4S1GA

Renin in complex with (s)-1-(3-fluoro-5-(((s)-1-phenylethyl)carbamoyl)benzyl)-4-isopropyl-4-methyl-6-oxotetrahydropyrimidin-2(1h)-iminium
Total Genus 91
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
91
sequence length
339
structure length
339
Chain Sequence
TLGNTTSSVILTNYMDTQYYGEIGIGTPPQTFKVVFDTGSSNVWVPSSKCSRLYTACVYHKLFDASDSSSYKHNGTELTLRYSTGTVSGFLSQDIITVGGITVTQMFGEVTEMPALPFMLAEFDGVVGMGFIEQAIGRVTPIFDNIISQGVLKEDVFSFYYNRDSENSQSLGGQIVLGGSDPQHYEGNFHYINLIKTGVWQIQMKGVSVGSSTLLCEDGCLALVDTGASYISGSTSSIEKLMEALGAKKRLFDYVVKCNEGPTLPDISFHLGGKEYTLTSADYVFQESYSSKKLCTLAIHAMDIPPPTGPTWALGATFIRKFYTEFDRRNNRIGFALAR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Iminopyrimidinones: A novel pharmacophore for the development of orally active renin inhibitors.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Renin
molecule tags Hydrolase/hydrolase inhibitor
source organism Homo sapiens
total genus 91
structure length 339
sequence length 339
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.4.23.15: Renin.
pdb deposition date 2015-01-13

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00026 Asp Eukaryotic aspartyl protease
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.40.70.10 Mainly Beta Beta Barrel Cathepsin D, subunit A; domain 1 Acid Proteases 4s1gA02
2.40.70.10 Mainly Beta Beta Barrel Cathepsin D, subunit A; domain 1 Acid Proteases 4s1gA01
2QZWA 4NJUA 3OY4A 5P3MA 5OZ4A 5OZ1A 3VF3A 1GVUA 4YDFA 1GVTA 5P5TA 5KQZA 5P27A 2P8HA 3LIYA 1K2BA 2G69A 5P29A 3PMUA 5KR2A 4GYEA 4A6CA 5OYTA 1AIDA 1BXQA 5P60A 2ER7E 1EPME 1JLDA 2I0DA 5OYVA 4DQCA 4E43A 2PMAA 3OU4B 1RPIA 5HE7A 4Y5AA 5P06A 4MC2A 4DQEA 4OBJA 1E80E 5HD0A 4H3FA 4FAFA 5P6BA 1MPPA 3NLSA 4WTUA 2ZHVA 5P26A 3T11A 1A30A 4KE0A 2AOGA 4DJPA 5SY3A 1BILA 3BHEA 2G1RA 5P33A 4FRIA 3TKWA 3KDBA 4DV9A 