3VYEA

Human renin in complex with inhibitor 7
Total Genus 90
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
90
sequence length
340
structure length
335
Chain Sequence
LTLGNTTSSVILTNYMDTQYYGEIGIGTPPQTFKVVFDTGSSNVWVPSSKCSRLYTACVYHKLFDASDSSSYKHNGTELTLRYSTGTVSGFLSQDIITVGGITVTQMFGEVTEMPALPFMLAEFDGVVGMGFIEQAIGRVTPIFDNIISQGVLKEDVFSFYYNRDSLGGQIVLGGSDPQHYEGNFHYINLIKTGVWQIQMKGVSVGSSTLLCEDGCLALVDTGASYISGSTSSIEKLMEALGAKKRLFDYVVKCNEGPTLPDISFHLGGKEYTLTSADYVFQESYSSKKLCTLAIHAMDIPPPTGPTWALGATFIRKFYTEFDRRNNRIGFALAR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Design and discovery of new (3S,5R)-5-[4-(2-chlorophenyl)-2,2-dimethyl-5-oxopiperazin-1-yl]piperidine-3-carboxamides as potent renin inhibitors
pubmed doi rcsb
molecule tags Hydrolase/hydrolase inhibitor
source organism Homo sapiens
molecule keywords Renin
total genus 90
structure length 335
sequence length 340
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.4.23.15: Renin.
pdb deposition date 2012-09-24

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00026 Asp Eukaryotic aspartyl protease
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.40.70.10 Mainly Beta Beta Barrel Cathepsin D, subunit A; domain 1 Acid Proteases 3vyeA02
2.40.70.10 Mainly Beta Beta Barrel Cathepsin D, subunit A; domain 1 Acid Proteases 3vyeA01
3TLHA 1UPJA 5P23A 5ENKA 5P5RA 2VS2A 4QJ9A 4AA8A 4Y3QA 1BBSA 1IBQA 1HEGE 2ZE1A 3PSUA 5HDVA 5P4CA 8HVPA 5P3YA 2R5PA 4Y3DA 3OK9A 5F00A 4KB9A 3ZPTA 3I25A 4J1FA 4K4QA 4Q1XA 5P0OA 1RV7A 5OZ4A 2FGVA 4TVGA 5P6MA 1EBWA 2I4WA 4RZ1A 1W50A 1EC1A 4KE0A 4FRSA 5P87A 4YD3A 3TOGA 1MIQA 3VFBA 2NR6A 1EBYA 3ZKNA 3NLSA 1B6LA 1BILA 4H3JA 4Q1NA 3WZ6A 2FMBA 3PHVA 4OBFA 4YCYA 3TNEA 1BIMA 2IEOA 3OXCA 2JE4A 3L5FA 5JFPA 3LPKA 3AIDA 4A6BA 1G0VA 1EC0A 5P4YA 5P0GA 5P41A 1YTJA 4CPRA 4Y3EA 4FSLA 3PCWA 5P03A 5P0DA 2OHUA 5OYVA 3OU1B 5P61A 5P5JA 1J71A 2R9BA 4DPIA 2F8GA 2FNSA 5IS4A 3NWQA 5P2EA 3UF3A 5OZJA 3LPJA 