4XX3A

Renin in complex with (s)-1-(3-(benzylcarbamoyl)benzyl)-4-isopropyl-4-methyl-6-oxotetrahydropyrimidin-2(1h)-iminium
Total Genus 90
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
90
sequence length
339
structure length
339
Chain Sequence
TLGNTTSSVILTNYMDTQYYGEIGIGTPPQTFKVVFDTGSSNVWVPSSKCSRLYTACVYHKLFDASDSSSYKHNGTELTLRYSTGTVSGFLSQDIITVGGITVTQMFGEVTEMPALPFMLAEFDGVVGMGFIEQAIGRVTPIFDNIISQGVLKEDVFSFYYNRDSENSQSLGGQIVLGGSDPQHYEGNFHYINLIKTGVWQIQMKGVSVGSSTLLCEDGCLALVDTGASYISGSTSSIEKLMEALGAKKRLFDYVVKCNEGPTLPDISFHLGGKEYTLTSADYVFQESYSSKKLCTLAIHAMDIPPPTGPTWALGATFIRKFYTEFDRRNNRIGFALAR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Iminopyrimidinones: a novel pharmacophore for the development of orally active renin inhibitors.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Renin
molecule tags Hydrolase/hydrolase inhibitor
source organism Homo sapiens
total genus 90
structure length 339
sequence length 339
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.4.23.15: Renin.
pdb deposition date 2015-01-29

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00026 Asp Eukaryotic aspartyl protease
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.40.70.10 Mainly Beta Beta Barrel Cathepsin D, subunit A; domain 1 Acid Proteases 4xx3A02
2.40.70.10 Mainly Beta Beta Barrel Cathepsin D, subunit A; domain 1 Acid Proteases 4xx3A01
3OGPA 3OHHA 1LF2A 1T7JA 5P05A 3IXJA 5P04A 2WF3A 5P1ZA 3IA9A 3PM4A 4FLGA 5COOA 1E81E 5P6SA 3HVPA 1LS5A 1GVVA 5P0VA 5P23A 4DJVA 2R38A 3UCBA 2V12C 5OYXA 5IS4A 4HZTA 2HPEA 3TLHA 1ODYA 4J1FA 5P4RA 1XS7D 1DP5A 4RCDA 4ZSPA 4D89A 1EBYA 1FMBA 5P5PA 5P5VA 4NJTA 1HSHA 3NUOA 1D4KA 5P0YA 2R3WA 5APRE 1QBRA 3R1GB 1RPIA 1BWBA 1EPQE 3INEA 5OYQA 5P56A 3PWMA 3UQWA 5P4FA 4RZ1A 1W5WA 2A1EA 5P7QA 2FDPA 4OBGA 5P42A 4HA5A 5P8NA 3QVIA 1D4JA 3SAAA 2Q64A 5P5CA 5P4SA 1UPJA 3WZ6A 3APPA 2FDDA 3ER5E 5P5OA 5P11A 4RVJA 5OZQA 5KR1A 3T3CA 3I6OA 4OBZB 5OZZA 4L1AB 5P0LA 1HVSA 