4RRSA

8-tetrahydropyran-2-yl chromans: highly selective beta-site amyloid precursor protein cleaving enzyme 1 (bace1) inhibitors
Total Genus 106
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
106
sequence length
400
structure length
393
Chain Sequence
FVEMVDNLRGKSGQGYYVEMTVGSPPQTLNILVDTGSSNFAVGAAPHPFLHRYYQRQLSSTYRDLRKGVYVPYTQGKWEGELGTDLVSIPHGPNVTVRANIAAITESDKFFINGSNWEGILGLAYAEIARPDDSLEPFFDSLVKQTHVPNLFSLQLCGSEVLASVGGSMIIGGIDHSLYTGSLWYTPIRREWYYEVIIVRVEINGQDLKMDCKEYNYDKSIVDSGTTNLRLPKKVFEAAVKSIKAASSTEKFPDGFWLGEQLVCWQAGTTPWNIFPVISLYLMGEVTNQSFRITILPQQYLRPVEDVATSQDDCYKFAISQSSTGTVMGAVIMEGFYVVFDRARKRIGFAVSACHVHDEFRTAAVEGPFVTLDMEDCGYNIPQTDESRSHHHH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title 8-Tetrahydropyran-2-yl Chromans: Highly Selective Beta-Site Amyloid Precursor Protein Cleaving Enzyme 1 (BACE1) Inhibitors.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Beta-secretase 1
molecule tags Hydrolase/hydrolase inhibitor
source organism Homo sapiens
total genus 106
structure length 393
sequence length 400
ec nomenclature ec 3.4.23.46: Memapsin 2.
pdb deposition date 2014-11-06

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00026 Asp Eukaryotic aspartyl protease
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.40.70.10 Mainly Beta Beta Barrel Cathepsin D, subunit A; domain 1 Acid Proteases 4rrsA01
2.40.70.10 Mainly Beta Beta Barrel Cathepsin D, subunit A; domain 1 Acid Proteases 4rrsA02
4F76A 1JLDA 3SA5A 3QVCA 3GI6A 3NWQA 4Y50A 5BWYA 1QBTA 4MC9A 5P3OA 5IVRA 1G0VA 5HDZA 4J1KA 3O9FA 4ER1E 4N00A 5P3PA 5P0LA 3FNTA 3GI4A 4Y4GA 5OZJA 2F8GA 4K8SA 1EPNE 5P49A 4Y5GA 3BC4A 5OYXA 5P5OA 4QJ8A 3KM4A 5P6IA 3PM4A 3INHA 4EJLA 2MIPA 5P7ZA 3QP0A 2CEMA 4Q1WA 1APUE 1ZTZA 1TSUA 5DR7A 5P0EA 4HEGA 3HBOA 5P15A 4CMSA 3PSUA 1M43A 4YBIA 3NSHA 5OYZA 4Y35A 1T6GA 5P7LA 1AXAA 2AZBA 1BV9A 3ZKSA 3PBDA 5P6GA 3DK1A 1W51A 5OZ8A 1HTFA 3S7MA 1G6LA 5P2CA 3UDKA 3DCKA 4PZXA 3MSLA 3DUYA 5KQXA 2P3CA 3S54A 5P8SA 4HA5A 5P77A 1WBKA 1M0BA 1PPKE 1ODYA 5P73A 1FFFC 4ZEAA 5B18A 3DCRA 2A1EA 3H0BA 5P31A 4LXMA 3S7LA 3F9QA 4Y5KA 1HVSA 