2FGVA 4EHCA 2Q63A 1SGZA 3SAAA 1CPIA 2WF4A 2WF2A 4RYGA 3VV8A 3LPJA 5ISKA 4LXKA 5P70A 5P0OA 2FS4A 1ME6A 2PYMA 3FNUA 5P0DA 3D1XA 5P6QA 1LYWB 1EBZA 4I8WA 3CIBA 5P00A 1HVKA 4Y3RA 5P8OA 4ER1E 3TPPA 4I0GA 5P5QA 4GJ7A 2BKTA 1OD1A 5ER1E 3U71A 1MESA 3K5GA 5P49A 4UPJA 2P3CA 1PFZA 4OBZA 3QRMA 1RV7A 3QRVA 3VUCA 2R3WA 1G6LA 5P1JA 5P28A 5OZYA 2ZJLA 3EC0A 2IGXA 5P1CA 5P2AA 3BGBA 5P73A 4J1KA 1ZPAA 5P7IA 3EKXA 3JVWA 5OZ0A 1PSAA 1FFIC 3VFAA 5P84A 2G27A 5P1IA 4I0DA 1T7JA 5P3WA 2V10C 5P2GA 5P88A 4FAEA 5P0WA 3IVIA 5F01A 4Z22A 3URLA 2IDWA 5EZXA 2JYSA 3OQDA 2B8VA 3PWMA 5P19A 4B0QA 5P7VA 1D4HA 2I4WA 1YX9A 3OAGA 4I0ZA 4ZPGA 5HE5A 3MWSA 3HVGA 3FNTA 4Y3ZA 5KR8A 4Q5MA 1Z1HA 3KFSA 6UPJA 2PQZA 4CPQA 3ZMGA 3L58A 3N3IA 4Y57A 5P4DA 5P3JA 5P35A 4FM8A 7HVPA 2V12C 3UFLA 2B7ZA 5P40A 3PLLA 5P1NA 5P7TA 3GGAA 3OQKA 3G72A 2ZHSA 4GJCA 2FDDA 4IVTA 3S53A 4NJVA 4D89A 1HBVA 5P6RA 1YTIA 2AZ9A 1GNMA 5KOSA 4Y39A 3K1WA 1G35A 4I1CA 3SM2A 4Y4DA 3CKRA 4WY6A 1FB7A 1XL5A 4Y3YA 2ZJJA 1K6VA 3OWNA 3LZYA 3NDWA 4Y44A 5KAOA 1FQ5A 3K5FA 1BVEA 5P31A 1APWE 1AXAA 2H6TA 4QJ7A 1LS5A 1IDAA 4AMTA 4EJ8A 1BWAA 3U7SA 2G1YA 5OYSA 5KR0A 3OXWA 3UDRA 2ZHRA 5B18A 5OYRA 5P7WA 5HCTA 2ZJKA 5P64A 3INFA 3SA5A 4F74A 1TQFA 5P39A 4RCDA 3QROA 3IXOA 5IE1A 4GJ9A 3HDKA 2XFJA 1KJHA 2NXLA 1XE6A 4R91A 2QI5A 1SDTA 1ZP8A 1W6IA 5P0KA 4ZSQA 1APTE 4Y5NA 5OYXA 4JPEA 3MXEA 4S1GA 1LYBB 3QI1A 1QBRA 1B11A 3WSJA 3ZL7A 4Z4XA 3U6AA 4EWOA 3QS1A 1PPME 5OZJA 5OZTA 3MSJA 4Q1YA 1KJ4A 3TOFA 3UQUA 3KDDA 2BPWA 3VV6A 3EKYA 4QLHA 2PYNA 2OHUA 2NXDA 1LF3A 2NXMA 1RQ9A 3GI0A 5P3KA 3EXOA 8HVPA 5SZ9A 4J1IA 5P7CA 1D4SA 4GZFA 1SMRA 3NSHA 2FDEA 1BDRA 2R5PA 2FNTA 2SAMA 5P0BA 2O4NA 5P2ZA 3OHHA 1K1TA 5P72A 4RGHA 2B60A 2O40A 4ZIPA 4HE9A 5P0YA 3D1ZA 1SBGA 2P83A 4Y3DA 1EPPE 2UXZA 5P0UA 1E82E 1NPVA 4YD5A 3UCBA 5P0CA 5P7RA 4MC6A 4Y4JA 4RLDA 5P86A 3D20A 5P8AA 5P5SA 5DQ5A 