4PYVA

Crystal structure of renin in complex with compound4
Total Genus 90
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
90
sequence length
338
structure length
335
Chain Sequence
LGNTTSSVILTNYMDTQYYGEIGIGTPPQTFKVVFDTGSSNVWVPSSKCSRLYTACVYHKLFDASDSSSYKHNGTELTLRYSTGTVSGFLSQDIITVGGITVTQMFGEVTEMPALPFMLAEFDGVVGMGFIEQAIGRVTPIFDNIISQGVLKEDVFSFYYNRDSQSLGGQIVLGGSDPQHYEGNFHYINLIKTGVWQIQMKGVSVGSSTLLCEDGCLALVDTGASYISGSTSSIEKLMEALGAKKRLFDYVVKCNEGPTLPDISFHLGGKEYTLTSADYVFQESYSSKKLCTLAIHAMDIPPPTGPTWALGATFIRKFYTEFDRRNNRIGFALAR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Structure-based design of substituted piperidines as a new class of highly efficacious oral direct Renin inhibitors.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Renin
molecule tags Hydrolase/hydrolase inhibitor
source organism Homo sapiens
total genus 90
structure length 335
sequence length 338
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.4.23.15: Renin.
pdb deposition date 2014-03-28

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00026 Asp Eukaryotic aspartyl protease
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.40.70.10 Mainly Beta Beta Barrel Cathepsin D, subunit A; domain 1 Acid Proteases 4pyvA02
2.40.70.10 Mainly Beta Beta Barrel Cathepsin D, subunit A; domain 1 Acid Proteases 4pyvA01
3TNEA 2WEBA 1MRXA 3EM6A 2F3FA 4YDFA 4Y4EA 3O9CA 1LEEA 1ZP8A 2AODA 2H6SA 3SA7A 1DMPA 3PMYA 1HPXA 4EJ8A 1E5OE 5P6UA 5P1TA 5P53A 7HVPA 3OXXA 2PYNA 3MSKA 3SA6A 3OUDA 1OEXA 4GJ6A 4Y4GA 4F73A 5P0JA 3GGAA 3IA9A 5P29A 6FIVA 5P40A 5IVQA 3UQXA 4HEGA 2VNNA 5AH7A 3R0YA 4ACXA 4NJUA 3NXNA 3NXEA 1YTGA 3EL4A 5P4YA 1EC2A 3ER5E 2HC0A 4Y4BA 1A94A 1DIFA 1B6PA 5P4EA 3FKTA 5P8TA 5P2FA 4Y3SA 3OTSA 5P25A 3EXOA 5P4VA 2QZWA 5P14A 1IZDA 4GMIA 4QJ6A 1K6PA 4RCFA 2OAHA 4CPWA 3ZPUA 3FIVA 5P7OA 4I0DA 4CPSA 2B7FA 3NSHA 2ZJJA 3ZKXA 4B1EA 3AUPA 1G2KA 2HPEA 5DPZA 2OHLA 3OU1B 5P8EA 4COEA 2NMZA 5P4NA 5B18A 4DJRA 