3T7QA

Endothiapepsin in complex with an inhibitor based on the gewald reaction
Total Genus 86
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
86
sequence length
330
structure length
330
Chain Sequence
STGSATTTPIDSLDDAYITPVQIGTPAQTLNLDFDTGSSDLWVFSSETTASEVDGQTIYTPSKSTTAKLLSGATWSISYGDGSSSSGDVYTDTVSVGGLTVTGQAVESAKKVSSSFTEDSTIDGLLGLAFSTLNTVSPTQQKTFFDNAKASLDSPVFTADLGYHAPGTYNFGFIDTTAYTGSITYTAVSTKQGFWEWTSTGYAVGSGTFKSTSIDGIADTGTTLLYLPATVVSAYWAQVSGAKSSSSVGGYVFPCSATLPSFTFGVGSARIVIPGDYIDFGPISTGSSSCFGGIQSSAGIGINIFGDVALKAAFVVFNGATTPTLGFASK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Endothiapepsin in complex with an inhibitor based on the Gewald reaction
rcsb
molecule tags Hydrolase/hydrolase inhibitor
molecule keywords Endothiapepsin
total genus 86
structure length 330
sequence length 330
ec nomenclature ec 3.4.23.22: Endothiapepsin.
pdb deposition date 2011-07-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00026 Asp Eukaryotic aspartyl protease
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.40.70.10 Mainly Beta Beta Barrel Cathepsin D, subunit A; domain 1 Acid Proteases 3t7qA02
2.40.70.10 Mainly Beta Beta Barrel Cathepsin D, subunit A; domain 1 Acid Proteases 3t7qA01
1BDLA 3U7SA 2AIDA 2JXRA 2P3DA 1B5FA 1BIMA 1PSOE 5P8LA 1W5YA 5P3CA 4FRSA 3UDNA 1MTBA 5OZYA 1MT7A 1HVRA 3O9IA 1ODWA 2FIVA 1W6IA 2QNNA 5P2VA 4DJQA 4LXKA 1HSGA 2AOHA 3QIHA 4OC6A 2G69A 5P8MA 3SM1A 1HBVA 3DCRA 2VJ6A 3F9QA 4AZYA 4K8SA 2AODA 2BKSA 5P44A 1XL5A 5P5GA 5HCTA 1CPIA 1DMPA 5P2WA 8HVPA 1SDUA 4Y3QA 2F3FA 5P1QA 3I6OA 3L5EA 5P1EA 5P0JA 3LINA 1FLHA 4Y5BA 3VV7A 3UQRA 1FMXA 1ZPKA 3PSUA 2HPEA 1YTGA 3KT2A 1HVKA 1YM4A 1KJHA 5P4HA 5P1KA 2G1NA 1BWAA 2XFJA 4Y3JA 1MT9A 2I0AA 2SAMA 5IVTA 3G6ZA 3L3AA 4A6CA 5P2QA 3PGIA 3NXNA 4J5JA 3HLOA 3T7QA 2QI4A 4WY6A 3S85A 4ZPGA 5P6UA 2HAHA 5C9DA 3VUCA 4LXMA 3T11A 5P04A 2G94A 4J1EA 2G22A 2IENA 1FMUA 1ZJ7A 3OQ7A 3OWNA 4R95A 5P17A 5P70A 