4RYGA

Renin in complexed with n-({(3s,4s)-4-[(benzylsulfonyl)amino]pyrrolidin-3-yl}methyl)-4-methoxy-3-(3-methoxypropoxy)-n-(propan-2-yl)benzamide inhibitor
Total Genus 89
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
89
sequence length
339
structure length
336
Chain Sequence
TLGNTTSSVILTNYMDTQYYGEIGIGTPPQTFKVVFDTGSSNVWVPSSKCSRLYTACVYHKLFDASDSSSYKHNGTELTLRYSTGTVSGFLSQDIITVGGITVTQMFGEVTEMPALPFMLAEFDGVVGMGFIEQAIGRVTPIFDNIISQGVLKEDVFSFYYNRDSQSLGGQIVLGGSDPQHYEGNFHYINLIKTGVWQIQMKGVSVGSSTLLCEDGCLALVDTGASYISGSTSSIEKLMEALGAKKRLFDYVVKCNEGPTLPDISFHLGGKEYTLTSADYVFQESYSSKKLCTLAIHAMDIPPPTGPTWALGATFIRKFYTEFDRRNNRIGFALAR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title trans-(3S,4S)-Disubstituted pyrrolidines as inhibitors of the human aspartyl protease renin. Part I: Prime site exploration using an amino linker.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Renin
molecule tags Hydrolase/hydrolase inhibitor
source organism Homo sapiens
total genus 89
structure length 336
sequence length 339
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.4.23.15: Renin.
pdb deposition date 2014-12-15

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00026 Asp Eukaryotic aspartyl protease
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.40.70.10 Mainly Beta Beta Barrel Cathepsin D, subunit A; domain 1 Acid Proteases 4rygA02
2.40.70.10 Mainly Beta Beta Barrel Cathepsin D, subunit A; domain 1 Acid Proteases 4rygA01
4A6BA 3FNTA 4LXKA 4R92A 1HIVA 2FDDA 5OZVA 2AZBA 3OUDA 2WEZA 3EKPA 1AJVA 3S43A 4J0PA 3M9FA 4QJ8A 3NDTA 3U7SA 1SIPA 4GJ8A 3QRMA 5OZ2A 1HRNA 3PLDA 3NYGA 3PMYA 1A30A 4I10A 4U8WA 5P1DA 5C9BA 1HPXA 1FFIC 4TVGA 5P64A 4JOOA 1SMEA 3I2LA 1FQ6A 2HAHA 2I4XA 4WTUA 5P46A 5P7WA 3NXEA 3FNUA 1ZBGA 5P4LA 5OYQA 1F34A 5P8VA 5P29A 4Y6MA 4B1EA 5I70A 5P1ZA 4J0ZA 5AH9A 1XL2A 1BIMA 5P1EA 1HOSA 3I25A 3S54A 5P81A 3MSJA 4Y5PA 5P8GA 5P5XA 5P7EA 3JVYA 2V16C 2R38A 4NJSA 1DPJA 3MXDA 4EYRA 2IDWA 2R9BA 