4GJCA

Crystal structure of renin in complex with nvp-bch965 (compound 9)
Total Genus 88
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
88
sequence length
340
structure length
337
Chain Sequence
LTLGNTTSSVILTNYMDTQYYGEIGIGTPPQTFKVVFDTGSSNVWVPSSKCSRLYTACVYHKLFDASDSSSYKHNGTELTLRYSTGTVSGFLSQDIITVGGITVTQMFGEVTEMPALPFMLAEFDGVVGMGFIEQAIGRVTPIFDNIISQGVLKEDVFSFYYNRDSQSLGGQIVLGGSDPQHYEGNFHYINLIKTGVWQIQMKGVSVGSSTLLCEDGCLALVDTGASYISGSTSSIEKLMEALGAKKRLFDYVVKCNEGPTLPDISFHLGGKEYTLTSADYVFQESYSSKKLCTLAIHAMDIPPPTGPTWALGATFIRKFYTEFDRRNNRIGFALAR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title A novel class of oral direct Renin inhibitors: highly potent 3,5-disubstituted piperidines bearing a tricyclic p3-p1 pharmacophore.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Renin
molecule tags Hydrolase/hydrolase inhibitor
source organism Homo sapiens
total genus 88
structure length 337
sequence length 340
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.4.23.15: Renin.
pdb deposition date 2012-08-09

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00026 Asp Eukaryotic aspartyl protease
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.40.70.10 Mainly Beta Beta Barrel Cathepsin D, subunit A; domain 1 Acid Proteases 4gjcA02
2.40.70.10 Mainly Beta Beta Barrel Cathepsin D, subunit A; domain 1 Acid Proteases 4gjcA01
3NU4A 4KE0A 1HIIA 1HSHA 4RZ1A 1CPIA 5OZKA 5P29A 1QDMA 2A1EA 4Y4TA 1BDRA 1KJ7A 2NTRA 3KT5A 1RPIA 4GJ5A 5OZAA 3F9QA 4DQBA 3IAWA 1FMBA 5P5WA 5P27A 5P1LA 4Y5KA 4Q1YA 3NU5A 1ZSRA 5P1EA 5P18A 2HB2A 3SAAA 5P85A 3LIXA 3SKGA 3R1GB 5DR4A 4WY6A 4NJVA 5P3PA 4YCKA 3QIHA 4FS4A 1YTGA 5P7YA 4D89A 5IS4A 2VIJA 1GVWA 3OWNA 1G6LA 3EKXA 3Q5HA 4L7HA 4Y41A 1MVPA 2OF0A 1MT7A 5P0QA 1TSQA 3VYDA 4L7GA 4JPCA 5P14A 3H0BA 2J9JB 