3ZKMA 3KFSA 2Z4OA 4Y35A 4IVTA 9HVPA 2PSGA 4OBGA 1SP5A 4DH6A 2MIPA 5KOSA 1PSNA 5P07A 4GJBA 4CKUA 3SA3A 5P6QA 3VFAA 4Y3SA 1ER8E 1FQ4A 2AZ8A 2P3AA 5P4MA 3OK9A 4L7JA 2XYEA 4Y4UA 3LPIA 5P6GA 4Y53A 1BAIA 5P5HA 3RSVA 4K4QA 2AOIA 2RKGA 4YD5A 4FM7A 4DJOA 1FQXA 2A1EA 3SACA 1RL8A 5P7BA 5P8BA 1JLDA 3Q3TA 5DPZA 4Y36A 5P7XA 5P1XA 2G20A 5BRYA 5P57A 1MUIA 2JJJA 5DR3A 4QJ6A 4JP9A 3QI1A 4Y5MA 5P62A 4RLDA 5TOLA 3OXVA 1HVJA 5E5JA 5P5CA 5OYSA 1K2CA 5OZJA 4EHCA 3D3TA 5P36A 1AZ5A 2A4FA 2NTRA 2BBBA 4LAPA 2APRA 2H6TA 1LZQA 5P26A 4I0JA 1HVIA 3H5BA 4Y4WA 4Q5MA 1ZBGA 4TRWA 3TH9A 1PSAA 4YHQA 4PYVA 3B7VA 3DK1A 4OBHA 1YTHA 3RU1A 4Y3YA 4CPTA 1D4KA 2G24A 5P32A 3HAUA 1BV9A 3O99A 5P0LA 4GJ8A 5P72A 5HDXA 5P6OA 1RQ9A 5KR2A 1ODYA 5OZ9A 5P5DA 2OHQA 1FIVA 2NNPA 5P1NA 4CPWA 3EMYA 4RCFA 3IAWA 5COOA 4YD4A 3LIZA 1YG9A 4FL8A 4Y43A 1T7KA 4Y3HA 1F7AA 2B42A 5P4XA 5P8HA 1OD1A 2ZGAA 1MEUA 5OZAA 1WBKA 5P7HA 3T7PA 2QCIA 3UDKA 3BC4A 3NU4A 3CIBA 3I2LA 2NXLA 1LYWB 1SIVA 4Y3XA 4X2LA 3SA4A 2FNTA 5DR8A 1TSQA 3DJKA 4D89A 4BEKA 5OZRA 3OGPA 2IKUA 4J0TA 2P83A 2WJOA 5P1WA 2FDDA 3EXOA 4GJ9A 5P4VA 5P09A 4H3IA 5P4WA 3HDKA 5I70A 5HD0A 5KR8A 3QP0A 5P3PA 3RTMA 4J1IA 3RTHA 5P05A 3LZUA 4FRJA 2I4WA 4F73A 2HIZA 1FQ8A 2G1OA 5P4PA 4Y44A 5P31A 3PEPA 3ZKSA 3IA9A 3IN3A 1HPXA 3R0YA 5SY3A 1NPWA 2QU2A 1ZP8A 3CYXA 4XKXA 3KT5A 5OZOA 5P08A 5P53A 4AA8A 1DW6C 3I7EA 4GB2A 2G1SA 5P25A 3OU4A 4KB9A 2Q15A 2WEBA 3PBZA 4D8CA 2NXDA 4RYCA 5AHBA 3ER3E 4Y5PA 5P0NA 5P4DA 2QI7A 1HVSA 5P7PA 2I4DA 5P1AA 3K5FA 3SA5A 4QJ9A 3BXRA 4Y3PA 2QD8A 4HA5A 5AH8A 4LBTA 1TSUA 1VIKA 5P7GA 1IDAA 3OU1A 3O9LA 3OXWA 5KQFA 5P3EA 4LC7A 4OBZA 5P6BA 5P7QA 5ENKA 5P0VA 2O4SA 4B78A 1D4SA 2WF0A 5P3LA 2R5PA 5I3YA 2PWRA 5P2RA 5IVSA 3EKYA 2V16C 2I4QA 2HB4A 5P7AA 4TRYA 5P0ZA 3DUYA 5P4KA 3T3CA 2BKTA 1D4LA 2IKOA 1DPJA 2H6SA 4WTUA 3Q4BA 1B6PA 2P3BA 1ZTZA 5P19A 5P0CA 1OHRA 3C9XA 4MC6A 2Q54A 5P2DA 2V11C 5P82A 4JPEA 5KAOA 5DGUA 2AVSA 5P75A 1EBZA 4N00A 4Y45A 1OEWA 4RRNA 