3SFCA

Structure-based optimization of potent 4- and 6-azaindole-3-carboxamides as renin inhibitors
Total Genus 88
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
88
sequence length
340
structure length
340
Chain Sequence
LTLGNTTSSVILTNYMDTQYYGEIGIGTPPQTFKVVFDTGSSNVWVPSSKCSRLYTACVYHKLFDASDSSSYKHNGTELTLRYSTGTVSGFLSQDIITVGGITVTQMFGEVTEMPALPFMLAEFDGVVGMGFIEQAIGRVTPIFDNIISQGVLKEDVFSFYYNRDSENSQSLGGQIVLGGSDPQHYEGNFHYINLIKTGVWQIQMKGVSVGSSTLLCEDGCLALVDTGASYISGSTSSIEKLMEALGAKKRLFDYVVKCNEGPTLPDISFHLGGKEYTLTSADYVFQESYSSKKLCTLAIHAMDIPPPTGPTWALGATFIRKFYTEFDRRNNRIGFALAR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structure-based optimization of potent 4- and 6-azaindole-3-carboxamides as renin inhibitors.
pubmed doi rcsb
molecule tags Hydrolase/hydrolase inhibitor
source organism Homo sapiens
molecule keywords Renin
total genus 88
structure length 340
sequence length 340
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.4.23.15: Renin.
pdb deposition date 2011-06-13

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00026 Asp Eukaryotic aspartyl protease
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.40.70.10 Mainly Beta Beta Barrel Cathepsin D, subunit A; domain 1 Acid Proteases 3sfcA02
2.40.70.10 Mainly Beta Beta Barrel Cathepsin D, subunit A; domain 1 Acid Proteases 3sfcA01
3ECGA 3ZKSA 5P17A 4EQ0A 5P2HA 5P3CA 2HPEA 5P3AA 5P0HA 5P2CA 4K8SA 5IVSA 4Y35A 4S1GA 1ENTE 5OZYA 4Y3MA 4YBIA 1YM4A 1KJFA 2BB9A 3WB4A 3ZLQA 3L5DA 1IZDA 2FMBA 2QAKA 3CYWA 4B77A 3SA8A 1B5FB 5P0MA 3S7LA 1FLHA 3Q3TA 4WY6A 3S8IA 3VYFA 3PEPA 3LPJA 5OZNA 5AH6A 4X2LA 1BV9A 5OZGA 1PSNA 3T6IA 3APPA 5P4DA 4OBZA 4Y6MA 3S2OA 3TPPA 4Y41A 1BWBA 1Z1HA 4YE3A 2V11C 3ER5E 1T7IA 4Z50A 5OZBA 4Y4BA 2VNMA 1QDMA 5P46A 4Y45A 5OZ0A 4GJCA 3FX5A 4FLGA 4NPUA 1DIFA 2R5PA 5P1ZA 5P5FA 5P7YA 5P39A 2Q11A 1FGCC 3PVKA 4XX4A 2I4DA 2ZDZA 1NPWA 3D1ZA 4JP9A 5P0ZA 4YCTA 2R3WA 3UDPA 3LPKA 4Y5BA 3NWXA 4Y3EA 3ZPTA 