5P5NA 5P6WA 1XN3A 5P4CA 5P76A 3SM2A 4Y3XA 4LP9A 2APRA 5P17A 3VYFA 3OTYA 3L38A 2FNSA 4TVHA 5P64A 5P7YA 5AH9A 1FQ5A 3O9FA 1EEDP 1G6LA 4EXGA 4L1AA 5P44A 3HW1A 5HTZA 4RLDA 3VUCA 3PVKA 5P78A 2O4NA 1ZPKA 2R43A 4TRZA 1HVIA 3D1XA 5P6MA 1MERA 4AUCA 2BPXA 2G1SA 5P43A 5P8DA 5OZMA 4L7JA 4B72A 4Y3ZA 4RVXA 5P4OA 4J5JA 4RRSA 5P8AA 2AVSA 2BKSA 5BWYA 1LYBA 5P72A 2QZXA 1TQFA 2AIDA 2XYEA 3O9CA 4I1CA 5HU1A 4YBIA 5P4LA 5P18A 5OZYA 1YM2A 1T6EX 4Y6MA 3VEUA 4HDFA 2BPVA 3H5BA 5OZ9A 3NWQA 1W50A 5P1AA 4EJ8A 3TPPA 1UH7A 2ZE1A 4Z2ZA 1SDUA 2R8NA 5P2HA 3CMSA 1T7IA 4B77A 5P4PA 1TW7A 5P45A 5P03A 5ENKA 3PSGA 2IEOA 4TRYA 5ER2E 5P82A 5P0AA 3VG1A 1FGCC 2OAHA 2PQZA 5P41A 5P81A 5P6VA 3TOGA 3QAAA 5P12A 2Q63A 5P1SA 2HM1A 4YD6A 5JFPA 2V0ZC 3OU3A 1W51A 5P7CA 2ZHSA 5SY3A 7UPJA 1YG9A 5ER1E 3DCRA 4Q1WA 2WF4A 4I0HA 4Q1XA 5P5ZA 1EBKC 2IDWA 2WECA 1K6TA 1GVWA 4Y3DA 1PSOE 2AZCA 5P6UA 3PSUA 5P1PA 3O9DA 2ZJIA 1META 4J1HA 3OUAA 4J0VA 2VJ6A 1AXAA 1DW6C 3OQKA 4Y4TA 5P0BA 4FS4A 4MC1A 4I0GA 1A8KA 3TKWA 5P28A 3KFPA 1HHPA 5P02A 2JXRA 3EC0A 5P3OA 5OYVA 2ZJMA 2QU3A 4DQBA 4J1CA 2QMDA 4EHCA 3FX5A 4Y4DA 5HU0A 4Y41A 3AUPA 3OXXA 4KE1A 1NSOA 4D8CA 2OHNA 2FS4A 1HPOA 2ZJJA 4QJ8A 3ZPSA 5P1JA 4I0FA 2VKMA 2G27A 1D4LA 4BFDA 5P8EA 3UDMA 4FRIA 3TPRA 4CP7A 5SZ9A 5KQFA 1UH8A 5OZ8A 1YTHA 2HC0A 1K1TA 3T6IA 5J25A 5P3EA 4XXSA 1YTJA 1MT9A 4ZSMA 1K2CA 3D1ZA 1SP5A 2NNPA 3GGAA 4Y3SA 4Y3MA 2F80A 5P32A 5P74A 5I3XA 2QZLA 5P6YA 2O4LA 2VIEA 5P6OA 5P86A 5P5QA 3RTHA 4DQHA 5KQXA 5P8LA 3BC4A 2BKTA 1MEUA 4MC2A 5KAOA 2HAHA 1NPWA 4CPWA 4Y56A 3RTMA 5P84A 2QMFA 4ZLSA 2H6SA 5P5LA 4DQFA 5CLMA 5P79A 1EPLE 2G1YA 5JG1A 3UQPA 3D3TA 3KDCA 3G6ZA 4Y5GA 7HVPA 3U71A 2P4JA 5P3JA 2VJ9A 3DV1A 1PPME 3EL4A 1A8GA 4I11A 4Y39A 3PCZA 3TL9A 4ACUA 2FGUA 2QI7A 1TSQA 3KFRA 3MWSA 3PHVA 1E80E 1AM5A 1KJ7A 1YX9A 3UFNA 3GW5A 3HAWA 4I8ZA 5HCTA 5P6HA 2QI6A 3Q6YA 4DJXA 3EBZA 1IDAA 1NH0A 4GJ7A 4QJ2A 3FNTA 2R5QA 4Y3GA 3QROA 4X2LA 5P49A 5P00A 2NR6A 3QVCA 3PRSA 5P0NA 5OZ3A 3R4BA 4HEGA 1B6PA 5OZWA 