3K5FA 2PMAA 5P3OA 3SFCA 1BAIA 4Y45A 2HPFA 5P0TA 5P0NA 3S43A 4GJ8A 4CPUA 5P8IA 4M8YA 4F74A 5I70A 2QHYA 3QROA 4Q1YA 5P8LA 2PWRA 3NWXA 5P4UA 1RQ9A 5P5AA 4FGXA 5IVQA 5P3NA 5P6PA 5P8SA 5P58A 4NPTA 5P4HA 4EPJA 5SY3A 5P05A 3U71A 1D4IA 4DQEA 3UTLA 5C9BA 3FV3A 5P5YA 5P3RA 2AVOA 4Y3TA 2FGUA 1RNEA 3OU4A 1HBVA 3O9LA 5P2GA 1DIFA 2ZYEA 3O9HA 6UPJA 1SDVA 4ZIPA 4GJBA 1FEJC 5P3IA 5P7ZA 4TRZA 1BDLA 4FRJA 5P1UA 3KFSA 5I3YA 2B42A 5DR0A 5P2JA 5P8JA 1MESA 3OUCA 3NUJA 5ISKA 5P15A 3RU1A 5KAOA 2G1RA 2PYNA 4Y4BA 4BEKA 1WBMA 4DJRA 3S7MA 5P8TA 4OBJA 3Q5HA 2HS1A 4Y3HA 4Y3XA 3VUCA 5P4VA 2HIZA 5P4IA 3T7QA 5P4OA 3OUBA 3R0WA 3ZPUA 1YTHA 3OXWA 5OZAA 4PHVA 3D91A 5HDXA 4Y5LA 2ZHUA 1PROA 4EQ0A 3LHGA 1HSHA 3T7XA 3OOTA 4QLHA 4K8SA 4I0JA 1T7JA 5DGUA 3RTNA 4R5NA 5P3MA 1BV7A 3I6OA 5E5KA 5P2OA 1ZSRA 3EM3A 4S1GA 4Y51A 2ER0E 2WKZA 3NXEA 4L1AA 1GNMA 5P3UA 3BXSA 5I3VA 5P1CA 2V0ZC 1FGCC 5P50A 1FQXA 3BC4A 1A30A 1GVWA 4LC7A 2J9JA 5P2DA 5P79A 4H3GA 5P1GA 5P4RA 1ZPAA 3INDA 2HC0A 1F34A 4J0PA 5OZVA 3VEUA 1NPAA 2AZ8A 3MSJA 3U6AA 2QHZA 5P5IA 5P5XA 1EPNE 2BBBA 2OHRA 4Y4DA 5HCOA 2NTRA 4B72A 1MUIA 4LL3A 4ZSQA 2AOEA 1NPWA 5P6IA 4ZE6A 5HDZA 5P2MA 2JYSA 5P26A 5DQ1A 3KT5A 5P7CA 3WZ8A 3F9QA 5P78A 4J0TA 1APUE 4Y3RA 3EBZA 2HS2A 4Y5MA 2F81A 5P33A 2QI3A 5P45A 3SA3A 5P07A 5P5KA 5P5EA 4D83A 5P0IA 5P70A 1MERA 3QS1A 5P27A 5P7HA 3HVPA 3VYEA 5AHAA 3O9FA 1LF4A 5OZEA 5P0RA 3S54A 5OZMA 5OYUA 2AVSA 1D4LA 3OQDA 2QZWA 4Y37A 1FKNA 2AZCA 3S8IA 5P8EA 3UDKA 4QJAA 4HVPA 1OD1A 5P0WA 4L7HA 2P3CA 1B6PA 1MTRA 1A9MA 3VSWA 5ER2E 4TRWA 5P8CA 3ZKGA 3UPJA 4Y5PA 4Y3NA 5P0CA 4AA9A 5F01A 3K5DA 2P83A 2QNPA 3TPJA 4J0VA 2Z54A 2AVQA 2I4XA 5P5DA 3Q6YA 5P81A 2PH8A 4EHCA 5P19A 4EJDA 3UCBA 1APTE 3UDYA 3VFAA 4K4RA 1FFFC 5P1PA 3OOZA 2Q54A 5P6BA 4OBHA 4D85A 1META 3ER3E 3N4LA 2I4DA 2AOIA 2P3BA 3EL1A 2PWCA 3UDHA 5P7GA 5OZGA 3O9AA 2HM1A 3LZSA 3LIXA 4Q5MA 5P85A 4CP7A 3EKYA 4EP3A 3UHLA 1FQ5A 5P7IA 2AOJA 1EPOE 3PBZA 2PC0A 5OZOA 3ZPSA 3BVAA 2QD8A 4QJ6A 4NJTA 2IENA 3UQPA 