4RYCA

Renin in complexed with 4-methoxy-3-(3-methoxypropoxy)-n-{[(3s,4s)-4-{[(4-methylphenyl)sulfonyl]amino}pyrrolidin-3-yl]methyl}-n-(propan-2-yl)benzamide inhibitor
Total Genus 88
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
88
sequence length
339
structure length
336
Chain Sequence
TLGNTTSSVILTNYMDTQYYGEIGIGTPPQTFKVVFDTGSSNVWVPSSKCSRLYTACVYHKLFDASDSSSYKHNGTELTLRYSTGTVSGFLSQDIITVGGITVTQMFGEVTEMPALPFMLAEFDGVVGMGFIEQAIGRVTPIFDNIISQGVLKEDVFSFYYNRDSQSLGGQIVLGGSDPQHYEGNFHYINLIKTGVWQIQMKGVSVGSSTLLCEDGCLALVDTGASYISGSTSSIEKLMEALGAKKRLFDYVVKCNEGPTLPDISFHLGGKEYTLTSADYVFQESYSSKKLCTLAIHAMDIPPPTGPTWALGATFIRKFYTEFDRRNNRIGFALAR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title trans-(3S,4S)-Disubstituted pyrrolidines as inhibitors of the human aspartyl protease renin. Part I: Prime site exploration using an amino linker.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Renin
molecule tags Hydrolase/hydrolase inhibitor
source organism Homo sapiens
total genus 88
structure length 336
sequence length 339
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.4.23.15: Renin.
pdb deposition date 2014-12-15

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00026 Asp Eukaryotic aspartyl protease
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.40.70.10 Mainly Beta Beta Barrel Cathepsin D, subunit A; domain 1 Acid Proteases 4rycA02
2.40.70.10 Mainly Beta Beta Barrel Cathepsin D, subunit A; domain 1 Acid Proteases 4rycA01
1RQ9A 4OBZB 3KDCA 3ER3E 5P82A 1FQXA 5P7RA 3TH9A 1B5FB 3KDBA 3RTHA 3D91A 5P03A 1QBRA 3MXEA 4APRE 3PI0A 2BKSA 3LNKA 5OZ4A 1ER8E 5P40A 5P7PA 9HVPA 2PSUA 4B78A 3S85A 2J9KA 4GJ5A 5J25A 4RGHA 5P7LA 4OC6A 5OYZA 2AOIA 1APTE 5P5EA 5P7MA 2B7FA 4H3JA 1HPVA 3BRAA 2QK5A 4RYGA 1TSQA 4DJQA 4Q1WA 4NJTA 4QLHA 2PK5A 3BXSA 5P3WA 2IKOA 3G70A 