3GGVA 5P7IA 5P6PA 3CYXA 1LF4A 3TPPA 1K1TA 5P55A 3K5FA 2I4WA 4GJ9A 4A6BA 3OUCA 3KFPA 3EKVA 4RVJA 2V13A 4DJXA 2AIDA 4FIVA 5OZLA 5P1VA 5T4SA 4OD9A 3D3TA 1EBYA 4D88A 4CMSA 3CIDA 3NR6A 2ZJKA 4DQCA 5P6VA 3QS1A 1MESA 5P5UA 3TPLA 2FMBA 5P7MA 4Y53A 3VV6A 5P2GA 5P1EA 5P2YA 3QPJA 5P01A 4FRIA 2G1YA 1BXOA 3NDTA 3DCKA 3HZCA 2AOJA 1A8KA 1TW7A 5HDXA 3SABA 5P1CA 1UH8A 2IKUA 1LF3A 4PZXA 2UXZA 5OZ5A 4LAPA 4Y3GA 1ZPKA 4OBZA 3PSGA 3QBHA 4MC2A 5OZFA 1UH9A 5P0RA 2QCIA 1QS8A 3APRE 4J1KA 3ER3E 3BXRA 5P84A 4J5JA 4H3GA 4OBHA 3ZKMA 5SY2A 5HE5A 5P0GA 2G20A 2QZLA 2FIVA 5P3MA 3S2OA 1GVXA 5P3FA 1F34A 4ZPFA 2IRZA 5P5MA 5AGZA 5KR8A 4YD7A 1MERA 1HIHA 4EXHA 4Y5LA 1E80E 3URIA 3S54A 1A9MA 2V11C 5P0BA 2A1EA 4PZWA 4YD5A 5P66A 3I6OA 3NYGA 2ZHTA 5P45A 2OHQA 3PLDA 4DQHA 2Z4OA 4EJDA 2V00A 3VCMA 3UDMA 1MVPA 4Y3FA 4XX3A 1EPRE 5DR7A 3EKXA 4Q1NA 5P48A 1AJVA 5P56A 4Z4XA 2ZHRA 5DQ5A 1HSHA 5P3UA 4EP2A 4Z22A 3LPKA 2OHSA 5OZ6A 3LPJA 4PYVA 3SACA 1B6KA 1K6CA 1KJFA 2Q54A 3TTPA 4ACUA 4J1CA 3RTMA 4Y5NA 4WY6A 3SM2A 4QJ7A 5I3WA 4RVXA 2ZJLA 2ANLA 2G94A 2P3CA 5P3WA 2Q5KA 4R93A 2CEJA 5P2QA 3R0WA 5P17A 1GNNA 2O4NA 1YM2A 3KDCA 2FNSA 3TKGA 4R95A 1AJXA 1QBRA 2PSGA 3BRAA 4I8ZA 2QU3A 2F81A 5P2DA 3IGBA 5P4MA 3PB5A 5IVTA 5P4KA 2HB3A 1IBQA 1APWE 4GB2A 5P1GA 3R4BA 5P4DA 2R5PA 5P41A 3OU4A 3IXOA 3Q70A 4AA9A 2PQZA 3UQWA 2MIPA 5P5WA 5P5NA 2UY0A 3HAWA 3L38A 4D89A 5OYQA 1W6HA 4B78A 1DPJA 2ZGAA 2VS2A 3RU1A 3CMSA 3MWSA 3IVHA 3TOGA 5JFPA 3I25A 3KYRA 1D4IA 5P57A 3OQAA 3VLAA 1XE5A 2P3DA 4Y51A 4EQJA 3NDWA 1B5FA 3OHFA 5ENMA 3PSUA 1D4LA 1FMBA 5JG1A 3PSYA 4B70A 3T11A 2QD6A 4XX4A 3LZSA 1FMUA 5P44A 5OZTA 1KZKA 1NSOA 4GJCA 1BVEA 2AOEA 3SA8A 5P63A 4JPCA 1W50A 4Y4WA 5FIVA 5SY3A 1HTGA 2I0AA 1EPLE 4Y6MA 3SAAA 4Y38A 3VSWA 2O4KA 3L5DA 5P3QA 3CYWA 1VIJA 1CZIE 5P58A 4ZSPA 3SM1A 2ZJMA 4Y3AA 3D1ZA 5P78A 4J0PA 1M0BA 3SA5A 1MSNA 3NU4A 3T3CA 3N4LA 2AOHA 3EMYA 3HVGA 3GI4A 5P79A 4X2LA 4Y5PA 3VYDA 1W51A 1PROA 3L5BA 5P6DA 3F9QA 2QI3A 3M9FA 1EEDP 3LHGA 3AIDA 5P2OA 