4ER1E 5DQ5A 4JP9A 2PC0A 3HZCA 3Q70A 3RSVA 2G22A 4OBFA 5P3UA 2HS1A 4OC6A 5P0IA 5P2TA 1RV7A 2P3AA 2ZHVA 4OBKA 4R91A 1XL5A 4U7QA 5P2RA 3SLZA 5P2UA 1HVLA 5P40A 9HVPA 3SA6A 1IZIA 4Y4WA 5HDZA 2V10C 5DR8A 4Y5PA 5P4BA 5OZIA 2SAMA 5P6GA 5P83A 1APTE 2NXLA 5OZAA 5P31A 1SDTA 2OHMA 2ZHUA 2IL2A 1KJHA 2ER7E 4Y4AA 2HB2A 1XE6A 3S43A 1IVPA 3S45A 2AVMA 5P6PA 3PMYA 2IGYA 1D4HA 5C9DA 5P1CA 3SABA 3ZLQA 1MT8A 1D4YA 1BAIA 1EC3A 5P1FA 1HSGA 2O4KA 5P39A 3D1YA 3UQRA 3OQDA 5P8FA 3OWNA 1G35A 5E5KA 1N49A 3KMXA 5P65A 3OAGA 1ME6A 3O9GA 4FRSA 4DQEA 4HDPA 3LPKA 5P4ZA 5P4QA 3VV6A 4H3IA 3BHEA 4NPTA 5FIVA 3HAUA 1ENTE 5P8QA 4PYVA 5P08A 3ER3E 1G0VA 4LAPA 3SM1A 3LZSA 3INDA 2PYMA 1QBSA 1ZSRA 2OHUA 2PH8A 4WY6A 5P0OA 5P8HA 4F76A 1LF3A 4TVGA 1CMSA 1KJGA 2AVQA 4Y53A 5JODA 3FIVA 3OGQA 2WF0A 4NJSA 4Y5AA 5F01A 1GKTA 5P1KA 5IVTA 4DJQA 2NNKA 3T7QA 3ZOVA 5OYWA 5DR1A 1OEWA 3CYWA 1HXBA 3OOZA 5P8CA 4L7HA 3OU1B 4L6BA 4LBTA 3K5GA 5P7DA 5P5KA 3SKGA 3NYGA 4FRJA 4I0ZA 2UY0A 3O9EA 5P7AA 5OYZA 3EKTA 4Z4XA 3EL0A 2B8VA 5C9FA 5IE1A 5AHAA 1AAQA 2QNPA 4B1CA 3PI0A 4Y3YA 5HDVA 4ER2E 3CIBA 3VYEA 5P2DA 3VFAA 3O9LB 1GNOA 3JVYA 1C70A 3Q5HA 4XX4A 3SKFA 5DQ4A 2BB9A 1GVUA 5HD0A 5P0SA 5P3WA 2ER9E 4AMTA 5P2OA 2OF0A 1SMRA 5P6NA 5F00A 4AA9A 5P1VA 3LIZA 5AGZA 1LZQA 2VA6A 2QHYA 3OHFA 2P83A 2XFKA 3ZKSA 5P1WA 5P37A 2NMZA 2R3TA 2VNNA 3NXNA 5OZGA 2I4WA 4M8XA 2OHKA 1MTRA 1BDQA 4J0TA 3QI1A 1U8GA 1MUIA 1WKRA 1LF4A 1D4SA 1M43A 3WSJA 3GI0A 3BUFA 4Y4XA 3OUDA 1B6KA 5P7MA 1BBSA 3OUCA 3NXEA 4B0QA 1W6HA 4Y3PA 4Y4EA 3LZYA 5DQ1A 5P1TA 1K6PA 1W6IA 1EC1A 3SO9A 5KQYA 4Y44A 3GI6A 5P25A 4QJ6A 1AJVA 3PLDA 4YCYA 3MSKA 4K8SA 3NDWA 5P60A 5P66A 1ODXA 4EYRA 4OBHA 5B18A 3EL1A 2NXDA 1ZTZA 1UH9A 3EKXA 3O9HA 5P2AA 5P3AA 4H3JA 5P87A 4Z22A 4Y54A 3KM4A 3KN0A 5P7UA 3OXVA 1EPOE 5P5MA 3DK1A 5P8PA 4YHQA 4Y3RA 4Y3JA 3HLOA 4Y47A 2Q3KA 2G24A 1Q9PA 3OU4B 3HBOA 5P70A 2VS2A 4NJVA 1GVTA 1PFZA 4I12A 5P0ZA 3LIYA 5P1DA 5P3KA 4Y48A 5P34A 4RYCA 3WB5A 1FIVA 1EPPE 5P8TA 3EMYA 3JVWA 1ZBGA 3OU4A 