5COOA 2ZJNA 3O9CA 1W5YA 3OOTA 2WF0A 3UDMA 1LZQA 3UDRA 3SM1A 3KFRA 4NPUA 5DR0A 4YD5A 3UQXA 1MIQA 3TTPA 5OZGA 4Y4JA 1B6KA 3U71A 3TNEA 3DUYA 2MIPA 1K2BA 3TKGA 3KFSA 5P44A 5IS4A 1IZEA 2J9JA 1WBMA 1BDLA 1HVKA 3ZLQA 3LZVA 1MRWA 1MT9A 4LBTA 5P4FA 3IN4A 5HDUA 2HS2A 3C9XA 3FNUA 2FNTA 3EXOA 3FX5A 1EPLE 5P7HA 3BUGA 3GW5A 1UH7A 5P8EA 3SPKA 2OHPA 4DQEA 5OZYA 4YD6A 4RZ1A 2HPFA 3GI6A 4FAFA 3IA9A 2BB9A 5OZIA 4DV9A 5P3IA 2AQUA 5P69A 5KR0A 5DQ4A 4LL3A 5P3DA 2QZXA 1JLDA 5P37A 3SA5A 4FAEA 3FNTA 2JYSA 3PCWA 5P2VA 3KA2A 4F73A 2VIEA 3U6AA 5P5FA 1RL8A 2IEOA 4Q5MA 1KJGA 2H6SA 4J54A 1K1TA 4DJYA 1SMRA 3VF7A 3TPJA 1EC3A 1UH8A 5OYSA 4HA5A 4Y5LA 1YTJA 5P5UA 5DQ5A 3LIXA 4AA9A 2FNSA 2VA5A 3NDTA 4Y47A 1FMBA 1FFIC 2ER0E 1ZPAA 5P1CA 4ZPEA 2VA7A 3CIDA 4Y35A 5P3QA 5BRYA 3CYXA 5P16A 1HWRA 5P68A 1DPJA 4YBIA 2V12C 5P22A 2F3FA 3HDKA 1E5OE 2ZDZA 4YE3A 5COPA 5P39A 1IBQA 1YX9A 5P5HA 3AUPA 1BV7A 5P01A 5OZAA 1FQ4A 4Y4ZA 2VS2A 5OZ1A 5P8GA 4J0VA 6APRE 3SABA 2JXRA 1D4KA 5P4AA 5P5DA 5P1ZA 5OZVA 3HBOA 5HE7A 2IRZA 4FIVA 5P7QA 1IIQA 1C70A 1ZBGA 5P70A 3H0BA 1E81E 5P2ZA 5P6CA 2JE4A 3INFA 5P38A 3EKXA 4J1IA 5P6UA 5DQ1A 4PEPA 2BPWA 2ZJHA 4KUPA 5OZ8A 5I3WA 5P1IA 3SA3A 1AM5A 5P0AA 2V0ZC 4X7IA 2IENA 5P4GA 3L5EA 6UPJA 1PFZA 4NKKA 3OXVA 3R0YA 5P8UA 5P2IA 5P2XA 2O4LA 3EL0A 5P25A 4FLGA 4FRJA 4H1EA 1Q9PA 1RPIA 5C9DA 4H3IA 4GIDA 1GKTA 4Y3WA 4BFBA 2IKUA 2AVVA 4DQGA 2AZCA 3QN8A 2BBBA 3TL9A 3QRMA 3SQFA 1FMXA 2NPHA 5P4XA 5AH7A 3OU1A 1FFFC 3HZCA 5OZPA 2FGUA 4L7HA 3UDYA 4I0HA 3S56A 2G26A 3BVAA 3I8WA 4EJKA 3EL4A 4N00A 5P0GA 3MXDA 4GB2A 2OHNA 3HLOA 3PBDA 3DV5A 2HPEA 3FSMA 5P0IA 3OGQA 2Q63A 4L1AB 5ER2E 3NYGA 4K9HA 1SDUA 3FNSA 2RENA 5P1HA 5HE4A 4J1FA 1EPPE 3VLBA 2WF2A 4Y38A 1XL5A 1G35A 4MC1A 4J1CA 4OD9B 2RSPA 1YTIA 3OU3A 4HDPA 5P8KA 1ODWA 4Y3HA 1EAGA 5P00A 3K5DA 4D83A 1SIPA 2AVSA 5P12A 4I0FA 4XXSA 5P5YA 5P76A 3VLAA 