4L7HA 3BUHA 5OYQA 5P1VA 4B1CA 3R1GB 5P3TA 2BPVA 3OUDA 2P83A 2NXLA 3KMXA 1HPOA 1LF3A 5OZ5A 3KFSA 5P2HA 3MSKA 3NXNA 1YTIA 3PHVA 3PWRA 5HU0A 5AHCA 3SA4A 5P3HA 3UQUA 3TOHA 5DPZA 2P4JA 3EL1A 5P3CA 3QIHA 4RGHA 5P82A 1EPQE 5HDUA 5SZ9A 5P2NA 2FNSA 3H5BA 5OYSA 4KB9A 5P3YA 2OHPA 3ZPSA 4DPIA 4J0YA 2WEAA 3OUAA 2IGXA 1MEUA 1AZ5A 4Y4JA 2VS2A 4DH6A 5P8EA 4QJ6A 2IGYA 5P59A 5P7YA 3KFRA 4CKUA 3OUDB 1XE6A 3I8WA 3VV8A 1E81E 1XL2A 2B7ZA 3EMYA 4ZE6A 1D4IA 9HVPA 2NNPA 4IVTA 5P5FA 2Q3KA 2OF0A 3TL9A 1YTGA 1W6IA 2WEBA 5P1IA 4GJAA 3URJA 3GGVA 3SABA 3VF5A 3O9AA 3GI5A 1AJVA 1HPSA 3HVPA 3SPKA 2R43A 1FMBA 4NPTA 5P2MA 5ISKA 2OHLA 4GJDA 2AODA 4NJSA 5P0NA 5P7WA 4B77A 1QRPE 4DPFA 3ER3E 4S1GA 4I0DA 1T3RA 3NR6A 2QI4A 3LZSA 2BB9A 4Y54A 5P37A 5SY3A 1YM4A 5P8TA 3TTPA 2IL2A 4E43A 3QROA 3OADA 2R5PA 1GNMA 3O9CA 3TKWA 2VJ7A 3O9LA 1XN2A 5P4VA 3EM6A 1HBVA 3QRMA 1SDUA 4JECA 1TCWA 2G27A 3PGIA 5P6WA 3TH9A 5P33A 2RENA 2QI6A 4Y5NA 4I12A 5P1ZA 3NU5A 3EKVA 1META 4Q5MA 2Q5KA 3KF0A 5P7XA 5P7FA 2O4NA 1EC3A 5P28A 1EBKC 4ER2E 5P1RA 4Y5EA 4PPHA 5P0GA 1HOSA 5P3KA 1HVJA 4FL8A 1CZIE 5OZNA 2Z54A 4WY6A 4BEKA 2OHKA 5IVQA 3OUBA 5P4UA 3WZ6A 5P44A 2G1OA 2V12C 4Y4UA 4HZTA 4QJ7A 3INFA 5OZKA 5P1JA 5P81A 3KYRA 4ACUA 1PFZA 5P7KA 5I3VA 3L5DA 3L59A 2QD6A 5P6AA 4FIVA 1BBSA 5P1SA 3FSMA 5P4CA 5P8QA 3D1YA 2BJUA 1MT8A 5P0DA 5P80A 3QBFA 2OHUA 1OEXA 5P55A 2V13A 5DR3A 1A94A 5P2FA 3OU4B 3VUCA 5J25A 3IVIA 1IIQA 5P7QA 4EYRA 4D89A 3TNEA 2PWRA 3VSWA 3PLLA 5P52A 5P6NA 4D88A 2R5QA 5P1NA 3UHLA 1RNEA 1HVRA 1B6MA 3BVAA 1FQ7A 5P5ZA 5P3MA 4Y56A 5DGWA 3OGPA 2QI3A 2J9JA 5HE4A 5P47A 4U7VA 5P4QA 3NU6A 4GJ6A 4Y3JA 4LP9A 3UDQA 5P86A 1DAZC 3EL5A 5P57A 5P8VA 4I11A 3OHHA 4L6BA 5KR0A 3T7XA 5ER1E 5P74A 3PWMA 3KDCA 2QD7A 1PPME 2AVOA 5HCOA 1M4HA 2QU2A 1EBZA 3FIVA 4LC7A 6UPJA 5KR8A 1HPXA 3I2LA 4MC1A 5P3JA 3APPA 5P7EA 2WF4A 2IRZA 2AIDA 4EJ8A 2QU3A 2J9JB 3TOFA 3EL0A 1MVPA 5P6EA 3UDYA 2F3EA 2WEDA 4EXHA 1AVFA 4GJ7A 1HVCA 1KJGA 1BWBA 1HRNA 3WB4A 5P1BA 2WHHA 3NUJA 2PSGA 1CMSA 3APRE 3ZKGA 3LPKA 4FRIA 4EP3A 5P1QA 2XFJA 2WEZA 2JE4A 1SMEA 3CMSA 3LIXA 5P3ZA 3WZ7A 5P7HA 3D91A 5P8JA 1ZPAA 3FNSA 5P0XA 5P85A 5P7JA 1RV7A 