1BV7A 4XX4A 9HVPA 5P0KA 5I3WA 1D4JA 5IVTA 3OY4A 3LINA 2R3WA 2RSPA 4Y3RA 5P4ZA 5P4PA 5P66A 1FF0C 1FG8C 4J0ZA 5P74A 2XFIA 1GNNA 5P86A 1D4HA 1QBRA 2PK6A 3OTYA 2Q54A 5OZ1A 3VV6A 1AXAA 1EPRE 4OBDA 5JFPA 5KR0A 3UQUA 1T7KA 2OHQA 5HDXA 5P8GA 1E81E 4FM6A 2FGUA 2FXEA 2BPWA 5P2IA 5P5IA 5OZ7A 5P3CA 3GW5A 2BB9A 2HPFA 5P7KA 4FLGA 1PROA 2BPZA 3DV1A 5P57A 4HLAA 5P3BA 5P82A 4DVFA 4X2LA 5P5HA 5P3TA 3L5BA 2Z54A 1HXWA 3VLBA 5OZOA 3TPJA 4DJWA 3ZKIA 1IZEA 1PPLE 5P6SA 1XDHA 3UFNA 4ZSMA 4FE6A 5P8VA 4IVSA 5P7BA 2F81A 3WB4A 3GI4A 4HDFA 3D3TA 4Y5EA 1HVKA 4RCFA 1A30A 1AJXA 3K1WA 4RCEA 5BRYA 5P06A 5P68A 4I0FA 3L58A 2IKUA 1LZQA 4A4QA 3SPKA 3OGPA 5SZ9A 2G1YA 4ZPGA 4CPXA 2G20A 3GGUA 5P8PA 4FSEA 1M4HA 5F00A 1YM2A 4I8ZA 2NR6A 3PJ6A 2NMYA 5P15A 4YD7A 5P0ZA 3T3CA 3VFAA 4ZPFA 3R2FA 3ER3E 5P3FA 5AHBA 5P3AA 4Y5AA 5P88A 4J1EA 6APRE 3MSLA 4J1FA 1AAQA 2ZJMA 3OU1A 5AH8A 4YCTA 2R3TA 5OZDA 3UDJA 4FSLA 3DV5A 4H3JA 3HW1A 4DJUA 5P3WA 3C9XA 1PPME 5P59A 1HHPA 2AZ9A 1SMEA 1M0BA 5P2DA 3OQAA 3I8WA 4FM8A 1GKTA 4AUCA 3PM4A 2RKGA 2VKMA 6FIVA 4Y3ZA 1E5OE 5P8BA 4YBIA 5COKA 2VIEA 1ZPKA 4Q1XA 5P5LA 5P2MA 5P4HA 4Z22A 5P3VA 2ZHSA 5KQZA 1YM4A 2AOFA 1EPME 3EM4A 3OU4B 2Q15A 4Y4JA 2ANLA 3TPRA 1B5FA 3CYXA 5HDUA 3HAWA 1XS7D 4BFBA 4Y3TA 1HRNA 3VYEA 2AOIA 1YTJA 5OZYA 4QJ7A 1T6EX 3IA9A 1HVLA 3NLSA 2WEDA 1ODXA 1HVSA 2F80A 2APRA 5P2CA 4EJ8A 5P1CA 3SACA 3NUOA 5P6GA 4Q1NA 4NPUA 5P2KA 4K9HA 1A94A 4HEGA 2PQZA 1T3RA 4GJ8A 5P0XA 1K6TA 2JJIA 2AVSA 3IXOA 5P3RA 3BVBA 3HBOA 5OZFA 5OZTA 3CIBA 3B80A 5P1QA 3BHEA 5P5XA 5P02A 3S7LA 4J1HA 1WBMA 3OUDA 2NXDA 3LIYA 4ZEAA 1ODYA 5E5JA 3FKTA 5T4SA 4DV9A 1EPNE 4N00A 4QGIA 5P6OA 5P1GA 4JPEA 2AQUA 3LIZA 1AJVA 3QN8A 2UPJA 4YHQA 1QRPE 1EBWA 3SKFA 3IGBA 2HB3A 2ZJLA 4I10A 2WF1A 1VIJA 3UF3A 1BDLA 1FMXA 5ENKA 2QI0A 1ER8E 5P5PA 5IVSA 5P6YA 1YT9A 1LF3A 1LYWA 3EM6A 4CPWA 4Y4EA 