5P7JA 1APVE 2IGYA 2NNKA 1HVHA 3TPRA 2Q3KA 2PSUA 2FXDA 1FEJC 1MTRA 1FF0C 3ZKSA 1T7KA 4FM6A 5AHAA 3PLLA 5P2LA 2RMPA 3PHVA 1ZTZA 5P37A 5P2BA 5HCOA 3RSXA 5P2CA 1XN2A 4I0JA 1SDVA 1IVPA 2Q11A 5P73A 4Y5BA 5P6IA 5KQYA 1FQ7A 5OZZA 2NNPA 5P6GA 3KM4A 5OZNA 3OXCA 2R8NA 4Y4DA 5P3CA 3KT5A 3NWQA 1GVTA 1TCXA 3QAAA 2WJOA 5OZCA 3DUYA 5P19A 3L5CA 3N3IA 2WF3A 5P5XA 4FS4A 3KFRA 2HPFA 4UPJA 4FSLA 5P6JA 1HSGA 3UDYA 4DQFA 5OZWA 5P8LA 4Q1YA 3SKFA 3LIXA 2QI0A 5P00A 4J0YA 2BBBA 2P8HA 4CPQA 4LBTA 3D1YA 1NPWA 4HDBA 4DV9A 1A8GA 4DJWA 3ZPTA 1IZEA 1YG9A 5P6EA 1HTRB 3MSLA 2VNMA 4Y5EA 5E5KA 1AXAA 2QK5A 4RRNA 5P39A 2ZJHA 3NWXA 2OHKA 1EPME 2RKGA 4QLHA 2WHHA 5OZYA 1AZ5A 3DM6A 1FFIC 3G70A 3OUAA 2Q63A 4ER1E 3VV8A 1LS5A 1HWRA 4IVSA 3BUHA 3QRMA 3TL9A 4CP7A 4YOAA 3L5EA 5P8IA 5P1WA 3Q5HA 1YT9A 4GJ5A 1PSAA 1KJHA 7UPJA 4Y54A 5P3YA 3EM3A 3IN3A 2NXLA 2NR6A 5P72A 4I0GA 1YTHA 1RQ9A 4HVPA 1PPKE 1Z8CA 1MSMA 1SH9A 5P81A 4D8CA 4J1FA 5SXNA 2SAMA 1OEWA 3HBOA 3C9XA 5P50A 1NPVA 3PVKA 3VEUA 1LZQA 4L7GA 4F74A 5P5SA 5P20A 3VFAA 4FL8A 5P2HA 3S7MA 1MIQA 5P4LA 5TOLA 2B8LA 5OZBA 3EKQA 4KE1A 2XFJA 5I3VA 1HIIA 3BVBA 5P6WA 5P7YA 2F8GA 1MT9A 2ER9E 4MC9A 4D83A 3SQFA 5P7AA 4GJDA 5P2RA 3CIBA 3O99A 5P7XA 4HDFA 4DVFA 4Y3DA 5COOA 1MPPA 1FG8C 2ZHUA 2I4QA 2R38A 5P60A 5P62A 3LIYA 4J0VA 3UHLA 5J25A 5P59A 2BPZA 2VA6A 3ZKIA 5P2SA 2WEZA 3BVAA 4Y5MA 3O9LB 2I0DA 3UQPA 1LYBA 3BC4A 3OTYA 4YCTA 4DJUA 2BJUA 5P87A 2WEDA 3QN8A 3JVWA 1WBKA 2NXMA 4NPUA 3IAWA 3UDKA 5P0LA 3PGIA 2QI1A 4FRJA 5DR3A 2JJJA 2PH6A 4IVTA 2FDEA 3BGBA 1HBVA 3URJA 4GIDA 4Y4JA 4YD3A 3IN4A 9HVPA 5OZEA 5P47A 3L58A 2HAHA 4TVHA 5P36A 1BBSA 5P3ZA 5P4XA 1ZAPA 2B42A 4I0ZA 1HVIA 4HA5A 3BGCA 3O9AA 4EJKA 5BWYA 4B72A 4L7JA 2G1SA 5P0XA 1Q9PA 3ST5A 4Y3NA 2OF0A 3L3AA 5P08A 5P8SA 4Y3HA 1G35A 5HVPA 4OBKA 4ZIPA 4CPRA 5P5GA 1B6MA 3QVIA 5P6CA 4AUCA 1K6TA 3OOZA 5P51A 1D4YA 5P2AA 2VIEA 4Y39A 3O9IA 5P77A 5P2EA 1W5XA 3VYEA 1ZSRA 4YCKA 4DJVA 3K5CA 2VJ9A 4YOBA 3WZ8A 2G1RA 5DQ1A 5P0QA 5HE7A 5P8UA 