3T6IA

Endothiapepsin in complex with an azepin derivative
Total Genus 89
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
89
sequence length
330
structure length
330
Chain Sequence
STGSATTTPIDSLDDAYITPVQIGTPAQTLNLDFDTGSSDLWVFSSETTASEVDGQTIYTPSKSTTAKLLSGATWSISYGDGSSSSGDVYTDTVSVGGLTVTGQAVESAKKVSSSFTEDSTIDGLLGLAFSTLNTVSPTQQKTFFDNAKASLDSPVFTADLGYHAPGTYNFGFIDTTAYTGSITYTAVSTKQGFWEWTSTGYAVGSGTFKSTSIDGIADTGTTLLYLPATVVSAYWAQVSGAKSSSSVGGYVFPCSATLPSFTFGVGSARIVIPGDYIDFGPISTGSSSCFGGIQSSAGIGINIFGDVALKAAFVVFNGATTPTLGFASK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Endothiapepsin in complex with an azepin derivative
rcsb
molecule keywords Endothiapepsin
molecule tags Hydrolase/hydrolase inhibitor
total genus 89
structure length 330
sequence length 330
ec nomenclature ec 3.4.23.22: Endothiapepsin.
pdb deposition date 2011-07-28

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00026 Asp Eukaryotic aspartyl protease
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.40.70.10 Mainly Beta Beta Barrel Cathepsin D, subunit A; domain 1 Acid Proteases 3t6iA02
2.40.70.10 Mainly Beta Beta Barrel Cathepsin D, subunit A; domain 1 Acid Proteases 3t6iA01
1TSUA 1BBSA 5P4EA 3K5DA 1B5FA 3QPJA 3INFA 1AJXA 3WZ8A 1HIHA 4OD9B 5OZ5A 3SA6A 3BGCA 5P38A 1SIPA 3TNEA 6UPJA 5P6YA 5P52A 3LIYA 2G1RA 3URIA 3SACA 4ZSQA 1PROA 4HDPA 1SMEA 5P2BA 2IQGA 4L6BA 4DJWA 5P55A 5P0QA 5JFUA 3LPJA 2OHPA 3L5DA 3L5FA 3BUGA 3AIDA 3PWWA 1GVXA 3ECGA 1G0VA 3TOGA 2B7ZA 5P6HA 1EBZA 1EPQE 5P0SA 2AODA 4I0IA 4YOBA 5P1QA 2OF0A 3PSYA 4R8YA 1HOSA 5P8PA 4HA5A 1FMBA 4QJ9A 3C9XA 5P50A 5P5EA 3RSVA 5C9FA 5P46A 1LYAB 1K1TA 3T6IA 4YHQA 3VV6A 4EPJA 4JPCA 5OYWA 5P32A 4Y3JA 4LXKA 3UQPA 1C70A 5P1NA 4I0ZA 4Y3TA 3TKGA 4Y5GA 2WEBA 2V13A 1IVPA 5P5AA 3O9IA 3VLBA 4Y3EA 2A4FA 4H1EA 2QHCA 5P08A 3U71A 2RKFA 5P65A 1KJGA 5P2AA 5P6AA 2NXDA 2WF0A 2F3FA 2JYSA 3A2OA 5P54A 2J9KA 1IBQA 1FG8C 4CPRA 4EYRA 2VJ6A 