2ZJKA 3EL4A 4Y3MA 3UFLA 4FM7A 1HIIA 4WTUA 4I0ZA 4BFDA 2XFIA 4I0GA 2RENA 5DQ5A 5P2TA 1T6GA 3LINA 4OC6B 5P08A 1QBUA 3TL9A 5KR1A 1PFZA 2UPJA 5BWYA 4YD4A 2IKOA 2NNPA 4JP9A 5P7JA 1B5FA 4QJ2A 5P4GA 5P6VA 3T3CA 2VNMA 5P5UA 1GVTA 4EJLA 5P56A 3D1XA 2CEJA 4Y3AA 5P17A 5HVPA 3SAAA 5P8NA 4D89A 1AVFA 3BUHA 5EZZA 3LZYA 3L5CA 1SH9A 4EP2A 4R95A 4B1DA 4APRE 5P34A 2BPZA 1HVKA 2WF2A 5P72A 3LZUA 3OHFA 5P7SA 4GJ6A 5IVRA 4RCDA 1Z1RA 1SMEA 3FNTA 1XL5A 4A4QA 1VIKA 5P4BA 2O4SA 5P1OA 1FG6C 5P2WA 3D20A 3VLAA 2NPHA 2P4JA 4FRKA 4D88A 2JXRA 2VJ6A 3IAWA 5P1HA 3MWSA 5OZ6A 5P48A 3MXEA 2NXMA 4Y3PA 5P3ZA 3L3AA 1FIVA 3UDMA 2V12C 4OBGA 5P5OA 1LYAA 5COPA 4YD5A 3S53A 3TH9A 4EXGA 3OQAA 5P3CA 5P8BA 4PYVA 5P4MA 4Y39A 5P8UA 4J5JA 5P0XA 5OZNA 5P4WA 5P8DA 5OZKA 3PLDA 5OZDA 4TRYA 1IDAA 3INFA 3QAAA 4H1EA 4DUSA 3L58A 5P4TA 5P7BA 3KN0A 1HPSA 2I4VA 1EPME 1U8GA 3PI0A 2R5QA 2CEMA 3HVGA 1LYWB 1Q9PA 1PPKE 1UH9A 1HPXA 2WEBA 5OZIA 3UFNA 4X2LA 2R43A 5P6FA 2JJIA 2HB2A 2XFJA 1A94A 3DK1A 1D4KA 4Y6MA 5P2UA 5P3WA 3TKGA 5SY2A 4NJVA 3EKVA 2MIPA 4I0EA 3O9BA 5P3KA 4GB2A 2A1EA 5P67A 5P2BA 5OZBA 5P3XA 3N3IA 2G1NA 4RVIA 4NPUA 5HE7A 4Y57A 4LBTA 2I4QA 2P3DA 5P77A 1LYBB 4HA5A 4LP9A 2QI0A 5P59A 2O4PA 3IA9A 2CENA 3NU4A 5KOSA 3DV5A 4UPJA 4I0HA 5P6DA 3EXOA 1SP5A 3DCKA 5P6AA 5P7PA 4K4PA 1AM5A 3UDJA 2I0DA 1A8KA 5COKA 3G6ZA 2VIJA 9HVPA 2VA7A 3OADB 5KR0A 5P40A 2PSUA 4WY6A 3Q4BA 3VF5A 4IVTA 1F7AA 2QI7A 1HTGA 5P2ZA 2G1OA 1HEFE 3NR6A 4GJCA 1VIJA 3PCZA 5P42A 3K5GA 2V16C 5P20A 3D3TA 2AODA 5P7VA 5P2AA 5JG1A 1FQ4A 4XX4A 2UXZA 4I1CA 2Q15A 5P7KA 4L7JA 1ODWA 4YOBA 1BVGA 2WHHA 4NJSA 1HVSA 1PSOE 3PSGA 3INEA 4YA8A 4ZPEA 3VYDA 4RCFA 3IN4A 4Y5AA 5P6OA 5P31A 3R0YA 3PMYA 3SA5A 1YTIA 5P3LA 5P7TA 1Z1HA 4DQCA 2ZJIA 4RLDA 2AZBA 4F76A 4XXSA 4Y3FA 3VLBA 2R3WA 1C70A 2I1AA 1KZKA 4MC2A 4PZXA 1SIPA 3NDWA 3OAGB 5P71A 2VJ9A 4N00A 1LEEA 5P0UA 3RTMA 4GMIA 4GIDA 1HRNA 2XFKA 3O9CA 5P6JA 1BVEA 3NU9A 3PSYA 1GVUA 3L5EA 5P1TA 2AVMA 5IVTA 4OD9A 2OHQA 1TQFA 3IVIA 1FQ7A 4RCEA 