1KJ4A 5P6PA 5F01A 1NH0A 5OYXA 2QZWA 5P08A 5OZEA 3UHLA 3PBZA 1YM2A 1NSOA 5P6KA 3MSLA 5JODA 5AH9A 2UXZA 3OHFA 5P0YA 3TPRA 2HAHA 2QD6A 5P8CA 4ZSRA 5P5GA 3OU1B 3IGBA 4X2LA 3R4BA 1K2CA 1C6YA 2WKZA 4RVXA 5P2YA 5ISJA 4B1CA 5OZOA 3UDNA 5COKA 3S45A 1SDTA 5P49A 4YD4A 1PSNA 5P0EA 1SIVA 2FXDA 1FQ6A 3DCRA 5P28A 5P4MA 5KAOA 3SM2A 3OK9A 3LITA 4Y48A 4J0TA 3UDJA 3SA6A 3EBZA 5P1EA 5P6BA 5P4PA 4Y4DA 3UDQA 5P3OA 4Y3YA 1IDBA 1PROA 1YG9A 4RLDA 2PWRA 3LIYA 1U8GA 4U8WA 5DQCA 5DGUA 3LPIA 3QPJA 1M0BA 2VKMA 2O4NA 2QMPA 3QS1A 3APPA 2NMYA 5P35A 4KB9A 5P42A 2AODA 2OHRA 3WZ8A 1GVVA 5P1TA 3KMYA 4R95A 5P0XA 4DQHA 1SDVA 1PSOE 5P5PA 4M8XA 4RCFA 5OZ9A 2O4KA 3NU6A 5P7WA 4EQJA 5KR1A 3T6IA 3T7XA 3GI0A 5P2EA 1T6EX 2BPVA 5P13A 6FIVA 2AVOA 3KYRA 4CMSA 3OADA 4ACXA 3KF0A 2Q64A 5P0ZA 3NDWA 5OZRA 3ZKNA 3UTLA 5OZ5A 5P79A 5KOSA 4QJAA 2IGXA 3ZPTA 4S1GA 3EC0A 5P8IA 4PYVA 5DR4A 2OHQA 3I25A 3HVPA 1QS8A 3OY4A 3DV1A 3OU4B 1APWE 4HZTA 4Y4XA 1CPIA 1EPME 1PPKE 1FG8C 5P1AA 3HD8A 5P1QA 3QI1A 5P20A 5P73A 2WEAA 3NU9A 5P2KA 3SA9A 1W5VA 2R3TA 3NU4A 5P5CA 3OUBA 2QZLA 4J1HA 2QU2A 4YBFA 3QVIA 5P5KA 1KZKA 4F75A 3AIDA 3EM6A 4FM8A 1FGCC 1WBKA 5P71A 3VV7A 5P3CA 1FB7A 2WEDA 3R0WA 3OADB 3S54A 2QI1A 3K4VA 1Z1HA 5P3HA 4TRWA 1AJXA 3VFBA 4ZLSA 4J55A 5P7KA 3NU3A 7HVPA 1A94A 1HEFE 2AZ9A 5P4TA 5BWYA 2G24A 2B42A 2SAMA 4MC9A 4U7VA 3VYEA 2NTRA 5P7GA 1HTEA 4YOAA 2WF4A 2NNPA 1ZP8A 4AA8A 5P0CA 5P1MA 5P56A 1OHRA 1C6XA 3OQDA 5P0KA 5P1LA 2Q3KA 4GJCA 5DPZA 1ZPKA 2ZJIA 4TRYA 3T11A 3GGXA 1XE6A 3L3AA 3TOGA 4PZXA 4OBKA 3URLA 5B18A 2G22A 5DR8A 5P4VA 3KDDA 2QZKA 5P8QA 4KE1A 5P89A 2QI0A 1KJ7A 4MC2A 2HM1A 3S53A 4DJRA 2XYEA 5F00A 4GJBA 1D4LA 5P1FA 5P14A 5P0RA 3K4VC 5P3YA 5P1SA 3SKFA 3S43A 3O9GA 1T3RA 5P8HA 1B6MA 5TOLA 2FMBA 1FQ7A 1D4HA 5P64A 1QDMA 5P7VA 4Z2ZA 4D8CA 5P0DA 4ER2E 3RSXA 3S7LA 2PH6A 5AHCA 1B6PA 1ODXA 4CP7A 1CMSA 4RRNA 5AH8A 5JFPA 