2JXRA 5I3YA 4R92A 4A4QA 1ODYA 3KA2A 5P3UA 3QRVA 5P22A 1MPPA 5P7CA 5P1LA 2Q54A 3I7EA 5ENMA 1BIMA 1LF3A 4RGHA 2AVSA 1HSIA 3PJ6A 4CP7A 3K4VC 3UDPA 2BB9A 3VFAA 7UPJA 1TCWA 1ER8E 5P87A 3EL9A 4A6BA 5P5SA 2QAKA 4B1EA 4Y5LA 5P8OA 2AOCA 2PSVA 1J71A 1QS8A 2QMGA 5P0DA 2P83A 4I12A 2ZHRA 3OQ7A 3T11A 2ZHTA 4OBDA 4DJRA 3RVIA 3SM1A 3CYXA 1HTGA 1OEWA 5P2IA 1BXOA 1SGUA 1RL8A 4Y51A 4YBIA 1A94A 3L59A 1VIJA 4B70A 2OHMA 4UPJA 4GJDA 5P41A 3PHVA 4EJ8A 3UDMA 3DV5A 1FKNA 2V00A 3LINA 4NJVA 5SZ9A 4YE3A 4KUPA 4Y4DA 4FM7A 5P29A 4Y5CA 3LIVA 5P2RA 4AZYA 3Q5HA 1MT8A 5P04A 3PVKA 5P0ZA 5OZ3A 4CPSA 5P4ZA 5HVPA 5P6QA 3O9GA 3BXRA 1IZIA 4EP3A 1EC0A 5P2JA 4S1GA 3L5BA 4FAFA 1G2KA 5P7FA 3WZ6A 2ZYEA 2FXDA 5P1FA 4HLAA 2PQZA 1RQ9A 1BVGA 1B6KA 1TW7A 1HPXA 2AVQA 4ZSRA 5P74A 5P4OA 1SDTA 5E5KA 2OHLA 2WECA 3VF7A 4TRZA 3I2LA 3O9HA 3Q70A 2ZJNA 5P2LA 5P8BA 5P0HA 3EC0A 5OZZA 3LIZA 1ZSFA 2R3WA 2ZJKA 2AOFA 4Y36A 4Y47A 4JP9A 4XXSA 3FNUA 5P31A 3PI0A 3PI5A 4YA8A 5OZJA 4B77A 2Z4OA 5T4SA 5I3WA 3UDHA 2VKMA 5P4UA 5APRE 1PPME 4AUCA 1B6LA 4RVJA 4DQGA 2QI6A 2I4WA 1ZJ7A 5P1YA 5P0VA 1YM2A 1SGZA 4FSLA 2QI5A 1HRNA 3AUPA 4D88A 4Y3RA 5HDVA 4TRWA 4GMIA 2XFJA 4PZXA 5OZFA 5OYRA 3OXXA 1APWE 4XX3A 5BWYA 2Q63A 2PH6A 5P4PA 5P6EA 3S2OA 2OHTA 3NUOA 2O4KA 5P5HA 2G1SA 4Z22A 5P82A 2ZJJA 3ZOVA 1XE6A 4YD7A 5P1SA 1W5XA 5P6JA 5P5RA 5P2EA 1D4YA 5P1BA 1PSOE 5OZTA 5P00A 5P09A 5OZOA 1MTBA 4I1CA 2FGVA 1HVSA 1YTJA 3QBHA 5P7UA 2ZDZA 1EPLE 4F75A 3S43A 2PK5A 5P88A 5OZ9A 5KQZA 4U7VA 2Q3KA 1YG9A 3ZL7A 4NKKA 3ZKIA 1EC3A 5P6WA 4DJOA 4CPTA 5P0CA 3FKTA 1FIVA 3NXNA 2V12C 2F8GA 4ZSMA 1D4SA 5P8GA 5P78A 4PEPA 4I11A 3HLOA 5P16A 5I70A 2CEJA 3D91A 1ENTE 4N00A 4QLHA 3EKWA 9HVPA 1FB7A 3LPIA 1DW6C 3OXCA 4ZLSA 5P1AA 5P58A 5HE4A 5P5ZA 5EZXA 1HEGE 2IKOA 1PSAA 3ZKXA 4DI2A 4ZSPA 4J55A 4K8SA 3PGIA 1Z8CA 5P8NA 5HDUA 5OZSA 4MC2A 8HVPA 5P2WA 3TOFA 5F00A 2QMDA 3HAUA 3OU3A 5P4TA 2AVMA 3INHA 1APUE 3OHFA 2JJJA 3GGUA 5PEPA 2VJ9A 1WKRA 4YD3A 5KOQA 5P2TA 