2NXLA 3L5BA 2G1YA 3IXJA 4I0FA 4KE1A 5P73A 4A6CA 5C9FA 1IZHA 1B6KA 5P30A 1ME6A 4Z50A 3ZL7A 3DM6A 4AUCA 1QBRA 2OAHA 3IN3A 5P35A 2NMYA 2BKSA 4JOOA 4FM8A 4E43A 4EJKA 2BPXA 5ER1E 5P3FA 3S43B 5P5PA 1K6PA 1D4HA 2ZJLA 5P2IA 5BRYA 2QI5A 1HSGA 1WKRA 3QBFA 4DH6A 2Z4OA 3LIYA 1BXOA 4NJUA 1B11A 2PK5A 1DPJA 4ZPGA 5P8OA 2O4NA 1FMBA 5P16A 5P5LA 5OZPA 5OZRA 3KDBA 5AGZA 5DR8A 5P43A 4Z22A 3FX5A 1LV1A 1W6HA 5OYWA 2O40A 2ASIA 4I0IA 4J0YA 1E82E 1HOSA 3OU4B 1ODYA 3O9LB 1FB7A 4Y3WA 3S85A 5P6SA 1LF3A 4J1EA 1HIHA 5P2FA 3QRSA 3OXXA 3TPRA 4Y47A 5IE1A 4R93A 3RSXA 2QI4A 2OF0A 3PWWA 4COEA 1QRPE 5P7QA 3URJA 5P76A 4Y4XA 3VV6A 2FXEA 2RMPA 4RVXA 1M0BA 3UDNA 2ZGAA 2IKUA 5P0YA 5P7DA 5P25A 5P1QA 3LITA 5P0EA 5P3JA 5FIVA 1W6IA 5P6LA 2EWYA 4OBKA 4I8ZA 1W5XA 5P2QA 6FIVA 4Y41A 5P3PA 3HD8A 1OEXA 4XKXA 2H6SA 5PEPA 5P89A 3CKTA 2ZJNA 3IXOA 1KJHA 5P2SA 3R1GB 2F3KA 5OZQA 1ODXA 5P8AA 3TPPA 3GI0A 4QJ8A 1CZIE 4ER1E 2FXDA 3D1ZA 3D1YA 1KJFA 1HVIA 5DQ4A 2FLEA 3FIVA 2UY0A 3VV7A 5P5SA 5AH7A 2B8VA 5DR3A 5ISJA 1M4HA 4U7QA 5OYQA 2RKFA 1K2BA 4L1AB 2IQGA 3SABA 2J9KA 4L6BA 4OBZB 1SGUA 2J9JB 4GYEA 4RYCA 5P51A 5P3BA 4RRSA 2Q63A 5P7YA 1D4JA 5P3SA 4DJXA 2WEZA 1YM4A 5P3GA 1FMXA 1AJVA 3OY4A 4JPCA 1D4YA 3R4BA 1OEWA 4Y4EA 3OGPA 1IDBA 1TCXA 1GNOA 5P7OA 3EKPA 5P1VA 1APWE 5P69A 2JJJA 5P6NA 2RKGA 5OZSA 3SKFA 3T11A 3JW2A 2V10C 4Q1WA 3QBHA 1TSQA 4ZSPA 3VYFA 1SIVA 1K1UA 2OHPA 3EKQA 1NPVA 5P5CA 3L5DA 4ZSRA 5P1FA 5P2RA 2F80A 2PSGA 1M43A 1D4SA 4Y36A 1DW6C 5SXNA 2R3TA 1ZSFA 3KMXA 4M8XA 4ZPFA 5P0SA 2QMGA 3EC0A 4ZSMA 3EMYA 3KFNA 5P88A 5P29A 5B18A 1E80E 1MSMA 5JODA 1LS5A 3EL9A 5P5QA 4CPTA 5P7NA 5OZ9A 3SM1A 3PB5A 3NXNA 4J1CA 5P5BA 1SDTA 3VV8A 4FE6A 3FKTA 2XYEA 1K1TA 2Q55A 5P06A 3S7LA 3KFRA 5P22A 2QK5A 4YE3A 5KR8A 4EWOA 5P4DA 3KMYA 4CMSA 1MVPA 3VG1A 4LAPA 5P28A 2O4KA 5P84A 5P64A 2WEAA 5DGWA 5P4NA 1T3RA 4Y3SA 3NDTA 4Y4JA 1YG9A 4BFBA 2BPYA 4I8WA 1A8GA 1SDUA 3KA2A 4J1IA 4Y5KA 1BXQA 3WSJA 2NMZA 2BPWA 4HZTA 5P65A 4FAEA 1FLHA 1B6JA 5P36A 5UPJA 