3IN3A 4KUPA 3WB4A 1U8GA 1UH8A 4DJQA 4L6BA 2XFIA 2HPFA 2WEAA 4Y9WA 1FLHA 2G1SA 5BRYA 4ZSPA 4DH6A 2QZLA 4Y5LA 5P08A 3TTPA 4Y4AA 3FX5A 5P2CA 2ASIA 5P0GA 1CMSA 3H0BA 3T7PA 2IKOA 3VF5A 2AOJA 1FEJC 4OD9A 5JODA 1K6PA 5AH9A 2O4KA 4Z2ZA 1T7KA 5P3UA 5P1TA 5P5UA 5P1ZA 1MTBA 3UDMA 3OUDA 5IVSA 1QRPE 3BXSA 5DQCA 3S45A 3R1GB 3S43A 4Y3PA 5P7XA 2BB9A 5P03A 2FDPA 3NYGA 2IS0A 5P1KA 1EPNE 3INDA 3LZVA 5APRE 3EL0A 4NJSA 2B7FA 4GMIA 5OZPA 2OHLA 4RVJA 4J0YA 3OGQA 3NUJA 1TCXA 4Y54A 5P1SA 5P62A 3KFNA 5P12A 5P8RA 2Q11A 5P59A 5OZVA 5P48A 4FL8A 3VF7A 4YCTA 1MVPA 5P6GA 5P5NA 4AA8A 5P57A 3I7EA 1AM5A 4YOBA 5P0MA 3LIXA 5P77A 1HHPA 3L38A 4B1DA 3OU1A 3BVAA 4Y5EA 3NDUA 1BDQA 5P6YA 4Y3QA 2IRZA 2Z54A 2IGYA 3KF0A 2IKUA 5P4PA 1EC3A 1LEEA 4J0PA 5HU0A 5P4EA 1HXWA 2HM1A 3CMSA 5P1BA 5AHCA 5P7DA 3LIQA 2P3BA 4DJWA 5P44A 4XKXA 3VV7A 5P20A 3VLBA 4EJDA 5P2KA 3DOXA 2QZKA 4FCOA 1EPRE 3EL1A 5OYUA 4DQGA 4N00A 3UQRA 4QJ8A 4LBTA 1EAGA 5AGZA 1FMXA 4Y3GA 2V11C 3M9FA 4LXMA 5P6EA 1Z8CA 2BJUA 1SIVA 1EPLE 2B8LA 2R43A 4Y58A 2AVOA 5P02A 2H6SA 3SACA 2AVQA 3KMYA 5P6TA 4OBFA 2ZJHA 1HSGA 3LHGA 5P36A 1W6HA 1WKRA 2QI4A 2VIJA 3OADB 1T7IA 1ZSFA 4IVSA 3ZKNA 2Q64A 5P8CA 4OBHA 2I4UA 2J9JA 3VYEA 5P8MA 5OYZA 3JVYA 3MSLA 3TNEA 4RVXA 3NU5A 5P8TA 3RSXA 1M0BA 1MTRA 4Y4EA 3ZPUA 5P2MA 2FXDA 4RCEA 4L1AA 3LITA 4H3GA 1GNNA 5OZ6A 4LP9A 3ZOVA 1TSUA 5P4SA 3KM4A 6FIVA 2AOFA 4EPJA 4GJAA 4H1EA 3IXJA 3K4VA 4K4PA 3TOHA 5P5BA 1HPSA 3JW2A 3VCMA 3O9IA 1XE5A 3PBZA 5P8JA 2RMPA 5P1LA 2BPXA 2Q15A 5P0FA 5P4JA 5FIVA 5P05A 5EZZA 4XX3A 2XYEA 2AOEA 5P8KA 3DCKA 3S8IA 2PH8A 3OQ7A 2R9BA 2HB4A 2IENA 5P2YA 4FE6A 3L5CA 4B1EA 5P18A 2FIVA 3FV3A 5P47A 5P2XA 5OZXA 3S7LA 5DR4A 3ZKMA 1DPJA 2OHTA 3NDTA 1K6TA 3RTMA 5JFPA 2QD7A 3OQAA 2BQVA 2ER0E 3OTSA 2AZBA 4JP9A 5P0EA 5P4VA 5P0IA 1AAQA 5P3RA 5DR0A 3TPJA 1HEFE 5P7AA 5P5JA 2PSUA 3SA4A 2VJ9A 5OZWA 5P2UA 2XFKA 