3QVCA 3KT2A 2XFKA 2RKGA 5P0OA 1TCXA 5P1OA 1B11A 4ER1E 5P30A 3K5GA 4Y39A 2AVMA 1DMPA 4L6BA 4Y45A 2FGVA 4Y4EA 2QU3A 3PSGA 5P7JA 3EKVA 1CZIE 5P62A 3JVWA 3O9AA 5P3XA 4CPXA 1FMUA 5P5OA 3B80A 2VIJA 3A2OA 1QBTA 4I0IA 3S43B 4TRZA 4Y4BA 4LXMA 2F3EA 1HEGE 1HBVA 5SY3A 3INEA 2QI4A 1SMEA 3EKYA 3T3CA 3TKWA 1W50A 3URJA 2QNNA 2BJUA 2I4DA 3DJKA 2B60A 4CPTA 3OAGA 4R8YA 4WY6A 3SA4A 2UY0A 2OF0A 5UPJA 5APRE 2AVQA 4OC6B 4FCOA 4JECA 2QI7A 4Y3NA 5P6AA 4DPIA 4BEKA 4DPFA 1XS7D 4Y57A 1EC0A 4EWOA 5HD0A 5P2TA 2F80A 3HAUA 5P6MA 5P4KA 5P1RA 5P6QA 4Y6MA 4DUSA 5P2HA 3O9FA 5P4EA 5HDVA 5OZ0A 5P2DA 4ZSQA 5P59A 3BHEA 5KQXA 5P7NA 1LEEA 3LZYA 3ECGA 4OBJA 4M8YA 3S8IA 5OZJA 3UDKA 2VJ6A 2HB2A 5P5NA 4RROA 4PPHA 5P7SA 2VNNA 2J9JB 2R9BA 3R1GB 4GJ6A 3QP0A 2OHSA 5T4SA 1A8KA 5P18A 2ER9E 4MC6A 4AMTA 2WF3A 2WEZA 1NPAA 2G27A 5HVPA 1EPQE 4Y41A 4Y4GA 1E82E 5KR2A 3TOHA 2OHMA 2G1NA 2ZE1A 1MESA 1PPME 1YTGA 2ZJJA 4OBGA 1LF4A 4WTUA 5KR8A 4CPQA 1LF3A 3KN0A 1HPXA 2IDWA 5P5SA 4EHCA 4Z4XA 3LIVA 4B77A 1IVPA 4DJWA 1AIDA 1KJHA 3DM6A 2F81A 5P2WA 1BVGA 4A6BA 5AHBA 1D4SA 5P6FA 2OAHA 4IVTA 5P7OA 1G0VA 4GJ9A 2PK6A 4DI2A 5P54A 4FS4A 3LZUA 3L5DA 5P2NA 3I7EA 4ZPFA 3OHHA 1HPSA 2AOJA 1DIFA 2AZBA 3D3TA 5P3PA 3G72A 3IN3A 5P55A 4XX3A 5I3XA 5P2OA 4DQCA 5PEPA 2PYMA 4J17A 3NUJA 2R8NA 1GVXA 4EXHA 2QD7A 5IVSA 3CKRA 5OZQA 4QGIA 1HRNA 4Y3MA 3VSXA 3OXWA 1Z1RA 1K6PA 1HVJA 1NPWA 3QBFA 2VIZA 1HOSA 5DR3A 1HSGA 5P2LA 5OYQA 2PYNA 4I10A 3ZPSA 4DJVA 4Y3ZA 5P7IA 5P3JA 5OYWA 5P1KA 8HVPA 2NR6A 3PSYA 1FIVA 5P77A 5KQYA 1K6VA 3I2LA 3PWWA 2BPZA 4FRIA 4J0PA 5P6NA 1HTGA 2ZHRA 2IS0A 3ZKSA 1IVQA 3UQRA 4DQBA 3PLLA 3L5BA 3VSWA 1UPJA 3CKPA 2AZ8A 4J0YA 5P1VA 4GMIA 4Y37A 1BILA 2QMGA 4Y44A 3VF3A 2P3AA 3T7QA 2B8LA 3PM4A 1TZSA 5P32A 2B7ZA 4YDGA 3N4LA 4FGXA 2PMAA 2O4SA 4DJPA 4Y58A 5OZ2A 2XFJA 5P75A 5P6JA 3H5BA 5P47A 2ZJKA 2ZJMA 1A30A 5OZCA 5P2GA 2QP8A 5P1GA 