3TPPA 3D1YA 2HC0A 1FQ8A 2B60A 3BXSA 4Y4GA 3EL5A 5ER2E 5JODA 2RMPA 1XN3A 3IA9A 5AHAA 5P6UA 4Y3XA 5DGUA 4H3JA 5OYQA 1MUIA 3CICA 5OZQA 3OUDA 4DJQA 2ASIA 3SKGA 2QMPA 4Z4XA 4DJVA 2IL2A 2NNKA 1EPPE 5P5OA 2WL0A 5OZNA 5P8TA 5P1VA 5P0NA 3HW1A 3NR6A 4RCEA 2AVOA 4FCOA 3HBOA 5P7EA 2QZXA 3KFPA 5P23A 1NPWA 2PSUA 3L58A 4OBJA 5P84A 3NU4A 1C6ZA 1OHRA 3SA9A 3KYRA 2QZKA 2FDPA 5AH6A 1LF4A 4Y5NA 2AZ8A 3OXVA 1QRPE 1D4JA 5HCOA 5P1TA 5P2VA 4QJ7A 5P42A 1HPSA 5P1MA 1XDHA 3ZMGA 3OAGA 4LXAA 4Y44A 3KMXA 3GGAA 5P71A 1QDMA 1E81E 3VF5A 4COEA 2APRA 3ZPUA 3T3CA 1F7AA 1KZKA 1ZAPA 1EBKC 5P3QA 5P2QA 3HVGA 4ZE6A 5P2NA 3APPA 1KJHA 2AOIA 1GNMA 3FNSA 3KDBA 5DQ2A 1DMPA 3UFNA 1DPJA 1ZSRA 5P43A 3KDDA 1D4IA 2G24A 5P13A 4JECA 4XKXA 5P8HA 1G35A 4J17A 2RKGA 2WF3A 4JOOA 5P6MA 4B78A 4TRYA 3FSMA 3UTLA 5KQYA 2O40A 3B80A 2OHUA 3G70A 4J1FA 5P85A 2BPZA 5P7NA 2AOEA 5P2GA 5DGWA 3ZPTA 4HE9A 4H3GA 4Y50A 4Y4AA 2ER9E 2FS4A 4EXGA 2B42A 3K4VA 5P3VA 5P3CA 4ACXA 4ER2E 4Y3NA 3UF3A 4J0PA 2PWRA 3LPKA 5P7MA 3ZKNA 5P7HA 3QBFA 3MXDA 2ZHUA 4YCTA 1GVWA 3BUHA 3OQAA 4Y4XA 2JE4A 4AA9A 2QNPA 1IDBA 1HVJA 5DR4A 3LZYA 1YTGA 2F81A 5CLMA 2QD8A 4YDFA 4FM6A 3EL0A 3QROA 1XN2A 5P5XA 4YD5A 5P6XA 2PMAA 1WBMA 1XS7D 1LYAA 5P62A 1B6MA 1NPAA 3KT2A 1CMSA 3O99A 3N3IA 3BVBA 1KJFA 2WHHA 3OU4B 5P5IA 1HBVA 1D4KA 4Y57A 1ZTZA 2G1OA 4LXMA 1T3RA 3IVIA 5P3HA 4J0VA 3O9DA 1B6JA 2BPVA 3OWNA 4GJ5A 3UDKA 4I8ZA 4Y53A 1FF0C 2FLEA 4DJYA 5P7DA 4Y3SA 1HXBA 5OZPA 4K4RA 3QP0A 2FGUA 2CEMA 2PYNA 1NH0A 4Y4ZA 5P5JA 3UQXA 2NMYA 4RVIA 5P67A 5P1IA 1PPKE 2FXEA 1ZLFA 3LZUA 4X7IA 5P4LA 5P3LA 4Y3DA 2G69A 4GB2A 3BGBA 1PFZA 5P8SA 3VEUA 4DJPA 1A30A 3VYEA 5P40A 5OZBA 5P8VA 5P6TA 5UPJA 4BEKA 5P01A 3VLAA 5P03A 5P5KA 1M43A 2PWCA 3EMYA 5ISJA 2IGYA 3CKTA 3O9LB 5P19A 2Z54A 1D4LA 3H5BA 5AHBA 1XL5A 2BJUA 5OZMA 5P3BA 4PZWA 2QI4A 3DV1A 5P0GA 4OBGA 3UDNA 3K1WA 4GJ6A 2V11C 5OZAA 5DR3A 1FEJC 1AIDA 3MSKA 2A1EA 5I3VA 5P77A 4Y3QA 5KQFA 3DCRA 5P56A 4Y3YA 1HWRA 1ZBGA 2H6SA 