA 3WZ6A 1YTIA 2PC0A 5P5EA 1B6LA 2F81A 3LIVA 1DP5A 3QVIA 2APRA 1PFZA 5P2TA 4Y5NA 3EM4A 5P1JA 5T4SA 4Y5EA 3FX5A 5OZPA 4WY1A 2QI4A 1FMBA 3INDA 5P7KA 1ODWA 3O99A 5P4RA 4OBZB 1HVIA 2FIVA 3VYFA 3PSYA 5P1CA 2R43A 4FS4A 4ZSMA 1EBYA 3DM6A 2BQVA 4DPIA 4ACUA 4FE6A 3I2LA 5P08A 2G1RA 5P3AA 5P0AA 3OXXA 1FF0C 4OBDA 4X2LA 5P7EA 5P11A 1RV7A 2QZKA 5P40A 1F34A 5IVRA 3NU6A 2P3DA 3UFNA 5P5YA 4MC9A 2O4LA 2UY0A 4L7JA 5P4AA 5OYWA 3LIQA 3UDRA 3C9XA 5P0RA 2R38A 4ER4E 4GJ8A 4PYVA 3PGIA 3PEPA 1HSIA 5P6GA 3UPJA 3LPKA 4EP3A 5P4ZA 4Y41A 2ZJHA 1PPKE 4NJTA 5ER1E 4CPQA 4J1EA 3JVYA 1J71A 2B7ZA 5OZBA 1FKNA 2VNNA 1OHRA 4HA5A 1YM2A 5P02A 5P38A 5P3CA 3BXSA 3FSMA 2QHYA 3FNSA 4LC7A 5P7QA 1KJHA 3R1GB 3EL9A 3NWXA 5IE1A 1B11A 3OQ7A 4RROA 1MRXA 4XXSA 3QS1A 1E5OE 1K6TA 4FRSA 3VV6A 3SA3A 3KFPA 5P6XA 6UPJA 3O9CA 1KJ4A 3BUFA 1U8GA 4OD9A 5P7PA 4ZPEA 5P1GA 3FKTA 1IDBA 5P32A 2B8LA 3ZPTA 1RPIA 5TOLA 5P7JA 5P6PA 4OBKA 5P1EA 3VFBA 2VA5A 3VV8A 3KYRA 4H3FA 5P7HA 3Q70A 5P0ZA 5P0XA 3INHA 3PB5A 5P1RA 1MPPA 1B6JA 5P43A 4R92A 5P1AA 5KR8A 2WECA 1QBUA 3IXKA 4MC2A 5P2GA 2G20A 2R8NA 1DAZC 5P4DA 4Y4DA 2OHQA 3PLLA 4J1IA 1C6YA 2QNQA 4J0PA 5P07A 2FDEA 3NUOA 1HIHA 4DQHA 3PCWA 1MTRA 1N49A 1YT9A 4FSLA 5UPJA 5P4QA 4B1CA 1FLHA 3OXCA 4CPUA 5P7GA 4Y5GA 2I4DA 5COOA 1ME6A 5P4WA 2ER0E 5P15A 4AZYA 3SA7A 5P6ZA 3MSJA 1HVJA 2ZE1A 5KR2A 4LBTA 5P5PA 2G1NA 4DJUA 4QJ8A 5P4UA 4YOBA 5KR0A 3KDCA 3OUDA 4Y3QA 5P34A 5P3GA 9HVPA 5P0SA 3LZUA 5KQZA 2B8VA 2CEMA 5OZ1A 3QVCA 3HW1A 2WF3A 2AVMA 2P3BA 3PBZA 5HDZA 3VF3A 5BS4A 3OOZA 4B72A 4FRIA 4DJVA 3O9IA 2JXRA 1GNNA 4IVTA 4Y3SA 4OC6B 3QBHA 3FV3A 5P4CA 4B70A 1HOSA 5P2YA 2QD8A 4YBFA 3T3CA 1SMRA 4I0IA 5P58A 5C9BA 2QU2A 4ACXA 1MUIA 5OZHA 4Y3EA 5I3XA 1APTE 2AZ9A 2FDDA 5P3EA 1QRPE 5P3WA 3UQWA 3D1YA 4DQEA 4B78A 4NJVA 5P71A 5P5IA 5I3VA 4I0FA 5APRE 3ZPSA 2AOIA 5OZAA 4I10A 3EKWA 5OZTA 3GI6A 3O9LB 5P7DA 3ZKMA 2VNMA 4FLGA 3H0BA 3OU1A 1TCXA 4Y3RA 4Y57A 2BKTA 3NXNA 4RCDA 1QBRA 5C9FA 3RTNA 1B6KA 2ZHTA 5OYVA 4BFBA 3BUGA 5P2RA 5P4PA 4YCYA 1GNOA 3HVGA 3MXDA 2QHZA 5P3QA 1NPVA 2NXLA 3OADB 3LHGA 5P46A 5P7UA 1XL2A 4EWOA 2I4XA 3BC4A 4J1FA 5DR0A 5P67A 3HBOA 4Y48A 5OYRA 3FNTA 5P8VA 3S7LA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 5P8R A;  3GGU A;  4GMI A;  2XFI A;  4QJ7 A;  5OZY A;  4ZE6 A;  3U7S A;  1D4Y A;  2F80 A;  3PHV A;  5P7V A;  2JYS A;  3LZY A;  5P74 A;  1FMU A;  4RLD A;  3URJ A;  3UFL A;  1K6V A;  4H3I A;  5KAO A;  4GID A;  4EJK A;  4EYR A;  2BPZ A;  1D4S A;  2HC0 A;  5P7S A;  1SH9 A;  4I0Z A;  4HVP A;  3O9D A;  4GJ5 A;  4WTU A;  5P75 A;  3ZMG A;  4F73 A;  3OU3 A;  5OYT A;  3GGX A;  3BGB A;  3NU4 A;  5P88 A;  3UHL A;  5P0K A;  1M43 A;  1IZH A;  1SIV A;  2OHK A;  4ZSQ A;  5P5B A;  5I3Y A;  5P7X A;  2AOD A;  5P0L A;  5P0F A;  4PZX A;  5P1D A;  2Q64 A;  4Y38 A;  3S45 A;  3I7E A;  2NMZ A;  4Q5M A;  4YDG A;  2OHL A;  1LF2 A;  1TCW A;  5P76 A;  4DJX A;  2VIY A;  3K5F A;  1IBQ A;  4I0H A;  5P18 A;  3LIX A;  4LP9 A;  1HPX A;  5P2U A;  5P89 A;  1PPM E;  5P27 A;  1BVG A;  3UQU A;  5AH6 A;  5P0G A;  5P53 A;  2NR6 A;  5P3T A;  5P6U A;  5P5H A;  1AAQ A;  3EMY A;  3NYG A;  1SGU A;  4EHC A;  5HD0 A;  1KJ7 A;  1CPI A;  5P7Z A;  1LEE A;  5DQC A;  1K6P A;  4UPJ A;  2G69 A;  4Y3T A;  4Y54 A;  3SKF A;  2HPE A;  1EC3 A;  5P5O A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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