3PRSA 5P0RA 2OHSA 1HVLA 1XN3A 5P2SA 4Q1NA 1VIJA 1FG6C 4I11A 3ER3E 3EKQA 4HDFA 5HCOA 2R5QA 4J55A 4I8ZA 4D88A 5P3QA 5P1AA 3L5BA 5P8NA 5P50A 1FF0C 5CLMA 4DPIA 3L59A 5F00A 2OHKA 5OZSA 1XS7D 5P7HA 3RSVA 3D3TA 2AQUA 4PHVA 5P67A 3NDXA 5P42A 2AOHA 5DR1A 5P4YA 3IGBA 1IVQA 1B5FA 3OTYA 1HIVA 3C9XA 2OHPA 4CPSA 4OBZB 1N49A 2WKZA 5P0TA 2V16C 2VKMA 1T3RA 1FQ7A 3EL9A 3PWRA 4HZTA 5P0SA 2VIEA 1NPWA 3QVCA 3NWQA 2HAHA 2BPVA 3O9HA 4Q1WA 4COEA 4OC6A 1DW6C 2WEBA 3OUBA 2V0ZC 5P7SA 3IA9A 1LF2A 4CPUA 5P8IA 5COKA 2WF1A 1ZPKA 5P66A 3VEUA 4R95A 5OZ8A 1BXOA 2AZCA 5OZCA 3HAWA 3D91A 4I0FA 5P1DA 4HVPA 4CKUA 2I4VA 3VYFA 3PGIA 3EBZA 3WB5A 2IQGA 2IL2A 3UF3A 5OZFA 4NKKA 1HIIA 3OAGB 5P1WA 5P10A 2RKGA 4RRSA 3SA3A 3PSGA 5P5EA 1EBYA 3QBFA 5HDUA 1EBKC 4FM6A 4Y3SA 1ODYA 3UFNA 1ZBGA 4YBFA 5P1HA 1EPOE 2AVMA 5OZEA 3Q6YA 2J9KA 5P3SA 4L7JA 3PB5A 2Q3KA 4Y4XA 2HS2A 5P3XA 5P56A 5P5VA 4U7QA 5P52A 5I3WA 4EP2A 3A2OA 4RROA 2IEOA 3OUAA 5P3IA 1J71A 2F3EA 4J0TA 3VSWA 5OZ7A 3HLOA 3QIHA 5P3ZA 5P8UA 4HDBA 3O9AA 4R5NA 4Y4ZA 5P01A 3N4LA 1FFFC 2VNNA 5P6PA 2AVSA 2ZJIA 5P34A 1HVJA 4Y3MA 5P7QA 5P3FA 3UTLA 2QHZA 5P11A 3VSXA 5JFUA 3EKWA 5P5RA 3NU9A 4LHHA 1EC2A 3URIA 5P41A 2QAKA 3FSMA 1IDBA 4OBDA 1SDUA 5OZRA 1F34A 3OQFA 4Y5KA 5OZ2A 3VLAA 1G0VA 5P5WA 3SO9A 2ZJNA 3RTHA 5AHBA 5AHAA 1EPQE 2R3TA 5P6MA 4DJYA 4J54A 2WL0A 2VJ6A 3NU3A 5P22A 5P4IA 2QI0A 3I6OA 3MXDA 3INEA 4Y3LA 5P8EA 5P2IA 2JXRA 1XN2A 2WEZA 4J1HA 4FRJA 3ZKSA 3BVBA 5P5GA 3KDCA 3TOGA 4ZLSA 1BVGA 1W5WA 5P55A 5P51A 2VS2A 1MSMA 1MIQA 5P1XA 5P0LA 5P16A 2QI3A 5PEPA 2HB3A 5P6CA 1WBKA 5KQFA 5P5FA 4DFGA 4CPTA 4YD7A 5P53A 4Y3EA 5P5LA 1HVSA 1NH0A 4XXSA 1APVE 1YTGA 1IZEA 3S56A 3SA8A 1W50A 5P4BA 5P1OA 1YT9A 4U8WA 3SFCA 1A94A 4J5JA 5P2TA 4GJ5A 5P2RA 4Y43A 3G70A 3QP0A 5P0XA 2JE4A 1EBWA 3T7QA 4YOAA 5P5AA 5KQYA 2A1EA 4XX4A 5IVTA 1QBSA 5ENMA 4YHQA 2NPHA 3O9BA 4AZYA 4Y3NA 