5I70A 3VFBA 4PZWA 2ER0E 5OZMA 5P8GA 1LYAA 5OZZA 5P67A 5OYRA 4FE6A 3OU3A 5P3QA 5P1XA 1MRWA 2ANLA 2QZKA 5P70A 4QJ9A 1T6EX 4QLHA 4Z50A 4J1IA 5FIVA 3K5FA 2F80A 4K4RA 5P02A 3OWNA 1EPOE 2I0DA 3CYWA 5OZSA 2QZWA 2JYSA 1ODXA 3T7QA 2NNKA 4K4QA 5P58A 4XX3A 4H1EA 3EKYA 1APVE 4RYCA 2APRA 3KFNA 5P4PA 1W5WA 1LYAB 1HEGE 3LPIA 5P6LA 3TPLA 2XFKA 5P0MA 1GKTA 4D83A 3BGBA 5P26A 3PSGA 3T11A 3BXRA 5KR2A 3IA9A 1C6XA 4H3IA 5P6RA 3L38A 3PB5A 1D4JA 4Y3NA 5P36A 2ASIA 4Y43A 4LBTA 1K6VA 3WB5A 4ACXA 5KR1A 1HIHA 3PWWA 2FMBA 5P3XA 2QZLA 2I1AA 1IZDA 4B70A 4Y3XA 3OUCA 5P42A 4Y47A 3RTMA 1MESA 4Z22A 5P5GA 4R92A 3L5CA 4APEA 1MT9A 5P0KA 4PYVA 1CPIA 4GYEA 4Y5MA 1YTHA 5P01A 5APRE 4J0TA 2PK6A 4R93A 1MT7A 4RRSA 2WF2A 1BAIA 4AMTA 4CPRA 5OZYA 5I3WA 3OAGA 4J0ZA 3RTNA 5KQZA 1B11A 3DV1A 3MXDA 3T6IA 2B60A 5P3VA 4DI2A 3K5DA 5AGZA 5EZZA 5P18A 4DJOA 4F73A 2QI0A 5C9FA 4RYGA 5P0WA 3UDJA 4NJTA 2HB4A 1W5XA 4I1CA 4DQHA 1DMPA 5AH7A 5P45A 3HLOA 2PK5A 4Y3TA 3NLSA 3NU4A 5DQCA 4TRYA 3OTSA 4I0ZA 4ZSPA 2HIZA 2Q11A 1YX9A 3FV3A 1J71A 4Y9WA 5P5HA 1MERA 5P7BA 5P2UA 4J5JA 2QI5A 3L5FA 5P1EA 3O9GA 1MSMA 2PMAA 2V0ZC 4OBFA 3LINA 2AOIA 3AIDA 4RVJA 4KE0A 5OZ3A 3CICA 2HB3A 3Q3TA 2UXZA 3MWSA 1F34A 2QMGA 4OC6A 3ZPTA 1FMUA 1TSQA 5P6MA 3S85A 5P22A 3IXJA 3PI0A 5P03A 5P2OA 2QZXA 3UFLA 4ZLSA 3PVKA 2JJJA 1EPLE 4OBZB 1APTE 4Y3DA 1T7KA 1FQ4A 5P3DA 5P10A 1SDTA 1NSOA 4YCTA 5P8UA 5KQYA 3WZ8A 4DJXA 5P6JA 2Z4OA 5P8CA 4Y3PA 1K1TA 5P2EA 3EKWA 5P5SA 5P13A 3RU1A 5P5PA 5OZ0A 1B6JA 5P6DA 4OC6B 5P3RA 2ZJNA 4XXSA 2G20A 5OZIA 2IS0A 1UH8A 1HTGA 5P8OA 3KT5A 4I0GA 2QHZA 4HDFA 2ZJHA 4EQJA 3EM4A 3BVBA 3VFAA 4DJPA 4Y5PA 3NWXA 3OQKA 3D3TA 3B7VA 5HE5A 1D4LA 3VYDA 3Q6YA 5P5YA 1K6PA 5P6FA 3Q4BA 4GB2A 2IKOA 3S56A 1IZIA 3JW2A 3WSJA 4LXAA 1FF0C 2QI1A 1WBMA 5OZCA 4RVIA 5P00A 1Z1HA 3IAWA 4OBGA 5P29A 3DV5A 5P6KA 2IKUA 3QBHA 1SH9A 3BRAA 5P2RA 4DVFA 4YDFA 5OZBA 1K6TA 2ZJIA 2QMDA 3TKGA 5P7IA 3QVIA 4DQGA 3FNUA 5ENMA 4L7GA 1XE5A 1BDQA 4Y57A 2AOFA 1EC0A 2EWYA 7UPJA 4Q1NA 5OZ2A 3IGBA 5P1GA 4J1HA 5P39A 3URLA 5P53A 1HHPA 2V00A 3CKPA 4GJ8A 1XDHA 1W50A 4AUCA 2XYEA 2HS2A 3OOTA 5P7OA 1BIMA 4R5NA 3ZKXA 4NKKA 3O9DA 3R4BA 3ZKIA 3PBZA 