5P8EA 3VUCA 2I1AA 3OQ7A 4LAPA 3Q70A 5P80A 2PWRA 3PSUA 3SQFA 4I0HA 5P1RA 5JG1A 5P8RA 1TSUA 1B6LA 5P6MA 5P7AA 1HIHA 5P79A 3UPJA 2PYNA 5OYYA 1HEFE 1MSNA 3OQKA 2QI1A 3R4BA 3EKYA 5P8HA 1KZKA 5AH6A 5P0LA 5P30A 2HPEA 3OOZA 4ACXA 2FDEA 4I11A 4WY1A 5P2AA 3LIQA 1BBSA 4Y3JA 1W5VA 5P6PA 3SA7A 3ZMGA 1LYBA 5P4QA 5P5CA 1LYAB 1RV7A 3PVKA 3QRMA 1OD1A 2I0AA 5P5EA 1SMRA 5P00A 1KJGA 5P4GA 3PEPA 3G6ZA 5HDVA 1DPJA 5P7NA 2AOGA 3CIDA 5P0FA 2IEOA 3BGBA 1RL8A 2FMBA 3O9IA 3PLDA 3L5FA 2BBBA 4Y48A 1HWRA 5OZ2A 1IZIA 5P8LA 2IENA 2PH8A 5P32A 4CPTA 3K5GA 4OBFA 3OXCA 3D1YA 2BJUA 3VEUA 3AIDA 5P2BA 3OOTA 4D88A 4ZLSA 4F75A 3QVIA 3UCBA 1K2CA 5P4LA 1HPXA 3S54A 3NYGA 3IN3A 3SA4A 2OAHA 5KAOA 3PLLA 4K8SA 2QI4A 2P8HA 5P08A 1FQ7A 1T7JA 1BXOA 5C9DA 4FL8A 5P8JA 5P26A 4Y3HA 5OZBA 5OYSA 1B11A 3GI0A 4TVHA 3O9GA 2AOHA 1SIPA 5DGUA 4JECA 3PI0A 4JP9A 3OU3A 3S7MA 1K6CA 5P7GA 5P6RA 3Q3TA 5P56A 2V12C 3SABA 4FRIA 2Q5KA 3QRVA 1HTRB 2Q11A 2Q64A 1W50A 2IGYA 1QS8A 3HVPA 1HOSA 4J17A 2I4VA 5P4MA 1EC1A 3HVGA 3KT2A 3CYWA 5P3LA 4Y4GA 5P6AA 5ENMA 3VV8A 3VV7A 4AMTA 2O4LA 2J9JA 4FGXA 4RLDA 4Y6MA 4DJVA 5P6CA 5P5AA 3D1ZA 2JYSA 2ER7E 1SDUA 5HE5A 3AUPA 3UDKA 2QMGA 3PRSA 5I3YA 4I0DA 2QMFA 1K1TA 1QBTA 3TOGA 3OAGB 2ER0E 4Y4AA 5OZZA 3OUCA 2R8NA 1APVE 3T7XA 5P6FA 2G21A 3RVIA 3RTMA 1HVHA 4M8XA 1FGCC 4PZXA 4GJ9A 4PZWA 3T7QA 1LF4A 1FEJC 5HVPA 5P2YA 5P54A 4K4RA 5FIVA 5P4AA 4Y36A 1APTE 3OGQA 2JJJA 5P7FA 1YTIA 4LXKA 5P41A 4ZE6A 1HPSA 4NJSA 2ZE1A 5IVRA 2HS1A 5P43A 4QLHA 3L5CA 3RU1A 5P1HA 3LHGA 2AVQA 2QNPA 4B77A 4EWOA 1MIQA 4ZPEA 1KJFA 2QZWA 4RVJA 5P04A 5DR3A 2ZHUA 5DQ1A 2R38A 5P4WA 2QAKA 5KQYA 5BWYA 4OD9B 5OYVA 3VF5A 1G0VA 3R0YA 5P6HA 1K6PA 1CMSA 1FFFC 1GVTA 3HZCA 1EBYA 1PFZA 3PHVA 1DW6C 3K5DA 5P01A 1RQ9A 3OADB 1C6XA 5UPJA 3T7PA 3DUYA 5P1IA 2SAMA 3PGIA 3EKWA 4XX3A 5P5TA 5I70A 5P0UA 5KR2A 4J55A 1IZHA 