3VSWA

Human renin in complex with compound 8
Total Genus 88
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
88
sequence length
340
structure length
340
Chain Sequence
LTLGNTTSSVILTNYMDTQYYGEIGIGTPPQTFKVVFDTGSSNVWVPSSKCSRLYTACVYHKLFDASDSSSYKHNGTELTLRYSTGTVSGFLSQDIITVGGITVTQMFGEVTEMPALPFMLAEFDGVVGMGFIEQAIGRVTPIFDNIISQGVLKEDVFSFYYNRDSENSQSLGGQIVLGGSDPQHYEGNFHYINLIKTGVWQIQMKGVSVGSSTLLCEDGCLALVDTGASYISGSTSSIEKLMEALGAKKRLFDYVVKCNEGPTLPDISFHLGGKEYTLTSADYVFQESYSSKKLCTLAIHAMDIPPPTGPTWALGATFIRKFYTEFDRRNNRIGFALAR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Design and optimization of novel (2S,4S,5S)-5-amino-6-(2,2-dimethyl-5-oxo-4-phenylpiperazin-1-yl)-4-hydroxy-2-isopropylhexanamides as renin inhibitors
pubmed doi rcsb
molecule tags Hydrolase/hydrolase inhibitor
source organism Homo sapiens
molecule keywords Renin
total genus 88
structure length 340
sequence length 340
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.4.23.15: Renin.
pdb deposition date 2012-05-11

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00026 Asp Eukaryotic aspartyl protease
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.40.70.10 Mainly Beta Beta Barrel Cathepsin D, subunit A; domain 1 Acid Proteases 3vswA02
2.40.70.10 Mainly Beta Beta Barrel Cathepsin D, subunit A; domain 1 Acid Proteases 3vswA01
5P46A 5OZ2A 3NU4A 3KMXA 2BQVA 3EKTA 4KE1A 1YG9A 2Q64A 3NDUA 2HM1A 1D4JA 2ASIA 5P76A 1MT9A 2Q5KA 4FAFA 1HTEA 5P7VA 5P4BA 4L6BA 5OYXA 4PHVA 3IXOA 4Y4DA 3RTMA 5P0TA 2A1EA 1FFIC 5SY2A 5P0DA 5P3VA 2P3BA 5P32A 1EPLE 1EC3A 4ZE6A 5P8KA 4Y3AA 1HVLA 2WEBA 4B1DA 5P69A 2Q15A 4ZPFA 3ZLQA 5P7IA 1IDBA 3EKYA 3OU4B 3NDXA 5P0GA 2AODA 1Q9PA 3VG1A 3VYDA 3D1XA 4EPJA 4QJ2A 5AHBA 2OAHA 4Y54A 2G27A 1T6EX 4MC9A 3SAAA 2OHNA 1MT8A 4OBDA 3SPKA 2V11C 