1YT9A 2F3FA 3GI5A 4H1EA 5UPJA 3T7XA 2QNNA 4Y3FA 2OF0A 4Y57A 4Y53A 1UH9A 3CKTA 3I2LA 3UDJA 5OZOA 5P2WA 4ZE6A 5P4PA 3TKWA 5P8SA 5P4FA 5P7BA 3UHLA 3UTLA 4XX3A 4I0ZA 3O9LB 4GJ8A 3R0YA 5OZ3A 5P3QA 5IVTA 4RVJA 1K6VA 4YCKA 5P5CA 2AVOA 1D4SA 1EC3A 5P4HA 1IDAA 3OXVA 1BDRA 5P42A 5P6EA 4DQFA 3BVBA 1HVKA 2UPJA 3S54A 3VF3A 4J1CA 3I25A 2IGYA 5P7UA 3VV6A 2F3KA 1HTRB 3FV3A 3GI0A 5P4KA 4MC2A 5P5LA 5P8TA 5DQ5A 2G27A 5P07A 4B0QA 3SA5A 1SGUA 3D3TA 1MT7A 5P5ZA 1VIKA 5P5PA 5P5RA 5P1MA 4GYEA 5P3BA 4LXAA 4OD9A 1GVVA 1BVEA 1B6LA 4KUPA 4HZTA 3S53A 3G70A 1APVE 4Y4UA 4N00A 5P71A 2SAMA 3O9EA 5P87A 1EC2A 2J9KA 1ZP8A 4CMSA 2Z4OA 3URIA 4Y54A 4DQHA 5DR8A 1E5OE 1C6YA 1G6LA 2A4FA 3T7PA 5P0OA 4DJXA 1QBUA 4Y50A 3VV8A 1LS5A 5P48A 5P16A 5P4NA 4Y3PA 3FNUA 5P70A 4FRSA 2HS2A 5TOLA 5P7VA 4YD4A 2BQVA 5P0GA 1GNNA 5P2YA 1M43A 4I11A 1KJHA 2FGVA 4ZPEA 5P6LA 1YX9A 3L58A 1G35A 4AZYA 3QPJA 5P1DA 5P09A 4NPTA 4I0IA 3LZUA 4EHCA 4YDFA 4GJ5A 4D88A 5P36A 3VF7A 4A6CA 1NH0A 1LYWA 5OZ4A 5P60A 5P6PA 5P49A 4OBZB 3EKWA 4FAFA 1MT9A 5P7RA 4DJWA 2IQGA 2RMPA 5P0KA 2R8NA 1ZPKA 5P15A 5P4TA 1W6IA 3NU5A 4Y3JA 2PWCA 5P7XA 1HPOA 4ZEAA 2VA7A 2RKGA 5ENMA 1BDLA 2G26A 3BXSA 3ZKNA 2OHKA 2WF1A 5P2NA 5BS4A 4B72A 3VG1A 2O4PA 2NMYA 5P3FA 3PCWA 1HOSA 4Y5CA 5P05A 3S43A 3TH9A 3A2OA 5P3DA 1W6HA 3OGQA 4UPJA 1HPSA 5P72A 5P4AA 5P68A 1F34A 5DR3A 1HTFA 4GJAA 3EBZA 2WECA 4M8XA 3OY4A 4Z22A 4Z4XA 4GZFA 2V00A 1NSOA 3BVAA 1M0BA 2R38A 1ODYA 1TSUA 3SA9A 4FM6A 5P4LA 5KR0A 3DV5A 4Y4DA 5OYTA 1SP5A 1F7AA 5P08A 3LIYA 5P8BA 4RGHA 3JVWA 5P7JA 2OHPA 4AA8A 1RNEA 4J17A 4YD3A 5ISJA 3ST5A 5P2RA 2EWYA 3CKPA 4GJDA 1T3RA 4Y3QA 1IZHA 2BPZA 5P3PA 1HVSA 5P45A 5IE1A 5P7LA 3RSXA 4J0VA 2AVSA 3OQKA 2VIYA 3DOXA 5HE5A 5P2SA 4OBDA 1MERA 2FIVA 3FNTA 5P0WA 5P5BA 2FDPA 2PSVA 5DPZA 1KJ4A 5ENKA 3DJKA 4RVIA 1AJXA 3OQDA 3OGPA 1MRWA 2BPWA 2ZHTA 2Q3KA 3PMUA 3GW5A 3JW2A 5P66A 3TOGA 4I0JA 1MVPA 1HVLA 5P5IA 4Z2ZA 3T3CA 4MC1A 3C9XA 3I6OA 1HVRA 5P1WA 1B6MA 4Y4GA 1IIQA 1YTIA 4Y5NA 1QBSA 4OD9B 