3NLSA 2Q55A 4YCYA 3G72A 3QP0A 3UDRA 3PWMA 4RYCA 4Y3QA 2B8VA 3PBDA 2V12C 3QI1A 5OZPA 3OK9A 5P5KA 1B11A 5HTZA 3DOXA 3TKWA 2G27A 5OZGA 2G1OA 4JP9A 5P83A 1MRWA 3QRVA 4J0ZA 4LHHA 3EC0A 3OQFA 4OBDA 3QBFA 1BDQA 4RROA 4Y4XA 2VA5A 1FG6C 5OZOA 2CENA 5P5AA 1LF2A 4EJLA 5ISKA 2H6TA 4J1EA 5P2ZA 4GJ7A 5OZ4A 5P2WA 3KDBA 4OBGA 1HVRA 3OADA 5HDVA 5PEPA 1NPAA 3UDJA 4YDGA 5KR2A 1UH7A 1ODYA 4I11A 4Y3TA 5P1SA 2PK6A 3UQRA 4CPTA 5P6BA 4AMTA 4Y36A 5P8RA 1HTFA 2AVOA 5DR1A 2G24A 5OZSA 2QP8A 5P65A 5OZ2A 2VIZA 1SDTA 4B00A 4U7VA 2QZKA 3HDKA 3INDA 1QRPE 3I8WA 1AAQA 3WZ6A 4HLAA 5KQFA 2QMFA 4H3FA 2BKTA 5P85A 2AVSA 4Y3YA 3GW5A 4LXAA 1A30A 4L7HA 1JLDA 1FFFC 1APUE 1BAIA 3INHA 3KFSA 5P24A 5P5CA 5P7BA 4Z50A 4A4QA 3PRSA 4J0TA 5OYVA 5KAOA 4K8SA 5ER1E 2QAKA 4CKUA 5P8HA 1DW6C 1N49A 5P5OA 2QMDA 5P7FA 3K5DA 4Y3XA 5OYWA 4I8WA 5P07A 2I4UA 1ODWA 5P3GA 4R92A 3EL5A 4Y3EA 3TH9A 3SO9A 5HDUA 1ZBGA 4J17A 3ZL7A 5P1BA 3SA9A 2BPVA 2QNPA 3BUGA 5P34A 2OHMA 4ER4E 2AZ9A 2ZHSA 1HXWA 2FXEA 3S45A 1HVLA 1IVQA 5OZIA 5P4QA 5P6AA 4KB9A 4YBIA 2FDPA 2XFIA 1SIVA 3VF5A 5P2JA 5P7SA 5P8BA 1HRNA 3WB4A 2XFKA 3D20A 5OZUA 1TSQA 5P6KA 5P6NA 5P8JA 1FKNA 5P6QA 5OZMA 3OU1A 3KMXA 5P11A 4ZPGA 3I2LA 3ZKQA 2R9BA 4Y43A 5P1MA 5P7QA 5P3HA 5P6FA 2BPWA 5P7LA 3NU3A 2BB9A 5P1YA 4NJVA 2IL2A 3O9DA 3EKWA 4DQEA 1QBSA 2CEMA 5P4IA 4ZSQA 3U6AA 3NU6A 1YX9A 1D4SA 4RVIA 1HPVA 1ZSFA 1MEUA 4M8XA 5P30A 5P3AA 5OZHA 2G21A 5P18A 4Y50A 5I70A 3R2FA 2QMPA 4Y35A 4Y4TA 4R5NA 4I1CA 4FCOA 1CPIA 2ER7E 5P2IA 4FM7A 3EL9A 2ZE1A 1HTEA 5P22A 5P28A 5P1LA 2BPXA 5IVSA 3S56A 4RYGA 2VJ7A 4Q1XA 1HVJA 2QI6A 3K1WA 2VIJA 1BDRA 1B6JA 5CONA 2QNQA 5P2MA 4EP3A 3ECGA 1FIVA 1W5YA 2QNNA 4B1DA 1IIQA 1RPIA 2AOGA 5P4WA 5P02A 4Y4AA 5SZ9A 3CKPA 1B6LA 4Y56A 5IE1A 2P3BB 2WKZA 1EC0A 1DP5A 5DGUA 2I4VA 3GI0A 4GYEA 2QI7A 2PWCA 5P6ZA 2IEOA 2QD8A 2HB2A 5APRE 1AIDA 1ZJ7A 4H1EA 3KT2A 5P69A 3D1XA 4YE3A 2O4LA 3VSXA 4L1AB 2P83A 4K9HA 5P3LA 5P4TA 5P33A 2WECA 5P5EA 3LITA 1K2BA 2F3EA 5P4GA 3LINA 5AHBA 2JE4A 1RNEA 