5P27A 3HZCA 3PJ6A 5P1MA 3C9XA 2WKZA 1FGCC 4I0EA 4DJYA 3SAAA 4RLDA 4YE3A 5P4ZA 2V11C 5P41A 4H3GA 5P25A 5DR1A 3EKQA 2I4DA 5P7CA 1MTRA 3LIQA 5P3IA 1AIDA 1K2BA 5OZPA 1FB7A 6APRE 3PEPA 5JG1A 1D4KA 4CP7A 4GMIA 4GJBA 4I10A 3CKTA 4YOBA 1APWE 3T7PA 5P4BA 3LZYA 1ER8E 3O9IA 1PPLE 5P65A 1EC1A 2PYMA 4Y3FA 3R2FA 5OZGA 2FGVA 5OZUA 2QMFA 3PSYA 3QN8A 4HLAA 3CIDA 5P62A 3ZKNA 2PQZA 5COPA 1GVUA 4WY1A 3OXVA 5P2QA 4CPUA 4EPJA 2BPXA 5P3BA 3IN4A 3LZUA 3K1WA 1MPPA 5P0IA 5P4SA 2Q55A 1FFIC 4FRJA 3LIYA 4GJCA 5HD0A 1OHRA 2P8HA 5P69A 5P3EA 5P6SA 2Q63A 5P2YA 5P12A 5E5JA 3OXWA 3VYFA 1W5YA 4Y4AA 1OD1A 5ER2E 4HDPA 3SM1A 3NYGA 2PC0A 2BQVA 2WF0A 3O9HA 4B78A 1E80E 5P1WA 3MSJA 5OZ6A 1LS5A 1FEJC 2G24A 2FXEA 4B1DA 3SA8A 5P5TA 5OZDA 2FLEA 1BVEA 3NDXA 4FSLA 3TPPA 2H6TA 4DJQA 2HPFA 5C9DA 3VYEA 3NUOA 3QAAA 2F3KA 4RRNA 5P2WA 3BHEA 1SDVA 3OU4A 1HSHA 1HVHA 5OZWA 1ZJ7A 5P84A 2HM1A 3INEA 4QJ2A 1ME6A 4FSEA 5P0FA 1C70A 3TPRA 3LHGA 4L1AB 1IZEA 2HB2A 3NDTA 5P4FA 4TVHA 1KJ4A 4ZPGA 5TOLA 1DPJA 2AVVA 1LZQA 5CLMA 1B6KA 5P2TA 5P6YA 4Y3RA 2I4QA 3KA2A 5P11A 2QCIA 4DQFA 5F01A 4LXKA 5P6PA 3VF3A 5OZHA 5P1UA 1EEDP 4APRE 5IE1A 1HVKA 3PMUA 2VA5A 3OTYA 2QNNA 2Q54A 3ZL7A 2ZJMA 5P4XA 1FIVA 3UQXA 3PCZA 1G2KA 5P06A 5P09A 3CKRA 4GIDA 3SKGA 2R3WA 2VNNA 3GGAA 1PSNA 4Y4EA 2PH6A 5P1DA 3OQDA 3HVGA 3EKXA 5P2KA 5P8MA 3O9EA 4XX4A 4B0QA 1BDLA 1GNNA 4FM8A 5IVTA 2HS1A 5P71A 1HTEA 1DP5A 2VJ9A 2AZ9A 3UDNA 4KUPA 5KQFA 4COEA 1FMXA 5P4GA 2P3AA 3QI1A 5KOSA 5P8AA 3A2OA 1HIVA 5P8KA 5JODA 2AOJA 3KN0A 4JPEA 4EQ0A 5P16A 1UPJA 2NR6A 2ZJLA 1BVGA 5IS4A 3OGQA 5P8FA 5HU1A 5DQ4A 1YTJA 1Z1RA 2RSPA 2BPWA 4MC6A 1PSOE 1LYWB 5OYYA 5P8LA 1EBWA 5P3SA 3KDBA 5KAOA 3ST5A 1C6ZA 1DIFA 4ZPEA 3TLHA 3GW5A 4Y38A 4MC2A 2AZ8A 4WTUA 2R38A 5P6CA 2CENA 5P24A 5P7SA 2QNPA 5F00A 4ZSRA 2VA6A 5P56A 5OYVA 3KFPA 2NPHA 4QJAA 4HE9A 1N49A 2VIEA 5P5BA 2NMYA 5P0ZA 3IVHA 1AAQA 3EC0A 1FQXA 4F74A 4PHVA 3RSVA 2F3FA 4LAPA 3D20A 5P5DA 1TCXA 5P1FA 5P4RA 4BELA 5AHAA 5P2GA 3UDHA 5OZ4A 1LF4A 1C6YA 5P89A 2VIYA 3HDKA 3ECGA 2G1YA 4DJVA 1ZSFA 1QDMA 2V10C 2OHRA 3EBZA 2QK5A 1GVVA 4FLGA 4Y5LA 1TZSA 3Q5HA 5C9BA 2QD8A 3SA3A 1FLHA 5P1YA 4RZ1A 5P3AA 5OZOA 