5IS4A 4GJ9A 2VJ7A 5AH9A 3OQ7A 5P0YA 5P00A 1ODXA 3RVIA 4Q1YA 5P2BA 4HA5A 4NKKA 4B1EA 4JPEA 4JPCA 4PHVA 5OZLA 5ISKA 2QP8A 2VIEA 5P6ZA 1XL2A 1FB7A 5KQFA 3SACA 3PBDA 1AVFA 3UF3A 4OBJA 2R5QA 2FXEA 2WEAA 4Y47A 3OADA 5P13A 4CPRA 5P3ZA 4Y5GA 2AQUA 3BUFA 5P4QA 5HVPA 1HEFE 3SQFA 5HU1A 1RL8A 3UQXA 3QRMA 4QJ6A 1XE6A 4J5JA 2QI6A 3UQUA 2V10C 2Z54A 3R2FA 2VS2A 1T6GA 4F73A 5P2ZA 1LYWB 1JLDA 3OOTA 3HZCA 4FRJA 5OZWA 4Y48A 2P3AA 5OZ6A 3PWWA 3INFA 3OUAA 2CEJA 4GMIA 2AZ8A 2I4QA 3GGXA 4GIDA 5C9DA 1Q9PA 3SA3A 5P1VA 1W5YA 2ZE1A 5P1BA 4LP9A 5P3MA 4K4QA 5OYRA 4Y3RA 4YCYA 1LF4A 1FKNA 1UH8A 2QI3A 3KT5A 3O9HA 5P1HA 3IN3A 4OC6A 6UPJA 5JFUA 5P5DA 5P5SA 5P8IA 3NYGA 1ZLFA 3TTPA 5P8QA 4Y3HA 1WKRA 1EPOE 5P6GA 2AVVA 2OHLA 1DMPA 2AOFA 3S43B 3VEUA 3OHHA 5P8GA 4RRSA 2WF3A 2NR6A 5P12A 2ER0E 7HVPA 3N4LA 4DQEA 2ER9E 3Q5HA 5CONA 3AUPA 2NMZA 4B05A 3DCKA 3GGAA 3U7SA 3D1XA 1GNMA 2VIZA 2FNSA 1GKTA 1HWRA 5P7WA 3FNSA 1AAQA 1BIMA 5COPA 3BGCA 2AZBA 2G22A 1K6TA 1SBGA 3UDNA 2JXRA 2ZJIA 2J9JA 5P7SA 3IXKA 4HDBA 3KT2A 1RPIA 4RCEA 2VA6A 5P1IA 3NU3A 3PLLA 5P8PA 3FSMA 4DJRA 2WEZA 5OYZA 1MSMA 3UDMA 5P5XA 4FM8A 1GNOA 5P34A 3L5EA 2XYEA 2FS4A 3KDDA 2QI7A 4Y3TA 5P06A 1FQ4A 5P01A 3N3IA 4ZPGA 2IENA 3NWQA 3PB5A 3EM6A 4Q1NA 2ZHVA 4J1HA 3URJA 5P59A 4Y5AA 5P41A 4Y3WA 3KFSA 2BPXA 3LZYA 3HDKA 2P3BA 2A1EA 2B8VA 2PK6A 2HIZA 4DPFA 2V12C 5DR7A 5DQ2A 3ZMGA 3K4VC 1CMSA 4OBGA 3FKTA 4R5NA 4YOAA 2R3TA 1EPLE 6APRE 5SY3A 2AZCA 5P3WA 1HVHA 5P2XA 2OHUA 4CPSA 4LAPA 5COKA 4D85A 3IXOA 4CPQA 3APRE 4ER2E 4Y38A 2ZJKA 3BHEA 5P10A 3LHGA 3VUCA 2VNNA 5I3VA 3QS1A 5P6QA 1K1UA 3TOHA 5P0RA 2BJUA 5OZEA 3O9BA 5BWYA 5P53A 1FMBA 3UDKA 3LINA 2VKMA 3R0WA 5P7OA 1APTE 3HD8A 5P6SA 5P73A 4Y3ZA 3ZPSA 4TRZA 5P80A 3EL0A 3O9AA 1AJVA 2AZ9A 4RCFA 4U7VA 1BXQA 5OZXA 2Q63A 5P3LA 5HDXA 4DJPA 5P0SA 3MSKA 5P30A 3RSVA 3IA9A 3LIZA 1QBTA 5P0NA 1C6ZA 3TLHA 5AH8A 5P2JA 2QI4A 3INDA 5P8VA 3QROA 5F01A 5P6WA 1EEDP 5OYUA 3L5FA 3OUDA 4J0YA 3ER3E 1PFZA 5P4IA 1LYBA 5P6JA 1M4HA 2PSGA 3SO9A 