2QHZA 3OOZA 4DFGA 5COOA 4DJUA 4YCYA 3T7XA 3SABA 1APTE 4GIDA 1FMXA 1M4HA 1BWBA 2QZWA 4Y54A 5OYZA 5DPZA 3QRMA 5P4XA 1BWAA 4RRNA 2R38A 4RLDA 2I4QA 1RNEA 5P14A 4D83A 5P7SA 1ZPKA 2OHRA 5HU0A 4U7QA 3R1GB 5OYUA 1XE5A 5P1PA 4EJDA 2QZLA 3INEA 5DR1A 2HS2A 4YD4A 5P47A 4J5JA 1MSNA 3BHEA 1N49A 4GJCA 3IXJA 2R5QA 5OYXA 1OD1A 4I0HA 4ZPGA 1FQ5A 3I6OA 5P6OA 3S45A 4YD6A 5P48A 5P7LA 4QGIA 2HS1A 5P3MA 3EKXA 5P3KA 3RTNA 3VV8A 3LIXA 2I4UA 1SBGA 3QVCA 1KJ4A 3NDXA 1NPVA 4OBZB 1HVIA 3SM2A 3SA7A 5DQCA 5P1OA 3RTHA 5OZVA 5P5TA 4OC6B 1LF2A 3JVYA 2HPFA 5P5QA 2FDDA 5P53A 1DIFA 5P4WA 7HVPA 5TOLA 1VIKA 5P4HA 2QI3A 3WB5A 3TOHA 4ACUA 4B00A 5KR0A 2OHSA 4DH6A 2VS2A 2XYFA 5P7AA 1K6VA 4L7GA 4NPUA 3RU1A 5HCTA 4AA8A 2WEAA 1W50A 2QI1A 4FGXA 3OGPA 5P3PA 5P69A 3OUCA 3JVWA 2R5PA 2IKUA 4CPUA 1ZP8A 1W5YA 3SA3A 5P7KA 1FLHA 3S54A 1W5WA 5E5JA 1K2BA 4J1HA 3S56A 1F34A 2I4VA 2QD6A 4Y4BA 3S53A 4CMSA 4TVGA 5P64A 5P79A 5P4DA 5KR1A 5P1CA 2VJ7A 4I0GA 1YT9A 1QBSA 5P39A 5DQ4A 3QRSA 2AOGA 5P7RA 1LYBB 3MXEA 5P2YA 5P2SA 1ODXA 1B6PA 4Y4EA 3FNTA 2AZCA 3O9FA 1CPIA 5CONA 3L5CA 1IZHA 4Z2ZA 4DJXA 3UQRA 2ZJLA 2FNSA 3TLHA 2BPXA 5DR0A 2PK6A 4YOAA 2QMFA 5P15A 3EKQA 2VIYA 3OK9A 5P0KA 5OZKA 1T6EX 5HU1A 3ZKQA 3NDWA 1FQ7A 2P3DA 4IVTA 4I0EA 4D85A 4Y41A 1T6GA 1PSNA 1MTRA 5P63A 1FG6C 5KAOA 3PBZA 2UPJA 3HZCA 4IVSA 2PSGA 4Q1XA 5P83A 5P36A 3ST5A 1HTFA 5P2HA 2QK5A 1GVTA 3OU1B 4Y43A 1MRXA 3S8IA 1D4HA 5OZRA 4AMTA 1B11A 3MSJA 1W6IA 5P30A 5P8RA 1ZPAA 3TPRA 1TZSA 1EEDP 2G94A 1EPNE 3I8WA 4J1IA 4I0DA 1Q9PA 5P6VA 3S7LA 4Q1YA 5P1GA 5P4VA 2FNTA 3ZLQA 2XFIA 4CPQA 1ME6A 4L1AB 4R93A 3D1ZA 4DQBA 5P3GA 5P8FA 4Y3HA 5C9DA 1HPOA 1TCXA 4NJTA 5P27A 2WKZA 4F76A 2H6TA 1W5VA 5P6GA 3EL1A 4EP2A 4I10A 3VFBA 5P7PA 1FQ4A 2UY0A 1HTRB 5P7OA 3DCKA 5P12A 1C6XA 2PYMA 3ER5E 4RZ1A 3IXKA 5OZXA 3NSHA 3NU5A 5P0YA 4FAEA 5P5GA 2XFKA 5P66A 3OGQA 3SAAA 5SXNA 3TKWA 4GJBA 1BDQA 1LV1A 3DK1A 4OBHA 5AH8A 4Y58A 4DVFA 4EQ0A 2QNNA 4B1CA 2Q15A 5P7VA 1HSGA 3TH9A 