5P6RA 1YX9A 2OHNA 4I12A 2FDEA 5P0QA 3HAUA 4RVJA 5P8RA 1C6ZA 1YTGA 5P14A 3SO9A 2P3BB 3QI1A 4RYGA 2QD7A 1K6CA 4DFGA 1FF0C 2G20A 5P4AA 3DUYA 2VIZA 5P10A 5P3EA 1ZLFA 3NSHA 4LXKA 4I10A 5P8KA 2OHTA 2AIDA 5AHBA 5P09A 2WF1A 5P4QA 1BWBA 3NU6A 2ZHSA 3NU3A 4RRNA 3OHHA 3PWRA 5P4JA 2ZJJA 1JLDA 3MXDA 5OZ7A 2PK6A 4DJWA 2QMPA 1G35A 3O99A 2O4LA 2AOGA 4R8YA 4NKKA 4Y9WA 5OZ0A 5APRE 4Y3LA 5P1XA 5P4KA 3RVIA 5HU1A 5P7FA 4Y4ZA 3NU5A 1FQ8A 2HB3A 1B5FB 3JVWA 5CONA 3OQKA 5DR7A 4IVSA 1MRXA 3SQFA 2Q3KA 3OUDA 5P8MA 4CKUA 2IGYA 5HD0A 2Q5KA 5P1KA 5P6EA 2AOCA 5P8PA 1QDMA 2ZHRA 1IZEA 4Y44A 1FQ6A 3LNKA 1HXBA 5P8HA 3Q3TA 2OHLA 5P02A 4ER2E 1G2KA 1BWAA 3MSLA 5P0PA 1GKTA 3GGVA 5P3HA 4ACUA 5P7WA 3GW5A 3ZLQA 2ER7E 3AUPA 3PBDA 3LPIA 5P1JA 5P5MA 3GGUA 2VKMA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 3TLH A;  1UPJ A;  5P23 A;  5ENK A;  5P5R A;  2VS2 A;  4QJ9 A;  4AA8 A;  4Y3Q A;  1BBS A;  1IBQ A;  1HEG E;  2ZE1 A;  3PSU A;  5HDV A;  5P4C A;  8HVP A;  5P3Y A;  2R5P A;  4Y3D A;  3OK9 A;  5F00 A;  4KB9 A;  3ZPT A;  3I25 A;  4J1F A;  4K4Q A;  4Q1X A;  5P0O A;  1RV7 A;  5OZ4 A;  2FGV A;  4TVG A;  5P6M A;  1EBW A;  2I4W A;  4RZ1 A;  1W50 A;  1EC1 A;  4KE0 A;  4FRS A;  5P87 A;  4YD3 A;  3TOG A;  1MIQ A;  3VFB A;  2NR6 A;  1EBY A;  3ZKN A;  3NLS A;  1B6L A;  1BIL A;  4H3J A;  4Q1N A;  3WZ6 A;  2FMB A;  3PHV A;  4OBF A;  4YCY A;  3TNE A;  1BIM A;  2IEO A;  3OXC A;  2JE4 A;  3L5F A;  5JFP A;  3LPK A;  3AID A;  4A6B A;  1G0V A;  1EC0 A;  5P4Y A;  5P0G A;  5P41 A;  1YTJ A;  4CPR A;  4Y3E A;  4FSL A;  3PCW A;  5P03 A;  5P0D A;  2OHU A;  5OYV A;  3OU1 B;  5P61 A;  5P5J A;  1J71 A;  2R9B A;  4DPI A;  2F8G A;  2FNS A;  5IS4 A;  3NWQ A;  5P2E A;  3UF3 A;  5OZJ A;  3LPJ A;  3K5F A;  2PMA A;  5P3O A;  3SFC A;  1BAI A;  4Y45 A;  2HPF A;  5P0T A;  5P0N A;  3S43 A;  4GJ8 A;  4CPU A;  5P8I A;  4M8Y A;  4F74 A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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