4B1CA 4R92A 5P6NA 4EJLA 3EL1A 5HU0A 5P3IA 1D4LA 5P1WA 5P10A 5APRE 3DCKA 2Z4OA 2OHLA 2ASIA 5P1VA 5P4FA 5OZNA 3INEA 3KDCA 4Y39A 2QZLA 2WF3A 3TLHA 2R9BA 5HE4A 2VJ6A 1BV9A 1FB7A 3KFSA 5P35A 5P8AA 3EXOA 1B6JA 5P5UA 5P12A 2XYFA 5P2SA 2ZHTA 2VNMA 2AZBA 4I0IA 4X7IA 2QNQA 3ECGA 3KMYA 4OBKA 5P70A 5P5GA 2PH6A 2QI3A 1MPPA 4DJPA 3DK1A 5P8QA 4YD5A 4LL3A 4J0TA 3SA6A 5JODA 5P5MA 4Y4WA 2H6SA 3U71A 3SA3A 2ZDZA 4NJUA 2NMZA 4Y9WA 3PSYA 4U7QA 4E43A 4FM7A 1T6GA 5OYTA 2OHKA 5P49A 3IXJA 3IXKA 5OYXA 3QPJA 4CP7A 2ZJNA 1GVUA 3OU4A 4B0QA 2G1RA 2IS0A 1EEDP 4RVXA 3WSJA 2PSUA 3H5BA 5OZSA 5P33A 5P7RA 3HAUA 5P4XA 3NDWA 4D85A 4LXMA 4B05A 4Y3DA 5OZVA 3SLZA 5P0TA 3R0WA 3DJKA 2G27A 2R5PA 3KM4A 3SFCA 5I3XA 5HDZA 4EQ0A 3UQXA 5P3XA 5HU1A 5P4VA 1GVVA 1AIDA 4R93A 5P75A 2I4XA 5P2RA 4R95A 4YD6A 5P69A 3ZKNA 2G22A 4A6CA 4EJKA 1YX9A 1Z1RA 5P17A 5P05A 1E82E 3MSJA 3KFPA 2QMDA 3QRSA 5P22A 5P31A 4BELA 2O4SA 2QD7A 1GNOA 2R43A 4Y3QA 1HVRA 5P0GA 2FDDA 1HSIA 3BXSA 4ER1E 3PWMA 3OXXA 3APPA 2AVMA 1UH8A 1D4KA 3LZSA 5SXNA 3U7SA 4FAEA 4APRE 4DFGA 4LBTA 4Y5CA 3LPJA 1DIFA 2ZGAA 4Y43A 4LHHA 2O4PA 5P8NA 4OBZB 3A2OA 5P4JA 5P7OA 4A6BA 2V13A 3L59A 4L1AB 4ER4E 3APRE 1ME6A 1W5YA 1HTFA 3UQRA 3PMYA 5P34A 5P4DA 2OHUA 3VFBA 5COPA 2O4KA 4EYRA 3ZKXA 5HTZA 3OXWA 5P0OA 4HVPA 5P4BA 5OZHA 1MTBA 1GNMA 4OBJA 3SA9A 1ZP8A 2WEZA 3S43B 5AH7A 4H3IA 3ZKSA 5P73A 3ER5E 4BEKA 3UDMA 3S2OA 3VSXA 4J5JA 5P2LA 2WEBA 3ZPTA 1LYAA 4J0VA 2I4DA 3UDNA 1FQ4A 2F3FA 4GMIA 1MT9A 5P23A 6UPJA 5P4RA 3TOHA 1D4SA 4CPSA 4QJ9A 5P0MA 5P3ZA 4Y57A 1FQ5A 5P1BA 2FS4A 5P11A 4TRWA 4AA9A 5P16A 3PI5A 1EBZA 2F3KA 4WTUA 3LPKA 1HPVA 3D1XA 5P64A 1BVEA 5P0WA 5P0PA 3QROA 5P5RA 4MC9A 3OK9A 1SDVA 4LC7A 4EPJA 3S8IA 5P1UA 4OC6B 5ISJA 5P0CA 4LP9A 2P3BB 4L7JA 3G72A 1BDQA 2G1NA 5OZLA 5OYRA 1D4YA 1A8GA 2ZHRA 4J0YA 1K2BA 4Y3FA 1Z8CA 2NNPA 4MC2A 3OHFA 