4MC6A 4Y4EA 5P4ZA 5OZ8A 5HDVA 4J1KA 5P61A 2IRZA 5P8DA 5P44A 4GJ6A 1BXOA 3TPRA 3BRAA 2BKTA 2H6SA 5OZKA 5P6DA 3ZKMA 5BRYA 4F74A 2B42A 5P7NA 1KZKA 3S56A 2I1AA 5E5JA 1IVQA 3PLDA 1TCXA 5OZ2A 2R43A 4DJQA 2QU3A 2Q64A 1EPNE 5P0LA 5P4XA 2G1OA 3GI6A 5I3XA 2XFKA 1J71A 1LV1A 3GGUA 2B7ZA 2Q15A 2G1SA 3IGBA 1HRNA 1YTJA 1K6CA 2B60A 4EXHA 4PZWA 4DPIA 5P1JA 5P2KA 1PSOE 2WJOA 4R8YA 4BEKA 4WTUA 5P19A 4Y5EA 5P23A 3LIQA 3OUCA 2PK5A 1META 5P1PA 1PROA 1FG6C 3OAGA 3NLSA 5P5UA 5IVQA 4Y36A 5AHAA 3ZPUA 2PH8A 3EKTA 2WF2A 3SM1A 1W5XA 2QZKA 5OZJA 4DJOA 1FIVA 5P2TA 5P7QA 5P0FA 4BFBA 3NR6A 1TQFA 3RTNA 3SABA 4I0DA 3ZL7A 5P27A 1HPVA 5KQXA 5P04A 1HVIA 3LPIA 1XDHA 5P8MA 4L7GA 2ZYEA 3HLOA 4TVGA 1IDBA 1FQ8A 3LIVA 4EYRA 3OU4B 3PI0A 4B70A 2P8HA 5P6OA 4EP3A 1B11A 5P0QA 1DAZC 3CKRA 5PEPA 3DCRA 2F80A 2QMGA 4DQCA 4HDFA 1SH9A 5OZFA 3T11A 2XFIA 3DV1A 5P4UA 3SFCA 3L5CA 4Q1XA 1EPRE 1MPPA 1FF0C 3OUBA 3KDBA 5OZ7A 4DJUA 3UPJA 2I4UA 2QI0A 5P6NA 3CIBA 5P6FA 3INHA 2JJIA 3LZSA 5P85A 5P3UA 5P1AA 2AVMA 5P0TA 3KFPA 1ZBGA 4LXMA 2RENA 4EJLA 5P8HA 3ZKGA 5P8OA 2UY0A 1EBZA 2ZJMA 2O40A 4ER4E 4FIVA 5P52A 3LNKA 3HAUA 4LBTA 5P4YA 1MEUA 3D20A 5P4SA 3NUOA 4Y4TA 4D89A 3K5CA 4Q5MA 4M8YA 5P8KA 1OEWA 3MXEA 3O9DA 5ER2E 1FFFC 4U7QA 3FIVA 4R95A 4D83A 5P4GA 3IXJA 3H0BA 3QI1A 5FIVA 3VSXA 1ODWA 4L1AA 5P5WA 3UQWA 4FS4A 5KQZA 3EC0A 3EL4A 3WZ7A 3OUDB 4TVHA 5P64A 4AUCA 4XKXA 1LYBB 1IZEA 3UFLA 3GGVA 4CPWA 2CENA 5COOA 5P7CA 2B8LA 4QJ8A 1ER8E 4Y5LA 2FDEA 1XN2A 2AIDA 4YD5A 5P47A 5KAOA 2NNKA 2ER6E 3KDCA 1BVGA 4IVTA 4ZSMA 2AOCA 2ER7E 5OYQA 1G0VA 2ANLA 1T6EX 2IL2A 2NXDA 4Y4XA 4QJ2A 3HVGA 3Q6YA 4K4PA 5P0VA 2ZHSA 2AOIA 3OU1A 4KE0A 3VYDA 1PPME 1FQ7A 4I1CA 4EWOA 1ZSRA 5P7GA 4EQJA 1RV7A 2QU2A 5P18A 5P8FA 5P6YA 3EXOA 5P2FA 5P5KA 1LZQA 1A94A 1BV7A 3HVPA 3VSWA 2PC0A 5P7DA 4HE9A 4Q1WA 2IDWA 3UDRA 1RQ9A 1BAIA 4J55A 3NDWA 2I0AA 1HIIA 5P4RA 5OZ9A 2UXZA 5P69A 5P7FA 4Y3GA 5P3RA 5P6UA 1NPVA 3D1YA 4DJVA 3IAWA 2H6TA 2JE4A 3OXWA 1ZPAA 5P6AA 4Y44A 5P7TA 4PYVA 1BWAA 