5DQ2A 5P63A 3RU1A 4Y3TA 3DCKA 2AQUA 1NPWA 2AZCA 4HDPA 3IXJA 5P3BA 1YTJA 4Y9WA 5HD0A 4H3IA 1EPQE 1ZSFA 4Y41A 3OK9A 2ZHUA 4OBFA 3BRAA 4Y39A 4YD5A 1EEDP 1OEXA 3MSLA 5P4DA 4X7IA 5P50A 5P1TA 3PI5A 4X2LA 1T7KA 5P5VA 1HRNA 1PSNA 5P8PA 2JE4A 4APEA 5P71A 2PMAA 2AVQA 4L1AA 4NJSA 4DJQA 5BRYA 2WHHA 4R91A 5P81A 2G1NA 3O9AA 5P1GA 4GYEA 5OZSA 3I8WA 4TVHA 3OGQA 5OZYA 4QJ9A 2O4LA 4YA8A 5P8VA 3APRE 3O9HA 3HD8A 4EQ0A 4CPTA 5P3EA 4GJ5A 1BVGA 5OZ7A 1GVUA 5P3DA 4ZIPA 3OAGB 1LEEA 2QK5A 4EHCA 5P6ZA 1FIVA 4J0TA 1B5FB 3S43B 5P1DA 5F00A 5B18A 5P4WA 3KFPA 5P8QA 5DQ1A 4DVFA 5P34A 2QMFA 1RV7A 5P8BA 2FIVA 3EMYA 5P6JA 4YBIA 1W51A 5P1AA 2VS2A 3BXRA 3S85A 2ZE1A 5P4EA 1A94A 3NWXA 4AA8A 5OZ6A 5BS4A 5ENKA 1FMBA 3LIVA 2AOCA 5P5MA 2O4KA 4R5NA 2CEMA 3UDYA 4YD3A 3CICA 3ZKIA 1K1UA 5P6WA 5C9FA 2I4UA 2Q55A 4F76A 1K6VA 2I1AA 1HTGA 3NU5A 2B60A 4Y3PA 3TOFA 2ZHSA 4J1HA 4DJWA 1YTIA 3AUPA 1G0VA 2P3AA 3OXWA 2ZJIA 3F9QA 3VV8A 5P4TA 2QHYA 3N4LA 3DK1A 5OZWA 5OZNA 3OTYA 1AZ5A 2G21A 4YOBA 2G24A 2NMYA 2CEJA 5SXNA 3ZPTA 3ST5A 5JODA 5P0MA 2V10C 1HSHA 3QBHA 1YM2A 1BILA 3G6ZA 4YE3A 3O99A 3GGUA 2RKFA 4ZSMA 4J0ZA 1ER8E 4D8CA 2NNKA 2FDDA 4ACXA 2R38A 3EM6A 5P1IA 3BGBA 3D20A 3PLDA 3VLAA 4YDFA 4YCKA 5IVTA 1UPJA 3O9LA 4DV9A 5IVRA 1HVRA 1MSNA 3WB5A 5P17A 4U8WA 1IVPA 2OHTA 5TOLA 2QI3A 1A8KA 3CYXA 4XX4A 5P6XA 5P1YA 2ZJLA 4DH6A 5P36A 1AJXA 5P43A 3PSYA 6UPJA 1BBSA 4DJOA 4HLAA 5P5YA 5P3KA 2V13A 3OOTA 4Y4XA 4B05A 3ZKNA 1MIQA 1BDQA 3NUJA 1BDRA 2IL2A 2I4VA 3VF3A 3FNUA 4QLHA 2QD6A 1HVJA 2NTRA 1APUE 5P85A 1RL8A 1E82E 1LF4A 5P4PA 3UPJA 1C6ZA 1IZDA 5P3LA 2ANLA 5P4OA 5F01A 1HBVA 4Y57A 4U7VA 5P0QA 5P22A 3K5CA 3CMSA 2AOEA 5P4MA 1FG8C 4YOAA 1TSUA 5P5DA 1LF3A 3OU1A 2HPFA 5P4AA 1KZKA 1QBUA 5P6DA 5P00A 1K6CA 3PBDA 1EBZA 2ZDZA 5P7BA 2BPWA 1GVWA 3LIYA 3GI6A 1BXOA 5P41A 1ODWA 1VIKA 1MRWA 2ZJNA 4YDGA 5OZTA 