3T11A 3TPLA 4Y37A 4B1CA 1IBQA 2BBBA 4TRWA 3ZOVA 4PYVA 2NPHA 2QMDA 1B5FA 5P37A 5P84A 2G22A 4FIVA 5P4AA 4HE9A 5P3AA 4YD3A 1RV7A 4B70A 3EKTA 2AOJA 4I0FA 4J1EA 5HCOA 2AQUA 1CPIA 3OOTA 2F3FA 2V0ZC 4IVTA 4YOAA 4LC7A 1HEGE 5P6KA 5P7MA 2WEAA 1Z1HA 1BV9A 1BDRA 3WZ6A 2AVMA 5P1QA 5P69A 5P5HA 3OGPA 3RTHA 5ISKA 4CMSA 4PPHA 5P2LA 3VUCA 2IEOA 4N00A 5ENMA 4Y48A 2AZCA 1HTRB 4X7IA 5P43A 5TOLA 3OXCA 2PMAA 5P2VA 4MC2A 2QI5A 2F81A 4HDFA 2QZWA 3TPPA 5P6QA 4DJXA 5KOQA 4Y3TA 1HXWA 4ER1E 4Y50A 5P5JA 3RSXA 4RYCA 1FLHA 3ZKMA 2WHHA 2Q55A 3CKPA 4YBIA 2JYSA 2MIPA 5P7BA 1EBWA 3D1ZA 3QAAA 5P2CA 3UPJA 2F80A 3OADB 5P09A 4EJDA 5P24A 2QI0A 2WF3A 5P7FA 3NDWA 3HVGA 3OU3A 5P40A 5OZWA 3MWSA 4L7HA 5P3DA 1EC0A 4QJ9A 1YTJA 4YE3A 5AHAA 1VIJA 3NXNA 1NPVA 2ER9E 4DJVA 1HVHA 1K2CA 5P0ZA 5P7XA 3VLBA 1SMRA 1IDAA 1FGCC 3KT2A 4TRZA 5P2FA 5P8KA 4ZSRA 4DJOA 3ZPUA 2FMBA 2ER6E 4Q1XA 1MT9A 3GI4A 3OUCA 5OYRA 4Y3QA 3G6ZA 2OHNA 3EL5A 4OC6B 3KFRA 1BVGA 1G35A 3WZ8A 3OQKA 3PMUA 2QI7A 3ZPTA 4ZSPA 3UHLA 5OZJA 3ZMGA 5T4SA 2AOIA 2WF1A 5P5CA 1LZQA 4I1CA 1IZEA 1M43A 1B6KA 1NSOA 3UTLA 3L5FA 2PYMA 4Y3PA 3GGXA 5P4HA 2OHPA 4H1EA 4RRSA 4OBJA 4Y9WA 5HU1A 4M8XA 4GJAA 1A8KA 4I0GA 4EPJA 2WJOA 2ZHVA 5P7LA 4K8SA 3VSWA 3PEPA 5P6HA 3BUHA 5P2QA 3EC0A 3OY4A 4LP9A 5P6VA 3FIVA 5P6SA 5OZTA 3IN3A 3HAUA 3PHVA 3TTPA 2FXEA 3L58A 3OQAA 4Y5MA 3PRSA 4D88A 2V00A 3K5GA 3NWXA 5P2RA 5P8TA 3AIDA 1QS8A 2BQVA 5I3WA 5OZYA 4APRE 5P2TA 5P6CA 3IXOA 5P5TA 5ISJA 2J9KA 2R8NA 3VF5A 3OADA 4CPSA 5P68A 1EPOE 1ZPKA 5P0PA 4QLHA 3L5CA 1HVIA 2HM1A 4Y4DA 5APRE 1UPJA 4AA8A 5IS4A 5P3KA 3K5DA 2O40A 3BGBA 3S56A 3QVCA 5P7ZA 5OZKA 1DIFA 3LPKA 1GVXA 5P48A 2AOCA 3KF0A 4OC6A 1HIHA 5P8RA 2ZGAA 3T6IA 3VV6A 3L5EA 2QCIA 5P2NA 4QJ6A 2IKOA 2V10C 3O9HA 4Y5GA 4DQBA 5P8DA 5BRYA 1ER8E 2ZJJA 3U6AA 3LITA 2QZKA 5P8EA 1IZDA 5P17A 1FFFC 4CPXA 1RQ9A 3EBZA 4ZPFA 4GYEA 4Y53A 5KQZA 4AA9A 2VA7A 2OHKA 4XX3A 2FGVA 1Z1RA 3URJA 5P0XA 1FQXA 3FX5A 5P2SA 5HVPA 4Y38A 5P2DA 5P4FA 4EP3A 1C70A 1OEWA 2P3DA 4H3FA 5P14A 3NDXA 5B18A 5P0SA 