2RENA 2V11C 2VNNA 3ZPUA 5P60A 3WZ8A 2WECA 5P0SA 5P8FA 2V16C 4B70A 3NR6A 5P13A 5P6LA 5P24A 5P7TA 3QS1A 1AVFA 3D20A 5HD0A 4QJAA 3RSXA 4YOAA 5P1NA 3EL9A 3IVIA 2ER9E 3FV3A 3OQDA 5I3VA 2IGXA 4GB2A 3UDQA 3CKPA 2WJOA 4Y4XA 2AOCA 4Y5GA 2QHZA 5P2ZA 1NPWA 5P3OA 5P3EA 5P0JA 3FX5A 3GGVA 3LZVA 5P84A 1META 5P5SA 3I7EA 3LITA 3CKRA 3NSHA 2QI5A 1W6HA 5P5BA 2PSVA 1MRXA 5P81A 4CPRA 2HAHA 4M8YA 3I25A 3GI6A 2V00A 3OAGA 3NDXA 3GI5A 1C6YA 4COEA 5JFUA 5P36A 4GJCA 4R91A 5P1AA 4DJQA 1ZLFA 2G1OA 3EKVA 1BXQA 1BWBA 5P44A 5DQ4A 5P7CA 4RCDA 4APEA 2OHMA 5OZ3A 5P7ZA 2G24A 4HA5A 3OTSA 3NDUA 3SO9A 3WZ7A 3O9DA 2UY0A 1A8KA 4Y3GA 4DJRA 2OHRA 1J71A 4GJ7A 3U6AA 5P3JA 3NXEA 5DQCA 2AVVA 1EC2A 5P72A 1OEWA 4Q5MA 5P1KA 3ZPSA 1ZAPA 4EP2A 3INFA 4FCOA 5P25A 1QBUA 1LS5A 4U8WA 5P7EA 4Y3AA 4DQCA 5OZWA 5P3NA 4YE3A 2AZ8A 3ZOVA 4Y4ZA 5P87A 4Z4XA 1NH0A 5P4EA 2Q55A 5P2JA 3MXDA 4OD9A 5P6DA 4XKXA 3EMYA 5P3GA 4ZSRA 4B78A 3B7VA 5HCOA 3CICA 2QMPA 4L6BA 3S85A 4YDFA 3OADA 3MWSA 3QI1A 5C9BA 4F76A 1W5XA 1PSOE 4IVTA 1F7AA 5P5DA 5DPZA 1TCWA 2CEMA 1DP5A 3OHHA 5P37A 4CPUA 5OZCA 1HPOA 2BKSA 3QBHA 2ZJJA 5P4UA 2IRZA 3D91A 3Q4BA 2B8VA 3QAAA 3JVWA 4EXHA 2BQVA 1SP5A 1EBKC 3FNTA 5P3DA 5P7MA 4B1DA 1EC0A 3ZKQA 5P63A 5P5OA 3T6IA 2VA5A 2HIZA 2G26A 4S1GA 3S45A 4Y5MA 1IZDA 2WF2A 1DMPA 3LIVA 1AZ5A 1YG9A 4EP3A 5AHCA 4FAFA 2Q63A 4RVIA 4RROA 3DM6A 1B6MA 2WEAA 3UDRA 3I6OA 3FNSA 4GJ6A 5OZGA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 3NU4 A;  4KE0 A;  1HII A;  1HSH A;  4RZ1 A;  1CPI A;  5OZK A;  5P29 A;  1QDM A;  2A1E A;  4Y4T A;  1BDR A;  1KJ7 A;  2NTR A;  3KT5 A;  1RPI A;  4GJ5 A;  5OZA A;  3F9Q A;  4DQB A;  3IAW A;  1FMB A;  5P5W A;  5P27 A;  5P1L A;  4Y5K A;  4Q1Y A;  3NU5 A;  1ZSR A;  5P1E A;  5P18 A;  2HB2 A;  3SAA A;  5P85 A;  3LIX A;  3SKG A;  3R1G B;  5DR4 A;  4WY6 A;  4NJV A;  5P3P A;  