2QI7A 3R2FA 1IIQA 5P61A 5P18A 2VKMA 3PHVA 4FGXA 1J71A 2R43A 5P7MA 1FQ8A 5SY3A 1EBYA 3GI5A 1DMPA 4GB2A 2XFJA 2I4WA 5P0EA 4QGIA 3SABA 3FKTA 5P65A 3O9CA 5JFUA 2G1OA 4MC1A 2QNPA 3CKPA 1BV7A 3OGPA 3EL9A 5AGZA 5P5NA 3B7VA 2BKTA 3L58A 5P2GA 4J54A 4TRYA 4S1GA 3DUYA 4IVSA 5OZDA 4PEPA 5I3XA 3UDNA 4I11A 2VIZA 1HVIA 1XL5A 3QI1A 5OZZA 4DJXA 3ECGA 1ZTZA 2QNQA 2BPVA 3RSVA 3SM2A 5P5CA 5P14A 5AH7A 2PSUA 5P5KA 3M9FA 3OUDA 3UDKA 1A8GA 3Q5HA 5OYTA 5OZ3A 2QMPA 5P6VA 8HVPA 1D4YA 5OZ8A 1VIJA 5P1BA 2G1YA 3QIHA 5DR0A 1AXAA 2XFKA 1IDAA 4RVIA 5P06A 4FRSA 5OZHA 5P3AA 2R9BA 3NUOA 4YCTA 2OHPA 5OZLA 5I3WA 3O9FA 4K4PA 2QD7A 3UCBA 3KM4A 3S53A 3IAWA 5P8LA 2OHQA 4Y3SA 5P15A 3R4BA 4JOOA 4I8ZA 5FIVA 5P7AA 3DJKA 4CPRA 5DQ5A 3PSUA 1G35A 4Y5CA 1FB7A 5P7LA 2R5PA 3SO9A 3KDCA 4OC6B 1M4HA 2WF2A 5P47A 5P2XA 4COEA 3OHHA 5P5BA 5P8JA 1QS8A 5OZ5A 1G6LA 2IRZA 4HDFA 1UH8A 3QVCA 3ZOVA 5P2SA 4J0VA 2WF4A 2XYEA 3BUHA 3EM4A 3OWNA 2BKSA 2HIZA 4ER1E 1HIIA 3S7MA 3PBZA 1HTRB 4I0FA 1A30A 5P6YA 5P2LA 5P3SA 4DQBA 1Z8CA 3UDQA 4Y53A 1HSGA 5P88A 3TKGA 1ZLFA 1IBQA 3FX5A 3FIVA 5OYSA 5DR8A 4B0QA 1CPIA 1K6TA 1Z1HA 3OU4A 5APRE 5P1XA 3S54A 4DJYA 3KDBA 3QRSA 1FQ4A 2IGYA 2I0DA 3LIXA 3HZCA 5P5WA 4K4RA 3O9IA 4QJAA 3K4VC 4FRIA 5P5IA 1HEGE 4FE6A 1JLDA 3S2OA 4ZPEA 1E80E 5P12A 2PK6A 5AH9A 4I10A 5P7EA 4A6BA 1SMRA 4PPHA 5P8CA 3OOZA 1KJ4A 1FQ7A 4GJ7A 2ZHVA 5P82A 3SA5A 3QRVA 3LHGA 4GJBA 5P83A 4Y36A 4DQGA 3OQKA 4ER4E 5P3FA 2I4XA 4Y3EA 5OZBA 3OHFA 3EL0A 1W6HA 4TRWA 3EBZA 3PI0A 4K4QA 1BXQA 5P0ZA 3U7SA 3KT5A 3OY4A 5E5JA 4I0EA 5EZXA 5ER2E 5ISJA 2BPXA 5DQCA 3L5CA 1EAGA 5OZEA 5P2ZA 4UPJA 1APTE 4Y4JA 5P4IA 5P6SA 3VFBA 5OZ1A 3NDWA 5P7PA 4DQHA 4U7QA 1ZBGA 2WECA 4CKUA 3CIDA 3OAGA 2BPYA 5P4FA 5P56A 1DAZC 4Y43A 5P4RA 1PPME 3EKXA 5AH8A 1B5FA 3S43A 1W50A 5P2UA 5P60A 5HDUA 1ODYA 2IS0A 4YBFA 4ER2E 1C6YA 1LYWB 