4AZYA 4B70A 3FIVA 5P6YA 1W6HA 5OZXA 4GJDA 5SZ9A 5P74A 2I4UA 4L7GA 5P0PA 2ASIA 3ER5E 4RYCA 1M4HA 3L5CA 1AJVA 3DCKA 5FIVA 5DR7A 5P4SA 5P0BA 1DW6C 5P02A 1ZJ7A 1T7IA 3Q6YA 5KQFA 1BWAA 1EPRE 3INHA 1HVIA 1WKRA 1A8GA 5P1XA 3OUDA 3NUOA 5P2MA 3UQPA 3NU5A 2QMDA 3VUCA 4Y3LA 5P1YA 1IZDA 5BS4A 2PWCA 4R91A 5P0JA 4F74A 5P3UA 4Q1YA 3SACA 2I4WA 3B7VA 4CPRA 4Y51A 5HTZA 1OEXA 3ZKQA 4I8ZA 2PH8A 5P65A 5OZ3A 4I12A 4APEA 3IXJA 4YOBA 5OYYA 3SFCA 1SBGA 1HVRA 5P27A 2G1OA 4Y3SA 3UF3A 1EC2A 2I1AA 2QHCA 2FLEA 1G6LA 2PQZA 2O40A 1FQ8A 3LHGA 2R43A 5P3KA 2G20A 2FXEA 5OZHA 3UFLA 4JPCA 1D4IA 2WF1A 2BPXA 2ZHSA 4J1KA 3OUDB 1MERA 5KOQA 3SLZA 2ZHVA 1OEWA 2B8VA 1BVEA 3OQAA 4F76A 4ZSMA 2RMPA 4J1EA 3NWXA 4KE0A 3BGCA 1Z8CA 1AXAA 5P7DA 5OYUA 5P6OA 3D1XA 4TVGA 5P6EA 4BFDA 5P5LA 4YD3A 5OZNA 5P8NA 5OZWA 4FSEA 4GJAA 2CENA 3VFAA 1HSIA 2WHHA 1T7JA 3ZKIA 1BWBA 3URIA 5P83A 1GVWA 5P51A 5P5XA 7UPJA 4Y3XA 3Q4BA 5P46A 5P2SA 4EXGA 4EJLA 3VYFA 5I3YA 1ODYA 2QNPA 3KM4A 5P8VA 1MRXA 3PI5A 3O9IA 5P0NA 3VV8A 3OXCA 1BBSA 4HDFA 5P4UA 2G21A 4Y4UA 4AUCA 1IZIA 1VIKA 5P4QA 5P19A 5I70A 2I4VA 2P3DA 4R5NA 1DAZC 1LYWA 5OZTA 5P63A 5P66A 2A4FA 5P78A 5P58A 2NNKA 1RNEA 3CIBA 4Q1NA 3QBHA 4Y4TA 4EJDA 1MTRA 1XL2A 3IXOA 3NDUA 2QHYA 5P1UA 1QRPE 3D20A 1XDHA 3BUFA 1MPPA 2ANLA 3O9EA 4LC7A 5P8LA 1G2KA 1K6TA 1HIHA 5P34A 1MTBA 5P60A 5P5BA 4EP2A 5P6SA 1BXOA 3DOXA 5P8AA 3LZSA 4OBDA 3EL5A 1IDAA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 1RQ9 A;  4OBZ B;  3KDC A;  3ER3 E;  5P82 A;  1FQX A;  5P7R A;  3TH9 A;  1B5F B;  3KDB A;  3RTH A;  3D91 A;  5P03 A;  1QBR A;  3MXE A;  4APR E;  3PI0 A;  2BKS A;  3LNK A;  5OZ4 A;  1ER8 E;  5P40 A;  5P7P A;  9HVP A;  2PSU A;  4B78 A;  3S85 A;  2J9K A;  4GJ5 A;  5J25 A;  4RGH A;  5P7L A;  4OC6 A;  5OYZ A;  2AOI A;  1APT E;  5P5E A;  5P7M A;  2B7F A;  4H3J A;  1HPV A;  3BRA A;  2QK5 A;  4RYG A;  