5P26A 1SIVA 3B80A 5P75A 5P7BA 2FNTA 1FEJC 1MIQA 5OZJA 5HE5A 4ZEAA 5P30A 1LYBB 4EPJA 3QRMA 4COEA 3R2FA 4OBJA 4JPEA 5P6BA 3WB4A 1BIMA 1HPXA 1LYAA 3CICA 3TOHA 5P8IA 5P2WA 3BVBA 4GIDA 4JOOA 4I0IA 3EM4A 4CPQA 5P89A 4JPCA 4Y35A 5JFUA 3ZL7A 1BV9A 2I4XA 3NU3A 1RL8A 3SA7A 5OZSA 4FL8A 1ZPAA 3DM6A 2WEZA 3CKPA 5P0QA 5P4HA 2O4PA 5P1LA 5P47A 3OTSA 2I0DA 3FSMA 4WY1A 3KT2A 1K6CA 2OHTA 5P6QA 4FGXA 1BDRA 4U8WA 5P8UA 3B7VA 2FMBA 3EKVA 1EBWA 4Y5KA 4QGIA 1Z1RA 3KYRA 4NJUA 2VIYA 2PH6A 5P15A 5P16A 3SA9A 5P3ZA 2ER6E 5P0GA 4Y4ZA 3K5FA 1HRNA 2I0AA 5P2YA 4F74A 5P07A 1F7AA 3PBZA 2ZDZA 1F34A 3ECGA 3PSYA 1FF0C 4Y5EA 5P36A 1HTGA 2Z54A 3PLLA 5P4MA 5HDXA 5P0PA 1B6MA 4I10A 5P73A 3L5CA 3NSHA 5P3RA 2HPFA 5P5AA 3CKTA 1PPKE 1Z8CA 4J17A 2UPJA 4Q5MA 3UDQA 1IVQA 2B60A 5P2MA 4Y5NA 4QJ9A 2P8HA 1HVKA 5BRYA 5P7OA 4YBFA 2OHLA 2Z4OA 3KFNA 4DJPA 5P3SA 4DPFA 5P5DA 4PHVA 4F73A 2RKGA 2VNMA 5HVPA 3G72A 1MRWA 4ZSQA 3PCWA 2I4QA 4D83A 3TOFA 4OBDA 5P5XA 3DUYA 3IAWA 5OZNA 5P13A 3BGCA 5P7ZA 3SA5A 2RMPA 4Y43A 1SBGA 3KFSA 4CKUA 3BUGA 4Y5BA 2NXMA 3G70A 5P0EA 4GJAA 4EJKA 4YD7A 1SMEA 1K2BA 2V11C 5P2ZA 5P6KA 1FG8C 3UFLA 4J0ZA 3EKYA 4DJWA 3QS1A 1HIVA 5OZTA 2AZBA 3NDXA 5P7XA 4GJ5A 4PEPA 1EPRE 4RRNA 5OYSA 2J9KA 3ZKIA 1M0BA 3NLSA 4J55A 4J54A 2WHHA 4FM6A 5P54A 5P5IA 3S56A 3EKQA 4EJLA 3K5DA 1PPLE 5AH6A 1A9MA 5P53A 5SY2A 3VV7A 4PZWA 1HVRA 3EL5A 4GMIA 2OHQA 3CYXA 4L7GA 5OZHA 5P1QA 5OZBA 1APVE 3RTNA 2I4UA 2BJUA 3UDPA 3KMYA 5P6DA 5OZLA 4FAEA 2QI1A 4Y3FA 3S2OA 4DPIA 4FIVA 3OXWA 4IVTA 1ZJ7A 5P3LA 3UHLA 2HIZA 1HEGE 5P4EA 4AZYA 3MSLA 2QI0A 5ISKA 3UDYA 4GJ6A 3OQAA 4DUSA 2G26A 5P46A 3LIXA 5P68A 4F75A 1ZSFA 4DJUA 2XFJA 2QK5A 4LXAA 1LV1A 2B7FA 4OC6B 3VF5A 3OY4A 4APRE 1QRPE 2CEJA 4YE3A 3ZMGA 1RQ9A 1CZIE 5P2FA 3IVHA 1HTEA 5I3VA 2ASIA 3VCMA 3OQ7A 4BFBA 4Y3WA 4Y3QA 1CPIA 3VSWA 2WEAA 5P7HA 2ZJKA 4YOBA 8HVPA 1FQXA 5P51A 1HEFE 2AOFA 5P2KA 1GVXA 2CENA 1OEXA 4BELA 5P4GA 5P2GA 5P0XA 1BVGA 2HB4A 1LEEA 1EBZA 3R0WA 3UDKA 5I70A 5P8MA 3ZKQA 5DR3A 3S43B 2BQVA 5P59A 