3OQFA 4FIVA 1IVPA 1HVLA 3OOZA 5T4SA 4GJDA 4ACXA 5P1LA 1IDBA 4FE6A 4Y48A 5P6TA 5P0SA 4Y9WA 4YD6A 3PJ6A 4Y38A 1SMEA 5P1OA 4GZFA 1EPQE 5P6EA 1FB7A 5P3HA 3PM4A 3AUPA 3CKRA 1YM2A 2IEOA 3MSJA 5P1GA 3EBZA 2QP8A 3DV1A 5DR4A 4Y3LA 5P1JA 1D4JA 6APRE 1W51A 2AVVA 5DR1A 1EPPE 4Y37A 3EL4A 3BUGA 5BWYA 1IVQA 3DV5A 1DIFA 1A94A 1DAZC 3CIDA 3KMXA 2FXEA 5P1IA 2B8LA 3K5DA 1AXAA 2OHLA 1QDMA 3BRAA 4GIDA 5P7DA 5P5QA 1CZIE 3H0BA 4Y5GA 4J0ZA 1HVCA 1U8GA 1J71A 3R4BA 5AH9A 4Y3ZA 6FIVA 3I8WA 4ZE6A 2CENA 3NDTA 4DI2A 3UQXA 3UDMA 4TVHA 4PEPA 1TQFA 3WZ6A 4EQJA 2PK6A 3O9GA 4DJYA 3GGAA 3O9BA 1EC1A 3KFNA 4EPJA 1FG8C 2QMFA 5P8QA 1SBGA 2R3TA 3RSXA 4Y5EA 3UQUA 4Z22A 5P0EA 4I0IA 3NU6A 5P27A 2J9KA 1UH8A 5P1CA 2F3EA 5P3NA 1EC2A 2PH6A 1N49A 1BV7A 2ASIA 1Z1RA 4RCEA 2UY0A 4TRZA 5P3DA 4YBIA 1IZHA 2JYSA 3T6IA 1EPNE 4CPQA 1SGZA 4K4RA 5C9FA 5P4BA 3O9FA 4LHHA 2VA7A 3ZPSA 5P2ZA 2ZJJA 5OYWA 4DQCA 5P0HA 1Z8CA 3PLDA 2OHUA 5P10A 5P2EA 4I0GA 2BPWA 4Z4XA 4D88A 3CKPA 3SKGA 1DP5A 3OOTA 1TCXA 5P4IA 3VLBA 5OZ8A 1HTFA 2I4VA 5P0RA 3TKWA 3UCBA 1B6MA 5P22A 4FCOA 3BVAA 1GVVA 2NMZA 4FSLA 3OTSA 1A9MA 3HW1A 5P00A 5OZ4A 2V00A 4DJUA 5P18A 4ZPFA 1PROA 1EPOE 5P74A 5OZ5A 3SPKA 5AH7A 5P30A 2R9BA 3OXCA 1HEFE 5OZBA 2VJ9A 5OZPA 1W5XA 2RSPA 5P8RA 3OQAA 3PSYA 1MIQA 5P4EA 1ZAPA 4I0HA 4A6BA 3KDBA 5P8DA 3UDHA 4QJ8A 5P47A 4YBFA 5OZGA 1FQ7A 4OBJA 4QGIA 4L1AA 3MXEA 2NMYA 5P55A 3VF7A 5IVQA 1KZKA 3ZPUA 5P7NA 1GVXA 2QNPA 4RZ1A 3UHLA 3QRSA 3NDXA 1GNNA 4NJVA 5P40A 2AVMA 2QNQA 3NWXA 1FF0C 1E5OE 3APPA 1HIVA 3EC0A 3QRVA 3NDWA 5P3AA 4U7QA 2ZJMA 4Y47A 4FRKA 3TKGA 5OZIA 4OBDA 5I3XA 3LPKA 1TZSA 5P12A 4B05A 5SZ9A 2VA6A 3CICA 5P16A 5P3OA 3SA6A 3KFRA 1XS7D 4BFDA 4ZPEA 2J9JA 4J54A 1MT8A 5P2CA 4DV9A 3NWQA 3NR6A 4MC1A 4I11A 5HU0A 5P2SA 5P69A 1LS5A 3MSLA 4YD3A 4ER1E 1E82E 5OZFA 1RNEA 3GW5A 3QS1A 5P8CA 3VF5A 1BVEA 4Y4AA 2PYNA 1LYWA 1FMBA 3O9AA 2AZBA 3SO9A 5P6ZA 4Y5AA 5KOQA 3NU9A 3OU3A 5IS4A 5P6CA 4FAFA 2VKMA 3NDUA 1FQ6A 3BUFA 5AGZA 5OYVA 