3KF0A 5OZ0A 4OC6B 3UTLA 2FS4A 2R3WA 5DGWA 1BIMA 5P0PA 5HE4A 3ZOVA 4Y57A 4WY1A 3PBZA 3Q4BA 5P88A 3UFLA 3MXDA 1RL8A 1YTIA 3UDHA 4LC7A 5AH6A 1SBGA 3VF7A 3VFBA 3TLHA 3NDXA 5P86A 2V10C 5P13A 4OBJA 4B0QA 3CICA 4HE9A 1HIVA 5P3NA 3INFA 4YA8A 3S43B 1HPSA 4RCDA 1T7JA 1KJGA 2OHRA 5P3JA 5P8MA 3RTNA 4I0IA 3RVIA 1SMEA 6UPJA 5E5JA 2PH8A 1GNOA 5P4BA 1SMRA 5F01A 2J9KA 5DR4A 4Y5CA 1IDBA 3DK1A 2EWYA 5AHCA 4PEPA 4FRKA 1KJ7A 2NTRA 4LXMA 1LYAB 1G6LA 4I12A 4ZLSA 5P3RA 2VIYA 2P3AA 5P1HA 2VKMA 5P0CA 1HVSA 1XN3A 5P0AA 4TVGA 2P4JA 2AZBA 2IS0A 4Y45A 5P1KA 1AM5A 3UCBA 3BHEA 3PMUA 3NUOA 2AVQA 5P5DA 5P4JA 3GGXA 5P6LA 1BXQA 5OZKA 5P5FA 2V0ZC 5P0SA 4I0EA 3QVCA 4JOOA 2ZJNA 4APRE 3LNKA 4MC6A 1FQ4A 5P8DA 4Q1WA 4ZE6A 2IKOA 2APRA 5P61A 3OY4A 3SA4A 1OD1A 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 3TNE A;  2WEB A;  1MRX A;  3EM6 A;  2F3F A;  4YDF A;  4Y4E A;  3O9C A;  1LEE A;  1ZP8 A;  2AOD A;  2H6S A;  3SA7 A;  1DMP A;  3PMY A;  1HPX A;  4EJ8 A;  1E5O E;  5P6U A;  5P1T A;  5P53 A;  7HVP A;  3OXX A;  2PYN A;  3MSK A;  3SA6 A;  3OUD A;  1OEX A;  4GJ6 A;  4Y4G A;  4F73 A;  5P0J A;  3GGA A;  3IA9 A;  5P29 A;  6FIV A;  5P40 A;  5IVQ A;  3UQX A;  4HEG A;  2VNN A;  5AH7 A;  3R0Y A;  4ACX A;  4NJU A;  3NXN A;  3NXE A;  1YTG A;  3EL4 A;  5P4Y A;  1EC2 A;  3ER5 E;  2HC0 A;  4Y4B A;  1A94 A;  1DIF A;  1B6P A;  5P4E A;  3FKT A;  5P8T A;  5P2F A;  4Y3S A;  3OTS A;  5P25 A;  3EXO A;  5P4V A;  2QZW A;  5P14 A;  1IZD A;  4GMI A;  4QJ6 A;  1K6P A;  4RCF A;  2OAH A;  4CPW A;  3ZPU A;  3FIV A;  5P7O A;  4I0D A;  4CPS A;  2B7F A;  3NSH A;  2ZJJ A;  3ZKX A;  4B1E A;  3AUP A;  1G2K A;  2HPE A;  5DPZ A;  2OHL A;  3OU1 B;  5P8E A;  4COE A;  2NMZ A;  5P4N A;  5B18 A;  4DJR A;  3GGV A;  5P7I A;  5P6P A;  3CYX A;  1LF4 A;  3TPP A;  1K1T A;  5P55 A;  3K5F A;  2I4W A;  4GJ9 A;  4A6B A;  3OUC A;  3KFP A;  3EKV A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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