2BPZA 5P0NA 3QBHA 3B7VA 4FLGA 4ZSMA 4EQ0A 4X2LA 5BS4A 1MT9A 5P3VA 2WECA 5P8GA 3NR6A 3ZLQA 5CONA 5I70A 5DR3A 1HTRB 5DQ1A 2O4SA 2G1OA 4A4QA 1ODWA 5P5YA 1NPAA 5HDVA 5P8LA 3O9FA 5OZNA 5P4LA 1UPJA 4Y45A 2I4XA 5P5PA 5P2BA 1HVIA 5SY2A 3CYWA 5P6AA 2FMBA 4ZPEA 3DK1A 5OZAA 5P1YA 3APRE 1PPLE 5OZZA 4YD3A 2VIYA 5P6VA 3EL4A 1APUE 1B6PA 3RTNA 1BIMA 5P2QA 3BUHA 5P75A 1MRWA 5P17A 2F8GA 3UDPA 1BV9A 4OD9B 4B70A 4ZSRA 1A8GA 3CIDA 3GI4A 4DQBA 3PMYA 3OUDB 5P6XA 5P6NA 4R8YA 5P7EA 1A9MA 4Y48A 5P4WA 4YA8A 3S43B 1B6LA 4OBKA 5OZGA 2PSGA 1E5OE 4MC9A 5OZBA 4Y53A 1FQ4A 3LIVA 3GGXA 4DI2A 5DR7A 1XDHA 2F80A 3NU6A 5SXNA 4EP3A 1AJXA 4EXGA 3EM6A 5I3XA 4BFDA 5OZUA 3PLDA 5OZQA 5P6ZA 2WJOA 5P8QA 4D85A 3ZKGA 5P6FA 1DAZC 4F73A 3S85A 1YM4A 3QVIA 4Y37A 5AH7A 1HVHA 1VIKA 1ER8E 3BUGA 3OU1B 4NPUA 2V13A 4YE3A 5P6JA 1IZDA 4PZXA 5I3YA 1PSNA 5P7NA 3O9DA 5TOLA 2RKFA 3S7MA 1META 3NWXA 3GI5A 4FSEA 3S2OA 1PROA 3BXRA 4Y5PA 2G24A 5P7LA 2G1NA 2QHCA 3URJA 2P3BB 3R4BA 2NR6A 3RVIA 4DQHA 5OZDA 4DVFA 1C70A 1GVVA 3ZPSA 2BPYA 3OUCA 3PWWA 2UY0A 1D4YA 4YDGA 4LAPA 1RNEA 2AVVA 4Y3FA 3PSUA 5P5IA 1ZAPA 3O9GA 3OXCA 4Y3TA 3R2FA 5DPZA 5P4TA 2FGUA 1MERA 4LL3A 2UPJA 4ACXA 5P7FA 3TH9A 5COOA 5P79A 1HTEA 2F3KA 5P3BA 4JECA 2R38A 5P3YA 2AODA 4FSLA 4HEGA 1MT7A 3UDKA 3T3CA 5P58A 1W5XA 3LZUA 5P6LA 5P15A 4Y4GA 5P7UA 3SLZA 1LYAA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 2QZW A;  4NJU A;  3OY4 A;  5P3M A;  5OZ4 A;  5OZ1 A;  3VF3 A;  1GVU A;  4YDF A;  1GVT A;  5P5T A;  5KQZ A;  5P27 A;  2P8H A;  3LIY A;  1K2B A;  2G69 A;  5P29 A;  3PMU A;  5KR2 A;  4GYE A;  4A6C A;  5OYT A;  1AID A;  1BXQ A;  5P60 A;  2ER7 E;  1EPM E;  1JLD A;  2I0D A;  5OYV A;  4DQC A;  4E43 A;  2PMA A;  3OU4 B;  1RPI A;  5HE7 A;  4Y5A A;  5P06 A;  4MC2 A;  4DQE A;  4OBJ A;  1E80 E;  5HD0 A;  4H3F A;  4FAF A;  5P6B A;  1MPP A;  3NLS A;  4WTU A;  