4Y4ZA 4U8WA 2G26A 3NDUA 5P8HA 3SM2A 2PYNA 3EL4A 4GZFA 4Y58A 3S45A 3L3AA 3OU1A 3L5BA 1NPAA 5P5WA 4D85A 4R95A 3D1ZA 1MIQA 2QI7A 5DQ1A 8HVPA 5BRYA 5P7PA 2AVMA 2B8VA 3VV6A 4FAFA 2OHNA 3QPJA 2R8NA 2SAMA 4L7JA 4Y39A 2AOEA 4TVGA 2RMPA 3SKFA 4K4PA 4YOAA 3L5EA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 4F76 A;  1JLD A;  3SA5 A;  3QVC A;  3GI6 A;  3NWQ A;  4Y50 A;  5BWY A;  1QBT A;  4MC9 A;  5P3O A;  5IVR A;  1G0V A;  5HDZ A;  4J1K A;  3O9F A;  4ER1 E;  4N00 A;  5P3P A;  5P0L A;  3FNT A;  3GI4 A;  4Y4G A;  5OZJ A;  2F8G A;  4K8S A;  1EPN E;  5P49 A;  4Y5G A;  3BC4 A;  5OYX A;  5P5O A;  4QJ8 A;  3KM4 A;  5P6I A;  3PM4 A;  3INH A;  4EJL A;  2MIP A;  5P7Z A;  3QP0 A;  2CEM A;  4Q1W A;  1APU E;  1ZTZ A;  1TSU A;  5DR7 A;  5P0E A;  4HEG A;  3HBO A;  5P15 A;  4CMS A;  3PSU A;  1M43 A;  4YBI A;  3NSH A;  5OYZ A;  4Y35 A;  1T6G A;  5P7L A;  1AXA A;  2AZB A;  1BV9 A;  3ZKS A;  3PBD A;  5P6G A;  3DK1 A;  1W51 A;  5OZ8 A;  1HTF A;  3S7M A;  1G6L A;  5P2C A;  3UDK A;  3DCK A;  4PZX A;  3MSL A;  3DUY A;  5KQX A;  2P3C A;  3S54 A;  5P8S A;  4HA5 A;  5P77 A;  1WBK A;  1M0B A;  1PPK E;  1ODY A;  5P73 A;  1FFF C;  4ZEA A;  5B18 A;  3DCR A;  2A1E A;  3H0B A;  5P31 A;  4LXM A;  3S7L A;  3F9Q A;  4Y5K A;  1HVS A;  4L7H A;  3BUH A;  5OYQ A;  5P1V A;  4B1C A;  3R1G B;  5P3T A;  2BPV A;  3OUD A;  2P83 A;  2NXL A; 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 5AH9 A;  5DQ2 A;  5P6Z A;  5AH6 A;  1MRX A;  4OBH A;  3HAW A;  2P3D A;  3IN3 A;  5P4E A;  3OAG B;  5P68 A;  2FNT A;  1SMR A;  5P1A A;  4NJV A;  3QS1 A;  4ER4 E;  5COO A;  2ZHT A;  2PSV A;  2I4V A;  5P5Q A;  4I8W A;  2VJ6 A;  5P5J A;  4Y3Y A;  1A9M A;  2IDW A;  4TRZ A;  4YD6 A;  4FM7 A;  5P0O A;  4X7I A;  3K5G A;  2HAH A;  5P1L A;  5AHB A;  1AM5 A;  1BXQ A;  3UCB A;  4J54 A;  1K2C A;  5P0Y A;  3M9F A;  1OEW A;  5P2X A;  3GGX A;  2ZGA A;  1FQ5 A;  5P7A A;  2ER7 E;  1IDA A;  1U8G A;  1HVI A;  2FIV A;  5P0C A;  1ENT E;  4F75 A;  1XS7 D;  2OHT A;  5P63 A;  3UF3 A; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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