4FSEA 4J55A 2QZWA 1DPJA 3VYFA 3I7EA 4ZPGA 1F7AA 3EXOA 5P2BA 3D91A 5COKA 1WKRA 2WJOA 1SH9A 5HDZA 2SAMA 2QNNA 4JP9A 5P57A 5DPZA 5JFPA 2QI1A 3OADA 3APPA 4YD4A 2R3TA 5P8FA 2OHLA 4PYVA 5P13A 4Y5LA 3BHEA 2VA7A 1EBKC 4Y56A 3BC4A 5I3VA 3UDJA 3RTNA 2I0AA 4KE0A 5P26A 4GJ8A 2APRA 4D89A 3EKVA 2NMZA 3H5BA 3K1WA 2G22A 4LL3A 5P48A 4I0GA 4K9HA 5P1EA 5P4LA 4J0YA 4OBZB 3K5FA 3BXSA 3SQFA 2UXZA 1FQXA 5P7QA 4TVGA 5P16A 5HDVA 3ER3E 2VA6A 3UQPA 5P5AA 5P3MA 4YCYA 4NJUA 1FKNA 5OYWA 3LINA 1XE5A 4D83A 3UF3A 4NKKA 3ZKMA 4B77A 5P10A 5P38A 3SA8A 5P5OA 5P7RA 5P1MA 2G1SA 4FRKA 3SA3A 2FS4A 2PWRA 1UH7A 3K4VA 2QI0A 5P1NA 2PYMA 5P1PA 1EC1A 2PK5A 2G1RA 3INDA 3WZ7A 2AZ8A 2A4FA 4I12A 3SA4A 3L5BA 5P2NA 3PWRA 3TPJA 5OZRA 5KR1A 5P5QA 2RSPA 2HC0A 5I3YA 4CPXA 3GGAA 4XXSA 1MVPA 3UDPA 4HEGA 5OZOA 4K8SA 4EP2A 4Q1XA 2AOJA 1YTGA 5IE1A 3SACA 1GVXA 5P37A 4J1CA 2OHSA 1SIVA 4CPQA 5IS4A 4CPSA 3HAUA 3OADB 3LNKA 4A4QA 4FL8A 4XX3A 4M8XA 5P0FA 3KMYA 1EPOE 1SGZA 1D4LA 1META 3RVIA 2FXEA 3EKQA 4FLGA 3D3TA 1N49A 1OHRA 3INFA 5KQYA 1ZPKA 3CKRA 3EKWA 5P5JA 4Y3LA 1BV9A 4LP9A 4GJ6A 4Y5AA 1GNNA 3LITA 5ISKA 1K6PA 5OZMA 3URLA 2WL0A 2PSGA 1MESA 2RMPA 4F74A 4NJTA 4DJUA 1FG6C 2WEAA 5P7YA 1DP5A 1YM4A 3NYGA 3SLZA 2OF0A 2QZXA 3JVWA 5P19A 5P01A 2P8HA 4EXGA 1KJFA 3HDKA 5P42A 3INEA 5P6FA 5P04A 4DJVA 5P8SA 4Y3NA 1FF0C 3UQXA 5P2MA 3TTPA 2F8GA 4Y5EA 5OYYA 2P83A 3QPJA 4PZXA 4J0PA 3VV7A 3C9XA 3L5DA 3VSWA 4Y4AA 3I6OA 5PEPA 1PPLE 1E81E 2BBBA 5P7JA 5P0XA 5P1SA 3VFAA 4Y3HA 1YTHA 4OBJA 5P3RA 1MUIA 3SA9A 4FRJA 1D4IA 3R0YA 3DM6A 1D4SA 4DQFA 1PFZA 5P2QA 4EJDA 1HXWA 1FFFC 5P1UA 3NU3A 2NNPA 4H3JA 5OZKA 2FNSA 5P5RA 3K5DA 3MXEA 5P40A 1MT7A 1W6IA 3HW1A 1ZJ7A 3EM3A 3QBFA 2RKGA 3SKGA 3H0BA 4BELA 1ZAPA 4FAEA 3NSHA 3TPRA 5P0IA 5P25A 3KYRA 1B6JA 4EJKA 1D4HA 1SP5A 5P53A 5COPA 5P1RA 5P6RA 1SBGA 1LYAA 1HSIA 3KN0A 2NXLA 