1AVFA 1B6LA 2QD6A 3TPLA 4FSEA 5P4IA 2NPHA 2HB3A 5P58A 2QU2A 4D88A 4B1EA 4DQGA 1YTIA 4K4RA 1OHRA 3LNKA 5P7KA 5OZ2A 5P20A 3IN4A 5P3PA 1T3RA 5P6FA 5DQ2A 4RVIA 3EL9A 3OAGB 5P1NA 1AIDA 3FKTA 1TCXA 1FFFC 3ZKGA 3A2OA 2RKFA 5IVSA 2PYNA 3LINA 3U7SA 4QLHA 4X7IA 4OD9B 3LIQA 3O9AA 3LPJA 1XL2A 5OZPA 1C6ZA 5AH8A 4DV9A 4Y3HA 3INHA 1APUE 5P2IA 2G21A 4FCOA 3L5EA 1B6JA 5AHCA 1MTBA 4LC7A 5OZFA 4OD9A 3PB5A 4EP3A 4LXKA 2JYSA 1FMUA 2P3DA 2R5PA 5P5WA 1SGUA 1SDVA 3PI5A 5P7TA 1DAZC 4DJYA 3TPJA 5P4DA 5OZVA 1HOSA 5P3IA 4MC6A 1XE5A 4R92A 2OHPA 2QP8A 3K1WA 4B1DA 4LXMA 3VSXA 2QZKA 2F3KA 1FQ8A 4KB9A 4J0YA 2FXDA 3S54A 3O9IA 3KDBA 3MSJA 5P6TA 3ZKMA 4A6CA 1B5FB 4CPUA 2IKUA 5P5UA 2FIVA 3PJ6A 5P4VA 2G69A 2Q55A 5P55A 5P3TA 1XDHA 1FKNA 2J9JB 5P7JA 2O4SA 4EWOA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 3OGP A;  3OHH A;  1LF2 A;  1T7J A;  5P05 A;  3IXJ A;  5P04 A;  2WF3 A;  5P1Z A;  3IA9 A;  3PM4 A;  4FLG A;  5COO A;  1E81 E;  5P6S A;  3HVP A;  1LS5 A;  1GVV A;  5P0V A;  5P23 A;  4DJV A;  2R38 A;  3UCB A;  2V12 C;  5OYX A;  5IS4 A;  4HZT A;  2HPE A;  3TLH A;  1ODY A;  4J1F A;  5P4R A;  1XS7 D;  1DP5 A;  4RCD A;  4ZSP A;  4D89 A;  1EBY A;  1FMB A;  5P5P A;  5P5V A;  4NJT A;  1HSH A;  3NUO A;  1D4K A;  5P0Y A;  2R3W A;  5APR E;  1QBR A;  3R1G B;  1RPI A;  1BWB A;  1EPQ E;  3INE A;  5OYQ A;  5P56 A;  3PWM A;  3UQW A;  5P4F A;  4RZ1 A;  1W5W A;  2A1E A;  5P7Q A;  2FDP A;  4OBG A;  5P42 A;  4HA5 A;  5P8N A;  3QVI A;  1D4J A;  3SAA A;  2Q64 A;  5P5C A;  5P4S A;  1UPJ A;  3WZ6 A;  3APP A;  2FDD A;  3ER5 E;  5P5O A;  5P11 A;  4RVJ A;  5OZQ A;  5KR1 A;  3T3C A;  3I6O A;  4OBZ B;  5OZZ A;  4L1A B;  5P0L A;  1HVS A;  5P5N A;  5P6W A;  1XN3 A;  5P4C A;  5P76 A;  3SM2 A;  4Y3X A;  4LP9 A;  2APR A;  5P17 A;  3VYF A;  3OTY A;  3L38 A;  2FNS A;  4TVH A;  5P64 A;  5P7Y A;  5AH9 A;  1FQ5 A;  3O9F A;  1EED P; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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