5P10A 5P1UA 5P5YA 4NPUA 2JXRA 5P0NA 5P34A 1W5YA 4JPCA 5P4UA 3VFAA 4QGIA 1B6LA 2QAKA 5P3UA 2AOHA 1FKNA 5P5OA 1HWRA 4BEKA 5UPJA 3CYXA 2A4FA 4Y5EA 4APEA 2ASIA 3LHGA 5OZIA 5KAOA 3HDKA 4J1IA 3Q3TA 4Y3GA 4B0QA 4A6CA 3LIZA 1QBSA 5P2JA 1SGUA 4I0EA 4CPWA 5OZXA 1E5OE 4KE1A 4Y4AA 2G21A 5P4CA 5P60A 1HVSA 1TZSA 2PC0A 5P7KA 5P0KA 2CENA 4M8YA 2G1YA 3OAGB 5P5KA 5P6XA 5P3VA 1SP5A 1JLDA 2G1OA 4Q5MA 5OYWA 2NTRA 3CMSA 1T6GA 4FSLA 5DR7A 2FS4A 5OZGA 2BKSA 1HIIA 5P6YA 5P3FA 5P52A 5P4WA 3TKWA 2FIVA 1HSGA 3ST5A 4CPRA 5P5GA 2F3EA 3IN4A 3URIA 5P4GA 1QBTA 4Z2ZA 2QMFA 3S2OA 3K1WA 4B72A 5P36A 3NR6A 1FQ8A 4GZFA 2XYEA 4YCTA 4DQHA 5COPA 3PLLA 3PVKA 2FXDA 1AXAA 3SAAA 3KFPA 5P7QA 5P4QA 3UDKA 4Y3HA 4DJPA 3RTNA 1U8GA 3KDBA 5J25A 3CKRA 1MRWA 1TCXA 2HB4A 3SA3A 5IE1A 3ZLQA 5JG1A 2G1SA 2QHZA 5AGZA 2HB3A 1SGZA 4Y54A 3DOXA 4RVIA 4Y4GA 4FM6A 2FGUA 3UQUA 1HVLA 1B6MA 4GMIA 3TPJA 1MIQA 2ZHRA 4I12A 1TQFA 4NJTA 2RKGA 4EJ8A 4FAFA 1KJ4A 4XKXA 4FRKA 3O9BA 1B6PA 5P7HA 5HDVA 4CKUA 5P7AA 1LF2A 1GKTA 3N3IA 1C6YA 3FNSA 5P0WA 5P51A 1QDMA 3B7VA 3NU6A 4J17A 4BFDA 3EL0A 5P23A 3GI6A 4YBFA 5P66A 2QU2A 3CKTA 4D83A 5IVTA 3MSKA 3UDPA 3OU4B 2HPEA 4GB2A 5P0IA 5P5ZA 1NPAA 3UQPA 3QN8A 4Y44A 5SZ9A 1K1UA 4D8CA 4ZE6A 1T7IA 1ZSRA 2G26A 1MEUA 5P08A 2H6TA 4PHVA 5DPZA 1AVFA 4YHQA 3TLHA 5E5KA 3INFA 4GIDA 3VCMA 3INHA 2HIZA 3OAGA 2AVQA 3KN0A 3KFNA 5P71A 3I7EA 4RVXA 4Y4WA 5P3YA 3NUJA 5P35A 4CP7A 8HVPA 2HB2A 4HDPA 4FRJA 2OHQA 1RPIA 5P2MA 2RMPA 2O4KA 5P1FA 4ZIPA 5P18A 1QRPE 4K4QA 2VS2A 3WB5A 5P26A 1FQ5A 1BXOA 5COOA 1SDVA 5P15A 5SY2A 2ZJHA 3SM2A 4OBDA 3IGBA 4F76A 2O4LA 5P1SA 2QD7A 4R93A 4RROA 5OZRA 1ZAPA 5P70A 4Y56A 4R91A 3INDA 3OTSA 5P6GA 3LZUA 1KJHA 2Q3KA 4HVPA 2I4QA 5C9FA 4JP9A 1HHPA 4Y3FA 3EXOA 5P11A 3TKGA 2V11C 5DR3A 5OZMA 1DP5A 1UH7A 5P1JA 6UPJA 2BB9A 3PJ6A 5OYUA 4J54A 4KB9A 2WL0A 1EPRE 2PQZA 3KT5A 5P2YA 4FM7A 4DFGA 2HS1A 1HPVA 1EPME 3VYEA 1D4YA 1SH9A 2JE4A 5OZUA 1RNEA 5P5FA 2WEDA 3O9IA 2QZLA 5P6EA 3OU4A 1MERA 2G1RA 2CEMA 5AH7A 1LYBB 2UY0A 4DI2A 1WKRA 5P3LA 