1TSQ A;  4DJQ A;  4Q1W A;  4NJT A;  4QLH A;  2PK5 A;  3BXS A;  5P3W A;  2IKO A;  3G70 A;  5COO A;  2ZJN A;  3O9C A;  1W5Y A;  3OOT A;  2WF0 A;  3UDM A;  1LZQ A;  3UDR A;  3SM1 A;  3KFR A;  4NPU A;  5DR0 A;  4YD5 A;  3UQX A;  1MIQ A;  3TTP A;  5OZG A;  4Y4J A;  1B6K A;  3U71 A;  3TNE A;  3DUY A;  2MIP A;  1K2B A;  3TKG A;  3KFS A;  5P44 A;  5IS4 A;  1IZE A;  2J9J A;  1WBM A;  1BDL A;  1HVK A;  3ZLQ A;  3LZV A;  1MRW A;  1MT9 A;  4LBT A;  5P4F A;  3IN4 A;  5HDU A;  2HS2 A;  3C9X A;  3FNU A;  2FNT A;  3EXO A;  3FX5 A;  1EPL E;  5P7H A;  3BUG A;  3GW5 A;  1UH7 A;  5P8E A;  3SPK A;  2OHP A;  4DQE A;  5OZY A; 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 1PSO E;  5P5P A;  4M8X A;  4RCF A;  5OZ9 A;  2O4K A;  3NU6 A;  5P7W A;  4EQJ A;  5KR1 A;  3T6I A;  3T7X A;  3GI0 A;  5P2E A;  1T6E X;  2BPV A;  5P13 A;  6FIV A;  2AVO A;  3KYR A;  4CMS A;  3OAD A;  4ACX A;  3KF0 A;  2Q64 A;  5P0Z A;  3NDW A;  5OZR A;  3ZKN A;  3UTL A;  5OZ5 A;  5P79 A;  5KOS A;  4QJA A;  2IGX A;  3ZPT A;  4S1G A;  3EC0 A;  5P8I A;  4PYV A;  5DR4 A;  2OHQ A;  3I25 A;  3HVP A;  1QS8 A;  3OY4 A;  3DV1 A;  3OU4 B;  1APW E;  4HZT A;  4Y4X A;  1CPI A;  1EPM E;  1PPK E;  1FG8 C;  5P1A A;  3HD8 A;  5P1Q A;  3QI1 A;  5P20 A;  5P73 A;  2WEA A;  3NU9 A;  5P2K A;  3SA9 A;  1W5V A;  2R3T A;  3NU4 A;  5P5C A;  3OUB A;  2QZL A;  4J1H A;  2QU2 A;  4YBF A;  3QVI A;  5P5K A;  1KZK A;  4F75 A;  3AID A;  3EM6 A;  4FM8 A;  1FGC C;  1WBK A;  5P71 A;  3VV7 A;  5P3C A;  1FB7 A;  2WED A;  3R0W A;  3OAD B;  3S54 A;  2QI1 A;  3K4V A;  1Z1H A;  5P3H A;  4TRW A;  1AJX A;  3VFB A;  4ZLS A;  4J55 A;  5P7K A;  3NU3 A;  7HVP A;  1A94 A;  1HEF E;  2AZ9 A;  5P4T A;  5BWY A;  2G24 A;  2B42 A;  2SAM A;  4MC9 A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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