3U71A 2ZHVA 4HZTA 2PSUA 2EWYA 4J17A 5P4LA 1AVFA 1LYBA 3FV3A 4Y4TA 4Y50A 5P73A 5P1MA 1XDHA 2WEDA 1EBKC 3ZKNA 4YOAA 2HC0A 5P3WA 4NJTA 5P5FA 1B6LA 3EL5A 4GJCA 2F81A 5P8JA 1C6YA 4B77A 5P61A 2ZYEA 2B60A 3Q70A 5P89A 5P0BA 1AJXA 4PZWA 3FNSA 4L1AB 3NYGA 2P4JA 4J0VA 5OZTA 2QI1A 5P5IA 4CPUA 1BILA 1EAGA 5OYXA 2QI5A 3EKXA 4DJPA 5P7SA 4Y5KA 2HS1A 3OUDA 1G35A 4ZIPA 1M43A 3EM6A 5OYRA 5P1SA 5AHCA 1W6HA 3TPPA 1A30A 5P6IA 1IZDA 5P88A 5P3UA 4ZSPA 1QRPE 3R0WA 1IIQA 4I8WA 2F8GA 1BDRA 4ACUA 5P38A 2PYMA 4L7HA 3D91A 2IL2A 2FXDA 5P11A 1SMRA 4HDFA 3DOXA 2J9JB 5SY2A 4I0FA 1LYAA 4F74A 5OZ7A 4JECA 5JFPA 5P01A 5SXNA 1SH9A 5HU1A 1RV7A 4KE1A 3KMYA 3G72A 4I1CA 1ZSRA 4LXAA 3S7MA 3ECGA 5P0XA 5P4UA 1TW7A 2IS0A 5P2LA 2B8VA 2O40A 4CMSA 3B80A 4Y3EA 2Q5KA 5P45A 5ISKA 3G70A 3R1GB 1E81E 1XL2A 4NPUA 4QLHA 5IE1A 2BPYA 3NSHA 1SIPA 3CMSA 5P7RA 4HDPA 3PWMA 5P6NA 3GI0A 1EBWA 4Y4JA 5P6VA 1LYBB 1QS8A 2VJ7A 1MTRA 4U8WA 1GVUA 3VSWA 5P84A 3QPJA 5P0IA 1XE5A 3UDPA 3SABA 1K6VA 3PHVA 3LZSA 5P1ZA 1IBQA 1T6GA 1B11A 1YX9A 1NPVA 2Z54A 5P0GA 5P8SA 3D1YA 2AOJA 2CEJA 1Z1HA 5P5XA 2NPHA 1ME6A 1LF3A 1WKRA 5IVRA 1QBUA 4EJ8A 2NR6A 2QMGA 2ZHRA 4DQBA 5OZZA 2HM1A 3OUDB 4Y3MA 3FNUA 2Q55A 4AA9A 3TTPA 1MVPA 5P78A 2G21A 1KJGA 5P28A 7HVPA 2VS2A 1GVTA 4DJRA 4MC2A 3BGCA 1K6CA 3IXKA 5P35A 1BXQA 5P2KA 4ZLSA 4FAEA 2B7FA 1FKNA 4Y3AA 4R92A 4RVJA 1PFZA 5P13A 5OZKA 1FQ5A 4YOBA 3L5BA 5ENMA 4NPTA 4BELA 3K4VC 1LYAB 2AZCA 4I12A 4Z2ZA 2O4KA 3L38A 5P3BA 3TOFA 3OY4A 4DJXA 1EC0A 1HTGA 4DQHA 1W5VA 1T6EX 5DQ1A 1QBRA 1PPKE 3PLLA 3PRSA 1MSNA 2P3CA 5P1YA 4CPXA 2I0DA 3ZKIA 4R91A 3VSXA 5KQYA 2Q11A 5P7FA 1SDVA 5P20A 4RRSA 5OZMA 5I3WA 5COPA 2IGYA 4R5NA 5P63A 4ER2E 3LZYA 1F34A 4CPRA 5P0OA 5DGWA 2FNSA 1HTRB 2WECA 4J0PA 4DJVA 4YDFA 4Y3RA 3OQKA 1BBSA 2AOCA 3S54A 5P1VA 2OAHA 4U7VA 1T7IA 1MERA 5P2HA 3PBDA 3RTNA 5P0KA 5P37A 2BPZA 4EJKA 1G0VA 4R8YA 5P3VA 3LITA 2PC0A 2ZHSA 3EM3A 4YDGA 3VV8A 5P5AA 4QJ7A 1HVHA 2QZKA 5P3XA 3ZKGA 3UDQA 1M4HA 3UFNA 5P2AA 