1PPLE 5P4EA 4QJAA 4QJ7A 3PCWA 3LNKA 1CZIE 3FKTA 5P79A 2CEJA 2AOEA 4NJUA 5P31A 1C6XA 4B00A 5P8IA 3LPJA 1XS7D 4YD7A 3APRE 4FSEA 4DJYA 3CYWA 1NH0A 4Y4JA 3OU1B 3OXVA 3R0YA 3AUPA 4Y3NA 5BS4A 5OYYA 1LV1A 5P6RA 2XFIA 5HTZA 2WKZA 4RCEA 2I4DA 5P4YA 5P57A 3SA8A 5OZ8A 5KQXA 5P0FA 3QP0A 4B05A 1BV7A 3UQRA 1UH8A 1PSAA 1EBYA 5KR8A 5OZDA 5DQ5A 3NWQA 1OHRA 4J55A 5P0MA 5P0OA 1E81E 2R5PA 5P75A 3VF3A 2PWRA 5DR8A 4AUCA 1G2KA 1PPME 3PI5A 2IQGA 2AVSA 4YCKA 3DV1A 1HVKA 4HA5A 1EPLE 4ZEAA 1PSNA 5OYTA 4J0YA 3D20A 4CPQA 1EC1A 4CPTA 3EKXA 3O9FA 3EKVA 1BDLA 5P2AA 5P8NA 1K6CA 3EKWA 3IVHA 3PB5A 4L7JA 3VF7A 5P4DA 5P53A 4YDGA 4Y3XA 1FEJC 5KR0A 5P12A 3TL9A 1WBKA 3VV8A 2Q54A 4RGHA 4GJ5A 5P83A 5P1VA 5P8CA 4H3JA 3Q5HA 1HVJA 2PK6A 3EMYA 3SO9A 3SACA 2VA6A 3L3AA 5P6UA 5OZZA 5P72A 1YTIA 4Y36A 1LYBA 3PWMA 3BVAA 5EZXA 5P67A 1E82E 4GJ9A 2G69A 4OBHA 4DV9A 1VIKA 5P2WA 1IIQA 3PSYA 3K5CA 4ZPEA 4Y45A 5JODA 3OHFA 3U71A 5PEPA 4EJLA 3ZKNA 1W6IA 3WB4A 5P6MA 4TVHA 3UDQA 3SFCA 4I0JA 3KDDA 4R95A 4XX4A 1W50A 3OU1A 3HBOA 5P1OA 4D85A 1MTRA 3O9LB 4PEPA 3URLA 4HDBA 5P88A 4A4QA 3BUGA 5P4TA 1A8GA 3OHHA 4RYGA 4MC1A 4Y3LA 4FS4A 5P25A 4FRIA 3O9GA 5P6PA 1OEXA 1T7KA 2QMPA 4L6BA 2VA5A 5P28A 5P1NA 2AZ8A 3OQDA 4PZXA 4OBGA 3I8WA 3SLZA 3O99A 5P3CA 3HVPA 1BILA 3UDNA 3NLSA 2G24A 5P80A 3OXWA 1ZPAA 1GNNA 5P19A 1MTBA 4IVSA 1FB7A 1D4SA 5P5LA 5P8QA 3OGQA 1KJFA 1FMXA 2WF4A 4I8WA 5OZ4A 5P3MA 2NXMA 3VLAA 5KQFA 1HEFE 5P0HA 2Q15A 1W51A 5P4BA 3D1YA 1GVUA 5P7PA 5P42A 2QHCA 5DR1A 2G1NA 4ZSMA 3N4LA 1G6LA 2AVVA 5P61A 4EQ0A 1LYWB 5OZSA 1EPNE 2XYFA 2J9JB 5P4IA 3G72A 1HXBA 2HS2A 2XFJA 4Y3DA 2V13A 5OZQA 5P4OA 3QIHA 1EC3A 1HPOA 5COKA 2WECA 1QBRA 1W5VA 4LXAA 5P1XA 3OWNA 5P55A 4BFBA 3FV3A 2NNPA 3UQWA 4RCFA 4Y4ZA 1FIVA 4RVJA 2QU3A 4ACUA 5P65A 4R5NA 1KZKA 1YTHA 5AH6A 5HU0A 1BDQA 3BRAA 4K4PA 1AJXA 1FQ4A 2AODA 4GJBA 3GGUA 1K6TA 4Y4EA 3G70A 9HVPA 5P7GA 3RVIA 4J1HA 3O9LA 3KMYA 3UDYA 3PWWA 2I4UA 1BWAA 1MPPA 2OF0A 2ER0E 4EXGA 3QVIA 3HZCA 4OD9B 2PSGA 2ZJMA 5P5SA 3HLOA 3PBZA 1W5WA 5P7SA 2RSPA 