5P68A 2QHYA 4Y35A 3TPLA 5OYSA 3WB4A 3IN3A 4RVXA 3INDA 5F01A 5SY3A 3ER3E 4Y48A 3KF0A 4FRSA 5P0MA 1JLDA 3Q6YA 5P2KA 1K1UA 1Z1HA 4B1DA 1HIVA 2P3BA 4K4QA 4EXHA 3TPJA 4PHVA 3K5GA 5DR8A 5P1JA 4J54A 4Y5BA 3HAWA 3NU3A 2VIJA 3EKTA 2R3TA 2R43A 4LP9A 4CKUA 3OQFA 2HB4A 5AHCA 2ZE1A 1AXAA 2FMBA 1LZQA 4QJ8A 1EC2A 2AOJA 1YM4A 5KR2A 4R5NA 3KN0A 5P4KA 5OZHA 3OADB 4B72A 3Q4BA 4YDGA 4MC1A 5P5WA 3B7VA 3RTMA 4FL8A 3LZSA 2O4LA 3PSGA 4YCKA 5P0PA 5P8DA 5P3WA 5OZYA 5P6PA 5OZ0A 1AZ5A 3SA8A 5OZCA 2I0DA 1FFFC 3I25A 5P34A 5OZ6A 5OZIA 3PLDA 4DPFA 2P3AA 2NXMA 2ZJIA 2HB3A 1LYWA 3BRAA 2QP8A 3PWMA 2ER0E 3EXOA 3PM4A 5P07A 3O9EA 1HVLA 1HPVA 2P8HA 1HXWA 4OBKA 1GVUA 5P3RA 2G1YA 1IIQA 3OU4A 5P3ZA 4Y3FA 5OZGA 5P4CA 5P3DA 2QU3A 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 1TSU A;  1BBS A;  5P4E A;  3K5D A;  1B5F A;  3QPJ A;  3INF A;  1AJX A;  3WZ8 A;  1HIH A;  4OD9 B;  5OZ5 A;  3SA6 A;  3BGC A;  5P38 A;  1SIP A;  3TNE A;  6UPJ A;  5P6Y A;  5P52 A;  3LIY A;  2G1R A;  3URI A;  3SAC A;  4ZSQ A;  1PRO A;  4HDP A;  1SME A;  5P2B A;  2IQG A;  4L6B A;  4DJW A;  5P55 A;  5P0Q A;  5JFU A;  3LPJ A;  2OHP A;  3L5D A;  3L5F A;  3BUG A;  3AID A;  3PWW A;  1GVX A;  3ECG A;  1G0V A;  3TOG A;  2B7Z A;  5P6H A;  1EBZ A;  1EPQ E;  5P0S A;  2AOD A;  4I0I A;  4YOB A;  5P1Q A;  2OF0 A;  3PSY A;  4R8Y A;  1HOS A;  5P8P A;  4HA5 A;  1FMB A;  4QJ9 A;  3C9X A;  5P50 A;  5P5E A;  3RSV A;  5C9F A;  5P46 A;  1LYA B;  1K1T A;  3T6I A;  4YHQ A;  3VV6 A;  4EPJ A;  4JPC A;  5OYW A;  5P32 A;  4Y3J A;  4LXK A;  3UQP A;  1C70 A;  5P1N A;  4I0Z A;  4Y3T A;  3TKG A;  4Y5G A;  2WEB A;  2V13 A;  1IVP A;  5P5A A;  3O9I A;  3VLB A;  4Y3E A;  2A4F A;  4H1E A;  2QHC A;  5P08 A;  3U71 A;  2RKF A;  5P65 A;  1KJG A;  5P2A A;  5P6A A;  2NXD A;  2WF0 A;  2F3F A;  2JYS A;  3A2O A;  5P54 A;  2J9K A;  1IBQ A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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