1YTIA 2IDWA 5P5MA 3Q6YA 5P7YA 4EQ0A 5EZZA 4A4QA 1E80E 3UQWA 2AZ9A 5ER2E 4Y4GA 4HDBA 3SM2A 1NPAA 2NNKA 4XX3A 4HLAA 3PSGA 2PQZA 2P8HA 3QBHA 5P7OA 1TCWA 5P1DA 3TOGA 4Y3FA 3JVWA 3LHGA 5OZEA 3HVPA 5P24A 4YCKA 5P56A 1HSHA 3URJA 5P2TA 3LPJA 2QMDA 3IVIA 5P1HA 5P3TA 5P0AA 3NU3A 5HE4A 3EL9A 1SGUA 1EC3A 2QHZA 4GYEA 4Y3GA 4PZXA 1HSIA 3UTLA 4FS4A 3N4LA 5OYTA 4EP3A 4Y56A 5P8PA 3S45A 3S43A 3MSKA 2WEZA 2HB2A 3MXDA 1K6PA 1M0BA 5DQ4A 2IQGA 3QVCA 5P6LA 1B6JA 5HE7A 1IZEA 5P7TA 5P68A 2G27A 2IGXA 3D1XA 3JW2A 3S56A 3BXSA 3GGVA 5P33A 3CKTA 4AMTA 2WF2A 1FGCC 2UXZA 2V0ZC 4RYGA 4NKKA 5OYYA 2VIYA 5ER1E 1Q9PA 3TPRA 5P5VA 3LZVA 1APUE 3EKPA 5P3ZA 1FFIC 3INFA 4Y41A 4EYRA 4Q1YA 5P06A 5JFUA 5OYQA 5OZ2A 4FLGA 3UF3A 5P2NA 4PPHA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 1BDL A;  3U7S A;  2AID A;  2JXR A;  2P3D A;  1B5F A;  1BIM A;  1PSO E;  5P8L A;  1W5Y A;  5P3C A;  4FRS A;  3UDN A;  1MTB A;  5OZY A;  1MT7 A;  1HVR A;  3O9I A;  1ODW A;  2FIV A;  1W6I A;  2QNN A;  5P2V A;  4DJQ A;  4LXK A;  1HSG A;  2AOH A;  3QIH A;  4OC6 A;  2G69 A;  5P8M A;  3SM1 A;  1HBV A;  3DCR A;  2VJ6 A;  3F9Q A;  4AZY A;  4K8S A;  2AOD A;  2BKS A;  5P44 A;  1XL5 A;  5P5G A;  5HCT A;  1CPI A;  1DMP A;  5P2W A;  8HVP A;  1SDU A;  4Y3Q A;  2F3F A;  5P1Q A;  3I6O A;  3L5E A;  5P1E A;  5P0J A;  3LIN A;  1FLH A;  4Y5B A;  3VV7 A;  3UQR A;  1FMX A;  1ZPK A;  3PSU A;  2HPE A;  1YTG A;  3KT2 A;  1HVK A;  1YM4 A;  1KJH A;  5P4H A;  5P1K A;  2G1N A;  1BWA A;  2XFJ A;  4Y3J A;  1MT9 A;  2I0A A;  2SAM A;  5IVT A;  3G6Z A;  3L3A A;  4A6C A;  5P2Q A;  3PGI A;  3NXN A;  4J5J A;  3HLO A;  3T7Q A;  2QI4 A;  4WY6 A;  3S85 A;  4ZPG A;  5P6U A;  2HAH A;  5C9D A;  3VUC A;  4LXM A;  3T11 A;  5P04 A;  2G94 A;  4J1E A;  2G22 A;  2IEN A;  1FMU A;  1ZJ7 A;  3OQ7 A;  3OWN A;  4R95 A;  5P17 A;  5P70 A;  3ZKM A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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