4J1EA 5E5KA 3I2LA 1HIHA 4I0IA 3IVIA 5P7WA 4Y3XA 1XS7D 5SZ9A 3CIBA 2VNMA 4I8WA 3VUCA 3ZPSA 3IVHA 1EPNE 4Y3JA 2QMGA 5DQ4A 2V00A 1ZPAA 2QU3A 1T3RA 1C6XA 2QU2A 3DOXA 1T7JA 3L59A 5C9BA 5HTZA 3FNSA 5P0JA 5P86A 1K2CA 4OC6A 4R93A 1EBWA 2O4NA 5IVSA 1KJ7A 2FDPA 3HVGA 1MSMA 5P03A 2HB3A 2AZ9A 2QI6A 5P1WA 4RROA 5P58A 1LF2A 3MSJA 2ZJKA 3WZ6A 5P3TA 3U6AA 5P1FA 4J17A 1HPSA 4ZSPA 5AH6A 5P72A 1HXBA 4EP3A 4OBHA 4Y3FA 2UY0A 5P52A 3FNTA 4L7JA 3PB5A 5P0VA 3SFCA 3PCZA 5UPJA 5P6AA 1W5XA 4WTUA 3S56A 1AJVA 3KT2A 5P0KA 5P8EA 3ZKSA 4Y4GA 4YD7A 5ER1E 5P0WA 1K1TA 5P8OA 4NPUA 4L7HA 5P1JA 5P29A 5P44A 3DCRA 4Y58A 2R5QA 1GNOA 3G72A 5P1QA 2I4DA 3QROA 4J1FA 5P8NA 4D85A 4Y4WA 5P4SA 2ZHTA 3L5FA 1HTFA 3T7XA 4I0ZA 2I4QA 4B72A 5P54A 1OEWA 3JW2A 3ZL7A 1RQ9A 3PWWA 1XDHA 2NPHA 2R8NA 1BAIA 1EPRE 3HLOA 5P3UA 4A6CA 4Y3ZA 3UDMA 1PROA 2ZJMA 5P2HA 5P7ZA 1LYAB 3BVAA 1HHPA 2NXMA 4QJ8A 4APRE 5P3WA 2FGUA 1XE6A 4Y4BA 3UTLA 2G94A 1W5WA 5P6IA 5OZXA 4EQJA 5P3CA 5P0YA 1G2KA 2QHCA 1IZEA 3D1ZA 5KOQA 3BGCA 3OXXA 5OZ4A 5P4VA 4NPTA 4H1EA 4N00A 1RNEA 3IN3A 2WKZA 3TL9A 5P2WA 2V0ZC 5P5SA 2QI4A 1MTRA 1W5YA 5P02A 4YHQA 1LYWA 2ZGAA 5OZQA 5P7GA 2AVOA 3S8IA 2RENA 4D88A 4DJRA 4Q1WA 4RCFA 4Y35A 4H3GA 5P1OA 2IGXA 5OYQA 4OD9B 2QAKA 4RYGA 4CPWA 5P4JA 3OUAA 5CLMA 3Q4BA 5P11A 4LHHA 3LZSA 3R0WA 4ZLSA 5P5UA 4Y5MA 5P4KA 4FS4A 4WY1A 3JVYA 3VYEA 3KFSA 4I1CA 1BWAA 4LXMA 1RPIA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 5P46 A;  5OZ2 A;  3NU4 A;  3KMX A;  2BQV A;  3EKT A;  4KE1 A;  1YG9 A;  2Q64 A;  3NDU A;  2HM1 A;  1D4J A;  2ASI A;  5P76 A;  1MT9 A;  2Q5K A;  4FAF A;  1HTE A;  5P7V A;  5P4B A;  4L6B A;  5OYX A;  4PHV A;  3IXO A;  4Y4D A;  3RTM A;  5P0T A;  2A1E A;  1FFI C;  5SY2 A;  5P0D A;  5P3V A;  2P3B A;  5P32 A;  1EPL E;  1EC3 A;  4ZE6 A;  5P8K A;  4Y3A A;  1HVL A;  2WEB A;  4B1D