1MRXA 5P2OA 3TOFA 3KDCA 3PI0A 4NKKA 5P33A 5P0LA 5P0JA 2PSUA 5P8AA 5DQ1A 1LF4A 4FRSA 5P4VA 1T3RA 3T7QA 3SA6A 4Y43A 2NXDA 4Y4XA 5P1HA 4EWOA 5FIVA 3VYDA 5P0TA 5OZLA 3I6OA 4Q1WA 5P02A 5P76A 3GGVA 1LYWA 2FLEA 4Y58A 3BXSA 1NPWA 4OBFA 1XDHA 4FGXA 2Z54A 3DCKA 5P5VA 2P4JA 3RTMA 4NJVA 1HTFA 5P4ZA 4B78A 5DQCA 3IVIA 5C9DA 1YTGA 4Y4TA 3EM4A 3S7LA 2H6SA 3KM4A 3A2OA 4QJ2A 5P7UA 4WY6A 1QBUA 2NMYA 1GNOA 3O9CA 7HVPA 3WZ7A 4Y3RA 4JPEA 5P07A 2Q64A 5OZ1A 1EPQE 3EL1A 5P1PA 5OZFA 5P3ZA 6APRE 1SDTA 5P2GA 1GVVA 5HCTA 3S45A 5P00A 5P3BA 2NMZA 1MUIA 4Y5LA 1M0BA 2HPFA 5P78A 5P06A 5DGWA 3CIBA 5P4RA 5OYZA 4YD5A 2QI1A 1IZIA 5P44A 2AVOA 5HE7A 1MSNA 2B8VA 1MT7A 4GJ6A 3O9DA 5P3WA 4OD9A 2I0DA 2B7FA 1BVEA 2VJ6A 2OHUA 5P74A 3MXEA 1ZLFA 5P7CA 2EWYA 1ZJ7A 3D3TA 3WSJA 1D4JA 2P3CA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 4A6B A;  3FNT A;  4LXK A;  4R92 A;  1HIV A;  2FDD A;  5OZV A;  2AZB A;  3OUD A;  2WEZ A;  3EKP A;  1AJV A;  3S43 A;  4J0P A;  3M9F A;  4QJ8 A;  3NDT A;  3U7S A;  1SIP A;  4GJ8 A;  3QRM A;  5OZ2 A;  1HRN A;  3PLD A;  3NYG A;  3PMY A;  1A30 A;  4I10 A;  4U8W A;  5P1D A;  5C9B A;  1HPX A;  1FFI C;  4TVG A;  5P64 A;  4JOO A;  1SME A;  3I2L A;  1FQ6 A;  2HAH A;  2I4X A;  4WTU A;  5P46 A;  5P7W A;  3NXE A;  3FNU A;  1ZBG A;  5P4L A;  5OYQ A;  1F34 A;  5P8V A;  5P29 A;  4Y6M A;  4B1E A;  5I70 A;  5P1Z A;  4J0Z A;  5AH9 A;  1XL2 A;  1BIM A;  5P1E A;  1HOS A;  3I25 A;  3S54 A;  5P81 A;  3MSJ A;  4Y5P A;  5P8G A;  5P5X A;  5P7E A;  3JVY A;  2V16 C;  2R38 A;  4NJS A;  1DPJ A;  3MXD A;  4EYR A;  2IDW A;  2R9B A;  3T11 A;  3TPL A;  4Y37 A;  4B1C A;  1IBQ A;  2BBB A;  4TRW A;  3ZOV A;  4PYV A;  2NPH A;  2QMD A;  1B5F A;  5P37 A;  5P84 A;  2G22 A;  4FIV A;  5P4A A;  4HE9 A;  5P3A A;  4YD3 A;  1RV7 A;  4B70 A;  3EKT A;  2AOJ A;  4I0F A;  4J1E A;  5HCO A;  2AQU A;  1CPI A;  3OOT A;  2F3F A;  2V0Z C;  4IVT A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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