2ZHV A;  5P26 A;  3T11 A;  1A30 A;  4KE0 A;  2AOG A;  4DJP A;  5SY3 A;  1BIL A;  3BHE A;  2G1R A;  5P33 A;  4FRI A;  3TKW A;  3KDB A;  4DV9 A;  2FGV A;  4EHC A;  2Q63 A;  1SGZ A;  3SAA A;  1CPI A;  2WF4 A;  2WF2 A;  4RYG A;  3VV8 A;  3LPJ A;  5ISK A;  4LXK A;  5P70 A;  5P0O A;  2FS4 A;  1ME6 A;  2PYM A;  3FNU A;  5P0D A;  3D1X A;  5P6Q A;  1LYW B;  1EBZ A;  4I8W A;  3CIB A;  5P00 A;  1HVK A;  4Y3R A;  5P8O A;  4ER1 E;  3TPP A;  4I0G A;  5P5Q A;  4GJ7 A;  2BKT A;  1OD1 A;  5ER1 E;  3U71 A;  1MES A;  3K5G A;  5P49 A;  4UPJ A;  2P3C A;  1PFZ A;  4OBZ A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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 4DUS A;  4LXA A;  5P6K A;  2ANL A;  3DV1 A;  4ACU A;  4ER2 E;  1HSI A;  5P2H A;  1T6E X;  4MC1 A;  5P2O A;  1ZJ7 A;  4EYR A;  2I0A A;  4Y6M A;  5HDZ A;  4TRW A;  5P2N A;  2PC0 A;  2P3A A;  1M4H A;  5E5K A;  3UQP A;  5E5J A;  2ER6 E;  3ZKX A;  4AUC A;  1W5Y A;  1UH7 A;  1D4I A;  4PZW A;  1NSO A;  2AOC A;  3LIN A;  3QN8 A;  2QNN A;  5P8V A;  3KFR A;  3R0Y A;  5P8S A;  4FRS A;  3TL9 A;  2VA6 A;  4K8S A;  3UQW A;  5IVQ A;  4YBI A;  5UPJ A;  5P81 A;  5HU1 A;  3ZPT A;  2QMD A;  4I12 A;  4NPT A;  5P78 A;  3SA9 A;  5P2D A;  4JPC A;  4YD4 A;  2NMZ A;  5P82 A;  3OU3 A;  4FRK A;  2G21 A;  4RRN A;  1HRN A;  5P46 A;  5P4C A;  5JG1 A;  2ER9 E;  3FIV A;  3OGP A;  4L7H A;  2PWC A;  3VG1 A;  5P07 A;  1HWR A;  4Y4T A;  5ENK A;  4K4Q A;  2I1A A;  4F76 A;  4PYV A;  3SM1 A;  4DJV A;  4ER4 E;  3EKT A;  4CP7 A;  4J0Z A;  4J17 A;  3OK9 A;  5P4M A;  4FS4 A;  4Y56 A;  4DPF A;  3D1Y A;  5P4F A;  4QJ9 A;  3INH A;  3VFB A;  3K5C A;  1FG8 C;  5C9B A;  4Y47 A;  5AH8 A;  1LYA B;  1YTH A;  5DGU A;  4B05 A;  2Z4O A;  3FNS A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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