4J0ZA 1K1TA 3KN0A 5P8RA 3KMYA 5P4JA 5P50A 3PJ6A 5P1RA 2G24A 1EPME 5DR0A 5P65A 2O4KA 9HVPA 4DUSA 1D4IA 1HTGA 1SDVA 1SDTA 4CPUA 2HC0A 4Y5PA 5P33A 3EMYA 4FL8A 4CPXA 4QJ9A 3G72A 3L38A 5P2MA 2ZGAA 1W50A 4K9HA 2FGUA 4YOBA 3LITA 1K6PA 4H3JA 4ZPFA 5P0EA 3UDYA 5OZUA 4YHQA 5P3HA 4ER1E 5P1NA 3SM2A 1HIVA 5JODA 1QRPE 4U8WA 5HCTA 4J1EA 1UPJA 4HVPA 3G6ZA 4Y3DA 2AOGA 1HEGE 2IS0A 3Q4BA 1QS8A 2NPHA 2CEMA 4A6BA 4Y3YA 3ZOVA 5P6IA 3B80A 5I70A 5P5OA 5EZXA 5P7KA 4TRWA 4DJYA 2AODA 3SA7A 4RRNA 2V0ZC 3OTSA 4FAEA 2G21A 5P7AA 1DW6C 1LYAA 1ZAPA 7UPJA 5P0DA 2VIJA 4L1AB 2Q55A 3L5BA 4LC7A 2WF4A 2G1RA 3O9FA 2AOHA 3WB5A 3EL1A 4ZSRA 4B1CA 1A9MA 4HLAA 1ZTZA 1SGZA 4JOOA 2P3DA 2P83A 2P3CA 1DP5A 2I4XA 5P5TA 1ZJ7A 2ZJNA 3OWNA 5OYYA 3PBZA 5HDZA 1XL5A 4APEA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 3ECG A;  3ZKS A;  5P17 A;  4EQ0 A;  5P2H A;  5P3C A;  2HPE A;  5P3A A;  5P0H A;  5P2C A;  4K8S A;  5IVS A;  4Y35 A;  4S1G A;  1ENT E;  5OZY A;  4Y3M A;  4YBI A;  1YM4 A;  1KJF A;  2BB9 A;  3WB4 A;  3ZLQ A;  3L5D A;  1IZD A;  2FMB A;  2QAK A;  3CYW A;  4B77 A;  3SA8 A;  1B5F B;  5P0M A;  3S7L A;  1FLH A;  3Q3T A;  4WY6 A;  3S8I A;  3VYF A;  3PEP A;  3LPJ A;  5OZN A;  5AH6 A;  4X2L A;  1BV9 A;  5OZG A;  1PSN A;  3T6I A;  3APP A;  5P4D A;  4OBZ A;  4Y6M A;  3S2O A;  3TPP A;  4Y41 A;  1BWB A;  1Z1H A;  4YE3 A;  2V11 C;  3ER5 E;  1T7I A;  4Z50 A;  5OZB A;  4Y4B A;  2VNM A;  1QDM A;  5P46 A;  4Y45 A;  5OZ0 A;  4GJC A;  3FX5 A;  4FLG A;  4NPU A;  1DIF A;  2R5P A;  5P1Z A;  5P5F A;  5P7Y A;  5P39 A;  2Q11 A;  1FGC C;  3PVK A;  4XX4 A;  2I4D A;  2ZDZ A;  1NPW A;  3D1Z A;  4JP9 A;  5P0Z A;  4YCT A;  2R3W A;  3UDP A;  3LPK A;  4Y5B A;  3NWX A;  4Y3E A;  3ZPT A;  1YT9 A;  2F3F A;  3GI5 A;  4H1E A;  5UPJ A;  3T7X A;  2QNN A;  4Y3F A;  2OF0 A;  4Y57 A;  4Y53 A;  1UH9 A;  3CKT A;  3I2L A;  3UDJ A;  5OZO A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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