4YCK A;  3QIH A;  4FS4 A;  1YTG A;  5P7Y A;  4D89 A;  5IS4 A;  2VIJ A;  1GVW A;  3OWN A;  1G6L A;  3EKX A;  3Q5H A;  4L7H A;  4Y41 A;  1MVP A;  2OF0 A;  1MT7 A;  5P0Q A;  1TSQ A;  3VYD A;  4L7G A;  4JPC A;  5P14 A;  3H0B A;  2J9J B;  1BV7 A;  4XX4 A;  9HVP A;  5P0K A;  5I3W A;  1D4J A;  5IVT A;  3OY4 A;  3LIN A;  2R3W A;  2RSP A;  4Y3R A;  5P4Z A;  5P4P A;  5P66 A;  1FF0 C;  1FG8 C;  4J0Z A;  5P74 A;  2XFI A;  1GNN A;  5P86 A;  1D4H A;  1QBR A;  2PK6 A;  3OTY A;  2Q54 A;  5OZ1 A;  3VV6 A;  1AXA A;  1EPR E;  4OBD A;  5JFP A;  5KR0 A;  3UQU A;  1T7K A;  2OHQ A;  5HDX A;  5P8G A;  1E81 E;  4FM6 A;  2FGU A;  2FXE A;  2BPW A;  5P2I A;  5P5I A;  5OZ7 A;  5P3C A;  3GW5 A;  2BB9 A;  2HPF A;  5P7K A;  4FLG A;  1PRO A;  2BPZ A;  3DV1 A;  5P57 A;  4HLA A;  5P3B A;  5P82 A;  4DVF A;  4X2L A;  5P5H A;  5P3T A;  3L5B A;  2Z54 A;  1HXW A;  3VLB A;  5OZO A;  3TPJ A;  4DJW A;  3ZKI A;  1IZE A;  1PPL E;  5P6S A;  1XDH A;  3UFN A;  4ZSM A;  4FE6 A;  5P8V A;  4IVS A;  5P7B A;  2F81 A;  3WB4 A;  3GI4 A;  4HDF A;  3D3T A;  4Y5E A;  1HVK A;  4RCF A;  1A30 A;  1AJX A;  3K1W A;  4RCE A;  5BRY A;  5P06 A;  5P68 A;  4I0F A;  3L58 A;  2IKU A;  1LZQ A;  4A4Q A;  3SPK A;  3OGP A;  5SZ9 A;  2G1Y A;  4ZPG A;  4CPX A;  2G20 A;  3GGU A;  5P8P A;  4FSE A;  1M4H A;  5F00 A;  1YM2 A;  4I8Z A;  2NR6 A;  3PJ6 A;  2NMY A;  5P15 A;  4YD7 A;  5P0Z A;  3T3C A;  3VFA A;  4ZPF A;  3R2F A;  3ER3 E;  5P3F A;  5AHB A;  5P3A A;  4Y5A A;  5P88 A;  4J1E A;  6APR E;  3MSL A;  4J1F A;  1AAQ A;  2ZJM A;  3OU1 A;  5AH8 A;  4YCT A;  2R3T A;  5OZD A;  3UDJ A;  4FSL A;  3DV5 A;  4H3J A;  3HW1 A;  4DJU A;  5P3W A;  3C9X A;  1PPM E;  5P59 A;  1HHP A;  2AZ9 A;  1SME A;  1M0B A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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