A;  5P69 A;  2Q15 A;  4ZPF A;  3ZLQ A;  5P7I A;  1IDB A;  3EKY A;  3OU4 B;  3NDX A;  5P0G A;  2AOD A;  1Q9P A;  3VG1 A;  3VYD A;  3D1X A;  4EPJ A;  4QJ2 A;  5AHB A;  2OAH A;  4Y54 A;  2G27 A;  1T6E X;  4MC9 A;  3SAA A;  2OHN A;  1MT8 A;  4OBD A;  3SPK A;  2V11 C;  5DQ2 A;  5P63 A;  3RU1 A;  4Y3T A;  3DCK A;  2AQU A;  1NPW A;  2AZC A;  4HDP A;  3IXJ A;  5P3B A;  1YTJ A;  4Y9W A;  5HD0 A;  4H3I A;  1EPQ E;  1ZSF A;  4Y41 A;  3OK9 A;  2ZHU A;  4OBF A;  3BRA A;  4Y39 A;  4YD5 A;  1EED P;  1OEX A;  3MSL A;  5P4D A;  4X7I A;  5P50 A;  5P1T A;  3PI5 A;  4X2L A;  1T7K A;  5P5V A;  1HRN A;  1PSN A;  5P8P A;  2JE4 A;  4APE A;  5P71 A;  2PMA A;  2AVQ A;  4L1A A;  4NJS A;  4DJQ A;  5BRY A;  2WHH A;  4R91 A;  5P81 A;  2G1N A;  3O9A A;  5P1G A;  4GYE A;  5OZS A;  3I8W A;  4TVH A;  3OGQ A;  5OZY A;  4QJ9 A;  2O4L A;  4YA8 A;  5P8V A;  3APR E;  3O9H A;  3HD8 A;  4EQ0 A;  4CPT A;  5P3E A;  4GJ5 A;  1BVG A;  5OZ7 A;  1GVU A;  5P3D A;  4ZIP A;  3OAG B;  1LEE A;  2QK5 A;  4EHC A;  5P6Z A;  1FIV A;  4J0T A;  1B5F B;  3S43 B;  5P1D A;  5F00 A;  5B18 A;  5P4W A;  3KFP A;  5P8Q A;  5DQ1 A;  4DVF A;  5P34 A;  2QMF A;  1RV7 A;  5P8B A;  2FIV A;  3EMY A;  5P6J A;  4YBI A;  1W51 A;  5P1A A;  2VS2 A;  3BXR A;  3S85 A;  2ZE1 A;  5P4E A;  1A94 A;  3NWX A;  4AA8 A;  5OZ6 A;  5BS4 A;  5ENK A;  1FMB A;  3LIV A;  2AOC A;  5P5M A;  2O4K A;  4R5N A;  2CEM A;  3UDY A;  4YD3 A;  3CIC A;  3ZKI A;  1K1U A;  5P6W A;  5C9F A;  2I4U A;  2Q55 A;  4F76 A;  1K6V A;  2I1A A;  1HTG A;  3NU5 A;  2B60 A;  4Y3P A;  3TOF A;  2ZHS A;  4J1H A;  4DJW A;  1YTI A;  3AUP A;  1G0V A;  2P3A A;  3OXW A;  2ZJI A;  3F9Q A;  3VV8 A;  5P4T A;  2QHY A;  3N4L A;  3DK1 A;  5OZW A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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